3ZLPA

Crystal structure of schistosoma mansoni peroxiredoxin 1 c48p mutant form with four decamers in the asymmetric unit
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVPPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
publication title Switching between the Alternative Structures and Functions of a 2-Cys Peroxiredoxin, by Site-Directed Mutagenesis
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 29
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, V, W, X, Y, Z, a, b, c, d, e, f, g, h, i, j, k, l, m, n
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zlpA00
5ECNB 3ZMKA 3KD0A 4JE1A 2DJKA 2XPEA 4MZCA 5DAKB 2PWJA 2GTUA 3D5JA 4F82A 3A3TA 1FB0A 3LGCA 4JBBA 3KTLA 2VOCA 1SYXA 1IYIA 5F05A 1XCCA 4GLTA 3ZFBA 1M9AA 4NWYA 4PQ1A 1YKAA 3ZYWA 3D0ZA 1G6YA 1M99A 4PNFA 2M80A 4V1Ap 2HLSA 3LJRA 1NSWA 1AAZA 2FWHA 3LXZA 1JZRA 2FD3A 4HEA2 3P8WA 5FHIA 2N5AA 3G7IA 3FZ5A 4FH8A 1GSSA 4I2UA 6GSXA 1WIKA 3U6VA 2CA8A 3FYGA 1K0NA 1PKZA 2FA8A 3WGEA 2R6KA 3ZL5A 1KBNA 3S9FA 5CRHA 4AGSA 3FEUA 3TKRA 4MH3A 5JCGA 2K8VA 1A2LA 2N5BA 1E6BA 4KB3A 2JSYA 3HY2A 4X1UA 3PR8A 4LMVA 1T4ZA 4YQVA 4HZ4A 4H86A 5ELAA 1TU8A 4I2TA 2AAWA 2YZUA 1OKTA 3LQ7A 3ZFLA 2PVQA 2KOKA 1XXUA 2C0EA 1S3CA 1S3DA 2JZRA 1RK4A 4OCEA 3VLNA 1VGLA 4ZL8A 2R2JA 1PGTA 1JLWA 4GSSA 3KMOA 4HOJA 1A23A 1AQXA 1FW1A 1PN9A 1X9SB 3EE2A 3GH6A 4ZILA 4G19A 3CRTA 1GNEA 1U88A 3D4TA 4BL7A 1G6WA 2MMNA 1QUWA 1PRXA 3C73A 4F2IA 3UIWA 5IMZA 4E8HA 1J08A 5IMFA 1R5AA 1YEPA 1X9WB 4PQHA 3Q74A 3A5WA 3G7YA 5F0GA 1YKCA 2IMEA 3TB2A 1WMJA 4RQXA 1M7TA 1TP9A 4ZBAA 2CV4A 4N11A 3VI7A 5J5NA 5D8IA 2JADA 1AW9A 4EL1A 1FOVA 3EU3A 1X5DA 1Z7RA 3CRUA 2DMMA 4TVEA 1GSQA 2TRCP 2VCTA 1TU7A 3IR4A 3ZVJA 1AQVA 5EY6A 3UARA 2WZ9A 2DIZA 4ECCA 1XPVA 3L4NA 3QPMA 1V58A 2HYXA 5AISA 2CX3A 3RBTA 3ME8A 1B9XC 4JU5A 4TR0A 1NW2A 1V9WA 3F3RA 3HVXA 3M1GA 3IV4A 3ERGA 1VRSD 1VF2A 5CREA 2LQQA 1XVWA 4NXIA 2K8SA 4MJBA 3DIEA 4GWRA 3EINA 4EXJA 2H1AA 1F2EA 4AJ7A 3UVHA 3GKXA 4Q5RA 2VCWA 3UBKA 1QGVA 5AIVA 3CSHA 3O6TA 3QD9A 2H6YA 2M46A 2H1DA 5FT3A 2HNLA 2MZCA 3KH7A 16GSA 3EMXA 3KGKA 1EV4A 1ERWA 4NV5A 1MDJA 1SL0B 3FZ4A 2V41A 2VCQA 2IWTA 4BA7A 5D9WA 2C8UA 2FA4A 3DGQA 2VM2A 5CO3A 5IMAA 1JZWA 2DBCA 5F8BA 1GTAA 3MDKA 3FHKA 3GN3A 4WR4A 1FB6A 2GQLA 2GQKA 1J9BA 3H93A 1ZMAA 4N0VA 1USBA 3G9BA 2R3XA 3N9JA 3CXGA 4HQSA 2H8LA 4Q5QA 3GX0A 3W8JA 3GKNA 1TOFA 1TXXA 2ON5A 2MMAA 2ZCTA 2AJQB 2I1UA 2CQ9A 2HZEA 3EMPA 1VF3A 2P31A 1GSFA 4V2LA 3IOSA 3F8UA 3CMIA 2OKAA 1A8LA 2TIRA 1S3AA 3LXTA 1XOBA 1NHYA 2LEGA 3VURA 2B1LA 3LG6A 3ZIVA 1JHBA 2O87A 3DVXA 5DJMA 3EU4A 1WRYA 1XBSA 2PVOC 4GCIA 5IPGA 1PSQA 1T4YA 3FK8A 4JZQA 1U6TA 2IFQB 2WJUA 1K0CA 4ECJA 4O92A 1X9MB 1GTBA 4EKZA 3GKMA 1M2AA 1PKWA 3F3QA 4FO5A 3APSA 3GTUA 3APOA 2LNSA 4K8MA 3TJJA 3GL3A 4F9ZA 3M9JA 5HFIA 4ISDA 1U3AA 5DALA 3I9V2 3GX8A 5H5RA 4I8BA 5G2ZA 1G7EA 19GSA 1MEKA 2WB9A 2DJ3A 3G7JA 2K18A 2VO4A 1PX7A 1TRWA 1ML6A 5HR1A 3HCZA 4EDZA 1GUHA 2B6MA 4JEDA 4D73B 5IIZA 1FAAA 2MBTA 3UBLA 1C72A 4MLYA 5ID2A 5KN1A 3UJ1A 5EPFA 1XW6A 2IPAA 1SKWB 2C3QA 4PX1A 2KP1A 4IKHA 1TW9A 1XWBA 4AF2A 2YWMA 1OE7A 2EC4A 1EOGA 4OWYA 5A4VA 1K0DA 5A4WA 4IN0A 2HSYA 3GKKA 4ZIJA 3A2WA 5B7CA 5J9BA 3JCML 2F8AA 3CSJA 2H30A 2NBSA 2V32A 3H8QA 3BJ5A 2WFCA 5B8AA 4MF5A 3TCOA 1Z6MA 4WETA 10GSA 3LWAA 3NIVA 4K9ZA 2C3TA 3RPPA 5IM9A 1OC9A 2VD0A 3WT1A 2QGVA 5GAPD 2IMKA 4HS1A 3OR5A 2H6ZA 6GSTA 4ZL7A 4MPFA 3GURA 2RUEA 1GUMA 3Q18A 3GL5A 5IO2A 5CYYA 4PQIA 4LLRA 3IDVA 3ZITA 3APQA 3BOAA 3IRAA 1GP1A 1AIUA 4TN8A 1YF1A 3DEXA 4K2DA 4DVCA 4IQAA 3UAPA 5HFGA 3O3TA 5LCZA 3GYKA 1ZYQB 1O7UA 1SL2B 2RM5A 3J7Yb 5JWRB 2YN1A 3LSZA 3EC3A 1J0FA 4OFTA 2B7JA 1GNWA 2AHEA 1NHOA 4DSSB 1G7OA 2L6DA 3KEBA 5JWOB 2J23A 5IQYA 3QDNA 1UC7A 1GULA 4NHZA 2LTKA 1GH2A 3HYPA 2HRNA 4OO5A 3N5OA 2JZTA 6GSYA 1EGRA 1TKDB 1BAYA 1Q98A 1T8EB 11GSA 2H76A 1MD4A 4WR5A 1PQNA 3ZVJD 3Q6OA 1EP8A 4KCAA 1OYJA 3U5RE 3NZNA 5CRDA 5LNKe 2CAQA 4CW9A 3L9UA 1WWJA 5G5EA 2DJ1A 3DWVA 4O5RA 1QMVA 1OAZA 3ERFA 1SK1A 3M3MA 3D21A 2YJ7A 4IS0A 1ZOFA 4MPGA 4WF4A 5DQSA 1Z5YE 3LYKA 3TJBA 1T7PB 1XW9A 2C4JA 2DJ2A 4IP6A 1K3OA 4V1Ag 3I6AA 2PU9C 5D93A 1GWCA 3TJGA 1WOUA 3VWWA 2V1MA 5CNWA 3ZLPA 4ZB6A 4EDYA 2VM1A 3EVIA 4LL4B 5CRGA 2YV9A 4XS6A 4FYBA 1K0OA 1CQGA 1AQWA 2FY6A 2XPDA 6GSVA 4WEYA 2E0QA 5J3RA 4G2EA 4KDYA 1GSDA 2JZSA 4MF7A 3IHQA 5ECIB 2BJXA 1MTCA 2H70A 2YWNA 3ME7A 3GFKA 1M2DA 4K6XA 2B5EA 3CTFA 5COHA 2EIOA 1ZL9A 4LA1A 1K0BA 1SK0A 4XS4A 5ECSA 4ECBA 1YF0A 3HVVA 4TXVA 3DKSA 14GSA 3KCMA 4K0GA 1XWGA 4GRFA 3IC4A 5LD0A 3ISOA 2VCVA 3DMLA 2FLSA 2VCZA 4WF5A 3DYRA 1FHEA 3QAVA 3CYNA 2OADA 4TW5A 4MJEA 2ON7A 3GV1A 4KNDA 2WRTA 1UN2A 2R5GA 2V6KA 2IL3A 2KP2A 1SK2A 4V2NA 2HT9A 5HR2A 2LRNA 4ZXGA 1M2BA 2LJKA 4L0UA 4G9HA 3GH9A 4FYUA 4XRAA 4POMA 3MAKA 5INYA 1YJ6A 4L8EA 2BTOT 4KDUA 1KEBA 5ECKB 2P5QA 1FVJA 3J7Yk 5CRWA 5GAND 3BD2A 4J56E 2L6CA 3H79A 5IOWA 2NVLA 3ERWA 1B8XA 4IQ1A 1GSUA 1Z6NA 4MP4A 4RI6A 4JR6A 3EYTA 5F06A 1DE1A 2E2MA 3D6IA 3HZ8A 4Q5NA 2K6VA 5HR3A 2DC5A 4ACSA 2GQMA 2YWIA 1Z7PA 5HFKA 2YWOA 8GSSA 4TR1B 4ULXA 3L9VA 1SENA 2WS2A 3IAM2 3F4RA 2PN8A 4ILFA 5G1LA 1K3YA 2OE3A 4LL1B 5JWQB 2OACA 1GTUA 4ZB8A 2C80A 1PD21 3F4SA 3HA9A 4I6XA 4POLA 3EWLA 3TOUA 2GS3A 3D22A 3IXRA 2ZNMA 5EL8A 5HR0A 1EP7A 2CVDA 2OJLA 1A8YA 4HQZA 4MH2A 3WT2A 3UL3A 3EURA 5D96A 2KLXA 4GTUA 1TRUA 5KN2A 1A24A 2IJYA 3SBCA 3L78A 7GSSA 1A2MA 4J2FA 2MMZA 4PGTA 5FWGA 5CP1A 2LJAA 2F9SA 4EC0A 3DVWA 6GSWA 3LYPA 2CVBA 4ZBBA 1T1VA 3M0FA 2L59A 3W6GA 2C0DA 4ML6A 4JR4A 2YJHA 1M0UA 2ES7A 4K0NA 1I9DA 2O89A 4ID0A 1GLPA 4QL9A 4POBA 1XWKA 1ABAA 1ACVA 4OCFA 2OBIA 1GRXA 2CT6A 4ZBDA 3HJMA 3TOTA 1OVNA 2RIIA 4ZL9A 1HYUA 2I9HA 2FWGA 2L4QA 3HZ4A 1K3LA 4KGIA 2REMA 2HRFA 5C04A 3TGZA 2MMOA 4MCUA 1B4PA 1JFUA 5GSTA 5J4UA 4KX4A 5G5FA 2AB6A 2VL2A 2WDUA 5EVOA 2AUVA 3QR6A 4QQ7A 3KTBA 1F9MA 3F9UA 1WPIA 1SKRB 2YP6A 2H71A 4DSRA 3IK9A 2HZFA 4BWQA 3L9SA 4L5LA 1XFLA 3BBYA 2LRTA 1SJZA 2LS5A 2PUKC 3KJYA 4IHUA 1H75A 2GLRA 1M9BA 1OKDA 3ZMLA 4E8EA 3RHBA 1YDKA 1ZZYA 3Q19A 2H66A 3PGTA 4TXOA 4NHWA 1VF1A 5IOXA 2VAFA 3C8EA 1OC8A 2WCIA 1T3BA 5A5KA 2WGRA 2IMFA 4K7IA 1HNBA 2CZ3A 2PBJA 4PUAA 1XIYA 5DAKA 5L71A 2VD1A 3QAGA 2A2SA 2H0HA 1HNCA 4GQFA 4PURA 4KW6A 3GNJA 1BX9A 5KN0A 1O6JA 3DXBA 5G30A 4XHMA 4MABA 2GSTA 1R4WA 1OC3A 2GT5A 3KZQA 4ML1A 4YQUA 1HQOA 1JZDA 3GSSA 1YY7A 2VCXA 5B8BA 1SD9A 4WXTA 2IMDA 2VL2C 3A2VA 2CVKA 4BVYA 3F63A 1XWCA 2C1YA 3VPQA 1PL1A 2TRXA 3VWVA 1SU9A 2X99A 5DCHA 6GSSA 1B48A 4J57E 3IPZA 1ERTA 1PL2A 2RM6A 4PXOA 5IPHA 2OE1A 4Z7XA 2H73A 2GZPA 1PMTA 1R26A 1THXA 2PGTA 5AIXA 2HXKA 1FG4A 3H4KA 4HDEA 3QFBC 1SKSB 2GVPA 3FY7A 4KUNA 1B9YC 4GSTA 1B4QA 5C00A 2L57A 3I43A 3HJPA 4HJMA 1ERUA 2LV3A 4MMMA 1ST9A 4OMVA 4OFNA 2QKEA 1ERVA 2H0GA 2N5FA 4Q5FA 1CQHA 2J9HA 2PMTA 2FWEA 2C0GA 3HJOA 1V40A 5JCUA 4L0WA 1BEDA 2IMIA 1YZXA 5ECRB 4F03A 1E2YA 2FWFA 4NV2A 2VUPA 3IE3A 1XWAA 2JL4A 2JSZA 2O8VB 5B6MA 3C1RA 2NPBA 2LKUA 3RAZA 2HZEB 2GGTA 3MSZA 4TOPA 1X5EA 2YZHA 1N2AA 3WYWA 2C0FA 2H1GA 1DUGA 2X8CA 2VIMA 2K9FA 3HVSA 4EE0A 3TKSA 4CDOA 1TK8B 3VK9A 4GSNA 2X8GA 1MDIA 1AXDA 1DSBA 1KNGA 1Q4JA 1QK8A 3IA1A 1ON4A 2MYGA 3DD3A 1TJDA 3IBHA 3QCPA 3P90A 4MDCA 4X0XA 4EVMA 1JLVA 4NPBA 3HXSA 2C3NA 4KAEA 1LJRA 2L5OA 1WJKA 3CBUA 5ECPB 4N0ZA 4IBPA 5ECHB 5AGYA 1LU4A 3GTUB 1IYHA 3TKPA 3M9KA 3TUEA 1GLQA 3O76A 5E59A 1O73A 2I3YA 4KE3A 3RPNA 3TDGA 3MWHA 1AC1A 4TKYA 2I81A 1X0RA 2ZUPA 2DLXA 4XTSA 5DALB 4F0BA 4LMWA 4YQMA 3HDCA 4N10A 1K0MA 1V98A 3TRPA 2GZYA 3UOMA 2HE3A 2E2GA 1BQ7A 5ECQB 1ZYEA 4NAXA 4HZ2A 3AY8A 1K0AA 2YPMA 3WD6A 3ED3A 1ZGNA 4KDXA 1RQMA 2MBSA 1MD3A 5ID2B 5B6NA 4HUAA 9GSSA 2YOIA 1TRVA 2XC2A 2VLTA 3FW2A 4FYCA 3TKSC 2LJRA 3US3A 4MZBA 4XRDA 2H74A 5DQYA 2DJJA 1UVZA 3CSIA 3HD5A 5DDLA 1A0FA 1SJIA 1VF4A 2GZZA 3BCIA 4KA0A 4YAPA 1Z3EA 1ILOA 2ALBA 2XBIA 1DE2A 1SD8A 1F37A 1H4OA 5ECMB 2OE0A 2M72A 3A2XA 5CAXA 1F3BA 2JACA 5G1KA 3RDWA 4V2MA 2NDOA 3V1WA 2BMXA 5H5SA 1OC9B 3TRQA 4XIHA 3PH9A 1BYEA 3WGDA 3M8NA 3LEFA 3MNGA 3DRNA 2QC7A 2A2RA 3UMAA 1UA5A 1HNAA 4K7OA 2Z9SA 4QL7A 4AJ8A 5D9XA 3BCKA 5DJLA 1EV9A 1R7HA 1QFNA 2IFQA 18GSA 4IJIA 3H1NA 2HI7A 3FZAA 4PUFC 1Y6EA 5IMDA 2FUG2 1XOAA 3FR6A 4XS1A 4EF0A 20GSA 3VWXA 1EOHA 1PA3A 3FR3A 4NMUA 5D73A 1Y25A 4MK3A 2A4VA 4BWSA 