3ZREA

Reduced thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
TMTQTVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia pseudotuberculosis
total genus 44
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zreA00
2CX4A 5EY6A 3C71A 2H01A 2CZ2A 3FK8A 4WF5A 1K0OA 3IDVA 4G2EA 3F3QA 5DVBA 1TKDB 5D9WA 1PL2A 2AYTA 2GT6A 4HI7A 2HSYA 1B48A 3KP8A 1AW9A 1TI3A 2H70A 1LU4A 3F0IA 2IFQA 5D9XA 1JZWA 1XWGA 4ZBBA 3LSZA 5H5SA 3L0HA 1EP7A 4HDEA 2LRNA 1B9XC 1EEMA 4D73B 3VLNA 1BX9A 4DVCA 1O8WA 2O85A 5CRWA 4X43A 3F9UA 2FA4A 3HJMA 3PR8A 1QXHA 3C1SA 4RUVA 4YAPA 1XOAA 2TRCP 4O92A 3ERGA 3ERFA 1M99A 1R7HA 2V41A 4I8BA 20GSA 2F51A 1G6YA 3DVWA 5B8AA 3LXZA 4MJBA 3CBUA 2ZCTA 4OFNA 2Z9SA 4MZBA 1R5AA 2P0GA 4LL1B 2AAWA 1A24A 3MSZA 3TKSC 5AN1A 1GNWA 1VGLA 1PN9A 3Q74A 1X5DA 2N5AA 1YKAA 1Z5YE 4O7HA 2WRTA 5ECSA 3LORA 3L9VA 4EF0A 1TRWA 3TJBA 2V2GA 4HZ4A 2YJHA 2LV3A 1GTUA 2OADA 3DD3A 2H73A 4GQCA 2GS3A 1TI1A 2B5EA 4BA7A 1YZXA 4MF6A 5ID2A 4EKZA 2RUFA 2GSSA 5DCGA 1FB0A 2D2ZA 4LLRA 2FGXA 1OC9B 3KP9A 4GSTA 4Q5NA 2FY6A 4TR1B 2OE1A 1MDJA 4BWQA 3QFAC 1PKZA 4IP1A 1SL2B 2IJYA 4JRRA 1SKRB 2GZZA 4NWYA 1FVKA 3ZYWA 1VRSD 1EZKA 3EE2A 3TB2A 2L59A 3ZTLA 3M3MA 4F9ZA 4F2IA 3LXTA 3C7MA 1FO5A 4POBA 4PNFA 2HZEA 3E0UA 3IHQA 18GSA 3W8JA 4KGIA 2ZUPA 3UIWA 4BVYA 4XS6A 2NPBA 1X0RA 2JSYA 2YZUA 1Q4JA 4TKYA 4V1Ap 1S3AA 5JCGA 5B7CA 1PA3A 3CTGA 5ECPB 3ZRDA 2RUEA 3IBHA 2C0FA 2FNOA 4PNGA 4GSNA 2QSIA 1PGTA 2TIRA 2BMXA 1H75A 1A2LA 4CW9A 3GH6A 3HD5A 5B6MA 4IJ3A 4BL7A 2OE0A 2IMDA 2GGTA 2O87A 4KB3A 1CQHA 4ZBDA 2C4JA 2XHFA 5IMFA 3I43A 1WMJA 2C80A 4RQXA 2R3XA 1A0RP 4I5QA 4MPGA 3U5RE 3KGKA 19GSA 3GTUB 2L5OA 4K9ZA 2OBIA 4KCAA 2VIMA 2X8GA 3C8EA 3QCPA 1O8XA 4MH3A 3RPPA 4POMA 3EMPA 4YQVA 2IWTA 1THOA 2IN3A 2TRXA 1AAZA 3GH9A 2P31A 3LQ7A 3TKPA 1RQMA 3GX0A 5DAKB 3F4RA 3IV4A 2CZ3A 1JHBA 1V9WA 4K8MA 1FB6A 2RM6A 2H66A 1Z9HA 2H6XA 2J23A 2YNXA 5KN3A 4BPYA 4XHMA 3M9KA 2FWHA 2B5YA 3VI5A 1ZYQB 3WT1A 2LRTA 1EEJA 