4XRAA

Salmonella typhimurium ahpc t43s mutant
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFSFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVCPAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 60
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xraA00
2DJ3A 4H86A 5CRHA 2XHFA 2DBCA 3ZFBA 2LQQA 5D8IA 5A4WA 4MZBA 5DJLA 2OJLA 4CW9A 3FZAA 2ZNMA 6GSXA 9GSSA 4MCUA 1BJXA 3KGKA 2C1YA 4ZB6A 3FY7A 4OMVA 1BEDA 5G5EA 1BAYA 3ZFLA 3IA1A 2HFDA 2F8FA 2H1AA 2HE3A 3FZ4A 3IK7A 1KBNA 3D0ZA 2VL2C 3DKSA 4LMWA 3U6VA 3FR9A 2GZPA 1YKCA 3TJGA 1XOAA 1TRUA 4HU9A 3J7Yb 3QMXA 5JCGA 4EF0A 4LL4B 5E4WA 4OFTA 4OFNA 4V1Ap 4KW6A 3UARA 3IDVA 4POMA 3E3EA 2P5QA 4EVMA 2FA4A 1AIUA 5IO2A 2H01A 1K3LA 2R2JA 4JRRA 4MZCA 3ZVJD 5DQSA 4MP4A 5ECIB 2MYGA 2ON5A 4POBA 3F4RA 2LKUA 2PN8A 2VLVA 2YWNA 2LNTA 1K0MA 2VL2A 1GSEA 1GNEA 4HUAA 3N5OA 2YWOA 3GHAA 1AAZA 2V32A 4NWYA 4Q5FA 3LGCA 2VCVA 1BG5A 3CRUA 3G7JA 4GCIA 4WF5A 4K1FA 2J23A 3OR5A 1F3BA 1TK8B 1ON4A 1SU9A 1A23A 1ML6A 3Q19A 2PERA 4EDZA 2L6DA 1ZYQB 2OA7A 1Z9HA 4F82A 2CVKA 3UVHA 3TB2A 1USBA 3KH9A 1PX7A 2M72A 20GSA 1YF1A 4GLTA 3K8NA 3I43A 4IELA 3GKXA 2CQ9A 1RQMA 2DJ1A 2L59A 4KNDA 3ZITA 4MZWA 4ML6A 5DJMA 4GF0A 4HJMA 3ZVJA 2CX4A 5D93A 1EV9A 1ERVA 2GZZA 2EIQA 3QPMA 2RIIA 3GA4A 2PWJA 4ECIA 2L5OA 3LSZA 3QOUA 3UEMA 1GSUA 4DSQA 1K0DA 3Q6OA 5B8AA 4GSNA 1SYRA 2JZTA 1ABAA 4TXOA 1YDKA 1A2JA 2WZ9A 2XBIA 3L9SA 4YQUA 2FWEA 3ZRDA 1ERTA 2X8GA 1O81A 3QD9A 1QMVA 2B7KA 3UJ1A 4N0ZA 1TKDB 4O7HA 3DEXA 4AGSA 4EKZA 1DE2A 5GSTA 2BMXA 5IMCA 3IAM2 1Q4JA 1EZKA 3UOMA 2AV4A 1NSWA 3TKSC 4K6XA 3O76A 1ZL9A 3D21A 4XHMA 2JADA 4L0WA 4KSMA 3KZQA 4WETA 2GSSA 1WE0A 3QAVA 1YZXA 5ECHB 5DALA 1I9DA 1OKDA 4IGJA 2X8CA 3F63A 1WP0A 5B8BA 3G7YA 4EXJA 3D5JA 4GWRA 4Z7XA 1O7UA 4XCSA 2L5LA 2WFCA 3EVIA 4TR1A 3WGDA 5IPGA 3VURA 1VF2A 1G7OA 2KUCA 4ULXA 2C3TA 12GSA 2AYTA 1SJIA 3DD3A 2JZSA 4KH7A 4OCFA 1OC3A 5C00A 1Z6NA 2YJHA 4AJ6A 4EDYA 4I5QA 1XW9A 2HRFA 3F3QA 4OWYA 