1SL2 | Genus

Total Genus 28

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	28
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	KIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/electron transport/dna
molecule keywords	5'-D(CPGPAPAPAPAPCPGPAPCPGPGPCPCPAPGPTPGP*
publication title	Nucleotide insertion opposite a cis-syn thymine dimer by a replicative DNA polymerase from bacteriophage T7. pubmed doi rcsb
source organism	Enterobacteria phage t7
total genus	28
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1sl2B00

2WZ9A 2K8SA 4TR1A 1Z7PA 1JHBA 4D73B 5CRWA 2VM2A 5DQSA 3UIWA 3TGZA 2VM1A 3E0UA 4PQHA 5JCUA 2BTOT 5JWQB 1EV4A 4TVEA 4GWRA 3RBTA 3ED3A 3CTGA 3FZAA 4OD7A 3M3MA 1R26A 2WFCA 4RUVA 2C1YA 2DJ3A 2X8GA 3E3EA 4KCAA 1BAYA 2H74A 3IE3A 2IN3A 3SBCA 3GFKA 3RDWA 3TUEA 3IOSA 5AGYA 5ECLB 2TIRA 1T8EB 1X5EA 5ECPB 5ECIB 4KGIA 2AYTA 1S3CA 2D2ZA 1SK1A 2QGVA 3GKMA 2VO4A 1GUHA 4Q5QA 3C1RA 4LA1A 3LG6A 1PQNA 2E2MA 4X0XA 1QQ2A 4FO5A 5IMCA 2JSZA 2KOKA 4D73A 3ERGA 5AIXA 1V9WA 4GXZA 1USBA 3US3A 3P90A 2F8AA 4KA0A 4MMMA 1G7EA 3F6FA 3F6DA 4MF5A 5C00A 1MDJA 5IO0A 4LMVA 3FZ5A 1LJRA 1MDKA 3EE2A 4MABA 4X1UA 3I6AA 1X9MB 1GSQA 1TW9A 3LFLA 2HZFA 2L59A 2HRNA 2F8FA 1CQHA 2MMNA 3P8WA 3TOUA 3MSZA 1UVZA 1YEXA 2KLXA 2EIRA 2AUVA 2GQMA 2C8UA 2N5FA 3HZ4A 1Q4JA 2LJRA 4GTUA 1ST9A 5JCGA 2JSYA 2B7JA 4V1Ag 3IR4A 1GTIA 2GQKA 3GL3A 4MZWA 4BWQA 2YWMA 3VFIA 2ZNMA 4NV2A 3P7XA 4O92A 20GSA 4BA7A 4ZBBA 3KD0A 1BEDA 2J9HA 2R6KA 2RM5A 2MMZA 3QR6A 1SU9A 3ERFA 3WYWA 3D0ZA 2GT6A 3CSIA 3P2AA 1B9XC 1K0AA 4ILFA 1KEBA 2FCHA 2I9HA 1QK8A 2VOCA 5D9TA 1SL1B 2M46A 3ZVJD 3E9JB 3J7Yb 1JZOA 1EP8A 4OCFA 1VGLA 2O7KA 3IRAA 4I6XA 3H8QA 1PX7A 1FG4A 3EC3A 1SL2B 3IDVA 3HA9A 1SYXA 3TRPA 2B1KA 5CRGA 3DVXA 1GTUA 1LBKA 4RQXA 2JADA 1WJKA 3UMAA 1TRSA 1A0FA 2VD1A 3GHAA 3F63A 3ZREA 4K0NA 2NTOA 5GSSA 3G7JA 1TRUA 4O5RA 4OMVA 1ZGNA 1K3YA 1WE0A 3CBUA 3M9KA 1Z5YE 1XW6A 2CX4A 3D4MA 3VWWA 1TKDB 1SJIA 4K2DA 5F05A 1JFUA 1T4ZA 4POLA 4HS1A 4V2LA 5HR0A 4HZ4A 2EC4A 4FYBA 1SK0A 2FD3A 2TRCP 3Q6OA 3K8NA 