3S9FA

The structure of tryparedoxin i from leishmania major
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
SGVAKHLGEALKLRKQADTADMDSLSGKTVFFYFSASWCPPCRGFTPQLVEFYEKHHDSKNFEIILASWDEEEDDFNAYYAKMPWLSIPFANRNIVEALTKKYSVESIPTLIGLNADTGDTVTTRARHALTQDPMGEQFPWRDE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Tryparedoxin
publication title The crystal structures of the tryparedoxin-tryparedoxin peroxidase couple unveil the structural determinants of Leishmania detoxification pathway.
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania major
total genus 48
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3s9fA00
1V40A 4GQCA 2YNXA 4ECBA 5GZZB 2O7KA 3TKSE 5G1KA 4H86A 1E2YA 3HKRA 1YJ6A 1ILOA 1VF4A 1K0OA 4HS1A 1TTZA 3H79A 1V2AA 3UEMA 3CRUA 1AQXA 3DYRA 4IJ3A 2P5QA 2OE0A 3TUEA 4TXVA 1XXUA 2CVBA 1ZCPA 3GYKA 3US3A 2FNOA 2Z9SA 3CXGA 4ML6A 1EP7A 5DAKB 1Z5YE 3M8NA 5IO2A 1M2DA 1QFNA 2VCZA 14GSA 2YWOA 3QFAC 18GSA 2V2GA 5CREA 1ZZYA 1A0RP 2M72A 16GSA 1F9MA 2F8FA 1THXA 1SJ6A 1SL1B 2O87A 4BWQA 4PNGA 2I4AA 6GSUA 1XOAA 2HE3A 4EKZA 2HZFA 1TK0B 4TR3A 1SJIA 1X9MB 4F03A 1YY7A 4EC0A 1XOBA 2PVQA 3L4NA 3SBCA 4O92A 1FVJA 2RM5A 4PGTA 2GT6A 2MYGA 1ACVA 1B4QA 1ZL9A 2VD1A 3LJRA 1G6YA 1JZDA 2LSTA 2VM2A 3P90A 2JZSA 3FYGA 3CSHA 4RQRA 1K3OA 1FHEA 3CTFA 1A24A 3RPNA 5JWQB 1TP9A 1FO5A 4IQAA 4HUAA 13GSA 3GRXA 1M2AA 4I6XA 2B1LA 2RM6A 5J9BA 3J7Yk 4MZCA 3ZTLA 3LXTA 2IMIA 3BJ5A 2N5FA 5ELAA 2GVPA 2DC5A 3EWLA 2R2JA 4KGIA 1THOA 2OACA 5ECQB 3HVXA 4ILFA 3E0UA 2YV9A 1TW9A 2H8LA 2A2SA 4MJAA 3ZVJD 2GS3A 4HZ2A 1SYRA 4V1Ag 1XWAA 2AV4A 4LMVA 1AIUA 1B9YC 2GT5A 3A2XA 4TOPA 5D93A 3K8NA 1FB0A 1OE7A 2LJAA 3HVVA 2WB9A 3RHBA 3FRCA 3TJBA 3FEUA 5DJLA 1GL8A 3QAVA 1H75A 4WEYA 2C0GA 1YF1A 4FYCA 1XIYA 1PL2A 3UIWA 4JR6A 2R4VA 2GQKA 2LUSA 2IL3A 3JCML 2DBCA 2KUCA 1EWXA 5B8AA 3W8SA 4OO4A 3HJMA 2HRFA 3NZNA 3G9BA 3M3MA 3PINA 3C8EA 2P5RA 1YF0A 4ECJA 2H75A 3Q74A 4TXOB 3VWXA 3EVIA 5ABRA 2J9HA 3LYKA 3WD6A 5JWRB 1U87A 20GSA 2VL9A 4OFMA 5DVBA 5GAND 1JZWA 2MZCA 4RQXA 4YAVA 