3ZVJD

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITLNDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKHGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 33
structure length 168
sequence length 168
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
D PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjD00
2VCXA 3ZRDA 2AUVA 1FB0A 3H8QA 3M8NA 2M72A 3BOAA 5IO0A 4TR4A 5JWQB 5J9BA 3LGCA 4K7IA 3A5WA 4ILFA 2V2GA 4IW9A 2H72A 3QAGA 4HJ2A 1FB6A 4IN0A 4KAEA 3ZYWA 4LLRA 1HNAA 4EKZA 2YWNA 2WCIA 3I6AA 5AISA 2AV4A 4V1Ag 1OKTA 2TRCP 3L0HA 4ZIJA 2HLSA 1ILOA 2HE3A 1EP7A 1RK4A 2PERA 3VPTA 2GZPA 2H19A 4ISDA 2GDRA 2WJUA 2QGVA 3VWUA 1O6JA 3CRTA 2HRNA 1VRSD 3IV4A 2KOKA 4ML6A 5ECNB 5AGYA 1PN9A 5KN3A 3LORA 2OE0A 3DMLA 2B3SA 2DIZA 2VLUA 2OBIA 2HFDA 1ZYEA 2CV4A 4NWYA 1A0RP 2VCWA 5CRGA 4ZL9A 2KUCA 1TW9A 4LL1B 2B7JA 4YQUA 5B6MA 4MJAA 3IXRA 4TKYA 1ERWA 2LJKA 2ON5A 4IQ1A 4GSTA 4PQHA 5CP1A 3HCZA 3EYTA 3E9JB 4POBA 3TJBA 5ECIB 3C7MA 4I97A 1FG4A 3TKPA 1DE2A 4IJ3A 2C3TA 4QQ7A 3GFKA 1VF1A 3QR6A 2GSSA 3G7YA 1QFNA 3WYWA 3GHAA 2TIRA 2YCDA 3C71A 1TJDA 4Q5NA 5LD0A 1NW2A 1E2YA 4KB3A 1M9AA 1OKDA 1TP9A 3WGEA 1VF3A 2F3MA 2H1DA 6GSYA 2C1YA 1F3BA 1KTEA 4FYCA 2DIYA 2KLXA 2GS3A 1U6TA 4YQVA 4X43A 4DSSB 1PMTA 3UL3A 2C0FA 4XS6A 2IMDA 3N9JA 3WGXA 2AB6A 1QGVA 4IHUA 2PVQA 1V98A 2YJ7A 3O6TA 2EC4A 1XVQA 4XTSA 2E0QA 4L0WA 4K7NA 2B5YA 1GP1A 5IMVA 1KBNA 1O81A 1M9BA 4FH8A 1URMA 4POKA 2C4JA 4TXVA 4EC0A 2V1MA 5CRDA 2VLVA 3KP9A 2R4VA 4I8BA 4PNGA 3ERWA 4MF5A 2DSAA 5IPHA 3LXTA 1UC7A 2VOCA 4TR0A 1QK8A 4Q5RA 1USBA 2VCTA 2O7KA 1MDIA 3IAS2 4WETA 5D73A 6GSUA 4V2NA 5JWRB 2HZFA 2MMZA 5EVOA 1QUWA 4K7OA 4HDEA 4WEYA 3IPZA 1PGTA 5J4UA 5GSSA 1SKSB 3ZVJA 2A4VA 4GWRA 1JHBA 5E4WA 1X5EA 2KP2A 2VL2A 1X9WB 4N11A 2E2MA 4OD7A 5KEJA 3ME8A 4AJ7A 1TKDB 1GUHA 2L57A 3ERGA 1JZOA 2L6CA 1PSQA 4CHSA 2D2ZA 3I69A 3A2VA 2G0FA 2X8HA 4NAXA 2TRXA 1QXHA 2VL9A 2KP1A 1FHEA 2H66A 5ID2B 2LNSA 3ZFBA 5HR0A 2H0GA 1E6BA 4MF6A 3MAKA 