1OE8A 2OA7A 3IK7A 4O32A 3TJJA 5ECSA 2REMA 4IVFA 2RIIA 3FZ9A 1YY7A 3IK9A 1EP7A 4K8MA 1YKCA 1DSBA 1HQOA 1T3BA 4AGSA 2H73A 3LSZA 1R5PA 1J9BA 3PGTA 3HVXA 3MWHA 1Z6NA 2DSAA 1A0RP 1MD4A 1ERUA 5IPGA 5B8AA 3TRXA 1XFLA 1V2AA 2LRTA 3D21A 4EL1A 3QAGA 3O76A 2FNOA 1Z6MA 4DVCA 1X9WB 3H79A 3W8JA 4ECIA 2ES7A 3I69A 2GZZA 5A5KA 1DBYA 5ECOB 1PD21 1QFNA 8GSSA 4I5QA 5A4VA 3VK9A 5IIZA 5D9VA 1GLQA 2HXKA 2M72A 5G5EA 1TXXA 3ZYWA 3QFAC 2KP1A 3UVHA 5CRHA 1UA5A 5CP1A 1K0NA 1EGRA 3KP8A 1M2AA 5DJMA 2LSTA 2OACA 4NMUA 1N2AA 14GSA 5COHA 1B48A 3IBHA 4JR6A 1TU8A 4GLTA 4FH8A 2YN1A 2X8HA 3RHCA 1SKSB 1T4YA 4MZCA 3VWUA 3ERWA 4TKYA 4MH2A 4CDOA 3BBYA 3TKQA 3L9SA 2P5RA 4TR0A 1WPIA 2F51A 3FW2A 5ID2B 1O8XA 4AJ7A 4Q5RA 5IMFA 2HSYA 4AJ8A 2C3QA 4HDEA 1BG5A 5DJLA 1QXHA 3DWVA 3GA4A 5FHIA 1PMTA 3DGQA 5LD0A 13GSA 4ULXA 2B5YA 5D93A 2PUKC 4E8EA 1TI1A 4CW9A 3SWLA 4QQ7A 4NV5A 2RUFA 4BWSA 2C0DA 1J0FA 4XS4B 1ABAA 5IPHA 1V57A 4MJBA 2G2QA 5L71A 4F9ZA 2PMTA 4YQMA 1X5CA 1Y25A 1PA3A 1KNGA 3EMXA 2HNLA 2PVOC 4IBPA 3FK8A 2JU5A 4JR4A 4BVYA 4HQSA 1HNBA 3RPNA 1M2BA 5JWRB 4YQUA 5EL8A 2FWGA 3UVTA 3ZLPA 1T00A 3QD9A 3ISOA 4KB3A 2IMKA 3UAPA 1XVQA 1WP0A 3NIVA 2DMMA 1YF0A 3FR6A 5ID2A 1XVWA 3BOAA 3Q18A 4HOJA 1QUWA 3KZQA 2JL4A 3FHKA 3VI5A 4X43A 2H8LA 3TKRA 2LTKA 2B1LA 5IMVA 2M80A 3GYKA 2LNTA 2V2GA 1R7HA 2YNXA 2YJ7A 3QDNA 2BJXA 4F0BA 5ABRA 3VPQA 1PN9A 1TI3A 4Z7XA 2H71A 3TKSE 1Z9HA 2XPEA 4XS4A 3EMPA 1AQVA 3QPMA 2B3SA 2XPDA 5ENUA 2P31A 3A2WA 4PUFC 2MMAA 3IHQA 1PKZA 2B5EA 1K0DA 4IKHA 2C3TA 5C04A 1GLPA 2GSTA 4V2NA 5HFIA 1JZRA 2H6YA 4J2FA 4MJAA 2C4JA 2CQ9A 2A4VA 2OE1A 3VLNA 2HYXA 2H6ZA 1T1VA 2JZRA 3BCKA 1NM3A 2LQQA 1DUGA 2O87A 1JZDA 1UC7A 1HYUA 1W89A 3ZFBA 3IXRA 4N30A 5ECKB 4HU9A 4WBJA 4IQ1A 3IA1A 3ZIVA 1WRYA 2YJHA 2LV3A 3W8SA 4FYCA 1VF3A 4XS1A 3CXGA 5F8BA 4KSMA 2XC2A 4N10A 1XCCA 4L5OA 1ZYQB 1PSQA 4J57E 1WIKA 2I81A 4K0GA 2VCZA 2H75A 4XRAA 3EU3A 4NAXA 2AAWA 3HKRA 3QAVA 1URMA 2YZHA 2AHEA 3CSHA 5D73A 3ZMKA 2L57A 5B6MA 4KW6A 3ZZXA 1HD2A 1GTBA 1AXDA 3F9UA 5D9XA 4MJCA 5HFKA 2YV9A 2FA8A 5LCZA 3HHVA 1U3IA 3IAM2 