3SBCA

Crystal structure of saccharomyces cerevisiae tsa1c47s mutant protein
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
VAQVQKQAPTFKKTAVVDGVFDEVSLDKYKGKYVVLAFIPLAFTFVSPTEIIAFSEAAKKFEEQGAQVLFASTDSEYSLLAWTNIPRKEGGLGPINIPLLADTNHSLSRDYGVLIEEEGVALRGLFIIDPKGVIRHITINDLPVGRNVDEALRLVEAFQWTDKNGTVLPCNWTPGAATIKPTVEDSKEYFEAANK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin TSA1
publication title Disulfide biochemistry in 2-cys peroxiredoxin: requirement of Glu50 and Arg146 for the reduction of yeast Tsa1 by thioredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 64
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3sbcA00
1AW9A 5J41A 3H79A 3E0UA 5D9TA 1PKWA 4N0VA 2YJ7A 1WWJA 5G31A 3E3EA 3VLNA 3F6FA 1ZGNA 4KSMA 1JZDA 1O7UA 1VRSD 3UARA 2VCQA 1Z7PA 4GLTA 4RI7A 3IAM2 3BD2A 1EOHA 1ZOFA 5HQPA 2OE0A 2A2RA 5J9BA 2IFQA 2LTKA 1F9MA 2I4AA 1OC8A 5DQSA 5ECNB 2TIRA 4MA9A 5IOXA 3WGEA 1V40A 4MCUA 4IS0A 2RUEA 1G7EA 2MZCA 5D9VA 1JZOA 2JL4A 4HDEA 2M80A 4PGTA 2XPEA 1SL2B 2LSTA 3GKKA 1GL8A 1MEKA 4K1FA 3ME7A 2OE3A 1U3AA 3LWAA 1O81A 2VL9A 2CVKA 2H1BA 3TJKA 1M2AA 2E2MA 2PBJA 3GA4A 2I3YA 4XRAA 5IMAA 4JZQA 4RUVA 3LG6A 4HQZA 2J23A 4MDCA 2M46A 1N2AA 4IVFA 4QL7A 1QFNA 3KP8A 3QAGA 3QDNA 11GSA 3M1GA 5ECQB 4PQHA 4YQUA 3L0HA 4ZBAA 3A3TA 4MF6A 22GSA 1QMVA 3L9VA 2EIRA 4Q5QA 3ZMLA 1U87A 2GSTA 3FZ5A 4F2IA 1LBKA 4V1Ag 2OADA 2JACA 3FZ9A 3FR3A 2C3TA 2GVPA 5G5FA 3GMFA 2JZTA 1OE8A 2KOKA 3RHCA 5ELGA 2CZ3A 2MBSA 2F51A 2VO4A 1SL1B 4LL4B 1W4VA 1Z3EA 2B6MA 3FY7A 3KJYA 5ECHB 1THXA 2CQ9A 4OCFA 1NHYA 3N9JA 1SKSB 2CAQA 3TRXA 3GV1A 1OC9B 3D4TA 2WFCA 2MMOA 4K6XA 4TOPA 2K8SA 4WF4A 3EWLA 4MJEA 4WEYA 3EMXA 3M9KA 2RM5A 2QC7A 2VOCA 