4O5RA

Crystal structure of alkylhydroperoxide reductase subunit c from e. coli
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords AhpC component, subunit of alkylhydroperoxide reductase
publication title Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o5rA00
3UEMA 2LJAA 2DJ0A 2LSTA 3P90A 4KX4A 4ZL8A 1XOBA 3G7YA 1HYUA 3HVXA 2YJHA 1OVNA 2EIQA 3WYWA 4V2NA 1KBNA 1UC7A 3WGEA 2HZEA 5ECHB 1U6TA 3IV4A 1VRSD 2WZ9A 1VF4A 2GQLA 2VCWA 1CQGA 1T8EB 3GYKA 3GUSA 3O3TA 1KEBA 3A2WA 5JWQB 4WKWA 3CTGA 5D9XA 3DWVA 5F8BA 1GRXA 1B9XC 2LS5A 1ERWA 1BX9A 1PD21 4NXIA 2Z9SA 1K0BA 1NHYA 4AF2A 4WR4A 5COHA 2VO4A 1PKWA 1ZYEA 5DQYA 3EURA 1AC1A 4IN0A 2I3YA 3LJRA 1A0RP 4TR4A 2HYXA 4EF0A 4HU9A 3CSHA 2V6OA 1EGOA 2TRXA 5G1KA 3C1SA 3MWHA 1OE8A 4MH3A 2BJXA 4MF5A 1MTCA 4MPGA 5CO3A 2CZ2A 4HZ4A 2CA8A 3CSIA 3KMNA 3KP8A 8GSSA 1C72A 3M1GA 2XPDA 3ERWA 2CQ9A 5KN0A 1ZL9A 3TRQA 3P2AA 2DLXA 3DIEA 16GSA 3S9FA 5ECLB 1SK1A 2C3NA 4LMVA 1SK2A 5ELAA 1BYEA 1SD8A 1ZMAA 17GSA 4ZB9A 4PXOA 3TKQA 2YNXA 2FHEA 4G2EA 2DJKA 2GGTA 1GULA 3HHVA 5D9WA 4TN8A 4KH7A 4KSMA 4X43A 1YDKA 2F51A 13GSA 1TJDA 2OBKA 2PVOC 4E8EA 2JACA 2AUVA 2LQQA 3IE3A 3HJPA 5G31A 3TB2A 3TKRA 3KXOA 2HXKA 4BL7A 1Z6NA 3VWUA 1K0AA 4HUAA 1JZWA 2H76A 3F4SA 5L71A 5FT3A 3RDWA 1T4YA 3EU3A 3VPQA 1TRUA 2MMNA 3HDCA 1QFNA 5G5FA 9GSSA 4OFTA 3E9JB 1SJ6A 4XRDA 1X5CA 2VAFA 3HA9A 3ME7A 1Z7RA 3GA4A 1X9MB 3DKSA 1BEDA 3DMLA 4FYBA 1TI1A 4I97A 3GMFA 4N11A 4AJ7A 2YZUA 1QGVA 3VWVA 3FYGA 1YF0A 5KN2A 2IPAA 5IO2A 2R3XA 3L9VA 2FUG2 3D0ZA 4DEJA 1GUMA 3VI5A 2H74A 5GZZB 2B7KA 2D2ZA 4ZIJA 3UOMA 1RQMA 4DSSB 3EINA 1B48A 3KP9A 1MDIA 4KUNA 2DJJA 3R2QA 4FH8A 4L5OA 2PPTA 3FRCA 1XW6A 4TXVA 4PX1A 5DCGA 1A23A 4JR4A 3CBUA 2GT5A 4PQIA 2IMEA 1FAAA 4IHUA 4Q5FA 2CVDA 1XCCA 4TR3A 1ERVA 1USBA 2R37A 4OO5A 1FO5A 2YWIA 2IFQA 2LJKA 2YV7A 3ZVJD 1YF1A 3H8QA 3KD0A 4KNDA 3D22A 1A24A 3UVHA 2N5BA 3QPMA 3FW2A 2EIOA 1UN2A 2X64A 5DAKA 4GXZA 1ZYQB 2CT6A 4JR6A 3ZITA 4O32A 