1W4VA 3M9JA 4J56E 3FRCA 2CA8A 4I2UA 1I9DA 2DC5A 1SK2A 3AY8A 1XWKA 3UJ1A 1NHOA 1FVKA 4ACSA 1XIYA 3HCZA 1E6BA 4KE3A 5E4WA 3ZRDA 1M9BA 3HVVA 6GSVA 3FR9A 4WR5A 1E2YA 1FAAA 4GQCA 2C0EA 2X64A 1TJDA 22GSA 3H4KA 18GSA 1PGTA 5G5FA 3C73A 1U88A 4IJ3A 3APOA 4L8EA 4DSRA 6GSWA 2LQOA 3A3TA 1GSEA 5J4UA 4POMA 3DXBA 1YZXA 2WRTA 5KEJA 1K0CA 4ZB9A 1Q98A 4F2IA 4ZB8A 5CREA 2LJKA 3PH9A 2DJ2A 5GZZB 4KDXA 3D22A 4KCEA 1K3OA 4PX1A 4POBA 4JE1A 4ECJA 1VRSD 5IO2A 3KCMA 1SYRA 1BJXA 1M9AA 2CT6A 2LKUA 4L0UA 2PBJA 3NOFA 3G7YA 1YQ1A 1OC8A 2IWTA 1I5GA 4GCIA 1G6YA 5G31A 1YDKA 2DJKA 1X9SB 2H1BA 4IS0A 3ME7A 3ZIJA 1EV9A 1PRXA 2X99A 2DIYA 3G9BA 5F07A 1NHYA 2DIZA 1SL0B 2P0GA 3LJRA 2PN8A 1A2JA 2C80A 3L78A 2V6OA 1XZOA 1ZZYA 1XXUA 4MZBA 2B5XA 5F06A 2TRXA 1O8WA 3UL3A 2OKAA 1XW9A 4TXOB 5A4WA 4EE0A 2FGXA 2NBSA 3KXOA 2H6XA 1AQXA 1FHEA 2FY6A 1ON4A 5CYYA 1U6TA 2V1MA 2L5OA 4IP1A 4OFTA 1JLVA 4K9ZA 2DJ1A 1FOVA 2PERA 2R37A 2Z9SA 4KDYA 2MMOA 1VF1A 1TP9A 3G7IA 1PL1A 1Z7RA 2MZCA 4RQRA 3DD3A 4K7OA 4ZL8A 1GRXA 1GNEA 2L4CA 1ML6A 1V58A 1V40A 3UARA 2LJAA 3CTFA 3DEXA 4DSQA 4OO4A 4WEYA 3EVIA 2ALBA 1ZYEA 1DE1A 3A2XA 5D8IA 2CVDA 2DMLA 2R2JA 1NSWA 2K9FA 5JCWA 1ZCPA 4ZB6A 1XWGA 1EEJA 1Z3EA 3UEMA 2IMDA 1KTEA 3TKSA 1M0UA 3F8UA 6GSXA 4ECCA 3LWAA 4TXOA 2HFDA 1X5DA 2JZSA 4MCUA 2L6CA 2YOIA 2DJJA 3GSSA 3J7Yk 2YCDA 4LL4B 2IJYA 2VAFA 3TJFA 1BYEA 3EWLA 2X8CA 4MK3A 3GURA 4KUNA 5DQYA 3DRNA 1ZL9A 3IV4A 3KTLA 3F3RA 2LNSA 3UOMA 5KN0A 3IPZA 3KH7A 4PNFA 5KN2A 1AAZA 1XBSA 3L9UA 3GMFA 4MP4A 4HEA2 2ZCTA 3KGKA 3EINA 4PQIA 1R4WA 2FHEA 2JZTA 2IMIA 3W6GA 5H5RA 3FR3A 4OFMA 5DALB 1ZMAA 2ON7A 2YWOA 3GSTA 2RLIA 4HU7A 1THXA 1GTAA 4YAPA 4OFNA 3KH9A 2LRCA 3IAS2 2GS3A 4Q5NA 4MLYA 1OVNA 4L5LA 1Y6EA 2VLUA 4OWYA 1X0RA 4WETA 3H1NA 4RI7A 2I1UA 1GSDA 2CV4A 5H5QA 3GL5A 2IIYA 1SJ6A 1H75A 4OCEA 2L4QA 1U87A 1VF4A 2PU9C 4L0WA 1MTCA 4NWYA 4EDYA 1SJZA 2CAIA 2GLRA 6GSYA 3DYRA 4G9HA 1TK0B 4N11A 3M8NA 4XIHA 2NVLA 2GGTA 5INYA 1EWXA 1SKWB 2AV4A 3N5OA 2FWFA 5CRDA 3A2VA 4TXVA 1OKDA 4BPYA 2FUG2 2LRNA 5E59A 4ZXGA 3APSA 4PQ1A 2CX3A 4EKZA 5J41A 4I97A 