4XIHA

Crystal structure of the r116a mutant ahpe from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
HMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANAGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords AhpC/TSA family protein
publication title The active site architecture in peroxiredoxins: a case study on Mycobacterium tuberculosis AhpE.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain ccdc5079)
total genus 53
structure length 153
sequence length 153
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xihA00
3M3MA 3TOTA 3TJFA 5J41A 1FOVA 1R5AA 2WCIA 1XWCA 2CVBA 2YWOA 3ZYWA 1HNAA 4ZILA 3US3A 2CQ9A 3KMOA 4ID0A 1E2YA 1O81A 1TTZA 3QMXA 1ILOA 4HZ2A 1GTBA 2V2GA 5GSSA 2XBQA 4V1Ag 3D4MA 1NHOA 2WZ9A 3ZL5A 1I5GA 4RQXA 4PNGA 7GSSA 5CYYA 5F05A 2XPDA 3KD0A 2LRTA 1XWBA 4I8BA 1GTIA 1T8EB 4QL7A 2L4QA 5IIZA 4POLA 4NV5A 5C04A 2IL3A 1K3OA 2GZZA 3DWVA 1Q98A 2FA8A 4HJ2A 1LBKA 1PGTA 1XWKA 1GL8A 3MAKA 2L57A 4MF7A 1OC8A 2HSHA 1IYIA 2P5QA 4J56E 1GRXA 2K8SA 4CHSA 2C0FA 2CX4A 1YF0A 1GSSA 1OKDA 3VPQA 1VGLA 2ZNMA 1F37A 2E7PA 4K9ZA 4L5OA 5AIVA 1QXHA 3Q6OA 2P5RA 4O32A 3ED3A 4I5QA 3FZAA 5DDLA 1OC9B 2LS5A 2I3YA 3ZFLA 2IMKA 3VWXA 1A24A 3DEXA 3EINA 4OO5A 1PKZA 2JADA 4EKZA 1HNCA 3GSTA 1ERVA 4HUAA 2H0IA 2B3SA 2DMMA 1K3YA 3TJBA 2CA8A 4ECJA 13GSA 3RHCA 2GTUA 3CTFA 3N9JA 1GUMA 1TU7A 3L9SA 3PINA 3ZIJA 3G7YA 2MBTA 4OD7A 1N2AA 4KX4A 4F0CA 1X5EA 1SL0B 3GIXA 3BCIA 2K18A 4V1Ap 4PUFC 2HZFA 4HDEA 3VWVA 14GSA 2I1UA 1BX9A 1NW2A 4IELA 4Q5RA 4ILFA 2JZTA 2K8VA 2HYXA 3HVXA 3CRUA 2X8GA 3Q74A 5IMDA 2YWMA 1AQWA 1YEXA 4NPBA 3Q19A 2YJ7A 5ECKB 1XZOA 2N5BA 3CSIA 4FYUA 2YV9A 3EE2A 3GA4A 3GRXA 4KSMA 1ERUA 3FZ5A 1PSQA 3RAZA 1QGVA 3GUSA 4EF0A 3ZVJD 5GZZB 4MJAA 1J0FA 1XW5A 3VK9A 4LMWA 3F4TA 3IPZA 4O92A 4J57E 3KTBA 1S3CA 5JCUA 4TN8A 2IJYA 1K0CA 3VFIA 4L8EA 4X43A 1XCCA 1UA5A 3GX0A 2OBIA 4NXIA 4ULXA 1JZOA 1OAZA 2WULA 2KLXA 1T4YA 3E9JB 3TKSA 4OCEA 1TRUA 4TR1A 2GQMA 4E8EA 2H8LA 2A2RA 3F6FA 3D22A 3VI7A 1F3BA 1G0TA 2VD1A 2YP6A 