4XIHA

Crystal structure of the r116a mutant ahpe from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
HMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANAGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords AhpC/TSA family protein
publication title The active site architecture in peroxiredoxins: a case study on Mycobacterium tuberculosis AhpE.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain ccdc5079)
total genus 53
structure length 153
sequence length 153
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xihA00
4L0WA 3TRPA 1TRUA 2YWMA 5J4UA 2CAIA 1WIKA 17GSA 4DSQA 5INYA 2YNXA 5J9CA 3DWVA 3GMFA 4PGTA 3BJ5A 3L4NA 4EDZA 3APQA 1RK4A 2YOIA 2DMMA 1DBYA 5ECKB 2HRNA 4ZL9A 2DJ0A 1W4VA 2L57A 4JBBA 1GP1A 1G6YA 3GSTA 4BVYA 1FAAA 2KHPA 4MA9A 5GZZB 5IOWA 3PR8A 1JZRA 1M2DA 1M2BA 5D96A 2B5YA 3FW2A 1O6JA 4MZBA 2YWIA 1PL1A 5ECMB 1DUGA 4WEYA 1XWBA 2VL3A 1B9YC 2H0IA 1R5AA 2CZ2A 2CX4A 5DDLA 3O3TA 13GSA 2VCTA 2V32A 4TKYA 2VL2A 2I81A 2VCXA 1U6TA 4ZL8A 3MNGA 5LNKe 2L5LA 3MWHA 3LFLA 3UVHA 4PNFA 3R2QA 3TCOA 4MZCA 3EE2A 2ZNMA 6GSVA 1ABAA 4XRDA 3KZQA 4J57E 3ZREA 3ZZXA 3N5OA 2L6DA 2LRTA 4EKZA 1XW9A 3A2VA 5DAKA 2EC4A 4TR0A 2QKEA 1HD2A 3CSHA 1NHOA 3EYTA 5LD0A 4GSNA 2E0QA 1BEDA 5DJLA 2GSQA 2GDRA 2J9HA 2VL9A 1AW9A 3D22A 4KDYA 4EO3A 1EGRA 1M9BA 3UJ1A 3PINA 4O5RA 5DCHA 3HY2A 1OC9B 1ZZYA 3WD6A 4OO5A 2OE1A 2H71A 1XBSA 4GQCA 5DCGA 5D8IA 5H5QA 3CBUA 3VWXA 3GSSA 4GSTA 1H4OA 2O8VB 3KD0A 2VD0A 4KH7A 3ZLPA 3F63A 3VLNA 4I97A 2GS3A 1KBNA 3UOMA 2WRTA 2H6XA 5AN1A 2MMOA 4MP4A 4V2MA 2DJJA 3DRNA 5H5SA 4NPBA 3W6GA 4RQRA 3GN3A 3GKKA 3WYWA 2I3YA 4WXTA 3M9JA 5C00A 1SJZA 2VOCA 2O85A 2VCZA 2ES7A 19GSA 4KCEA 3QPMA 4IQAA 4XS6A 2NPBA 4IBPA 4HZ4A 2X8HA 4KSOA 1MDKA 4IKHA 3TJGA 2CA8A 4L5OA 1XOBA 3L9VA 4X1UA 4AJ6A 4HEA2 4TRXA 4WKWA 4O92A 4BL7A 4YQUA 4O7HA 4NV5A 3FKFA 4H86A 3ZYWA 5J5NA 5CRHA 4ECJA 3TDGA 4IELA 3K8NA 4L0UA 3FHKA 3HVSA 4MJAA 1B4QA 2MMNA 3VURA 2CV4A 3GA4A 2P0GA 4RQXA 2HZEB 2KUCA 3IOSA 1A8YA 2H1BA 1O85A 1T4ZA 