4AF2A

C61s mutant of thiol peroxidase form e. coli.
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
QGIDPFTMSQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVSAASVRKFNQLATEIDNTVVLCISADLPFAQSRFCGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAVLKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
publication title The Structure of an Orthorhombic Crystal Form of a `Forced Reduced' Thiol Peroxidase Reveals Lattice Formation Aided by the Presence of the Affinity Tag
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 52
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4af2A00
1B48A 3CSHA 3CRUA 2H66A 1YY7A 4K0NA 5A4VA 1ILOA 1O85A 1HNBA 2A4VA 4MH3A 5HFKA 3Q18A 1CQGA 3KCMA 3G9BA 4GLTA 3CSJA 1MD3A 4Q5QA 4E8HA 2ZNMA 4MCUA 2YWMA 1GSEA 1A0RP 5IQYA 4L5LA 1V58A 3BBYA 2LRCA 3HVVA 1K0MA 2IN3A 3VWUA 1AAZA 2CZ3A 2YWNA 5IPGA 1G6YA 3O6TA 3CRTA 3GV1A 3FW2A 3CTGA 3VK9A 3VI7A 5DDLA 14GSA 5GSSA 2YJ7A 5JWQB 2H8LA 1GSFA 5HR1A 4PX1A 2NBSA 2LQQA 2OADA 4F2IA 20GSA 4K7NA 2D2ZA 3W8JA 1GLPA 3FKFA 1T7PB 2LTKA 2G2QA 3D0ZA 3WT1A 4MH2A 5B7CA 5IMZA 3TJFA 1SL2B 3IE3A 1KEBA 3HZ4A 11GSA 1XW5A 3TKSA 6GSYA 1VRSD 2FWFA 4ID0A 3IHQA 4K1FA 5CP1A 4Q5RA 3GTUA 4I8BA 5GAPD 1TTZA 1SJZA 3DKSA 5ABRA 2GLRA 5A4UA 3UVHA 1SK0A 4BVYA 2H19A 3EU4A 1UVZA 2GT5A 4KUNA 4TR0A 2G0FA 5E59A 2WS2A 2IFQB 4AF2A 4N0ZA 2IWTA 2FWEA 6GSWA 2IMEA 2RIIA 1XCCA 2CX4A 5EL8A 1H4OA 3TRQA 2BJXA 1XBSA 4OO5A 9GSSA 3UARA 1X9MB 4HZ4A 1A24A 2I1UA 4TOPA 2PVOC 2LUSA 1NHYA 4HU7A 5HR2A 4TR1B 4G9HA 2HE3A 5J9CA 3LEFA 5DQYA 3RPNA 3UBLA 3Q6OA 5GAND 2WDUA 4WEYA 2E2MA 1PL1A 1B4QA 4F9ZA 3O76A 2IPAA 2NDOA 1BEDA 4EXJA 1N2AA 3GIXA 1YZXA 3M9KA 2X8GA 2WZ9A 1E2YA 4EKZA 3TRXA 2EC4A 2L6DA 2R6KA 1YF0A 2J9HA 4AJ6A 4HUAA 3L9UA 4WF4A 2ES7A 3P90A 3LORA 1YDKA 4OMVA 2DJ3A 3ERFA 2GZYA 3HVSA 1YEPA 3NIVA 2HRFA 1GTIA 1ZL9A 1Z5YE 1BG5A 4FO5A 2MBSA 2B5XA 2AJQB 3KP8A 5DVBA 3ME8A 3EYTA 4MK3A 4EO3A 1QUWA 3RHBA 1NSWA 2IL3A 3F4SA 4NV5A 2E2GA 3SWLA 5F8BA 2HYXA 1LU4A 3H4KA 4CDOA 4ZL8A 2K6VA 2VCWA 1FG4A 2GSSA 1PL2A 2I9HA 1UA5A 4HOJA 4V2NA 2B6MA 3RDWA 2FCHA 1K0BA 3JCML 1HQOA 3HXSA 4POBA 2OE0A 1OYJA 4OO4A 4XRDA 4XHMA 2I81A 5ENUA 4IQ1A 2FUG2 2RM6A 4WR4A 2AHEA 5JCUA 3PR8A 3D22A 1GSUA 3MWHA 1XPVA 2C0DA 3HCZA 4EDYA 3TJKA 2PMTA 1JZDA 2YV7A 4GQFA 4G10A 1Q98A 5DJMA 2WFCA 4QL7A 4PNFA 2VO4A 5G31A 1JZOA 1ERVA 1QMVA 5H5SA 3M8NA 1NW2A 1OE8A 1Z3EA 1GNEA 2DIYA 2GZPA 3HY2A 1XWKA 3Q74A 2O89A 3HA9A 3BOAA 4PNGA 4L5OA 3M1GA 2KUCA 4N10A 5IMAA 2GQLA 2VM1A 3EINA 1ZOFA 3C1RA 2N5FA 3WGXA 2JSYA 5AISA 2MMAA 2H73A 3ZFBA 4JR4A 1X0RA 2YJHA 5IIZA 4XCSA 1K0AA 1ON4A 5IMCA 1TP9A 1XWAA 3IBHA 3UEMA 3LXTA 4KDYA 2B1KA 3GKNA 1WIKA 1GL8A 5IM9A 1YKAA 2FNOA 2R2JA 2O8VB 2K8SA 5JWOB 3TRPA 1B9XC 1EOGA 1SENA 3ZITA 1F6MC 4TXOA 4G2EA 2FA8A 2MBTA 5G30A 1U3AA 2Z9SA 2B3SA 3EWLA 1N8JA 1K0NA 3GHAA 1PMTA 3DD3A 2H6ZA 3KTBA 1JLWA 2OJLA 2M46A 4JBBA 1XOAA 4RQRA 1M7TA 1O73A 3ERGA 4TW5A 3ED3A 3W8SA 4ML6A 1VF4A 2M72A 4BA7A 4ZL7A 1S3DA 2HZFA 1AXDA 4XS4B 3TOUA 4Z7XA 5CRDA 3F0IA 1QK8A 1SD8A 3UAPA 3I69A 3GKKA 4IELA 2QC7A 5JCWA 1FAAA 2YOIA 2F9SA 2L5LA 3QFBC 2OE1A 1SL0B 1IYHA 3ZVJD 5JWRB 4DSRA 3L78A 4ZIJA 4DVCA 4LL1B 3GSTA 3ZRDA 2QSIA 2GQKA 5IOWA 3MAKA 3IOSA 4ZILA 1XXUA 4JU5A 2LJRA 2DC5A 5ECLB 3KH7A 1M9AA 3VFIA 1GTUA 2CVBA 2F3MA 2OACA 3E0UA 1Y25A 3TCOA 19GSA 3FK8A 4WBJA 5DJLA 3TJJA 1GSDA 2AUVA 3D6IA 1YEXA 4FYBA 1ZZYA 4MZWA 4MF5A 1MDIA 1EV4A 5B8BA 3LSZA 2HZEB 2TRCP 1TKDB 3ME7A 3KJYA 4MP4A 3NOFA 3FEUA 1J9BA 3IAM2 6GSTA 2YCDA 3DIEA 3E9JB 5D93A 4KAEA 4E8EA 3GUSA 4DSSB 4MJEA 5D96A 4IGJA 6GSXA 3CBUA 3KTLA 2L5OA 5ID2A 5ECHB 4RUVA 1NM3A 3ZLPA 1FW1A 1NHOA 2LV3A 4PUFC 5G1KA 2H6YA 5D73A 1EEJA 2HSYA 4IVFA 3ZL5A 1GUHA 3A3TA 3VWXA 2GSRA 2XPDA 3IDVA 3EVIA 2C8UA 5GSTA 4N11A 4JE1A 3M9JA 5DALB 3O3TA 1SJ6A 1OC8A 4KB3A 4AJ8A 1WPIA 4XRAA 4MF7A 1G6WA 1EGRA 2H1BA 4TKYA 4GWRA 22GSA 5J41A 4YAPA 3FZ4A 2FHEA 3G7IA 4DEJA 3DVXA 3D21A 3KM6A 3ERWA 4PQIA 2TRXA 5IMDA 2P5RA 1R5AA 3ZFLA 3EMXA 3C71A 5KEJA 2C3QA 1GNWA 4TR3A 4JRRA 2YANA 3I9V2 1RW1A 1XFLA 1ERUA 3F63A 3FZAA 3H1NA 3KIJA 4WR5A 1F2EA 1GSSA 1OKDA 4HEA2 5L71A 4F82A 5DBQA 4LMWA 5ECIB 5EPFA 2YN1A 2BMXA 2IMKA 3FY7A 3EC3A 4ECIA 4GCIA 4KGIA 1FO5A 2O87A 1WE0A 3FZ9A 2NVLA 2DIZA 2JACA 3NZNA 5D9WA 4OFNA 3QOUA 4IN0A 3J7Yb 1X9SB 4K7IA 3A5WA 3ZIVA 3LJRA 3GH9A 2C80A 1H75A 2H71A 5H5QA 1O8WA 3IV4A 3IK7A 4PQHA 1HYUA 1XWBA 4FH8A 4HJ2A 5C00A 3KGKA 3DYRA 1GSYA 4PURA 1SU9A 3EURA 2LKUA 3GA4A 3ZMKA 3UVTA 1W89A 1XWGA 2VOCA 3ZTLA 4ZB9A 1XVWA 2VL2A 1A0FA 1V40A 13GSA 2CV4A 2DMLA 1EZKA 2H0GA 4I6XA 2FLSA 1JLVA 5ELGA 4V1Ap 5ECOB 2IIYA 4EF0A 1CQHA 5CRWA 3VI5A 1GTAA 1Z7RA 3QR6A 1T3BA 2EIQA 5IPHA 1JFUA 2KOKA 5EVOA 2C0FA 2V41A 1A8LA 3KMNA 4D73B 4HJMA 4TRXA 3DRNA 1GLQA 2DSAA 4EC0A 1R7HA 3E3EA 4O5RA 4F03A 3HKRA 1THOA 4EVMA 3KZQA 2H0IA 1J0FA 3KEBA 1X9WB 4POLA 1UN2A 1WWJA 1AW9A 3HD5A 4X1UA 4AGSA 5CAXA 5C04A 3GL5A 3OR5A 2MYGA 5A5KA 1ZMAA 4KCEA 3HJOA 2AAWA 5LNKe 1GTBA 1ABAA 5DAKB 3TKPA 5J5NA 1MDJA 3TKSC 1OC9B 2LNSA 2VD0A 2H72A 5ELAA 1T1VA 2LJKA 4PGTA 1KNGA 2DBCA 2PPTA 2FGXA 2CVDA 2HRNA 5AIVA 3C8EA 1W4VA 1TK8B 4L8EA 2H1AA 4KNDA 4MJCA 2M80A 2CT6A 1ZGNA 5F06A 1YQ1A 4OCEA 4MJAA 4NV2A 3DEXA 3TOTA 3P8WA 3LYKA 3RHCA 4MZCA 2C0GA 3UIWA 3GURA 3GH6A 6GSUA 3FR9A 1MTCA 3D4MA 1M2AA 1WP0A 2V6KA 4KCAA 3DVWA 2P0GA 3RPPA 2DJ1A 5CNWA 1SL1B 1G7OA 3A2VA 2FD3A 2IFQA 2VCQA 1ZYEA 3WGDA 1LBKA 1EGOA 2GQMA 2VL2C 3HZ8A 2C3NA 1U3IA 1K0OA 5IMVA 1BAYA 3QCPA 2L57A 1M9BA 2QGVA 2O85A 1DSBA 3C73A 2HXKA 2C0EA 1R4WA 2GGTA 4NHZA 4KW6A 2VM2A 1I5GA 4YH2A 5J3RA 3MDKA 4NXIA 4TR1A 1GUMA 2NTOA 3L4NA 4ECBA 5CYYA 2HSHA 1KBNA 4KDXA 5KN2A 2VCTA 2XBIA 3K8NA 5HFGA 2DJJA 3Q19A 4NHWA 4JZQA 2JZRA 2L4CA 3KMOA 16GSA 2RUFA 2VIMA 3QMXA 1TK5B 2DJ0A 4HI7A 2HLSA 4EUYA 3IA1A 7GSSA 1BQ7A 2MMNA 2VLUA 4IQAA 4GF0A 5HQPA 2X8HA 4X0XA 1T00A 3ZVJA 2JADA 2YPMA 1DE2A 1TRVA 4CW9A 1SK1A 1F3BA 5HR3A 2H76A 2RM5A 3DWVA 3M0FA 3R2QA 5D9TA 4KSMA 5KN3A 4MABA 4KA0A 1FVJA 3VLNA 2VLTA 3SBCA 3A2XA 4MPFA 1B8XA 3F6DA 3F4RA 2OBKA 2C1YA 4IHUA 4RI6A 4K2DA 3TDGA 2E0QA 3L9VA 4KX4A 5F0GA 1PN9A 1A2MA 2FY6A 1E6BA 3FYGA 4YQUA 5G5FA 3ZIJA 3APOA 5IO2A 2MMOA 2N5AA 1OC3A 