3VWUA

Crystal structure of peroxiredoxin 4 from m. musculus
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
177
structure length
172
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFKSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLNHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGVLRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTVCPAGWKPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Synergistic cooperation of PDI family members in peroxiredoxin 4-driven oxidative protein folding
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 49
structure length 172
sequence length 177
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3vwuA00
3GHAA 2I81A 4EL1A 4TN8A 3UIWA 2GZYA 5HR2A 3F9UA 3FZ9A 4G9HA 4YQVA 6GSSA 1AXDA 2N5FA 4NAXA 4WR4A 3GX0A 1QFNA 1ZYQB 5COHA 2QC7A 4HZ2A 1KBNA 4WF4A 3TJFA 4K6XA 2K18A 1QUWA 2OE0A 4ULXA 3UMAA 3E9JB 4L5OA 1XPVA 1X5CA 1A24A 1YDKA 3DXBA 2YN1A 4XS6A 3GKKA 5G5FA 3IPZA 2P31A 4I6XA 2O89A 5GZZB 3LXTA 2YZUA 3EU4A 3QR6A 2AB6A 2KUCA 1LJRA 2L59A 3IAS2 3G9BA 4HU7A 1XCCA 4GSTA 3TKSC 2MBTA 2IWTA 1ON4A 1JZRA 4V1Ag 2HRFA 2FWFA 2VCVA 4TKYA 3HHVA 2IIYA 2NBSA 2D2ZA 2HLSA 2QGVA 2A2SA 3GTUA 1GWCA 3I69A 4K8MA 2JZRA 5IMDA 2WGRA 4V1Ap 2REMA 4TRXA 1TRVA 5DDLA 2M80A 3M0FA 3I43A 1EP7A 1U87A 2GQKA 1NW2A 1V40A 3P2AA 3PH9A 5DVBA 3RPNA 5E59A 4P3YB 5EVOA 1A8YA 1SJIA 1TDIA 2IMEA 4DSSA 4I2UA 2Z9SA 1QQ2A 2HE3A 4WR5A 4GSNA 1K0BA 4V2MA 3TJJA 3NZNA 3M1GA 1HQOA 5GSSA 2V2GA 5G31A 3L78A 2GSQA 1PKWA 3E0UA 4KDYA 2YPMA 1TP9A 1XBSA 1GSFA 5J9CA 4KH7A 3HVSA 1ABAA 4KUNA 3ED3A 2CVDA 5LNKe 2X8CA 2FWHA 2YZHA 1AC1A 3VWXA 1SYXA 2MMZA 4GTUA 1Z9HA 5JCWA 2FWGA 2OACA 2H1AA 2HSHA 2E2MA 4YQUA 4TOPA 3ZIVA 2XC2A 12GSA 1W89A 4XRDA 1GLPA 4OFTA 16GSA 3NOFA 5KN0A 3NIVA 1V58A 4LL4B 3J7Yb 3FR3A 1NHYA 5DAKA 3F6FA 3GL3A 1XW6A 3FR9A 4HJMA 2DJ2A 2DIYA 4KA0A 4LMVA 2IL3A 1M0UA 3KP9A 4G2EA 1MDJA 3KMNA 6GSVA 3R2QA 3H79A 1FB6A 3GTUB 2HXKA 3IBHA 3MSZA 4DSQA 1FB0A 3TKPA 1T3BA 1R7HA 3KCMA 4YAVA 1XVWA 3ERFA 2VL9A 2DJ0A 2H19A 5D73A 1OAZA 5E4WA 2X64A 4NXIA 1XOBA 1R5AA 3ME8A 2LJRA 4AGSA 4DSSB 2H70A 2IMIA 2QKEA 5F8BA 3KMOA 4DVCA 3UAPA 3BJ5A 4KDUA 1SYRA 1GSUA 4TR3A 4MF6A 2GQMA 3EWLA 5AGYA 5DJLA 1OE7A 3TJKA 4GSSA 1EEMA 1PSQA 2PVQA 2FNOA 4MMMA 1S3AA 1ZOFA 3MAKA 5CRGA 3C1SA 4POKA 4WEYA 2ON5A 1FOVA 3TKSE 4WBRD 1QK8A 2QSIA 2GGTA 4ZL8A 3ZMLA 4PNGA 2H8LA 1PL1A 5GSTA 2GZPA 2LSTA 2OJLA 1OYJA 3GH6A 1VRSD 1XWKA 3QAGA 3LJRA 1Y6EA 1A0RP 1JLVA 3VWVA 3CBUA 1GP1A 5H5RA 5HFIA 4XS1A 4IHUA 3CTFA 1XWGA 2VLUA 2LJAA 4GQFA 4KB3A 4TR4A 3L4NA 3LYPA 4ECJA 1CQGA 1G6WA 1SJZA 4JR6A 2L5OA 5ECMB 5EY6A 2H72A 3TKRA 3LXZA 2VO4A 3BCIA 1GLQA 3KIJA 5JCGA 4D73A 3GMFA 3CRTA 1BX9A 3UARA 1UC7A 5HQPA 3IA1A 14GSA 1Q4JA 4RI7A 2CZ3A 4POLA 3D22A 4OD7A 3F8UA 5G30A 3GKMA 1GSEA 3QAWA 3HZ4A 4YQMA 2I9HA 3D4MA 3GL5A 3H1NA 4XCSA 4BVYA 2YOIA 4ECBA 2FY6A 1IYIA 1FVJA 4O7HA 1PN9A 3QMXA 2GTUA 4OCFA 4ACSA 2HNLA 2VM2A 2YCDA 4RQRA 2H76A 4NHZA 3GKXA 2OA7A 3TJBA 3DVWA 3W6GA 1MEKA 4K2DA 5FHIA 5CRDA 5C00A 3DRNA 3N5OA 2CAQA 2E2GA 4KGIA 4KX4A 2VCQA 1YKAA 1VGLA 4BA7A 1F3BA 4MA9A 2IJYA 3L9SA 5CNWA 1KNGA 2A2RA 4OO5A 1EP8A 5DCGA 3IC4A 3M9JA 2JL4A 4ZXGA 1GSQA 3GA4A 4MF5A 5ECLB 2XPEA 4TR0A 2YP6A 2DBCA 3FZ5A 1AAZA 4MABA 2E0QA 3ZYWA 4HQZA 5IOWA 4MPFA 2LNTA 4D73B 3P8WA 3LEFA 3W8SA 4KAEA 2LJKA 2XPDA 4L8EA 4MCUA 2KP2A 4KCEA 3GN3A 1E6BA 1DSBA 3DWVA 1FO5A 2LNSA 1T7PB 1THXA 4MH3A 2B5EA 3V1WA 5J9BA 2IFQA 2MBSA 1K0CA 2H0GA 3BOAA 3HYPA 2O8VB 4HOJA 5HFGA 3FW2A 3H8QA 4L0UA 2CA8A 2DJJA 2WULA 5LD0A 5AISA 4WETA 4ZIJA 5D96A 1J0FA 4IQAA 5B8AA 4IELA 5CYYA 2JACA 3G7IA 3LORA 3HJMA 2R5GA 2OBIA 1GH2A 2YWIA 3IXRA 3KH9A 3F3QA 2GS3A 3MWHA 2R4VA 2WFCA 4RI6A 4Q5RA 3KTLA 1V98A 1ACVA 4NMUA 3ZITA 5IIZA 1GTBA 2N5AA 2B1KA 2IPAA 4KSMA 1AIUA 2OBKA 4OO4A 2V41A 2ZNMA 3KTBA 1K0AA 2VCZA 3Q74A 3TGZA 4MZCA 4ZL7A 2MMAA 1YEPA 3EC3A 2WJUA 1O85A 4RQXA 5FT3A 2FUG2 2H73A 4MP4A 4PQHA 5A4WA 3D4TA 4MJBA 4DEJA 4EC0A 4IN0A 5ECPB 2I3YA 2O87A 2I4AA 2GZZA 1TK8B 1VF4A 5IO0A 5KEJA 5HR3A 1URMA 2I1UA 1SL2B 1T4ZA 1AQWA 4ZL9A 2RLIA 3EU3A 3P7XA 2IMKA 2GVPA 6GSXA 9GSSA 2AAWA 1PA3A 2G0FA 5IMVA 2J9HA 1E2YA 2TRCP 2X8GA 4JEDA 5J5NA 2G2QA 5J41A 2IFQB 2FCHA 1GL8A 1IYHA 2LRNA 2VUPA 2YV7A 2GT5A 2X99A 3RHCA 5IM9A 3KH7A 1A23A 3TKSA 3CSJA 4GWRA 5DQYA 4IP1A 1PKZA 1M9BA 1OE8A 4X1UA 1T4YA 2C0EA 4PUAA 3UBKA 2R37A 3CRUA 2CX4A 2VL3A 4GQCA 1YQ1A 1PMTA 3HJOA 3FR6A 3N9JA 2VCTA 3ZMKA 1V57A 5IPGA 1SK0A 1SL1B 5FWGA 4F0CA 4HDEA 1H4OA 2OADA 1AW9A 2DIZA 1XZOA 2YJHA 4N10A 1SD8A 4ZB8A 2J23A 3D5JA 4NPBA 4POMA 4N0VA 1T1VA 3A2WA 4AF2A 3EE2A 4IBPA 1S3DA 2B5YA 3VK9A 3VI7A 5ECKB 4I5QA 2IN3A 4Q5QA 5LCZA 4LLRA 13GSA 3FYGA 1X5EA 2BJXA 4EO3A 3FZ4A 1B48A 2L5LA 3DGQA 1V2AA 1K3LA 4E8EA 2EIRA 2K6VA 3P90A 1VF3A 1TU8A 8GSSA 2L6DA 4WF5A 3CSIA 3WGEA 2B5XA 3EURA 1O7UA 4PQ1A 3JCML 1XIYA 2AUVA 3VWWA 1QXHA 1OKTA 4EUYA 3LWAA 3IK9A 2BTOT 4ZB6A 1DE1A 3F63A 2RUFA 5HFKA 4E8HA 4NV5A 1ZYEA 4K7NA 4KNDA 1Q98A 3QAVA 5JWOB 2PWJA 3F3RA 3O76A 1TK5B 4GF0A 4JZQA 4IJ3A 4MK3A 2DMLA 2AV4A 3QCPA 4JR4A 5ECNB 4ECIA 4I97A 1K0DA 3BCKA 3G7YA 3A5WA 2OE3A 2N5BA 4FO5A 2CQ9A 1UA5A 3O6TA 2C3QA 3LSZA 3D6IA 2GQLA 5L71A 3ZLPA 2LV3A 5DCHA 1M99A 4HQSA 3WGXA 2NTOA 4TR1A 2F8AA 4HI7A 3UEMA 4OCEA 2YNXA 2VOCA 3I6AA 3F4RA 3VFIA 1K0NA 1GSDA 3VWUA 4K7IA 2V6OA 4O5RA 4QL7A 3UJ1A 5CRHA 2M72A 2CVKA 2LKUA 5JWQB 2VCXA 3WYWA 3HY2A 4EDZA 2C80A 1M2BA 1Z7PA 2YWMA 1QMVA 3FEUA 3F6DA 4JBBA 2GDRA 4CHSA 2GLRA 2KOKA 1LU4A 5D93A 2KP1A 4I8BA 4N0ZA 1FHEA 3MDKA 1N8JA 3EYTA 5KN1A 4F2IA 1U88A 2GSRA 4K1FA 2CVBA 3ZFLA 4XHMA 4QQ7A 2H66A 1RW1A 4KE3A 3M9KA 1XWBA 3IK7A 5G1KA 2C0FA 4HZ4A 2GSSA 1O8WA 2F3MA 2LQOA 1AUCA 3RBTA 3VURA 1GTAA 5A4VA 4MJAA 4J56E 3IR4A 3KM6A 1Z5YE 3KGKA 2JADA 5DAKB 3ME7A 1PX6A 5B6MA 2DLXA 2B6MA 3FZAA 1RK4A 1G0TA 5ECOB 3ZVJD 1TU7A 3APOA 5EPFA 1ERWA 1TXXA 1FG4A 2KHPA 5KN2A 4F9ZA 4ZBBA 3EMXA 2B1LA 1GUKA 2C8UA 2GT6A 1DBYA 3VLNA 5ELGA 4TR1B 1ZCPA 3DYRA 5IMFA 4MDCA 3ERGA 1BYEA 3LQ7A 3GIXA 3D21A 2PGTA 4AJ6A 4Q5FA 1BQ7A 5CP1A 3F4SA 1O81A 2YV9A 3GFKA 3US3A 1X9WB 1YF0A 3C71A 1KTEA 2VLVA 2XBIA 4AJ7A 4CW9A 1FAAA 3D0ZA 5F07A 2DMMA 2KLXA 3A3TA 2FGXA 3H4KA 1GUHA 1J08A 4PQIA 1SJ6A 2XBQA 4IP6A 1Z3EA 1JFUA 3FK8A 1M2AA 3DVXA 1I5GA 5CRWA 2C3NA 3RDWA 1I9DA 2P5RA 1JHBA 4FYUA 1U3AA 1SU9A 1G7EA 1NM3A 4IKHA 1YY7A 1B9YC 3C8EA 5G1LA 3S9FA 3CYNA 3UOMA 3WT2A 4EE0A 3EMPA 4MJEA 5IO2A 4GCIA 4XIHA 5ENUA 3VI5A 4EF0A 18GSA 4NV2A 4F03A 1GULA 1U3IA 3APSA 3QD9A 3BD2A 1KEBA 1JZDA 4EXJA 4MLYA 2C0GA 3UBLA 4F82A 4Q5NA 2LUSA 1ZL9A 1EOGA 5ECHB 1UVZA 1HNBA 2C1YA 3Q19A 4YH2A 5HR1A 1TRWA 1TRUA 1TTZA 1XXUA 2LQQA 2H71A 4N30A 2H6ZA 3ZFBA 3TRPA 2R2JA 6GSWA 2B7JA 3IAM2 1TW9A 6GSTA 3Q18A 1USBA 2PBJA 1WE0A 1CQHA 2WCIA 1PX7A 4ML6A 3HA9A 1M2DA 2CV4A 4GRFA 3ZIJA 2JZTA 1OVNA 3ZL5A 4CDOA 2LTKA 3M8NA 2MMNA 2PMTA 3TB2A 2CZ2A 1A0FA 4IJIA 4J2FA 4N11A 1TRSA 1G7OA 2B7KA 3LGCA 4XS4A 1TJDA 5DQSA 1JLWA 2H6XA 3LG6A 2FD3A 3RAZA 3ZRDA 2R6KA 1SK1A 3AY8A 2VIMA 2CT6A 2CX3A 1PRXA 3LFLA 3TOUA 1VF1A 3UVHA 1XOAA 3KEBA 1PD21 2YWNA 3KXOA 1U6TA 2PU9C 1LBKA 3QPMA 4HJ2A 3FY7A 2K8VA 1ERUA 5ECSA 3ZTLA 3ZREA 3F0IA 2L4QA 1EV9A 3IRAA 1VF2A 1R5PA 5F0GA 1HNCA 2LRTA 1EEJA 1GTIA 3QOUA 1WOUA 1WMJA 2PUKC 2CAIA 1FVKA 4TVEA 3RPPA 1PL2A 1RQMA 3FHKA 5IQYA 4OMVA 3PGTA 4PXOA 1JZWA 4ZB9A 3GV1A 2H6YA 4MZBA 5IOXA 3GYKA 1ST9A 3EINA 3KZQA 2GSTA 5DJMA 4KSOA 3IV4A 3PINA 1ZZYA 2LS5A 2PERA 3W8JA 1B8XA 1ERVA 3DIEA 4WKWA 3OR5A 2HYXA 2V6KA 2P0GA 4K0GA 2WS2A 1TI3A 3HCZA 1EGRA 2C0DA 5CAXA 3GSTA 5A4UA 4QL9A 1Z6MA 1PQNA 1MD4A 3ISOA 5DBQA 1M9AA 5AIVA 1OC3A 2HZFA 3HJPA 4XS4B 4NWYA 4YAPA 3O3TA 2YWOA 1EZKA 2OE1A 3CSHA 4ZBAA 4RUVA 3U5RE 4MJCA 4IW9A 2H75A 4BPYA 1EWXA 1TI1A 2IMDA 1THOA 4BWSA 4GXZA 1TOFA 1MD3A 2H0HA 5GAPD 2A4VA 3TRQA 1SKRB 2WRTA 2MYGA 1N2AA 5J3RA 3HVXA 6GSUA 4PURA 4H86A 3E3EA 1WRYA 2H1GA 4FH8A 4TXOA 4ILFA 1X9MB 2YJ7A 3CTGA 4BL7A 2H30A 2PPTA 3GURA 4L5LA 4FYBA 4V2NA 2ES7A 4JU5A 3QDNA 1XWAA 4LMWA 1F3AA 4F0BA 4XRAA 2DSAA 2B3SA 4OFNA 2EC4A 1GSYA 2AJQB 2R3XA 3CMIA 3HXSA 3HKRA 4EVMA 3TOTA 4PUFC 3DKSA 3FRCA 4PX1A 3TRXA 1S3CA 2H01A 4MH2A 2C4JA 4EKZA 3UL3A 2RM6A 1NHOA 2ON7A 3GX8A 4K0NA 4TXVA 4PGTA 1AQXA 2DJ1A 4MZWA 1OC9A 3IE3A 2VD0A 1YEXA 1XW9A 2NVLA 2O7KA 2FLSA 4KW6A 4L0WA 1SKWB 1UN2A 5D9XA 4JE1A 2TRXA 4MPGA 4I2TA 