4MA9A

Wild type salmonella alkyl hydroperoxide reductase c in its substrate-ready conformation
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title The sensitive balance between the fully folded and locally unfolded conformations of a model peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 59
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ma9A00
4HDEA 2X8GA 5HR0A 3IXRA 2MMZA 2GSQA 5KN0A 1J08A 4GCIA 1T3BA 1QXHA 3AY8A 1F2EA 1AQXA 2LRCA 2C1YA 1JLVA 1YF0A 4YH2A 5H5RA 3ME8A 3VK9A 3KXOA 1E6BA 4KX4A 3BD2A 3GH9A 2A2SA 3DWVA 3LXTA 2YN1A 4DVCA 3RHCA 3L0HA 1BEDA 3APOA 4FYCA 3QPMA 3S9FA 2D2ZA 4N11A 4RI6A 10GSA 3TKRA 4ZB8A 2LS5A 1PA3A 4H86A 1XXUA 3GL5A 1NW2A 5G2ZA 3F4TA 1FOVA 2AV4A 1G6YA 4IELA 3LJRA 2QC7A 4EVMA 4MZWA 1U87A 2BJXA 3IBHA 3ZMLA 1S3AA 2CX4A 4MF6A 1K0BA 4GWRA 3QR6A 3ZREA 1Q4JA 1BYEA 4MF7A 1ZCPA 2H0IA 2LQQA 2XHFA 2AYTA 1B4PA 3TJFA 3LGCA 2GT6A 2VLUA 4KSOA 2KUCA 5DAKB 3FY7A 3FZ9A 4OFTA 3OR5A 3ZFBA 1J9BA 4MF5A 2LQOA 4MCUA 2IMKA 3TJGA 1B9XC 5ID2A 4HJMA 1SJ6A 2DJKA 4ISDA 4GXZA 22GSA 4EF0A 2C0FA 2AJQB 4K7OA 2CQ9A 2FCHA 1VF4A 2FHEA 3P2AA 3GURA 3UJ1A 2FGXA 1PD21 2EIRA 2GLRA 1ILOA 5B8AA 3GUSA 3DEXA 3ERWA 2FWHA 2CAIA 2PMTA 3G7IA 1SKRB 5D96A 4X43A 1HNBA 2C8UA 2VM2A 5F05A 1A2JA 4XHMA 1EZKA 1FW1A 4G10A 1G0TA 1TRSA 4L8EA 4POKA 1BJXA 3GKXA 3IK7A 4POLA 1R26A 1Y25A 2LRNA 3HYPA 3MDKA 5DCHA 4MA9A 2V6KA 4P3YB 5LNKe 4LL1B 4E8HA 3TUEA 3MAKA 1MD3A 4PURA 3WT2A 5IIZA 2VCQA 2YCDA 2C3QA 1T8EB 1JZDA 4JR6A 2QGVA 2O85A 4ML1A 2OBIA 1SK1A 2DMLA 3CYNA 3IPZA 4EDZA 1OC9B 3QDNA 1A8YA 4AJ7A 4KNDA 3L9UA 2VD0A 3CSJA 2YV7A 1HQOA 1T4YA 1TK5B 1TJDA 4LA1A 3UARA 3U6VA 1AIUA 3TKQA 2XPDA 4TR3A 1RK4A 3TRPA 5IO2A 2GVPA 2LRTA 2ON7A 3P7XA 4V1Ap 5F8BA 2JACA 4I2TA 5CRWA 2IL3A 3LORA 1USBA 3F8UA 3EE2A 1JZOA 5ELAA 4TXOA 1ZYQB 3GSSA 3ZVJA 3LWAA 1TW9A 2GQLA 3HDCA 2P5QA 5DBQA 1JFUA 2F51A 3ZIJA 2N5BA 1TRVA 3BBYA 4OFMA 2B7KA 2GS3A 1Z6NA 1GSFA 1K3LA 1PKZA 5CRDA 1EP8A 1IYIA 3LG6A 4NAXA 1AC1A 1E2YA 1EP7A 5JCUA 1I5GA 1SL0B 4WBJA 1ZL9A 3CMIA 4AGSA 1W89A 2LEGA 3D5JA 4I5QA 3TKSE 2OE1A 2GSRA 1ERTA 2I81A 1SL2B 1U3IA 1DE1A 2FA4A 2FWFA 2BTOT 2VD1A 2C0DA 1AQWA 2R4VA 4EC0A 2IFQA 1GSSA 4DSRA 4NMUA 4K8MA 1A8LA 1R5PA 2K8VA 4KUNA 1T7PB 5HFKA 3VI5A 1URMA 2F3MA 2H30A 4AJ8A 4ML6A 5ECKB 4IVFA 1K0CA 1XWKA 4JZQA 3FR6A 5JCGA 1NSWA 2VL2C 3H79A 4YAPA 4KAEA 1MD4A 4I6XA 2DBCA 2G0FA 3M9JA 2DJJA 3FEUA 1QK8A 1XWBA 1ZZYA 3FKFA 5EVOA 4HU7A 2M80A 2RLIA 1KNGA 4QL7A 5KEJA 1SJZA 3BJ5A 3LFLA 2RIIA 1HNCA 3MSZA 5FT3A 2O7KA 2VUPA 3L78A 1ML6A 4WETA 1X9SB 5HR3A 2VCVA 2JL4A 3ZMKA 5CREA 2O89A 2IMEA 2E2GA 3GTUB 1TRWA 8GSSA 1TOFA 2B1LA 2R6KA 1DBYA 3LSZA 1KEBA 3KGKA 3KJYA 2GTUA 2NPBA 3CTFA 4RQRA 2HE3A 5J9CA 4EKZA 2X8CA 2YNXA 2C4JA 4ECJA 2V2GA 4K9ZA 1GSEA 3UMAA 2CT6A 1OKTA 3EU4A 4ZBAA 3WT1A 3VI7A 2V32A 4OO5A 2EIOA 1GUKA 1ON4A 1V2AA 3EC3A 4GTUA 2VCTA 1GLQA 2B5YA 2WJUA 3ZLPA 2O87A 3O3TA 4Q5NA 1T00A 1G7EA 1X9WB 2CAQA 2K8SA 1Y6EA 5EY6A 2L6CA 2L5OA 2JZRA 1ERWA 3HVSA 2L6DA 2P0GA 4V1Ag 5IQYA 2IJYA 2FWGA 2B5XA 4JU5A 3FHKA 3VWVA 1XOBA 2WB9A 1EWXA 2X8HA 4JRRA 1FO5A 4GSSA 1ACVA 1OC3A 2DIYA 3ED3A 3FZ5A 2V1MA 3IAS2 3TDGA 1F3AA 4ZIJA 2KP2A 4TR1B 3DKSA 1QFNA 3EINA 1YZXA 1M7TA 2CV4A 1THXA 1WWJA 5FWGA 2J9HA 4JR4A 1GSYA 5HFIA 2P5RA 4RUVA 3L9VA 6GSYA 2I1UA 2M72A 1YEXA 4XIHA 4I8BA 1N2AA 3VFIA 5B7CA 1T1VA 4MJAA 3KP9A 1XBSA 2CVKA 1XOAA 1A0RP 1PL2A 1NM3A 2H6YA 3CSHA 2YWIA 1GH2A 4K0NA 1QMVA 3ZFLA 4XS1A 3IRAA 1FHEA 1GP1A 4IJ3A 1XW9A 4XS4A 2PUKC 5J5NA 2IMFA 3EURA 3A5WA 4DSQA 4BWSA 6GSTA 2HI7A 3RDWA 3E0UA 2KLXA 1LU4A 3LXZA 2NDOA 5EPFA 1EOHA 1ZOFA 5DDLA 3CBUA 1ERUA 3LYKA 1O7UA 5JCWA 1YEPA 3KMNA 2C80A 4WF5A 1KTEA 4F9ZA 3QCPA 5A4WA 4KCEA 5G1LA 1K0AA 3IDVA 4EE0A 4KE3A 4ULXA 6GSWA 4J2FA 3UEMA 5J41A 2YPMA 2QKEA 1HNAA 5G1KA 2GDRA 3C71A 2RUFA 2H1GA 5HFGA 3UL3A 4G9HA 2VL2A 4TRXA 3ZRDA 4ECCA 1X9MB 4F2IA 4WR4A 1TXXA 1V58A 1SYRA 2F8AA 3F63A 2WDUA 2R5GA 2OBKA 3L9SA 1PGTA 3KMOA 2YANA 1PSQA 3GL3A 3R2QA 2LNTA 1GUHA 3GV1A 3H4KA 4D73A 2GSTA 3E9JB 2YZHA 3F3RA 4I97A 3CRTA 2WZ9A 4OD7A 5D73A 1MDKA 1A2MA 5CAXA 1BX9A 3KTBA 1M9BA 1TKDB 5ID2B 5DQYA 3GKMA 3F4SA 1K3YA 4TXVA 2HYXA 4WEYA 5AIXA 1TK8B 1G6WA 5GAPD 2I3YA 4HQZA 5B8BA 3UIWA 1NHOA 4MABA 1YKAA 5IMZA 3APQA 3W8SA 4J56E 4FYUA 2WGRA 4O92A 19GSA 5GAND 3VWXA 1RQMA 4OMVA 4K7NA 1EEMA 2OA7A 1ST9A 4F03A 3GRXA 1EOGA 3NOFA 2LSTA 5ECHB 1GL8A 1MDIA 1N8JA 5IMVA 2NBSA 4E8EA 13GSA 2V41A 2LJKA 4JBBA 4KW6A 4TKYA 5DCGA 3I6AA 2GZZA 2B1KA 2XBIA 3GKNA 3QAVA 9GSSA 1AXDA 3ISOA 2H76A 1OKDA 4XS6A 3C1RA 1UA5A 5D93A 3VPQA 2C0GA 1T4ZA 4NV2A 3DVXA 4IP1A 2YWOA 1ZMAA 2NTOA 1TK0B 1Z7RA 1PN9A 1QQ2A 2J23A 4MDCA 3I9V2 4O5RA 4HQSA 2O8VB 3A2WA 3WYWA 4BVYA 2GQKA 4QL9A 1OAZA 5LCZA 1GNEA 12GSA 2JU5A 2H6ZA 1PX6A 4WBRD 4DSSA 1VF2A 2KHPA 4OO4A 4TXOB 3W6GA 2M46A 1TU8A 4TR4A 4YQUA 5DALA 2PPTA 2X99A 4BA7A 3KH9A 2AB6A 1X5EA 3I69A 2ES7A 3CSIA 2DJ1A 4I2UA 3C73A 1K3OA 2LUSA 3K8NA 2PU9C 1MTCA 1OE8A 3M0FA 4IQ1A 2R2JA 2OJLA 2FNOA 1YKCA 2HZEA 2JZTA 4BL7A 2A2RA 5CNWA 4QQ7A 2IIYA 5EL8A 3HZ4A 1WPIA 2IFQB 2VAFA 3HJPA 4PUFC 5ENUA 4ZL9A 3UBKA 4TVEA 2MZCA 2R37A 2YWMA 3F0IA 1Z9HA 1DE2A 3HA9A 1Z3EA 5B6NA 4HUAA 5F07A 5ECNB 2CZ3A 4XTSA 5F0GA 1OVNA 3EMXA 1A0FA 3DD3A 5ECQB 1THOA 1M0UA 1OC8A 2H1DA 2HNLA 3ZYWA 2WCIA 4EDYA 4F0CA 3C1SA 3ZIVA 1TI3A 4CHSA 4LMWA 1JLWA 3TKSA 3QOUA 1BG5A 2H73A 2K6VA 2MYGA 4MZCA 1X5DA 2C3TA 2FY6A 4OWYA 7GSSA 5CRGA 3M1GA 3TJBA 2GZYA 2WFCA 1GWCA 4GLTA 3HXSA 4HEA2 2DC5A 3J7Yb 3FR3A 2B5EA 1WP0A 3TOTA 1X0RA 5AN1A 2REMA 3G9BA 4HI7A 2IPAA 2G2QA 1JZWA 4ZL7A 3D21A 4J57E 3M3MA 20GSA 2VCWA 3IOSA 1G7OA 3D22A 3VLNA 3ZVJD 3TCOA 4ZB9A 4IJIA 2P31A 4K2DA 1WJKA 1OYJA 3Q74A 2PWJA 4N30A 3KCMA 4V2LA 2FA8A 6GSXA 4BWQA 3ZITA 1VF1A 5COHA 5F06A 3H93A 2LV3A 3BCKA 4YQVA 4GSNA 14GSA 4X1UA 2L57A 3HVVA 3VURA 4V2MA 4ACSA 4Q5RA 3V1WA 2HSHA 5C00A 3QD9A 1CQHA 1HD2A 1M2AA 3UVTA 4CW9A 1YJ6A 1O85A 2JSZA 5IM9A 3D6IA 2L4CA 2H19A 1BAYA 2HLSA 4EUYA 1R4WA 3UBLA 2E7PA 3PGTA 2H75A 2LTKA 17GSA 3GA4A 3HJOA 1SD8A 4DEJA 2N5FA 3MWHA 4FYBA 1GSQA 2C3NA 1K0OA 1CQGA 2TRXA 2EC4A 2RM6A 4WXTA 4IBPA 2JADA 3SBCA 1SK0A 1XIYA 2YP6A 1SJIA 2PVQA 2H66A 1B48A 5IMCA 5AGYA 1TTZA 4HOJA 2HFDA 4NHWA 5IMDA 1A2LA 4F82A 4POBA 5HQPA 5KN3A 4F0BA 3QFAC 1H4OA 3EMPA 1V57A 5J9BA 3LEFA 3H8QA 2GT5A 2L5LA 2HRNA 3CXGA 4XS4B 4ZL8A 2H8LA 5DVBA 3G7JA 1XWCA 3HVXA 5HR2A 1KBNA 1B4QA 2CA8A 4PQHA 1ZYEA 2HZFA 2MMOA 3DXBA 5H5QA 3P90A 1SL1B 1M2BA 1V40A 2DLXA 2IN3A 1X5CA 4LL4B 4OCEA 4JE1A 3NZNA 4Q5FA 2ZCTA 1WE0A 3RHBA 1TU7A 3KZQA 3DRNA 4MP4A 1JZRA 3UVHA 3KP8A 1K0MA 3IC4A 4IQAA 5D8IA 5G30A 1XW5A 4KDYA 3VPTA 4N10A 4K6XA 1AUCA 3I43A 4NHZA 5IPHA 3APSA 1S3DA 4XRAA 1UN2A 3FW2A 5CO3A 5AISA 3UAPA 5D9TA 1O73A 1XFLA 5DJLA 1XWGA 2E2MA 1YDKA 2VO4A 3VWWA 2X64A 3RPNA 4MZBA 3RBTA 1XZOA 4TOPA 2DJ2A 2MBTA 3N5OA 5E59A 1JHBA 4D73B 3TKSC 3IAM2 5KN2A 3Q18A 3CTGA 1UVZA 2IMDA 2DSAA 2HT9A 16GSA 4ECIA 2F8FA 4Z7XA 4HU9A 1MDJA 3CRUA 1FVKA 3FYGA 5KN1A 3IV4A 2LJRA 1F6MC 3G7YA 4XCSA 1U3AA 1FB6A 1Z6MA 5ELGA 4IW9A 2AUVA 1BQ7A 3TOUA 3BOAA 5DQSA 2VM1A 1EV9A 2ZUPA 1PKWA 5J4UA 2N5AA 1AAZA 4YQMA 5L71A 4GQFA 1DUGA 1I9DA 3JCML 3HY2A 3F4RA 2QSIA 1YF1A 1GNWA 11GSA 2VL9A 1O81A 4IS0A 2DJ0A 1V9WA 2H74A 3KIJA 3PINA 3LQ7A 3DYRA 2FLSA 2YWNA 3M9KA 3FRCA 5INYA 4WF4A 1DSBA 4FH8A 2OKAA 5D9VA 1Z7PA 2B3SA 1WRYA 3F3QA 4EL1A 2RUEA 3L4NA 5D9WA 2I4AA 5H5SA 3FZAA 1AW9A 1MEKA 4NPBA 4PQIA 2AHEA 3US3A 4L0WA 2DIZA 4K0GA 1SYXA 2FWEA 4HS1A 2H01A 4IHUA 4MPFA 2MBSA 1TI1A 2VLVA 2E0QA 3BCIA 2H70A 2TRCP 3DGQA 5A4UA 2XPEA 4PQ1A 2PGTA 1M9AA 1PRXA 2HSYA 4ID0A 3IHQA 4DSSB 1GTUA 3ZTLA 5LD0A 5GSSA 3WGXA 4AJ6A 2KP1A 4MH2A 1QUWA 3UOMA 6GSUA 2XC2A 4O32A 5DALB 1GSUA 1NHYA 5DAKA 5A4VA 2OADA 4XRDA 4KDXA 1R5AA 3KTLA 1M99A 1TDIA 1XVQA 4IKHA 4EXJA 4ZB6A 4RQXA 2LKUA 1FAAA 2WULA 5ECSA 4ZILA 3TB2A 1YQ1A 2I9HA 3Q19A 4PXOA 4X0XA 3EVIA 2C0EA 2H0HA 4MH3A 1SU9A 4KGIA 4RI7A 3F6FA 1GTIA 2HZEB 4GQCA 3GSTA 1FVJA 1YY7A 3IE3A 1ABAA 1SK2A 3ZL5A 3TJJA 3GN3A 3A3TA 3WGDA 3W8JA 6GSVA 2BMXA 4KA0A 1A23A 1F37A 3O6TA 4ECBA 2CVBA 6GSSA 