4EVMA 5A5KA 1QUWA 3H1NA 2IMDA 2O85A 3ISOA 2YWIA 3EU3A 2OBKA 2GTUA 3GL5A 2R3XA 4D73A 4GSTA 1EZKA 1DSBA 2EIRA 4POKA 3ZL5A 4WF4A 3F3RA 4E8EA 2X64A 1T4ZA 2L59A 5DQSA 1GSFA 3VWVA 2ES7A 4KSOA 2NVLA 2IN3A 3IR4A 3G7YA 2VUPA 2H6ZA 5DJMA 4J57E 1GSUA 4DSQA 2LRTA 4BVXA 2KP1A 4MA9A 1EEMA 2PU9C 2DIYA 3HCZA 2NPBA 3KD0A 3ZREA 4IVFA 1ZYEA 1Z6NA 3IAS2 3OR5A 1GH2A 1USBA 2VL3A 1SYXA 3TKPA 1WOUA 3P7XA 2L6CA 2H6YA 2DMMA 5HR0A 2GSTA 1KEBA 4K1FA 4XCSA 5ID2A 1ZMAA 1ERVA 2H74A 2QC7A 1GSYA 2VLUA 2HXKA 4JEDA 2HZEA 2XPEA 2JSZA 3QD9A 3IC4A 5HR2A 2CA8A 5C00A 5B8BA 2H1DA 4ZBDA 1JLWA 4EE0A 4AJ7A 1GLPA 3Q18A 3TKQA 2H72A 3FZ4A 5DQYA 5G1LA 2CV4A 3IA1A 4L0UA 5D9VA 4HJMA 1Z7PA 1GUKA 3QAGA 4KH7A 1RK4A 1BYEA 1FG4A 1WE0A 2HSHA 5AIVA 2JADA 3IRAA 1OKTA 4NPBA 5F07A 2F3MA 1PL1A 5ECHB 3GTUA 2CQ9A 4TR1B 1X9SB 1XCCA 3KCMA 1C72A 1K0BA 1NM3A 5C04A 3ZFBA 1TDIA 3N9JA 4OCEA 4ZL7A 2L5OA 3GUSA 4MH2A 1V98A 1GUMA 3EMPA 2VL2A 4NXIA 2F51A 3Q19A 3D4TA 3L78A 1DUGA 2DJ3A 4GF0A 3FY7A 3L9UA 1PRXA 2OBIA 2B5XA 5HQPA 1NW2A 4BA7A 1O81A 1Q98A 2YCDA 5EY6A 1GRXA 2KP2A 2P31A 4HQSA 4NV2A 4FYUA 5AGYA 12GSA 4G9HA 1GUHA 2CZ3A 2FA4A 2HFDA 5J3RA 3GL3A 3FR3A 2CT6A 3NOFA 2FCHA 1G7OA 2HI7A 2IFQA 3DVXA 5HFKA 4V2NA 2GGTA 1TXXA 2DSAA 1SL0B 2GQMA 4K7IA 1WPIA 3TJJA 4EL1A 5KN1A 2GSRA 4X43A 1OYJA 1X5DA 1F3BA 2FWHA 1TRVA 4P3YB 4GSNA 3D21A 4KX4A 1EV9A 5KEJA 1W89A 2B7JA 2H76A 3I69A 4DEJA 1BJXA 1A23A 3GKXA 2OJLA 2P0GA 4I2TA 4BVYA 2WFCA 4DSSA 2VLVA 3F9UA 4KA0A 2MMZA 4XS6A 4IN0A 2LTKA 2HSYA 2AJQB 2MBTA 2TRXA 4K9ZA 2TRCP 1TJDA 2VOCA 1TRWA 3IAM2 1B8XA 2IJYA 8GSSA 3MDKA 4JE1A 1JLVA 1N2AA 2YZHA 4RI7A 4AJ6A 1U3AA 3HA9A 1TRUA 4IELA 3DKSA 3EURA 2YN1A 1AUCA 4MK3A 2H71A 5HR3A 2H0HA 4WBRD 1OC9B 5JCGA 1JZRA 4I2UA 2ZNMA 2C4JA 3IDVA 1I9DA 4ZL8A 4FO5A 1K0MA 3MSZA 2F8AA 3C1RA 2PGTA 2LQQA 1EV4A 5F06A 1BX9A 5CRWA 1FAAA 4Q5FA 3EINA 1QGVA 1GSSA 4PXOA 4KW6A 3D22A 5HFGA 3QAWA 4YQVA 3VK9A 10GSA 1XFLA 1G7EA 2YJHA 3GV1A 2FWEA 4L8EA 3TOTA 5GSSA 2YV7A 1PMTA 1TU7A 2FWGA 1KNGA 1K0CA 1EEJA 3KTLA 1AW9A 3BCIA 2E7PA 3RBTA 5IPHA 3ZFLA 1PX7A 2I9HA 4KCEA 2CAQA 5EL8A 4K6XA 1WIKA 4DSRA 2YANA 3QFBC 3HJPA 1OC8A 4G10A 4NMUA 5DCHA 5J41A 1K0DA 2ON7A 4YQMA 3ZZXA 4BPYA 2AYTA 3A2WA 3W6GA 2LNSA 1NHYA 4FIWA 4AGSA 4GCIA 4LL4B 2IPAA 4MZWA 2D2ZA 1B4PA 4K7OA 2EIOA 2G2QA 1H4OA 3HD5A 2MBSA 2FHEA 2HT9A 3KXOA 3TRPA 4KB3A 2AB6A 1KTEA 2L4QA 3UOMA 1VGLA 1SU9A 3VI5A 5B6MA 1URMA 1XW6A 2VCVA 3ME8A 3RHCA 2E0QA 5DAKA 2A2RA 5D9WA 5CO3A 5G2ZA 2CVKA 5IMDA 22GSA 3GKMA 4WR4A 3ERGA 2PVOC 3LGCA 4IW9A 5L71A 1OVNA 1ZYQB 5J5NA 5LD0A 1TOFA 3F6DA 3MAKA 4POMA 2NDOA 2PBJA 3RPPA 5E4WA 5DALB 3VI7A 2YPMA 4O32A 3BCKA 1V58A 4ACSA 1HNCA 4HEA2 1A8LA 3A3TA 3TB2A 2DJJA 4XRAA 2OA7A 3FZAA 4Q5RA 4GWRA 3IHQA 3O6TA 3ZIVA 4QL9A 3TOUA 3TGZA 2L4CA 4POLA 1S3CA 3TRXA 3L9VA 4ECIA 1UC7A 3IOSA 3APOA 1E6BA 4ZBAA 3HDCA 2E2GA 3CRTA 3D0ZA 4JBBA 1AC1A 3KMOA 6GSVA 2QKEA 1EOGA 2JACA 4J56E 2REMA 1BQ7A 3UL3A 1OKDA 1RQMA 3GIXA 5COHA 5CAXA 2IWTA 3U6VA 1MD4A 5G5FA 4ISDA 4XS4B 3TKSA 4XS1A 6GSSA 4DVCA 4EUYA 3L9SA 4MCUA 1JZOA 3GN3A 1HYUA 1GULA 1S3DA 1G0TA 1JFUA 2YZUA 3QOUA 3C7MA 2MMAA 2VCQA 4X1UA 3F4RA 2X8HA 3GKKA 4WR5A 3C71A 1GSQA 3WT1A 2PWJA 5IMAA 1OE8A 1YDKA 1ST9A 2VL2C 2LJRA 1GNWA 4ZB9A 1IYIA 1U3IA 4OWYA 4IBPA 1BG5A 3KM6A 3PH9A 3UJ1A 1XWKA 3ZIJA 4OFNA 2JZRA 3G7IA 3F4SA 4WXTA 5ECSA 2H1GA 1TI3A 5INYA 1SKRB 5H5RA 4MF7A 1DE1A 2H1AA 1U6TA 1YKCA 2OE1A 4EF0A 4K8MA 2B7KA 1PX6A 5ECRB 4OD7A 4KSMA 5DCGA 6GSXA 3KGKA 4V2MA 4JR4A 1J9BA 4PURA 3BOAA 1MD3A 4POBA 3F3QA 4CDOA 1GNEA 1V9WA 4KNDA 2JL4A 4JU5A 5ECKB 4F2IA 5EPFA 3Q6OA 1YKAA 1CQHA 1HNBA 4K7NA 1AQVA 1HNAA 2GZZA 2RUFA 3EU4A 2WULA 4IJIA 9GSSA 4NHZA 4AJ8A 1SK0A 1UN2A 1YZXA 1MDJA 4GXZA 5D9XA 4F0BA 2VM1A 2M46A 3M9KA 2V32A 1EOHA 4PQ1A 2WCIA 4PUAA 3KJYA 4MP4A 1ERTA 2VCXA 5CYYA 1LJRA 1T7PB 3EYTA 2DLXA 1Q4JA 1QQ2A 2LEGA 4HZ4A 1FW1A 5GAPD 3LG6A 2B6MA 4K0GA 5FWGA 2LRCA 1PN9A 2B5YA 4IGJA 4O7HA 1TKDB 3MNGA 2PMTA 2K6VA 1XBSA 2YWNA 1FOVA 1GWCA 3CSJA 3FR9A 2FA8A 2BJXA 4LA1A 3KTBA 5HR1A 3A5WA 1M7TA 1PSQA 2AHEA 2LQOA 2XPDA 3UVTA 3ZMKA 3D5JA 4XRDA 1PKWA 3C73A 3GA4A 3ZRDA 2FLSA 2WJUA 5ECLB 1VF2A 4IP6A 4MPGA 1JHBA 1I5GA 4ZBBA 5IQYA 4EDZA 1GLQA 1OC3A 3QPMA 2FD3A 3GURA 2CX3A 4IS0A 4WETA 4MPFA 4ZXGA 2NBSA 3DMLA 1GSEA 5F8BA 3ERFA 2R37A 3ZYWA 1SKSB 1F6MC 2V6KA 19GSA 3LWAA 3FZ9A 1YEXA 3WYWA 1M0UA 2GZPA 4YQUA 3UBLA 4KE3A 1T8EB 1K0NA 3WGEA 4PQIA 3LORA 1EP8A 2VO4A 4FH8A 4HU7A 1G6WA 2V41A 1UA5A 5G31A 3CTGA 2RIIA 4Q5QA 4TR1A 1FVKA 2LRNA 4GLTA 2I81A 1RW1A 1TK5B 2H66A 2X8CA 4BWSA 2DIZA 4WBJA 3BBYA 4MF6A 4HI7A 4ZILA 3TRQA 5EVOA 1TRSA 3F63A 2VCWA 4MZBA 4F82A 4ID0A 3QDNA 3IXRA 3VWUA 1PKZA 4J2FA 3VLNA 5ECNB 2XBIA 4XHMA 2K8VA 5A4UA 1WRYA 4ZL9A 2FWFA 4MMMA 2DJKA 5LNKe 4HQZA 4I5QA 1SL2B 1A2MA 3APQA 5AIXA 1ZOFA 2H0GA 2F9SA 4PQHA 5F0GA 1N8JA 1GP1A 4L5OA 3E3EA 1J08A 4NHWA 3ZLPA 2L5LA 3C1SA 1A0FA 3EMXA 4TW5A 2B5EA 3A2VA 2KLXA 2CAIA 5JCWA 2JSYA 1XW5A 3WGDA 1U88A 5E59A 1M9AA 5DBQA 4TVEA 4Z7XA 4TRXA 4N0ZA 4EDYA 4I8BA 4GTUA 1R26A 2HRNA 3QCPA 1Y6EA 3P2AA 2WGRA 3TCOA 4JZQA 2FGXA 3LYPA 2X8GA 2J23A 2VIMA 3QMXA 1YQ1A 2DJ1A 2CX4A 1XWGA 5LCZA 3DRNA 2C1YA 3EE2A 4KUNA 3IPZA 4NWYA 5A4WA 3APSA 1W4VA 2O8VB 5IOWA 3M0FA 1PA3A 1SD8A 3TKSC 5ECOB 4WKWA 1GTUA 3GH9A 2VD0A 3ZMLA 1K3YA 1R5AA 5ECIB 1SKWB 4O5RA 3J7Yb 1Z6MA 3I9V2 3EC3A 1OC9A 2X99A 4ZIJA 4KDUA 3R2QA 1ON4A 2I3YA 1A2JA 3VFIA 1J0FA 4G19A 3UVHA 1R5PA 1ML6A 3HZ4A 4V1Ap 3IE3A 6GSWA 1B9XC 4BL7A 3UAPA 5H5SA 3IBHA 5IM9A 2GZYA 1F2EA 4FYBA 2DJ0A 3F8UA 1XW9A 2WRTA 1WWJA 3MWHA 2OADA 4TN8A 4MABA 4I97A 1NSWA 1DE2A 2CZ2A 1M99A 5CRHA 3CMIA 3GFKA 3TKRA 1LU4A 3HVSA 2C0EA 2YJ7A 3V1WA 5CP1A 4TKYA 3GSTA 3FKFA 1MEKA 3FK8A 2KHPA 2WZ9A 5FHIA 1ZGNA 1NHOA 3FHKA 1QMVA 1K0AA 5KN0A 2HLSA 5G30A 1VRSD 3IV4A 3M9JA 1LBKA 3BD2A 2DMLA 3KZQA 1SENA 2A4VA 2I1UA 1ERUA 3KMNA 1TI1A 2H0IA 4XTSA 3ME7A 1AXDA 1T3BA 4K2DA 2PERA 2H70A 4KDXA 4V2LA 5ECPB 5DDLA 4WF5A 2C0FA 2H01A 1DBYA 2GQLA 5ENUA 1V57A 3NIVA 4KAEA 4LL1B 2YOIA 2HYXA 4MH3A 1PGTA 3N5OA 4IQ1A 4PX1A 4YH2A 1VF1A 3FZ5A 4D73B 5B7CA 4NAXA 3GKNA 4RI6A 2BTOT 4OMVA 1T1VA 4NV5A 4MJEA 3CSIA 2ALBA 3LEFA 2CVDA 3H93A 4G2EA 1SK2A 2LNTA 3SWLA 4ZB8A 2H6XA 1PD21 2H1BA 3UBKA 4EO3A 2WS2A 2XBQA 6GSYA 3DGQA 1SD9A 4OFTA 5D73A 2K9FA 3FR6A 1CQGA 2E2MA 3UMAA 3GSSA 4JRRA 1Z9HA 2ZUPA 4IHUA 3P8WA 1S3AA 1B48A 3S9FA 5B6NA 2VAFA 3TJFA 4MLYA 1HQOA 5FT3A 1SJZA 2K8SA 1KBNA 4ECCA 2H73A 5JWOB 2ZCTA 5DALA 4TR0A 2AAWA 2EC4A 5IIZA 4MF5A 5ID2B 3F6FA 2L57A 1WJKA 2L6DA 5CRDA 3QR6A 1T00A 1PQNA 1TK8B 2IIYA 1O8WA 2HZEB 2HNLA 3D4MA 1XPVA 1X5CA 3ZVJA 2JU5A 17GSA 4GQFA 1GTAA 2K18A 2IMFA 4N30A 5J4UA 4KCAA 3GNJA 5A4VA 3KH7A 5GSTA 3F0IA 3DEXA 2YWMA 4AF2A 2WDUA 2BMXA 2QGVA 3KP8A 2M80A 3HZ8A 3ED3A 3DIEA 3GX0A 4XS4A 4EXJA 4CHSA 1Y25A 3VPTA 2H30A 1EGOA 1YEPA 5JCUA 3GH6A 1Z3EA 3LQ7A 5IMCA 2AUVA 3ERWA 1AAZA 4TXOA 4GSSA 3I6AA 1UVZA 3F4TA 1MDKA 2PUKC 5IO0A 4F9ZA 2ON5A 3GTUB 4IP1A 3FW2A 1M2BA 1GSDA 1WMJA 2V1MA 3D6IA 3HXSA 2QSIA 4XIHA 4QL7A 2OE3A 3O3TA 3PGTA 4LLRA 4HU9A 3RDWA 5IMVA 1O7UA 3CBUA 3M1GA 1GTBA 3H4KA 3I43A 4ML1A 1Z7RA 3IK9A 2B1KA 2OKAA 3U5RE 3LXZA 2O89A 4Q5NA 2IMEA 5F05A 5ECMB 3TJGA 1O73A 3DWVA 2GSQA 3VPQA 7GSSA 2IFQB 1MTCA 3TDGA 4L0WA 3DVWA 6GSTA 1EGRA 2NTOA 1XVQA 2C3QA 4MDCA 3WGXA 3HHVA 5IMZA 3HJOA 1R4WA 4HJ2A 4PNFA 2RLIA 1O85A 1MDIA 3W8JA 2KOKA 4HOJA 2R6KA 1QXHA 3H8QA 2R5GA 1VF3A 2XC2A 1O8XA 2C8UA 3GMFA 4CW9A 3DD3A 4TR4A 1X0RA 2FUG2 4DSSB 4N11A 3GHAA 1A2LA 1ABAA 1M9BA 1F37A 2DJ2A 4X0XA 2VLTA 4YAPA 3ZITA 11GSA 4OO5A 2TIRA 3HY2A 1BEDA 4HDEA 4ULXA 2MMOA 4N0VA 1TU8A 2GSSA 5CNWA 1SK1A 4F0CA 5G5EA 1O6JA 4QQ7A 4E8HA 4OCFA 2MMNA 4MJCA 5KN2A 3RAZA 4RUVA 1BAYA 5D8IA 2IMKA 4ZB6A 1R7HA 4KDYA 2FY6A 5CRGA 5IPGA 4IKHA 5KN3A 2GLRA 1XVWA 5H5QA 2RUEA 1K3LA 2VCTA 3TJKA 1XWBA 2XHFA 1T4YA 2LKUA 1WP0A 4K0NA 2JZTA 3KIJA 2GDRA 2LS5A 2PPTA 2N5BA 3AY8A 4L5LA 1GTIA 3KH9A 2YP6A 3DXBA 5AN1A 2H19A 2G0FA 2N5AA 4LMWA 3IK7A 2C3TA 3G7JA 5HFIA 3LFLA 1AQWA 3KP9A 5D96A 5IOXA 2C0DA 3CYNA 3O76A 1A8YA 2EIQA 4PUFC 3LSZA 3PR8A 1HD2A 2LV3A 1XWCA 5D9TA 2B3SA 2C3NA 1ERWA 4MJBA 5IMFA 2PN8A 5ELGA 3VWWA 3HYPA 3KEBA 3E9JB 1QK8A 2LJKA 3GX8A 3VURA 3WT2A 1F3AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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