1K3OA 3F4TA 4EDYA 4ZILA 3TDGA 2VAFA 5KN3A 2XHFA 4AJ8A 2DC5A 3IHQA 4FYCA 1B4QA 3M3MA 2HRNA 4X0XA 1ILOA 2O85A 1ZGNA 2JSZA 5G2ZA 4O32A 2HT9A 2X8HA 2V1MA 2WDUA 1ML6A 3FKFA 3A2VA 4PNFA 1Y25A 2EIQA 3WD6A 2DJKA 4KDXA 4O92A 1YZXA 2ZUPA 2VD1A 5ECIB 3H93A 4LL1B 4TXOB 4FIWA 3HD5A 2L57A 3KJYA 1HD2A 5ABRA 3KP8A 4TW5A 4K7OA 5F05A 1GTUA 2P5QA 3I9V2 1SL0B 1R26A 3IDVA 2LEGA 1MDKA 2K9FA 2AYTA 3TCOA 1XWCA 1A2LA 20GSA 1XVQA 5CREA 22GSA 1GUMA 2OKAA 1K0MA 4HEA2 1O73A 1C72A 2BMXA 3TUEA 1BAYA 3IOSA 3L0HA 5D9TA 3TJGA 4G19A 5ID2A 5IMZA 4OFMA 2JSYA 2VL2A 4G10A 2RM5A 2YANA 4NHWA 5IPHA 2VL2C 3GRXA 3QFBC 1OC9B 2L4CA 1ZMAA 5B7CA 3SBCA 1YJ6A 1SKSB 1F37A 5C04A 3DMLA 2L6CA 2PN8A 1WPIA 3U6VA 5J4UA 5INYA 1GNEA 3DD3A 1EV4A 1F2EA 2V32A 2EIOA 3HVVA 2K8SA 2HI7A 1R4WA 2ZCTA 5ECRB 2HSYA 2FHEA 1K3YA 4DSRA 3GKNA 5ECQB 2WB9A 2F8FA 1WIKA 1SK2A 4OWYA 3C73A 1K0OA 2VM1A 1HYUA 4ISDA 1MDIA 2F9SA 2ALBA 1EGOA 1BG5A 1O6JA 1DE2A 3MNGA 4IVFA 1XFLA 2TIRA 5CO3A 1QGVA 1SD9A 4JRRA 5HR0A 2DJ3A 1OC8A 10GSA 5GAND 3ERWA 1Z7RA 5DALA 17GSA 3GH9A 1B4PA 4IQ1A 5IMCA 1F9MA 6GSYA 1T00A 1SENA 3UVTA 3A2XA 1A8LA 3GNJA 5B8BA 5F06A 1A2JA 3TKQA 1G6YA 2WZ9A 2FA4A 4J57E 1WP0A 2C3TA 3GUSA 5G5EA 4ID0A 1WJKA 1BEDA 4ML1A 1W4VA 5EL8A 4WBJA 3VPQA 1NSWA 5ID2B 2HZEA 4HU9A 1X9SB 1AQVA 5AIXA 3APQA 4V2LA 4K9ZA 3DEXA 1MTCA 2IMFA 3GSSA 1O8XA 2VCWA 2PVOC 1ERTA 2JU5A 1HNAA 2RIIA 2H1BA 5H5QA 3HDCA 5ELAA 3Q6OA 2NPBA 2NDOA 5AN1A 2H1DA 4BVXA 4GLTA 4IS0A 3QFAC 3HZ8A 3C1RA 3EVIA 1J9BA 3PR8A 1DUGA 4ZBDA 1V9WA 1H75A 1X5DA 1JZOA 5JWRB 3G7JA 4HUAA 3CXGA 1A2MA 3C7MA 3ZZXA 5D9WA 4KCAA 4HS1A 2F51A 1T8EB 2H0IA 3K8NA 1BJXA 1M7TA 1FW1A 5H5SA 1YF1A 1GRXA 3SWLA 3L9VA 5D8IA 2MZCA 2RUEA 2LRCA 3VPTA 5JCUA 1GSSA 1B9XC 2FWEA 2M46A 4X43A 11GSA 5DALB 3BBYA 1OKDA 4POBA 3RHBA 4XTSA 1TK0B 3KD0A 2FA8A 5IMAA 4IGJA 2E7PA 2HFDA 1GNWA 4Z7XA 4LA1A 4ECCA 2MMOA 1WWJA 2AHEA 1PGTA 1X0RA 3ZVJA 1F6MC 1XW5A 1EOHA 3WGDA 1TKDB 5D9VA 4BWQA 2H74A 4MF7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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