4Q5NA 1SYRA 3KZQA 2V32A 2BMXA 4N10A 5KN1A 2H6ZA 4RI7A 3C73A 4I5QA 3GL5A 2OKAA 3CYNA 4MZBA 4XIHA 1OKDA 5AGYA 1GSQA 4QL7A 4EC0A 3F9UA 1RW1A 4Q5RA 1E2YA 2AHEA 2ZCTA 3GTUA 2HFDA 4LL4B 1O73A 2VCZA 1NW2A 2IFQB 2VCVA 3LFLA 2LKUA 4MPFA 4OMVA 3F63A 1EOGA 2A2RA 2GDRA 5E4WA 2WB9A 6GSTA 2GSRA 3VFIA 2IN3A 2LUSA 4GSNA 3N9JA 4IQ1A 1K0MA 3H4KA 5AISA 2YWNA 4ZL7A 2LJRA 2GS3A 3LORA 2C3TA 4IJIA 2DSAA 3F6DA 3HZ4A 4HOJA 5AIXA 4XS1A 1SENA 1TKDB 4PNGA 1MD3A 3FZ4A 3IR4A 2B5EA 1JFUA 4V1Ap 3LXTA 3HZ8A 2HRNA 2C0DA 3MNGA 1HNAA 3HVSA 2HNLA 3GRXA 3WGDA 3HKRA 3ZFLA 3GX8A 2YZHA 4F0BA 4PQHA 3TDGA 4HI7A 4FYCA 1FB0A 3UJ1A 3FZ9A 1ZOFA 3GV1A 5F05A 5IQYA 2KOKA 2BTOT 2L59A 4EE0A 2C0FA 3OR5A 4K0GA 4HQZA 2PERA 2I4AA 4IJ3A 2GZZA 1XPVA 4ML1A 1PMTA 1WE0A 3LGCA 3W8SA 3GKKA 1XW9A 2CV4A 2H19A 5DDLA 1XWBA 2RM6A 1GH2A 1FOVA 1K0CA 3TJGA 4K6XA 2CX4A 1JLVA 2P31A 2PGTA 1EZKA 3ZZXA 1PA3A 2DBCA 2R2JA 4XS6A 1A0FA 1XOAA 3GHAA 2JL4A 5ECNB 5IMCA 3TJBA 4KA0A 3KTLA 2PN8A 1WJKA 2C0GA 3PH9A 4DVCA 3HCZA 2QC7A 1GWCA 3G7JA 5J9CA 1M7TA 2K8SA 4MA9A 4OWYA 1PX7A 3I43A 5EPFA 3DXBA 2AYTA 3ZIJA 1EWXA 1ZCPA 3KJYA 2IL3A 3BBYA 5J4UA 2L5OA 4AJ6A 3UVTA 1QK8A 4CHSA 2GQMA 3HY2A 5IMFA 3FK8A 1OE7A 1IYHA 1YEXA 3KEBA 3M3MA 1URMA 4O5RA 2ON5A 4PUFC 2REMA 2PVQA 2DIYA 3H93A 2QKEA 2C80A 4GQCA 5IMVA 3IPZA 1B8XA 1JZRA 4IELA 5GAPD 1G6WA 4MDCA 3CSJA 4HS1A 5D9VA 3EMPA 1VF2A 1G7EA 3ERGA 3KM6A 5ENUA 2VLVA 4K1FA 5HR0A 4YQVA 3O76A 4GSSA 3F3RA 3TKSC 2R6KA 3APQA 3J7Yb 3QMXA 5ECQB 1EGRA 2KUCA 2YP6A 3HJOA 3CRTA 4WF4A 3TUEA 4ECIA 3TJJA 4BVYA 4BWSA 1S3DA 2WS2A 1GSYA 1Q98A 1V2AA 2YV9A 4GTUA 1YKAA 1J08A 6GSVA 2H71A 2M46A 1EV4A 1Y6EA 5D93A 5JCGA 5HR2A 1OKTA 2VL3A 3H79A 2MBTA 1PGTA 2LTKA 4ZBBA 5HFKA 2GSQA 1E6BA 3GL3A 3ME8A 3QR6A 3ZVJA 4V2MA 5IO0A 2HRFA 4F0CA 1QXHA 5KN3A 1GSSA 1VGLA 4WR5A 2GT6A 2HSYA 2YJ7A 2KP2A 2VL2C 3TRPA 2EC4A 2WFCA 1MDJA 5HR3A 1TK8B 1AXDA 6GSYA 2WULA 4EUYA 4YAVA 4N0ZA 4IS0A 4FO5A 3LEFA 2GQKA 3TJFA 3TKPA 5ID2B 1QQ2A 