4XRDA

Salmonella typhimurium ahpc w169f mutant
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 55
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xrdA00
3IV4A 3KJYA 2V6KA 1FW1A 1SK1A 2L6DA 2QC7A 5GAPD 3M3MA 1T4ZA 4GXZA 3TJKA 1ERTA 1X5DA 2PGTA 4GLTA 1WOUA 2XHFA 3BCIA 2H0IA 1TOFA 2HT9A 4FYCA 2XPDA 1NW2A 3MDKA 5CRWA 1BX9A 2NPBA 2EIRA 1ABAA 1TI3A 2XBQA 1B9YC 2AHEA 5COHA 1MD3A 2ZCTA 5DAKB 2CT6A 14GSA 2CVKA 1GL8A 5IMVA 2PVOC 2PPTA 8GSSA 1H4OA 2VCXA 3APSA 3F63A 4O5RA 3A2XA 1VF2A 5HR3A 4WR5A 1MTCA 4O32A 4L5OA 3E9JB 5DQSA 4PNGA 5HR1A 3TUEA 1GH2A 1R4WA 4P3YB 2PBJA 4WF5A 5DALA 3TJFA 5IO2A 3PR8A 2PU9C 3ZVJA 3TCOA 2GT5A 2N5FA 2WDUA 3BBYA 5D8IA 4OFNA 3FR9A 3RAZA 3IOSA 2H19A 18GSA 4XS4A 5CO3A 3ZRDA 5H5QA 3GYKA 1EP7A 1U3IA 3G7JA 2K8SA 4GTUA 5J41A 3FHKA 1Z9HA 3QFBC 3ZIVA 4DSSB 1ZOFA 1XZOA 2DIZA 1AQWA 1XBSA 3GKXA 1EGRA 4RI6A 4TR1A 2I1UA 3VI7A 4CHSA 3LWAA 4Z7XA 1VF4A 6GSWA 1O6JA 1PSQA 2H6ZA 2DIYA 1OC9B 4OO4A 4XTSA 2VD0A 3EURA 3TRPA 1GUHA 4IN0A 1ERVA 4ECCA 5D73A 1YF1A 1DE2A 1TXXA 3ERFA 1JZRA 3DRNA 4MPGA 4ID0A 2GSQA 3H1NA 3O76A 3PINA 5B8BA 5EVOA 2K6VA 5G5EA 3SBCA 5IMFA 5G1KA 2X8GA 3LYPA 3QFAC 4JEDA 5G5FA 2H66A 4OD7A 3CBUA 2CVBA 4ECIA 3TRQA 3PGTA 3D6IA 3VWUA 3DKSA 2HSHA 1G7EA 3EE2A 1A0FA 3HY2A 1A24A 4IKHA 3EYTA 3KP9A 4MPFA 4TOPA 1GTIA 2FNOA 12GSA 1FB6A 4ILFA 3HYPA 2DJ2A 1SJ6A 1M99A 3APOA 3TKPA 1Z5YE 1NSWA 1SKSB 1VF3A 3N5OA 4Q5QA 4ZB9A 2X99A 3GN3A 1MDJA 4POMA 3TDGA 1EP8A 2FWHA 1TU7A 1Q98A 1QGVA 1TRWA 3ZTLA 4O7HA 3LXTA 4RUVA 1Y25A 5IPGA 2OE0A 3GMFA 5CREA 2QKEA 3D4MA 3BCKA 2YNXA 3IDVA 1EGOA 1X9SB 3CSHA 3ZL5A 1ZCPA 4KB3A 3HXSA 2HNLA 2HE3A 2RUEA 1NHYA 3DD3A 5CP1A 3KZQA 5J9BA 1X0RA 1SKWB 2LJRA 4ULXA 1K0NA 3QMXA 3A5WA 4QL7A 3TKRA 3HJPA 4OWYA 1S3CA 2L4QA 2YZUA 3I43A 4NV5A 2LRCA 1F3AA 2A2SA 2MMNA 4HQZA 4F0CA 3BD2A 3FRCA 5ENUA 4G2EA 3P7XA 