1OE7A 4Q5FA 3FZ4A 5G1KA 1SENA 2IFQB 4JRRA 5G1LA 5J5NA 1KBNA 5CAXA 4KH7A 5IMDA 1WOUA 4K7IA 1ACVA 2H01A 4JBBA 4ID0A 1FB6A 2WS2A 2FA4A 2R4VA 2WULA 2YANA 1PL2A 3CRTA 4TW5A 1YJ6A 4LMWA 5DCGA 5EVOA 2I4AA 2FLSA 1GSYA 3KM6A 1MDIA 2HZEB 2E7PA 4KX4A 2VD0A 4ECBA 4EXJA 4IQAA 3F4SA 4NHWA 1A24A 1A8YA 5D9WA 3VWXA 3KMOA 2A2SA 5J9BA 2ZUPA 2CVKA 4V1Ap 3EU4A 2H1GA 5ECHB 3BJ5A 3A5WA 2O8VB 6GSUA 3GH6A 1SD9A 3CRUA 5IQYA 5H5SA 5AN1A 3RPPA 1PKWA 1IYHA 5GAND 1FB0A 2IFQA 4HJMA 2OBKA 3HD5A 5ELAA 2R3XA 2LUSA 6GSTA 1RK4A 1BX9A 3UBLA 4DEJA 5GSTA 3GH9A 3ZITA 1QMVA 4CHSA 3C71A 3LYKA 5FWGA 2HZEA 4WKWA 3L9VA 4QL7A 1O73A 2H0GA 1EOGA 4EO3A 4GSSA 5IOWA 3HY2A 3DVWA 4EC0A 2ON5A 2K18A 3TKPA 2YWNA 2XBIA 3QOUA 5HFGA 2VUPA 5D96A 3IC4A 1HNAA 1EZKA 4IN0A 4WR4A 3TJKA 2DLXA 2GSQA 4IGJA 4HI7A 3GX8A 1XWCA 1BQ7A 3ZTLA 1ZOFA 5DAKB 1GSSA 3V1WA 5ELGA 1TTZA 10GSA 4PXOA 3GKNA 3TCOA 2H0IA 2VL2A 4AJ6A 2VL3A 2GVPA 1EEMA 2L5LA 4ZBAA 1THOA 4IP6A 3GKXA 3UBKA 3QAWA 4N0VA 5DBQA 5G2ZA 2H1DA 3GTUB 2BMXA 2K6VA 4KSOA 11GSA 3I43A 1ERTA 5J3RA 3D4TA 1S3AA 5B7CA 4LL1B 3WD6A 1GSUA 3BCIA 2OADA 5AIVA 2HLSA 3RHBA 3DIEA 1B8XA 1XPVA 4ZILA 4G10A 2HT9A 1O6JA 5F0GA 2C3NA 4PGTA 3HZ8A 2HI7A 3GRXA 1FVJA 1F9MA 3CSJA 2NPBA 3LYPA 5FT3A 4ISDA 4HUAA 1XOAA 2GZYA 2P5QA 1ILOA 2CAQA 1FW1A 2YV7A 2IMFA 3MAKA 4MDCA 5DAKA 2VCWA 1TRWA 3PINA 2GZPA 3F0IA 3D6IA 2OBIA 3KP9A 1K0MA 2VCXA 2QC7A 4WBRD 1OYJA 5IMAA 3LQ7A 2WDUA 3LORA 1YF1A 2HSHA 2R5GA 1MD3A 3GX0A 3MDKA 3NZNA 3F4TA 4MF7A 3GTUA 3LEFA 3GKKA 1JZWA 1SD8A 1GL8A 4MPFA 3FKFA 3ME8A 3GNJA 5ECQB 4JZQA 3WGEA 5HR1A 1F37A 3WT1A 4G2EA 4XS6A 3CMIA 1F2EA 3GUSA 3R2QA 1TOFA 3GN3A 3QCPA 5KN1A 1OAZA 4TR4A 1A8LA 1IYIA 2H19A 3HYPA 4JU5A 2XBQA 3EURA 4K1FA 3C8EA 2O85A 3QMXA 4GF0A 2GSSA 3D5JA 4I8BA 9GSSA 2H70A 4KDUA 4XHMA 5ECMB 3TJBA 1K0OA 2K8VA 1UN2A 3I9V2 4K7NA 1VF2A 4HQZA 4H86A 4E8HA 3L4NA 2V41A 4EVMA 3APQA 2WJUA 2J23A 1R5AA 4O7HA 2IMEA 3HXSA 2H72A 1EGOA 1T7PB 2B6MA 2FWEA 3TOTA 5CO3A 5B6NA 2VLTA 2MBSA 4F0CA 5IMZA 2F3MA 2LEGA 2G0FA 1AQWA 2QSIA 3F4RA 3TKSC 5JWOB 4GSTA 3U6VA 1HNCA 2KP2A 