4ULXA 4DSRA 3ZZXA 1ST9A 1TU7A 3RDWA 4G9HA 1SL2B 2GTUA 3QMXA 1GWCA 2X8GA 3FK8A 2C3NA 2H73A 5F0GA 2IJYA 2VL2C 2OJLA 3H93A 2PUKC 3GSSA 3F8UA 5DAKA 1T8EB 1GTAA 3DVWA 3TKSE 2HYXA 5ECQB 2GSTA 4MH3A 4ECJA 4PQIA 4TR3A 2YANA 4EDYA 5B7CA 4K2DA 1GLQA 1TI1A 4MJEA 3FYGA 3H1NA 2LSTA 4WKWA 2VL3A 4HS1A 2O8VB 4FIWA 4HU7A 2WZ9A 1BJXA 3L9VA 1AXDA 5AIVA 2QKEA 2MMOA 2IMFA 1R26A 2NBSA 2YOIA 1YKCA 1EZKA 2PVOC 5F8BA 1V58A 3EVIA 5G5FA 2F51A 4MF7A 5GZZB 2DJKA 1UVZA 5IMZA 4ACSA 1M99A 3NOFA 6GSVA 17GSA 5DQYA 4BL7A 2P5RA 1VF2A 4KE3A 3FR3A 5IQYA 3F6DA 3FR6A 3MDKA 3US3A 1WE0A 4AJ6A 1ZYQB 1SKWB 3DIEA 1K0OA 3F4TA 5J9CA 3QCPA 3HVVA 2H6YA 4XS4A 4ZL7A 3A2XA 4HZ4A 2BJXA 3F3QA 3TGZA 1FOVA 3HJOA 5HR1A 4OMVA 2GSRA 2V41A 2VM1A 3GNJA 5HFKA 4F0CA 2LS5A 4ZBAA 2L5LA 4NV2A 4ZILA 4IELA 2GQMA 3HHVA 1O8XA 3G9BA 3APSA 4OO4A 3GIXA 1OVNA 1YF0A 2OE1A 5ENUA 3TRXA 1Q98A 4KDYA 3N5OA 2PU9C 4I6XA 1OC8A 2VCZA 3FZ4A 3HVXA 4JEDA 5FT3A 5IO2A 5G31A 3D4MA 1MD4A 1TRVA 1CQHA 1GSDA 5EY6A 3TJKA 4V1Ap 3UBKA 5DJMA 3U5RE 2B1LA 5B6NA 2JZRA 1IYHA 4XHMA 4HU9A 4KH7A 2RM5A 5ECOB 2CX4A 3IOSA 2YZHA 1OYJA 1XZOA 1AQXA 4JBBA 4MP4A 3ZMLA 3GH6A 3OR5A 4ML1A 2L4CA 2M46A 3UOMA 3TOTA 2VM2A 1EEMA 2MYGA 3HKRA 1SD8A 3ZTLA 3NZNA 4RI6A 4QL7A 2DJ2A 1EEJA 3GL5A 2FA8A 1Z3EA 4ZBDA 3D6IA 3CRUA 1WOUA 4BPYA 1KNGA 8GSSA 1MTCA 2FGXA 4GF0A 5A5KA 2I3YA 1HD2A 3GTUB 5GAPD 2LQQA 1DSBA 3L9SA 4HOJA 5CO3A 2DJ3A 3CXGA 4IGJA 5A4WA 1AUCA 4K8MA 2B5EA 2CVDA 1GSUA 5IMCA 1EV9A 4KCEA 3KTBA 2HSHA 3TDGA 3QPMA 3RAZA 1YY7A 1ZMAA 2WGRA 3SBCA 4ECIA 5ELGA 4TR1B 3ZFLA 5ELAA 1SL1B 3VFIA 3L78A 2HZEA 4GRFA 4MA9A 3HY2A 1SU9A 4HI7A 3TRQA 1FO5A 3DVXA 3DXBA 4IP1A 3ISOA 1XWCA 4JR6A 1TK8B 1ZGNA 4MZWA 4BVYA 3HJPA 3Q19A 5IPGA 1YF1A 4N10A 1GUKA 1WJKA 1Z5YE 2BMXA 19GSA 4J56E 4JR4A 5CYYA 4MABA 3S9FA 1Y6EA 4IBPA 4KNDA 2H74A 4WR4A 2H0IA 2RUEA 2XBIA 4KSMA 2BTOT 3QOUA 3ZIJA 2A2SA 3O3TA 1SYXA 4KSOA 2OKAA 1GUMA 2PMTA 3FHKA 4WF4A 1U88A 1M2BA 1ERVA 5ECLB 3F4SA 4KX4A 1BEDA 1NM3A 2K6VA 4OCFA 