4GRFA 1YZXA 4LL1B 4O92A 1I5GA 4ECBA 2EIQA 3TB2A 3M1GA 1M9BA 5IMZA 4XIHA 2F8FA 1EOHA 4DVCA 2JADA 2LUSA 3ZYWA 5IPHA 3KH7A 3I6AA 4WR4A 3H8QA 1PX7A 2VM2A 2VD1A 4I97A 1EZKA 3ZFBA 4MJBA 5EL8A 3DMLA 4HEA2 1A0RP 3G7YA 5F07A 2YCDA 1GP1A 1K0CA 3HZ8A 5DCGA 5DCHA 2GQMA 1WP0A 3GL3A 5HFKA 4HUAA 3VWWA 4LLRA 4N30A 1M9AA 3D4TA 2IMKA 2DJ1A 3LFLA 5ECRB 2OADA 1XW6A 1GTAA 2IN3A 5G31A 1SYXA 5LD0A 2LS5A 2N5BA 1EOGA 5ECLB 3JCML 4MF7A 4MF5A 2GSRA 3IRAA 4MZCA 4L5LA 3ZITA 2JU5A 1K0DA 3J7Yb 5IIZA 4MABA 3GSSA 2VCWA 1PA3A 1H75A 1YY7A 2L59A 5H5SA 3FW2A 4AJ7A 2A2RA 4L8EA 4HI7A 3FZ9A 2E2GA 1A8LA 1YEXA 2QSIA 4IQAA 3M0FA 1O81A 2OBKA 1TTZA 1A8YA 2PUKC 4KSOA 1RQMA 4F9ZA 1B4QA 4NMUA 4X1UA 4POKA 3U5RE 3IAM2 1ACVA 2VCQA 2HZEA 2P0GA 2JSZA 3VPQA 3IHQA 1SJZA 3H4KA 4NHWA 1GRXA 2VL2A 5D93A 2O89A 2PN8A 3TKSC 2I4AA 4FH8A 1XWBA 1JLVA 1OC3A 3QDNA 3A2WA 1SD9A 4KSMA 3F3RA 4PUFC 5J9CA 2VOCA 2YV7A 1Z6NA 4ML1A 5C00A 2J9HA 2GLRA 3KEBA 3O3TA 2HZFA 2AYTA 4MZBA 3GTUA 2YPMA 3KH9A 3M9JA 2HXKA 2IJYA 3J7Yk 4OFMA 2H6YA 6GSYA 4PURA 1YKAA 2PERA 1O8XA 5F8BA 1GSUA 1XFLA 4V2NA 1EWXA 1UC7A 1BYEA 2P5QA 1OE7A 2IPAA 4GSSA 1OC8A 1SJIA 1V9WA 4IHUA 1SD8A 1TJDA 1XW9A 2F3MA 3A2VA 3WT1A 5F06A 2HFDA 6GSSA 4YQMA 2V1MA 2WCIA 4HJMA 4MCUA 4HDEA 3W6GA 3EVIA 5JCGA 3U6VA 4PXOA 3QPMA 5ECHB 2WGRA 2CV4A 2LJKA 2RM5A 2CQ9A 1Z7RA 2MBSA 4FIWA 1R5PA 5CRGA 4PX1A 2H73A 2XC2A 4OFTA 5ID2B 2V2GA 2REMA 5CRDA 5F0GA 2H0GA 4J2FA 3NOFA 2HRNA 1AQXA 3GX0A 2GGTA 2O85A 3E0UA 2R5GA 3HD5A 2H71A 1OE8A 2KHPA 2YP6A 2ZNMA 4TR1B 1TW9A 4JU5A 3IA1A 3S9FA 4K7IA 2LRNA 3RPNA 1OAZA 3RHBA 4BWSA 3DWVA 4RQXA 1V98A 4KCAA 2YWIA 1SK0A 3ERWA 2F51A 4J56E 3LXZA 5D96A 1NHOA 4ZL7A 5C04A 3GA4A 4MH3A 3QR6A 3DVWA 5A4VA 3KXOA 2LEGA 4L0UA 1SL0B 3LORA 1V58A 2I81A 1F6MC 5ECOB 3BOAA 3UEMA 2C3QA 3VWXA 1IYIA 2GDRA 3UOMA 4YQVA 3RBTA 2JZRA 4HQSA 1J0FA 1GSEA 1TU8A 