4WR4A 3IA1A 3BOAA 1QQ2A 1TRUA 4I2TA 3K8NA 1IYHA 1WPIA 3L4NA 3UL3A 3LFLA 3M0FA 3UARA 1ZYEA 4D73A 4CHSA 2KUCA 3IPZA 3RAZA 2B6MA 5A4VA 4MDCA 2GQLA 3IK7A 4WXTA 2VUPA 4JZQA 1B4PA 4TR4A 4KA0A 3TRQA 4KSMA 2K9FA 3LWAA 5HFKA 5ECMB 5C04A 4TR0A 2LRCA 1U6TA 2GZPA 4PX1A 3GIXA 1HQOA 3PGTA 4J2FA 1HNAA 1KNGA 3BJ5A 2YPMA 5IPHA 4G10A 1AQVA 4ML6A 5LD0A 4N11A 2DJ3A 1K0MA 3S9FA 3Q18A 3HY2A 4L8EA 4OO5A 5ECLB 1EOHA 1Z3EA 2IL3A 5AISA 6GSYA 3DGQA 3HZ8A 2E2GA 1E6BA 4DSRA 4L5OA 3H4KA 3FKFA 3ZVJD 5G2ZA 6GSVA 2WS2A 5CAXA 2VM2A 3FZ9A 3TJJA 2HXKA 4TXVA 2LSTA 8GSSA 2PBJA 2R2JA 2YP6A 4YQMA 1ERUA 4O5RA 4LMWA 4O32A 3LYPA 4TR1A 1X9SB 3ZIJA 4IKHA 5ECNB 4RI6A 2OBKA 5DQYA 1SK0A 4EDYA 2K18A 1AUCA 2F8FA 4LA1A 5IMZA 1GL8A 1T00A 1F37A 3VFIA 3EU3A 5DBQA 5A5KA 5IMAA 3GL5A 1MD3A 5IMVA 3GURA 3HDCA 1N2AA 3ISOA 2GSTA 2DIZA 4IQAA 2JU5A 2XC2A 5CNWA 3FHKA 3R2QA 1PD21 4MK3A 4F0CA 3WGXA 4HJ2A 5ECOB 4RI7A 4TN8A 3G7YA 4AJ6A 4F03A 4MF7A 4QQ7A 1OE8A 1C72A 5HFGA 1K0NA 4JR4A 1NM3A 1GUKA 4OCFA 3UVTA 2DJ0A 1SL0B 1TP9A 2KP2A 1PX7A 2V6OA 2DBCA 3APQA 2EIOA 3TDGA 3IXRA 3RHCA 2J9HA 1BQ7A 5ELAA 5JCWA 2GLRA 1J0FA 2REMA 4K7OA 3FR9A 1R4WA 1VF1A 3A2VA 2IMFA 4HS1A 1EV9A 3M1GA 1TJDA 1DUGA 5KEJA 1GP1A 2VLVA 1T1VA 1BAYA 1WRYA 3HXSA 5AGYA 4POKA 4K2DA 3GTUA 3HYPA 1G6WA 2IMIA 4YQUA 4ZB6A 1XIYA 3M9JA 1WWJA 4IS0A 5AIXA 3CXGA 2LUSA 5G30A 3RBTA 1BJXA 3VI7A 2HRNA 2VO4A 3GUSA 1Z6MA 4PQHA 4WEYA 2K6VA 1Y6EA 1DSBA 4IVFA 4ZB8A 5CO3A 5ECQB 5IPGA 3F6FA 5DAKA 3FR3A 4GTUA 1X9WB 1SJZA 2WZ9A 3F63A 2YWNA 2BJXA 1O73A 4AF2A 2H72A 3GA4A 3KIJA 1FOVA 4XS1A 4FH8A 3GSSA 3VWXA 4EUYA 1PRXA 3D5JA 5DQSA 3ED3A 3DVXA 3A2XA 4V2LA 3A5WA 10GSA 5J41A 6GSTA 1M7TA 1ST9A 2LTKA 5IMDA 3GV1A 2VCZA 1NSWA 4WR5A 3FEUA 4JR6A 5KN0A 3G7JA 2AUVA 2I81A 2PGTA 5CRGA 2IMKA 5D9TA 2F3MA 4IN0A 3FR6A 2PVOC 2X8HA 1S3DA 4L5LA 4K6XA 2VOCA 1K0CA 2A4VA 1NHOA 1FW1A 2JSZA 1DBYA 3IK9A 3F4TA 1ILOA 3P2AA 4PUFC 1GUHA 2MYGA 3VK9A 1DE2A 4FYUA 3GRXA 3ME7A 3ZVJA 1WE0A 1JFUA 2CX3A 5KN1A 3TOUA 4XCSA 3F6DA 3FZAA 3KEBA 1O81A 4KX4A 2CV4A 2A2SA 4MJCA 2XPEA 3ZITA 4OD7A 1LBKA 1XOBA 1SD8A 4OWYA 3H8QA 1J08A 2DSAA 1SK2A 1SK1A 2CVDA 1LJRA 5D8IA 4OCEA 22GSA 3LYKA 4K7IA 4ILFA 5GSSA 3D22A 2AJQB 1GUMA 5J5NA 1OKDA 4XTSA 4GCIA 4OFMA 5DALA 5L71A 3GSTA 1SU9A 1F9MA 1NW2A 2C3TA 3ZZXA 3HVVA 2YN1A 1W89A 4N0ZA 4KDUA 4ML1A 3M8NA 3CRTA 1M0UA 3ERWA 4ACSA 3APOA 4WBRD 1A23A 4K0NA 2JL4A 3TRXA 3HVSA 2L57A 1U87A 1GSUA 2BTOT 3TKQA 1USBA 1GSSA 3TGZA 2VCVA 4RQRA 2DMLA 1B4QA 2GDRA 5ECKB 3DMLA 3VPQA 1W4VA 1A0FA 2VD0A 3UJ1A 2V32A 5D9VA 1T4ZA 1X5EA 1T3BA 4MMMA 1GSYA 2HE3A 4FO5A 5EVOA 3ZIVA 1UVZA 5G31A 1THXA 3IRAA 3I6AA 3FYGA 4N30A 3F8UA 4HQSA 3KTLA 1KTEA 3GMFA 4E8EA 1Q98A 5ENUA 4ECIA 1PL1A 4EC0A 2C3NA 3BCIA 1UA5A 4MLYA 2PWJA 1ZMAA 1PX6A 1XWKA 1ZGNA 4TRXA 3HJPA 2O8VB 1Z6NA 1AQXA 2HI7A 3H1NA 1VF2A 2YZHA 4OFTA 3RPNA 1F2EA 1FHEA 4G9HA 4ZL9A 5JWRB 1V98A 4EDZA 4J57E 3WYWA 4NAXA 3IE3A 2G2QA 2ES7A 1F6MC 1G0TA 3KH7A 1WJKA 5JWOB 4XIHA 2YWOA 1A8LA 4NPBA 1M2DA 1TRSA 3SWLA 2M46A 4GF0A 3DKSA 2B1KA 5D96A 3ZMLA 4JE1A 2PPTA 5COHA 1KEBA 4NMUA 3UAPA 3EURA 3P8WA 5DDLA 2RM5A 1GSFA 1U3IA 4LL4B 5F8BA 3RDWA 3W8SA 1M9AA 4ZILA 12GSA 1QGVA 2H8LA 3ZL5A 3QAGA 1V40A 3HA9A 4NV5A 3UMAA 4Q5RA 3TKRA 3BCKA 2GVPA 13GSA 3NOFA 1XWCA 1M9BA 2H75A 2C0GA 1A8YA 1XW5A 3KZQA 5F0GA 1HYUA 1RW1A 1OE7A 4XRDA 1F3BA 4KE3A 5G1KA 3APSA 1GTIA 2GT5A 2X64A 4F0BA 1TDIA 5FT3A 2FWEA 3FY7A 5DJMA 2H19A 2NVLA 2HLSA 1OC8A 1ZZYA 5ID2B 5FWGA 4HJMA 2YCDA 3FRCA 2GQMA 1M2AA 5G5FA 1GTBA 3UVHA 1B9YC 3C1RA 1EWXA 2JACA 2C3QA 2WGRA 4X0XA 5HR3A 4IP6A 2OJLA 1ZOFA 3ZLPA 3PINA 2I3YA 1GSDA 1OAZA 4MCUA 2PUKC 2VL2C 2H0GA 5J4UA 3DRNA 1TK0B 3HKRA 2RIIA 1TTZA 3GKXA 2P5QA 1EOGA 4L0WA 4ZIJA 3FZ4A 4WF4A 3V1WA 2HZEB 2FD3A 3KXOA 1OC9A 4ID0A 4PUAA 4KDYA 4ULXA 9GSSA 3D4MA 3G7IA 4TW5A 1XBSA 3QDNA 5B8BA 2H1GA 1TW9A 4K1FA 2LKUA 2LJKA 6GSUA 2FWFA 3ME8A 5CREA 1ERTA 2KLXA 1V2AA 3QR6A 2K8VA 2QGVA 1SJIA 3KTBA 4IGJA 1QFNA 5FHIA 2MMAA 2P5RA 4MZWA 4J56E 1U3AA 2YV9A 5G5EA 2R4VA 1TU7A 1ZL9A 1G7OA 1SYXA 3GKMA 4XS4B 2H76A 5D73A 4POLA 1JZDA 5C00A 2WFCA 3L9SA 5ELGA 3O3TA 2WCIA 2H0HA 2B7JA 2NTOA 1ERVA 4LMVA 4ZB9A 2DJKA 3LGCA 3DIEA 2VAFA 2NBSA 5IIZA 2HFDA 2HT9A 1WIKA 1DE1A 4KW6A 3DWVA 2CVKA 2LQQA 2MMNA 3CRUA 4HQZA 1Z7PA 5CRHA 7GSSA 4DSSB 4V1Ag 4ECJA 4MP4A 2L6CA 5HQPA 2KHPA 1SL1B 4MA9A 2H6ZA 4G19A 3J7Yb 4WKWA 2FHEA 5F07A 1TRVA 3KH9A 1GNEA 2WJUA 4BVXA 1TK8B 3HVXA 5E4WA 5GZZB 4ZL8A 5EL8A 3N9JA 3EC3A 2H1BA 1YJ6A 2C1YA 3D6IA 1XFLA 3QAWA 3TRPA 3BD2A 1EV4A 2RLIA 1XCCA 1VF4A 3TJKA 1K3LA 4I6XA 3EVIA 4KCEA 2L4CA 2EIRA 2JADA 2CAIA 3FZ5A 3NZNA 2IPAA 2HRFA 3I69A 5A4WA 5CRDA 2FWGA 3KM6A 1GLPA 3VWVA 3GX8A 1G7EA 4EXJA 1VF3A 2QKEA 2LJAA 4TXOB 4ZL7A 2EC4A 1HD2A 5HFIA 4ECBA 1SKWB 5IMCA 2L6DA 1AC1A 3GFKA 1AQWA 3TKSE 2I4AA 2B5XA 1OKTA 2JZTA 2R37A 5CP1A 3VWWA 1ML6A 2V6KA 2B1LA 14GSA 5DJLA 4V2MA 3W6GA 5J3RA 2CAQA 5AIVA 1TOFA 5JWQB 2DJJA 3QFBC 4PGTA 3DEXA 1YEPA 5J9CA 3CSHA 4IJIA 11GSA 2H74A 4GSSA 1XWAA 3EU4A 2NDOA 3CMIA 4TOPA 1O6JA 4IBPA 3ZFLA 3BBYA 2JZSA 1I5GA 5E59A 1GH2A 3UBLA 2OA7A 1AXDA 1RK4A 5G1LA 5F06A 4BWSA 3UBKA 2VCQA 1U88A 1XVWA 2CVBA 2AV4A 1AIUA 1XXUA 2PU9C 1ABAA 1TU8A 3GHAA 1FAAA 1HNCA 5LCZA 4TR3A 3FW2A 1MEKA 4HU7A 3F4SA 4E8HA 2LNSA 2H6YA 4Q5QA 2HZFA 2XBIA 3RHBA 4NXIA 3JCML 2VLUA 3HZ4A 1XW6A 2L4QA 1WP0A 3F3RA 1YQ1A 1X5CA 3EYTA 3QOUA 2PMTA 5ECHB 5INYA 3CYNA 1FVJA 3ZREA 1BEDA 1YEXA 3TJFA 3MAKA 1I9DA 1OVNA 4OO4A 4FYCA 1PKWA 1FG4A 2MBTA 5IM9A 4ZBAA 3KMNA 1X9MB 5H5RA 4KNDA 4F82A 1E2YA 4TVEA 3U6VA 2I9HA 3LEFA 3TKSA 3IAM2 4HOJA 2WULA 2XPDA 2M80A 3PH9A 3D4TA 3EMXA 3GKKA 2V1MA 2C8UA 2F8AA 4HU9A 1HNBA 3NIVA 1XPVA 2YANA 4N0VA 1T4YA 2MMOA 2O7KA 5ABRA 2H1DA 3CSIA 2N5FA 4PURA 3TCOA 3D21A 17GSA 2FCHA 2VCXA 2FUG2 4KAEA 3E9JB 2K8SA 4WBJA 2GQKA 2YJ7A 3EINA 2MMZA 4NV2A 1GLQA 1JZRA 1MD4A 3MNGA 1K0AA 3US3A 5ECIB 3D0ZA 4HZ2A 4XS4A 4K7NA 3CSJA 2OKAA 4QL9A 3IC4A 3Q19A 3ZFBA 4GWRA 2GSQA 2DJ1A 2VCTA 5IOWA 2XBQA 5B6NA 4JBBA 5GAPD 4N10A 1YF0A 5A4UA 2QC7A 4X1UA 4HEA2 2MZCA 2ON7A 4NHZA 3MWHA 1IYIA 1V57A 3DYRA 4CDOA 3L9UA 4MZCA 1SD9A 2LEGA 4GXZA 4DSSA 4PQIA 2CQ9A 2VL9A 4JEDA 1F3AA 2IFQB 3J7Yk 6GSXA 5J9BA 2I1UA 4EVMA 4EO3A 1GRXA 3WT2A 1JZOA 4IHUA 4QL7A 1MDKA 3UEMA 1PSQA 4DSQA 5IQYA 4XRAA 16GSA 4GQFA 1YKCA 1GULA 1YDKA 3O76A 3QMXA 2R6KA 3ZMKA 2H1AA 2DMMA 2G0FA 3GL3A 3P7XA 4Z7XA 1ZCPA 2ON5A 4OMVA 5D93A 4P3YB 4AJ7A 1SJ6A 1T7PB 4GRFA 2F9SA 1ON4A 1XW9A 2A2RA 2DC5A 4H86A 2H0IA 1XVQA 2LJRA 5IO0A 2OACA 5IOXA 2N5BA 2VCWA 4ISDA 4MPFA 1GTAA 2DIYA 3LJRA 2X8CA 1EGOA 2L5LA 1NHYA 4TXOA 4MF5A 1QUWA 2EIQA 3TJGA 3KMOA 2KOKA 2FLSA 1K3OA 4GLTA 4IW9A 2IIYA 4EE0A 4L0UA 4ZXGA 1A2MA 3VPTA 1PQNA 6GSWA 5HR1A 5LNKe 4HUAA 2ZNMA 2E7PA 3GN3A 3KCMA 2LS5A 4KDXA 5EPFA 1URMA 1EP8A 3QAVA 2HSHA 4DEJA 3TUEA 4EL1A 2GSRA 3VWUA 1S3CA 2B3SA 2AB6A 3GKNA 4ECCA 3L78A 1UN2A 2VL3A 2JZRA 4MH2A 1H4OA 3TOTA 2WB9A 5GAND 1O7UA 4PQ1A 1N8JA 4MJEA 4IQ1A 2CA8A 4PXOA 3KJYA 4YH2A 5CYYA 3C73A 1KBNA 3IAS2 1UC7A 5GSTA 1OC3A 1M2BA 2WDUA 4AJ8A 1JLWA 2H71A 3N5OA 1XWBA 1V58A 3KD0A 1J9BA 2VLTA 2VD1A 3A3TA 4I2UA 2DJ2A 2OE3A 3VURA 4FYBA 5DCHA 3GYKA 4Q5FA 1O85A 3MDKA 3EWLA 5DALB 2YWIA 1A2JA 2CT6A 3GNJA 4IELA 4WETA 1GSEA 1MDIA 5HR2A 1JLVA 4JU5A 2YV7A 5HR0A 3H93A 2H30A 3IR4A 1QK8A 3OR5A 2E2MA 1K0BA 1K3YA 4MJAA 1SYRA 5KN2A 2LQOA 2X99A 5H5QA 2DLXA 3LG6A 3UOMA 2PERA 1R5PA 1ERWA 2O89A 2C0EA 3O6TA 3A2WA 2FA8A 2LNTA 5ECRB 4I97A 4V2NA 1YF1A 3WD6A 1K0DA 2MBSA 2PVQA 3I9V2 1EGRA 1ACVA 3SBCA 4AGSA 3Q6OA 1WOUA 4FIWA 2M72A 4KUNA 3H79A 2KP1A 5F05A 6GSSA 3AY8A 1PMTA 1TXXA 3HJOA 4KH7A 3QD9A 3HCZA 2C0DA 3CTFA 1SKSB 1YY7A 1SENA 1T8EB 3G9BA 3QPMA 1XZOA 3E3EA 2HNLA 2HYXA 1Y25A 1TK5B 2GTUA 1BYEA 1GSQA 2VL2A 4MABA 2VM1A 2PN8A 4KSOA 4NHWA 2IMEA 5JCUA 1GWCA 5IO2A 2AHEA 1R26A 2R5GA 1CQGA 1QMVA 2ALBA 3IOSA 1OYJA 2E0QA 1B8XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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