The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
197
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structure length |
196
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Chain Sequence |
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Oxidoreductase
|
source organism |
Homo sapiens
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molecule keywords |
Peroxiredoxin-4
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total genus |
63
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structure length |
196
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sequence length |
197
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chains with identical sequence |
B
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ec nomenclature |
ec
1.11.1.15: Peroxiredoxin. |
pdb deposition date | 2011-08-28 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00578 | AhpC-TSA | AhpC/TSA family |
A | PF10417 | 1-cysPrx_C | C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3W8S A; 4TRX A; 3E9J B; 1K3O A; 4HZ2 A; 19GS A; 1F6M C; 3TOU A; 2IN3 A; 2WB9 A; 5A5K A; 4MZC A; 3MNG A; 8GSS A; 4GSS A; 2GQL A; 5F05 A; 2I81 A; 1F9M A; 1YY7 A; 1TK8 B; 3VLN A; 5CYY A; 3CXG A; 3A2X A; 2MMN A; 4POK A; 3IPZ A; 3ZL5 A; 3EIN A; 2V6O A; 1F3A A; 3LOR A; 3TUE A; 5ECQ B; 2H8L A; 4ZBB A; 3WGE A; 5DCG A; 4IBP A; 4MF7 A; 2HZE B; 2YN1 A; 1MDK A; 1JZW A; 1K0N A; 1X9M B; 4EXJ A; 1TDI A; 1F2E A; 4O32 A; 1BJX A; 1FO5 A; 2FD3 A; 2NDO A; 2RLI A; 1LU4 A; 2AYT A; 4MP4 A; 4NV2 A; 3M9J A; 1V98 A; 5J9B A; 3GTU B; 2DJ2 A; 3KCM A; 3GV1 A; 1M0U A; 1KTE A; 3FW2 A; 2YNX A; 5JCG A; 1YKC A; 2CVD A; 4K1F A; 3CRU A; 1OC9 B; 4MMM A; 2VOC A; 2KLX A; 2KUC A; 1GSF A; 3F0I A; 3O6T A; 1ST9 A; 1AQW A; 5EPF A; 4IS0 A; 1BYE A; 4EDZ A; 2MYG A; 2FHE A; 4IJ3 A; 3IV4 A; 1MEK A; 3D6I A; 3P90 A; 1MD4 A; 1SKR B; 5CRW A; 1AIU A; 1TRU A; 3EU3 A; 4V2L A; 2LST A; 5COH A; 5KN0 A; 3MWH A; 1PRX A; 5ECR B; 3F6F A; 3ZVJ D; 5FT3 A; 3C8E A; 3QCP A; 4JZQ A; 5DQS A; 2H1D A; 1G7O A; 5B7C A; 3I69 A; 5CO3 A; 3LXZ A; 3IHQ A; 3APO A; 1K0A A; 1N8J A; 4XCS A; 4MK3 A; 4DSR A; 2CVK A; 2C0D A; 1X5E A; 4D73 A; 2B5E A; 1K0B A; 4KB3 A; 5C00 A; 5DAL B; 4I8B A; 4OMV A; 5J4U A; 3TKR A; 1F37 A; 1W4V A; 3TJB A; 3TKS A; 5J9C A; 2HRF A; 2J23 A; 1XW9 A; 4OCF A; 1AXD A; 2FWE A; 1OYJ A; 1X9S B; 1GLQ A; 3GH9 A; 3GMF A; 5B6M A; 4TR1 B; 3ZVJ A; 3PGT A; 5HR1 A; 1EOG A; 2FGX A; 2YV7 A; 4RUV A; 4XS4 A; 5J3R A; 2H6X A; 3GX0 A; 3QAW A; 2JAC A; 2LNT A; 3LWA A; 2B5Y A; 3IK7 A; 1U6T A; 5JWO B; 22GS A; 2ZNM A; 1EOH A; 4X0X A; 5DBQ A; 4MJE A; 2C3Q A; 4ZIJ A; 1PKZ A; 4K6X A; 2L5L A; 4F03 A; 1XOA A; 1XWA A; 3CTF A; 1USB A; 1EP7 A; 2LUS A; 2HXK A; 2I1U A; 1GSY A; 4JBB A; 3Q74 A; 1SYX A; 2ZCT A; 4RI6 A; 2DJ1 A; 3UIW A; 1VF4 A; 1YQ1 A; 4AGS A; 3KMN A; 3VI7 A; 4OO5 A; 3VWU A; 3GN3 A; 3Q19 A; 2O89 A; 1ZOF A; 2P31 A; 1VF1 A; 3GYK A; 2DJ3 A; 1AUC A; 4GRF A; 3UAP A; 2H71 A; 5ID2 A; 4CW9 A; 3FY7 A; 3DKS A; 2GSR A; 1TW9 A; 2M46 A; 1FB0 A; 3HJP A; 3M8N A; 2H74 A; 1TP9 A; 2RM5 A; 5CRE A; 3HD5 A; 2GDR A; 4RQR A; 2YJ7 A; 4GLT A; 1XBS A; 2LNS A; 4ZBA A; 2HRN A; 1KBN A; 3IAM 2; 2LJR A; 4J2F A; 4XRD A; 2MMZ A; 3EVI A; 5AGY A; 3VFI A; 3CYN A; 4MH3 A; 1HYU A; 2CX3 A; 2H19 A; 5A4V A; 4QL7 A; 3M9K A; 4EKZ A; 5H5R A; 1NHY A; 3DGQ A; 3BD2 A; 3LG6 A; 3G7Y A; 1MD3 A; 2YWM A; 2G2Q A; 4G10 A; 2H76 A; 2MZC A; 2C0E A; 1ZYQ B; 2C4J A; 3P8W A; 3LJR A; 2GSQ A; 5ECM B; 3TKQ A; 2FWH A; 1TK5 B; 2XHF A; 3GH6 A; 5IQY A; 3H8Q A; 3FZA A; 3TJK A; 3IDV A; 1PKW A; 3FR6 A; 3F4T A; 1WJK A; 4YAP A; 1G6Y A; 4NPB A; 3PIN A; 5FHI A; 3TJG A; 1OKD A; 3DIE A; 2A4V A; 1C72 A; 1T4Z A; 5B8A A; 2H6Y A; 2K8V A; 3GUS A; 2BJX A; 4MLY A; 1V9W A; 1GWC A; 1DE2 A; 1SU9 A; 4KCE A; 3M1G A; 4GCI A; 4TVE A; 4WEY A; 3UBK A; 2I4A A; 3E0U A; 1EV9 A; 1DBY A; 5D9W A; 3UVT A; 2FUG 2; 3KEB A; 2N5F A; 2F8F A; 1IYI A; 2L57 A; 3ZFL A; 2AHE A; 2HZE A; 1HNC A; 2E2M A; 4OFN A; 2H6Z A; 1J9B A; 4O92 A; 3FKF A; 5JCU A; 4ECI A; 1DUG A; 3UOM A; 3R2Q A; 2LRT A; 3I6A A; 4I6X A; 5ECO B; 3VWX A; 3GFK A; 5DAK B; 3ERW A; 1Z5Y E; 1GTI A; 3TRQ A; 1OE7 A; 2DSA A; 2WFC A; 4WR4 A; 2A2R A; 2HSH A; 3H79 A; 4KW6 A; 1YJ6 A; 2HYX A; 3A5W A; 3L9S A; 4KSO A; 4Q5N A; 5HFG A; 1S3A A; 2R4V A; 2NBS A; 2IME A; 4WBR D; 1GTU A; 4HEA 2; 1OC9 A; 3HVX A; 5AIV A; 1Z6M A; 5ENU A; 1GNW A; 1T8E B; 3QDN A; 3RBT A; 2A2S A; 3ZYW A; 1PX7 A; 1O7U A; 2TIR A; 3P7X A; 3NIV A; 4MF5 A; 1OKT A; 2GT6 A; 1ZCP A; 3LQ7 A; 4K0N A; 4IP1 A; 4YQM A; 2FCH A; 4MJC A; 4OFT A; 2WJU A; 2LQO A; 3MSZ A; 2I3Y A; 4DVC A; 1U87 A; 2JU5 A; 1O8X A; 4N0Z A; 4WKW A; 5DJM A; 2EC4 A; 4MJA A; 2X8H A; 4LMW A; 2C0G A; 2YOI A; 1PA3 A; 3F8U A; 3ZLP A; 4QL9 A; 4O5R A; 1O73 A; 2NTO A; 4P3Y B; 