3GV1A 1YF0A 2GQLA 1EEJA 2O8VB 5IO0A 4G9HA 4OO5A 1T7PB 4GCIA 4ZBDA 5LNKe 2B5YA 3IXRA 1Z3EA 2K8VA 3GKMA 5EPFA 5IQYA 4EL1A 1YQ1A 4MP4A 1JHBA 3WGDA 3E3EA 2C0FA 3EU3A 4KAEA 3KD0A 4K7OA 2NDOA 2C4JA 2V32A 4TXOB 3UIWA 1GTBA 4QQ7A 3FR6A 2AUVA 1O73A 1PKWA 3ED3A 1QK8A 1IYHA 1HD2A 4ZBAA 3IR4A 4H86A 5J3RA 2LV3A 2AAWA 2MMZA 2NTOA 2VCZA 2N5AA 3EWLA 1GSDA 3Q74A 4X0XA 3MWHA 1FHEA 1AQVA 2B7KA 3GKNA 1LBKA 4EVMA 1U6TA 1T1VA 3UAPA 3CTGA 2P5RA 4KCEA 4HOJA 2IWTA 4ISDA 1SL2B 3L9SA 1JFUA 2DBCA 2KLXA 3AY8A 1M0UA 1O7UA 2GTUA 3ME8A 3RPPA 2C3TA 5ABRA 1AAZA 1U87A 1CQGA 3TJJA 2WS2A 2DJ3A 1A2LA 1Q4JA 3FR3A 1R5AA 5JWOB 4TR3A 2R6KA 1K3OA 5INYA 3IBHA 4GQCA 2DC5A 4JE1A 1DBYA 2B5XA 1S3AA 4TXVA 2CX4A 1X9MB 2FWGA 3UVTA 4ZB8A 3L9VA 20GSA 4DEJA 1USBA 4NPBA 1CQHA 1Z7PA 3ERGA 2H8LA 1GSYA 2VM1A 1K0AA 3G7IA 4IELA 1TDIA 2MZCA 3DXBA 1FVJA 4K9ZA 16GSA 4IS0A 1QMVA 4XS6A 3LSZA 1ST9A 5FHIA 4AJ6A 2H30A 3C8EA 2DJJA 5G2ZA 4DSSA 4ZBBA 3KCMA 4YQUA 3FZ4A 2PWJA 3NZNA 4PQ1A 1FB0A 3WYWA 2JZTA 2ES7A 3KTLA 5FWGA 1W89A 3EINA 1XVQA 4K2DA 3DVXA 1U3AA 4GSTA 4PQHA 1LU4A 2TIRA 1W4VA 3GX8A 5DQYA 4IP6A 3IK7A 1FOVA 2TRXA 4MK3A 6GSXA 4E8EA 1AUCA 1HQOA 4HU7A 2FA8A 1YEPA 1R26A 1PD21 2L6CA 2C1YA 4N0ZA 1F37A 2LRTA 2MYGA 4TRXA 2YV9A 2C80A 3EMPA 3CSIA 3DYRA 5HQPA 4IJ3A 4GSNA 1QQ2A 3LJRA 13GSA 2LQOA 2OJLA 2FWFA 3QAWA 1T3BA 1O85A 1Z6MA 2JACA 2H1DA 4K8MA 2OBIA 1BAYA 4EE0A 2IIYA 3L78A 5AN1A 4F0BA 3RDWA 3HZ4A 3EU4A 1GNEA 4KGIA 5B6NA 1QXHA 2M80A 4HZ4A 3FY7A 1HYUA 3H79A 1F9MA 1ZMAA 1KBNA 3QOUA 3CYNA 4ZILA 2LSTA 1AW9A 2GZZA 2FA4A 2RM6A 1TK0B 2FGXA 4BL7A 2FUG2 1N2AA 5ECQB 3VWVA 4F03A 1SKRB 2IFQA 4PNFA 3GURA 2OE1A 5IOXA 1OKDA 3GTUB 4WEYA 1E6BA 3C73A 1OKTA 2DMLA 4GF0A 4AJ8A 1EEMA 1UVZA 3LG6A 3GHAA 4RQRA 3TOTA 1TP9A 4ECJA 2HYXA 4JR6A 2YOIA 5KN0A 3GL5A 2KUCA 1PMTA 5A4WA 1YDKA 2OACA 1WWJA 2VCTA 1PGTA 4ML6A 4K1FA 