4XCSA

Human peroxiredoxin-1 c83s mutant
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
179
structure length
179
Chain Sequence
GSHMSSGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-1
publication title Crystal Structure of Dimeric Human Peroxiredoxin-1 C83S Mutant
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 179
sequence length 179
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xcsA00
5IOXA 3G9BA 2RUEA 4F2IA 2OACA 4OFTA 1A2JA 1PD21 3W6GA 1GP1A 1THOA 2C80A 2YNXA 2H0IA 1X5EA 3C1SA 2HRNA 5H5QA 2AUVA 5AGYA 5G5EA 1EP8A 2K18A 5LD0A 2K8VA 5ID2B 1K0AA 1YF0A 3I9V2 1M7TA 2MMZA 5E59A 1GSYA 3GIXA 2VL2A 2K6VA 5A4WA 4YH2A 2VCQA 2H30A 4GSNA 1NSWA 2GSQA 2NVLA 3FY7A 4EC0A 3VI7A 1UVZA 5KN3A 3E3EA 1G7OA 4LL4B 12GSA 4K7IA 4KB3A 2R37A 3FEUA 4EXJA 1XVWA 3OR5A 1K0OA 2L4QA 3QMXA 1B48A 2WDUA 3KTLA 1TU8A 1QXHA 2KLXA 2WZ9A 3QD9A 2JU5A 2M72A 3TKSA 2GDRA 3HZ8A 2LRTA 3TJGA 4L0WA 5HR1A 1JHBA 1PSQA 1J0FA 1U3IA 4GWRA 3QFBC 1M2BA 3NZNA 4LMVA 2WS2A 4MH3A 1Y6EA 1K0BA 4WR4A 2VL9A 2VCWA 4MMMA 4KX4A 1QUWA 1AIUA 1JZDA 3KEBA 2DJ0A 3F6DA 2OE3A 3KM6A 3UVTA 2PERA 2O87A 4KDYA 4K1FA 1DE1A 3BOAA 3GH9A 2B1LA 1ZOFA 2QKEA 3U6VA 2HRFA 2H75A 3M1GA 1ABAA 4EF0A 4KDUA 1BG5A 2FA4A 3BCKA 3RHBA 2MMNA 2CV4A 4PNGA 1OE8A 3CMIA 1U88A 3GV1A 1G6WA 4MZWA 4K0GA 2DJ2A 2IIYA 5GSTA 2WJUA 1NW2A 4PQHA 3TRXA 3CSJA 2YZUA 2OA7A 3RAZA 1K3OA 2TIRA 5IM9A 4YQMA 2CVKA 3FHKA 2MBSA 4PQIA 5ID2A 4QL9A 3UL3A 2PN8A 4FIWA 1X9WB 3KGKA 1GL8A 1SD8A 3CSIA 4I97A 2LQQA 2DJ1A 3CRUA 2RIIA 3TOUA 2YP6A 4G9HA 2V6OA 1HNCA 3LG6A 1YEXA 4L8EA 3ERFA 4MJEA 3ZLPA 2FWGA 5C04A 1EOGA 1AC1A 3QAWA 2R6KA 3D22A 4XS1A 2GQKA 3GKKA 2V41A 2WCIA 3IC4A 4IW9A 1O73A 3ZVJA 9GSSA 1XW9A 4FH8A 4ZL7A 2IWTA 3EYTA 5IIZA 1G6YA 1XWKA 4E8HA 3EMXA 5D9TA 2FY6A 4BVXA 3IRAA 1GRXA 2HSYA 5DAKB 3GRXA 1YJ6A 2X99A 4MK3A 1FB0A 5IO2A 2HFDA 3VPTA 3EU4A 5GAND 5D73A 3TDGA 2JZRA 3DIEA 3LSZA 4MJAA 4Q5RA 5ECMB 1SENA 3TJBA 2M46A 4ECCA 3F3RA 3O3TA 3TCOA 3L9VA 1NM3A 1LBKA 3WT1A 2DJ3A 