3VWVA

Crystal structure of n-terminally truncated peroxiredoxin 4 from m. musculus
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
HHSSGLVPRGSHMPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFKSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLNHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGVLRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Synergistic cooperation of PDI family members in peroxiredoxin 4-driven oxidative protein folding
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 54
structure length 182
sequence length 182
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3vwvA00
1DUGA 2H19A 1HD2A 4IKHA 1V2AA 2R5GA 2TIRA 4IQAA 1K0OA 5IMZA 1ZZYA 5IMVA 5IIZA 3UL3A 3S9FA 2AJQB 4P3YB 2HNLA 1EGRA 4Q5QA 3EC3A 2IMFA 3ISOA 4F0CA 1JZRA 1HNBA 3GSTA 3FZ9A 2GTUA 2DJKA 3W8SA 3TRPA 4J57E 2O7KA 4GF0A 4EDYA 3ZL5A 2YJHA 1OE8A 2L4CA 3Q74A 2CAIA 1B4PA 2DJ3A 4O32A 2REMA 1XVWA 1XWKA 3O6TA 1H75A 1Z3EA 3I9V2 2LNSA 5D93A 4PUAA 5EY6A 3TRXA 2BTOT 1ERVA 2N5BA 3TKQA 1O8WA 2VIMA 1YDKA 1DBYA 2LRCA 2FWFA 1XWCA 3HDCA 1Z9HA 2JU5A 2N5AA 3FR9A 5F05A 1EOGA 2O8VB 4GTUA 4OMVA 2EIRA 3TJKA 3L9UA 4MMMA 2LJRA 2GZYA 4TW5A 1O8XA 4I5QA 2VOCA 4OO4A 3WGXA 19GSA 1SL0B 4XRDA 2B1KA 4NHWA 3LG6A 1AQVA 4J56E 3IOSA 4BPYA 3ERFA 3IRAA 4F0BA 3VPTA 1O6JA 2YP6A 4HI7A 4CDOA 1EWXA 2VAFA 4XCSA 1GUHA 3ZFLA 5JWRB 2AUVA 3CSJA 2X8GA 4KE3A 4AGSA 2K6VA 2P0GA 1FW1A 4IP6A 3GX0A 2FA4A 20GSA 3M8NA 2F3MA 2C0FA 1X9MB 2K8SA 4F82A 2FHEA 3M3MA 4ZB6A 2J9HA 3L0HA 4MP4A 1X5EA 3G7IA 4MCUA 2R4VA 5B8AA 5J4UA 5B6MA 1GSUA 2WJUA 3NIVA 3LYPA 1M99A 2M72A 2J23A 2GS3A 2IWTA 4MDCA 3LXZA 4TXOB 2FWHA 1BAYA 4MZWA 1GSFA 5E59A 3NOFA 4XS6A 3N5OA 3EU4A 3QAVA 4NMUA 2HFDA 3FK8A 2X99A 3A2XA 2EIOA 2PVOC 1BQ7A 4I2TA 3WT2A 3SBCA 5F8BA 4HZ4A 2GT5A 3HY2A 4PXOA 1M0UA 2P5QA 1M2BA 2HE3A 1JLVA 3J7Yb 1M2DA 3F6DA 2HYXA 4NAXA 2H71A 3HJMA 2XHFA 5DDLA 1SU9A 2P31A 3CRTA 2H6YA 4G10A 3GH9A 1VGLA 4ZBBA 1DE2A 2B3SA 1NHYA 1DSBA 2XC2A 3TJFA 1T4YA 3QMXA 1QXHA 4AJ8A 4JR4A 3P8WA 5B6NA 3G9BA 4HJMA 2HI7A 3DGQA 4YQVA 2VO4A 4KH7A 4HEA2 5F07A 5CREA 1TU8A 2H73A 3EMPA 2AHEA 2B5XA 2H72A 1WE0A 2O85A 2YNXA 1TJDA 3VK9A 1XWBA 2C4JA 4N0ZA 4H86A 4HJ2A 2GSQA 4K7OA 4I6XA 3VWUA 5AGYA 1GRXA 1J0FA 1ML6A 3HA9A 4K0GA 3FY7A 4GLTA 1T8EB 3I6AA 5ECKB 3GHAA 3GSSA 1WWJA 2XBQA 1M9AA 3UARA 2H0IA 3EE2A 3CTFA 2LS5A 2I9HA 3ZVJA 3TRQA 1UN2A 4TR0A 5LD0A 2K9FA 2LTKA 4GRFA 3GTUA 4ZB9A 4KDXA 1RQMA 1GL8A 2L6CA 2CVKA 4WXTA 4Q5RA 3BCKA 5G31A 1SYXA 2GSTA 14GSA 5IQYA 4LA1A 1PD21 2OBKA 3F3QA 4PUFC 1F6MC 5IMAA 2EIQA 1K3OA 4MF7A 1WMJA 4GQCA 4HS1A 2C80A 1H4OA 1TK5B 4GCIA 1YJ6A 2ZCTA 4WBRD 1O73A 4ECJA 5H5RA 6GSYA 2IN3A 1MDKA 4YQUA 1SENA 1A8YA 4KSOA 2V6OA 3RPPA 4IW9A 3EU3A 3ZMKA 2LNTA 1TKDB 2RUFA 4HQSA 3H1NA 5G1LA 3IAS2 3F4RA 3C7MA 1ST9A 4XS4A 3RAZA 1EV9A 1M7TA 2O87A 1OC9B 3EMXA 1ON4A 1URMA 2GSSA 1VF2A 3GN3A 1OC3A 5IOXA 1MD3A 3BCIA 3TUEA 2D2ZA 2B6MA 3LFLA 1QGVA 2B5EA 4X0XA 3TB2A 1LBKA 1AIUA 3QFAC 3HKRA 4OWYA 2H0GA 3GH6A 1TTZA 3CXGA 1CQGA 1XXUA 2H76A 2RUEA 2DJJA 2LRNA 3QFBC 3ERGA 1SKSB 2FNOA 3EVIA 4PX1A 3UVHA 3VWVA 4FYBA 3F9UA 3HVVA 5GSTA 5DJMA 2JL4A 4ZL8A 2VD1A 2CZ2A 2CZ3A 3L9VA 3ME8A 4WR5A 1EP8A 4DSRA 4PGTA 4O5RA 1PL2A 5ID2B 1SK0A 5D9TA 3ZZXA 1SKWB 2A2RA 3FHKA 1TK0B 1GUKA 1FO5A 4WR4A 2H1BA 3QCPA 2HZEA 2YZHA 1LU4A 5EPFA 4EUYA 2YWIA 1FHEA 1I9DA 2C3TA 2YCDA 3HZ4A 1GTAA 5CRWA 2VL2C 1BYEA 3ZIJA 1U3IA 4GSSA 3E9JB 1T00A 5AIVA 1SL2B 3Q19A 4IQ1A 5IO2A 2WS2A 1QK8A 4LL1B 4EC0A 4RUVA 2GGTA 1ZL9A 1NW2A 1TRWA 1V9WA 1FAAA 1GNWA 2A4VA 1V98A 1K0MA 5CAXA 4OD7A 4DSSB 3N9JA 2B5YA 4XTSA 5D96A 1A24A 2L4QA 3HD5A 1RK4A 1XW9A 1OE7A 3WD6A 8GSSA 3KH7A 1MDJA 5DCGA 5CRHA 1SYRA 1NSWA 2MBSA 1MDIA 2FGXA 2NVLA 2H66A 5E4WA 4NV2A 3LEFA 4MPGA 4ZIJA 4PQIA 2VL2A 2PU9C 2L5LA 4IBPA 4N30A 5KN2A 2VL3A 2X8CA 1V40A 3UJ1A 1TU7A 3EYTA 4ZL9A 1K3YA 1LJRA 5ECQB 3P7XA 2HT9A 1YF0A 5J9CA 2PUKC 3DD3A 3NZNA 2C0DA 3LSZA 2IMKA 1BEDA 5HFIA 4MJCA 1Z6NA 5HR0A 2I3YA 4K8MA 3TCOA 1HNCA 1Z7PA 5GZZB 4F03A 4RQRA 1SL1B 3ZMLA 3RHBA 1YKAA 4N10A 3D5JA 2DIYA 1UC7A 3PH9A 3CYNA 4MH2A 2YWOA 2DJ1A 1KNGA 3IAM2 4ILFA 4K6XA 3FKFA 4LMWA 5IMCA 4G19A 2RLIA 3KD0A 4OFNA 2WRTA 5ELGA 3CSIA 4MF6A 1PX7A 5AIXA 2F9SA 4WF5A 4KUNA 2HSYA 2QGVA 4KCEA 3FEUA 2FA8A 5ECIB 5DJLA 2HLSA 4TRXA 3MDKA 6GSVA 5B7CA 3LYKA 4KAEA 4L5LA 3HZ8A 1QMVA 4XRAA 3V1WA 2MBTA 4IHUA 2QKEA 5C00A 1FVJA 1TXXA 3UMAA 5L71A 1B4QA 3M9KA 2F8AA 2GQLA 17GSA 2H0HA 1XCCA 5CYYA 4HU7A 3CTGA 2OKAA 1SK1A 3GUSA 1UVZA 1OAZA 1Q98A 1VRSD 5DALB 2C1YA 3GMFA 1UA5A 3UBKA 1JHBA 1FG4A 1EEJA 2LQQA 3IE3A 2LJAA 5DAKA 1X5CA 2H1GA 1SK2A 1BG5A 3A5WA 3SWLA 4TR1A 1B9YC 6GSUA 3G7YA 1JLWA 2H1DA 2L59A 2VLTA 1GSEA 2DSAA 3HXSA 5G5EA 2VCQA 1GTUA 1B8XA 4GXZA 3JCML 3HYPA 2JZTA 1TRSA 4Q5FA 1JFUA 3WYWA 3ED3A 4POBA 1NHOA 1QUWA 2OE3A 1S3DA 4ID0A 3M0FA 2WDUA 3LORA 1FVKA 4POKA 3C71A 1DE1A 1V57A 3HVSA 2CT6A 1FB0A 3LQ7A 3IHQA 4TXVA 3F6FA 2FLSA 3IK9A 1TRVA 2B7KA 2M80A 4MJBA 4NV5A 4QL9A 1TDIA 1I5GA 4D73B 2B7JA 2H01A 5COHA 3UBLA 1U6TA 3GKXA 4IGJA 4F9ZA 3RBTA 1TP9A 5ELAA 2VCTA 3FZ5A 5H5SA 5ABRA 3D4TA 4XHMA 3FW2A 2O89A 1TW9A 4AJ6A 2FWGA 3TOUA 4E8EA 4YAVA 2AV4A 5CNWA 2K18A 1S3AA 2VD0A 2VCXA 9GSSA 5A4WA 3C1RA 1PGTA 3ZVJD 1SD9A 2PGTA 5G2ZA 1OC8A 3IBHA 2VLVA 2DLXA 3GL5A 4FH8A 1C72A 3IXRA 4O7HA 2HXKA 1K3LA 4KDYA 4WKWA 2IJYA 1GSQA 3W8JA 1GLPA 4PQHA 3L4NA 4ZILA 5D9WA 3O76A 3G7JA 4RI7A 4AF2A 2CVBA 4EXJA 2LSTA 2PERA 1B48A 4PQ1A 1GUMA 3VI5A 4V2MA 2AYTA 5KN0A 1SD8A 4WEYA 5ECLB 4MJAA 5KN3A 3PINA 1XOAA 4L0WA 5IO0A 4MH3A 4POMA 4KW6A 2VCWA 4XS1A 1PRXA 3US3A 1GSYA 3KMNA 4MLYA 3FZAA 4KNDA 5ECMB 1PSQA 1E6BA 6GSXA 4JU5A 1G6WA 4JRRA 1OKTA 5DQSA 4KCAA 4OFTA 2R3XA 2KP1A 1G6YA 1HYUA 2VLUA 4GSNA 1A2JA 2MMNA 2IMEA 2R37A 2RM6A 1VF3A 5FWGA 3ZYWA 1GSDA 2AAWA 1PA3A 2H8LA 1AW9A 1QQ2A 2OJLA 3TKSE 12GSA 2EC4A 1ZCPA 1U3AA 3KGKA 2G0FA 1GH2A 2VCZA 1F37A 5IMDA 1G7OA 3DYRA 3OR5A 1ERWA 1M9BA 5DBQA 2PWJA 1TI3A 3GNJA 2IMIA 5H5QA 1IYIA 3RPNA 3KTBA 3QAWA 1XPVA 4GWRA 3FRCA 3CRUA 4FYUA 5D9VA 4DSQA 2VCVA 2AB6A 5CP1A 3CMIA 2OE1A 4TOPA 5LCZA 1GTBA 1M2AA 4NXIA 13GSA 1EZKA 3MNGA 5EVOA 1GULA 2LJKA 4RQXA 2PPTA 3TJBA 2C0GA 4ECIA 1A0FA 2ON7A 4ML6A 2FY6A 4KA0A 2IFQB 5JWQB 3APSA 3F63A 2IMDA 3FZ4A 4MJEA 2YWNA 3GURA 1AXDA 3HJPA 1IYHA 2CX4A 3IV4A 3EURA 1USBA 1K0DA 3ERWA 2WFCA 2OA7A 1WPIA 3E3EA 3LGCA 2YPMA 2TRCP 1WP0A 4EF0A 1PN9A 2LRTA 3KP9A 3F0IA 3J7Yk 3FR6A 5EL8A 1VF1A 5J5NA 2B1LA 2H74A 2JACA 5DQYA 3VWWA 4DEJA 1AAZA 3H93A 2JZSA 1G0TA 2C3NA 3BOAA 2VL9A 4N11A 2DMLA 5KEJA 1O85A 5HR3A 2BMXA 3ME7A 5AISA 4ZXGA 4HUAA 3DVWA 4EE0A 5D73A 4ACSA 4G9HA 2YJ7A 3IA1A 1R4WA 4MK3A 2GDRA 2I4AA 3D21A 1XBSA 1AQWA 3C8EA 2PMTA 3F4TA 3GKKA 2H6ZA 2YV7A 1R5AA 4X1UA 2GLRA 3IDVA 4GQFA 1X9WB 3QPMA 3PR8A 3P2AA 2DJ0A 1YKCA 1EV4A 3H4KA 1GSSA 3KP8A 3IPZA 2KLXA 2E0QA 4TXOA 5A4VA 3VFIA 2LEGA 4YH2A 1AC1A 1X5DA 3GTUB 3HHVA 1WOUA 3IC4A 4I8BA 2CV4A 4EL1A 3GYKA 2YV9A 5A4UA 4BVXA 3CSHA 2PN8A 2DJ2A 1T7PB 1V58A 2K8VA 3UOMA 4PNGA 1BX9A 4V2LA 1ZYQB 2A2SA 4BWSA 2YN1A 2YZUA 2X64A 1XW6A 4EDZA 1FOVA 16GSA 4FYCA 5ECSA 3D0ZA 5HFKA 3D22A 2C0EA 1MEKA 4AJ7A 2GSRA 5D9XA 2QSIA 1AQXA 2GQMA 2FD3A 4NHZA 5ECHB 2IIYA 2E2MA 2HRFA 2JSYA 3H8QA 1F3BA 4IJ3A 2NDOA 1GWCA 2E7PA 3MAKA 3MWHA 4ULXA 2C3QA 4QQ7A 2JZRA 1OYJA 5G1KA 4FIWA 1B9XC 1XOBA 1R5PA 2H30A 4KSMA 4RI6A 1R7HA 2VM1A 3ZLPA 1A8LA 3Q18A 2OACA 2GQKA 2RM5A 2ZUPA 4LL4B 5ECPB 4XS4B 5G30A 4HOJA 3ZFBA 3DIEA 3KCMA 1SJZA 3WGEA 3W6GA 2HSHA 4N0VA 11GSA 1A2MA 4ZBDA 5HFGA 4MF5A 1TOFA 2OADA 1PMTA 5F0GA 1GNEA 6GSSA 4KGIA 2I1UA 1F3AA 2MMZA 4I2UA 3DEXA 4EVMA 3GA4A 3EINA 1O81A 4IVFA 3VPQA 2CAQA 2V1MA 3F4SA 2QC7A 4O92A 3C1SA 1ERUA 4JEDA 3QD9A 4YQMA 1Y6EA 4MA9A 5A5KA 1A0RP 1WIKA 4V1Ap 5ECRB 2WB9A 3ZREA 2L6DA 2PBJA 4L8EA 2BJXA 4GSTA 1ZYEA 3KTLA 5JWOB 1J9BA 2HZEB 4I97A 2GZZA 5INYA 3ZTLA 5AN1A 2FWEA 2VUPA 5D8IA 1MD4A 3O3TA 3U5RE 3DXBA 3MSZA 1NM3A 4HDEA 1X0RA 3GKNA 2P5RA 2CQ9A 5J41A 4F2IA 1GP1A 4OCFA 2HZFA 1Z7RA 3VURA 1PKWA 1ILOA 3TJGA 4QL7A 4YAPA 1QFNA 2L5OA 5CO3A 4V1Ag 3UVTA 1KBNA 2WCIA 3HVXA 2H75A 4BWQA 2I81A 5JCUA 2IPAA 5HQPA 2NPBA 1OC9A 7GSSA 3H79A 2XPDA 1SJ6A 1YY7A 2IFQA 3KH9A 3WGDA 1TI1A 1Y25A 3LXTA 3DVXA 2PVQA 5JCWA 5CRDA 2JADA 3UIWA 2R6KA 4L5OA 5ECNB 3BD2A 4PNFA 5HR2A 2NBSA 3DKSA 4JZQA 2GZPA 4TVEA 5ECOB 1WJKA 3D6IA 1PKZA 1W4VA 2OE0A 4OO5A 1ACVA 2MYGA 2OBIA 3TKRA 2M46A 4ZBAA 3BBYA 5B8BA 3AY8A 5ID2A 1TK8B 2H1AA 4JBBA 2CX3A 3QDNA 3I43A 5FT3A 1XIYA 2CA8A 5FHIA 3KJYA 2TRXA 4BL7A 4NPBA 1R26A 3A2WA 3M1GA 6GSTA 5IMFA 2WZ9A 4E8HA 1JZDA 1K0BA 4OCEA 3TKPA 4IS0A 3FYGA 3QAGA 4TN8A 1S3CA 4IJIA 3DMLA 4FO5A 5GSSA 2KP2A 1OVNA 2V6KA 1MTCA 1YQ1A 1ZOFA 2YWMA 5IM9A 1T3BA 1A2LA 2HRNA 5GAPD 3GV1A 4CW9A 1SKRB 4K1FA 5IOWA 5HR1A 3UAPA 3DRNA 1JZOA 4HU9A 4KDUA 1SJIA 2F51A 18GSA 2V41A 2WULA 4DSSA 4K0NA 2DBCA 4DVCA 1ZGNA 4ZB8A 1U88A 3QR6A 3ZIVA 1Z6MA 5IPHA 1XW5A 3Q6OA 1W89A 1E2YA 1THOA 2MMAA 2JSZA 3KIJA 1WRYA 3LWAA 3ZRDA 2CVDA 3GIXA 3KXOA 3F8UA 1KEBA 4IN0A 2WGRA 2LQOA 2LKUA 2H6XA 1Z5YE 2KHPA 4Z7XA 3IR4A 4X43A 1TRUA 1U87A 2LV3A 1ZMAA 1T4ZA 2Z9SA 5DAKB 3PGTA 2DIZA 4ZL7A 1PQNA 5JCGA 4BA7A 3WT1A 3RDWA 1EP7A 4TR1B 3LJRA 4TR3A 2IL3A 3L9SA 2ON5A 4CHSA 5CRGA 2KUCA 1BJXA 3QOUA 2N5FA 3VI7A 3TOTA 4ECBA 5C04A 2GT6A 3EWLA 3E0UA 1HQOA 1THXA 2XBIA 2R2JA 4BVYA 1EOHA 4MZBA 3UEMA 3D4MA 2DC5A 5GAND 3HJOA 4HQZA 5J9BA 3VWXA 1AUCA 2F8FA 2ALBA 4K9ZA 1T1VA 4LLRA 1YF1A 4LMVA 2RIIA 3K8NA 1K0AA 2YOIA 1A23A 4WBJA 6GSWA 4EKZA 1XWGA 1PL1A 2DMMA 2KOKA 5IPGA 3GFKA 4V2NA 4HZ2A 4K7IA 1EGOA 1K0NA 5ENUA 4ML1A 5DVBA 1XZOA 2V32A 1GTIA 3GKMA 2MMOA 2FUG2 2L57A 4OFMA 5F06A 1ABAA 1J08A 4MABA 3A3TA 1F9MA 4IP1A 3IK7A 1K0CA 4ECCA 1PX6A 3GRXA 5DALA 3RHCA 3TKSC 4TKYA 3M9JA 4MPFA 5G5FA 22GSA 4KX4A 1FB6A 2X8HA 5LNKe 3APOA 3TJJA 4J2FA 3R2QA 1F2EA 2V2GA 2FCHA 3CBUA 4KB3A 1X9SB 3L78A 2G2QA 5J3RA 2XPEA 2H70A 1YEPA 2ZNMA 1CQHA 3HCZA 3TGZA 1RW1A 3P90A 2VM2A 1G7EA 3KZQA 4ISDA 3TDGA 3GX8A 3KMOA 5KN1A 3U6VA 4G2EA 4L0UA 1VF4A 4NWYA 3KEBA 1HNAA 1XFLA 1GLQA 4EO3A 3A2VA 2YANA 4JR6A 3C73A 4K7NA 2ES7A 4K2DA 1YEXA 1XVQA 3I69A 5DCHA 3F3RA 1N2AA 3ZITA 3VLNA 1EEMA 3TKSA 4JE1A 2MZCA 2NTOA 3DWVA 4Q5NA 4POLA 4IELA 3FR3A 4WF4A 2GVPA 1O7UA 3APQA 4MZCA 2LUSA 4TR4A 1OKDA 4D73A 10GSA 1N8JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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