4LLRA 4E8EA 3GL5A 3KIJA 1GTAA 2WJUA 5G2ZA 1Z6MA 4PQ1A 1DSBA 1T8EB 4WETA 2O7KA 4IP1A 5HFKA 2CVDA 1XVQA 1TKDB 3ZFBA 1VRSD 3TKQA 5IO0A 4BWSA 1R7HA 3BD2A 2GTUA 3E0UA 3GKXA 4JRRA 1SYXA 2MYGA 3DXBA 11GSA 4X0XA 4V1Ag 5E59A 2DMLA 3TUEA 2DBCA 1K3YA 2X8GA 4G10A 4I2TA 5ABRA 1FB0A 5D9VA 4WF4A 1BQ7A 4WBRD 3WGXA 1M9AA 2I4AA 1GTIA 3APOA 1KEBA 1XCCA 1UC7A 2GSRA 2BTOT 2F8AA 2FUG2 2F8FA 2IJYA 4POKA 2VCQA 5A5KA 2CVBA 2ZUPA 2XBIA 2G2QA 4JR6A 4G19A 4ZILA 1G7EA 1SL1B 3QD9A 1FHEA 2K6VA 4K7IA 1TK5B 2XPEA 1PL2A 1GNEA 1F6MC 4LA1A 1SL0B 5ECPB 1URMA 5FHIA 4F0BA 3DVWA 2LV3A 2DJ1A 1EOGA 3RPPA 2AUVA 2X8CA 4DSSB 4Z7XA 3QMXA 1MDIA 1XW6A 1V40A 3G9BA 5CRDA 3D5JA 2P31A 5L71A 1WOUA 2GVPA 3ZFLA 5HFIA 1WP0A 1TDIA 2XC2A 5AGYA 1X9SB 1EWXA 2PPTA 1OC3A 2OJLA 1TI3A 2QSIA 4N10A 2R37A 4BWQA 1PX7A 3HKRA 3IC4A 2JL4A 1R4WA 4PUAA 5ID2A 1GTBA 1X5EA 2H19A 2P5RA 4IHUA 3L9SA 2FGXA 4RI7A 4TVEA 5CYYA 3HHVA 3CTGA 5CRGA 5D9XA 4GLTA 2L6CA 2OA7A 3BBYA 4F03A 2FLSA 1FW1A 2MMAA 1XWGA 4ZB8A 4KX4A 3HDCA 2C3TA 2DIYA 3F3RA 1Z7RA 5B6MA 4MJCA 3VPTA 2IMIA 2B1KA 2RUFA 1PRXA 3LGCA 1YY7A 1E6BA 2PERA 4ZB9A 3LEFA 6GSWA 1TTZA 4P3YB 5G30A 2AHEA 3KXOA 1AQWA 4K2DA 4F82A 2K18A 4Q5QA 4ZBAA 3TOUA 3ME8A 1AIUA 1VGLA 1NHYA 4WF5A 2LRNA 1U87A 1SJ6A 4XTSA 1WRYA 1QK8A 4OFNA 2F3MA 2DJKA 3E9JB 4MJBA 2GLRA 3EINA 1TW9A 1JZOA 3ZIJA 1OE7A 4WR5A 6GSUA 1TRSA 2I1UA 3FR6A 3SBCA 1GLQA 1A23A 3UBKA 2PGTA 4KDXA 3GIXA 1U3IA 4GQFA 2B7JA 4GF0A 4GRFA 1B9XC 2REMA 4ML6A 3C71A 3QOUA 6GSXA 4TW5A 1SD8A 2NVLA 1ERVA 4NHZA 2JU5A 2GT6A 3A2WA 1XVWA 1FB6A 4IN0A 4XCSA 2LUSA 2FWHA 2IL3A 4OWYA 10GSA 5D9TA 1Y25A 2OE0A 1X0RA 3RHBA 1GH2A 14GSA 2H66A 4LMVA 2IN3A 4KB3A 2DSAA 3NIVA 2C1YA 2HT9A 3H79A 1XZOA 2I9HA 2LNTA 1C72A 5IPGA 3H93A 6GSYA 1F3AA 3GRXA 5E4WA 2IFQB 1ON4A 6GSSA 4KAEA 3F0IA 3HCZA 5B7CA 1F37A 4ID0A 1G0TA 5J41A 4EUYA 1WPIA 5KN2A 4PQHA 3UARA 4ZL7A 1HNBA 3QAVA 4HDEA 1F9MA 2YPMA 1MEKA 3KEBA 2FHEA 3GYKA 4F0CA 3LG6A 2A2SA 4JR4A 4ZIJA 4PX1A 1DE1A 1IYIA 1I9DA 3D21A 2B5XA 3FYGA 5ECSA 4HOJA 2M80A 3IPZA 5AIXA 4Q5RA 3KJYA 2YWOA 1PA3A 1YKCA 2WCIA 4I6XA 4N11A 2C80A 4NWYA 3IDVA 3GTUA 1JHBA 3OR5A 2FY6A 4KGIA 1GULA 2R2JA 5CAXA 4K1FA 4AJ7A 5CREA 1M99A 2RM6A 4JZQA 2HSHA 3GFKA 4YAPA 3GL3A 3DGQA 3D4TA 3Q18A 1OE8A 2KP1A 5IM9A 1JLWA 1UN2A 1V98A 3L9UA 5GSSA 2L4QA 3N9JA 3RAZA 1FOVA 3P7XA 2V1MA 4XS1A 5JWQB 4ECBA 3GX8A 5HQPA 1GSYA 2FA8A 3TKSE 2R6KA 2WS2A 3FEUA 2CT6A 2MMZA 2GGTA 2H6ZA 4KCAA 5GAPD 4OCEA 2PMTA 2AB6A 3ERGA 1TP9A 3LORA 4BA7A 1G7OA 3WGEA 2B1LA 1K3LA 4D73B 3IAS2 3M8NA 1EZKA 4HJ2A 2KOKA 2OE3A 5G5EA 4O32A 4ACSA 3VPQA 1SL2B 2LQOA 4HS1A 1XW5A 3C7MA 2AYTA 4J56E 2IWTA 2M72A 1JZDA 1ZCPA 4K9ZA 3DIEA 5CO3A 2ON5A 1TU8A 4TR4A 5HR3A 1IYHA 2B7KA 5F05A 1T3BA 2VLVA 2RUEA 4ZB6A 1SD9A 1PGTA 2FA4A 1TI1A 4TR3A 2HRFA 3FZ9A 1PX6A 2CVKA 3HJMA 3VI5A 1GSUA 3CYNA 5C04A 3VFIA 1PN9A 4XS4B 5G5FA 1H75A 4IQ1A 1ZMAA 3F6FA 1TOFA 3M0FA 2HNLA 3KMOA 4TXVA 2LJRA 4HZ2A 2HYXA 1Q98A 1THOA 1XWKA 3US3A 4F9ZA 2TIRA 3KCMA 3VWVA 3GH9A 3RPNA 2XBQA 2VCWA 4MK3A 5A4VA 3HVXA 5H5RA 3NZNA 2HFDA 1Y6EA 1ST9A 1YJ6A 5B8BA 3KM6A 4EC0A 2H0HA 1GTUA 1UVZA 1QXHA 2C3QA 1V57A 1A24A 4K6XA 4TXOA 3HVVA 3HA9A 5KN0A 1U88A 2GQKA 2GZYA 2FNOA 3CRUA 1ZL9A 2CQ9A 4OO4A 3HZ8A 1AC1A 3ERFA 3I9V2 1FVJA 5EL8A 3G7JA 4TR1A 2GSSA 5D73A 3J7Yk 5F0GA 4PURA 2OBKA 2L59A 1HQOA 3TJKA 1T7PB 3ME7A 4HI7A 2JZTA 1WE0A 1JZWA 2JACA 1FVKA 1LU4A 2LRCA 5DALA 2HXKA 4JE1A 5G31A 5IO2A 1B8XA 4HQZA 4RI6A 1XIYA 2YZUA 2LJKA 1VF2A 2MBTA 4MH3A 4FH8A 2ON7A 1TRWA 3LXZA 2C0DA 2VLUA 3H1NA 5IPHA 4N0ZA 2LSTA 1SKSB 1YEPA 4QQ7A 3QFBC 1Z3EA 3EMPA 2YN1A 5FT3A 3HXSA 3IK9A 3C1RA 2NBSA 2VD1A 2C3NA 5F07A 1TK0B 3UMAA 3TRXA 3IAM2 4GCIA 3F4RA 1EV4A 4BPYA 4JU5A 4Q5FA 1K0CA 2LNSA 1S3AA 3RBTA 3DEXA 4HQSA 2L5OA 3D6IA 2HLSA 2H76A 3QCPA 1PQNA 3G7YA 4K8MA 3ZVJD 5F06A 1CQHA 1X9WB 2B3SA 4MF6A 4FIWA 4G2EA 1AQVA 2H74A 4K7OA 4CW9A 1Z9HA 2E2MA 3TKPA 4EF0A 5A4UA 2PBJA 4L8EA 1KNGA 4NXIA 2IIYA 2E7PA 3GUSA 1PKWA 5ECLB 1O7UA 5DJMA 3ZL5A 1XXUA 3IBHA 2CAQA 4OFMA 1GSSA 2FD3A 2L4CA 2LJAA 4WR4A 1EEMA 4CHSA 4X43A 5JWOB 3HD5A 3L0HA 5AIVA 5JCGA 3HJOA 