3TJKA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c245a mutant in reduced form
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
LHLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVAPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjkA00
1F37A 3L9SA 4QL7A 4ZL8A 5G1KA 1K0NA 4MCUA 1OVNA 3F4SA 1CQHA 3KTBA 2H6XA 1A8YA 2B3SA 2YCDA 4ILFA 1PMTA 2H73A 1J08A 5LD0A 4K1FA 1ML6A 1R5PA 1AC1A 3D4MA 1I5GA 4KSOA 2OJLA 1AW9A 3A5WA 2GZPA 3IPZA 5J41A 1TDIA 3GKMA 5ELAA 3F6FA 4L5LA 1XXUA 4XS4A 1ST9A 4TVEA 3H4KA 4HJ2A 3IE3A 4AJ6A 3GSSA 2EIRA 1OC9B 2WULA 3IV4A 4ZBDA 1XWGA 3KGKA 3FHKA 3CYNA 3ZLPA 1TK0B 2V1MA 4ZB8A 4TR0A 3GA4A 3KMNA 2ZUPA 4MF5A 5COHA 5F07A 1M2AA 3LJRA 5ECOB 2VCZA 5KN3A 2C3QA 3L9UA 3UAPA 1MDIA 1GTBA 5HQPA 2YN1A 3GNJA 2XPEA 3DVWA 2H75A 3GL3A 3IK9A 3KXOA 1XW6A 22GSA 1QUWA 2BJXA 3LEFA 2B5EA 1CQGA 3GSTA 2PERA 3D0ZA 3ZMKA 5CREA 1LJRA 3DGQA 2RLIA 5D73A 1U87A 2G2QA 1XFLA 2GSQA 3WD6A 1XWAA 4IVFA 4FYUA 2M46A 1SD9A 4GQFA 4HEA2 4HJMA 2V32A 2VL3A 3D6IA 4KE3A 3DD3A 3HJPA 4J57E 1YY7A 3ZREA 1F9MA 1A23A 4ZB6A 3D22A 5JCGA 3DIEA 5H5SA 3TKSC 3F8UA 3UVTA 4F9ZA 2GDRA 4ZBBA 2PMTA 2R3XA 5ENUA 2X8CA 3R2QA 2HNLA 5A4UA 3TOUA 3TRQA 4N11A 4ZL7A 4PNFA 2A2SA 4Q5QA 5B8BA 18GSA 5DQSA 1U6TA 1YQ1A 1Z9HA 3GYKA 3Q18A 1XBSA 1YDKA 4GWRA 4PXOA 5DBQA 3CSJA 1GL8A 4K7OA 1NW2A 4NXIA 3JCML 1B9YC 4TRXA 2CA8A 2JU5A 4GSSA 3VPQA 1WWJA 5KN1A 3P90A 1DSBA 3DEXA 3IHQA 5DJMA 4IHUA 1GUMA 1PN9A 5LCZA 3DYRA 2C0FA 5KN0A 3FYGA 4MDCA 5CRGA 3RHCA 1TRVA 2CVBA 4ECCA 3ME8A 3RAZA 1GUHA 1G7OA 4BPYA 1XPVA 4JE1A 6GSUA 4V2LA 1PA3A 4OO5A 19GSA 1LU4A 2OE1A 3GTUA 1EV4A 3TKSE 1B4QA 3N9JA 5DAKA 4IS0A 2DIYA 1ILOA 2H8LA 1V9WA 3DRNA 4NV5A 1N2AA 1HQOA 1AAZA 1JLWA 2GQMA 5J9BA 2DC5A 4EDZA 1B9XC 4V1Ag 5ECPB 5F0GA 1TP9A 3CXGA 4HU7A 3FZ5A 16GSA 3EWLA 3W8SA 3RDWA 2XHFA 2O7KA 3D21A 3GURA 3PINA 1DUGA 1YEXA 3GH6A 2YWNA 1SYXA 4IQ1A 4G2EA 1AIUA 5DCGA 1M99A 2L5LA 1NSWA 2E2GA 4PUAA 2IIYA 3HJOA 5JCWA 4NMUA 4K2DA 4EUYA 2FWEA 1PD21 5ID2A 1KTEA 5ECLB 4HS1A 2I81A 3V1WA 4WEYA 2VCXA 3FZ9A 3GHAA 2VAFA 2YZHA 2C1YA 1TU8A 3KTLA 2HLSA 5E59A 1VF2A 5A5KA 1AQXA 2ZCTA 2CZ2A 2NVLA 3J7Yb 3F3QA 3ZITA 4X43A 5C04A 5ELGA 4DSRA 4TN8A 1HNCA 5H5QA 3P2AA 4HU9A 2H71A 2B5YA 1DBYA 3Q19A 5G1LA 3O3TA 1BJXA 4NV2A 1ERTA 3MSZA 3KZQA 3IAS2 5EVOA 2RUFA 3TJGA 4K6XA 2XBQA 3HY2A 1HD2A 4ZL9A 1Z6MA 2FD3A 2H19A 4ULXA 4GF0A 2VCQA 4RQRA 5B6MA 2WRTA 1LBKA 3F63A 5DALA 3EVIA 2YANA 2VLTA 3C8EA 4FYCA 2CX4A 4TR4A 4MK3A 2ALBA 1ZMAA 1T4YA 3UIWA 5HR0A 3TJBA 2O87A 1T7PB 2WS2A 3EE2A 3NIVA 2V6OA 1QGVA 4PX1A 1Q98A 1DE2A 3WT1A 2I4AA 5ECQB 2H70A 4CW9A 4TXVA 2LQOA 4D73A 1YF0A 1THXA 2J9HA 2VUPA 3BJ5A 4GSTA 1QK8A 3TKPA 1Z5YE 8GSSA 5JWQB 2JZTA 3ZFBA 4F0CA 1KEBA 1PL2A 3QMXA 3WGEA 2C4JA 2VD1A 2HXKA 4V2MA 1EOHA 4WR5A 3TOTA 2X8GA 5ECMB 4ISDA 1RK4A 5D96A 4JU5A 3QFBC 3G7IA 3FR6A 4X1UA 3WYWA 2WFCA 3MWHA 1TKDB 3VLNA 1HNBA 3IDVA 2DMMA 4EKZA 2HRFA 4TXOB 3M3MA 5HR2A 2LRTA 1GLPA 2PUKC 4CDOA 5A4WA 1TRUA 5D9XA 1V58A 5A4VA 2FCHA 4JEDA 2HE3A 6GSTA 1UC7A 2ZNMA 4IW9A 1RW1A 2X64A 2H1DA 3IBHA 1BEDA 4BVXA 2IWTA 4NHZA 1R4WA 1GNEA 1SJIA 2CQ9A 1FW1A 5D8IA 2AUVA 1XWKA 2BTOT 1GTUA 1O7UA 1ON4A 2WZ9A 3M9JA 1AXDA 1AQWA 3ZVJD 2F8AA 3GUSA 3ZIVA 1FG4A 4IQAA 5J3RA 3G9BA 4KDYA 1FHEA 1K0DA 2H0HA 1M2BA 2HSHA 3A2VA 2GQKA 4YH2A 3QAWA 3APSA 4GRFA 1TTZA 2LSTA 5G31A 1T00A 2XBIA 3TCOA 3UBLA 4TR3A 1WJKA 3KEBA 2B1LA 2VL2C 2JZSA 1ABAA 4MH3A 4GSNA 2F8FA 4KCAA 4XS4B 2HZFA 4O32A 1V57A 3F3RA 3F6DA 3WT2A 3A3TA 4QQ7A 4ECJA 3HCZA 1XCCA 1GP1A 1OE8A 1PGTA 4HDEA 2KHPA 4MF6A 1OE7A 3HZ4A 1EZKA 1SU9A 3EU3A 1B48A 4IBPA 2I3YA 2H72A 4LL4B 4PUFC 2GGTA 4XIHA 1VF3A 3RPNA 1O8WA 2L57A 4DSSA 3ZL5A 1K0MA 3C1RA 2I1UA 3Q74A 1EOGA 5G2ZA 3UJ1A 1E2YA 3KD0A 2QKEA 2IMFA 3FZAA 3CSHA 1ZOFA 2IMIA 2FLSA 3EU4A 4MA9A 3VPTA 4AJ8A 1GSQA 4N10A 5D9VA 1MD3A 2V2GA 1X5DA 3KCMA 4ACSA 1SJ6A 1PRXA 1TW9A 4MJBA 2VOCA 3WGDA 2EIOA 2MMOA 3DWVA 2OKAA 2P5QA 3LWAA 4F2IA 4GCIA 4MP4A 1XWBA 5F05A 1PX7A 1OC8A 5GAND 4RI6A 1DE1A 3DXBA 1UVZA 2CAQA 1O8XA 1JZWA 2C0DA 4MH2A 3ED3A 4DEJA 1T4ZA 5EL8A 2L6CA 3G7YA 4I5QA 3RBTA 4G19A 5CYYA 3UEMA 4OWYA 3E9JB 5CRDA 5DDLA 2H1BA 4O5RA 2LNSA 2LQQA 3P7XA 4TR1A 1YKCA 4L0UA 2WDUA 2I9HA 3FEUA 3KMOA 4MPGA 4POKA 4FYBA 1TI3A 3ERFA 1ERUA 1OYJA 1FAAA 3CMIA 4YQMA 4EO3A 2O85A 2VLUA 1BG5A 1K0CA 2VL2A 4XS6A 5GAPD 5JCUA 4GLTA 1IYIA 2OACA 4ZXGA 5B6NA 3RPPA 4HZ2A 4HQSA 4IELA 1TK8B 2FWFA 3AY8A 3IC4A 1EV9A 1OKDA 3GTUB 5B7CA 2CV4A 4KB3A 2G0FA 3P8WA 2L4QA 1AUCA 2MBSA 2H6ZA 4MJAA 1N8JA 3GFKA 1WE0A 1OAZA 2YWOA 4I2TA 2R4VA 2P31A 3KH9A 4E8EA 2P0GA 5EY6A 4XTSA 3S9FA 3E3EA 3UARA 2YV7A 3KJYA 4MZBA 3VWXA 4N0VA 3D5JA 2DJ0A 2B7JA 3H93A 4POBA 3HKRA 1U3IA 3ZTLA 2H0GA 2MYGA 3LSZA 2RM5A 2KUCA 2DLXA 4LA1A 3HDCA 2B5XA 3LXTA 3GIXA 4WBJA 3LYPA 1M0UA 4RI7A 2R2JA 2K9FA 2AYTA 2RUEA 5GSSA 1Z7RA 4HQZA 1TRWA 2KOKA 3I6AA 1PSQA 1ERWA 2XPDA 1X9MB 2H66A 5AISA 1C72A 4TKYA 2FY6A 1JLVA 5ID2B 3PH9A 3QAGA 2L59A 1BX9A 2LS5A 1GTIA 2PVOC 3VURA 2Z9SA 3US3A 1QFNA 2CT6A 4WF5A 2VIMA 1VRSD 2FWHA 1BYEA 2YOIA 2NBSA 1TJDA 3CRUA 4PQHA 1JFUA 1FB6A 4Q5RA 2F9SA 5CRWA 4ZILA 5F06A 3BBYA 1XIYA 2KP1A 2HZEA 4Q5FA 3EURA 4RQXA 3ZVJA 1SL1B 4AGSA 2JACA 4KH7A 1FVJA 4FH8A 5HR1A 3UBKA 1MD4A 2QC7A 4XHMA 1SK2A 1BQ7A 3CBUA 1G6WA 1A8LA 4ZB9A 1EEJA 3TKSA 4BWSA 2DJJA 1NM3A 4WF4A 1XZOA 3ZZXA 3HD5A 3LGCA 5F8BA 2GZZA 2H0IA 4O7HA 1WIKA 3PR8A 4BWQA 2IFQB 5DALB 2IMDA 4OCFA 4KA0A 4KUNA 5IPHA 1UN2A 1A0RP 2VO4A 2QSIA 1QMVA 4NPBA 1S3DA 1X0RA 2LJKA 2LJRA 3C7MA 4K0GA 2HT9A 4O92A 2HFDA 1Q4JA 3MAKA 3CSIA 3J7Yk 2GSTA 1ZZYA 1MDJA 3SBCA 2H76A 5D9WA 2JSYA 2WB9A 5B8AA 2RM6A 1YZXA 2YJ7A 5IOXA 4P3YB 1XOBA 1JZOA 4ZIJA 1T3BA 4IKHA 2MMNA 3QCPA 1I9DA 3NZNA 1F3BA 1S3AA 4DSQA 5HR3A 1R7HA 4YQUA 1O73A 1WOUA 1GNWA 3O76A 2CVKA 4MABA 1U3AA 3VI7A 4IJIA 1R5AA 3ZFLA 1T1VA 2FWGA 3GX8A 4J2FA 1SK0A 1HYUA 3QR6A 5ECRB 4AJ7A 4JZQA 5GZZB 3K8NA 5AIVA 4POLA 1B4PA 5HFIA 1X9WB 2GSSA 4XCSA 2E7PA 1A2JA 4V1Ap 3W8JA 3TKQA 2RIIA 3LG6A 3TUEA 2FHEA 1A2LA 1ZGNA 5CNWA 1X5CA 4BVYA 2WGRA 4K9ZA 2X8HA 3C71A 3HYPA 2AB6A 1PKWA 2J23A 1K3LA 1B8XA 5INYA 2IJYA 4PGTA 1XVQA 4ZBAA 3TKRA 3ZIJA 1HNAA 3KP9A 4OFTA 5IMFA 3L9VA 4F82A 4IP1A 2TRXA 2H30A 1GULA 3FK8A 1YF1A 4N0ZA 3UVHA 1WP0A 2L4CA 4V2NA 4LMVA 3L78A 3FW2A 4K7NA 2H74A 2L5OA 4BA7A 2FUG2 4K0NA 13GSA 1YJ6A 4YAPA 5IM9A 2C0GA 4MF7A 1SL2B 3BD2A 2LRNA 3I43A 2H6YA 3BOAA 1VF4A 1RQMA 6GSWA 2R6KA 3EC3A 3KIJA 1KNGA 2TRCP 6GSXA 5IPGA 2VCWA 3GX0A 4WBRD 4PNGA 2IPAA 2O8VB 5KN2A 5GSTA 1V2AA 3GMFA 1XW9A 3LFLA 4ML1A 4DSSB 3APQA 3M9KA 2LRCA 4WKWA 3GKNA 4WETA 5C00A 2DBCA 4E8HA 2V6KA 3GRXA 2LNTA 2F3MA 2VM2A 3A2WA 1THOA 4I2UA 14GSA 4CHSA 2GT5A 2N5AA 5IO2A 1Z7PA 5IO0A 4EVMA 1EWXA 1A0FA 4PQ1A 1FB0A 2GTUA 4HOJA 4BL7A 3W6GA 2K8SA 3TB2A 2OBIA 3ZMLA 5CP1A 1G0TA 4G9HA 4GTUA 1J9BA 2IMEA 1KBNA 4JBBA 4GXZA 1FVKA 1GSFA 2A2RA 3HZ8A 4IN0A 1T8EB 1WMJA 1QXHA 3H1NA 2CAIA 3SWLA 1M9BA 4KAEA 5E4WA 1Y25A 2LEGA 5IOWA 3ME7A 4OO4A 5L71A 3IK7A 4NWYA 3MNGA 2MMZA 4EDYA 1W89A 2YJHA 3QOUA 1EP8A 2E2MA 3NOFA 3QD9A 3ZRDA 1SKRB 3VK9A 3HJMA 1JZDA 2YP6A 3IRAA 4OFNA 2AV4A 3BCIA 4TR1B 3H79A 3F0IA 3KP8A 3G7JA 1GUKA 2VL9A 4MJCA 3LXZA 1SK1A 2M80A 4YAVA 1XW5A 1J0FA 1OC3A 2YPMA 1URMA 5IIZA 5JWRB 5D93A 3O6TA 1BAYA 1Z6NA 3C73A 2PU9C 6GSSA 3EMXA 4Q5NA 1OC9A 5IMAA 4FIWA 2FGXA 4K7IA 1NHOA 4DVCA 3MDKA 2GLRA 1WRYA 1U88A 3HVXA 3QDNA 1MDKA 1V40A 1K0BA 2TIRA 2P5RA 3TJJA 3Q6OA 1YKAA 4ML6A 4X0XA 3KM6A 3GV1A 2ES7A 3F4RA 3IA1A 1G7EA 4N30A 2X99A 1MTCA 2WCIA 1GLQA 1ZYEA 3GH9A 3QFAC 2N5BA 1SENA 3IXRA 4MZWA 5IMVA 5DQYA 5DAKB 4JR6A 1M9AA 3A2XA 3UL3A 2YV9A 5G5FA 5IMCA 5DVBA 2B1KA 4KW6A 1GSDA 1K3OA 4KX4A 2YZUA 2H01A 1H75A 2PWJA 1TU7A 2FA8A 1PKZA 3EINA 4YQVA 4WXTA 2C8UA 9GSSA 2YWIA 5AIXA 3GKXA 3H8QA 5D9TA 3EMPA 5J9CA 3E0UA 4EXJA 4OCEA 2B7KA 3RHBA 3U6VA 4F0BA 1GSSA 5IQYA 2DJKA 4HI7A 4NHWA 2MBTA 2REMA 2F51A 2H1GA 1A2MA 2AJQB 2HZEB 4RUVA 2V41A 3VWVA 4KCEA 5DJLA 1USBA 2LUSA 3CRTA 5AN1A 3CTGA 1SJZA 1EP7A 2PBJA 3DMLA 1PX6A 2O89A 4QL9A 1F2EA 2K18A 4EL1A 1GRXA 3HVSA 4I97A 3HA9A 4G10A 7GSSA 4KSMA 5FWGA 2PVQA 3VFIA 2HSYA 4KNDA 2VM1A 3TGZA 2OE3A 2GSRA 4MZCA 3TRPA 1X9SB 2H1AA 3F9UA 2GS3A 3C1SA 4EE0A 2JZRA 2DSAA 3L0HA 2E0QA 4IJ3A 3TRXA 2VCTA 2ON5A 3I9V2 5JWOB 4OMVA 2CVDA 2JL4A 5FHIA 3GN3A 2VCVA 2LV3A 11GSA 2MZCA 3QAVA 5IMZA 1ZYQB 1ACVA 2DMLA 1GSEA 2BMXA 2PGTA 20GSA 2DJ1A 1H4OA 3N5OA 4XRAA 3PGTA 1JZRA 5HFGA 4GQCA 5J4UA 1WPIA 3APOA 1SKSB 1YEPA 10GSA 6GSVA 3WGXA 1FO5A 4LLRA 3LQ7A 4Z7XA 4J56E 2NPBA 2IL3A 1K0AA 4MMMA 3TDGA 3M0FA 6GSYA 3LORA 5FT3A 2C3TA 2IN3A 5ECKB 2WJUA 5ABRA 3ZYWA 4EC0A 4TOPA 4XRDA 3HHVA 4D73B 1TRSA 4L5OA 1QQ2A 5J5NA 4H86A 2MMAA 1IYHA 5H5RA 2JADA 2OBKA 2IMKA 2GT6A 1TK5B 1X5EA 5LNKe 4MLYA 3U5RE 3FY7A 3VWUA 3IAM2 4I8BA 4IGJA 2IFQA 2PPTA 1PL1A 1SL0B 1O81A 4ECBA 2R37A 4MJEA 3BCKA 1W4VA 2AHEA 1M2DA 2GVPA 3GL5A 4FO5A 2PN8A 2K8VA 1M7TA 2AAWA 4I6XA 1Y6EA 4OD7A 4L8EA 3ISOA 4KDXA 1GWCA 1ZL9A 1FOVA 1PQNA 5ECNB 2B6MA 2CZ3A 4PQIA 2L6DA 2DIZA 2A4VA 3I69A 1SKWB 1ZCPA 3CTFA 1JHBA 1EEMA 4LMWA 2HYXA 2K6VA 3ERWA 2NDOA 1GSUA 2LJAA 1F6MC 4EF0A 2ON7A 3D4TA 2QGVA 1Z3EA 2M72A 2EC4A 1R26A 2C3NA 3TJKA 5HFKA 2OADA 2KP2A 17GSA 1EGRA 2VLVA 2OE0A 3IR4A 3DVXA 1XOAA 3L4NA 3EYTA 4OFMA 3UMAA 4K8MA 3VI5A 1GSYA 4AF2A 2C80A 1ERVA 5CRHA 5CAXA 5KEJA 1TXXA 1F3AA 3TJFA 2GZYA 3FR3A 1SYRA 3FZ4A 4JRRA 2HRNA 1K3YA 2D2ZA 3DKSA 1O6JA 5EPFA 3FKFA 2LKUA 4F03A 2XC2A 5ECIB 3HVVA 5ECHB 3LYKA 3F4TA 3FRCA 1GH2A 2R5GA 1SD8A 5ECSA 3GKKA 3QPMA 4IP6A 2JSZA 4MPFA 2FA4A 5AGYA 3HXSA 2VD0A 1XWCA 1K0OA 3IOSA 3KH7A 4KDUA 1A24A 1VF1A 1NHYA 2FNOA 1E6BA 2N5FA 2C0EA 4NAXA 4ECIA 4POMA 5CO3A 4XS1A 1VGLA 2LTKA 3ERGA 1UA5A 4HUAA 1EGOA 3M1GA 4WR4A 1TOFA 1O85A 5G5EA 4TXOA 3M8NA 5DCHA 4ID0A 2NTOA 1AQVA 4JR4A 2KLXA 1G6YA 2HI7A 1MEKA 2CX3A 4LL1B 3VWWA 4L0WA 5IMDA 4TW5A 2DJ2A 1TI1A 4KGIA 2DJ3A 3UOMA 1OKTA 1XVWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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