3FR9A 5G2ZA 4O32A 3P90A 4EO3A 3WT1A 3UEMA 3IRAA 4HUAA 5IM9A 3U6VA 4G19A 1Q4JA 5GAND 3C8EA 1XW6A 3W8JA 1AW9A 4F0BA 2O87A 1TOFA 3ZMKA 3IR4A 1I9DA 3ME7A 2IFQA 1XVWA 1BX9A 13GSA 4HEA2 1YQ1A 2QC7A 3TOUA 2QSIA 1K3OA 1YZXA 2FY6A 1U87A 1SK1A 3RHBA 1B4QA 2GQLA 2CVBA 1ZL9A 1TTZA 5L71A 2FLSA 5DBQA 3IDVA 2OACA 2C0EA 3BCKA 4BVXA 3F63A 3Q18A 4TXOA 1R5AA 2JSZA 2R3XA 4MMMA 2C80A 3P8WA 1YEXA 3DKSA 5KN1A 3EC3A 3DEXA 1UN2A 2B7KA 3W8SA 2YV7A 3GX8A 4ECBA 4E8HA 5HFIA 1MDKA 1JLWA 2OADA 1K3YA 3HD5A 5CAXA 1QQ2A 3RHCA 1EOGA 2E7PA 2VAFA 2MBTA 2YP6A 3LYPA 2H1AA 2H75A 2L4QA 4YAPA 1A0FA 2JACA 1GRXA 1PL1A 4GCIA 4J57E 1GTIA 3VWVA 4MJBA 3L9UA 1PL2A 9GSSA 3D4TA 5DVBA 4OO5A 3PR8A 3IK9A 1BG5A 3FZ9A 1EP8A 4K0NA 3F0IA 4Q5FA 2GZZA 4D73A 1OC9B 4XCSA 3PH9A 4YAVA 4I5QA 4NHWA 1GSEA 4FYUA 2VD0A 3EU3A 2IIYA 3C1RA 1EWXA 2K8VA 4BA7A 2HSYA 2AJQB 4JU5A 5EL8A 5IOWA 3TKSA 1PD21 1TRSA 2VO4A 2CQ9A 3M0FA 2LRCA 1WMJA 3GYKA 4K0GA 2FWHA 4F82A 1ZCPA 1ERUA 1T00A 3UMAA 1A2JA 2FHEA 2JADA 2X99A 3EINA 3UIWA 3IE3A 1TK5B 18GSA 1M2DA 1PX7A 2GQKA 2NTOA 2VCQA 1MEKA 4PUAA 1TU8A 3FZAA 1YDKA 2P31A 4Z7XA 3LSZA 1XCCA 1ON4A 1SYRA 2OE3A 1R5PA 5C04A 1G6YA 1K0MA 3HYPA 4MJCA 1H4OA 1TK0B 2N5BA 4DSQA 4MCUA 2MMNA 1ACVA 1FVJA 3RBTA 1A2MA 5CNWA 3CSHA 3CSIA 2HT9A 3TKSC 4RQRA 3DD3A 4WBRD 2P0GA 2GVPA 1DE1A 2F8AA 1XIYA 4XIHA 3FW2A 3VI5A 2FCHA 3P2AA 3CTFA 3TKQA 4FO5A 1JZWA 3AY8A 2HNLA 1ZOFA 5G1KA 4NPBA 4JRRA 5DALB 2ZNMA 2NDOA 4MK3A 1K0AA 3GKNA 2XC2A 3GSTA 3TKRA 1Z6MA 2N5FA 2IMIA 5B8AA 1GSQA 4I2TA 1AIUA 3ZIVA 1LU4A 2R2JA 2WS2A 4ZL8A 2GLRA 5KN0A 4OFMA 5ECHB 3KIJA 4PURA 4G2EA 5D96A 2H1BA 1PKZA 2YV9A 4O92A 2YWOA 2O89A 3KMNA 2JZSA 1SJZA 2V32A 5B8BA 3PGTA 4CW9A 3D22A 5LCZA 1Y25A 2IN3A 2MZCA 3J7Yk 3NIVA 3ZREA 1MD3A 3VK9A 2I81A 4MLYA 4EXJA 4KGIA 5D9XA 1SJ6A 2FWGA 3QAWA 3WGDA 4DSSA 4GSNA 1YEPA 1NHYA 5J5NA 1X0RA 1PA3A 5IMDA 3LG6A 1HQOA 1TXXA 3UARA 4JE1A 2DJ0A 1MDJA 2JSYA 3VWWA 1T4YA 3LFLA 3MWHA 11GSA 1M2AA 3F4RA 3KP8A 1SKRB 1A8YA 2YJHA 1J0FA 1Z9HA 5H5RA 4AGSA 1K3LA 4EF0A 1PQNA 2OBKA 3GV1A 1O7UA 1SJIA 4O7HA 1W89A 3G7JA 5JCGA 4GQCA 4GSSA 4P3YB 3ZLPA 4K9ZA 2H01A 3BCIA 4FYBA 4F9ZA 1VGLA 1XWKA 2LUSA 1HNBA 2IL3A 3QD9A 3LEFA 2DJJA 2JZTA 1WPIA 4BWSA 1EGRA 1AAZA 3EWLA 2C3QA 1UA5A 2K18A 2B1KA 1THOA 4WR5A 2WDUA 1U3IA 1T3BA 2VUPA 4DEJA 5G5EA 2EIQA 1H75A 5C00A 3EURA 2LQOA 2CAQA 3TUEA 2VD1A 3ERFA 3KTLA 1JZRA 2VCVA 4MZBA 5IOXA 2YNXA 1M0UA 3MSZA 4ECCA 5G1LA 1N2AA 1T1VA 3GX0A 5ID2A 1XOBA 1KEBA 14GSA 3EU4A 3R2QA 3QAVA 4KA0A 3RPPA 1R4WA 2E2GA 5AIXA 1N8JA 5CRWA 5E59A 1B8XA 2ALBA 4RUVA 2C8UA 1AC1A 2IMKA 2JL4A 1SL0B 4ZBBA 2PPTA 3KXOA 2O85A 4IP6A 4IVFA 3RPNA 3UVHA 2H1GA 3LQ7A 1A2LA 3VURA 4EDZA 3KGKA 2I9HA 3UVTA 1GSFA 5IMFA 1B9XC 2NPBA 2DLXA 1K0BA 4NXIA 1XWAA 4LMVA 3HDCA 1XWBA 3O76A 4POLA 2WRTA 2REMA 3D0ZA 4ZB8A 4TVEA 1ML6A 2P5QA 3I43A 1T4ZA 1TDIA 2PGTA 4K6XA 1ABAA 3M1GA 2PN8A 3GKXA 4WF5A 4IJIA 1XWGA 1SD9A 2IWTA 1O73A 3I9V2 1O8WA 3C73A 1WRYA 7GSSA 3J7Yb 1G0TA 4MH2A 2AAWA 2H6ZA 4NV5A 4XS1A 3WT2A 5D8IA 1F37A 3A2WA 4JZQA 4HJMA 4X0XA 3ED3A 2K9FA 2GT5A 1V57A 4MPGA 3VPQA 1A8LA 1X5CA 3EE2A 4OWYA 4TW5A 6GSXA 3MNGA 3BJ5A 4NHZA 1JFUA 2FWFA 1GH2A 3HJMA 4YH2A 3GMFA 3H79A 1Z7PA 3CSJA 4PX1A 2NVLA 1WWJA 2R37A 5DJLA 3TB2A 1G7EA 2OA7A 1U3AA 1G7OA 3HZ8A 4L0UA 3P7XA 3BD2A 2B5XA 3GRXA 3QFBC 1SK2A 2LNTA 5DAKB 4GLTA 4Q5QA 2MMAA 5ECPB 1C72A 3Q6OA 4TN8A 3VI7A 2XPEA 1BYEA 2X64A 3HXSA 1V9WA 4EVMA 1Z7RA 2H6XA 4AJ8A 6GSWA 1DBYA 4NMUA 3LYKA 2LEGA 3G7IA 1J08A 2RM6A 4PGTA 2V6KA 1PX6A 1B48A 5D9VA 1VF4A 2MBSA 2YWIA 2EIRA 3DYRA 1OE7A 3F3RA 1PKWA 2YN1A 3E3EA 2H71A 3GH9A 2PBJA 3DWVA 3GKKA 1XW9A 1SENA 2K8SA 5KN2A 2IMEA 2L59A 3CYNA 1AQVA 1R7HA 2DBCA 3EMPA 5JCWA 2J9HA 4HQSA 2H70A 1RQMA 3SWLA 1GNEA 5HR3A 2C0GA 1X9MB 12GSA 4K1FA 2IPAA 2ZUPA 1DUGA 2WULA 3GTUA 4O5RA 5ABRA 4XS4B 1W4VA 20GSA 2LJRA 3Q74A 3QDNA 4GTUA 1FAAA 4DVCA 4L5OA 3DRNA 3APQA 4KDXA 4ZXGA 1B4PA 4TOPA 2GT6A 4CDOA 6GSSA 2FWEA 1Z6NA 2EIOA 1EOHA 5GSTA 4LL4B 2CAIA 2G2QA 2XHFA 4TR1A 3C1SA 1THXA 