1EOGA 1GUKA 3GYKA 3VWXA 1YEXA 5GAND 2LEGA 1HNBA 4KDYA 2DJKA 1OE7A 3QCPA 2IMDA 3IHQA 19GSA 3M1GA 4JZQA 3C1RA 2VCZA 1XXUA 2WCIA 3ME7A 3ZMKA 1WRYA 1X9SB 5A5KA 4NAXA 4ID0A 3G9BA 5L71A 2H1GA 2F51A 1A8LA 3GKNA 3BBYA 2H1DA 1V2AA 1GP1A 4MDCA 4N10A 2FUG2 2WRTA 3D4TA 11GSA 2LJKA 1HYUA 4HZ2A 1THOA 4KX4A 1XVWA 18GSA 2E0QA 4ECBA 5EY6A 4MPFA 2YCDA 5INYA 4WR4A 3PINA 2L4QA 3ZIJA 3QAWA 5J3RA 1U3IA 4IW9A 2NPBA 4OO4A 4KCAA 4I6XA 1ZOFA 3ME8A 5JWRB 3RBTA 1THXA 1B9YC 2XC2A 2GDRA 3FEUA 1T4YA 1PA3A 1GUMA 5KN2A 2IN3A 1PKZA 3CXGA 4IQAA 3ZYWA 4FH8A 2VD1A 5CRDA 3CYNA 4GXZA 3RHCA 3WT1A 4MH3A 3DIEA 5JWQB 4TR4A 5JWOB 13GSA 3MDKA 3DYRA 1XFLA 1PMTA 4I8BA 3GNJA 3A2WA 3MNGA 1TDIA 2DLXA 2IIYA 2K6VA 4MJCA 5CREA 5ELGA 1TOFA 4PURA 2N5BA 3KEBA 3KMOA 2H0IA 4AJ8A 4WXTA 4V2NA 3APQA 3GMFA 2WB9A 4V2LA 2ON7A 3MAKA 2H75A 2EC4A 4Q5NA 4GRFA 2MBTA 3F4SA 1DBYA 3TUEA 2HYXA 4G2EA 4YAVA 5HR0A 5ECSA 2ES7A 2DJJA 3HD5A 1ERWA 2FWHA 2AB6A 4KDXA 5D9VA 3ERGA 2CA8A 5IMAA 1A8YA 1M2BA 2YOIA 3FR3A 4K2DA 4XS1A 4GSTA 2JSYA 1SL0B 2IFQB 1JZDA 4F03A 2DMMA 2ZCTA 1X0RA 4YH2A 2LS5A 3TCOA 2LUSA 3GL3A 17GSA 3Q18A 3LXTA 1ZZYA 3IV4A 3VWVA 4HS1A 3KD0A 1E2YA 2X8HA 3GTUA 3GH6A 4XRAA 2FCHA 2VLUA 1SKRB 5J41A 3APOA 2IMFA 2MMNA 2XBQA 7GSSA 1V98A 1HNAA 1G7EA 2IJYA 2NDOA 2QC7A 3KCMA 4OD7A 3DWVA 2H0HA 4I2TA 2DIZA 4IQ1A 5CYYA 4JU5A 4MA9A 2HRNA 2CAQA 3ZREA 4GQCA 2FNOA 3ZLPA 5B6NA 4JE1A 5AGYA 5J4UA 3ZTLA 3NOFA 1X9WB 2GQKA 3QFAC 3JCML 3A3TA 4J56E 3VWWA 3KM6A 5F05A 1AC1A 3F9UA 1F2EA 1SKSB 1QK8A 1J08A 1M2DA 4Q5RA 3EINA 3D22A 3LXZA 1URMA 5HQPA 5JCUA 1FVJA 5DBQA 2N5FA 1T00A 2QGVA 1WMJA 1M0UA 2YP6A 1E6BA 4L8EA 2HNLA 2C0EA 2B7JA 1JFUA 4GQFA 1Z7RA 4LMVA 2REMA 4F0BA 2FD3A 3ERWA 3LG6A 2VD0A 5KEJA 2LJRA 4BVYA 2GGTA 2I81A 4XS4B 4N0VA 3LFLA 1Z7PA 1XOBA 1XIYA 2H19A 5HFKA 2NBSA 4PQHA 2B6MA 2G2QA 5ID2B 4HDEA 4K0GA 5G5FA 5LNKe 5DCGA 1VF4A 1O8WA 1XZOA 3IC4A 2DJ2A 5ECKB 5E59A 3H4KA 1TJDA 3F8UA 4KA0A 3KIJA 4FO5A 1B48A 1XPVA 3HCZA 