2OA7A 1TRWA 4TXVA 5ECNB 1PRXA 1XIYA 1ML6A 4X43A 1ERWA 3S9FA 5ECSA 5DCHA 4F0BA 5D9XA 1JZRA 1FHEA 2PUKC 3DMLA 1ZYQB 2C4JA 3CXGA 2AB6A 2TIRA 5CRHA 4OD7A 5B6MA 2ZUPA 3F3QA 4MMMA 1YJ6A 3TKRA 3GTUB 18GSA 4CHSA 2HI7A 4GRFA 2AYTA 2IMFA 4J2FA 3QDNA 1GRXA 1A2JA 2O7KA 2VL3A 1K3LA 1KTEA 4N30A 4WXTA 1EP8A 2PGTA 3W6GA 1A23A 4I5QA 3GX0A 3D4TA 4LLRA 4P3YB 2R5GA 1ACVA 1OKTA 4OFTA 1V98A 3H79A 2L4QA 1V9WA 2KHPA 4L0WA 3MSZA 4KE3A 4ZBBA 2PN8A 3WGEA 2JZSA 1EWXA 2LJAA 5CREA 3U5RE 3IXRA 2IJYA 4BVXA 3ZZXA 5FHIA 2K9FA 2B7KA 2X8CA 3QFAC 3LQ7A 2FWGA 3KXOA 3LG6A 4HQZA 2XBQA 4N0VA 2DMMA 4KH7A 3PGTA 1XWCA 3KD0A 3APQA 1VF2A 1O7UA 5IOXA 2F51A 4ZBAA 4ZL9A 2XHFA 2MZCA 3D5JA 1GSQA 5F07A 3UOMA 1K3YA 5G2ZA 2JU5A 5KN1A 4MDCA 1SYRA 2DLXA 4TN8A 5D9VA 3LYPA 1PSQA 2LS5A 3FHKA 1TDIA 1XW9A 5INYA 1DE1A 1V2AA 1V57A 1ERTA 2ON5A 4IS0A 2WGRA 1EV9A 5GZZB 2IMDA 1T8EB 2CVKA 2GZZA 3EE2A 2H30A 3FZ5A 2V32A 3LXZA 2C3TA 2VLVA 5D8IA 4XIHA 3U6VA 4YQMA 5G1LA 1VGLA 2VAFA 1DUGA 4ULXA 5JCGA 1U88A 4EL1A 8GSSA 1WOUA 1DBYA 3BCKA 5HFIA 2DJKA 3IRAA 1QFNA 3F4TA 5KN0A 1RQMA 4AJ7A 2H1GA 4JR6A 2I4AA 3CSIA 3FR3A 2YZHA 1O8XA 2F8AA 5A4WA 4ZXGA 1MDKA 1EOHA 1UC7A 2LQOA 1TK0B 1U6TA 1TJDA 2KP1A 1AQVA 2RLIA 1SKRB 4XS4A 2GS3A 2LRNA 3J7Yk 3ZMLA 5AIXA 2F8FA 1PX7A 2K18A 2CAIA 4ZBDA 3TJGA 2KLXA 3IK9A 1PKZA 4EDZA 12GSA 4QL9A 1BJXA 2WJUA 4LL4B 4GQCA 1HNAA 4NWYA 1T4YA 2GVPA 2L6CA 1WMJA 2X99A 4KDUA 4H86A 1TU8A 5J4UA 2EIRA 2PU9C 3TKQA 4HZ2A 4RI7A 17GSA 2R3XA 4V2LA 4WBRD 2VCXA 4ZB6A 2V1MA 2FWHA 3IR4A 1A8YA 4BPYA 3WT2A 4XS1A 1TOFA 2CA8A 2H74A 2IMIA 1M2DA 4I97A 1VF3A 2HZEA 1Q4JA 1XVQA 4IKHA 1F37A 3I43A 1ZCPA 4FYCA 1T4ZA 4O92A 3HVXA 2CZ2A 2AV4A 3UJ1A 1BX9A 4IP6A 2VUPA 4BWQA 4DSSA 1G0TA 1VF1A 2PERA 3N5OA 2GSQA 6GSVA 1QXHA 3DXBA 3C7MA 4J57E 1QGVA 1MEKA 4MLYA 1TU7A 5AGYA 4RQXA 4F0CA 1FVKA 3UBKA 3HJMA 1AUCA 3GX8A 4V2MA 3WD6A 2N5BA 3BD2A 4POMA 2CQ9A 2H75A 3QAGA 3LFLA 4IP1A 1SKSB 2HFDA 2B5YA 1S3AA 5DALA 10GSA 2LEGA 1GWCA 1U87A 3ISOA 4NAXA 2WB9A 4PQ1A 2XC2A 2CX3A 1B4PA 4NMUA 4TXOB 4XTSA 1OAZA 2MMZA 3GL3A 2DJ2A 4GTUA 3UL3A 5H5RA 1TW9A 1Z6MA 3G7JA 2B1LA 5LD0A 1K0DA 4HQSA 3TJBA 2LRTA 3P7XA 1OE7A 2PVQA 4K0GA 2R37A 2OBIA 2ON7A 3HYPA 1SJIA 1AQXA 3CYNA 1BYEA 4IBPA 4V1Ag 1JHBA 2HNLA 4OWYA 3KH9A 4POKA 4EE0A 5DCGA 3L9SA 4ML1A 4G19A 3GKMA 2CAQA 2K8VA 3GN3A 1FB0A 2H01A 3TGZA 2BTOT 1C72A 1FB6A 1O6JA 3HDCA 3DGQA 1IYIA 4GSNA 2OE3A 3A2WA 3CMIA 1PKWA 1Z9HA 2EIOA 2WULA 4LA1A 4IJIA 4XS6A 2JL4A 1YF1A 4MJBA 2ALBA 4ZB8A 1SK2A 5IO0A 5G5EA 1M0UA 4OFMA 1URMA 5F05A 1TI1A 3TKSE 4WETA 4K6XA 4HS1A 1PQNA 1YKCA 1K0CA 3APSA 4MZBA 3QD9A 1EP7A 2VL9A 4IJ3A 5ECKB 4HU9A 1GH2A 1AC1A 3L0HA 2KP2A 3TB2A 3GMFA 4MA9A 1LJRA 2WRTA 4NPBA 1THXA 4TVEA 2B7JA 3GFKA 2V2GA 3F8UA 1PX6A 4K7OA 1F9MA 4I2UA 1I9DA 3C1SA 2HT9A 1GUKA 3G7YA 2PWJA 1PA3A 2PBJA 1SKWB 2A2RA 1M2BA 6GSSA 1A2LA 1GULA 1GP1A 3IC4A 1OVNA 4MF6A 3N9JA 5B8AA 2V6OA 5ID2B 1ST9A 3VWVA 1FOVA 3M3MA 4D73A 1O81A 3EU3A 3MNGA 4IW9A 3QAWA 1EEMA 2H1DA 4FYUA 3GSSA 2GT6A 4MPGA 1R5PA 5ECMB 4J56E 2L59A 4O32A 3VPTA 4KSOA 3TUEA 2GTUA 3HJPA 5CO3A 3UMAA 2I3YA 1JZWA 4WF5A 3QPMA 4O7HA 3FRCA 3BJ5A 3KP9A 2H6XA 2JZTA 5E4WA 4YQVA 3H93A 3EMPA 2QKEA 4GSSA 4K8MA 3ZYWA 5ECQB 5ECPB 4GXZA 1TRSA 5IMFA 2WCIA 5DQSA 2X64A 4ILFA 2H70A 4FIWA 1Z6NA 5DAKA 1X5CA 1HD2A 1B9YC 1HNCA 1OC9A 2RUEA 3ZREA 2P31A 1SD9A 5FT3A 3LWAA 1M99A 3IAS2 1XOBA 2YWIA 5FWGA 1S3CA 1WRYA 1AIUA 2LNTA 3P2AA 1MD4A 3WYWA 3GKXA 1K3OA 2REMA 3GYKA 3H8QA 4QQ7A 1TXXA 1G7EA 1TI3A 4Q5FA 1R26A 4PXOA 1XW6A 5HR0A 4JEDA 2YP6A 3GNJA 3FR6A 1X5EA 3F9UA 3QAVA 3PINA 5AN1A 1TRUA 3IPZA 3VPQA 4ACSA 4PUAA 4DSQA 2A2SA 2JSZA 2VCZA 5J9BA 5COHA 2P5QA 3RBTA 3F6FA 3VWWA 2GSTA 3GRXA 4L0UA 5CRGA 1Z7PA 5B6NA 4ECJA 3VURA 2YZUA 1USBA 2ZCTA 1XZOA 3RAZA 2VCVA 4OCFA 2E7PA 5ECRB 1AQWA 1Y6EA 2J23A 4BL7A 2YWOA 2VD1A 4GSTA 4I2TA 4TR4A 1WJKA 3V1WA 2B5EA 1PGTA 2NPBA 5EY6A 4LMVA 3F3RA 2H0HA 2YNXA 3I6AA 4BWSA 3AY8A 3LGCA 3PH9A 2GDRA 2R4VA 2OKAA 4K9ZA 1J08A 2FA4A 2XPEA 5LCZA 3BCIA 4Q5NA 3US3A 1SYXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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