5CO3A 1EP7A 1K0NA 1ILOA 5IQYA 3GX0A 4CHSA 5F0GA 1ERVA 3E9JB 1E6BA 1WE0A 4GSTA 2E2MA 4O92A 2F51A 3F4TA 5GSSA 5DQYA 2L57A 2HI7A 2VM1A 3HVSA 5CP1A 1V98A 1GNEA 6GSUA 2HZEB 4JRRA 3PGTA 5J5NA 3A5WA 2CVBA 3G7YA 4GLTA 4Q5QA 4MLYA 3JCML 2LKUA 1SYRA 3AY8A 1H75A 4IKHA 3ERGA 4POLA 1FB6A 1OE7A 1MD4A 3FRCA 3KP8A 4X1UA 3GNJA 1GLPA 2X8HA 1PGTA 5IMAA 3PH9A 1GLQA 4JZQA 3KMNA 1YDKA 2GSSA 4DSSA 2OADA 1H4OA 3UBKA 2RUFA 6GSTA 2BTOT 2V6KA 3D4TA 5CRHA 2GZPA 1WRYA 3KH7A 5D96A 3NOFA 1U6TA 4HZ4A 3SWLA 3J7Yb 1K0MA 2H72A 5A4UA 3CTGA 1ERUA 3FZAA 2R4VA 2IMEA 1HNAA 1Z7RA 2H74A 4NV2A 5J3RA 3TKSE 1XIYA 1SJZA 22GSA 2LJAA 2FA8A 2LJRA 5DAKA 3PINA 4QQ7A 3GA4A 3MNGA 16GSA 4F03A 2QSIA 3VWXA 2HSHA 2AHEA 3WGEA 4ZL9A 2ES7A 2DIZA 3EE2A 1G0TA 5GZZB 1V40A 1F2EA 4ISDA 2X64A 2C3QA 2MMAA 3ZFLA 5CYYA 1XWAA 2VCXA 5ELGA 4FYCA 3TKPA 3W8JA 2H76A 1KEBA 2WB9A 4TOPA 4I8BA 4XTSA 4ZBBA 2IL3A 3FKFA 1FW1A 2GGTA 1UC7A 2OE0A 1M2DA 2KHPA 3ZMKA 1A2LA 1MTCA 4ID0A 5D9VA 5ECHB 1TXXA 5CAXA 1BQ7A 4MA9A 2CZ2A 5IMFA 3LJRA 2FLSA 4WEYA 5DJLA 4Q5FA 4GF0A 3QCPA 3KJYA 1IYHA 3GUSA 3IHQA 4XS4B 4KW6A 1HD2A 3L0HA 5B6NA 3HJPA 2B5EA 2A2RA 2PVQA 6GSSA 4N0ZA 2L5LA 5D93A 3KIJA 3DVXA 3EWLA 3DD3A 5D8IA 4E8EA 2B3SA 1B8XA 1ZZYA 3HVVA 4TR0A 1XWGA 1V2AA 2GZYA 2A4VA 1GH2A 4RQXA 1SKRB 14GSA 1OC9A 4HQSA 3WGXA 1MDJA 2OE1A 5G2ZA 2R5GA 2O85A 3HXSA 3FR9A 4OO5A 1VRSD 3H8QA 2FGXA 4V1Ap 2PUKC 3D5JA 3VLNA 3VFIA 5KEJA 4H86A 4K7OA 3F4SA 1AW9A 2NPBA 5FT3A 1SL0B 2O8VB 3F0IA 3ZIVA 1A2MA 1SK0A 1LJRA 2PVOC 3LORA 2YOIA 1M2AA 1PL2A 2IN3A 4AF2A 5F8BA 4MP4A 1W4VA 5IO0A 2VUPA 2R2JA 4MABA 1KNGA 2TRXA 4O7HA 3UBLA 2H1GA 2WFCA 4FYUA 1X9MB 5COHA 1EEMA 4WKWA 4CDOA 1FO5A 4GCIA 3GURA 2OJLA 2KOKA 2N5AA 1S3CA 5D9WA 2YWIA 2XC2A 2VD1A 2HYXA 4PNFA 4ZIJA 4HU9A 3ME7A 1K3YA 1B9XC 2DBCA 4OWYA 2C4JA 4JBBA 3FR6A 1QQ2A 5DCHA 3O76A 4DSRA 3EC3A 2P0GA 3LQ7A 4XHMA 4OCEA 1XPVA 3ZYWA 2I3YA 5HFKA 3N5OA 2N5BA 4L5OA 4F82A 2LRNA 1TK5B 1V9WA 1A24A 3LYPA 3VWUA 2H0GA 2QC7A 5B8AA 5J9CA 1N8JA 2FHEA 2H01A 3HDCA 3UOMA 1NHYA 3EURA 2HE3A 3IK9A 3LWAA 4TKYA 4XS4A 3QAVA 1AQWA 4GXZA 3A2XA 3U5RE 2JADA 2GT5A 1NHOA 2F8FA 1GTUA 2CZ3A 3HKRA 5C00A 3WYWA 3UARA 4MH2A 3D0ZA 2ON5A 5IMDA 3H93A 4ECBA 2VLVA 2PPTA 4POBA 2AV4A 1GTBA 2EIQA 1YKAA 2VCTA 2CAIA 1YKCA 2VM2A 3ZIJA 1TRWA 2PWJA 1B9YC 1PX6A 3K8NA 3TOTA 1F3AA 3ISOA 1R5PA 1JZRA 3D21A 1GSEA 18GSA 4NV5A 3KP9A 5HFIA 1SKSB 4WBJA 5GAPD 3VPQA 1GUKA 1WWJA 1DSBA 5B6MA 4G2EA 4RI6A 2O89A 1XFLA 1XWBA 4FYBA 4YQUA 4JR6A 1DUGA 1FAAA 2LQOA 3VWWA 1V57A 2PMTA 3APQA 1Z6NA 5L71A 1THXA 4N10A 2I4AA 1XVQA 1OYJA 4KCAA 5G31A 2XBQA 4K2DA 2AYTA 2B1KA 2VLUA 3HJMA 2C0DA 3RHCA 1LU4A 2CT6A 3C1RA 3QOUA 2YWNA 1O81A 2VAFA 5JCWA 1RW1A 4OFNA 1FG4A 3UEMA 1OC3A 1R26A 1F37A 2KP2A 4FO5A 4LA1A 3Q74A 1F9MA 1XCCA 1K0CA 2H6XA 3EMPA 2F9SA 4K0NA 3L9SA 5HR2A 2CQ9A 2H71A 1PKZA 4NAXA 4K9ZA 1KBNA 2C8UA 3ZMLA 3GN3A 3G7JA 4K7NA 3DWVA 1A8YA 6GSVA 2YJHA 3G7IA 1RK4A 1U3AA 3TRPA 1C72A 4IQAA 2EIRA 3M3MA 2YJ7A 2P5RA 1BX9A 5G5FA 3A2VA 1YZXA 1E2YA 3M9KA 1XOAA 1A0RP 3SBCA 2CAQA 5CRDA 4EDYA 5B8BA 4NMUA 1X9SB 2FWEA 2J9HA 4GTUA 1X5CA 4ZILA 3BJ5A 2JSZA 4MF6A 1MDIA 5JWQB 3TKQA 3C7MA 3KCMA 1X5DA 2NTOA 4N11A 2LTKA 1EWXA 1I5GA 1GWCA 5DALB 1TRUA 3HVXA 5B7CA 1ON4A 2VL2C 5KN1A 2VL3A 1GSDA 3D4MA 4AJ7A 2MMOA 5HFGA 4OMVA 2H1AA 2A2SA 2YWOA 1T1VA 5EY6A 4PQ1A 4GRFA 3ZZXA 3RPPA 2E2GA 2KUCA 1BEDA 4GQCA 3KMOA 4IBPA 4V2NA 2G0FA 2GQMA 1XXUA 1Q98A 3DRNA 1AAZA 3IPZA 2M80A 2C3NA 2FD3A 4V2LA 2WGRA 1CQGA 3FZ5A 5ECPB 3WT2A 3CSHA 1TP9A 4BVYA 3CRTA 4HUAA 3WD6A 3TKSC 2REMA 2XBIA 4ML6A 2H1BA 1WJKA 2ZCTA 3ZRDA 5INYA 1EZKA 1F3BA 3GX8A 2EC4A 1HQOA 3F4RA 4K6XA 5ECLB 3ERWA 4ZBAA 3GYKA 1DBYA 4AJ6A 4PGTA 1M99A 2OBIA 1YEPA 4HU7A 5ECRB 1ERTA 4Q5NA 3KD0A 1RQMA 3FZ4A 1I9DA 3L78A 4NHWA 2B7KA 5IOWA 1SYXA 2H19A 1M0UA 4WETA 5ECKB 1VF1A 3GL3A 5CRWA 2YV7A 1B4QA 3UJ1A 2HXKA 1S3AA 2E7PA 5F06A 4EKZA 1AXDA 2JL4A 3VI5A 1URMA 2C0EA 3TB2A 1GNWA 2GS3A 4EVMA 4TW5A 4GQFA 1YY7A 1YF1A 3GKNA 2XPDA 2AJQB 1WMJA 2DC5A 1VF4A 1JZOA 2RM5A 3F3QA 3VK9A 1GTIA 1M9AA 5A5KA 1GULA 3M0FA 5AISA 4DEJA 4IP6A 10GSA 1O85A 2I1UA 2IMFA 1PN9A 4TXVA 3ZL5A 2L59A 5DALA 1K0DA 3BCIA 5DVBA 3S9FA 4HQZA 4OO4A 4PUAA 5JWRB 2LNTA 2CA8A 4J56E 2CVDA 5F07A 3TJJA 3GHAA 4HJMA 1TTZA 3ZVJD 2P5QA 1HYUA 2HZEA 2H0HA 4PURA 1MEKA 4O32A 3O6TA 3IOSA 2VD0A 4I6XA 2GTUA 2LSTA 1M9BA 4KSOA 3ED3A 1T4YA 3P90A 4L5LA 3HCZA 3KXOA 4BWSA 4EDZA 3EU3A 2MBTA 3ZITA 4F0BA 4PXOA 1PKWA 5DCGA 3TGZA 3I69A 1BYEA 5ECNB 5FHIA 2L6DA 3VURA 3I6AA 3IK7A 1BJXA 2YANA 1ZYEA 1QGVA 5D9XA 4HS1A 3P7XA 4KSMA 1JLVA 3TJFA 4IVFA 5J4UA 4V1Ag 3EINA 4TR1B 4X0XA 1SKWB 4J2FA 3TUEA 1FHEA 4PX1A 2O7KA 4XRAA 4N0VA 2QGVA 4G10A 1TI1A 3HY2A 2V1MA 2LJKA 2C0GA 5AIVA 5LNKe 2AB6A 2B6MA 2CX4A 2DMMA 4MPFA 1OC8A 2V32A 4RQRA 1Z3EA 1TRVA 1ZGNA 5DBQA 3CBUA 5DDLA 5JWOB 2L6CA 5IMZA 4RI7A 2YV9A 3NIVA 5ELAA 1Z7PA 2VO4A 17GSA 1PQNA 2CX3A 3LEFA 2LRCA 2E0QA 4WF5A 4KDXA 3FR3A 3EVIA 3J7Yk 4HDEA 1R4WA 3A2WA 11GSA 3CXGA 3QFAC 4LMWA 3LGCA 1EOHA 1IYIA 1SL1B 1AUCA 3F6FA 4IJIA 3VWVA 4EO3A 3QPMA 1TOFA 1XBSA 4ZB8A 3Q18A 1Z9HA 5H5RA 5IPHA 1A23A 2MZCA 3IV4A 4JR4A 1YQ1A 1PA3A 3GKMA 2XHFA 3RBTA 3MSZA 1ST9A 3DMLA 1VF2A 1XOBA 3FW2A 1OKDA 1ZYQB 3IXRA 1SL2B 1HNBA 2V2GA 1W89A 1TU7A 1ZMAA 4J57E 4OFMA 2YWMA 3GMFA 1DE2A 1SK2A 1MD3A 3M9JA 1UN2A 5A4VA 2H70A 2B5YA 2IPAA 1AQVA 2GT6A 4WR5A 2J23A 2B7JA 3HD5A 6GSWA 5CRGA 1PMTA 1O6JA 3MDKA 3MWHA 2LS5A 4EL1A 2ALBA 4HEA2 4I2TA 1WOUA 3US3A 2ZNMA 5H5SA 2OKAA 5G30A 2OBKA 3APSA 2IFQB 1XW5A 5F05A 3C73A 2GSTA 2K8SA 8GSSA 1JFUA 1A0FA 4TR1A 4JU5A 3GFKA 3HYPA 3ZTLA 2LNSA 1TDIA 1SU9A 2GVPA 19GSA 1J9BA 3N9JA 1T3BA 4LL1B 4JEDA 4KGIA 2RM6A 1G7EA 3GH6A 2HZFA 4G19A 4IGJA 1TKDB 1QMVA 3M8NA 20GSA 2GZZA 4BA7A 2HT9A 3DVWA 2DIYA 1QK8A 2VOCA 4K8MA 4NPBA 2HNLA 5J9BA 4IELA 3I43A 3LYKA 3LXZA 3BBYA 1ML6A 1GSSA 3TRQA 2FWHA 2DJJA 4ZBDA 5FWGA 4IN0A 2Z9SA 2DSAA 1V58A 5IPGA 3IBHA 1SJIA 4I5QA 3RDWA 4YQVA 1UA5A 2PGTA 4ZB6A 5HQPA 1ZL9A 4TRXA 5EL8A 6GSYA 4DSSB 5IMVA 4O5RA 3F63A 1R7HA 2H1DA 5CNWA 1F6MC 3TJKA 2TRCP 3IAS2 3Q19A 4ILFA 4IJ3A 4MJCA 3RPNA 2PBJA 2XPEA 4MJBA 1TJDA 2ON7A 1USBA 4WXTA 5HR3A 3E0UA 3QR6A 3C8EA 4EE0A 2EIOA 1A8LA 4DVCA 1OVNA 4L0UA 2JACA 1WP0A 2H73A 2IMDA 3TKRA 4OCFA 4XS6A 2VIMA 1QFNA 3QDNA 4X43A 4OD7A 1U87A 1EV9A 1O8XA 1SJ6A 4BPYA 1KTEA 3BD2A 5DQSA 5E4WA 1XWCA 3F9UA 2H6ZA 2FUG2 1TI3A 1GSFA 2DJKA 3D6IA 2AAWA 2N5FA 3FYGA 3P8WA 4ZB9A 6GSXA 1CQHA 2PU9C 3IDVA 2GSRA 4KCEA 3UAPA 2NBSA 5DJMA 1EGOA 3H4KA 4MF7A 3HZ4A 5ENUA 2VLTA 1PRXA 1XZOA 2FCHA 3IR4A 4TN8A 1SD9A 4P3YB 2H6YA 1PX7A 4MF5A 1SK1A 1J08A 4NXIA 2IMIA 4JE1A 2IFQA 4RUVA 1Q4JA 4POKA 1T7PB 4KA0A 4ULXA 1ACVA 2BMXA 2B5XA 1PL1A 1O8WA 4XCSA 1TK0B 3KZQA 4PUFC 4N30A 5JCGA 1K3LA 3FK8A 4TXOB 1S3DA 3Q6OA 4BWQA 4EUYA 2I9HA 5IMCA 3LXTA 2YPMA 3GKXA 1T4ZA 1JLWA 5G1KA 2LEGA 4IQ1A 1WIKA 2FWFA 2VCZA 4ECJA 4ACSA 1OKTA 1FVJA 2DLXA 2JSYA 2NDOA 3GSTA 5ECOB 2L4CA 3F8UA 2DMLA 3H79A 13GSA 3ZREA 3IAM2 3GL5A 4HI7A 3L9UA 4KH7A 1TW9A 1B4PA 1N2AA 1OC9B 2ZUPA 4KUNA 5KN0A 3P2AA 3HA9A 4D73B 2H8LA 4ZL8A 3V1WA 2RLIA 3R2QA 3GTUB 1ZCPA 5AIXA 4XRDA 1JZWA 2GQLA 4CW9A 1ERWA 2JZTA 2FNOA 1T8EB 5LCZA 4KNDA 2KP1A 5EPFA 4HJ2A 4F0CA 1MDKA 4MPGA 4YAVA 2F3MA 2LV3A 3CTFA 4TR3A 3KTBA 3DYRA 4HZ2A 4NWYA 4ZXGA 2X8GA 1FVKA 4LLRA 1BAYA 3PR8A 5ECSA 1T00A 4MCUA 2HLSA 1VGLA 2L5OA 4Z7XA 4IHUA 2X8CA 1GSUA 5HR0A 4WBRD 3H1NA 2VCVA 3A3TA 4HOJA 2C3TA 3CYNA 2MYGA 3APOA 4BL7A 5ECQB 1Z5YE 2YZHA 3IE3A 5KN2A 4AJ8A 5G1LA 5JCUA 1EEJA 5AN1A 3HJOA 2G2QA 4IS0A 4TVEA 1GSQA 1EV4A 2R3XA 3UVHA 4ML1A 3DEXA 3UMAA 4V2MA 2F8AA 4DSQA 5CREA 1TK8B 3DGQA 3DKSA 2K9FA 3LFLA 1TRSA 4AGSA 3IA1A 3HHVA 5ECIB 4TR4A 4IP1A 2H66A 4POMA 1GUHA 4MDCA 1WPIA 2BJXA 4TXOA 2I81A 2WRTA 5ABRA 4MZBA 3L4NA 2YN1A 1O7UA 2LUSA 1OAZA 1X0RA 3ME8A 2IJYA 2WULA 1GTAA 3MAKA 2GLRA 4MZCA 4KE3A 4YAPA 4I2UA 3C71A 2IMKA 4GSSA 1XW6A 2D2ZA 3UIWA 1VF3A 3FZ9A 4F9ZA 3KH9A 5J41A 3DXBA 1AQXA 1FOVA 1GUMA 1Z6MA 4WF4A 3W8SA 4D73A 1EGRA 1R5AA 3ZFBA 4ECIA 4XIHA 4NHZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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