3TRXA 1EEMA 5GAPD 4RI7A 1SL2B 14GSA 4MH2A 1YF0A 4OCEA 1NHOA 1OYJA 5AIVA 3QFBC 1GWCA 2GSRA 1BYEA 3A5WA 2K8VA 1Z3EA 1T8EB 3BJ5A 2GT5A 1VF3A 3UVTA 1B8XA 1SK2A 1F3AA 2WS2A 5HR3A 4LL1B 1XWBA 1K3YA 1T1VA 2YV7A 3C1SA 5ECPB 2I3YA 1QXHA 1LJRA 1K0OA 5AIXA 2P0GA 2TRXA 1GSQA 3UAPA 1U3AA 2IMEA 4BL7A 1RW1A 4WR5A 4MABA 1FB6A 3ZIVA 4IN0A 5KN3A 4MLYA 1K0AA 3TJJA 3GX0A 3NIVA 5ECQB 1FOVA 3M9KA 5KN0A 2OE0A 3TKSE 1K3OA 2KP2A 4KSOA 4KUNA 5DQYA 5G31A 2LV3A 3V1WA 4IP6A 1GTUA 5LD0A 2PPTA 2VL9A 1AXDA 3TJKA 1OC8A 4ACSA 1GUHA 5EPFA 2VUPA 3P8WA 1R4WA 5ECRB 1EWXA 6GSWA 4XS6A 4ECCA 2O7KA 3HJOA 4IVFA 2C3QA 4P3YB 1FO5A 2JSZA 3LYPA 4QL9A 4PQIA 4IP1A 5DAKB 5CAXA 2DC5A 3N9JA 4TR0A 2M46A 2D2ZA 2HXKA 1ST9A 3CMIA 4DSSB 3VK9A 1N2AA 4WEYA 3E9JB 2H30A 4FYBA 1GL8A 3HY2A 2R6KA 2OBIA 3WGXA 3H79A 1JZRA 4ILFA 4IKHA 2LJAA 3ED3A 4FYCA 1MDIA 2WDUA 2AJQB 1MTCA 4RQXA 4ISDA 1QGVA 1Y6EA 4ZL8A 1AQXA 4IS0A 1A2LA 5CP1A 3GH9A 2M80A 3EMPA 1FVKA 2OE1A 2F9SA 1X5EA 3RHBA 4KGIA 1T4ZA 1JHBA 1AUCA 1OC9B 4BWSA 1UVZA 5A4UA 1V58A 2MMAA 4GSSA 3O6TA 1SYXA 1SJ6A 4CHSA 1A0RP 2J9HA 3VPQA 1X5CA 4K8MA 5ELAA 1YKAA 2CV4A 3VLNA 3TJFA 1QUWA 2RM5A 1O85A 3FK8A 1XW5A 2DSAA 1YQ1A 1WOUA 4XRDA 2PU9C 3EYTA 4LA1A 4NXIA 2N5AA 4L5OA 3C7MA 2PUKC 1H4OA 3WT2A 1TI1A 1EOHA 3EURA 1MDKA 1A0FA 4ZIJA 1O6JA 3TRPA 2R3XA 1LBKA 3GKMA 3EU3A 3I9V2 2LSTA 4NHZA 1U6TA 5G1LA 3GKKA 4EL1A 2TIRA 3M0FA 2H76A 1PRXA 2IL3A 1ZYEA 4L5LA 6GSUA 1JZWA 2WULA 2MMOA 4NV5A 5G30A 1KNGA 2GLRA 4TW5A 3R2QA 4L0UA 2LRNA 4YAPA 3D6IA 3GSTA 1SK1A 6GSTA 5H5QA 3CSIA 1TTZA 2R37A 6GSYA 3C71A 3HVXA 4D73B 2EIOA 1PD21 2C0GA 2PVOC 2GQLA 4RUVA 2VL3A 3DGQA 1G6WA 5J9CA 2C80A 2H0GA 4ZBDA 1GLQA 4K7IA 5IMDA 3TJBA 2O8VB 3BOAA 5IPHA 2YZUA 1JLWA 4HI7A 2K8SA 5IQYA 3QDNA 3KMNA 3FR6A 1TK5B 2C4JA 2CT6A 4MJEA 2GTUA 3F0IA 1S3DA 5IMFA 4J57E 3LWAA 1YJ6A 3W8SA 4MMMA 1S3CA 1TRWA 1N8JA 2LRCA 1XVQA 5KN1A 2YJ7A 5IMZA 3L9UA 1YEPA 2V2GA 4PGTA 2YWIA 1K0NA 4TVEA 4PNGA 1NW2A 3J7Yk 3HJPA 2V41A 