3TJBA

Crystal structure of wild-type human peroxiredoxin iv
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 56
structure length 170
sequence length 170
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjbA00
2B7KA 5HFKA 2N5FA 4K2DA 3Q74A 4MZBA 3AY8A 1TW9A 2C4JA 5EVOA 2JU5A 1NW2A 4MCUA 5IM9A 4F0BA 3F4SA 3ME8A 3CSHA 5B8AA 5CRHA 2PBJA 4LMVA 3KM6A 4MH2A 2L4CA 2C8UA 2RUEA 3LORA 3H8QA 2A4VA 1Y6EA 1SJIA 3HCZA 5CP1A 1ZGNA 2RLIA 2PPTA 1X9WB 3DXBA 3TOUA 1Z6NA 3VFIA 3IV4A 2HXKA 3IE3A 2L57A 4DVCA 2GT5A 2PVOC 1GTIA 2H01A 3CSIA 6GSWA 2RUFA 3GUSA 3I6AA 3TKQA 2L4QA 2CAQA 2CA8A 5DQYA 2JSZA 4NXIA 2OE1A 13GSA 2CX4A 5GSTA 1N8JA 2R4VA 2JZTA 3C1SA 3HJPA 1M0UA 2DJKA 5ELGA 4L5LA 5A4VA 4V2NA 3U6VA 4AJ8A 1M7TA 5F8BA 1GULA 2VCTA 4MZCA 3VPQA 2LEGA 5D9TA 3NOFA 1PKZA 5IMZA 2IMFA 1EV4A 3LYPA 4DEJA 1F9MA 4F03A 2PVQA 2A2RA 2L6DA 4JZQA 4RQXA 3QDNA 1BYEA 3E0UA 3WGEA 1I9DA 3H4KA 3BCKA 1JZOA 5J9CA 1AUCA 4ZIJA 4V1Ag 1R5PA 1TRSA 2EC4A 3MDKA 2KHPA 2KLXA 1GLPA 4O32A 4XS4A 4JRRA 1ERUA 3MSZA 5EY6A 4ACSA 2XBIA 5IO2A 4IQ1A 2YWIA 1Z3EA 3LXTA 4MLYA 1O6JA 3ERGA 5G1KA 1R26A 4FO5A 2X8HA 5IPGA 1O8XA 2CVKA 4X1UA 4G19A 3IK7A 3EINA 1PD21 4POBA 4KX4A 3HYPA 1H4OA 5DALA 3NIVA 2ZNMA 4XS1A 4MPGA 5ECMB 2F3MA 4QL7A 2IJYA 1XW9A 1GSQA 4HI7A 5IIZA 2WFCA 3TJFA 1ST9A 1NHYA 2VO4A 4TR1A 4DSSA 2VM1A 4HOJA 1QGVA 3VWWA 2F8FA 3KGKA 2ON7A 1HNBA 3TKRA 4DSRA 5IOXA 2IPAA 3QMXA 3U5RE 3S9FA 4XRAA 3QR6A 4K0GA 5IMAA 1THXA 3ZZXA 1R7HA 2GZZA 5DAKA 1BX9A 1SK1A 5HFIA 1QK8A 4Q5RA 1SD9A 4YQVA 4PUAA 5D8IA 3QCPA 4KH7A 4MF7A 4AJ7A 2R37A 1XCCA 3CXGA 2LJRA 5F07A 4LL4B 4K1FA 2V6KA 1DSBA 2N5AA 3FY7A 4RQRA 4WBRD 5B6NA 16GSA 3M8NA 1PRXA 2VLUA 3UBLA 5JCUA 2LRCA 2QC7A 4MF6A 3A2XA 4KDXA 7GSSA 5HR2A 1THOA 4NWYA 1FAAA 4TVEA 3IRAA 1PX7A 4V2LA 14GSA 2ALBA 3PINA 3ERFA 5B7CA 2HSHA 2VCQA 4NMUA 1BG5A 4MJCA 3TUEA 3M0FA 1AAZA 1DE1A 3ZMKA 5D9WA 4ECJA 4ISDA 4MK3A 2P31A 1JHBA 4PUFC 4GLTA 2H6YA 2IFQB 2WZ9A 1TOFA 1VF3A 4F0CA 