4X0XA

The structure of ahpe from mycobacterium tuberculosis revisited
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
HMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative peroxiredoxin MT2298
publication title Revisiting sulfur H-bonds in proteins: The example of peroxiredoxin AhpE.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 54
structure length 153
sequence length 153
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x0xA00
1SD8A 4HQZA 1AXDA 1OC8A 6GSXA 3MWHA 2YWIA 4OFTA 1AQWA 4NMUA 2H1GA 4BVYA 2L4CA 4JR6A 2LJAA 5CRDA 5ECIB 3TKSC 2BJXA 16GSA 1OKDA 3M8NA 2KHPA 3SWLA 1WP0A 1EP8A 2X8CA 1ZGNA 2FWHA 4OCFA 2FWFA 2IMEA 3W8JA 3HXSA 3GH6A 1GTUA 3PR8A 4RI6A 5LCZA 5COHA 2VLUA 2MBTA 2VD1A 2KLXA 4KAEA 7GSSA 5ID2B 4F9ZA 4ML6A 1AQVA 2C0EA 2LUSA 3APOA 3KH7A 3W8SA 2V6OA 2V2GA 2C8UA 2HZFA 4K7IA 3KM6A 1NM3A 2RLIA 4XS4B 4ZL9A 5D9XA 5GSSA 1TTZA 2HLSA 5DALA 5DQSA 3M9KA 3RPPA 4ACSA 1ZYQB 3C8EA 4LL4B 2D2ZA 2R37A 3HJMA 4O5RA 2HI7A 5A4UA 5C04A 3A2WA 3DRNA 3FHKA 4PGTA 1F2EA 2QGVA 2VL3A 3LXZA 4ZBBA 2A2SA 3HZ8A 4K6XA 1J0FA 5AISA 3U5RE 1N8JA 1YDKA 4IS0A 5DDLA 5ECLB 4HU9A 3Q19A 3TB2A 1K0OA 3L9UA 2WS2A 2R4VA 1XWKA 2XPDA 2YOIA 5ECRB 5IOWA 1AW9A 2E7PA 2P5RA 2DJ3A 4D73B 1R5AA 1YJ6A 3DKSA 1HNCA 1F3AA 2YNXA 1YZXA 4RI7A 2AB6A 1SKRB 2MMNA 3E9JB 4KDYA 1B48A 3LWAA 4PXOA 1MDKA 1U3IA 2CAQA 4N0ZA 1XIYA 4IKHA 5ABRA 1SD9A 3KP9A 2WRTA 4NXIA 3KXOA 1DE2A 14GSA 4O7HA 2V41A 4JRRA 4POKA 3F3QA 2GSTA 4ILFA 4PNGA 5G1LA 1K0NA 3FZAA 3TJKA 3KGKA 3WGXA 4XRAA 3LJRA 2XHFA 2YWOA 2GZPA 2HT9A 5GZZB 1H4OA 1XOAA 1PN9A 1URMA 1DBYA 3BCIA 3EU3A 4OCEA 4YAPA 3UL3A 1XXUA 3ED3A 4KCAA 1GWCA 4BWQA 4F0CA 3F4RA 4WR4A 1XW9A 1PGTA 3IAM2 5E59A 2C0GA 1ERUA 3OR5A 1XBSA 1GTIA 1M2DA 2DMMA 5F07A 1HNAA 1TI3A 4MMMA 4J56E 1GTAA 2YJ7A 2YZHA 4OFMA 5ENUA 5IPHA 1OE7A 2YWNA 1GP1A 2GLRA 1SJIA 3LORA 2QKEA 2DIYA 3DGQA 4H86A 5ID2A 3W6GA 2LRNA 2TIRA 5J9BA 2OBKA 3APSA 5A4VA 1QFNA 5AIVA 2JL4A 2TRCP 3IBHA 4NAXA 2HYXA 3CTFA 2GSSA 3QAVA 4KSOA 1UN2A 3UVHA 4OMVA 1OYJA 2F3MA 4ID0A 4IP1A 3F4SA 4HJMA 3P90A 2LKUA 5D8IA 1JZRA 2ALBA 1TU7A 2C3NA 1TJDA 1GUMA 2M46A 3GKNA 1EWXA 3GIXA 2I1UA 2DIZA 3FZ5A 4G2EA 4HZ2A 4TW5A 3HZ4A 3KP8A 1USBA 4Q5QA 5HFKA 3TJGA 2TRXA 4L8EA 1X5DA 3HHVA 3TUEA 1T1VA 3VWWA 1OC9B 1ABAA 1F6MC 4BL7A 1TOFA 1GUHA 2B7JA 2GQLA 3IK9A 4K0GA 1Z6NA 4WETA 1BEDA 1GH2A 2KP1A 4TR3A 1PL1A 1RQMA 3F8UA 22GSA 3ERWA 5HR3A 3DXBA 1ILOA 4MPFA 1FB0A 1WOUA 4N30A 2YANA 2GGTA 1GUKA 2A4VA 5CYYA 5D9TA 2JU5A 4KW6A 4NV5A 4IJIA 4PUFC 1U88A 2GT5A 4ZB8A 5G5EA 2LEGA 5IM9A 1QUWA 4IQAA 4K7OA 4JU5A 2LJKA 5G30A 3G7JA 4ECBA 3VLNA 4K8MA 2IL3A 1TRWA 1A23A 1NHYA 2BTOT 2HNLA 3CSIA 1B9YC 2GSRA 3G7YA 5ECNB 3S9FA 5A5KA 4JR4A 4DSSA 1Z7PA 2E2GA 5F06A 4DSRA 3O3TA 3TKRA 1K3LA 2H6YA 2OJLA 2GQKA 5H5RA 1O8XA 1JHBA 3RPNA 2ZUPA 3KZQA 3FW2A 1KNGA 3R2QA 2FCHA 1EEMA 3IAS2 4IVFA 4AJ8A 2YCDA 1QK8A 5ECKB 1WE0A 1Z3EA 3IXRA 2P31A 5J4UA 2IFQA 2WGRA 5GAPD 2VCZA 1DSBA 4ECIA 5H5SA 2N5BA 1S3DA 1EP7A 5HFIA 3VWUA 1GSDA 3H8QA 2L6DA 1EV9A 3KMNA 3Q6OA 1GSEA 2H8LA 1FO5A 6GSVA 1BX9A 2ON7A 2ZNMA 4KDUA 2C80A 1XFLA 3DVXA 4KB3A 3KEBA 2RUEA 3A2XA 1JZOA 3N9JA 3ZZXA 1SL2B 1W89A 2XBQA 1JZWA 3D21A 2HRFA 4MH2A 2VCVA 3M1GA 1PSQA 3TRQA 3EINA 2OBIA 4K9ZA 2VCWA 3D22A 3UJ1A 3LGCA 3GKXA 1TK5B 1GSSA 1AUCA 3C1RA 2R2JA 5DAKA 2LTKA 3GL5A 2KUCA 3ZLPA 1CQGA 3GURA 5KEJA 2H76A 1SJZA 2B1LA 2CQ9A 2RIIA 4CHSA 3FR6A 3C71A 5CP1A 1SKWB 3IV4A 3KIJA 5CNWA 2O8VB 3ZITA 1U6TA 5D96A 5CRHA 3QOUA 5JWQB 1GSUA 4ZBDA 4MZCA 2FHEA 3I9V2 3GSSA 1GL8A 1R5PA 4MJBA 4KE3A 2H71A 4ZIJA 2VLVA 5G2ZA 3ZREA 3QR6A 4X43A 2PGTA 3C73A 3KTLA 4EO3A 3IA1A 5LD0A 2P5QA 1XWGA 2X64A 1M9BA 3CYNA 1O73A 10GSA 3VI7A 2LQQA 4FIWA 4IQ1A 3TRXA 3GMFA 4KX4A 2FA8A 4Q5FA 1BG5A 2VO4A 5A4WA 4XCSA 2DBCA 1XWBA 2YV7A 4Q5NA 4FYCA 1FAAA 2WB9A 2HSYA 3D4TA 1V98A 4Z7XA 4TXVA 2GVPA 3FK8A 2RM6A 3H4KA 2YWMA 3GHAA 3EMXA 4MABA 4TRXA 4V2MA 5GAND 2EIQA 4ZL8A 1YEPA 5IOXA 1YF0A 1S3AA 5EY6A 3E3EA 17GSA 19GSA 2XC2A 2PMTA 4X0XA 2V6KA 5INYA 3ERGA 3WGDA 4X1UA 2IWTA 3F4TA 4Q5RA 4EC0A 3IOSA 4WBJA 3CRTA 4HOJA 3VFIA 1A2LA 3FYGA 4HUAA 4MPGA 4WBRD 4BVXA 2WZ9A 5IMFA 1G7OA 3CSJA 1KEBA 3HKRA 1O8WA 1K0AA 3FZ9A 2HXKA 3L9SA 1XOBA 4F03A 4MP4A 2ON5A 5HR1A 4HQSA 5GSTA 3IDVA 1ZZYA 5DVBA 3GTUB 4GSSA 5IMCA 2G2QA 1J08A 3GX0A 2HSHA 2CAIA 2WULA 1T3BA 4TXOB 3LSZA 3CMIA 3DD3A 1E6BA 2C0DA 5IMVA 4XS6A 3PGTA 2LRCA 4PQHA 3NZNA 2LSTA 3IHQA 1FG4A 3ZRDA 3P7XA 4YQVA 4OFNA 1G0TA 5HQPA 2NVLA 2QSIA 1K0CA 2O87A 6GSUA 1GSYA 3UVTA 5AN1A 1A8YA 2AYTA 2MMOA 3GH9A 4GRFA 3UBLA 3K8NA 2HZEB 1R26A 1TRUA 1U87A 1GSQA 2VCTA 2O85A 1R4WA 3TOUA 3QMXA 4N11A 1F3BA 4CDOA 4ECJA 3TOTA 3VI5A 4YAVA 2FNOA 4HI7A 1ZOFA 3N5OA 1OC3A 3VWXA 4LLRA 5B8AA 4IW9A 3RHBA 1SENA 3QCPA 1GSFA 6GSYA 5KN3A 1ERVA 2MYGA 2H6XA 1YEXA 3M9JA 2JZRA 2I81A 4IBPA 5EPFA 3TKQA 3I43A 2LJRA 2CX4A 3EVIA 2M72A 2ZCTA 4BPYA 2M80A 1OVNA 3PH9A 2AUVA 4MZBA 1T00A 1S3CA 1HYUA 1T8EB 2HE3A 1PA3A 2R5GA 2H66A 4POBA 3SBCA 1VF1A 3UARA 3UEMA 5ELGA 2H1AA 2YN1A 1F9MA 4XIHA 3QAGA 2RUFA 2VL2C 4IELA 1SKSB 2C1YA 1TU8A 5D93A 2CT6A 4WF5A 1EGOA 3ZMKA 1O85A 3RHCA 1K0DA 2B5XA 3D5JA 1GRXA 5ECOB 2FD3A 2Z9SA 4MK3A 4XHMA 4MLYA 1ZMAA 4HDEA 5H5QA 3DVWA 4WKWA 4KGIA 3ZVJA 2H19A 5IPGA 3TKSA 5KN1A 4RQRA 2O89A 4GQCA 4GWRA 3WYWA 1XW5A 3CSHA 3A3TA 1XVWA 4EUYA 3O6TA 4KUNA 4K0NA 5DBQA 3MAKA 3HCZA 3HD5A 4L5OA 1X9WB 3KH9A 1A0RP 5ECMB 4GTUA 1YQ1A 1WRYA 1MEKA 5L71A 1AQXA 2H01A 4XS4A 3MDKA 2PUKC 3D0ZA 3Q18A 1PKWA 2OE3A 2YJHA 1IYHA 2E2MA 3ISOA 2B5YA 2PVQA 3TGZA 3TJJA 5ECHB 3EC3A 3LEFA 4GCIA 4MJAA 3TJFA 2VIMA 2H70A 3UAPA 3F6FA 5EVOA 1YKCA 3H1NA 4TR1B 1V2AA 4TXOA 5D9WA 3UIWA 3D4MA 3LXTA 3GRXA 2A2RA 1FHEA 5CREA 1CQHA 6GSWA 4RQXA 1HQOA 2CVKA 2HFDA 4OD7A 2WDUA 2VUPA 4ULXA 2OADA 3QFBC 3A2VA 1BJXA 2AHEA 3US3A 1H75A 1SYRA 2K8SA 4TKYA 3TCOA 1TI1A 1M9AA 3F6DA 1THXA 2K8VA 4E8HA 1F37A 4MDCA 1Z9HA 4D73A 2B5EA 5IMAA 2H1BA 4GSNA 1ACVA 4YQUA 2J9HA 3H93A 2IMIA 4HU7A 2FWEA 2WCIA 1BAYA 3MNGA 2VAFA 1IYIA 3L4NA 3AY8A 1MDIA 5LNKe 1WJKA 1TDIA 3FRCA 2DLXA 3C1SA 1T7PB 1V9WA 5B6NA 4BWSA 3RBTA 1GTBA 1LU4A 3UOMA 2DMLA 4F82A 2PN8A 2X99A 1PX7A 4POMA 2L5LA 1Q4JA 2H75A 5EL8A 3FR9A 1SL1B 3G9BA 1DUGA 2K6VA 3Q74A 2NBSA 5ECQB 2IJYA 4L0WA 5B7CA 2JSZA 1XW6A 1GLPA 2LNSA 4MZWA 1B4PA 2MZCA 1NW2A 3QFAC 4NHZA 2LV3A 4L0UA 4JZQA 1SK2A 2X8GA 2YPMA 2DJ1A 1VF3A 4DVCA 5J3RA 4ML1A 3DIEA 2GS3A 3BD2A 4I8BA 1M7TA 1MDJA 1PL2A 4OO5A 1C72A 2K9FA 4P3YB 1K0BA 4N0VA 2REMA 4O32A 1G6YA 4FH8A 2LS5A 1TW9A 1XCCA 2KP2A 3GL3A 3RAZA 1G7EA 1Y6EA 4ECCA 4J2FA 4GLTA 1BYEA 5DALB 2JSYA 3TKPA 2DJ0A 2X8HA 2E0QA 3ZYWA 3EURA 2GZYA 3L0HA 1VGLA 1T4YA 1LJRA 3ME8A 5JCWA 2DJKA 5FT3A 3WGEA 4GSTA 1TXXA 4WR5A 1TK0B 4PQIA 4WEYA 3A5WA 4TN8A 1WWJA 4AGSA 1B9XC 2H6ZA 1NSWA 4MF5A 4F2IA 3ZFLA 1GNWA 3WD6A 5HFGA 4HEA2 4ZBAA 1MTCA 1M2BA 2YZUA 1JFUA 1ERWA 4WXTA 2NTOA 6GSTA 4G9HA 5DJLA 1NHOA 2B6MA 4E8EA 5JCUA 5B8BA 1Q98A 1ZCPA 4FYBA 2N5FA 1X5EA 1V40A 4MF7A 1PRXA 2GQMA 1OC9A 3WT2A 3U6VA 3G7IA 2DSAA 2VL9A 1GULA 1FB6A 3HJOA 1X0RA 4N10A 3IC4A 5DCHA 3BJ5A 4XTSA 2NPBA 1EZKA 3IRAA 1FOVA 1Y25A 2GDRA 3ZTLA 4XS1A 2C3QA 4EE0A 1X5CA 4DSQA 4F0BA 1JZDA 4FO5A 2CA8A 2FY6A 2PERA 2ES7A 3F0IA 1X9MB 2MMAA 3ZVJD 4O92A 4KDXA 2NDOA 4IP6A 3NOFA 4NV2A 4IGJA 3TRPA 11GSA 2DJJA 3CRUA 2EIRA 2DJ2A 4PNFA 2KOKA 6GSSA 2LNTA 3APQA 5IO2A 3J7Yk 4LL1B 5AIXA 2K18A 1UVZA 1A2JA 3DEXA 5IIZA 4MF6A 1EEJA 5J9CA 2V32A 4AJ7A 2EIOA 2HRNA 3ME7A 3HVVA 3ERFA 2WFCA 3KTBA 3DYRA 4KSMA 1I5GA 1R7HA 2OE1A 4QL9A 2H0GA 5J41A 4ZB6A 1FVKA 3M0FA 2JZSA 2YP6A 2B1KA 3CTGA 4TVEA 1V58A 2OACA 1MD3A 3VWVA 3F63A 4FYUA 2H72A 3RDWA 3FY7A 3ZFBA 4PURA 3VPQA 3ZL5A 4ZL7A 3PINA 5JCGA 3QPMA 1T4ZA 1OAZA 1VRSD 4I5QA 1TRVA 2IN3A 20GSA 1A8LA 2O7KA 2VM2A 2J23A 1WMJA 2FUG2 2L57A 4I6XA 2OKAA 1XWAA 5J5NA 4LMWA 4ZILA 3C7MA 4POLA 4BA7A 4K1FA 1XPVA 4JE1A 4I97A 2C0FA 4IHUA 2H0HA 1FW1A 3GN3A 2VCXA 1J9BA 3P8WA 3VPTA 4MA9A 2N5AA 3IE3A 5DJMA 3F3RA 2VD0A 2PU9C 1YF1A 2IMKA 1PX6A 1SYXA 1ZYEA 4PX1A 5AGYA 2QC7A 4OWYA 3EYTA 1TKDB 5IMZA 3J7Yb 1ST9A 3QAWA 5B6MA 1QMVA 3GKMA 4AF2A 3EWLA 1PD21 5G31A 2IMDA 1AIUA 3WT1A 4HZ4A 3VURA 5F8BA 2BMXA 2L5OA 2OA7A 5DCGA 1GLQA 1EOHA 3TJBA 3E0UA 2XPEA 5CAXA 1MD4A 4K2DA 4DSSB 2CZ2A 2CVDA 2IIYA 2FWGA 1X9SB 5G1KA 3GUSA 4EXJA 4WF4A 1YY7A 2GZZA 3LFLA 3DMLA 1HNBA 5D73A 4NHWA 4V2NA 18GSA 1PMTA 3I6AA 3GX8A 2CX3A 5DQYA 2F51A 4QQ7A 5CRGA 2LQOA 1PKZA 2VOCA 4EDYA 2IFQB 5ELAA 3GFKA 2OE0A 1LBKA 3GV1A 2L4QA 3M3MA 4KCEA 4NPBA 3KMOA 2FA4A 1Z6MA 4IN0A 3TKSE 3DWVA 2AV4A 3HVSA 3KD0A 1SK0A 4QL7A 2IPAA 2I3YA 3QD9A 2MBSA 1KTEA 5JWRB 3KCMA 1FVJA 3H79A 3FZ4A 1U3AA 1QGVA 3IR4A 4G19A 4GXZA 2B7KA 8GSSA 1AC1A 2G0FA 3GTUA 3L9VA 3FKFA 1TP9A 1SL0B 1JLWA 3HDCA 4GF0A 2V1MA 1THOA 1Z5YE 4EF0A 5CRWA 1UC7A 5D9VA 3ZIJA 5DAKB 1UA5A 1K0MA 4K7NA 1TK8B 2WJUA 1KBNA 2C4JA 4LMVA 2F9SA 2P0GA 1GNEA 3V1WA 3P2AA 3ZIVA 2PBJA 1SJ6A 4KH7A 4HJ2A 2MMZA 5F05A 1VF4A 3O76A 1N2AA 3IK7A 3ZMLA 2HZEA 1HD2A 4JEDA 3IPZA 4YQMA 4PQ1A 3EU4A 2H1DA 3F9UA 4MCUA 4IJ3A 1A0FA 3BBYA 4EL1A 1B8XA 1ON4A 1AAZA 3HA9A 2C3TA 4LA1A 2GTUA 2JACA 1M0UA 3GKKA 2L6CA 1RK4A 4OO4A 5FWGA 4ZB9A 1DE1A 2DC5A 4AJ6A 4CW9A 5G5FA 1K3OA 2EC4A 1SK1A 3D6IA 5F0GA 4HS1A 4EVMA 2IMFA 1PQNA 1Z7RA 2VM1A 2LRTA 3HVXA 1O81A 1WIKA 1OKTA 1K3YA 3JCML 1G6WA 4YH2A 1O7UA 3UBKA 1OE8A 1I9DA 2VLTA 1QQ2A 2FGXA 5HR2A 1WPIA 4EDZA 3GNJA 3FEUA 3MSZA 3GA4A 3BOAA 4L5LA 2I9HA 4PUAA 4MH3A 2XBIA 4KNDA 1B4QA 4GQFA 1JLVA 3GYKA 2H73A 2VL2A 4TR0A 1ERTA 3I69A 2FLSA 4TR4A 5E4WA 4V1Ag 5ECSA 1ML6A 4DEJA 2YV9A 5ECPB 4V1Ap 2JADA 3UMAA 3QDNA 2CZ3A 4JBBA 1SU9A 3EE2A 13GSA 2RM5A 3NIVA 4ISDA 2PVOC 4NWYA 2F8FA 3L78A 3VK9A 2GT6A 2VCQA 4MJCA 2PPTA 5CO3A 3HJPA 3LG6A 1EV4A 1XZOA 1XVQA 3TDGA 4G10A 4EKZA 4XRDA 12GSA 2H74A 2R6KA 3LYPA 4ZXGA 1O6JA 1EGRA 2B3SA 2H0IA 5FHIA 2JZTA 5IQYA 3CBUA 1A24A 5KN2A 2I4AA 3BCKA 3EMPA 5IMDA 2CVBA 3LYKA 3FR3A 1XWCA 2AJQB 4I2TA 4TR1A 2H30A 3GSTA 3CXGA 1QXHA 1RW1A 1BQ7A 2GSQA 2R3XA 1ZL9A 2CV4A 1YKAA 5C00A 4J57E 4TOPA 9GSSA 2AAWA 1W4VA 4KA0A 3HYPA 3HY2A 1VF2A 1V57A 4I2UA 5KN0A 5JWOB 4MJEA 1M2AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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