4RQXA

Crystal structure of human peroxiredoxin 4(thioredoxin peroxidase) with mesna
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
GTAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Cysteine Specific Targeting of the Functionally Distinct Peroxiredoxin and Glutaredoxin Proteins by the Investigational Disulfide BNP7787.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 55
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4rqxA00
4O32A 1J08A 1BAYA 2GQMA 5FWGA 5G1KA 1ERTA 4X43A 4MF5A 3GH6A 5CYYA 2KUCA 3GIXA 1HQOA 1O8WA 3BCKA 4HEA2 2M72A 1CQHA 4F9ZA 2E7PA 1UVZA 3Q19A 1ERUA 4ID0A 3LJRA 4D73A 1SL2B 3DMLA 4HI7A 3RPNA 4XRDA 2OBIA 2ES7A 2H6ZA 3FHKA 3IBHA 3VPTA 2FUG2 3KTBA 2H19A 2HRNA 2JZRA 2VIMA 3TKRA 3FKFA 2VCTA 4ZBBA 3KGKA 3GN3A 3J7Yk 3HYPA 4IVFA 3H1NA 1SENA 4ISDA 2A4VA 3NOFA 3FR6A 3N9JA 1M9AA 3EMXA 1OC9A 2KHPA 3CSIA 3D22A 3EINA 4K7NA 4HJMA 3F4TA 3JCML 3IAS2 5DAKA 1KEBA 3M3MA 2EIQA 4K7IA 2H0IA 3EVIA 4EVMA 5J3RA 4NV2A 1XBSA 5A4UA 1GNEA 4NHWA 3HJMA 5CRWA 2OE3A 3HVXA 1FW1A 1WPIA 4KUNA 2DIZA 2IMEA 3GSTA 1SJ6A 2M80A 4L5OA 2H1GA 2I9HA 4MMMA 6GSUA 3CMIA 1EV9A 2GQLA 3GMFA 2K9FA 1EOHA 3TJFA 1WOUA 2JU5A 2OJLA 2R37A 1E6BA 4K2DA 2ALBA 2C3QA 1Q4JA 4NAXA 4F0CA 1YF1A 4XS4B 3M0FA 3P7XA 17GSA 4XS6A 1LBKA 4ULXA 2G2QA 2IMDA 20GSA 1RW1A 3HVVA 1JZDA 1GRXA 3HD5A 4QL9A 4G9HA 1A2LA 1M99A 1BEDA 1B48A 1TU8A 5J4UA 1GTAA 4IW9A 1PKZA 1VF2A 2VCZA 3GKXA 4ZB6A 4MF6A 2VL9A 2GVPA 3EU4A 4DSSB 1PGTA 3RPPA 1YKCA 4RUVA 1XWKA 2O7KA 2PERA 2VAFA 1NHYA 3VLNA 3KH7A 2I3YA 2OE0A 4BVXA 1O81A 3LSZA 2LNTA 4NXIA 4KSMA 4MPFA 1F37A 2GSTA 3ME8A 5FHIA 3D4TA 4RI6A 5D96A 3TOUA 3R2QA 3QAVA 5C00A 3TCOA 2RUFA 6GSWA 2HRFA 3KTLA 3KXOA 3S9FA 3I6AA 2HE3A 2V2GA 1QGVA 2IMFA 2R6KA 2X8GA 2NDOA 4N30A 2WRTA 5D9XA 3GV1A 2HYXA 3D0ZA 2XPDA 5C04A 2BJXA 3QFBC 2IJYA 1WMJA 2YANA 3CTGA 1R5PA 1W4VA 4XCSA 4ML1A 4IHUA 1U3IA 1Z3EA 4JBBA 10GSA 1O85A 3WGDA 4XS1A 1FVJA 1XVQA 5IMFA 4POKA 3M1GA 4EDYA 2YNXA 2JACA 4HZ2A 1XVWA 1TI1A 4X0XA 2E0QA 2H01A 1J0FA 1MDKA 2LV3A 2V41A 2VCVA 3KJYA 3A2VA 3MAKA 2FA4A 1BJXA 1QXHA 5E4WA 3GRXA 4EDZA 1UN2A 4FH8A 4FYCA 2FCHA 1YQ1A 2H66A 1PMTA 3WYWA 3RAZA 3ZREA 4YQUA 3ZYWA 1XW9A 1SJIA 3ERGA 3LWAA 1GTBA 3ZVJD 1YJ6A 4TRXA 3GTUB 3UEMA 1YEPA 3GKNA 4KE3A 3G9BA 2H74A 3EE2A 4L5LA 3GX0A 4OD7A 14GSA 5G31A 4POBA 4POLA 3KD0A 5G5FA 5J9CA 2WCIA 4KH7A 4JRRA 3GNJA 1NM3A 1BYEA 4D73B 3HJOA 1M0UA 2PN8A 1GL8A 4K1FA 1OYJA 3RBTA 2C0DA 3U6VA 3FZAA 5IIZA 1PRXA 4KGIA 3D21A 3LGCA 3CXGA 2FGXA 5B6NA 2B1KA 1G0TA 1S3DA 3HJPA 3VURA 2C3NA 12GSA 3M9JA 2CVBA 3EMPA 2HNLA 3TB2A 2CT6A 2L5LA 2LS5A 4MABA 2P5QA 4Z7XA 3M8NA 2GSRA 4TKYA 3DIEA 2DJ1A 5JWQB 2LJAA 6GSTA 1XWCA 2VL2A 4HQSA 3UBLA 3UVTA 3BOAA 5DQYA 4HZ4A 1SJZA 1VF4A 5IMAA 2N5AA 2EIOA 1Z5YE 3ZIVA 5ECQB 1F2EA 1QK8A 1ZL9A 1XFLA 5J5NA 1A8YA 1EOGA 2CV4A 1GSEA 2YJ7A 3CRTA 2VLUA 1X5CA 4L0WA 3O76A 4OO4A 3F8UA 1B4PA 1Z7PA 3PR8A 2G0FA 1T00A 3KM6A 4I5QA 3IV4A 4IQ1A 5A4WA 2L57A 1OC3A 5B6MA 2XC2A 2IIYA 2IFQA 4WF4A 1Y25A 3ME7A 3HY2A 3BBYA 2CVKA 4LL1B 2MMAA 4PQHA 2OADA 2O87A 3ERWA 2OKAA 1UC7A 3TKSA 4GSTA 2LJRA 1OKTA 5D93A 3MDKA 2MMZA 5IMVA 4JZQA 2F8FA 2WGRA 2P5RA 2ON5A 3F9UA 2B5YA 4BVYA 2VO4A 3IAM2 2X8CA 2C8UA 2H6YA 3L78A 1A2JA 2RIIA 4I8BA 1Z6NA 3KZQA 1EZKA 3W8SA 3FZ4A 2DJJA 1TRUA 1URMA 3P90A 4TW5A 5CNWA 5IOXA 2ON7A 5ELGA 2A2RA 2OACA 3KEBA 5DALA 3G7IA 4ZBDA 4JR4A 3GYKA 1DE2A 1Z7RA 3UL3A 5ABRA 2K18A 2VM1A 2HZFA 3IHQA 2PUKC 1GSSA 1K0BA 4TVEA 5JCUA 2LRCA 1YKAA 3O6TA 4XTSA 1CQGA 1QUWA 4HDEA 2K8VA 2AYTA 1U6TA 2H30A 3AY8A 2KP1A 5LD0A 3VFIA 4GQFA 6GSSA 1N8JA 3IOSA 2L59A 1AQVA 3C8EA 4CDOA 5CAXA 3GSSA 3EYTA 2CZ2A 3IA1A 4N11A 3TJKA 2PWJA 4KX4A 2YJHA 4GSSA 5F05A 5EVOA 2P0GA 2MMOA 3GTUA 4N10A 2H6XA 5ECRB 1A23A 2YV7A 5ECSA 2HXKA 1I5GA 2DBCA 4TR3A 8GSSA 1H75A 2J9HA 4IGJA 4GCIA 2M46A 4G19A 4Q5NA 1K0AA 4PQIA 3N5OA 1EGOA 2DC5A 2GLRA 1V98A 1JLWA 4FO5A 2REMA 2WULA 1XPVA 1V40A 5CO3A 2BMXA 3EC3A 2WB9A 4WKWA 4OFNA 3P2AA 4ECBA 1ZYEA 3GFKA 4BWSA 1QMVA 1XWBA 3UAPA 1K3LA 1M2AA 2FWHA 