1AUCA 5DAKB 1HNCA 3M9KA 1Z6NA 4FYUA 3I43A 3KMNA 3EURA 4EVMA 3QR6A 3V1WA 2E2GA 5CRWA 2V6OA 1O8XA 2C4JA 3VK9A 1ZYEA 3IV4A 5KEJA 3CSJA 4ECCA 1BJXA 4ISDA 2OACA 1ERUA 2YWNA 3J7Yb 5HR1A 2YJHA 1A0FA 1OC9A 2JSZA 3GNJA 1GNWA 3MDKA 1GL8A 1N2AA 3MAKA 5KN1A 1SU9A 5IIZA 4MCUA 1USBA 3CSIA 4WBJA 2V6KA 4N30A 1GSDA 1K0OA 5IMDA 2CX3A 2FCHA 1S3CA 5IMZA 4EXJA 1YEXA 2YANA 4E8HA 5B8AA 5JWRB 2ZCTA 3Q74A 2DJ3A 5IMCA 2R5GA 3CTFA 1O81A 3GURA 3GKMA 1CQGA 2EIQA 3VWWA 1LBKA 2C0GA 2C8UA 3HYPA 1V58A 3QDNA 3W8JA 1V2AA 4HUAA 4IS0A 1J0FA 2F9SA 2C0FA 1M0UA 1Z7PA 3GV1A 3FR9A 3FR3A 5JCUA 3ZMKA 1GUHA 3F8UA 3IA1A 3DMLA 4YQVA 2X99A 3EVIA 2A2RA 1XFLA 2G0FA 4L5LA 3TGZA 2VAFA 2QC7A 2V41A 1THXA 1RQMA 3F6DA 22GSA 4OFTA 3GH6A 1YDKA 3QAWA 4JEDA 2MBSA 2RIIA 3Q19A 1JFUA 4PQIA 4Q5NA 3IXRA 4BVXA 3RHCA 4NV2A 3W8SA 4I5QA 4XRAA 1GLPA 4PUFC 2BJXA 2EIRA 4K0NA 1XWAA 3TOTA 3LYPA 1VF1A 1QUWA 3KP8A 2HZEA 2PWJA 1SENA 4MJEA 4EE0A 4KA0A 1HNAA 1K0DA 2YZHA 4ZXGA 1X9MB 4ZBBA 2WDUA 3DVXA 3FRCA 3A5WA 4AGSA 1GSFA 2R3XA 3RDWA 2LKUA 2GQLA 1K0MA 1I5GA 3EU3A 3LJRA 3CRTA 1EV9A 6GSTA 3ZMLA 5DALB 2YV7A 1O73A 4QL9A 5COHA 2LTKA 5ECOB 1A2LA 1M7TA 1GSEA 1EEJA 4GTUA 2AJQB 2JADA 2N5FA 3EWLA 3LQ7A 3TJFA 3UAPA 3LXTA 3QAGA 5IMAA 3IRAA 1ZGNA 4V1Ap 3KH7A 1OAZA 1VF4A 5EVOA 5B6NA 5GSTA 3SWLA 5IMFA 2VL2C 4OD7A 1BAYA 1V9WA 4F2IA 3P90A 1YZXA 1NM3A 4XIHA 2H8LA 1U3AA 4ILFA 4DSSA 4IJ3A 1OKDA 2J23A 4FYBA 2PU9C 4FO5A 4RUVA 2ALBA 2HSYA 5EPFA 1A2MA 2N5AA 8GSSA 2GZPA 1DE2A 1PD21 1FO5A 2H1GA 5IOXA 2O89A 5HR2A 4KSMA 5EY6A 3KTLA 5D93A 4IJIA 3FZ5A 3E3EA 1NW2A 3WT2A 1K0AA 1QQ2A 4LL1B 3NOFA 5KN3A 4MZWA 5IMVA 5CNWA 2IPAA 3CMIA 2AAWA 4MPFA 1QFNA 1ERWA 4YH2A 5ELAA 4IVFA 5ID2B 4HU9A 3GX0A 1PSQA 1AQXA 1PKZA 3TKRA 2VO4A 5D9WA 5A4WA 2V2GA 3M1GA 4AF2A 2WB9A 1X5DA 3GHAA 2OADA 2WGRA 4EDYA 3C1SA 2FWEA 1J9BA 3D0ZA 5ELGA 5DBQA 5F8BA 4LMWA 3CXGA 3ERWA 3I69A 3F4SA 3EMXA 1ERTA 3FZAA 3DKSA 1MD4A 2NDOA 2DC5A 1SK0A 2IMKA 4MDCA 2H75A 3FK8A 1MD3A 3U5RE 2WFCA 3H8QA 20GSA 4CDOA 1R5PA 3QFAC 2A4VA 1TJDA 2DLXA 3P2AA 2OKAA 3TKSC 5FWGA 1SJIA 4PNGA 1EP8A 2QGVA 3ED3A 1S3DA 5HR0A 4MMMA 1R26A 1HYUA 3DD3A 2PVQA 1Z5YE 3S9FA 4NHWA 2H73A 5DVBA 2RLIA 4MF7A 2LS5A 3APSA 3TKSA 4POMA 3UIWA 5CP1A 1K3OA 3VWUA 3LSZA 3FZ4A 4I2UA 1B4PA 4POBA 2VCVA 1A2JA 3FY7A 5ECQB 1T4YA 2F51A 1TRVA 3EU4A 1E2YA 1BX9A 1OC8A 4KNDA 2HZFA 4AJ8A 1G6WA 3L78A 2M46A 1GUKA 3PGTA 2HI7A 3UEMA 1ML6A 4I8BA 2FWGA 4ZBDA 4GWRA 1A8LA 3C8EA 2O87A 2PN8A 1GUMA 2H01A 2OBIA 1K0NA 2VM2A 3KTBA 2K9FA 3ZRDA 1SK2A 1SK1A 4TOPA 7GSSA 1VF3A 1WMJA 1Q4JA 3PH9A 3IK7A 2PVOC 2AV4A 4DVCA 2K8SA 2NTOA 2R4VA 1SKRB 1T1VA 1QMVA 2C0EA 2IFQA 1ZYQB 2TRXA 1YKAA 3BCIA 4MABA 4POLA 1UA5A 3GKNA 1BG5A 2TRCP 4QL7A 2MZCA 3O6TA 4ULXA 5DQSA 1TXXA 2LQQA 1LJRA 1SKWB 5ECIB 3KGKA 4V2LA 3HJPA 4KE3A 2YJ7A 5G1LA 3AY8A 3IR4A 1GWCA 1KTEA 1MDJA 4LL4B 3WGDA 2B6MA 3H4KA 4GXZA 4NMUA 2K8VA 2VUPA 1ZOFA 5HFGA 1B48A 1N8JA 3F3QA 4G9HA 3A3TA 1XPVA 3EC3A 2EIOA 1JLVA 1WWJA 5DQYA 1EGOA 3ZITA 4GSSA 3VI7A 3C73A 3GTUB 9GSSA 16GSA 2RM5A 4ML1A 4FYCA 2LEGA 1F3BA 4DEJA 12GSA 3UVTA 1TK8B 1W89A 1ILOA 2JSYA 2D2ZA 1YF1A 4MLYA 1MTCA 3LWAA 2GSTA 2IMFA 4IGJA 5IQYA 2H70A 3IHQA 4IW9A 1BYEA 3A2XA 4MPGA 3P8WA 3MSZA 3O76A 4KUNA 1NSWA 4KW6A 4NAXA 4J2FA 5AISA 5G1KA 1O8WA 3U6VA 1OKTA 5ECHB 2BMXA 5J9BA 1WJKA 2PUKC 2GZZA 4V2NA 2HE3A 3KH9A 2XPDA 2YCDA 2H1DA 2DJ2A 2VLTA 2FWFA 4D73A 18GSA 1ACVA 3I6AA 2H6YA 1GSQA 4YAVA 1EOHA 2X64A 3DYRA 1GRXA 2CZ3A 3ZVJA 3BOAA 4MF5A 1J08A 4IP6A 1XOAA 1RW1A 1TU7A 1A0RP 1AXDA 1X5CA 2GT5A 2WZ9A 2YP6A 5JCWA 1PMTA 3LYKA 4TN8A 3G7IA 3UL3A 4XS4A 3TB2A 4OMVA 3TRQA 1T00A 2H0GA 4HJMA 2IMDA 1OYJA 4ECIA 2GQMA 3HZ4A 5ECNB 3KP9A 1EP7A 4HU7A 2YV9A 2H30A 2KLXA 3F9UA 1FG4A 2JZRA 4OCFA 3TJJA 4N0VA 2KP2A 3ZTLA 4EL1A 3M3MA 1K0BA 3UBLA 4K7NA 2H72A 1M2AA 3F4TA 2B5EA 2P5QA 1F2EA 5J3RA 1QGVA 3ISOA 2IMEA 5ENUA 2VIMA 4TXOB 3IE3A 1YQ1A 2XHFA 2H1AA 1AAZA 3Q6OA 1OVNA 2WULA 2VM1A 1XWCA 3ZIVA 1SYRA 4TR1B 4MH2A 5ECRB 3JCML 3BCKA 3TJBA 3WT1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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