3TKRA

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 with t118e mutation
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFEHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 65
structure length 197
sequence length 197
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tkrA00
4L0WA 1TRWA 1Q4JA 3P90A 2VL2A 3RDWA 4KCAA 1VF1A 2XPEA 5KEJA 4GWRA 3CMIA 5G5EA 2O85A 1FOVA 2VL3A 3LORA 3FRCA 1TRVA 5B7CA 4BWSA 1K0OA 3M8NA 3H93A 5B8BA 1X5CA 5HFKA 2H66A 3F6FA 1XFLA 3GRXA 17GSA 2MBSA 2PBJA 4P3YB 1YDKA 3F63A 3N5OA 1JZWA 3ZIJA 1SL2B 1SYXA 4F03A 2VLVA 1OYJA 3QD9A 4V2NA 3ZYWA 2L6DA 4DSSA 3ZMKA 1F3BA 5A4UA 2LQQA 4OFNA 4V1Ap 2VCWA 5G2ZA 3H8QA 4TR4A 4F0CA 5IOXA 2MYGA 4PQ1A 1QFNA 2HFDA 2VD0A 4YH2A 4GSNA 4RUVA 3WGEA 4IN0A 6GSTA 4MABA 3ZIVA 3ZVJD 4N0VA 3QDNA 3D0ZA 2IJYA 2X99A 1LU4A 4XIHA 1PQNA 1F6MC 4MF7A 4DVCA 3KEBA 2GT5A 3RHCA 4GF0A 2C0FA 1XCCA 4MZWA 4D73A 2LNTA 2DIZA 4HQZA 2X8GA 3TKPA 5HQPA 1GNEA 5IIZA 4EDYA 2CT6A 1AQWA 2AYTA 1QGVA 1M9BA 3GKMA 2M80A 4EF0A 3HJMA 4HOJA 3LXZA 2ZUPA 2L5LA 2LQOA 5DAKA 3F8UA 1VF2A 1PKZA 4H86A 4WKWA 5ECLB 2AB6A 1YQ1A 2AHEA 2BMXA 2VO4A 4IP1A 4TN8A 4J2FA 4JRRA 1FHEA 1BQ7A 3RBTA 3GIXA 1LJRA 5ECSA 2L5OA 3L9VA 4GLTA 4XRDA 3TB2A 3Q74A 4ZXGA 3EYTA 2GSRA 3HXSA 4JE1A 3A5WA 2NVLA 1XW5A 3RAZA 1THXA 2YV7A 2DBCA 5G1LA 2RM5A 1FVJA 1ON4A 1A24A 2HRFA 1SU9A 3FW2A 2H6XA 3CRTA 2FUG2 1VF4A 1PX7A 3C8EA 4PNFA 1RW1A 1G0TA 3FK8A 5DJMA 4BA7A 1U3IA 3FY7A 2JACA 1M7TA 3C71A 1TU7A 4KW6A 2NPBA 2YJHA 4K2DA 2B7KA 1TRUA 1GTBA 5EL8A 6GSVA 2GQLA 1Y25A 4O7HA 1XWKA 1SJ6A 1V40A 3GH6A 2OADA 1A0FA 1A8YA 2I3YA 2PVOC 3CXGA 2MMNA 1SD9A 4AGSA 4O32A 3QFBC 5ABRA 1T4ZA 1XOBA 2V32A 3LYKA 4IGJA 1B4PA 1AQVA 3D4TA 1OE8A 3ERWA 1EEMA 2FA4A 8GSSA 1GNWA 1PKWA 3KD0A 2R37A 2C80A 3WT1A 3A2VA 1LBKA 3FZ4A 5F05A 1QMVA 5IPHA 1QQ2A 3KGKA 4ISDA 1KNGA 4JEDA 4Q5FA 1NHOA 3IAS2 4I2UA 2CVBA 1ZL9A 4NAXA 2KP2A 5DCHA 1O73A 2VM2A 3TUEA 3VWVA 2E2GA 1I5GA 3BOAA 3IE3A 3TRQA 1MDIA 3EMPA 1XWCA 