4OCEA 4F2IA 3L4NA 5D9WA 1X9SB 2F9SA 3GN3A 5FHIA 4AF2A 2RLIA 5DDLA 3K8NA 2HRFA 2YPMA 2I1UA 1XBSA 3GURA 2KHPA 16GSA 2L5OA 2LRTA 5ECMB 1WP0A 5DQSA 5HR2A 2R6KA 3FKFA 1A24A 2HXKA 4EL1A 1PRXA 2ZCTA 1B9YC 5ECSA 1I5GA 2DMLA 5LNKe 4YQMA 2H0HA 5H5QA 4ID0A 3DGQA 5IIZA 2FUG2 2ON7A 5DCGA 1X5DA 4EUYA 1F2EA 3ZL5A 4KW6A 2CZ2A 5JWOB 4WXTA 2FA4A 5F05A 4HQZA 3KH7A 3FRCA 5H5SA 3M9JA 3TJGA 4ZB9A 2LTKA 4KDUA 4KCAA 2AYTA 5EPFA 1F6MC 2H8LA 2H76A 1K0DA 1F3AA 1BQ7A 1XXUA 3V1WA 3GA4A 4MPFA 4RQXA 3FZ5A 1A23A 3A3TA 3CTGA 1EGOA 3CBUA 1GLPA 1FW1A 4TRXA 3KH9A 3UAPA 2FNOA 3VLNA 2R5GA 2LJAA 2DJ1A 1IYIA 5IMAA 5ECRB 3FEUA 1JLVA 4F03A 2VIMA 6GSTA 2M80A 2GGTA 10GSA 2CA8A 3IBHA 3QFAC 2HZEB 2DMMA 5F06A 4I2UA 2YZUA 2H30A 3KJYA 3M3MA 1XFLA 1HYUA 3BBYA 1F9MA 4G10A 5HQPA 1SK0A 1K0NA 4PNFA 4E8EA 2I4AA 4WBJA 2LV3A 1OAZA 4MDCA 5A4UA 4N0VA 1GTUA 1S3CA 1YJ6A 4MZCA 5ECKB 4OFNA 3LJRA 3TRPA 1LBKA 1M7TA 4V2MA 5COHA 4LA1A 4POMA 2DC5A 22GSA 3TJFA 4BWQA 2VLTA 3ZITA 1YKAA 3KCMA 1GTBA 1EV4A 3UJ1A 1GSSA 2AHEA 1HNCA 4L8EA 1OC9A 1K0CA 2XBQA 3D21A 3M9KA 4IQAA 3F9UA 1V40A 3ZVJD 3EMXA 1XW5A 4RI7A 1GSYA 5FWGA 3TCOA 5CRHA 2IFQB 4N30A 4QL9A 5F07A 3IK7A 2L6DA 1CQGA 5D9TA 3IA1A 5HFGA 2WFCA 2RUFA 3KMOA 3W6GA 4OFTA 5G30A 3HVSA 1GL8A 3APOA 3TJJA 1GNWA 1RW1A 5J41A 1GULA 2ES7A 4PXOA 3E0UA 2WB9A 2LKUA 3F6FA 4KUNA 2LRNA 3IC4A 3KEBA 2GSQA 5CREA 1T7PB 4XRDA 1AQWA 2HI7A 1NSWA 3PINA 1BAYA 2C0DA 2X8CA 1FVKA 4V2LA 1S3AA 1XOAA 4TXOB 4IKHA 2J23A 5INYA 1V2AA 4GQFA 3KZQA 4J2FA 4EE0A 4X1UA 4LMWA 1QMVA 2N5AA 5A4VA 3HZ4A 5AN1A 3IHQA 1JZDA 3KM6A 4ZB6A 5J3RA 2F8FA 2V6OA 3HA9A 1OE8A 4L5LA 3GL3A 1TRWA 2PWJA 3CMIA 2CVKA 2JU5A 2Z9SA 3FY7A 4PQ1A 2YWMA 3LWAA 1ERTA 1J9BA 2CX3A 5DALA 1TRUA 4N0ZA 3H4KA 3JCML 1LJRA 1OC3A 3GKMA 4H86A 3LXZA 1G6WA 1S3DA 4D73B 1NHOA 1XPVA 2A2RA 3GUSA 2B6MA 4PUFC 2CZ3A 5DCHA 2CT6A 4XRAA 1TI3A 3WD6A 3UBLA 1WIKA 4GXZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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