3TKQ | Genus

Total Genus 61

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	61
sequence length	191
structure length	191
Chain Sequence	SKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Peroxiredoxin-4
publication title	Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4 pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	61
structure length	191
sequence length	191
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2011-08-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tkqA00

3LXTA 4ZXGA 1SK1A 2LRCA 3IAS2 4X43A 5AISA 5JCUA 2LJAA 2PU9C 2GGTA 4F9ZA 3DEXA 3HJOA 3IK9A 2JSYA 3QAWA 1ML6A 2P5QA 1G6WA 1EZKA 2RUFA 1ZYEA 2CX3A 5HFGA 3LJRA 1O81A 2GSRA 2IIYA 3J7Yk 1LU4A 3R2QA 4AF2A 4IP1A 3DWVA 2H30A 1O8WA 4ML6A 2GZZA 3TJJA 3UBKA 1KEBA 5IQYA 4TR1B 1GTBA 5G5EA 2PVQA 5CRDA 3GSSA 3GV1A 1V2AA 1ACVA 5G1KA 3ME8A 4POKA 5GAND 1FG4A 4K6XA 1T3BA 2M80A 4F2IA 1TRWA 1ZGNA 2H66A 1FVJA 4OFMA 1VF2A 3RHCA 4LL4B 2LKUA 5F8BA 1HNBA 1T4ZA 2P5RA 2LRTA 2FY6A 2YNXA 3LQ7A 1O6JA 1WPIA 6GSUA 2VD1A 4ZB9A 3UBLA 4J57E 2YWMA 5IMVA 3LSZA 3I43A 4PQIA 3ZFLA 1ZMAA 4BPYA 2ZCTA 3RAZA 2H01A 3Q6OA 5A4VA 3KD0A 4IJ3A 1S3AA 1GSEA 2H0GA 3US3A 1S3CA 4XIHA 4BVYA 3F0IA 1ZOFA 2IWTA 5KN2A 1XWCA 3ZL5A 2BTOT 2J23A 1JFUA 2MMZA 1B4QA 3C1SA 3L0HA 1I9DA 2F51A 1X9SB 1ERTA 1OC9A 1V40A 3APQA 3GFKA 5HR0A 1F2EA 4F03A 1OC9B 2R6KA 2F8AA 1A0FA 2HXKA 2M72A 2PWJA 2WDUA 3VPTA 3ZTLA 1PL1A 3VI7A 2KP2A 1R7HA 2WZ9A 4JR4A 3P90A 5IPGA 2LJRA 2FWFA 5EL8A 4XS4A 4NXIA 5DBQA 2ZNMA 3H79A 4G2EA 5B7CA 4KSOA 2NVLA 4XS4B 1GSDA 3WD6A 5DQYA 3FR9A 4NWYA 3GSTA 4DSQA 5AIXA 2IMIA 3CTFA 1V58A 2B5EA 1SYRA 3LYKA 6GSXA 2CZ3A 3KP8A 1BAYA 2AAWA 1TDIA 4XCSA 1XFLA 5EPFA 2JADA 3H4KA 3NOFA 3NIVA 1J9BA 3D21A 1F37A 4HU9A 1SD8A 2QSIA 2VAFA 2ZUPA 3M9KA 3ZYWA 1SK0A 3WT2A 4MK3A 4KX4A 1EEJA 4ZBAA 1SJIA 1XVWA 5CAXA 1H4OA 4N0VA 3ZVJA 1VRSD 2FGXA 3TJFA 2WRTA 3HCZA 1ABAA 1MDKA 1GP1A 1XBSA 1OAZA 4K1FA 3EURA 2IMFA 3VLNA 5H5SA 2FWHA 2HRFA 2CQ9A 4WF4A 2VCVA 2VM2A 4POLA 3RBTA 5JCWA 5DVBA 1X5EA 4OMVA 2N5BA 2X64A 2VCZA 2REMA 1SL0B 4NHZA 1K0MA 3KJYA 3WGDA 4KA0A 2LJKA 4ZB8A 2VLVA 1RW1A 3EVIA 1M9BA 4HEA2 1VF4A 3F9UA 2VCQA 4YH2A 2RUEA 3SWLA 3DGQA 4NV5A 2VM1A 4YQVA 4K0GA 5CO3A 1WIKA 3GH6A 4CW9A 4RQRA 3ZIJA 3F63A 2AB6A 1NSWA 4KDXA 1TU7A 4HU7A 5GAPD 1HNCA 3GMFA 1RK4A 3HY2A 16GSA 1JLWA 4V2MA 1V98A 2XBIA 1MDJA 2WFCA 3M1GA 3O76A 1JZWA 5B6NA 1GTAA 2DJ0A 4PUAA 2GT6A 2DSAA 2PPTA 1GSSA 4MH3A 3ZVJD 1F3AA 1GUHA 4F0CA 1A2LA 4YQMA 4EF0A 2LUSA 4J2FA 2VO4A 1ZYQB 5G1LA 2E7PA 2JSZA 2X8GA 1KBNA 9GSSA 2B1KA 4E8EA 2DJJA 1J0FA 3HZ4A 3KP9A 3TJBA 1KNGA 3Q74A 4KB3A 5DDLA 5EY6A 1TK8B 5HFIA 5GZZB 1A24A 2J9HA 4TKYA 1BEDA 1TRUA 5IPHA 3GURA 4FO5A 1TRVA 1XXUA 4MJAA 3HYPA 1DUGA 4MLYA 4ID0A 2LEGA 5D9TA 2LSTA 4DVCA 4I2TA 5ID2A 1USBA 1WE0A 5ECIB 1SL2B 2VL3A 4XTSA 5ID2B 1O73A 4K0NA 3L78A 3VWXA 3ERFA 4JU5A 2K6VA 1T00A 1G7OA 5DJMA 1Z5YE 1VF3A 2DC5A 2R2JA 3UVTA 2B7KA 4OFTA 2YWOA 2DLXA 3GYKA 4XS6A 2O8VB 5CRWA 3BOAA 4N11A 1GSQA 2WGRA 4ZBBA 1BYEA 2A2SA 4OCFA 1HD2A 11GSA 3A2VA 5J5NA 4ACSA 1NM3A 3M9JA 3KMNA 1WP0A 4YAPA 1GRXA 2B1LA 3TKPA 13GSA 3L9VA 2IFQA 4IQAA 1ZCPA 3NZNA 4I8BA 1GTUA 3C1RA 1T7PB 3LG6A 2A2RA 2XPDA 2IFQB 1N8JA 4DSRA 1NHOA 2DIZA 1TI1A 4F82A 4POBA 4TRXA 4L0UA 2LV3A 1QXHA 3IR4A 1UA5A 4RI7A 3WGXA 2LQOA 3EMXA 4KUNA 3H1NA 3GN3A 2GSSA 1E6BA 1SJZA 4MF5A 1YJ6A 3EU3A 4IKHA 5ECKB 3GKKA 2XC2A 3A5WA 4TR3A 2RLIA 1ZL9A 4PX1A 5EVOA 4HS1A 3APOA 4XRDA 3GL3A 4IP6A 5HR3A 1XWKA 3LORA 4KDYA 4TXVA 3O3TA 4IVFA 4MH2A 3F8UA 3RHBA 3HD5A 5DQSA 4LLRA 4N0ZA 2JZRA 4J56E 4OCEA 5CYYA 2YANA 5CRGA 4I6XA 4EXJA 2IPAA 2PBJA 2H1BA 2NDOA 1ERVA 3CRTA 3D5JA 5F07A 5ECLB 4PQ1A 5HR2A 5DCHA 3TKSC 4MZBA 1Z7PA 2E2MA 2DJ2A 2F8FA 3KCMA 4EVMA 2L6DA 4MDCA 8GSSA 2B6MA 3FHKA 4L0WA 5B8AA 4KDUA 3FEUA 3DYRA 3N5OA 2DBCA 2CVKA 2H0IA 3QR6A 2CV4A 3DXBA 3PR8A 1PMTA 2IMKA 1K0NA 2C3TA 1YF0A 1TU8A 2I1UA 1FVKA 2H70A 3QAGA 4MJCA 1LBKA 4ML1A 4G10A 2H72A 3HZ8A 4TVEA 1G6YA 2VL2C 2YZHA 19GSA 1M2BA 3KXOA 1PKWA 3CSHA 3V1WA 2MMAA 2EC4A 3GX0A 3HVVA 3KGKA 3MNGA 1DE1A 3RPNA 1YEPA 4ZL8A 4X0XA 4BA7A 2RM5A 1X5DA 2VUPA 2WJUA 3I6AA 2HZEA 3H93A 5ELGA 4DEJA 2GQMA 4NPBA 4TN8A 5J9CA 2HZEB 2IMDA 4FIWA 4PQHA 4ISDA 3ZZXA 3L9SA 3GA4A 3KEBA 4IHUA 5FWGA 1IYHA 1WMJA 4MPGA 3UIWA 4V2LA 4EUYA 5D8IA 4D73A 5KN1A 3C8EA 2TRCP 1PSQA 3D22A 5H5RA 4D73B 2L5OA 2R3XA 4AJ6A 2N5AA 1B8XA 5D9VA 3U5RE 3P7XA 1FAAA 3BCIA 3BJ5A 1A2JA 2XPEA 1ERWA 3IDVA 1SKRB 1EGOA 1MEKA 1QGVA 2IL3A 1DBYA 4GSTA 2G0FA 2H1GA 1WRYA 5LD0A 2CAIA 4GRFA 2V1MA 3W8JA 3ED3A 5HQPA 2I3YA 3D6IA 22GSA 1G7EA 2PERA 2FLSA 2B3SA 4MP4A 4GLTA 1SK2A 1YY7A 3ME7A 2GZPA 3A2WA 3Q19A 5COHA 2FA8A 1OC3A 4BL7A 2TIRA 3AY8A 2HLSA 3TCOA 4KNDA 1Z6MA 5IMAA 3TRQA 2GT5A 3FZ9A 1TP9A 3MAKA 2H6YA 5ELAA 3SBCA 1A2MA 3PINA 5LNKe 2ES7A 1SKSB 1PQNA 4HQZA 4TW5A 4WF5A 3HJMA 1A0RP 4GQCA 5JWOB 3FY7A 4NMUA 4IN0A 4Q5NA 1FHEA 4GCIA 1JHBA 7GSSA 1DSBA 4JBBA 4GQFA 1AAZA 2B5XA 2V6OA 3LYPA 2GSQA 1SYXA 5AIVA 1AQVA 1XZOA 4GSSA 4ZBDA 2I81A 1NHYA 2C8UA 3E0UA 3IV4A 18GSA 4FYBA 3C7MA 3MWHA 1QMVA 2H76A 3WGEA 5GSSA 2H73A 4TXOA 1UN2A 4HZ4A 3IK7A 2MMOA 3HKRA 3KIJA 1EEMA 3A2XA 5E59A 3VFIA 1ZZYA 2YV7A 4TXOB 1M2AA 3ZFBA 5IO2A 2N5FA 1UVZA 4GF0A 1IYIA 1GUMA 3TJKA 1TI3A 2AUVA 4HUAA 1HQOA 3GUSA 3PH9A 3DVXA 2XBQA 4QL7A 2CA8A 3M0FA 2C0FA 1X9MB 2CZ2A 2P31A 5IMZA 3ZRDA 3F3RA 1SD9A 1URMA 3L4NA 5JWQB 2EIOA 1WJKA 1EOHA 5D96A 4G19A 1DE2A 1PGTA 2L4CA 2V2GA 4FYUA 4K8MA 2HE3A 5HFKA 5IMFA 3Q18A 1X9WB 3WYWA 2K8SA 4X1UA 1Z3EA 3GHAA 4BWSA 3M3MA 2X99A 1YKCA 2GLRA 3CYNA 4I97A 2VLTA 2H1AA 5IOXA 5IMCA 2KOKA 1U3IA 5KN3A 3G7JA 4O5RA 1EP7A 3L9UA 5ECRB 2HYXA 1AXDA 1O8XA 1WOUA 2YPMA 2FA4A 3UJ1A 4NV2A 1B9YC 5D73A 2FCHA 2Z9SA 1WWJA 4YQUA 4Z7XA 2FD3A 1XIYA 3IXRA 5AGYA 3G7YA 1OYJA 2OADA 2M46A 5JCGA 2R5GA 4NHWA 2H0HA 3GKNA 4ZL7A 5D93A 4CDOA 14GSA 2V6KA 1U3AA 1MTCA 20GSA 3DRNA 4WBJA 1GLPA 2FWGA 1XOBA 2H6ZA 1SKWB 1BQ7A 2AV4A 1AIUA 4WEYA 4IQ1A 3UMAA 1M9AA 5F05A 1O7UA 3G9BA 2H1DA 3EE2A 2IMEA 3KMOA 5DAKA 1JZRA 1TK0B 2PVOC 4PGTA 5DAKB 2PN8A 3F4TA 2E0QA 6GSSA 1F3BA 2GZYA 1Q4JA 4L5OA 2MYGA 2KHPA 4POMA 1RQMA 1GSUA 2WCIA 2O89A 5A4WA 1PKZA 1OVNA 2HSHA 3APSA 4MZWA 4RQXA 3CMIA 4EL1A 3LEFA 3F4SA 4WETA 1R4WA 1X5CA 1NW2A 3IE3A 3E3EA 3GX8A 3FW2A 2CT6A 4O92A 4BWQA 3TGZA 4QQ7A 3TKSA 1QK8A 4YAVA 2DMLA 5G30A 2I9HA 2X8CA 2DJ3A 1EV9A 4OD7A 3MSZA 2YJHA 2JU5A 3LWAA 4KH7A 2VCTA 2AHEA 2TRXA 2BJXA 4F0BA 1LJRA 3D0ZA 2K8VA 3N9JA 2GSTA 2O85A 1EV4A 2OACA 2HZFA 2DJ1A 4K7NA 4O32A 1AW9A 1TKDB 1CQGA 17GSA 2O7KA 2VL2A 2MMNA 3GKMA 4V1Ap 1GSYA 5J9BA 5CRHA 4LMVA 5H5QA 1Z7RA 2FHEA 5D9WA 1MDIA 4PNGA 5FT3A 3BCKA 2HT9A 1JLVA 2CVDA 2L59A 1BX9A 5B8BA 1YDKA 3FZ5A 2KUCA 4XRAA 1N2AA 3E9JB 2GVPA 5DJLA 2YV9A 4ECIA 1XWAA 3K8NA 4P3YB 3CBUA 4KE3A 4WR4A 3GTUA 3VWUA 1C72A 1PX7A 1TJDA 1PD21 2OJLA 2VOCA 5ECHB 5J4UA 1V57A 4KSMA 4ILFA 5IOWA 3VURA 2L4QA 3UAPA 1AQWA 1GL8A 1JZOA 3G7IA 2PUKC 2YN1A 4KCEA 2OA7A 1A23A 3F3QA 1XCCA 3DMLA 1Y6EA 5AN1A 1SENA 5F0GA 2C4JA 3QAVA 5GSTA 3W6GA 5LCZA 5IMDA 4RUVA 2R37A 2FWEA 2D2ZA 1M99A 4AJ7A 4DSSA 1GTIA 4K7IA 3D4MA 5DCGA 2HI7A 1EWXA 3FR6A 2LNTA 4DSSB 2H6XA 1XW9A 3OR5A 1M2DA 1YEXA 2ON5A 3TOTA 4JR6A 4JE1A 3QDNA 5JWRB 3D4TA 3IHQA 4OWYA 2ON7A 1T8EB 3DKSA 1K0DA 3VI5A 3EINA 5KN0A 1HNAA 3I69A 1TXXA 1ST9A 1V9WA 3HA9A 3VWVA 4K7OA 2YZUA 3KTLA 2GDRA 3RDWA 3TUEA 3QD9A 2VL9A 4TR1A 3HVXA 4HOJA 10GSA 3GL5A 2CVBA 1UC7A 4MA9A 4MJEA 1U88A 4MPFA 1PN9A 2OBIA 5ECOB 3RPPA 2DJKA 3QPMA 1E2YA 3GIXA 2PMTA 3HXSA 1B4PA 1K3YA 4MMMA 2P0GA 1VF1A 1OE7A 4EDYA 1K0AA 5ECQB 2LRNA 5CP1A 4NAXA 1ON4A 3F6DA 2R4VA 3EYTA 1XWGA 2XHFA 2RM6A 1PX6A 3GRXA 3TRXA 1XVQA 4Q5FA 3M8NA 4ZB6A 5A5KA 2IN3A 3ZMKA 1EOGA 1PL2A 4TR0A 5ECMB 1TRSA 1YZXA 1GH2A 4V2NA 2CAQA 2FUG2 1VGLA 1TW9A 1GNWA 2I4AA 1F9MA 1AUCA 2NTOA 4MABA 3F4RA 12GSA 4LMWA 5ENUA 3IAM2 4JEDA 1W4VA 3QFAC 2YCDA 1BG5A 2GTUA 3FKFA 3ZIVA 3P2AA 4EC0A 5ECSA 1BJXA 3WT1A 4PURA 5C00A 3QMXA 3ISOA 2YP6A 4ZL9A 4GSNA 4TR4A 2A4VA 2WULA 2YWNA 1TTZA 1QFNA 2L57A 1O85A 4HJMA 2EIQA 1U6TA 5J41A 2H8LA 4IJIA 1GLQA 4EE0A 1K0OA 3LXZA 1XWBA 1XW6A 2O87A 2HFDA 3S9FA 2LQQA 3EU4A 3GH9A 3KTBA 3LGCA 4V1Ag 4O7HA 2L5LA 1YF1A 1ERUA 1OE8A 2JZSA 2KP1A 4MZCA 3EC3A 1YQ1A 1U87A 4MJBA 1KTEA 1SL1B 5IO0A 4MF7A 2K18A 3DVWA 4ECCA 1OC8A 3VPQA 6GSTA 3DIEA 2OKAA 3IOSA 3UL3A 2VLUA 3HVSA 1G0TA 2LS5A 5D9XA 3CXGA 1S3DA 5CREA 5ECPB 1FB0A 3P8WA 2C80A 3GNJA 4OO5A 2VD0A 3KH7A 3TDGA 4AJ8A 1R5AA 4K2DA 1AC1A 2VCXA 1A8LA 3LFLA 5F06A 2WB9A 3VK9A 3IA1A 5FHIA 2C0GA 1TK5B 4GTUA 2NPBA 1Y25A 2C1YA 2YWIA 4ECBA 1GULA 3KH9A 3FZ4A 4MF6A 4ULXA 2FNOA 3PGTA 4RI6A 1XPVA 4PUFC 2C0DA 1H75A 3BBYA 5G2ZA 6GSVA 1B9XC 4Q5RA 3C73A 4I5QA 3TKSE 2OBKA 2K9FA 5L71A 4ZIJA 1CQHA 4L8EA 3HJPA 3KM6A 2MBSA 4TOPA 1SJ6A 3O6TA 4N30A 4QL9A 1K3OA 2OE1A 1K0CA 1M0UA 4CHSA 1FB6A 1FO5A 2OE0A 5B6MA 1HYUA 3U6VA 3UARA 3HHVA 3J7Yb 4XS1A 2E2GA 3FYGA 2C3QA 2KLXA 5C04A 5G31A 5DALA 4G9HA 2B5YA 4EO3A 2LNSA 1R5PA 3HDCA 5DALB 3TKRA 5ABRA 4H86A 3TKQA 1B48A 4MCUA 4LL1B 4KW6A 5HR1A 5G5FA 3TJGA 1Z6NA 3JCML 2PGTA 4E8HA 1THOA 2H75A 4HJ2A 3ZITA 3KZQA 1MD3A 2B7JA 4K9ZA 6GSYA 6GSWA 1GNEA 4AGSA 3CSIA 3IC4A 4PNFA 2YJ7A 3IPZA 1XOAA 4HI7A 3TB2A 2L6CA 1R26A 1A8YA 2HRNA 4JZQA 2AYTA 2QC7A 4OFNA 2F3MA 3FRCA 3IBHA 4IELA 2C3NA 3ZMLA 5A4UA 4HDEA 2AJQB 2WS2A 5E4WA 3FZAA 1OKTA 2VCWA 2JACA 1THXA 2RIIA 3F6FA 1TOFA 4PXOA 4HQSA 1YKAA 4IGJA 5J3RA 2G2QA 1T1VA 4IS0A 1SU9A 1F6MC 4KAEA 4ZILA 4LA1A 3EMPA 4IW9A 1XW5A 3QFBC 2H74A 4I2UA 1QUWA 3VWWA 1Z9HA 3UOMA 3H8QA 4FYCA 2LTKA 4L5LA 4HZ2A 4EKZA 3GKXA 3CTGA 2VIMA 4GXZA 2OE3A 4EDZA 1EGRA 1I5GA 3TRPA 4OO4A 1K0BA 1J08A 2F9SA 2GQLA 1GUKA 1X0RA 2GS3A 3FK8A 4XHMA 2V32A 4WBRD 1GWCA 1PA3A 5INYA 2NBSA 3FR3A 2CX4A 4JRRA 1ILOA 1FOVA 4GWRA 2MBTA 1FW1A 3ERGA 1EP8A 2JZTA 3UVHA 4ECJA 4WR5A 5ECNB 3BD2A 3CRUA 3QCPA 4KCAA 1GSFA 4BVXA 5KEJA 2DMMA 2QKEA 2YOIA 1MD4A 3GTUB 2DIYA 4Q5QA 4N10A 2GQKA 3ERWA 2V41A 3EWLA 3W8SA 1T4YA 3A3TA 4KGIA 3QOUA 3CSJA 4FH8A 5IM9A 1JZDA 2HNLA 2QGVA 1M7TA 3UEMA 2JL4A 2H71A 4IBPA 1PRXA 3MDKA 2IJYA 1AQXA 3ZREA 4WXTA 1OKDA 2C0EA 1K3LA 2X8HA 3DD3A 1QQ2A 3TOUA 5IIZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3TKQA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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