2H75A 3PGTA 3GX0A 2A4VA 5ECIB 4ZL9A 3EURA 4JE1A 2D2ZA 2H66A 3HVXA 2P5QA 20GSA 3TJGA 5GSTA 2XBIA 5B8BA 4BL7A 1Y6EA 2NPBA 1T4ZA 5DJLA 3APQA 2BJXA 2VM1A 4ZBBA 1YEXA 3TCOA 1V57A 2HZEB 2WDUA 1S3CA 2C0GA 3W8SA 3UIWA 2H0HA 1A2MA 4L5OA 2ES7A 5DQYA 2R2JA 3KTLA 3EMPA 4NAXA 5G30A 3MSZA 2WULA 1GLQA 3VI5A 1A0RP 4WKWA 1XWCA 3ISOA 3VK9A 1PKZA 1DE2A 3PR8A 2V32A 2IMKA 1A2LA 1T00A 2GS3A 5DAKA 3IK7A 1TI1A 1SL0B 5ID2A 5H5QA 4Q5RA 1TU8A 2OJLA 2CX4A 3SWLA 9GSSA 5JCWA 1GTIA 5DCGA 1BQ7A 2C1YA 1URMA 3F8UA 4Q5FA 1TDIA 3HHVA 4Z7XA 5AGYA 1K3YA 1J0FA 1ZZYA 1EOGA 1KNGA 1TK8B 4NWYA 1X5DA 3LQ7A 3A2VA 4TRXA 5F0GA 2TRXA 1MDJA 2B5YA 2C0DA 2WCIA 4I2UA 2H0IA 5B6MA 4XCSA 1AQVA 3LSZA 4PQIA 2H8LA 3TOUA 2AHEA 1Z6NA 2PPTA 3V1WA 1SKRB 1A8YA 2R6KA 2HFDA 4G10A 2XC2A 3GHAA 1AIUA 4HJMA 2MMZA 3L78A 3F4TA 2N5AA 1GNWA 1YF1A 3I6AA 2PVQA 3M0FA 1XZOA 5HFIA 1C72A 4QL9A 4K0GA 1MDKA 1QGVA 2VCTA 3CMIA 2LV3A 2CA8A 2H30A 5CAXA 1J9BA 4I8BA 4WETA 2M72A 3VURA 3A5WA 1FG4A 4GQCA 3LORA 1W89A 1R4WA 1SJZA 3DGQA 4YQVA 2VLTA 1ZMAA 4TR1B 1OC9A 5IMCA 3HKRA 4ECIA 3GURA 3FKFA 5D93A 4O5RA 3D5JA 4KSOA 3BOAA 1B4QA 2RLIA 5CRGA 1K0OA 4POKA 5JCGA 1AQWA 1HNCA 5FWGA 4WR5A 3EC3A 3WT1A 1KEBA 1GULA 3DWVA 3W6GA 4AJ7A 4PXOA 4LL1B 4XS4B 2YP6A 1WOUA 3IOSA 3VPQA 3GTUA 5HFKA 1X9SB 4KB3A 1FVJA 1FVKA 3VWWA 4ZILA 2OACA 4IW9A 1WMJA 6GSXA 3HY2A 2J9HA 2FNOA 2P31A 2KP1A 3GUSA 5H5SA 1UN2A 3ED3A 4ZB8A 4NHZA 3HCZA 2B3SA 2FGXA 3TKPA 3TKSA 4F9ZA 2H6YA 5B8AA 2HT9A 1TK5B 2CVDA 1OVNA 3S9FA 6GSVA 1H75A 3CTGA 1OYJA 1QUWA 1OAZA 1MTCA 2OBKA 1SJIA 2PVOC 4IBPA 2PMTA 5ECMB 1TW9A 2K6VA 4L8EA 2L4CA 2FY6A 4D73A 3KP9A 5B7CA 1VF2A 2DJ2A 4K7NA 3GSTA 3EE2A 2O8VB 1EV4A 2OKAA 3GN3A 2WJUA 3O6TA 1QK8A 3QR6A 1HQOA 