5IIZA 2H6XA 1BG5A 2IMIA 2OA7A 2VCXA 5DCHA 2VIMA 2FA4A 3IK9A 1ERTA 4TKYA 2KHPA 1M2BA 1HQOA 3IAM2 5IOWA 2VM1A 3E3EA 1PX6A 1SD9A 3ZREA 1NHOA 4PUAA 4YAPA 1O7UA 2PUKC 4MJCA 2CAQA 5G1LA 2C8UA 1U3AA 4J56E 1SL0B 5EVOA 4ZXGA 1EV9A 3KIJA 3HJMA 4I8BA 2ON7A 2VL9A 2QGVA 3FY7A 1MDKA 4MCUA 1THXA 1TRVA 2A2SA 1LU4A 1XVQA 3IA1A 3NIVA 5A4UA 4TXOB 1I5GA 1GP1A 2VD1A 1TDIA 1AUCA 2IMFA 3BCKA 3FHKA 1PSQA 3BJ5A 2B6MA 2WDUA 1TTZA 1SKRB 5HQPA 3HVVA 3UBLA 1U3IA 2B1LA 2VLTA 2K9FA 2AJQB 1M9BA 4J57E 1GNEA 2NTOA 1EP7A 5CRHA 1T00A 4JRRA 1RK4A 1PN9A 4DSSA 2J23A 11GSA 1MEKA 1F2EA 4KDYA 2LQOA 2WJUA 3F4RA 3C7MA 3PR8A 4G10A 1EEMA 4MK3A 4HJMA 4XTSA 1YZXA 4XRAA 3Q19A 4NPBA 3QOUA 4F82A 2C1YA 4HDEA 4NAXA 2IJYA 1WRYA 5F07A 4MMMA 14GSA 4LA1A 4TVEA 1YY7A 5DALA 2RUFA 4GF0A 3MAKA 1SJZA 3TOTA 2ALBA 4GRFA 4JZQA 1K0NA 4ID0A 4NWYA 3A2VA 1R26A 1GLQA 3LQ7A 1AQXA 1XWGA 2P5RA 3QFAC 1YJ6A 1B4QA 1GTUA 1SL2B 2JADA 1IYIA 3ZIVA 1G7OA 2DJ1A 4RQXA 4MLYA 1TK5B 5B8AA 1JZOA 2E2MA 4MP4A 2J9HA 2X8HA 3U5RE 4TR1A 2VUPA 1PKZA 1T1VA 2YPMA 3ZMKA 4L8EA 2V2GA 5DALB 3EWLA 3GSSA 1GLPA 4NV2A 2L6CA 1A2MA 3C71A 2H75A 4XS4B 2R5GA 1A2JA 1ST9A 3W6GA 2B3SA 2HLSA 3EYTA 1ON4A 4X1UA 4KDXA 3C8EA 2LRTA 4K2DA 5E59A 4ZB8A 1O8XA 3IOSA 2FWEA 1V98A 3RPNA 1TXXA 2O85A 3GURA 1EOHA 2PBJA 3GX0A 1XWAA 1GTAA 1XIYA 4TR1B 5DJMA 1M9AA 4MJAA 1X5EA 5ECRB 3KMOA 4TRXA 4E8HA 4EDYA 4EKZA 3GN3A 3QDNA 1V57A 3FKFA 3DRNA 2VCTA 1PRXA 3DEXA 3L0HA 5AIVA 5GSTA 5CNWA 1ZZYA 2V1MA 4EO3A 1SYXA 1Z9HA 3K8NA 1ILOA 5CREA 4HEA2 4Q5QA 3L9UA 2NPBA 1GSUA 3M8NA 4O92A 1H4OA 1TU8A 4WBRD 1JZDA 2OE1A 4RUVA 3APOA 1R7HA 3RHBA 3DD3A 4KW6A 2OE3A 2ZUPA 5A5KA 3KH9A 4L0WA 3FR9A 1VF3A 2PWJA 1J9BA 1R4WA 3BCIA 4AGSA 3BD2A 2B5XA 1X9SB 2FWHA 3DVXA 19GSA 3UMAA 2FA8A 2HSHA 2B7JA 4H86A 3F3QA 4BPYA 20GSA 1O6JA 1WWJA 2L6DA 5JWRB 6GSXA 4L0UA 2FLSA 2XHFA 1SJIA 3EE2A 10GSA 1SKSB 1HD2A 2M72A 6GSUA 2OACA 1BJXA 1K0OA 5D8IA 3TKSA 4L5LA 3F0IA 1GUKA 1XWCA 2VLUA 1OC8A 2C3QA 4N30A 5ECOB 