2VIMA 4ZBAA 2R4VA 3TKPA 4ZXGA 1SL1B 4OO5A 4V2MA 5GSSA 4WKWA 2VCTA 3F3RA 6GSVA 3KH7A 3NZNA 2CX3A 1SJZA 1B9XC 4BPYA 3TOTA 2H66A 4IBPA 2YN1A 4XIHA 1KTEA 3EE2A 4QQ7A 2AAWA 3BCIA 3MSZA 2VO4A 2CZ2A 4TKYA 2IFQA 3HZ4A 3CSJA 4K0NA 1H75A 2FWFA 2G0FA 5COHA 3KP9A 4QL7A 1K0CA 4Q5QA 3EMXA 1FG4A 1GULA 5AISA 4ZL7A 2KOKA 2OBKA 1X5DA 2VM2A 1GRXA 4K7OA 2GQMA 3HXSA 3S9FA 3GFKA 3EC3A 2OACA 1W89A 1JZOA 4F9ZA 3KTBA 3GIXA 4JEDA 1IYIA 1ZCPA 3DXBA 4IJIA 1T3BA 1PL2A 2B3SA 3P90A 4WBRD 3HYPA 3TKQA 3F6FA 1B4PA 4PUFC 1AW9A 2P31A 5CRWA 3WD6A 3IOSA 2YWMA 1PSQA 1ACVA 2RLIA 2FLSA 1R26A 2I9HA 1F9MA 4E8EA 2JL4A 2MBSA 2DIYA 3UMAA 2O89A 5ECMB 3FW2A 3IBHA 3IR4A 2QSIA 3FHKA 2H6YA 5B7CA 5D9TA 2YANA 3IE3A 5IO0A 2CVDA 5LCZA 3F4TA 5JCWA 2GZYA 4IHUA 3IPZA 3FRCA 1AQWA 2E7PA 2L4CA 1PX6A 10GSA 2VCWA 2E2GA 2HZEB 5FHIA 2RUEA 1IYHA 5DCHA 1G0TA 4ZB8A 4EO3A 1GH2A 2B5YA 2HI7A 4HOJA 1VF1A 5D9WA 2A2SA 4KB3A 4G19A 2V6KA 4XS4A 1CQHA 4O5RA 2FA8A 1SK0A 5HFGA 1GNWA 4X1UA 3QR6A 4G10A 1Z5YE 2I1UA 5ID2A 4X0XA 3H93A 1V40A 2JZRA 2LQOA 4EUYA 2C8UA 1SENA 2NTOA 1TRVA 3HA9A 3C73A 4WF4A 1TW9A 4HU7A 3KP8A 1TI3A 2PBJA 16GSA 5GZZB 4KAEA 1O73A 3I6AA 3KTLA 4TOPA 2WGRA 1CQGA 1I5GA 5ECNB 2GVPA 2CZ3A 1TU7A 1OE8A 2YNXA 3PH9A 3A2VA 1EGRA 2HT9A 1T7PB 1GSDA 1WWJA 1J0FA 3W8JA 2B1LA 2B5EA 4MJBA 2H71A 1UA5A 1GTBA 3HVVA 6GSSA 1ZMAA 3EU4A 1ERUA 4HZ4A 4AJ7A 5IIZA 2VCXA 2C3NA 2KHPA 1V57A 5CNWA 1R5PA 2IMKA 1MEKA 4XTSA 1OAZA 4EC0A 3GX8A 3U5RE 3DVWA 4FIWA 1DSBA 4DSRA 3AY8A 3HJMA 4MK3A 1MD3A 4BWQA 3P7XA 4PQ1A 1UC7A 4E8HA 2FHEA 2VAFA 3W6GA 1EEJA 1XBSA 4DVCA 4YQMA 2HSYA 4ECJA 1PN9A 5DDLA 1DE1A 4RQRA 2B5XA 3ERFA 3US3A 1TXXA 2PMTA 4TR3A 1XCCA 2H74A 5HR1A 3QAGA 1A2MA 4JBBA 2KP1A 1BX9A 3UBKA 1FW1A 3UIWA 3CTGA 4MF6A 2XPEA 2PGTA 5ECLB 3P2AA 1X9MB 4X43A 1AQVA 4BA7A 3GN3A 5F07A 3VWUA 4J2FA 2H70A 4G9HA 5HFIA 2OE3A 2GSTA 4O32A 2HLSA 2X99A 4HJ2A 3FZ9A 1GTIA 5DAKA 5IM9A 1VGLA 1WPIA 3BD2A 2Z9SA 1XWGA 1FB0A 1EV4A 4MF5A 4RI6A 4TXOB 4DSSA 