3P2AA 13GSA 2AV4A 1SYRA 2XBQA 5JCWA 4RI7A 2PERA 2R37A 3ZRDA 5ABRA 2FNOA 3KXOA 2DSAA 5DBQA 3VFIA 5ELGA 1MDKA 5GSSA 4D73A 4O32A 4O7HA 2YANA 2O85A 2H6XA 3PINA 4EO3A 5AN1A 2B5XA 3RHCA 4KCEA 2F51A 5GZZB 4MJAA 12GSA 1F6MC 2D2ZA 2LRCA 2B7KA 2VLVA 1KTEA 2E7PA 3KP9A 2I4AA 4CHSA 2F3MA 3E0UA 4WKWA 1PX6A 3TRXA 2CX4A 2VL9A 5DCGA 1GSYA 3E9JB 3KMNA 2DJ0A 3W8SA 1OE8A 2O7KA 3L0HA 1TDIA 1GL8A 4POKA 1AUCA 3ZTLA 4MF6A 5KEJA 2FHEA 4IVFA 1SJ6A 4KH7A 4L5OA 4OFMA 3TJFA 4IJ3A 2NTOA 2VLUA 2P0GA 3E3EA 1QQ2A 4TRXA 4I5QA 2YNXA 2R4VA 4EUYA 1DBYA 4KSMA 2FCHA 2CZ2A 1V57A 3ZREA 1U87A 3KP8A 1Z9HA 4WBRD 2V2GA 4DSQA 2V6OA 2EIQA 4GXZA 3GHAA 4KSOA 3F0IA 4XS4B 3KIJA 3C1SA 1WE0A 1W4VA 1WP0A 1N8JA 4OD7A 3R2QA 3QOUA 1XZOA 1BJXA 3KH9A 1URMA 22GSA 1TK0B 1F3AA 2IIYA 1XW5A 4HU7A 5ECLB 4TR3A 2FGXA 2B5YA 1BG5A 4DSSA 2LSTA 4MZWA 2LUSA 3HKRA 2RLIA 1HD2A 2B3SA 2DMLA 3TKQA 3GMFA 3GIXA 2IN3A 3IAS2 5H5QA 1G0TA 5DVBA 1GUKA 3IK7A 2PPTA 1FVKA 1NM3A 3I69A 4FIWA 4HJ2A 1U3IA 2YV7A 4JRRA 3FR9A 4ZB9A 4HI7A 3TJKA 3CTGA 4I97A 4IGJA 1YQ1A 1TK5B 3QMXA 1THOA 3QAWA 4GQCA 2WULA 1V2AA 2AYTA 2H19A 2H1BA 1ZCPA 5ECOB 1EZKA 2X64A 4GF0A 5E4WA 3K8NA 3FRCA 3GRXA 3GUSA 2DIYA 3QFAC 4G10A 4XCSA 5IO0A 1YEXA 3VPTA 2RUFA 4ECIA 5G31A 1TI1A 1LBKA 4PNGA 3ZZXA 2CAIA 2F8FA 2H0IA 1JZOA 6GSUA 4F0CA 1T00A 4IW9A 4K1FA 4OO4A 1A2JA 2GSQA 2EIRA 1TI3A 3NOFA 3GA4A 2H72A 2KHPA 3F6DA 1GSEA 2HSHA 3WGXA 1RW1A 4N30A 5D9TA 4X43A 2VL3A 3TKSE 2G0FA 2HFDA 3F6FA 2G2QA 1R5PA 4MJCA 4HU9A 2H75A 3VI5A 2GT6A 3F4TA 2OBKA 3LORA 2KUCA 3HHVA 3P7XA 4YAVA 4BVXA 4BPYA 2X8HA 3D4MA 1TTZA 4IELA 3UEMA 3KM6A 1I5GA 3LFLA 5ENUA 3UVTA 1EWXA 1EEMA 2GSRA 1EEJA 4TR4A 1SL1B 4RUVA 2JU5A 1O8WA 2H01A 1TRSA 1XVQA 2GSSA 5A4UA 4K7NA 5J41A 3ZIJA 3FKFA 1O8XA 1A0RP 3SWLA 1EGOA 1O81A 3C7MA 4YH2A 2OA7A 5IMVA 2LNTA 4DEJA 1GTIA 4MA9A 5IMCA 4WBJA 17GSA 1X5CA 2YCDA 4IP1A 2LQOA 2L4CA 2XHFA 2L5LA 4AJ6A 2B1KA 3GSTA 5J9CA 5D9VA 5F07A 1FO5A 3VWUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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