3TGZA 1T4ZA 1SL1B 1F6MC 5J9BA 3TRQA 3TUEA 4BA7A 2HSYA 4PX1A 1XZOA 2PVQA 2B7JA 3UOMA 3L9UA 6GSXA 4ZIJA 1GWCA 4G2EA 2AHEA 1ON4A 1GNWA 1OAZA 2FWEA 3KP9A 3VI7A 4V1Ap 1PA3A 4I6XA 2WZ9A 1T3BA 2ZUPA 2LQQA 5IO2A 4MA9A 5CRGA 3CSHA 1PL2A 5H5RA 1GUKA 1AIUA 4HU7A 2FD3A 3C1RA 1B9XC 2VCXA 1X9MB 2H70A 1HD2A 3L9VA 1V58A 2CVDA 3TDGA 4PNGA 5J41A 1V57A 1GUHA 3KCMA 3LG6A 2LUSA 1K3YA 3DVWA 3GURA 2F3MA 4XHMA 4EC0A 3F6DA 3ZFBA 1BX9A 1KBNA 1SL0B 3GL3A 1C72A 2JZSA 2MBSA 2FHEA 3HHVA 2XBIA 2GTUA 5DJMA 1RQMA 3IK7A 4OFMA 5D9TA 4AF2A 1I9DA 5GAPD 1B9YC 2VM2A 1A24A 2IFQB 1GP1A 6GSYA 1AQWA 2VCQA 1TRVA 1VGLA 5AISA 4F03A 1TDIA 1AC1A 3DRNA 2GGTA 6GSVA 2YZHA 4JEDA 4V2LA 4L8EA 3ZLPA 3ZFLA 4K8MA 2HLSA 3GKKA 3IXRA 1V2AA 4AJ6A 3UIWA 2IN3A 3VPQA 3UARA 2HFDA 1LJRA 1MDIA 3LXZA 4ZILA 2GT5A 4MH3A 4V1Ag 4K0NA 1F3AA 4YAVA 1ZZYA 2K8SA 1JLVA 5F07A 4WEYA 2F9SA 4WBJA 3FW2A 2N5BA 3HDCA 4O7HA 5JWOB 4I2UA 2H73A 3QOUA 4RQXA 3HZ4A 5L71A 4TR1B 5G5EA 2VL2C 2DJ3A 4IS0A 5DALB 1M2BA 5ECPB 1VF1A 22GSA 3L9SA 4E8EA 1HNAA 1SYRA 5IOWA 5A5KA 3D4MA 2PPTA 1OC8A 1USBA 3HA9A 2OBKA 3L0HA 2VD1A 1XWGA 2JSYA 1YF0A 2FWGA 1SKRB 3BJ5A 4X1UA 2B1LA 3HKRA 3LYPA 4WBRD 2PGTA 2GSQA 3DVXA 5DVBA 1SD9A 2KLXA 4PUAA 5E59A 3WT1A 2JZTA 1PL1A 1MD3A 2AB6A 5KN1A 5AIXA 4Q5QA 3E9JB 4ECCA 4KDYA 3TJJA 2IWTA 3TKSC 4MJAA 1EGRA 3FYGA 2L6CA 5JCWA 1J9BA 4AJ8A 3APSA 2WS2A 4G10A 1SKSB 4IQAA 3Q6OA 2RUEA 1GSFA 3E3EA 1SK2A 2KOKA 2K6VA 2GZZA 5INYA 5ECOB 1WP0A 2V32A 3PINA 4BPYA 5LNKe 3VWXA 1T7PB 1GULA 1AAZA 1TJDA 2H76A 3ZZXA 3QR6A 5DJLA 3Q74A 2FWFA 3F3QA 4XRAA 3A5WA 2BTOT 2H0GA 2LRNA 1K3OA 2Z9SA 3ISOA 16GSA 2FNOA 1TK5B 1EV4A 3QFAC 5ECMB 5B8AA 4PNFA 5ID2A 2RM5A 1W89A 3QMXA 3QAGA 2YZUA 3D6IA 1GSYA 1F9MA 4TR0A 1EP8A 4XIHA 3DKSA 1TKDB 1JHBA 3KMNA 3IRAA 4TXOB 2WDUA 3V1WA 1EP7A 2OE1A 4GWRA 5IMZA 4KCEA 3LXTA 1M2DA 2RM6A 4DSQA 1XW5A 4ZXGA 5CP1A 3KP8A 4OMVA 4LL4B 4ML6A 5DCHA 1PKWA 3QCPA 4MLYA 3APOA 2FY6A 3O3TA 3TJBA 3A2XA 3E0UA 4ZB9A 5ECIB 2GSSA 4KSOA 3G7YA 1OE8A 2I81A 2YOIA 1S3AA 1QQ2A 1X9SB 4KNDA 5ECLB 4FYBA 3FR9A 5EL8A 1T8EB 4JR6A 4IBPA 5CREA 1U88A 1UA5A 3DD3A 1Q98A 2AV4A 3KMOA 2TRXA 4IP1A 1XW6A 2C4JA 2HSHA 5JWRB 5D73A 2VL3A 4KW6A 5JCGA 3UJ1A 1TXXA 1K0NA 3DYRA 4PXOA 3GL5A 2NTOA 3L4NA 2A2SA 3CSJA 3FRCA 4LMVA 1KNGA 4NMUA 2DLXA 1HNCA 1DSBA 2JL4A 5KN2A 2R5GA 4TR1A 2PVOC 1THXA 3KH9A 2LSTA 4I2TA 5HQPA 3C71A 3HCZA 2I4AA 2WJUA 1PN9A 2QC7A 2I1UA 1JZOA 1FHEA 4I97A 1AQXA 4JU5A 2HZEA 2H1DA 1HNBA 3M9KA 4L0UA 3ZIJA 4OWYA 3GUSA 3LEFA 3FY7A 4TXVA 4KA0A 3NZNA 4ZL7A 2C80A 4TOPA 4YH2A 4MCUA 1X5EA 3FR3A 1G7EA 2LJKA 2NBSA 4MZBA 4KCAA 2AAWA 1MD4A 3PH9A 5HFGA 1X0RA 3MSZA 4ILFA 1IYIA 4LA1A 3Q18A 4MJBA 5A4VA 3I43A 4HQZA 1Z9HA 4EF0A 1G7OA 1EEMA 2YWIA 5B8BA 2O85A 5ECHB 3MNGA 2L4QA 1NW2A 5KN3A 1GTIA 2B6MA 1YEXA 2KP2A 1TTZA 2B5XA 4DSRA 3HVSA 1GSUA 5IO0A 4EXJA 3VWUA 3U5RE 2LNSA 1S3CA 4P3YB 3A3TA 2H1BA 11GSA 4BL7A 3H93A 1O7UA 2AJQB 1G6WA 4MPGA 5DQSA 4IELA 2QKEA 1TK0B 4POMA 4KB3A 4F82A 3I9V2 3G7JA 1RK4A 4MH2A 3ZMLA 3BD2A 4PURA 3WT2A 2B3SA 2H8LA 5ENUA 4EKZA 4WR4A 5IPHA 2E2MA 4O5RA 1DE1A 1OE7A 5D9VA 1FOVA 13GSA 2TIRA 2PU9C 2H1AA 5GSTA 4WETA 4ZL9A 4V2NA 1PSQA 2GZPA 5G2ZA 2DJ2A 1FB6A 4TXOA 2LEGA 1TU7A 4QL7A 5ID2B 2DJKA 2V6KA 4J56E 3RHCA 1VRSD 1JZRA 4GSNA 4ZL8A 2C0GA 3TJGA 5EY6A 4NHZA 4ECJA 5DBQA 1T1VA 2C1YA 5IPGA 3DEXA 1R7HA 3APQA 1ZYQB 4QQ7A 2X99A 4WR5A 2DIYA 5GSSA 3GKMA 4IKHA 2VUPA 4RI7A 2XPEA 3TKPA 3HZ8A 4MZCA 4DEJA 2P31A 4ZBAA 2LRTA 3GX8A 2LTKA 7GSSA 1ZOFA 3CTFA 1FG4A 2X64A 3RHBA 4ACSA 2CA8A 4TR4A 2R4VA 4GRFA 2FLSA 2AUVA 4Q5RA 2VCWA 2CX4A 5F0GA 2QSIA 1JZWA 3CRUA 3SBCA 1ILOA 3H8QA 2HI7A 1XOAA 3J7Yb 2DSAA 1ZGNA 2YPMA 2IMKA 4F0BA 4WXTA 2L6DA 4NWYA 1DUGA 4NV5A 4EUYA 1B8XA 4MK3A 5IQYA 3OR5A 3ZMKA 4FYUA 2JADA 4K6XA 4F2IA 3K8NA 5B7CA 1K0MA 2L5OA 1OVNA 5G1LA 4MDCA 2D2ZA 5HFKA 1XIYA 3BCIA 2VD0A 1GSQA 2LQOA 3C73A 1M7TA 2GDRA 1TK8B 2B7KA 2V1MA 2H71A 5D8IA 2YN1A 4RQRA 3QAWA 1GUMA 1WE0A 4HJ2A 2B5EA 2MZCA 2PMTA 1MTCA 9GSSA 1HYUA 3LYKA 5DCGA 4Q5FA 1SD8A 2LKUA 4YAPA 1VF3A 4LMWA 1MEKA 2OA7A 5DDLA 2DMLA 4MJEA 1ERWA 2YV9A 4OFTA 1TI3A 2E2GA 2HZEB 3GHAA 4BWQA 2NVLA 1FB0A 2C0EA 1R26A 3ZVJA 2GS3A 3IDVA 5D9WA 3UMAA 2WFCA 1ML6A 3VWVA 3SWLA 3CBUA 1A2MA 1GLQA 3GA4A 3IE3A 4HUAA 2IPAA 3D5JA 1K0DA 2RLIA 4K0GA 2H72A 1PD21 4GF0A 2C0FA 2IMIA 2DJ0A 4MP4A 3WGXA 3WD6A 1ABAA 4KDXA 4OCFA 1TOFA 4OCEA 4YQMA 1B4QA 4HOJA 3ERFA 1XWAA 2XBQA 1GLPA 3DWVA 4AJ7A 2GQKA 3F6FA 5CRHA 3VK9A 4IN0A 5IMDA 3UBKA 3F63A 3W6GA 5COHA 3IC4A 1G6YA 1PX7A 4YQVA 3IPZA 1K0OA 1O8XA 4ZB8A 4GTUA 3FZ9A 3F0IA 1XCCA 3GH9A 3TKSE 3HXSA 2C3TA 1V9WA 4V2MA 5ELAA 4DVCA 1THOA 4IJ3A 1GH2A 2GZYA 1ZMAA 2R2JA 4OO5A 4PUFC 1NSWA 1BG5A 3NIVA 3DGQA 2YCDA 1SK0A 1TRWA 2N5FA 3LORA 1YZXA 1U87A 3ZRDA 2MMNA 3ZTLA 2YWOA 2VLVA 2V6OA 18GSA 2IL3A 2X8HA 2CX3A 2O8VB 3C7MA 1OC9B 5IMCA 1R4WA 1SKWB 1E2YA 1YDKA 3CYNA 1ZCPA 4WF5A 3EU3A 2L4CA 5HR0A 5DAKB 3RDWA 3QD9A 4K9ZA 5GAND 1GTUA 2MBTA 1EEJA 1O73A 4MZWA 3ZL5A 2F51A 2ZNMA 3QPMA 1SU9A 1X9WB 3TRPA 3IK9A 1YY7A 3MWHA 1EWXA 4N0VA 5G30A 1FO5A 5AIVA 2FA8A 2VLTA 3VI5A 2H75A 4XS4A 4NPBA 3ED3A 2CZ3A 3F4RA 1IYHA 2H0HA 3FZ5A 3PGTA 5AN1A 1BQ7A 4FIWA 4MF7A 1A0RP 4J57E 4KAEA 5HR3A 2GT6A 1XXUA 4HS1A 3EWLA 4KDUA 2F8AA 5EPFA 1PQNA 1A8LA 1TP9A 4TN8A 2EC4A 1GSDA 1SK1A 1A0FA 1O6JA 4DSSA 3H4KA 4CW9A 2J23A 3H79A 3US3A 4HU9A 3C1SA 5FT3A 2CAQA 1H4OA 1ERVA 1SYXA 1AW9A 2HT9A 19GSA 2DMMA 1LU4A 4GLTA 1WIKA 1ST9A 4MJCA 1MDJA 5ECKB 3IR4A 4EO3A 3KIJA 2JSZA 3FK8A 1Z6MA 5F8BA 4K7OA 4IJIA 2TRCP 3LFLA 5HFIA 3TKQA 1DBYA 5HR2A 1ACVA 4PGTA 3QDNA 4IP6A 1WJKA 3I69A 1AXDA 2VOCA 3F3RA 5HR1A 1F3BA 3UVHA 4EE0A 3VWWA 2QGVA 2MYGA 5ECNB 5H5QA 2ZCTA 4ECIA 1TW9A 4AGSA 1N2AA 1TRSA 1R5AA 1OKDA 4EL1A 3P8WA 2YWMA 3A2WA 3DXBA 1FAAA 1K0CA 2O89A 4J2FA 3TOTA 2YWNA 1M9BA 1PX6A 5KN0A 5IM9A 2R3XA 5LCZA 2NPBA 2PBJA 5GZZB 3W8JA 2CAIA 1KTEA 3EURA 1XOBA 4LLRA 4CHSA 3ZITA 4E8HA 2EIRA 3TRXA 5AGYA 2YP6A 1AUCA 1T4YA 1WRYA 5H5SA 4H86A 4JE1A 5F06A 3WGEA 3F4SA 2XHFA 2CQ9A 1U3AA 4O92A 1NHOA 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