2JU5A 22GSA 2OE0A 2G0FA 1XBSA 2H6YA 1WIKA 5HR1A 3Q18A 4XCSA 1DUGA 4MJEA 4Z7XA 4F2IA 3TJKA 5D96A 3VWWA 3QCPA 4ACSA 2DMMA 3QAGA 1TOFA 3VI7A 2F9SA 3HXSA 12GSA 3WGXA 3J7Yk 5LCZA 4GSTA 5DJLA 4GQFA 2JSYA 2KP1A 2OJLA 3UIWA 3MDKA 5B7CA 2HE3A 5D73A 4J2FA 2VL2A 3ZMLA 3H1NA 2L4QA 1ERUA 4K7NA 5J41A 1A8YA 1ACVA 4LMWA 3NOFA 2OADA 2H1GA 2LNSA 2E7PA 2P0GA 5FHIA 5B8BA 2YCDA 4N0VA 2L4CA 2O87A 2VCQA 4IP6A 4HJ2A 2E2GA 2O8VB 3LSZA 2YANA 3LYPA 1DE1A 3IBHA 4CW9A 2IIYA 1W4VA 1O81A 1UA5A 1EEJA 4RI6A 5GSSA 3VPTA 4WETA 2NBSA 4F03A 2H72A 2PU9C 4ZILA 3U6VA 3TOUA 4MH2A 2AV4A 4TOPA 2CAIA 3D4TA 4V2LA 1T4ZA 3I9V2 3GH9A 2N5FA 3F6FA 3IHQA 3F4TA 2EIRA 4D73B 3Q6OA 3LG6A 1XW5A 4ZB6A 3DYRA 5F0GA 2LEGA 1WMJA 1TRSA 2H30A 1HNCA 1SU9A 2WRTA 5ID2A 2B5YA 1W89A 3E0UA 3PGTA 3NZNA 1M2AA 1KTEA 4I2TA 4PNFA 3QFBC 2F3MA 2XC2A 4XHMA 1K3LA 5J3RA 5LNKe 1DE2A 18GSA 2M80A 4ULXA 4KSOA 4KCEA 2VM2A 1GL8A 4NHZA 5C04A 4POBA 5D9TA 4OO4A 1PQNA 3WT2A 4PURA 1FW1A 3VLNA 2RUEA 3GKMA 1LBKA 3KTBA 5G2ZA 4I2UA 4IBPA 2HZFA 1YQ1A 3ED3A 3L9SA 2FGXA 1G6YA 2JZRA 2JZTA 2X8CA 1K3OA 3UBKA 2H0HA 3CMIA 4K9ZA 5ECKB 1GNWA 3C1RA 4TXOA 2YN1A 1BQ7A 4G9HA 4EL1A 5GAND 5ECSA 1Z7PA 2GVPA 3P8WA 1AAZA 1UVZA 2HZEB 3TKSE 2TIRA 4YH2A 1K3YA 2WCIA 3F8UA 5B6MA 4ISDA 5A4VA 5DBQA 3DGQA 1OC9A 5CRGA 2IMKA 2DC5A 1THOA 1EP8A 2G2QA 4POKA 4K0NA 1Z5YE 5B6NA 4OFMA 1YKCA 3FZ5A 4WXTA 4KGIA 1O8WA 3EC3A 5DQSA 2NVLA 4WF5A 2WGRA 2R4VA 1FVKA 2LRNA 4MF7A 2N5AA 1F37A 1FB6A 4IVFA 3IDVA 1QMVA 4KB3A 2GSSA 1XWKA 1FVJA 3TGZA 4BA7A 4HZ2A 2LNTA 4TR0A 3CTFA 3KCMA 2X8GA 1F3AA 3VWXA 1Z3EA 2F8FA 5IM9A 4FYUA 2L5LA 1OC9B 2P5QA 3GSTA 5IMDA 3D5JA 1F3BA 1Y25A 4PGTA 3I69A 5DVBA 1ML6A 1S3CA 5EY6A 2K18A 3TCOA 3FR3A 1V9WA 1QUWA 5G5EA 4DSQA 1GTBA 1XFLA 4PQ1A 3IK7A 4V1Ag 3W8JA 2K6VA 3IXRA 3FR6A 2DMLA 3GKXA 3O6TA 2CX3A 5HFGA 4NHWA 1J0FA 1VF1A 5IOXA 5JCWA 4NV5A 4MF6A 3BOAA 4EVMA 5F06A 4KCAA 1OYJA 2K8VA 4GCIA 5FWGA 3A3TA 1X5DA 4POMA 4IQAA 3M9KA 2AAWA 1X0RA 4OCFA 