3FZ5A 4N0ZA 3DGQA 4X0XA 3RBTA 5A4WA 4AJ6A 3QAWA 3KTBA 3GKXA 1YKCA 5LNKe 1GNWA 4ZBAA 3C7MA 3HHVA 1SL2B 1T4ZA 2H1AA 3UAPA 1TK8B 3GKKA 1ZYQB 1F3BA 4J2FA 4XIHA 1G7EA 2O87A 3KH7A 2GGTA 5AIVA 5ECPB 2X8CA 3HDCA 3L0HA 1R4WA 2K18A 1XOBA 4Q5NA 4BVYA 2HE3A 1B9YC 1CQGA 2WS2A 2FA4A 2LSTA 5CYYA 1XW5A 4RI7A 3P90A 2V6OA 4ECCA 2DIZA 3CSJA 1ERWA 6GSUA 1OC3A 4MJBA 2K6VA 3L4NA 4D73B 4MJAA 1GP1A 3J7Yk 2F51A 4J56E 1UN2A 1PSQA 2H71A 3HD5A 1EOHA 2IMEA 2XPEA 1B9XC 1WOUA 4JR6A 2NDOA 10GSA 5B8BA 1JZWA 2R3XA 3KXOA 5AISA 2H0GA 4YQMA 1K3OA 1F2EA 2VM2A 3D5JA 2V2GA 4F9ZA 4ZB9A 5JCWA 1FHEA 2M80A 1EEMA 1SKWB 1KNGA 3M3MA 2P5QA 1T7PB 1O8WA 2NVLA 2CAIA 4IBPA 3LQ7A 4XCSA 1AC1A 2AV4A 4HEA2 5IPHA 2H19A 2HZEA 1YZXA 1KEBA 2E2MA 2J23A 4ZBBA 1A24A 1TU8A 3DKSA 2OADA 1M9BA 5KN1A 4L0WA 4GXZA 5J5NA 1A2MA 5KN3A 4KCEA 2MYGA 2C3QA 2YCDA 1MD4A 3FEUA 5ABRA 1AQVA 1OE8A 2WGRA 1Z6MA 3ZL5A 4KGIA 2FY6A 2OACA 4PGTA 4EDZA 3J7Yb 4HQZA 6GSTA 3TKSE 1ZCPA 4GCIA 2DJ3A 5EL8A 4OD7A 3JCML 4I97A 5CRWA 2LJKA 4BWSA 1GTUA 2LQQA 2H73A 3N9JA 1T00A 4YAPA 4LA1A 4IW9A 2M72A 1OKTA 1PMTA 3IR4A 3F6DA 3MAKA 5J4UA 3F3QA 3TKSA 5ECKB 1GTBA 1O85A 2FUG2 3GX0A 3M9KA 1XFLA 2YZHA 1AIUA 3HA9A 3FW2A 3C71A 3GV1A 2QGVA 3CBUA 1YF1A 4MPFA 3KTLA 4G9HA 1MTCA 3BOAA 4GTUA 4ML6A 2LNTA 1IYHA 3ZYWA 4OFMA 1TDIA 2K8SA 2C1YA 22GSA 3ZIVA 1K3LA 1YY7A 4N10A 1V58A 3D21A 2HSYA 5ENUA 4DSQA 1GH2A 2I81A 3TJJA 3HVXA 4BVXA 2H6XA 4KUNA 4TKYA 3GTUB 3TRQA 1V2AA 4I8BA 5F0GA 2G0FA 1F6MC 4Q5FA 3TOTA 1Q98A 2BJXA 3FR3A 1XWKA 3TRPA 1H75A 4PURA 2VIMA 4ULXA 3IHQA 2G2QA 3KCMA 2QSIA 1ILOA 1K0OA 2IMDA 2JZRA 1V40A 1USBA 5CREA 1A2LA 1XVWA 3D22A 5ID2B 1IYIA 2FCHA 1M9AA 2H0IA 2HT9A 3WD6A 2YWMA 4EXJA 2R2JA 5F05A 1B4PA 5FT3A 1WP0A 1Z9HA 4IN0A 1XZOA 2JL4A 1TJDA 1JLWA 4NV5A 3UBKA 5ECIB 6GSYA 5DVBA 4EUYA 3RPNA 1X5DA 3HVSA 3F3RA 4OFNA 3GL5A 2GSSA 4KB3A 4IP1A 1YDKA 1DBYA 3WGXA 3HZ8A 1Z7RA 18GSA 1SK2A 3FYGA 2R5GA 2L59A 3VI5A 3ZVJD 3CMIA 3DMLA 3BCIA 4FH8A 3GKMA 2YN1A 1YF0A 4GSNA 3ED3A 4NPBA 5JWOB 4EF0A 4N11A 2YWOA 2IFQA 1HD2A 3RHCA 3IPZA 2KUCA 1SENA 1SU9A 1M2AA 1OVNA 2PUKC 4GRFA 1V9WA 2TIRA 1U6TA 2RM6A 4V2MA 2OBIA 4OCFA 4GF0A 5KN2A 1WPIA 2RM5A 3VI7A 4AGSA 2WCIA 1BAYA 3L78A 2B5YA 11GSA 1B8XA 2C0FA 2GT6A 3RAZA 2LQOA 1SYXA 3TJBA 2JZSA 2DLXA 2EIOA 5H5RA 1XIYA 5DCHA 3PH9A 1GLQA 1EP8A 3F6FA 3CTGA 3VWUA 4MMMA 1O7UA 3Q19A 4K7OA 3RDWA 3TKPA 2GS3A 1GSSA 2X99A 2DIYA 2VD1A 2O8VB 4WXTA 4MZWA 1WE0A 4YAVA 5HR1A 1OKDA 2K8VA 4IJIA 2PWJA 2DJ0A 2FD3A 2HFDA 2LRTA 3KP8A 2H72A 4TR0A 4BL7A 3C8EA 2GQLA 3ZITA 1T4YA 4D73A 4EE0A 4FYBA 5C00A 1A8LA 1LBKA 4OMVA 4WBJA 1A0FA 4QL9A 1ABAA 2HRNA 2JSYA 3IA1A 2O89A 5E59A 1DE2A 2VLVA 4BWQA 4JU5A 4PXOA 5JWQB 1ML6A 5DBQA 1EP7A 2VL2A 2OA7A 4NHZA 2CVDA 3FK8A 4TRXA 1M99A 3DRNA 2DMMA 3ZFLA 3G7YA 4NHWA 4F82A 1EGOA 2REMA 1SJZA 5FWGA 4MJEA 3VWXA 3QAGA 1MEKA 4JEDA 1NSWA 2GQMA 1PX6A 5D73A 4BA7A 1FB0A 4OWYA 1SL1B 2BMXA 5LCZA 4TN8A 3MWHA 1MDJA 9GSSA 4GSSA 4EL1A 2VCXA 3GKNA 1WIKA 3P7XA 2C3TA 4NAXA 1F3AA 4O7HA 3TKSC 2FWGA 2VAFA 1TI3A 1V57A 1XVQA 1HYUA 4CDOA 3TRXA 2KP1A 2CVBA 5ECRB 3HKRA 1FOVA 1TK0B 2I9HA 4OFTA 4G2EA 1OC9B 3D6IA 5CO3A 2KP2A 2CX3A 4ZILA 1MDKA 2FWEA 1YEXA 4EKZA 3CYNA 3UVTA 5C04A 3LJRA 3GFKA 4XHMA 2WB9A 1BJXA 3N5OA 3LSZA 5AN1A 5CAXA 1HNAA 1W89A 3FZAA 4ECIA 12GSA 2N5BA 1VF2A 4FYUA 1XWCA 1F37A 1VGLA 4N0VA 1MDIA 2FWHA 1JZRA 1VF4A 4KAEA 2FA8A 2GVPA 3F4RA 1U88A 2AUVA 2PU9C 1DUGA 1GUHA 3F8UA 2LS5A 5ECLB 2AB6A 3BJ5A 2C0EA 4GSTA 4KW6A 4GQCA 2HNLA 3BD2A 1AXDA 1SKSB 3ZFBA 2VUPA 4HU9A 1RQMA 4WR4A 5IMVA 1ACVA 2I4AA 2E7PA 1QQ2A 3VK9A 4MH3A 5DALB 2LKUA 1G0TA 1E2YA 1QUWA 3SWLA 3FRCA 5D96A 5GSSA 4PX1A 1XWGA 3GH6A 3TCOA 2WJUA 4KNDA 5JCGA 3ZMLA 1GSYA 1URMA 3VWVA 1WRYA 1XWBA 2YWNA 3GTUA 2J9HA 2ZCTA 1FG4A 2OBKA 5AIXA 2GSQA 3QOUA 1FVKA 2MMAA 1SL0B 3WGDA 2CQ9A 2XPDA 1Z5YE 2ES7A 5DJLA 2YANA 1O81A 1GUKA 5ID2A 1WWJA 2OJLA 3QD9A 1K0NA 2VCZA 2H75A 1JLVA 1BQ7A 2IN3A 5A4UA 1K0DA 4TW5A 3GA4A 3IBHA 4JBBA 3DEXA 4MP4A 3H1NA 3GSSA 4LL1B 1XOAA 4POLA 2R6KA 1X5EA 5HR3A 5J9BA 3KH9A 2YJHA 1T3BA 5H5QA 1B4QA 2HRFA 1I5GA 5KN0A 4V1Ap 5GZZB 2B1KA 3PR8A 4N30A 2FGXA 1J9BA 2NTOA 2CT6A 3UEMA 4HZ4A 2I1UA 4XTSA 3QFBC 5E4WA 4HS1A 1YJ6A 4EO3A 2AYTA 4TR3A 4ZL7A 3KIJA 1AQWA 2MMOA 3PGTA 2HLSA 3EMXA 2GDRA 4ZB6A 1N2AA 1EGRA 2DC5A 3G7IA 2VL9A 3O76A 3CTFA 1J08A 2GSRA 3GHAA 5JWRB 2O7KA 1TKDB 4I6XA 1HQOA 4ZB8A 3VURA 4MABA 3E3EA 3UIWA 4BPYA 1VRSD 2VL2C 5IOWA 2VD0A 2P5RA 4HDEA 5ECQB 2YNXA 1OC8A 3L9UA 2C0GA 3LWAA 3EVIA 3FZ9A 3EYTA 3HJOA 1TRUA 4GWRA 5G31A 2IIYA 1TK5B 2E2GA 1T8EB 1PGTA 1EOGA 1GTAA 1KBNA 1ZL9A 1KTEA 3I43A 4EC0A 1EWXA 3ISOA 1FVJA 3GN3A 2KOKA 4HUAA 3DWVA 2H66A 5G30A 4FYCA 3ZRDA 3TJGA 1U3IA 4P3YB 5AGYA 4L8EA 3QPMA 1K0AA 2GZYA 2YP6A 2K9FA 1BEDA 2DSAA 5IMDA 2DJ1A 3TB2A 1ERTA 3GYKA 4ZL8A 3EU3A 1PN9A 3F0IA 1SD8A 2VLTA 3ZTLA 1HNCA 2YPMA 4QQ7A 4F2IA 2XHFA 3WT2A 3F63A 2GZPA 5A5KA 1G6WA 2GLRA 1K0BA 3UL3A 3K8NA 5IQYA 3M9JA 3A3TA 5LD0A 3W8SA 3LGCA 3EU4A 2NBSA 2TRCP 3CRTA 4ID0A 2LNSA 2WULA 2MBSA 5ECHB 2HYXA 2NPBA 1X9MB 2YV7A 1A0RP 1O73A 2B5EA 1ZOFA 2EIRA 2H74A 2OE3A 3APOA 4IS0A 1XW6A 2YZUA 3KZQA 2X8GA 3P2AA 1UA5A 1GUMA 4GQFA 2ZUPA 2PGTA 3FKFA 3KEBA 2LV3A 2DBCA 3D4TA 5HQPA 2AAWA 2XC2A 2DMLA 2M46A 1S3DA 2L5OA 1Y25A 4L0UA 1QMVA 3HXSA 3E9JB 3A2VA 3WYWA 1FO5A 4MA9A 5KEJA 2F9SA 2A2SA 2VCVA 4XRDA 2YJ7A 2HZEB 2C80A 3ME7A 1TRWA 1OC9A 4KA0A 1GL8A 3IAM2 3Q6OA 3GRXA 4KDUA 1T1VA 2MZCA 4OCEA 3ZREA 6GSSA 4IVFA 4TXOB 1X9SB 2DJJA 4LLRA 1GSUA 3HJMA 3UJ1A 1EV9A 1FW1A 2HZFA 2PMTA 1WMJA 4CHSA 4J57E 4RUVA 4E8HA 4KSMA 1TTZA 2H0HA 3IOSA 2BTOT 1OE7A 1W4VA 4IGJA 1K0CA 2YV9A 1QFNA 2PN8A 1X5CA 5GAND 1PQNA 2AHEA 1TP9A 5IO0A 2MMZA 3OR5A 3VLNA 4HJ2A 5CNWA 2LTKA 2LRNA 3D4MA 4HJMA 1YQ1A 1MD3A 1TI1A 2MMNA 1XPVA 4K7IA 2ON5A 2JACA 2IMKA 1LU4A 2I3YA 1SJ6A 2OKAA 3RPPA 3LFLA 3KJYA 3W6GA 4H86A 4RI6A 1PA3A 4K9ZA 3H93A 4MF5A 2WRTA 20GSA 3G7JA 2YOIA 5D93A 1PL2A 1C72A 5CRGA 3NZNA 2XBQA 3US3A 4Z7XA 3EURA 4K6XA 3TGZA 5J3RA 5DQSA 1UC7A 3Q18A 2GSTA 8GSSA 1XBSA 3GMFA 3DVXA 6GSXA 4K8MA 2GTUA 3L9VA 4JE1A 4K7NA 2H1DA 1R5AA 3FHKA 1M2BA 1EEJA 4TXVA 1Z7PA 1U3AA 3KD0A 4WF4A 3GL3A 3F4TA 3MNGA 4HZ2A 3APSA 1A23A 2MBTA 1S3CA 4KE3A 5IMCA 2B3SA 3GURA 3UMAA 2D2ZA 3DYRA 1K0MA 2X64A 3HY2A 3VPTA 1G6YA 3EMPA 1RK4A 4I2TA 1GRXA 3IAS2 4XS6A 1TRVA 3IC4A 4TR4A 2H1BA 1QXHA 2B7JA 2C3NA 4OO5A 3BBYA 1M2DA 4IP6A 3QFAC 3ZLPA 4PQIA 1AW9A 5F06A 1JZDA 1A2JA 19GSA 3ZVJA 3F9UA 3WT1A 5G1LA 3CRUA 4XS4B 1TXXA 1ZYEA 4ECBA 3G9BA 2IL3A 1OAZA 4AF2A 1NHOA 4O92A 2AJQB 3L9SA 1WJKA 5L71A 1GSEA 3GH9A 1GSFA 5DDLA 1CQHA 1ERVA 3HVVA 3QAVA 1S3AA 2FWFA 2LUSA 4ZL9A 3GX8A 5GAPD 3C1RA 3D0ZA 3W8JA 3V1WA 4EDYA 3H79A 5G5EA 4ZXGA 3GNJA 2H30A 4I5QA 3APQA 3KMNA 5CRDA 3M1GA 5D9XA 4O5RA 3A2WA 5G5FA 4YQUA 4PQ1A 1ZMAA 3IK9A 2H8LA 2JADA 3IXRA 4ZBDA 4ILFA 4IELA 2IWTA 1UVZA 4IQAA 2H76A 4WR5A 4WKWA 3ZIJA 2C0DA 3DIEA 2QKEA 2H1GA 3UVHA 5EPFA 4TR1B 3TJKA 4DSSB 3DD3A 1Q4JA 1VF1A 5HFGA 5INYA 4NV2A 3O6TA 5B6MA 1G7OA 3A5WA 2V32A 2RIIA 3KP9A 1B48A 4E8EA 2FLSA 2O85A 1V98A 2HI7A 5COHA 3EC3A 2EIQA 1XXUA 5DAKB 4PQHA 1JFUA 1X0RA 3P8WA 2B1LA 2PERA 1EZKA 1K3YA 1SYRA 1GWCA 3FR6A 4ML1A 2TRXA 3LXZA 4Q5QA 3UOMA 1ZZYA 2H70A 4K0NA 5ECSA 1GNEA 5HR0A 4I2UA 3FZ4A 2VCWA 1A8YA 2V1MA 3O3TA 4IKHA 2B6MA 4CW9A 2F8AA 1OYJA 3GSTA 1PKWA 1YEPA 2CZ3A 5ECOB 4KDYA 2CZ2A 1SKRB 2LJAA 5J41A 2L6CA 3GIXA 1SK0A 3FR9A 1AQXA 4L5OA 4IHUA 1PL1A 1XWAA 3LEFA 1ON4A 3SBCA 4OO4A 1FB6A 5FHIA 1NM3A 3LG6A 2WDUA 4TXOA 2FNOA 1LJRA 3IDVA 1J0FA 5G2ZA 2P0GA 2H6ZA 5D9VA 2OE0A 2Z9SA 1GSDA 2IMIA 2DJ2A 2GQKA 5ECNB 5DJMA 1E6BA 3DVWA 4PNFA 4KCAA 2FHEA 4IJ3A 4WETA 4FIWA 4POMA 4LMWA 4HQSA 4YH2A 3R2QA 3RHBA 4WEYA 5IMFA 2VOCA 3I9V2 3C73A 4WF5A 3UARA 5ELAA 4G10A 5DCGA 17GSA 4POKA 3ERWA 4PNGA 2B5XA 4TOPA 3I69A 2VL3A 1YKAA 3TDGA 3EE2A 4JR4A 5H5SA 4X43A 3EWLA 3KMOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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