1JHBA 2VLVA 4X1UA 5EPFA 3UBLA 1K0NA 1F6MC 2B7JA 1T8EB 1DE1A 1I9DA 2Z9SA 2YN1A 4MZWA 1TRUA 2HSHA 2VM2A 1XXUA 1N8JA 1EEJA 1F3AA 2XBQA 4KH7A 3CXGA 4XS6A 3IAS2 6GSTA 1WPIA 3BJ5A 3G7JA 3F4RA 2RM6A 3WYWA 1M99A 4YAPA 3R2QA 2XPDA 1V2AA 2P0GA 2DMMA 3JCML 1JZWA 3ERFA 5DALB 2VD0A 3GIXA 2O87A 5KN3A 2IPAA 3TRPA 2CV4A 2G0FA 1BG5A 4IHUA 4POMA 3ZVJA 4E8HA 2VCVA 1B8XA 2KLXA 2QKEA 1X9WB 3FK8A 3IBHA 2LJAA 1AAZA 4XRDA 2I9HA 4GSNA 1DSBA 2V1MA 5IMZA 4J56E 1XOBA 5C00A 2NTOA 4X0XA 1M0UA 1VGLA 1PN9A 1E6BA 4K2DA 1GSYA 2VAFA 4WXTA 2HLSA 1WIKA 1QQ2A 1XWBA 3TKSC 2C8UA 2C3QA 1GP1A 4PX1A 1BYEA 4V1Ap 3A2WA 1ZL9A 3KH7A 3KGKA 2WS2A 2FWFA 1T4YA 4GTUA 3ZTLA 4EO3A 3GL5A 3UVHA 3P90A 3EU4A 3M3MA 4IP1A 2VUPA 4DSSA 3C1RA 3NZNA 2H76A 1K0MA 2H19A 6GSUA 5LNKe 1U88A 5IIZA 4EVMA 2X99A 4MH3A 3KH9A 2LJRA 4NHWA 3ZRDA 1JZRA 2CX3A 4OWYA 2PWJA 1A23A 2BTOT 1ABAA 5HR3A 2IIYA 4Q5NA 1PA3A 5DAKB 5A4UA 1FAAA 2V2GA 1YEPA 3UAPA 5ID2B 1RK4A 5HFGA 5ECPB 3FEUA 4E8EA 3HJPA 4O32A 4EF0A 2L5OA 3ZL5A 3DIEA 3KZQA 4IP6A 2GTUA 1F3BA 4I2TA 3LGCA 3VWUA 1CQHA 2X8HA 1SK2A 3PH9A 3K8NA 1FOVA 2CZ2A 3UEMA 3FYGA 3DXBA 4J57E 2YANA 2G2QA 3ZFBA 2B5XA 4JR4A 1X0RA 4KA0A 1FB0A 3FZ4A 3RHBA 4IQ1A 4BWSA 3NOFA 2YJHA 5D9WA 2MMAA 2C80A 2YCDA 16GSA 2EIQA 3KCMA 2GSRA 4L5LA 5DALA 1HD2A 2JSZA 5LD0A 2B1KA 5IPHA 2LKUA 4CDOA 1K0CA 2F8AA 4OO5A 4ZBDA 3LYKA 3PINA 2GSSA 1XWGA 1A24A 4LMVA 2L5LA 1WP0A 4K0NA 1TKDB 2HRFA 3H4KA 5HR1A 4FH8A 3F3RA 3HJOA 3Q74A 3ZREA 1R5AA 1UVZA 2AAWA 1YKAA 2LJKA 2E0QA 17GSA 2WGRA 3UOMA 1TJDA 3KEBA 5GZZB 2MBTA 4DSQA 5ENUA 18GSA 3CRUA 1K0AA 3GTUB 3DYRA 4NPBA 3U6VA 4DVCA 2YWMA 3LXTA 3GH9A 2H6XA 2YV9A 1WE0A 4MPGA 1WRYA 2L6DA 4TR0A 4AJ6A 1FHEA 3OR5A 3GKNA 3KXOA 12GSA 4HU7A 3NIVA 2PGTA 4F82A 2LRCA 2ON7A 5CP1A 2GZYA 5F06A 1JLWA 3ERWA 3F63A 1ERVA 3LEFA 5JWRB 4TXOA 3VFIA 3VPTA 2F3MA 1DUGA 1M9BA 2IJYA 2V41A 1RQMA 3HD5A 3D0ZA 3LJRA 2O7KA 2NDOA 4KX4A 4O92A 13GSA 3ZIJA 1AQXA 2X8GA 2YNXA 2DIZA 2KUCA 2LEGA 3J7Yb 4D73B 2JADA 3DD3A 4HS1A 2DJKA 4HU9A 5A5KA 2VCWA 3HA9A 4O7HA 4KGIA 1O8WA 1XWKA 3H8QA 5EVOA 2H73A 5A4WA 3HVSA 2VL2A 3Q6OA 4LA1A 1R5PA 4I97A 3D21A 5JCUA 5AISA 1TK0B 1NM3A 1XW6A 4V2MA 1Z6MA 2I1UA 2L6CA 2IMEA 2XHFA 4H86A 2YWNA 3IR4A 3VI7A 2KP2A 2YOIA 2YWOA 5H5RA 2DC5A 3D6IA 1EGOA 2HSYA 3QPMA 4OMVA 3C8EA 3F4SA 1WJKA 2HXKA 4XS1A 3KMNA 5INYA 4KCAA 5CO3A 5ECOB 5F05A 2B1LA 3LFLA 4HI7A 4I5QA 4NV5A 2OE1A 5GSSA 1SYXA 5CYYA 4AGSA 4IJ3A 1PMTA 2CT6A 1GWCA 1BEDA 4BVYA 4HUAA 2JZRA 1SD9A 1A8LA 2QSIA 3IK9A 2GQMA 1USBA 3G9BA 2LUSA 1T1VA 2PN8A 2K18A 4MJCA 4ZL8A 1SYRA 1T3BA 3TKQA 5D96A 3DEXA 3GKMA 2TRCP 1QXHA 1TU7A 14GSA 3IC4A 1IYIA 3CSHA 3QMXA 4CW9A 1NHOA 3A2XA 10GSA 3Q19A 4ISDA 1R26A 2REMA 4TVEA 4DSSB 4G19A 2FA8A 2N5BA 1EWXA 1O8XA 1TXXA 3FW2A 3MAKA 1OE7A 4KNDA 2FD3A 3APOA 1SENA 4TXVA 2DLXA 4KDYA 4ML6A 2FHEA 3ME8A 3J7Yk 2V6KA 2X8CA 1SKWB 2H1AA 1X5CA 3EINA 3I69A 4MZBA 5IMFA 1GSSA 2LQQA 1FO5A 2YZUA 2H74A 3F0IA 2GT5A 4FYBA 3TB2A 3APSA 1VF3A 4YQMA 1VF4A 2VL2C 3IXRA 4RQRA 5LCZA 3M8NA 5J3RA 2DBCA 4FYCA 5KN1A 3US3A 4N10A 4ZB6A 3TKSE 4AF2A 4MH2A 4V2LA 1O85A 1YJ6A 1SJ6A 1S3DA 1T7PB 5DVBA 1KTEA 1RW1A 5ECRB 1PQNA 3C7MA 3TKRA 1OKTA 1GSFA 2GZZA 2WZ9A 1JFUA 2PU9C 4TW5A 3DVXA 1GTUA 3GYKA 4G2EA 4YAVA 1G6WA 3G7IA 3UMAA 3IA1A 1M7TA 1PL1A 1AXDA 4KDUA 1GUHA 2H0GA 4GF0A 1AUCA 4EUYA 2LNSA 4MMMA 1B9YC 2B5EA 3FZAA 2ZUPA 3I9V2 1X9MB 3MWHA 4JU5A 2LNTA 5ELAA 5JWOB 3O3TA 3IV4A 1K3LA 4HEA2 1YZXA 2AB6A 2JSYA 4F0CA 1GSEA 5GAPD 2C3NA 1O73A 1R7HA 1PGTA 1M2BA 1O6JA 2VLUA 2CVBA 5G5EA 4RI6A 1U6TA 1LU4A 5CRHA 1CQGA 3C73A 1M9AA 2ZNMA 5D73A 4ZL7A 1XW9A 2O89A 2X64A 2KHPA 2LS5A 2DJ1A 1K0DA 1HYUA 3ZLPA 3TJFA 6GSYA 4ILFA 2H1DA 4ZB9A 5ECSA 1ACVA 5F07A 5J4UA 3C71A 4GCIA 2K9FA 2YWIA 1PX6A 1GTBA 1KBNA 1A0FA 5G1KA 3ZVJD 5DCHA 5IMDA 3KM6A 2FUG2 5F8BA 3GFKA 1YF0A 5ECKB 5B6NA 3U5RE 3F9UA 3QOUA 3TUEA 5KEJA 1XPVA 1GUMA 4GWRA 1H4OA 4K7IA 4TXOB 3VWXA 2H70A 3DVWA 1BAYA 1ERUA 2IMIA 5CRWA 3TGZA 2GQLA 1VF1A 2OBIA 1Y25A 4GSSA 4JBBA 2NBSA 4JEDA 3QD9A 4MF5A 3HZ8A 4WBJA 1XW5A 4LMWA 3WGXA 1SD8A 1JLVA 4IKHA 2C4JA 2HNLA 3ZMKA 2C0FA 1FB6A 4ACSA 2IWTA 4PURA 2A2SA 4MK3A 4ZXGA 2H01A 3LXZA 1THOA 4MJAA 3BCIA 1K3OA 2O85A 2E2GA 2HE3A 3KTBA 3P2AA 1TRSA 1XVWA 3KIJA 2OA7A 3QAVA 2WRTA 2JZSA 3HYPA 3GNJA 2E7PA 4ECJA 4BA7A 1PRXA 4GSTA 1OC3A 1ZCPA 2H6ZA 4N11A 5DJMA 4JR6A 5FT3A 2LRNA 5AN1A 4EDYA 1IYHA 4GXZA 1GRXA 1MD3A 4ULXA 3BCKA 4ECCA 5A4VA 4K7OA 3TJBA 1TP9A 1B4PA 5GAND 1TOFA 2DIYA 2IMDA 5IO2A 3QFBC 1NSWA 4G9HA 3CSIA 4WF5A 3C1SA 1V9WA 4IJIA 2L59A 4OFTA 2V6OA 1TTZA 4JRRA 5COHA 4N30A 2MMNA 2R37A 2DJ3A 4DEJA 2R4VA 4L0UA 2FWHA 2GZPA 1GNEA 4MJBA 4XIHA 1ERWA 5EL8A 4QQ7A 4CHSA 3RPNA 4OFNA 3M9JA 2H72A 1EP7A 1OKDA 4FIWA 3HZ4A 3ZFLA 2GQKA 1S3AA 3SBCA 5EY6A 4OO4A 4ID0A 5IM9A 2F8FA 2N5FA 3RBTA 4EL1A 5E4WA 3GRXA 4MABA 1EEMA 3IRAA 3IPZA 3H93A 1X5EA 3L9UA 4I6XA 3F6DA 4ECBA 2YZHA 1V58A 4K8MA 1ERTA 1HNAA 2IMFA 2GSQA 4EDZA 1YY7A 1V98A 3WD6A 2GGTA 3L4NA 8GSSA 4EE0A 3FHKA 1XIYA 4NMUA 2FA4A 2CAIA 3GX8A 3HJMA 1GSQA 2HRNA 4MZCA 2H1GA 1M2DA 4PUFC 1GTAA 5G2ZA 1YDKA 2YPMA 3ZYWA 1Z7RA 3IDVA 3DMLA 2H71A 4POLA 4MP4A 1MD4A 5ABRA 4XHMA 5L71A 2GT6A 4OCEA 4BPYA 2GDRA 2L57A 5CREA 3LYPA 