3Q19A 2VL9A 2OE3A 4MPGA 4EDZA 3RAZA 3KMNA 1GULA 2PPTA 2A2RA 4G19A 4ML1A 2LS5A 2EIOA 2L6DA 4DSSB 2C0GA 2H1AA 3U5RE 4YH2A 1YKAA 1LU4A 5AISA 2MBTA 1EOHA 1DE2A 2VLVA 4XCSA 4PNGA 2B7KA 2H30A 1XWAA 1JLWA 3CYNA 1TDIA 3LXZA 1CQGA 2VCVA 4IW9A 2WGRA 4GQFA 2N5BA 6GSSA 1B4QA 1M99A 5EPFA 1GUMA 4IHUA 1F3AA 1GWCA 4OO5A 5ECNB 1M2DA 4IJIA 3QFBC 3JCML 5GAPD 3DMLA 2KHPA 2PVQA 2AB6A 4IELA 4ZIJA 2N5AA 4BL7A 7GSSA 5KN3A 4N0ZA 2C0FA 4ZL9A 4LLRA 4YAVA 1J08A 3DKSA 4DSSA 1AIUA 4I2TA 3VURA 2GDRA 1GH2A 2GTUA 4F82A 3MNGA 4NHZA 17GSA 2GSRA 3HDCA 4AF2A 3HJPA 2YP6A 3TRQA 1F6MC 1V98A 4GRFA 4TR3A 2H0HA 2DBCA 4WF5A 3M1GA 4XTSA 1RQMA 1NW2A 4F03A 3KIJA 1XOBA 2XHFA 1S3DA 3HVSA 3KTBA 3FY7A 1XWBA 1OC3A 3FEUA 4EF0A 2IL3A 4ZBDA 4POKA 12GSA 3M0FA 2HE3A 5IOXA 1FO5A 2H66A 1GNWA 2E2GA 2VIMA 4NPBA 4MA9A 4PURA 1MEKA 2WCIA 5DCHA 1B9YC 1A2MA 2YPMA 2RUEA 5B8BA 3O3TA 1OC9B 4P3YB 2MYGA 1SKRB 1A23A 3EYTA 3WT2A 1TK5B 2QKEA 3BD2A 1O85A 1OKTA 2CVBA 5LNKe 1AC1A 5HR2A 4KAEA 1GP1A 2CZ3A 3KEBA 3HJOA 4TN8A 4ZL7A 5G30A 3VWVA 1XW5A 2H76A 3WGDA 2VCQA 1GUKA 4FYUA 3TJGA 3HJMA 5CNWA 1WWJA 1H4OA 3TDGA 2FWHA 4WF4A 1F3BA 2F9SA 5HR3A 1U3AA 5DALA 16GSA 3S9FA 4PUAA 3TB2A 1O81A 4KNDA 1O7UA 2OJLA 4FIWA 1AUCA 1K3LA 4NXIA 19GSA 1G7OA 2PWJA 2CZ2A 5ECRB 4MH3A 3PR8A 5A4UA 2HRFA 1ERWA 5EY6A 3Q74A 2NDOA 5J9CA 2RM6A 1TRVA 1QGVA 2VCTA 2YWIA 4YQVA 1WMJA 1OC9A 3ZFLA 2WB9A 1TU7A 4BVXA 4XRDA 5HQPA 4QL9A 2AJQB 1PX6A 2PGTA 3C1SA 3L0HA 2E0QA 4V2MA 1TK8B 3F3QA 3O6TA 3KJYA 4GSNA 2JACA 2V32A 3WGXA 4K6XA 1N8JA 2I3YA 1A2LA 3GV1A 2GT5A 1K0BA 5DVBA 2YZUA 4MJEA 2EIQA 4JEDA 5DDLA 3ZMLA 3ZVJA 2O89A 4TR1B 3LXTA 3ZL5A 4TRXA 1YEPA 1C72A 2KUCA 4HZ2A 1GSFA 3N9JA 3VI7A 2DJ0A 1M7TA 2VL2C 4ML6A 3GIXA 1B4PA 1RW1A 2IPAA 4RI6A 5IM9A 3H93A 3FYGA 3LGCA 4EUYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1SL2B

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sequence length

structure length

Chain Sequence

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Chord Diagram

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