5DJLA 2V6OA 4PX1A 1GLPA 4JR6A 1QMVA 5ID2B 5D93A 2AHEA 1TP9A 3FEUA 1XPVA 4MABA 1BYEA 3P90A 2KP1A 1ML6A 2YV7A 4TR4A 3DXBA 3GSSA 3WGEA 4RQRA 3RDWA 4JR4A 4GXZA 3KCMA 1WP0A 1YJ6A 1X9MB 3VWUA 3KXOA 5COHA 2DIYA 4WF4A 5B8AA 3UBKA 3UEMA 4K0GA 4KDYA 3CSJA 2KP2A 1GWCA 4X1UA 2H72A 1M2AA 1TRWA 4KCAA 5D9XA 3VURA 4GCIA 3DVWA 3MNGA 4K1FA 3F4SA 1M2BA 4MZCA 1B9YC 1A0RP 3N5OA 2P31A 1EOGA 1HYUA 4NHWA 1XW9A 2B7JA 2LNTA 3TCOA 1NSWA 5D9TA 5CO3A 2N5AA 1BAYA 3DIEA 5A4VA 1CQGA 1TXXA 4IS0A 4CDOA 1F6MC 2H01A 4EUYA 2YWNA 1PX7A 3TKQA 2YWIA 3P7XA 2LUSA 3IXRA 3TRXA 2X8CA 1WJKA 3ISOA 4AJ8A 2BTOT 4V2LA 3DVXA 3QAWA 4G19A 3UBLA 2HSYA 4TVEA 2YPMA 4BVXA 2M46A 4IJIA 4EE0A 1M2DA 1FVJA 5D73A 2DJ2A 1GSUA 4I6XA 3VLNA 1M7TA 17GSA 5G31A 2VLUA 1XXUA 5B6MA 5CRGA 4L5LA 4TXOB 1SKWB 4GQCA 2GGTA 1AC1A 9GSSA 1T4ZA 4NV2A 3HD5A 3J7Yk 3LQ7A 2VL2A 4F82A 4EDZA 1O6JA 4MMMA 2ZUPA 1ZZYA 5D9VA 1FW1A 4OO4A 5A5KA 2RUFA 5F07A 2C1YA 3GKXA 2M72A 3LGCA 2B7KA 5ECIB 3F0IA 2H70A 1T00A 1QFNA 2GZPA 1DBYA 5D8IA 4ZBDA 4MCUA 1U3IA 1SL2B 2P0GA 3HZ8A 2WB9A 3IE3A 2VM1A 3BOAA 2G0FA 3P2AA 5EPFA 2H1AA 3QDNA 2VL9A 5ECRB 5IOWA 5J9BA 2LRNA 3G9BA 1GSYA 2GSSA 3FKFA 3ZRDA 4KW6A 4KNDA 3HVVA 1B8XA 2VUPA 4IVFA 2KHPA 3IAM2 1G7EA 1ZL9A 4TXVA 4DSSA 3EVIA 1H75A 3U6VA 5DCGA 4RUVA 4YQVA 2VOCA 4PQ1A 1Z9HA 4HI7A 5CRHA 4O7HA 1XBSA 3SBCA 2FLSA 1DUGA 3FYGA 4Q5QA 1O8WA 2KUCA 4XCSA 5D9WA 3IR4A 2R4VA 3EYTA 2CZ3A 2FWHA 2R2JA 4JU5A 4ZL8A 5LD0A 4LLRA 5IMFA 2MMOA 2RLIA 22GSA 5HR1A 1YY7A 3KM6A 4ACSA 1RQMA 5E59A 3PGTA 1FB6A 2H76A 3I9V2 4ZB6A 4N10A 1YDKA 1YKCA 4MPFA 1OC3A 2O7KA 2F3MA 1O7UA 3C73A 1V2AA 2AJQB 2H6ZA 2L4CA 1W89A 5G1LA 4YAPA 3L9VA 5IQYA 1K0DA 2MMAA 1EEMA 3QPMA 2XPEA 3WD6A 2NPBA 2LQOA 1UN2A 1BQ7A 1EZKA 5IMAA 3CTGA 3LJRA 2LSTA 1GNWA 1X0RA 2GQKA 1V98A 3ZVJA 1K0AA 2O89A 2OJLA 3QAGA 2HRNA 3APQA 1FG4A 2HZEA 1EEJA 1ZYEA 3KGKA 4LMVA 3IRAA 4I2TA 5DAKA 5IO0A 4GLTA 2LEGA 1BG5A 5H5RA 4YQMA 6GSYA 4HS1A 4BWSA 1AQXA 1VF2A 3KZQA 2LJRA 4X0XA 2MMZA 4NWYA 1A0FA 5CREA 1ZOFA 4WBRD 3F3RA 3LFLA 3L0HA 5AISA 5IMZA 