1O85A 3GNJA 4WBJA 4MABA 3M0FA 4XS4A 2X99A 1GUHA 2NDOA 1M99A 2GLRA 4EDZA 1BAYA 5ABRA 4LL1B 4TW5A 4YQMA 2HI7A 2KLXA 3US3A 5G30A 1WOUA 3EU4A 1AIUA 2H73A 5CP1A 1F9MA 3KH7A 4AJ8A 1I9DA 3SWLA 5IPGA 2H66A 2GSTA 2RLIA 4JE1A 2FD3A 1TU7A 3EVIA 1U88A 5INYA 2MMAA 2V6KA 4JEDA 2XBIA 2FNOA 4GLTA 1S3AA 1DBYA 2ZNMA 4WEYA 5H5RA 2O89A 3VURA 4ZL9A 4CDOA 1AW9A 4K7IA 5ECPB 4YQUA 1Q4JA 3M9JA 3IAS2 4OFNA 3JCML 2OBIA 1AQVA 1G0TA 2QSIA 1GSFA 2H8LA 3ZL5A 2JSZA 2H1BA 2YOIA 4BVXA 5ECIB 2MYGA 1A2LA 1N2AA 1SK0A 1N8JA 5JCUA 2CZ3A 1PL1A 1LJRA 4ZBAA 3SBCA 4ECBA 3IRAA 4IKHA 2GZYA 1SKWB 1JHBA 2H0GA 2I81A 2F8AA 4KDUA 1TW9A 4OD7A 2MBSA 3ZYWA 4IGJA 4IW9A 3VK9A 2XBQA 1GSDA 5H5QA 3PINA 1TI3A 6GSSA 1OAZA 3DVWA 2I9HA 2YWOA 5DAKB 2O7KA 2PMTA 5J5NA 3L4NA 2H1AA 1M2DA 1JLWA 2VOCA 3P7XA 4X0XA 7GSSA 1FG4A 4NMUA 4ML6A 5CAXA 4K7OA 2FY6A 3HYPA 2AB6A 5ELGA 1GSEA 4EXJA 1WPIA 3KGKA 4ZBDA 4BWQA 3FZAA 4QQ7A 1HNBA 3ZLPA 3AY8A 5IMAA 2C0EA 1GTIA 2YWMA 2DIZA 3HD5A 2LRCA 2MMOA 2IMDA 2RIIA 4JU5A 1TRWA 1R5AA 4HU7A 1WP0A 1T7PB 5LD0A 1XXUA 4I6XA 3GTUB 1TP9A 4MZWA 4KAEA 3QD9A 1OC3A 2E0QA 1A8LA 2TRCP 2LV3A 5A4WA 3LYKA 1XVWA 3QAVA 5IMZA 2XPEA 5HFIA 5CYYA 2I1UA 3ZFBA 4F9ZA 5EL8A 3ERFA 4P3YB 5IPHA 3A5WA 4O7HA 1V40A 3D21A 2VD0A 5AN1A 3N5OA 1B4PA 2DJ3A 1R5PA 3GH6A 1ZGNA 5CRDA 3WD6A 3FEUA 2FWGA 2CVBA 2JZSA 2A4VA 3Q74A 4QL9A 2CVKA 1MD4A 3D6IA 3A2XA 4ECCA 1K0DA 3ZRDA 3G9BA 1AQWA 1NSWA 2FWFA 3L78A 2IWTA 4GWRA 2C4JA 1CQHA 3QAWA 3UARA 3APSA 4K8MA 5J9BA 3UAPA 2H01A 1T3BA 6GSWA 2L57A 3EMXA 4OCEA 2MZCA 1V58A 1KNGA 1B9YC 3GKNA 3CXGA 2V41A 2ES7A 1NM3A 1PL2A 4HQSA 1YEPA 4IP1A 2HT9A 1SL1B 3WT1A 3ZTLA 3RAZA 2H1DA 3UL3A 5C00A 5KEJA 2H70A 4DSRA 3ISOA 1X9WB 1ABAA 3D4MA 4LLRA 2MMZA 1FHEA 4D73A 3GFKA 1F6MC 3MSZA 3TRXA 1M0UA 1XZOA 3LXZA 5ECMB 4JBBA 1H75A 2GZPA 5CRWA 2RM5A 3IC4A 1TK0B 4G19A 2FCHA 3GIXA 5H5SA 5JWOB 4ILFA 2B1KA 2DJ2A 4POLA 3RHCA 4MZCA 4FIWA 4MJBA 4RQRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite