3TJGA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c51a mutant in oxidized form
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjgA00
2H6ZA 4XS4A 5IMVA 5CRWA 1DE1A 5JWOB 3DRNA 4NV5A 2VL2C 3VK9A 1Z3EA 1PL2A 5J3RA 4K7NA 1HNCA 1A2MA 1E2YA 2M72A 1G6YA 4KH7A 2VCTA 1X5CA 5G5FA 3G9BA 1THOA 2HSYA 2CZ3A 2AYTA 4GLTA 1ZGNA 2G2QA 2H73A 1ON4A 4WBJA 1EOGA 2YV9A 3EC3A 3DGQA 4MMMA 2V32A 4IVFA 5G30A 1ILOA 1SD8A 5ECIB 2E7PA 1R5PA 4N11A 3H8QA 5HFKA 1ERVA 1N8JA 4PUAA 3ME8A 1CQGA 4IELA 2JSYA 5J4UA 1OYJA 4DSSB 3KH7A 2AAWA 5IIZA 1Z9HA 1GTBA 4LA1A 3EVIA 1PGTA 5KN3A 3O6TA 4ZL8A 2HZEA 3N9JA 2A2SA 2YZUA 3BJ5A 4RI6A 2FHEA 2QGVA 4N10A 2R37A 1K3LA 4POLA 3H4KA 3FZ5A 5ECOB 3GKKA 3KTBA 5F06A 4J57E 4NPBA 4CW9A 2VM2A 1G6WA 1GUMA 5AIXA 1G7OA 2LV3A 4IP6A 2DMMA 2XPEA 5GSTA 2MZCA 1A23A 3HVXA 2YP6A 5GSSA 1VF2A 3CXGA 1AQVA 1ZOFA 3GN3A 3CRTA 5JCWA 2MMNA 2OE1A 5D8IA 3HZ4A 3GURA 3TDGA 2VM1A 2PVQA 3UMAA 2NBSA 5JWRB 3QMXA 1K0OA 1XVQA 1X0RA 1W89A 2CQ9A 1S3CA 5G1KA 2L6DA 5IM9A 3Q19A 1K0BA 3MWHA 3IAM2 4G10A 1GTAA 3KD0A 1K0CA 5DBQA 2R3XA 4K9ZA 4MH2A 5D96A 3K8NA 4I2UA 3P2AA 3M1GA 3FK8A 1NM3A 3FY7A 4V1Ag 2MYGA 4ZL9A 1ACVA 1X5DA 3GMFA 5J9BA 2CAQA 22GSA 2GZYA 1GTIA 1K0DA 2C0GA 4MPGA 5HFGA 4TXOB 4FYUA 5CP1A 4MJBA 3I6AA 3EYTA 5G2ZA 1HD2A 3GRXA 3CBUA 3F3RA 2EIRA 4FH8A 4XS6A 3WT2A 3F4TA 2C8UA 3WD6A 2IFQB 1ERUA 1QXHA 4L5OA 1GP1A 2C0FA 4TN8A 2REMA 4RUVA 3WT1A 5HR1A 3TKPA 4NWYA 5IMZA 4MJEA 1FVKA 3IV4A 1PX6A 3UOMA 3RPNA 3FZAA 5B6MA 3UJ1A 2O89A 3DXBA 2VUPA 5IOXA 1PMTA 5ABRA 1TRUA 5DCGA 3A2VA 2R2JA 1DBYA 1V57A 2MMAA 2H8LA 3QPMA 4KB3A 1PN9A 5ECMB 1M9AA 1K0MA 1PSQA 1KTEA 2C3TA 1QQ2A 1AXDA 2ON7A 2HNLA 3M9JA 3VFIA 3LQ7A 2HYXA 2P0GA 1XWGA 1WJKA 1WRYA 5LD0A 2CX4A 2E0QA 2NPBA 3HJMA 2AHEA 1AQXA 3Q6OA 4FIWA 1V58A 1XIYA 5D73A 6GSSA 4KDUA 4O7HA 20GSA 2MBTA 2OACA 3LEFA 5KN0A 3GHAA 2L6CA 2R4VA 2WULA 3DEXA 1R7HA 3RDWA 3GKNA 3IDVA 2IJYA 4HS1A 5CRHA 4GTUA 4KNDA 2VCQA 2OA7A 1A8YA 4MZWA 4WXTA 1ABAA 2AUVA 3ISOA 2YOIA 1NHYA 4K1FA 4TKYA 1WPIA 3LG6A 3KMNA 1TK0B 4TR1A 2FUG2 1VRSD 3IXRA 4XIHA 1MD3A 1A8LA 1AAZA 1Z6NA 3GTUB 4KA0A 1OE8A 1Z7PA 1TK5B 3QOUA 2IMIA 1SENA 1J9BA 4GSSA 1YKAA 4Q5FA 4MF7A 5F05A 2L4CA 1ZL9A 4IKHA 1BAYA 4ML1A 1M9BA 4HQZA 3Q18A 4ECBA 3ZL5A 5J5NA 2A4VA 4K0NA 3M9KA 3UBKA 2VLUA 4JZQA 2BJXA 3UAPA 7GSSA 4HUAA 2YN1A 3VWUA 3TOUA 1ML6A 3H79A 4NV2A 1HNBA 1B9YC 1T00A 6GSUA 1YY7A 4D73A 3F4RA 2DSAA 4LL1B 3D22A 1GWCA 1PX7A 3HD5A 4K8MA 3VLNA 3D21A 1Z7RA 5ECSA 4ECJA 1K3OA 1GNWA 1SKSB 5CREA 3BCIA 4OO4A 4WETA 2LRTA 1EWXA 4ECIA 4JR4A 1Z5YE 2L5OA 1YZXA 3GNJA 3DIEA 1OKDA 1XWCA 3RPPA 1MDJA 5B8BA 3L9UA 5H5RA 1Q4JA 2OKAA 2ON5A 3L4NA 5D9XA 3IC4A 4L0WA 3LJRA 5DALB 2WFCA 2GT5A 4ZB8A 1ST9A 4HJMA 1TJDA 4GQCA 1WMJA 3QFBC 1AUCA 1Y6EA 1SYXA 1I9DA 1B48A 3W8SA 2L5LA 3QFAC 1QK8A 1EP8A 4L0UA 1YEPA 3FR9A 4DSQA 2I1UA 2HRNA 3H93A 3VPTA 1Z6MA 3GYKA 4XCSA 1R26A 3L0HA 5ECLB 5GZZB 4F82A 5E4WA 3N5OA 1U3AA 2IL3A 3UIWA 3EU3A 5GAPD 2HE3A 4GQFA 4IQ1A 1PKWA 5D93A 4LMWA 1WIKA 1WWJA 3HHVA 2R6KA 3ZVJA 3MDKA 2XBIA 4HZ4A 11GSA 4ULXA 3QR6A 5DQYA 3E3EA 2F8AA 5B6NA 1JZRA 2KP2A 4TR3A 4V2LA 3DMLA 1KEBA 3GFKA 1TU8A 1M2DA 1T3BA 3D6IA 1JZOA 1AQWA 5CRDA 3ZIVA 1SJZA 3IR4A 1QGVA 1XOAA 4ZB9A 1FW1A 17GSA 2H70A 2VD0A 3MNGA 1A24A 2B7JA 3TGZA 4PUFC 5IPGA 4JE1A 3I69A 4ECCA 4V2MA 4KCEA 3LGCA 2GZZA 5ID2A 3RAZA 3F0IA 1H4OA 2H66A 5L71A 3L9VA 3KEBA 4GWRA 3TRPA 3U5RE 2FCHA 2LNTA 2M46A 2AJQB 4WF4A 3HY2A 5EVOA 4EL1A 4N30A 4RQXA 3D4TA 5JCGA 1XWAA 4G9HA 3J7Yb 3F63A 1RQMA 1GTUA 2I81A 2GSTA 3A5WA 4WF5A 3EWLA 1FAAA 3F6DA 2HZEB 3HYPA 4IBPA 3GX8A 3TCOA 2VLTA 2WJUA 3DWVA 2F9SA 4OFTA 3HDCA 2C3NA 1T4YA 2X99A 2VLVA 2WB9A 2H6XA 3RHBA 5ECRB 4DEJA 4EC0A 3M0FA 3TJJA 5COHA 1TI3A 4F0BA 3E0UA 3TKSA 3KMOA 2WGRA 1TRVA 1R4WA 4LL4B 2K8VA 4V2NA 4MDCA 1SL0B 3GKMA 3HA9A 2RIIA 2QKEA 2ZUPA 1S3AA 2CVDA 3WGXA 4EKZA 3D4MA 1OE7A 1X9SB 1YKCA 3TKRA 3UVTA 1YDKA 1EGRA 2G0FA 1ZZYA 3GSTA 2QC7A 2JZRA 1EEMA 1SL1B 3KIJA 1EV9A 4NHZA 2I4AA 3EU4A 4BVYA 5DJLA 4FYCA 2JL4A 4PXOA 1XOBA 1BEDA 1T7PB 1M7TA 3TJKA 4FYBA 5G31A 3BBYA 1T1VA 3EURA 3ZVJD 1LBKA 4AJ6A 4YQMA 5IMDA 3PH9A 2CZ2A 3KH9A 2V41A 2KUCA 3MAKA 4PGTA 16GSA 4ZL7A 1TRWA 2FA8A 4Z7XA 4G19A 3VWVA 3FRCA 4GXZA 4QQ7A 2DJ1A 1V40A 4CDOA 5KEJA 1GSFA 2JU5A 2N5AA 3FR3A 5ECQB 3EE2A 4BL7A 3ZYWA 2LNSA 3QAVA 3P8WA 5DQSA 2KLXA 4OCEA 4I8BA 4E8HA 4HZ2A 2B6MA 1NHOA 2GSQA 2H0IA 2LQOA 1GL8A 1GSDA 1GSSA 4OCFA 2DJ0A 5DCHA 1B8XA 1I5GA 5J41A 4ILFA 2X8HA 4AF2A 2IN3A 5D9VA 4L8EA 2CT6A 3EMPA 4Q5NA 4XS1A 4IS0A 3PR8A 5H5QA 1FOVA 2B5EA 2H0HA 2HRFA 2GQKA 3IE3A 2JADA 1M99A 1T8EB 2H71A 1UVZA 2VAFA 2L57A 3TKSC 4N0VA 3BD2A 2JZSA 4XRDA 2D2ZA 2GVPA 2PERA 2Z9SA 2XC2A 4BWSA 2H75A 4PNFA 4QL7A 2XPDA 4NMUA 3GA4A 5DVBA 4WR4A 2GQLA 4I6XA 4MZBA 2VL3A 3C73A 5J9CA 19GSA 1G7EA 3CTFA 4XRAA 4ZXGA 2YWIA 2MMOA 5EL8A 1ERTA 2VL9A 1ZCPA 2RUFA 3ERGA 4H86A 3HJOA 1LJRA 4EE0A 2YJ7A 5D9WA 1NSWA 4TR4A 1K0NA 5IPHA 4O5RA 2IFQA 2O8VB 4BA7A 2OJLA 3LYPA 2FLSA 3C7MA 5KN1A 4EXJA 2C0DA 1QFNA 4RQRA 4OFNA 4K6XA 3F8UA 1XWKA 2ZCTA 1RW1A 1O73A 1U3IA 1SKWB 5ELAA 3DVXA 1AIUA 3ERWA 2JSZA 1Q98A 2RLIA 3ZITA 5IOWA 5ELGA 4TR1B 2I3YA 2CV4A 2J23A 3FZ4A 3US3A 3CSHA 2X64A 2GDRA 2R5GA 2A2RA 2DIZA 1JZWA 1O8XA 1XWBA 1FG4A 3A3TA 4J56E 4K7IA 5IQYA 1EZKA 2H1GA 3TKSE 3QCPA 1XW6A 2P5QA 5INYA 2RM6A 2FGXA 4O92A 3A2WA 1X9WB 3CSIA 4I5QA 1F6MC 5IO2A 2DIYA 1OVNA 1LU4A 2LRCA 5AIVA 2FWFA 1SJ6A 2MBSA 2GGTA 4YQUA 4F9ZA 3P7XA 4D73B 2HLSA 4HU9A 2PN8A 2GZPA 3ME7A 5IMCA 2H0GA 3KJYA 2VCWA 2PVOC 1F9MA 2K18A 2X8CA 4MA9A 3WGEA 1OC8A 1SK1A 3VURA 2H72A 2NTOA 1SL2B 1EOHA 3H1NA 2OBKA 1PQNA 14GSA 1BYEA 4POKA 3UARA 5A4WA 2DBCA 4YAPA 4ZILA 1A2LA 1N2AA 4ACSA 2DJKA 2QSIA 2GT6A 3D0ZA 1M2BA 4IHUA 2V2GA 3HCZA 6GSVA 5E59A 4I97A 5HFIA 4TOPA 4MZCA 1GLQA 2DMLA 2AV4A 3IK7A 1YQ1A 1SYRA 3M3MA 5B8AA 2DLXA 4ZBAA 2HT9A 1SK2A 4IN0A 4MJAA 4KX4A 1FB6A 4MLYA 2OADA 1KNGA 3KXOA 3C1SA 5A4VA 1TP9A 2NVLA 2WCIA 10GSA 3GL3A 3HKRA 4PQ1A 4AJ8A 4I2TA 2WDUA 3G7JA 4RI7A 2VOCA 1YF1A 2KOKA 3FKFA 4PURA 1QUWA 3BOAA 1GNEA 3GX0A 3MSZA 4CHSA 1MTCA 3ZRDA 2ES7A 3I9V2 2LJRA 1GRXA 3ZLPA 1GSYA 2FA4A 4WKWA 2WS2A 1XCCA 2HSHA 2J9HA 4P3YB 1G0TA 1YEXA 4ISDA 2OE3A 5JWQB 4PQIA 3GUSA 3JCML 3APOA 3IPZA 4GRFA 4Q5QA 5DALA 1SU9A 4BWQA 1TKDB 5CNWA 3APQA 1B4PA 5A5KA 2VO4A 2RM5A 4YAVA 2NDOA 1O81A 3PGTA 5DAKB 3WYWA 4F2IA 1X9MB 4EDYA 1MDKA 1HYUA 4N0ZA 2IPAA 4O32A 3BCKA 6GSYA 3NOFA 4IQAA 2P31A 1XBSA 3IA1A 4BVXA 2GS3A 5ECNB 2K6VA 2F8FA 1OC3A 1TI1A 4GSTA 1F3AA 3KP9A 1H75A 4XS4B 4G2EA 4K0GA 2DC5A 1VGLA 1V2AA 3APSA 2PWJA 2V6OA 2C3QA 3GV1A 1MDIA 3LYKA 4J2FA 4TRXA 1FB0A 3DVWA 4PX1A 1THXA 4EF0A 5A4UA 2TIRA 3TB2A 4EO3A 4NXIA 1K0AA 1B9XC 4TXVA 2YZHA 2VCXA 4MK3A 2F51A 2FWHA 3GH9A 3ZFLA 1UN2A 4LLRA 4JR6A 1S3DA 2GQMA 5CO3A 3QAGA 3CSJA 1XW5A 3A2XA 2B7KA 4X43A 2YWNA 4X0XA 5HR3A 4E8EA 1OC9A 5AN1A 1M2AA 2B3SA 3CRUA 1PRXA 4MABA 1AW9A 5EY6A 3W6GA 4ZB6A 1JLVA 2GSRA 4FO5A 1SKRB 4MCUA 1F2EA 2DJ3A 5LCZA 4AJ7A 4BPYA 3QD9A 1DE2A 2EIOA 2HXKA 5ECPB 4DSRA 2C1YA 2YPMA 3TKQA 2GSSA 2JACA 1YF0A 1OAZA 3TRXA 1GULA 4IP1A 4HEA2 2IMDA 3E9JB 1TOFA 2IMKA 1WE0A 3QDNA 1U88A 3TJFA 2YCDA 5C04A 5IMFA 4GSNA 2I9HA 3O3TA 6GSTA 1TU7A 2VIMA 4JU5A 2PUKC 2C0EA 4DSSA 4MP4A 1GSUA 2H74A 1QMVA 2LJKA 1BQ7A 2VCVA 5LNKe 2XHFA 1GUHA 1J08A 1ERWA 9GSSA 3TJBA 2CVBA 2LTKA 2CAIA 2LS5A 6GSWA 2FD3A 3NIVA 5EPFA 3CTGA 3F3QA 1DSBA 2GTUA 2YANA 4HQSA 4F03A 2RUEA 2HFDA 4POMA 2PU9C 2MMZA 3C71A 3CYNA 2IIYA 1JHBA 4WR5A 3DD3A 2FWEA 2HI7A 1A0RP 2B5XA 2HZFA 3ZMKA 3TOTA 4F0CA 4WBRD 8GSSA 4IW9A 3FR6A 1E6BA 5D9TA 3ZMLA 1SD9A 4KAEA 1X5EA 1NW2A 3LFLA 2LJAA 3P90A 4GF0A 3C1RA 3D5JA 4Q5RA 2PPTA 3M8NA 1XFLA 4MF6A 4EVMA 1VF1A 3RBTA 2ALBA 1URMA 5FWGA 3GH6A 4KDXA 2LSTA 1PD21 3I43A 3KGKA 1M0UA 4NAXA 3IOSA 4ZBDA 2H01A 4MF5A 3QAWA 1PL1A 3G7YA 3NZNA 2BTOT 3LORA 4KUNA 3UVHA 5B7CA 1SJIA 3F9UA 2CA8A 2LEGA 3EINA 4IJ3A 3IK9A 2YWOA 3R2QA 1EEJA 2IMEA 4KW6A 2LUSA 1EGOA 4HU7A 2WZ9A 1FHEA 4V1Ap 1ZYEA 1F37A 2L4QA 1OKTA 3WGDA 3ED3A 1BJXA 5FHIA 2H30A 4TXOA 1O7UA 2IWTA 4K2DA 3O76A 1GLPA 5AGYA 2H6YA 2GLRA 1BG5A 4GCIA 2YWMA 1A0FA 2LKUA 2B1LA 2H76A 2E2MA 5H5SA 2H19A 3F6FA 1K3YA 2FWGA 2O85A 2OBIA 5HR2A 3EMXA 4OMVA 2YNXA 3IAS2 2P5RA 3FZ9A 3LSZA 1PA3A 5AISA 2K9FA 1XXUA 5FT3A 5IO0A 3L78A 3U6VA 5CAXA 1JFUA 1JZDA 2IMFA 1O6JA 5ECHB 3UL3A 1PKZA 5G1LA 2LRNA 1W4VA 2BMXA 2WRTA 1EP7A 3C8EA 4JBBA 4ML6A 4WEYA 1TW9A 2B5YA 3HZ8A 1Y25A 3GKXA 3HVSA 2DJ2A 1WOUA 1ZYQB 4ID0A 4MH3A 3S9FA 4DVCA 3LXTA 3GSSA 1IYIA 4KSOA 2O7KA 4PQHA 5CYYA 1R5AA 2PBJA 1RK4A 3VI5A 4MJCA 4AGSA 1HNAA 4HI7A 2E2GA 4ZBBA 12GSA 3FHKA 3FEUA 3GL5A 1FVJA 1TDIA 18GSA 3W8JA 3SBCA 4XTSA 2JZTA 1AC1A 1TRSA 1XZOA 2H1BA 2EC4A 4PNGA 1J0FA 3ZFBA 4KGIA 3IHQA 1T4ZA 2YJHA 3ZZXA 5DDLA 3GTUA 3L9SA 4KE3A 4X1UA 1TK8B 2KP1A 5IMAA 2PGTA 3IBHA 13GSA 1U6TA 2B1KA 2OE0A 1GH2A 2CVKA 4HJ2A 2PMTA 3VI7A 3HJPA 3J7Yk 6GSXA 1ZMAA 3KTLA 1EV4A 1MD4A 4OO5A 2V6KA 3ZIJA 3AY8A 5GAND 2M80A 1FO5A 2X8GA 3GIXA 3IRAA 4OWYA 1UA5A 5KN2A 1F3BA 1TXXA 1CQHA 3DYRA 4HDEA 1XPVA 4OFMA 3ZREA 2LQQA 2TRXA 1V9WA 4POBA 3OR5A 3KP8A 3FYGA 2FNOA 3Q74A 2EIQA 4TW5A 5G5EA 2N5FA 1JLWA 3SWLA 1U87A 1SK0A 2FY6A 5DJMA 1A2JA 5F07A 1V98A 2VL2A 4QL9A 2TRCP 4XHMA 2XBQA 1IYHA 4IJIA 3TRQA 2YV7A 1UC7A 4IGJA 4MPFA 4OD7A 2K8SA 4KCAA 3VWXA 1C72A 1WP0A 1B4QA 1VF3A 3F4SA 3HXSA 4L5LA 3KM6A 4HOJA 1MEKA 1O8WA 2H1DA 3RHCA 2L59A 5HQPA 2AB6A 4TR0A 4JRRA 1HQOA 3KCMA 1XVWA 1GUKA 5F0GA 4TVEA 3VPQA 2ZNMA 1XW9A 2F3MA 2C4JA 5JCUA 1BX9A 2KHPA 3FW2A 3HVVA 2DJJA 4JEDA 3ERFA 1YJ6A 3TUEA 1VF4A 3KZQA 3LXZA 3ZTLA 4EUYA 4ZIJA 2H1AA 2VCZA 2CX3A 3UEMA 1GSEA 4K7OA 4YH2A 3LWAA 3PINA 5ID2B 1TTZA 5ENUA 3G7IA 5C00A 3CMIA 1O85A 4YQVA 1KBNA 2O87A 1USBA 5DAKA 2VD1A 4EDZA 3V1WA 1OC9B 4LMVA 3DKSA 5HR0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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