4PURA 2OBKA 4N0VA 2FWGA 1WE0A 4IBPA 2OKAA 2EC4A 3MSZA 5J4UA 4WETA 2V6KA 2AYTA 3LYKA 5DJMA 4N30A 2C8UA 2FWFA 5H5SA 4BWQA 2AUVA 4F2IA 4TR1B 4G9HA 1UVZA 2H6XA 3PH9A 4OWYA 2VIMA 1B48A 1A2JA 5GAPD 4H86A 5JCWA 3FZ4A 2DIZA 5DALB 1PRXA 3KMNA 4E8HA 3L4NA 2GSQA 3TB2A 2OADA 3WGXA 1WPIA 2VLVA 2CX3A 3E0UA 2FD3A 3A2VA 1DE1A 4XIHA 1YQ1A 4O5RA 2V1MA 4KA0A 1Z7RA 3D0ZA 1Z6MA 4DSRA 3LEFA 3HCZA 3TOUA 4PGTA 4MZBA 3C7MA 1B4PA 5AN1A 5ELGA 1X9WB 1AUCA 4OMVA 5HFGA 4Q5FA 3ZMKA 1E6BA 3A2WA 1ERWA 3GKNA 5HQPA 2DLXA 3H79A 4IN0A 3EMPA 5EL8A 4K0NA 2QGVA 4XS1A 2RIIA 3TRQA 1M0UA 5ECMB 2HLSA 2C3NA 4LL4B 3GNJA 2A2SA 2VL3A 3TKPA 2JL4A 5F8BA 2HXKA 3JCML 1FAAA 1PD21 1TRVA 4L0WA 2I81A 4Z7XA 2WRTA 4GWRA 5HR0A 4MP4A 4EVMA 4G10A 1VF3A 1O73A 3ZZXA 2BJXA 2B6MA 3F6DA 2IFQA 1GSDA 3A2XA 5ECLB 2XBIA 2LTKA 1A2MA 3RBTA 3L78A 4MK3A 4OCFA 4WEYA 1XOAA 3M9KA 4JBBA 5AGYA 5H5QA 3C1RA 3IAS2 3SWLA 3GL3A 10GSA 1F3AA 2I9HA 2VCZA 1EV4A 2CZ2A 2G2QA 1GNEA 2VAFA 4NHZA 5CNWA 2DJKA 1Q4JA 4ZBBA 3I43A 3VWWA 2PVOC 2VLTA 1SK1A 2WGRA 2EIQA 5ECNB 5B6NA 3FR9A 1AW9A 3A5WA 1Z3EA 2DJ0A 5IPHA 4EDYA 3BJ5A 1R26A 1THXA 2IMEA 1TK5B 2F8FA 2IPAA 2KOKA 5J9CA 2FNOA 1DSBA 3ERWA 1EP7A 1PL2A 3DRNA 5ECPB 4F0BA 2REMA 3DGQA 3ZFBA 1GH2A 3DYRA 3V1WA 3HZ4A 3DMLA 5F0GA 1PQNA 2X99A 4LL1B 4WKWA 2YZHA 2R6KA 4RI6A 3RPNA 1XFLA 2H1DA 2C3TA 4NAXA 2LNSA 3H8QA 4POKA 4TKYA 1SD9A 4F9ZA 1EV9A 2L6CA 3EMXA 2MZCA 2LJAA 4IQAA 1XOBA 2J23A 3FR6A 1YEPA 5KEJA 3HA9A 5INYA 3ME8A 3D6IA 3CRTA 2DMLA 4BVYA 4WF5A 2F51A 3HVSA 3ZTLA 4ZL7A 2XHFA 4G2EA 3TKSC 4D73A 1EGRA 4V2MA 3EU3A 4K8MA 1UC7A 3CMIA 3LYPA 4QL9A 4OFMA 2PBJA 3KEBA 1QQ2A 1V58A 4PQHA 2AAWA 3CSHA 3TJKA 2H19A 5EY6A 5CRWA 1NHYA 3DD3A 1K0MA 4IGJA 1ZMAA 1AQVA 4ZBAA 4ML1A 3ERGA 1K0NA 3E3EA 2B1KA 3VPTA 3GX8A 1RK4A 1TU8A 19GSA 4KSOA 1JZWA 3Q18A 3HDCA 5KN0A 2H1BA 2HZEB 5B8BA 3KTLA 4ECIA 2DJJA 2O85A 2XC2A 2YCDA 3TKSE 4XHMA 1OE7A 2L5LA 3HYPA 3TJJA 2E2GA 1LU4A 2VCQA 4KGIA 4NMUA 2R37A 4KDXA 11GSA 3NOFA 2L5OA 1T7PB 1RW1A 1TKDB 1JHBA 1SK0A 4POBA 1EGOA 4MH3A 5ID2A 3IK7A 3UMAA 5CAXA 1TJDA 2H71A 3S9FA 4GRFA 4FYBA 2CT6A 1T3BA 1JFUA 2LQQA 3UVTA 1MDIA 1YKAA 3DKSA 1SJIA 3U5RE 3CBUA 1TOFA 20GSA 1PN9A 1GUKA 4XTSA 3UJ1A 5ELAA 3M8NA 1SYRA 2PGTA 2VD0A 3HJOA 4MF5A 2VO4A 5KN3A 3GYKA 4KE3A 2H74A 3GH9A 3EU4A 1GSFA 2FWEA 2HFDA 4TR0A 4IKHA 1HQOA 1AIUA 2H66A 3F4RA 1SKSB 3APOA 3WGDA 2R3XA 4GSSA 1SU9A 4WBJA 3QAVA 1F2EA 3LG6A 3C1SA 2L6DA 1MEKA 4BPYA 2WJUA 1J9BA 1H4OA 6GSUA 1ABAA 2HT9A 1GUHA 3KJYA 2FCHA 3CXGA 2VM2A 3IA1A 3KH7A 4MZWA 2NTOA 1B9XC 3NZNA 1WMJA 3F63A 5JWOB 2LRCA 4HOJA 2AB6A 4FYCA 1ZCPA 1S3AA 2F9SA 4KCEA 1C72A 2HNLA 1KNGA 1XIYA 2E0QA 2LV3A 1N8JA 1MD3A 4PUAA 4TXOA 1XW6A 1USBA 1F9MA 3ZREA 4K2DA 3IC4A 5A4UA 3TJGA 3HJPA 2IFQB 4LA1A 2DC5A 2GT5A 4ZB9A 1JZDA 5F06A 1QK8A 2PWJA 2ALBA 1PMTA 3GHAA 4JE1A 3GTUA 4BA7A 1K0OA 1TRSA 5G2ZA 5IPGA 2ES7A 5G30A 2WFCA 3ERFA 5JWQB 1GULA 5FT3A 3HKRA 2QC7A 4GQFA 2C4JA 5ECHB 4PXOA 16GSA 3HHVA 1WRYA 2C0DA 1V57A 4AF2A 1XWGA 3NIVA 5C00A 1DE2A 1VF1A 1A8LA 2GQLA 3O76A 3GH6A 12GSA 2GZYA 3LWAA 6GSTA 3O6TA 3I69A 4K7NA 5IO2A 2ON7A 2PUKC 3KP9A 4CW9A 5HFIA 4JZQA 2C0EA 2CVDA 1YF1A 5B7CA 4MJCA 2ON5A 4K6XA 3UL3A 2GSTA 4PQIA 4ML6A 1SYXA 2NDOA 5ECQB 2DJ1A 4ZL9A 5J3RA 1JZRA 2X64A 4OFNA 1HD2A 4MJBA 4AJ7A 4MH2A 1BEDA 2BMXA 4ZXGA 4WXTA 3G7IA 5JWRB 2V41A 3UOMA 4EC0A 2HE3A 2FHEA 3UARA 3H4KA 5DVBA 1PL1A 1J08A 3IDVA 5DCHA 2AV4A 2IMFA 3FY7A 1FO5A 3HXSA 3H93A 2V32A 1R5PA 3IHQA 3PR8A 3BBYA 1OKTA 2PU9C 4WR4A 2F8AA 1R4WA 2DJ3A 4ZB8A 4IJ3A 3TUEA 3LSZA 4TRXA 2IWTA 1PA3A 1AXDA 4ECBA 1SJ6A 4XS4A 4YH2A 2C80A 4JEDA 4D73B 3VI5A 1GLQA 4KB3A 1TK8B 4FO5A 2H6YA 1GTAA 2OE0A 3QOUA 2LJKA 1M99A 4HQSA 1WWJA 3IK9A 2EIOA 2O8VB 4IP6A 4KH7A 3L9UA 5IMCA 3HY2A 1SK2A 3RHBA 3F8UA 2QKEA 3IV4A 1S3DA 2D2ZA 2O87A 2A4VA 3KIJA 5CP1A 1Z6NA 4HU7A 1X5CA 3FR3A 4IHUA 3W6GA 2EIRA 2GS3A 3FHKA 4ISDA 4MPGA 1X9SB 1MDJA 1OE8A 2JSYA 1TW9A 4AJ6A 1A8YA 2PVQA 3D21A 4HU9A 4I2UA 2E2MA 2NBSA 5LNKe 2HRFA 3F3QA 4J2FA 3QFBC 3UVHA 4EL1A 2JACA 3AY8A 3TDGA 2H30A 1ZYQB 4QQ7A 3ZLPA 2FY6A 3F9UA 3WT1A 3GL5A 4V2NA 1CQHA 1WIKA 3H1NA 2H0HA 5D96A 4BL7A 3IBHA 2IMDA 2HI7A 2IMIA 3FW2A 2PMTA 4P3YB 5EVOA 6GSXA 2OACA 3HJMA 5HFKA 2C0GA 4TOPA 4XRAA 4MF6A 1KTEA 4ZIJA 5GAND 3BCKA 2YJHA 3GKMA 5DALA 2OE1A 1OYJA 1GP1A 1LJRA 1YZXA 4DSSB 1SL1B 1OC9A 18GSA 2J9HA 4GSTA 5G5FA 1JLWA 5GSTA 1KEBA 4L0UA 1OVNA 4MA9A 5IOXA 1Z5YE 1HNBA 1X5DA 4KUNA 2CAQA 3TGZA 1T1VA 2Z9SA 1AAZA 5DBQA 3GMFA 2RUEA 1VF4A 3M0FA 3IOSA 5HR3A 3GFKA 2LKUA 2CV4A 3J7Yb 1VRSD 1R7HA 3UIWA 1JLVA 2N5FA 5E4WA 4IP1A 5ABRA 3GKKA 5IM9A 2PN8A 1XWAA 5A4WA 3EWLA 1ON4A 1ERTA 1M9BA 5DQYA 4EO3A 1ST9A 4Q5NA 4MDCA 3TRPA 4ECCA 1GSQA 4POMA 5G1KA 4MLYA 1MTCA 1IYHA 4HZ4A 1WOUA 3ME7A 1EOHA 3P8WA 2FGXA 1EWXA 4JRRA 5HR2A 2GSRA 3BD2A 4XS6A 4RI7A 2IIYA 2K6VA 2TIRA 2VCVA 2JSZA 2GDRA 4GTUA 2YNXA 1GSEA 4KDUA 3MWHA 5LCZA 3QD9A 2PERA 3O3TA 1B4QA 2C3QA 4PNFA 2YZUA 5J5NA 4N0ZA 5AIXA 2B5YA 3GV1A 3QR6A 5DAKB 2YOIA 2MBSA 6GSWA 2ZCTA 2JZSA 3FRCA 4DVCA 1PKWA 1W4VA 4IW9A 3A3TA 1THOA 3C8EA 5FWGA 2GVPA 3QFAC 1V9WA 2M80A 6GSVA 1U3AA 1Z7PA 3ZMLA 1XVQA 4K7IA 1MD4A 4K7OA 3EURA 2K9FA 4OFTA 3D5JA 4XRDA 3GTUB 3APSA 1ACVA 4TR3A 8GSSA 4F03A 5CRDA 1Y6EA 1U6TA 3M9JA 2H1GA 3GN3A 5L71A 4TW5A 4KAEA 2DSAA 3M1GA 1KBNA 3ZIVA 4YQUA 3TKRA 2FA4A 5KN2A 1Y25A 3MDKA 3FZ9A 1BJXA 1MDKA 2YN1A 2H0GA 4HEA2 1SJZA 1XVWA 3QCPA 2IN3A 2JZRA 1K0BA 3K8NA 1A23A 1SKRB 4WR5A 1FVKA 2PPTA 1K3LA 3C71A 2TRCP 2OA7A 4I97A 4DEJA 2WS2A 3OR5A 1FHEA 4MJEA 2B1LA 3W8JA 3D4TA 3WT2A 3CYNA 3LXTA 2H73A 3W8SA 1TK0B 1O8XA 1SENA 3EC3A 3KH9A 1G7OA 3UAPA 3R2QA 4FIWA 2OE3A 4FH8A 1V40A 3ZITA 3I6AA 2VL2C 1PX6A 2RM5A 1U87A 4DSQA 4IQ1A 2CAIA 3FK8A 2I4AA 4GSNA 1A2LA 5ENUA 1TI1A 2CVKA 3LXZA 4HQZA 2B5EA 1SD8A 4HJMA 1ZGNA 2FUG2 5JCGA 1U88A 2YANA 2H75A 5ECOB 2R5GA 1G6WA 3WYWA 4GF0A 2VCXA 1EP8A 3KP8A 5KN1A 2VCTA 2WDUA 1QUWA 2QSIA 3RPPA 4N11A 1URMA 1I9DA 4XS4B 4AGSA 1M9AA 1GTUA 4EXJA 5DQSA 2GLRA 2RM6A 2JU5A 2MYGA 6GSSA 5G5EA 3LORA 5FHIA 2X8HA 2B5XA 2VCWA 1O85A 1TI3A 1FB0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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