2VLT A; 5KN3 A; 1Z7P A; 1XVQ A; 5ECS A; 1HD2 A; 2AUV A; 1LJR A; 5F0G A; 3APS A; 4K7N A; 4ZXG A; 3WT2 A; 5G2Z A; 4NMU A; 5IMZ A; 3DEX A; 4FO5 A; 3V1W A; 3UL3 A; 2WRT A; 2DIY A; 3KH9 A; 4Q5R A; 2OAC A; 5GSS A; 1J0F A; 2VL9 A; 6GSX A; 3KJY A; 3DVX A; 3LYP A; 1YF1 A; 5KN2 A; 3MAK A; 3TRX A; 3EE2 A; 3HKR A; 4XIH A; 2R2J A; 3HY2 A; 3IE3 A; 4K8M A; 1QGV A; 3BOA A; 3KZQ A; 2PER A; 5GAP D; 4L0U A; 2LV3 A; 3VPT A; 1R5A A; 1A8L A; 1BED A; 2FA8 A; 1SKS B; 2B7J A; 3GHA A; 3RDW A; 4ZBD A; 5LCZ A; 17GS A; 4Z7X A; 5IO2 A; 3TKS E; 2OE1 A; 1O81 A; 3DD3 A; 1SL0 B; 4V1A p; 2HT9 A; 3TB2 A; 4F2I A; 1HNA A; 3H4K A; 1UVZ A; 2EIR A; 2IMK A; 5AIX A; 4ECC A; 3Q18 A; 4GST A; 2VCQ A; 4JE1 A; 4MDC A; 1WOU A; 3F3Q A; 4JR4 A; 4MCU A; 4H86 A; 5D93 A; 4MZW A; 4NHW A; 1T7P B; 4ECB A; 2CZ2 A; 4BVY A; 1MDJ A; 4OFM A; 1XWK A; 5ECL B; 1OVN A; 6GSY A; 4WF5 A; 6GSW A; 3RHC A; 2D2Z A; 4Q5Q A; 1YDK A; 2YWO A; 3ISO A; 4GWR A; 3A2W A; 1GNE A; 1W89 A; 2OBI A; 1ZGN A; 2HE3 A; 11GS A; 3WGX A; 2O8V B; 4ZB9 A; 5CRD A; 5L71 A; 1CQG A; 1B8X A; 4WBJ A; 3C73 A; 1SD9 A; 4FYB A; 2MBS A; 2RM6 A; 2X99 A; 4OWY A; 2L6C A; 2LQQ A; 4KUN A; 3J7Y k; 1SYR A; 3FRC A; 1QXH A; 3CRT A; 4V2M A; 2CA8 A; 3PR8 A; 1B48 A; 4KA0 A; 2HNL A; 4IW9 A; 3L9U A; 3HZ4 A; 3HCZ A; 3FEU A; 1ZL9 A; 1ERV A; 2MMA A; 2H70 A; 1FG4 A; 1DSB A; 4ID0 A; 2OE3 A; 3DML A; 1B4Q A; 4N11 A; 4ACS A; 1YF0 A; 4TN8 A; 5ECP B; 2H66 A; 5ECH B; 2VM2 A; 1MDI A; 4PNF A; 5HR2 A; 2G0F A; 1WMJ A; 2C3T A; 4PUR A; 1GRX A; 3F63 A; 1M2B A; 1VF2 A; 3IR4 A; 6GSV A; 3QFB C; 2FY6 A; 1B9X C; 4NHZ A; 1A2J A; 3CBU A; 3FYG A; 3WT1 A; 2DLX A; 2GZP A; 5J41 A; 3L9V A; 3GL5 A; 4MA9 A; 4BWS A; 3CSJ A; 16GS A; 1AW9 A; 4FH8 A; 4XHM A; 1V57 A; 2AAW A; 5G30 A; 4NAX A; 3JCM L; 5IMA A; 1XCC A; 3DRN A; 3US3 A; 2QC7 A; 3DYR A; 4IQ1 A; 4EL1 A; 3ED3 A; 1BX9 A; 2PUK C; 1XZO A; 1A2M A; 5JWQ B; 3EMX A; 2CVB A; 3F4S A; 4TW5 A; 2E2G A; 2VAF A; 2B6M A; 3GNJ A; 1XXU A; 1LBK A; 1DE1 A; 3BCI A; 5ELA A; 1Y25 A; 3UEM A; 3HJM A; 1K0O A; 3FZ5 A; 4K2D A; 1THX A; 2LRC A; 3QD9 A; 5F06 A; 1XWB A; 5ELG A; 3S9F A; 2ALB A; 4HI7 A; 4TR3 A; 4PGT A; 4WR5 A; 3CSH A; 3LEF A; 4AJ6 A; 1Z9H A; 2AV4 A; 2TRX A; 1NW2 A; 4HU7 A; 2GT5 A; 5DDL A; 4MF6 A; 5JCW A; 2VL3 A; 1TRV A; 5HFI A; 2AJQ B; 5GAN D; 4ZIL A; 5DQY A; 3HJO A; 1GUM A; 3HHV A; 5F07 A; 3AY8 A; 1K0M A; 3VWW A; 3KGK A; 4EVM A; 4KCA A; 4I5Q A; 5IMD A; 2GS3 A; 2F9S A; 1EV4 A; 2C1Y A; 1AQX A; 1GLP A; 4MPG A; 3BJ5 A; 1GSE A; 3HA9 A; 6GSS A; 1A24 A; 1ML6 A; 3LGC A; 1AQV A; 2H1G A; 5IMC A; 1GL8 A; 4ZB8 A; 1GUH A; 2PWJ A; 1FW1 A; 4GTU A; 2H01 A; 1NM3 A; 2VLU A; 4IGJ A; 1E2Y A; 2VLV A; 4HZ4 A; 1WRY A; 2VL2 C; 3ZIJ A; 3UAR A; 2LKU A; 3D5J A; 2FNO A; 1VF3 A; 4ML6 A; 3KTB A; 5IM9 A; 5D9X A; 2H1A A; 2EIQ A; 3IA1 A; 1Q98 A; 3ZRE A; 2DBC A; 2H72 A; 4AF2 A; 3KP9 A; 2YV9 A; 1QK8 A; 1XFL A; 1OE8 A; 3KD0 A; 3N9J A; 2QKE A; 3QOU A; 1PX6 A; 7GSS A; 4DSQ A; 1Z3E A; 1JLW A; 4NXI A; 3EYT A; 3IXR A; 2IFQ A; 3FR3 A; 2O87 A; 5GZZ B; 5CNW A; 3L4N A; 3ZZX A; 6GSU A; 4ZL8 A; 1YEX A; 1SJI A; 4LL4 B; 2BMX A; 4IKH A; 2LJK A; 1ABA A; 4HJM A; 3RHB A; 5EL8 A; 5ECK B; 4PQH A; 2FWG A; 4OCE A; 5D9V A; 4ZL9 A; 2KHP A; 3ZIT A; 3WD6 A; 1WWJ A; 1SL2 B; 3D21 A; 3F3R A; 1SEN A; 2M80 A; 4K7I A; 1ERW A; 3KTL A; 2MMO A; 4TKY A; 2H73 A; 3IBH A; 2K9F A; 2EIO A; 4GQC A; 1VRS D; 2B5X A; 4WXT A; 4HDE A; 3VWV A; 3H1N A; 1JZD A; 1M2A A; 3KM6 A; 3VPQ A; 1XVW A; 2X8G A; 3GIX A; 2P0G A; 1B4P A; 5HQP A; 3I43 A; 1SK0 A; 2DJ0 A; 4EO3 A; 1QMV A; 2CZ3 A; 1T1V A; 3U6V A; 1WE0 A; 2VIM A; 2VM1 A; 5B8B A; 3GSS A; 5E59 A; 1SD8 A; 1M9A A; 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1ILO A; 1U88 A; 3KIJ A; 4YAV A; 4I97 A; 4GSN A; 4F82 A; 4POB A; 3QAG A; 4K7O A; 2CT6 A; 1K0C A; 2K18 A; 4HJ2 A; 4XTS A; 3WYW A; 3SBC A; 1X9W B; 2IMF A; 2R37 A; 4TXO B; 1IYH A; 4CDO A; 2J9H A; 3GX8 A; 3EUR A; 2WS2 A; 4KND A; 4L5O A; 4PUA A; 5DVB A; 1FVJ A; 2I9H A; 1FAA A; 1SKW B; 1EEM A; 2L4C A; 1TK0 B; 3G7I A; 1PSQ A; 3F6D A; 2KOK A; 3QPM A; 4EUY A; 2LJA A; 2Z9S A; 4WET A; 3E3E A; 4ZB6 A; 1Z7R A; 2JL4 A; 1MTC A; 1XW6 A; 2GGT A; 3ZMK A; 3G9B A; 1TI1 A; 4V2N A; 4PQ1 A; 3TOT A; 1M9B A; 2PMT A; 3TCO A; 3EWL A; 1YEP A; 4HU9 A; 4KX4 A; 4V1A g; 4FYU A; 3QFA C; 1TRW A; 3TJJ A; 3EU4 A; 1UA5 A; 1M2D A; 1GSU A; 5IOX A; 2JAD A; 4L0W A; 1EP8 A; 3F9U A; 3GRX A; 3PH9 A; 3C7M A; 3FZ4 A; 1T3B A; 1TU7 A; 1YKA A; 2R6K A; 5G1L A; 3ERG A; 4PQI A; 1N2A A; 3ME8 A; 3OR5 A; 1GSQ A; 2VCV A; 2VCW A; 4ILF A; 1BAY A; 3FR9 A; 2L6D A; 5ABR A; 1ZMA A; 2QSI A; 3N5O A; 4YQV A; 1SJZ A; 4BPY A; 4IP6 A; 2IMI A; 4I2T A; 3K8N A; 2VUP A; 2F3M A; 2LS5 A; 2LTK A; 2CQ9 A; 5J5N A; 3HYP A; 1SL1 B; 2GQM A; 3NOF A; 1G6W A; 2YJH A; 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