1Z9HA 2DJ0A 5IO0A 4GQFA 1B9XC 1EV9A 1TRVA 2IL3A 2IN3A 5E59A 1XCCA 1U3IA 1B48A 3I43A 1PSQA 4RQXA 4PUAA 3UJ1A 1LJRA 3HXSA 1XVQA 1ML6A 2B7KA 2EIOA 4EC0A 1A2JA 2VCXA 3ERGA 5CNWA 3EYTA 2VL3A 1EGRA 3ZIVA 1BX9A 1ILOA 2PERA 3ZZXA 3D4MA 4LLRA 3UBKA 1XWAA 4NV2A 1SK0A 4HQSA 5J9CA 3N5OA 3TOTA 4KUNA 5CRDA 1GLPA 1G6YA 4PQ1A 2DSAA 3W8JA 5DDLA 3RPPA 3P8WA 2R5GA 3GH6A 4KAEA 5C04A 3P7XA 3MNGA 3E9JB 3EVIA 4FYUA 5IMVA 2R3XA 5FHIA 4ZIJA 1SU9A 2RUFA 1ON4A 3CYNA 4NXIA 2L4QA 2LRTA 3TJJA 5ECLB 1EP8A 1XOAA 1F37A 3UVTA 3O76A 3GKXA 1HNBA 1GSUA 2YV7A 3L9SA 5DBQA 2ZCTA 5KN0A 1I5GA 4AJ8A 4DSRA 1XBSA 4L0WA 1F2EA 7GSSA 1GH2A 3GSSA 3HVVA 19GSA 3UL3A 2QGVA 5D9XA 4IN0A 4P3YB 2AUVA 2HZEA 2VD1A 4GRFA 2HZFA 3D22A 2I81A 5HR2A 2K8VA 1K0BA 1PL2A 3BBYA 3H1NA 4HZ2A 4F03A 4PNFA 2GLRA 1UA5A 5G1LA 3IE3A 1TI3A 2FWEA 1Z5YE 3EU3A 1GUKA 1E2YA 4X43A 4EKZA 4TN8A 2IFQB 1MDIA 3DKSA 3IHQA 4PNGA 4EXJA 3KMOA 1NW2A 2DMLA 3VWVA 5KN2A 2VCZA 2FWGA 1G0TA 2PUKC 4F0BA 4HOJA 3FR6A 4BVXA 2VIMA 3DRNA 1AC1A 3CBUA 2C0EA 5IPGA 3F3QA 3TRQA 2ALBA 2DJJA 3TDGA 5D8IA 5JWQB 2LQOA 5HR0A 4J2FA 2FCHA 4KW6A 4YH2A 4N0ZA 3CTFA 5IOWA 1YQ1A 3MDKA 2ON5A 3RDWA 2JU5A 2RIIA 3QFAC 2HI7A 4OD7A 1G7OA 4IGJA 1Q4JA 2BMXA 3Q18A 4KE3A 1SK1A 3RAZA 5IQYA 1PD21 2AJQB 1TRWA 4K9ZA 5J5NA 6GSWA 5AIXA 4KCEA 4MF7A 4HJ2A 1EZKA 2FLSA 4V2NA 4MLYA 4WBRD 1PX7A 4XTSA 3CRTA 3QAWA 1J08A 4IELA 4KDXA 3AY8A 4HZ4A 4TR3A 4TR1A 3WT2A 3WGDA 4BWQA 3FRCA 1DBYA 3KD0A 5AIVA 1YKCA 4FO5A 2AYTA 2NVLA 2AV4A 3HDCA 4IQAA 2WB9A 6GSSA 1ST9A 2HYXA 2P5RA 2F9SA 3FR9A 3G7YA 3ZITA 4TKYA 4ML1A 4TR4A 4MPFA 1UC7A 4POBA 4XS4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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