3GMFA 2PVOC 5B6MA 2MMNA 4O7HA 3TRXA 2OE0A 1GUMA 2K9FA 1UC7A 4GF0A 1OC9A 4WKWA 2VLTA 4ILFA 1GLPA 1FG4A 2H0GA 5GSTA 4N0VA 4KSMA 5DJMA 3A2XA 2WS2A 3IR4A 5JWOB 5ECLB 2L59A 2LJAA 4FIWA 3PH9A 2JZSA 5HR1A 1GULA 3C8EA 1TP9A 2MMAA 5IPGA 2PN8A 2DMMA 1S3CA 4L5LA 2VL3A 5ABRA 1SD9A 4KDUA 1ZGNA 3DVWA 4OFNA 5AIVA 2YJHA 3ME7A 2FD3A 5ECIB 4IN0A 2HRFA 4MJBA 4L5OA 2AAWA 3HD5A 5GZZB 2B7JA 4TN8A 5IOXA 3NIVA 1XPVA 2VCXA 3GYKA 5JWQB 5IOWA 1QGVA 1F3BA 1GTBA 2H72A 2YV9A 1O6JA 1R7HA 5ECOB 2H6XA 1IYHA 1RW1A 2FUG2 3KD0A 4POMA 4MMMA 3U5RE 1WIKA 3GH6A 1LJRA 3D0ZA 4PX1A 4HZ2A 2TIRA 3H1NA 1J0FA 2VOCA 3IA1A 1GSDA 1ERVA 3SWLA 1B8XA 4TR0A 4Q5QA 2F9SA 1M2DA 2GSSA 1SKWB 4GSTA 2H1AA 3D4TA 1V98A 3QAGA 4PNGA 1VRSD 3TRQA 3N9JA 4PGTA 4K1FA 2HXKA 4AF2A 4KB3A 4V2NA 2JSYA 5E4WA 3FZ4A 2IWTA 4TW5A 1O8WA 4BVXA 4FO5A 5A5KA 4G2EA 1WOUA 1PX7A 5FHIA 3HCZA 5ECPB 3VWUA 1SENA 4NWYA 4CDOA 2CVDA 3J7Yk 4IP6A 3KH7A 3PR8A 2VIMA 4N0ZA 2YJ7A 3GFKA 4MPGA 5JWRB 3P8WA 3KM6A 3GX8A 3RAZA 1U6TA 2ON5A 2Z9SA 2IMIA 3HKRA 2PERA 18GSA 1LBKA 5J3RA 1EGRA 3GTUA 4EO3A 3C7MA 1K0NA 2EIQA 1AQVA 2L4QA 2YOIA 1K0DA 1VF3A 4KCAA 1PMTA 3F6DA 2KOKA 2K18A 3QFBC 2A4VA 3HZ8A 4HJ2A 4PUAA 4G19A 3EU3A 2ALBA 1W4VA 4LLRA 1Z5YE 2OE3A 3GHAA 3WGEA 1WMJA 3GIXA 5D9XA 4MK3A 1U88A 4ZBDA 2XBQA 1PQNA 3ZZXA 2LNSA 3EYTA 2H1BA 2YZUA 5ECMB 4OCFA 5IO0A 2RM5A 5CP1A 3FK8A 1GRXA 2GGTA 4NXIA 1B9YC 3M8NA 3WD6A 4BPYA 3Q6OA 5CYYA 3GKKA 2CX3A 4L0UA 4HZ4A 2R3XA 3DMLA 4JEDA 3GX0A 1F9MA 4PNFA 3IK9A 3E3EA 1SKSB 2CZ2A 5G5FA 4K7IA 2DJ3A 2NVLA 3ERGA 5ECRB 1Q98A 1HYUA 2WRTA 5IMFA 5C04A 3TJKA 1XWAA 3F9UA 3ERFA 1XW6A 1A24A 3KEBA 1VGLA 3D4MA 4MJEA 4TR1A 3A2VA 5CRHA 4LMVA 1FB0A 2ZNMA 3EWLA 2PBJA 5G31A 3GNJA 2GQMA 3O76A 3RPPA 2B6MA 2H71A 3QAWA 5IMAA 1EEJA 4WR5A 5G5EA 3FR9A 1O8XA 3LYPA 1PL1A 2V6OA 3TKPA 1TRUA 4YAVA 4ZBBA 1EV4A 4NV5A 1XVWA 4IGJA 3QMXA 4KH7A 3HJMA 2GZPA 1H75A 1GTAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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