5B6MA 1GSSA 4BVXA 3EWLA 1O8XA 2LTKA 1K0BA 2B1KA 3F6DA 5J9BA 3RPNA 2LNSA 3ZL5A 3HHVA 4MPGA 1G6YA 1MD4A 3SBCA 3CSHA 3I69A 2QKEA 1VRSD 2AUVA 3H1NA 2O85A 2ZUPA 3LORA 3GURA 3VPTA 2BTOT 5H5SA 1GTAA 4O92A 3SWLA 3HDCA 1EP8A 1Y25A 2MMZA 4TXVA 2XPDA 2H8LA 3GUSA 1ZGNA 1V9WA 2H6XA 8GSSA 2JACA 1TU8A 3TGZA 1OC9A 4EE0A 2GSQA 5DALB 3LJRA 2HZFA 1TP9A 3VI7A 2H1BA 4K7NA 5CO3A 5F06A 5IOWA 2VM1A 2FY6A 5G2ZA 1HNCA 4TR1B 2GS3A 1GLPA 1Z6MA 2HSHA 3GL5A 3RPPA 4FYUA 4F0CA 3CTFA 1JLVA 3TKSA 2IWTA 2JU5A 2AHEA 1UN2A 5CRGA 1GSYA 4TRXA 3L78A 4AF2A 3APSA 2A4VA 5ECOB 4JR6A 4GTUA 1HQOA 2I4AA 3KXOA 1TRSA 2YPMA 1OKTA 3E0UA 3PR8A 2R5GA 5F8BA 1M99A 2H72A 1EP7A 5D9XA 1KEBA 5D96A 3CBUA 2A2RA 4DEJA 1BQ7A 4YQVA 3Q74A 2K18A 5HR2A 1QQ2A 3TRQA 2E2MA 3DRNA 4ZL9A 4PX1A 2CAIA 5EL8A 4LLRA 3BCKA 1M2AA 1U88A 3LYKA 3CRTA 3LEFA 3FZ5A 3M3MA 4D73A 3LQ7A 5EVOA 5ENUA 1OVNA 2OKAA 3GSSA 1GSFA 1RK4A 2KLXA 2VLTA 4ZILA 1R7HA 22GSA 5D73A 2C0DA 4IJ3A 2WJUA 2V1MA 4NV2A 2L6CA 2RUFA 1XW6A 4POKA 1PQNA 4KCEA 3IXRA 2IPAA 4N11A 1F6MC 3HKRA 1F37A 2FWGA 1SKWB 1XWCA 3ZMLA 2BJXA 3PGTA 2F8AA 1PL1A 5G1KA 3L4NA 1B4QA 3TOUA 2P5RA 2RM6A 2MZCA 2FGXA 2K9FA 1M9AA 1EGOA 2GT6A 5J5NA 1LU4A 4KDUA 3MWHA 4CDOA 3FKFA 4K9ZA 1J9BA 2LRTA 3TKRA 3WGEA 2H73A 4PNFA 1HD2A 2IMIA 1S3AA 2VCQA 3HVSA 2YZHA 3UL3A 4PUAA 1NHYA 3RAZA 2NVLA 4NMUA 1XWKA 3L9VA 4POLA 3M8NA 4MF7A 3VI5A 2DMLA 4MJAA 3D4MA 1WIKA 1DUGA 1QFNA 2DJ0A 3HZ8A 2H6ZA 3DVXA 4HQZA 1ILOA 4ML1A 5FT3A 4I2UA 3RDWA 1FAAA 1M9BA 4V1Ag 1PGTA 1SD8A 2CVBA 3FYGA 3KJYA 2VOCA 1U87A 5IOXA 1M7TA 4NPBA 3GV1A 5DVBA 1YY7A 5A4VA 1SD9A 5AN1A 4F2IA 3ZZXA 3IRAA 4WBJA 5C04A 4ZB9A 4HEA2 1W4VA 1TK0B 4OFMA 3C8EA 3DMLA 4PXOA 2X64A 1Q98A 4KE3A 1R5AA 1NM3A 5IMVA 5ABRA 3ISOA 2YV9A 2EIRA 3UBLA 3A2XA 3GTUB 1A24A 3L0HA 4JR4A 3VFIA 4NHWA 3GRXA 3IAS2 3WYWA 4N30A 2OADA 4ZBBA 1FHEA 2L57A 5FWGA 3O3TA 4I97A 3H8QA 5F0GA 5H5RA 1WJKA 2ALBA 2TRCP 1C72A 1PKWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite