The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
197
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structure length |
197
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Chain Sequence |
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Peroxiredoxin-4
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| publication title |
Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
67
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| structure length |
197
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| sequence length |
197
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E
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| ec nomenclature |
ec
1.11.1.15: Peroxiredoxin. |
| pdb deposition date | 2011-08-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00578 | AhpC-TSA | AhpC/TSA family |
| A | PF10417 | 1-cysPrx_C | C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KP1 A; 1AAZ A; 3HVX A; 4FH8 A; 2DJ3 A; 2PBJ A; 1ILO A; 1MDJ A; 3KTL A; 2OAC A; 1ZMA A; 3G7I A; 1GL8 A; 1O8X A; 3HVS A; 2YJH A; 1XXU A; 1XVQ A; 3UIW A; 3P7X A; 1MD3 A; 4KCE A; 2FA4 A; 1I5G A; 1Z7P A; 3W6G A; 3ZVJ A; 1CQG A; 1YDK A; 1ERV A; 2P5Q A; 3VWX A; 2LS5 A; 1DE1 A; 2YAN A; 3GTU A; 1MD4 A; 4HDE A; 1R26 A; 3VWV A; 9GSS A; 2AB6 A; 2VLV A; 2YWN A; 2VOC A; 4POL A; 1XWA A; 1GUL A; 3FRC A; 4KE3 A; 1VF1 A; 5FHI A; 2H75 A; 2NBS A; 3N9J A; 4DSQ A; 5E4W A; 3ISO A; 2H0G A; 1T4Y A; 5HFK A; 3CBU A; 1BAY A; 3H8Q A; 3US3 A; 2F3M A; 5D96 A; 4AF2 A; 3VI7 A; 2AHE A; 2XBI A; 1YY7 A; 2NPB A; 2YP6 A; 1XOB A; 2LST A; 1XWG A; 5J9B A; 4NXI A; 2B3S A; 3L78 A; 2LRN A; 2FD3 A; 1J0F A; 3D4T A; 2OBI A; 3IC4 A; 3ME8 A; 5DAL A; 1GTU A; 1GWC A; 1E2Y A; 1YJ6 A; 3KD0 A; 1K0D A; 4JE1 A; 5H5S A; 2WB9 A; 1B8X A; 3KP9 A; 3G9B A; 1A2J A; 1V2A A; 1ZZY A; 2AUV A; 4XS6 A; 3ZFB A; 2WZ9 A; 1JZD A; 4H86 A; 1Z9H A; 1QFN A; 1H4O A; 3KIJ A; 2ALB A; 4HUA A; 4BL7 A; 5ECO B; 3DKS A; 3ZRD A; 2GZY A; 2DIZ A; 2GZZ A; 4XHM A; 2DLX A; 2IIY A; 2YZH A; 2H66 A; 3Q6O A; 3QR6 A; 2VM2 A; 4PQH A; 5DJL A; 2KUC A; 1WWJ A; 3DML A; 4FYC A; 4D73 B; 1EGO A; 3C7M A; 1OVN A; 5AIV A; 2LNS A; 3F6F A; 3UVT A; 4BPY A; 3FYG A; 3F63 A; 4KUN A; 2QSI A; 3G7J A; 4PNF A; 3D6I A; 4RI7 A; 3ZYW A; 1J9B A; 4O92 A; 1FO5 A; 2XC2 A; 4ZBA A; 5ID2 A; 3TCO A; 3HKR A; 3W8S A; 4N30 