1K0DA 3A2XA 9GSSA 2GTUA 2VOCA 1YY7A 5ELGA 2VCXA 4GTUA 3H1NA 7GSSA 3P7XA 4LLRA 5J5NA 1Z9HA 1EGRA 1FO5A 4LA1A 1GUHA 3EMXA 5IMZA 4PX1A 1T4YA 2LRNA 1YF1A 2IWTA 3J7Yb 4EL1A 3KCMA 1X9SB 4Z7XA 2YWIA 1HD2A 4XCSA 3ZFBA 2MBTA 3DRNA 3VFIA 1SKSB 18GSA 2PN8A 4KUNA 4BWQA 3ZL5A 4ZBDA 3HCZA 2KHPA 1FAAA 5J9BA 1M0UA 3IC4A 3FEUA 4YAVA 1WIKA 1GWCA 4HDEA 2ALBA 2NDOA 3L4NA 4MJEA 2DSAA 2ZCTA 10GSA 1JZDA 2O8VB 5JWRB 3DGQA 2H1DA 1IYIA 4WXTA 4RQXA 2B7JA 3EWLA 4ILFA 1O8XA 1XWGA 4O92A 1F3AA 1AW9A 2B3SA 3C7MA 3C73A 4KDUA 2WDUA 2LSTA 1DSBA 2VD1A 2FWGA 1U3AA 2H72A 2VCZA 1FB6A 2F8AA 1PRXA 4CW9A 2PGTA 1YEPA 2VUPA 16GSA 6GSWA 3BCIA 2E2MA 1K0MA 3TOTA 4MDCA 3GA4A 4ZBAA 2OE3A 2L59A 1HNCA 4XS4B 1F37A 1ERTA 1TTZA 3TDGA 2R5GA 3FR9A 2H30A 3VPTA 3GV1A 2K9FA 1EOHA 4GQCA 2H0IA 3E0UA 2PWJA 3KM6A 2LNSA 4PUFC 2A4VA 2B5EA 2R2JA 1OC8A 2LJAA 5LD0A 3EU3A 4YAPA 1YZXA 3IAM2 2N5FA 4I2TA 2ZNMA 4EDZA 2RUEA 4TOPA 1EV9A 5GSSA 4K8MA 2YZHA 3MAKA 3HA9A 2O89A 3GKNA 2YPMA 3EC3A 3UIWA 4GRFA 1V58A 5AN1A 1B9YC 3UEMA 5KN1A 4LL1B 1Z7RA 4IKHA 1RQMA 4AJ8A 4TR0A 2YN1A 2FWHA 2CAIA 2H01A 3EU4A 4ID0A 1G6WA 1X9WB 4MMMA 3VLNA 4PGTA 3VWXA 1DE1A 4MCUA 1VRSD 1WP0A 1V57A 5CAXA 2HNLA 2K8SA 5CYYA 3VWUA 4CHSA 1K0NA 1MDKA 5HFIA 5CRDA 3GYKA 5DDLA 3KMNA 5FT3A 1XOAA 3F4RA 3Q19A 3HJPA 3IPZA 1U88A 4G10A 3HKRA 2HT9A 2FD3A 1PMTA 1O81A 2YANA 1S3AA 3GX0A 3KH7A 3ZRDA 4HEA2 5KN0A 4L5LA 5ECRB 5JCUA 1Z3EA 2VL2C 4NV5A 3W6GA 2DJ3A 1SYRA 5H5SA 5FHIA 1K0BA 3LFLA 1XVWA 4F82A 4XS6A 1SKRB 4PURA 1Z5YE 2HSYA 1PX6A 3GSTA 3EINA 1ZYQB 3VI7A 5H5QA 4ML6A 1TDIA 3GHAA 3KTBA 3TJFA 2KLXA 3NOFA 1I9DA 4HU9A 5IOWA 3DD3A 4NMUA 5D9TA 3I43A 4JBBA 2X8CA 1HYUA 3R2QA 5IMVA 2TRCP 4MPGA 5LNKe 3PH9A 3BBYA 3DWVA 2CZ3A 4K7NA 2VIMA 1ACVA 3GH9A 1ZZYA 1GRXA 1M2DA 4IQAA 1UC7A 4ZIJA 3TGZA 1Q98A 1FW1A 1ILOA 3HD5A 1YJ6A 1JLVA 4PUAA 3F3RA 3FR6A 2JZRA 2IL3A 4X1UA 4AJ6A 4XS4A 4KA0A 4IQ1A 1ERWA 3N9JA 2RM6A 4I6XA 4TKYA 2OE0A 2GZZA 1GSFA 2JZSA 2F3MA 4CDOA 1FVKA 4K1FA 1MDJA 1M99A 4ZB8A 2H8LA 1V98A 1KTEA 4Q5QA 2F8FA 2JU5A 4KSOA 3ZLPA 3IRAA 1ZGNA 1OC9B 1OE7A 2C3NA 4LMWA 2PUKC 5E59A 1U6TA 2HLSA 5ECNB 2EC4A 1VF3A 3D5JA 1GLPA 4JU5A 1W89A 4F9ZA 1TP9A 4MJBA 2VM1A 3F9UA 2IN3A 3TRPA 4XS1A 4PXOA 2TIRA 1F2EA 2LEGA 1WPIA 5B6MA 3HDCA 3MNGA 2DJKA 2DLXA 1UN2A 1PN9A 3S9FA 1XZOA 4MJAA 1SD8A 1GP1A 3L0HA 4AJ7A 3MSZA 2HZEA 4DSRA 2CV4A 3GTUB 2XBIA 4ECBA 2HRNA 4L5OA 3HYPA 4LMVA 4G2EA 4WETA 1SK0A 3GSSA 2AAWA 3DVWA 5IMDA 2DMMA 4IHUA 4POKA 4IS0A 1NW2A 5ECOB 2EIOA 2L4QA 2WFCA 4WR5A 5D96A 1DE2A 4TW5A 2WJUA 3ERFA 3M9JA 4TVEA 5CNWA 2K6VA 3O3TA 1EV4A 2J23A 1HNBA 4ZB6A 2H0HA 1M9AA 2VLUA 3J7Yk 1PD21 2IFQB 5IO2A 2I81A 5KN2A 3E3EA 1XIYA 3Q6OA 2L6CA 2PERA 11GSA 4V2MA 4WBJA 2P0GA 2KUCA 4V2LA 4KDXA 3V1WA 2GT6A 3P2AA 4BL7A 1TJDA 1HQOA 3DMLA 5JCGA 1H75A 2L4CA 3SBCA 4FO5A 2P5QA 2LJRA 4ECIA 4OCFA 4ULXA 2GVPA 4FIWA 2P5RA 1FB0A 3C1SA 2OBKA 3F4SA 4N10A 5J41A 2OE1A 5IMCA 2DJ1A 2PMTA 3LGCA 2TRXA 5DJLA 3M1GA 2GLRA 2QC7A 3HZ8A 1W4VA 4ZL7A 3U5RE 1WMJA 3ZREA 2WRTA 2N5AA 1TI1A 13GSA 1Z7PA 2IIYA 1SK1A 1TK5B 5HR2A 1B4QA 4OFTA 1IYHA 1CQHA 5IPGA 1B48A 4GSTA 5DALB 3QAVA 5J9CA 4IBPA 5G31A 2JZTA 1BJXA 5DQSA 1R7HA 4G9HA 4NXIA 5B8AA 3CSJA 4OFMA 1G7OA 3WGDA 3ZVJA 6GSXA 4POMA 1K3OA 5F07A 1E2YA 1EOGA 3UJ1A 2GZYA 4IVFA 4OWYA 4NHWA 4EE0A 1OC9A 2C8UA 4IJ3A 4L8EA 6GSUA 3RPNA 1GH2A 4WEYA 4OMVA 2D2ZA 5ID2B 3WYWA 2YP6A 5JCWA 4IP6A 2LTKA 4RQRA 2DJJA 4DSQA 2GSSA 2H75A 1X9MB 2AJQB 3E9JB 5DQYA 2YZUA 1YKAA 1R5AA 1ST9A 3GTUA 1G7EA 2YCDA 3ZZXA 4WF4A 2HZFA 1MD3A 3RPPA 4KCEA 2FY6A 4KX4A 4KB3A 1GULA 2N5BA 3DEXA 3O76A 2H74A 3DKSA 4YQVA 3KH9A 2M46A 1DUGA 2JSYA 1E6BA 4E8EA 3M9KA 4OO4A 2O87A 1GSSA 3WGXA 1ZYEA 1S3DA 2IPAA 3PINA 1GSDA 3W8JA 3IXRA 1T8EB 2IMFA 2H6ZA 1URMA 5CO3A 5H5RA 1KBNA 4HUAA 3D4MA 4QQ7A 5D9VA 1XPVA 2LJKA 3GKXA 5IM9A 3UOMA 2IFQA 3JCML 1AC1A 3DVXA 1SJZA 3LQ7A 3QAWA 4N30A 2C3QA 4OD7A 3VK9A 1DBYA 3LXTA 2GQMA 3FZAA 3ERGA 2FCHA 4ECJA 2GQKA 4MF6A 3FR3A 1WE0A 2B1LA 1J08A 1WWJA 1GUMA 3M0FA 4K6XA 3GMFA 1MEKA 2DIYA 1HNAA 1M2AA 5G5FA 1O6JA 1O85A 5CRHA 2VL9A 2IMIA 4FH8A 5AIVA 1BX9A 2FWEA 1V2AA 5EPFA 4I5QA 4POLA 1NHYA 5COHA 4K0GA 5HR1A 4Q5RA 3GL5A 4JR4A 5ECPB 1T3BA 2H73A 2H1BA 3GX8A 4DSSB 4WR4A 4JR6A 2WB9A 3CTGA 5GZZB 1SL1B 1SK2A 2YWNA 1XBSA 4X0XA 5ECHB 5F06A 1UA5A 1Y6EA 1TK8B 1MD4A 4XTSA 2GGTA 4HJ2A 5IQYA 5G30A 3MDKA 5CRWA 3CSHA 5CRGA 2VCVA 2LRCA 5B6NA 5L71A 2AUVA 3ME7A 3A2WA 2B5YA 3LJRA 4QL7A 4EC0A 5DALA 4X43A 4PQHA 5D9XA 2OKAA 2H70A 4MLYA 2GDRA 3GL3A 4HQSA 1A23A 2H0GA 2CAQA 2WULA 2XC2A 3QPMA 2ON7A 1T00A 3GKKA 2C4JA 2KOKA 4KH7A 5FWGA 1CQGA 1M2BA 1T7PB 3H4KA 4BVXA 4RI6A 2EIRA 3HY2A 3A3TA 1OVNA 5ID2A 2HSHA 2C1YA 3IK7A 2YOIA 5D8IA 2OBIA 3D22A 5GAPD 1XXUA 3BD2A 5AISA 3QFAC 4N11A 3KMOA 4NV2A 2M72A 2R6KA 3K8NA 2CVDA 1XW9A 5ECQB 4KDYA 3TKRA 3UVTA 3WD6A 4MH2A 1X0RA 4IJIA 1K0AA 2LS5A 2NBSA 1ZOFA 2HYXA 5LCZA 2CQ9A 12GSA 2YWOA 4MH3A 3F3QA 5E4WA 5ELAA 3TJGA 3DXBA 3IR4A 4ZB9A 2G2QA 4MJCA 2MZCA 1TW9A 3G7YA 2OA7A 1ABAA 5INYA 1X5DA 4OCEA 1FG4A 3FKFA 1XVQA 3I69A 4K7OA 2E7PA 14GSA 4XRAA 4K9ZA 4MA9A 4HZ2A 4MPFA 4KAEA 1ERUA 3G9BA 2B6MA 2JADA 3SWLA 2H71A 2HE3A 4J56E 5ENUA 2FNOA 4J57E 3DYRA 3GFKA 3CTFA 4KNDA 4N0ZA 3Q18A 1KEBA 2Z9SA 1XW6A 2QKEA 1A8LA 20GSA 4ZL8A 1VGLA 1TKDB 1AQXA 1SKWB 1U87A 4NHZA 5GAND 3NZNA 3APQA 3UAPA 1YKCA 3VPQA 2RUFA 3GURA 4QL9A 4DEJA 2R4VA 1J9BA 3TKQA 3PGTA 1ERVA 5A5KA 4IW9A 1N8JA 2K8VA 1Z6MA 1GUKA 1K3YA 2REMA 3TJJA 2YV9A 2H6YA 3AY8A 2HI7A 3I6AA 4F2IA 3TRXA 1BG5A 1O8WA 5DCGA 1WJKA 3F6DA 4RI7A 4ML1A 3CBUA 3L78A 3QOUA 2G0FA 3IV4A 2DC5A 2R3XA 4FYBA 5HFGA 3G7IA 4POBA 3KXOA 4HU7A 3IA1A 5IMFA 2RLIA 4ZBBA 2FLSA 3LWAA 1OAZA 1SJIA 1TK0B 2CVKA 4Q5NA 1TRSA 4G19A 3P8WA 1AXDA 2IMEA 2WZ9A 4E8HA 1PSQA 2H19A 2QGVA 4OO5A 2WS2A 2NTOA 1EEJA 5D73A 4NWYA 4ECCA 4PQIA 3IHQA 4YQMA 4ACSA 5ECMB 4L0UA 5A4VA 3UVHA 4GQFA 2FWFA 1ZCPA 5IMAA 3O6TA 2E0QA 5D9WA 3H79A 1SL0B 3GNJA 2QSIA 4TR1B 3UL3A 6GSYA 2MMAA 1A2JA 2OACA 6GSSA 4KGIA 1TOFA 3TKSE 3APOA 4V1Ag 1C72A 1ML6A 2XPDA 5JWQB 3TCOA 3PR8A 2LUSA 1EGOA 2MMOA 2JSZA 3NIVA 5HR0A 2VLTA 2IMDA 3MWHA 4WF5A 4HZ4A 1GLQA 2FGXA 1BEDA 1YEXA 1GSEA 4AF2A 4NPBA 3OR5A 2GZPA 1USBA 3LSZA 1V9WA 2B1KA 1QK8A 3F0IA 2B5XA 3ISOA 3CSIA 2CZ2A 5J4UA 4F0BA 3D6IA 2YJ7A 3IDVA 3KTLA 5GSTA 3HZ4A 3G7JA 4MP4A 2AV4A 4HI7A 2XHFA 4K0NA 3US3A 2P31A 3WT2A 1WRYA 1R5PA 3HJOA 4TXVA 1R4WA 3KP8A 1K0CA 2BTOT 2I4AA 2A2RA 2GSTA 2DJ0A 4YQUA 3EVIA 1YF0A 2ON5A 1A2MA 1WOUA 4ZL9A 1XWAA 3M3MA 3FHKA 3VWWA 3HVSA 3IOSA 1BYEA 1S3CA 2LKUA 4EKZA 3W8SA 1PL2A 2VCQA 3C1RA 2C0EA 3TJBA 1QXHA 4MZBA 1BAYA 4KSMA 5CP1A 3VURA 3I9V2 1GL8A 5EVOA 2L57A 4BPYA 2ES7A 2EIQA 4TXOB 3UBLA 1GSYA 1OC3A 4TRXA 2JL4A 5CREA 2VAFA 2OJLA 2XBQA 3UMAA 1G6YA 2LRTA 3ZITA 3HVXA 1TXXA 3IBHA 5A4WA 3EE2A 1NM3A 1B9XC 4GXZA 2HXKA 1AAZA 1GSQA 5C04A 3ZFLA 4XHMA 3QMXA 1EP8A 2V6KA 1ZMAA 2I9HA 3GN3A 3D21A 3F4TA 1EWXA 3L9UA 3HHVA 2V1MA 1A0RP 5EY6A 1H4OA 4HS1A 2WCIA 1PL1A 1K3LA 2CA8A 2LV3A 5F0GA 2X64A 2A2SA 2IMKA 1NSWA 1O7UA 3ZMLA 3BJ5A 1PGTA 1RK4A 1JLWA 2K18A 3ME8A 4TR1A 3LYPA 2GS3A 2FA8A 1J0FA 1Z6NA 5F8BA 1AIUA 3QCPA 2RIIA 3ZTLA 5AGYA 3L9SA 4I97A 1A2LA 3TKSC 5ECIB 3FZ9A 5KN3A 1QUWA 2YNXA 5HR3A 3KIJA 4ZILA 3UARA 2FHEA 1SENA 3TOUA 5G1KA 2H1AA 5AIXA 3U6VA 3QAGA 2I1UA 5C00A 4MF5A 3DIEA 3LEFA 2PPTA 1GTIA 3APSA 3QR6A 3TKSA 4KE3A 5J3RA 2H76A 1OKTA 1UVZA 2MMZA 1XWBA 1THOA 3UBKA 5DBQA 4HJMA 4PNGA 3KP9A 2WGRA 2C3TA 2DMLA 4EO3A 5IO0A 4D73B 4EXJA 2H1GA 2O7KA 4FYCA 5D93A 4JZQA 2HZEB 5DVBA 4GSSA 4IELA 4I8BA 1EZKA 3CYNA 1EP7A 1X5EA 2CX4A 2KP1A 4WBRD 1MTCA 4O5RA 1JHBA 3EURA 1PA3A 2GSQA 2C0DA 2PVQA 2V6OA 3VI5A 4BVYA 3KJYA 4EVMA 1GTUA 3HVVA 2J9HA 5JWOB 4K7IA 22GSA 19GSA 4MZCA 5ECKB 5DAKB 1R26A 1T1VA 1F9MA 3FYGA 4TR3A 1GTAA 2BJXA 2CX3A 2C0GA 3KZQA 4EUYA 2V2GA 2V41A 2YWMA 3BCKA 2PU9C 4TXOA 3RHBA 1JZRA 3GUSA 1GSUA 1OKDA 2F51A 3CRUA 3ED3A 4MK3A 1N2AA 1AUCA 4LL4B 1JZOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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