A; 3APS A; 17GS A; 2L6D A; 5F07 A; 4ZL7 A; 2A2R A; 1X5C A; 5DAK A; 5H5Q A; 2R2J A; 2LTK A; 2TRX A; 1SK0 A; 2F51 A; 1N2A A; 5KEJ A; 1K0O A; 4HJ2 A; 2LRC A; 4PUR A; 4XCS A; 3WGE A; 3TUE A; 5EY6 A; 1AIU A; 2F8F A; 2H30 A; 2RUF A; 1HNC A; 1OAZ A; 3MWH A; 3GUS A; 3HY2 A; 2FHE A; 4K8M A; 4ISD A; 2IN3 A; 2H72 A; 2HZE B; 2K9F A; 2H6Y A; 5B8A A; 1C72 A; 2VD0 A; 3TKR A; 2PU9 C; 4TR3 A; 4DSR A; 4F9Z A; 2MMN A; 1GTB A; 2Z9S A; 18GS A; 1A8Y A; 2A2S A; 3HJM A; 2B1K A; 4G10 A; 3TJJ A; 4WET A; 3WT2 A; 3K8N A; 4BA7 A; 2OE1 A; 2GLR A; 3HJO A; 5HR1 A; 4O5R A; 4P3Y B; 4TN8 A; 3FK8 A; 4K6X A; 4EKZ A; 2C3Q A; 3D21 A; 5EPF A; 2LJR A; 2H1G A; 4NHZ A; 2KHP A; 5D9T A; 2DJ1 A; 1YF0 A; 2C1Y A; 1EEJ A; 3IXR A; 3TKQ A; 4HU7 A; 1WIK A; 4BWS A; 1TRS A; 3E0U A; 1SJI A; 1OYJ A; 3NZN A; 4OWY A; 4TRX A; 2HZF A; 2VO4 A; 2H1A A; 3IDV A; 4E8E A; 1WPI A; 3A3T A; 3ZIJ A; 3DIE A; 4MP4 A; 1FVK A; 4OO4 A; 2ZNM A; 1FAA A; 4IBP A; 4G19 A; 3V1W A; 2VIM A; 4MF6 A; 1XFL A; 5CO3 A; 3F3Q A; 2YNX A; 3CRU A; 3E9J B; 2L4C A; 4NMU A; 2DC5 A; 3HDC A; 4NAX A; 3GIX A; 3EE2 A; 2LJK A; 2VUP A; 4OFN A; 2H6Z A; 4PUA A; 3F8U A; 1G0T A; 1SK1 A; 1S3D A; 3RHB A; 3APO A; 2H73 A; 4RQR A; 3ERW A; 1ZYQ B; 4Q5Q A; 4F2I A; 6GST A; 5ECQ B; 2H6X A; 2CZ2 A; 1KTE A; 4WR5 A; 1UC7 A; 5CRW A; 1GSU A; 4IJ3 A; 4WBJ A; 1RW1 A; 1WOU A; 2H1D A; 1B9Y C; 1VF2 A; 4ZBB A; 1ZL9 A; 3DWV A; 4N11 A; 3HYP A; 4JBB A; 4I6X A; 2JSZ A; 5CRG A; 3KJY A; 3WD6 A; 1DSB A; 5CP1 A; 2IWT A; 8GSS A; 3L9U A; 3MNG A; 5CRD A; 5HFG A; 5J3R A; 2GQK A; 3UVH A; 5A5K A; 4D73 A; 5F0G A; 4XS4 A; 2EIO A; 3S9F A; 2B5Y A; 4MJA A; 5ECN B; 2H8L A; 1ZOF A; 3NIV A; 4RUV A; 1WRY A; 2OJL A; 5ECH B; 1EP7 A; 1G7O A; 5J5N A; 1SKR B; 5IOX A; 1AQW A; 3TRP A; 3QFB C; 3KZQ A; 4PQ1 A; 2LV3 A; 3LFL A; 1K3L A; 2LNT A; 1GNW A; 1M99 A; 4FIW A; 2EIR A; 2H74 A; 4O32 A; 1THX A; 4EL1 A; 3DYR A; 3TOT A; 1NSW A; 2WS2 A; 1BED A; 3LWA A; 4OMV A; 5GAN D; 5ECM B; 19GS A; 3KMO A; 1PGT A; 2DBC A; 5J41 A; 4KH7 A; 4ZB6 A; 4IKH A; 3IV4 A; 3CXG A; 2HZE A; 1EOH A; 4PX1 A; 5DQS A; 4KND A; 4V1A g; 5D9W A; 1SEN A; 1F2E A; 4WBR D; 4GTU A; 5DJM A; 3LYK A; 5IMF A; 3ZVJ D; 3EMP A; 4EXJ A; 3GKX A; 5EVO A; 2M46 A; 2L5L A; 1WE0 A; 4TR1 B; 1TOF A; 5COH A; 2BJX A; 2HT9 A; 3KH9 A; 1HQO A; 3VI5 A; 3D22 A; 1K0C A; 4ID0 A; 4MA9 A; 2WGR A; 2N5B A; 3RPP A; 1XWK A; 20GS A; 2R5G A; 2C80 A; 1OC8 A; 3Q18 A; 1A8L A; 1TI3 A; 3DXB A; 3ZL5 A; 3AY8 A; 2ON5 A; 4F82 A; 1EV4 A; 2D2Z A; 2YZU A; 4GWR A; 4ZIL A; 3RPN A; 2E2M A; 4XS1 A; 3GUR A; 3ERG A; 4DVC A; 2WRT A; 3DD3 A; 3FZ9 A; 3VUR A; 2H70 A; 3FZ5 A; 5DAK B; 3FY7 A; 2VCQ A; 4HEA 2; 1UN2 A; 3O76 A; 2YPM A; 1MDK A; 4F0C A; 5IOW A; 2JAC A; 4BVY A; 1YKA A; 5IMZ A; 1SKW B; 3TDG A; 2GSS A; 3CYN A; 2V6O A; 4TR4 A; 4KAE A; 4JED A; 1QQ2 A; 2HI7 A; 2YV7 A; 5G30 A; 2CZ3 A; 3LSZ A; 4KDU A; 2YJ7 A; 4YQM A; 1GNE A; 3N5O A; 2QGV A; 1YQ1 A; 3ZIV A; 1EOG A; 4MPG A; 3JCM L; 1BG5 A; 3L9V A; 1X9W B; 1B48 A; 2PVO C; 4KGI A; 2PUK C; 2C8U A; 2OE3 A; 10GS A; 1M7T A; 3FZ4 A; 5FWG A; 2LEG A; 1X9M B; 4OCE A; 2R4V A; 3TKS A; 2GQL A; 1AXD A; 4GSN A; 1B4P A; 1M0U A; 3O6T A; 4EC0 A; 1NW2 A; 4IEL A; 1XIY A; 4XTS A; 5DVB A; 1RQM A; 1JFU A; 1Z7R A; 1M9A A; 3DEX A; 5ENU A; 2KLX A; 1H75 A; 2K8V A; 6GSS A; 2J9H A; 1XPV A; 1W89 A; 2E2G A; 3ZRE A; 3I9V 2; 1OC3 A; 3MSZ A; 2V6K A; 1PX7 A; 2CX4 A; 3U6V A; 2JZS A; 3CTG A; 1GRX A; 4IP1 A; 3VK9 A; 1TK8 B; 4XIH A; 3ZML A; 2NTO A; 5LNK e; 1QMV A; 3F0I A; 4EUY A; 5ELA A; 2MBT A; 3U5R E; 1XWB A; 1F6M C; 1Q4J A; 1YKC A; 3QCP A; 3UBL A; 1FB6 A; 2WDU A; 3M9K A; 2QC7 A; 4K0N A; 3C1R A; 1IYH A; 1K3O A; 1WP0 A; 1M2B A; 1LJR A; 1ERT A; 4PGT A; 2B1L A; 1TKD B; 3DRN A; 4TXO B; 4QL7 A; 5CNW A; 3HZ4 A; 3TGZ A; 1EP8 A; 4TR1 A; 3WT1 A; 2V2G A; 2VCX A; 4K2D A; 5C00 A; 4ACS A; 1M9B A; 2H76 A; 4J2F A; 5KN2 A; 3J7Y b; 1SL2 B; 1KBN A; 3M8N A; 5D8I A; 2DML A; 3BCI A; 1K0M A; 1G6Y A; 4XRD A; 2CVD A; 1ERW A; 2VLT A; 6GSY A; 2V1M A; 4MJC A; 3BJ5 A; 1GUK A; 3WGX A; 1PL2 A; 3UBK A; 5ECR B; 4XS4 B; 1V98 A; 3EC3 A; 1TRV A; 4MZW A; 5D9X A; 1XW6 A; 3LQ7 A; 2TIR A; 2CVB A; 3E3E A; 4RQX A; 3RAZ A; 14GS A; 3IPZ A; 4ZB9 A; 3HD5 A; 2YCD A; 1K3Y A; 2MMZ A; 3M9J A; 3HJP A; 2C0F A; 4EDZ A; 11GS A; 5JWR B; 4BVX A; 1GSF A; 1MEK A; 4GSS A; 1GP1 A; 2X8C A; 4GLT A; 13GS A; 3OR5 A; 2XHF A; 1WMJ A; 1J08 A; 5ECS A; 2VL9 A; 5IMV A; 4XRA A; 2MBS A; 5GAP D; 1OKT A; 2EIQ A; 2P31 A; 3VPQ A; 4MH3 A; 1GSD A; 3UL3 A; 5G2Z A; 1G6W A; 5AGY A; 3A2X A; 5L71 A; 4MF5 A; 4Z7X A; 2PWJ A; 5JWQ B; 1SYR A; 4GXZ A; 3FR9 A; 4POK A; 1V40 A; 1BQ7 A; 1ERU A; 1OC9 A; 3H93 A; 4G2E A; 1EZK A; 2YWM A; 1T8E B; 2PER A; 4Q5N A; 1NM3 A; 1TW9 A; 2TRC P; 5HQP A; 1GLP A; 1SJ6 A; 1GTI A; 1IYI A; 3GRX A; 3GV1 A; 4LLR A; 4L0W A; 3LXT A; 3FR6 A; 4MMM A; 3UOM A; 1K0N A; 5D73 A; 1A23 A; 5ECP B; 3CSH A; 5DBQ A; 1DBY A; 2IFQ B; 2FWH A; 5CYY A; 5HR3 A; 2HXK A; 4K7O A; 1EGR A; 2HNL A; 2H19 A; 1X0R A; 3CTF A; 3GFK A; 1T7P B; 3GH9 A; 3HZ8 A; 4K9Z A; 2M80 A; 4IVF A; 3ME7 A; 2B7K A; 1ABA A; 3LOR A; 1TTZ A; 3J7Y k; 5ECL B; 4IS0 A; 4HU9 A; 5B7C A; 1U6T A; 2VAF A; 4MJE A; 2C4J A; 1CQH A; 3KM6 A; 3EYT A; 2GSQ A; 2CX3 A; 3VFI A; 2CAI A; 4YAP A; 4EE0 A; 5G1L A; 3IBH A; 5KN0 A; 1T1V A; 3IAS 2; 4POM A; 5GSS A; 2AV4 A; 4ZL9 A; 2O87 A; 5G5E A; 3H4K A; 3FZA A; 3IK7 A; 4IGJ A; 1TXX A; 1JHB A; 12GS A; 1ST9 A; 3P8W A; 4KA0 A; 3A2V A; 2K8S A; 3R2Q A; 2NDO A; 1SYX A; 3F4T A; 4TXO A; 4ZL8 A; 1ZYE A; 3P2A A; 5KN3 A; 1HYU A; 4NV5 A; 1ON4 A; 3ZZX A; 1JLV A; 4IW9 A; 5A4V A; 1USB A; 1VRS D; 4I97 A; 3IAM 2; 4EVM A; 4TVE A; 2PVQ A; 4MCU A; 5IPH A; 3A2W A; 1GH2 A; 4YQV A; 4DEJ A; 1FHE A; 4YQU A; 3RHC A; 1UVZ A; 3F9U A; 1N8J A; 1XCC A; 3SBC A; 2DJ2 A; 4K0G A; 1BX9 A; 4HQS A; 1QGV A; 1ACV A; 4MZC A; 5CAX A; 2M72 A; 2F9S A; 2E0Q A; 7GSS A; 5IO0 A; 3I43 A; 2IMI A; 3FKF A; 2P0G A; 2R6K A; 4MDC A; 1QUW A; 2IMK A; 1KEB A; 1BYE A; 3P90 A; 1DE2 A; 2WJU A; 1Z3E A; 2MMA A; 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2GQM A; 3GNJ A; 2OA7 A; 1O6J A; 1ML6 A; 4GQC A; 1OC9 B; 3TJB A; 2F8A A; 3TRX A; 2CA8 A; 3GN3 A; 5CRE A; 3IR4 A; 3F3R A; 3M1G A; 5DQY A; 5LCZ A; 3CRT A; 2N5F A; 3NOF A; 3QAV A; 2C3T A; 2LRT A; 3IK9 A; 4WXT A; 1XW5 A; 4QL9 A; 2LQQ A; 1ZCP A; 4GRF A; 4KSO A; 3IHQ A; 1YEP A; 3QD9 A; 4LL1 B; 1SKS B; 1QXH A; 2GZP A; 2V41 A; 3BOA A; 4LMW A; 4CW9 A; 1QK8 A; 1VF3 A; 3O3T A; 3LJR A; 4HZ2 A; 1F9M A; 1TRU A; 3APQ A; 2O85 A; 2P5R A; 3DGQ A; 1DUG A; 1FB0 A; 2QKE A; 2HSY A; 4NHW A; 1SL0 B; 3A5W A; 5IIZ A; 5F06 A; 2MMO A; 6GSU A; 3D0Z A; 4L0U A; 3KTB A; 4WR4 A; 1YEX A; 4TKY A; 3ZIT A; 4MZB A; 4YAV A; 4MH2 A; 1PKW A; 2IMF A; 4MAB A; 2GS3 A; 3VPT A; 3BBY A; 2AJQ B; 2REM A; 1V57 A; 5DCG A; 5A4W A; 1TU8 A; 4PNG A; 2B5E A; 3KEB A; 3PR8 A; 5EL8 A; 4KDX A; 2OAD A; 1GUH A; 4ZB8 A; 2H0I A; 1EWX A; 3L0H A; 1PRX A; 1F37 A; 1YF1 A; 2DMM A; 1E6B A; 2EC4 A; 4IQA A; 3PGT A; 4ZBD A; 1R5A A; 1VGL A; 3KMN A; 4WF4 A; 1AC1 A; 1T00 A; 3HXS A; 2K18 A; 2RM5 A; 1TK5 B; 3CSJ A; 4NPB A; 2CVK A; 2IL3 A; 4TR0 A; 4HJM A; 3RDW A; 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