3FZ5A 3UVHA 2H1AA 1VRSD 3P90A 11GSA 3KP8A 1V2AA 2VLTA 2RIIA 3HHVA 4MF6A 2H74A 1GSSA 2FD3A 1WRYA 4WKWA 1URMA 5H5RA 2LNTA 3IC4A 4XCSA 3Q19A 2H01A 1B9XC 4Q5NA 2IMFA 1BEDA 4V1Ag 3HJMA 3ISOA 2O87A 1HNCA 3GUSA 3GKKA 1Y6EA 4KDXA 1QUWA 4POLA 3K8NA 4N10A 3PH9A 1FAAA 4ZXGA 1WJKA 1GULA 3L9UA 1F3BA 4I5QA 2FCHA 2B6MA 2M72A 2IL3A 4KUNA 2VAFA 3C1RA 3HCZA 3N9JA 3TKSA 1PN9A 2VCVA 4EF0A 3ZLPA 1SU9A 3P2AA 4KE3A 4G10A 4J57E 2R4VA 5A4UA 4HU9A 2KP2A 4ZIJA 2WZ9A 4WBJA 3UJ1A 4OMVA 1JZWA 2WJUA 4IQ1A 1SL1B 2VL3A 4MDCA 3KMNA 1J08A 4I2TA 5IM9A 3ME7A 2GT6A 1TRVA 2F9SA 22GSA 2L4CA 2QGVA 3GFKA 3MNGA 3HVSA 3WGEA 4EO3A 4KH7A 1ZZYA 4Q5RA 1XCCA 4EXJA 1JLWA 2KOKA 2V6OA 4JZQA 5DALB 3F4TA 4K0NA 4JRRA 2H75A 2H1BA 4AGSA 2F8AA 4ZB6A 4TN8A 5KN3A 1WIKA 4E8HA 3KGKA 1TK8B 3D5JA 3C1SA 3KIJA 1XPVA 5GSSA 1G0TA 4XS4B 1K3LA 5JWRB 1MDIA 3GIXA 4BA7A 2FLSA 2YJHA 5F05A 3Q6OA 3O6TA 4IVFA 3TRXA 5IOWA 4MZWA 2B1KA 1UN2A 1PX6A 5AIVA 3D21A 1XWAA 4TR4A 2BTOT 5A5KA 4LMWA 2CAQA 4HZ2A 4K6XA 1N8JA 2OE3A 4EDZA 1FVKA 1TK5B 1V57A 3D0ZA 4V1Ap 1EV9A 1PRXA 1XWCA 5B8AA 1XXUA 4EKZA 4QL9A 1AC1A 3HKRA 10GSA 1XIYA 3US3A 17GSA 1OVNA 1KEBA 2MMAA 2R3XA 1XW5A 2L5LA 2CZ2A 3C71A 1M2BA 3L0HA 2PVQA 5FT3A 3WD6A 4YAVA 5JCUA 2JL4A 1B8XA 1ZL9A 4EC0A 1GWCA 3HVVA 3V1WA 1ZYQB 2EIOA 5HFIA 5DJLA 1BJXA 2OKAA 4V2LA 3OR5A 4WXTA 2B1LA 4YAPA 4BPYA 2GZPA 1T4YA 2AV4A 1YKCA 1AXDA 4BVYA 5HR2A 2AB6A 5E4WA 4IW9A 4POBA 2AJQB 4FYBA 1SYRA 4D73A 3GH6A 5D9TA 4TVEA 2GSTA 1GUMA 1XVWA 5B6MA 6GSUA 1WE0A 4XHMA 1ON4A 2C0EA 3FYGA 4FYUA 4DSQA 1PL1A 1YJ6A 5JCWA 2TRCP 1UA5A 2C0GA 3GNJA 7GSSA 5ID2A 2WB9A 2V41A 2HI7A 4XS1A 3W8JA 2GSSA 4IBPA 1B4PA 4AF2A 3TGZA 3HA9A 4GQFA 4KDUA 1TRSA 5J4UA 2B3SA 3G9BA 5IMDA 2FY6A 5CAXA 1RW1A 5GSTA 3F6FA 5HR0A 3DEXA 5HFGA 3VI5A 2YANA 3BJ5A 3FZAA 1SENA 1A23A 4I6XA 5DAKA 1PQNA 3ZMLA 1E2YA 4F82A 3F8UA 3MAKA 4GWRA 4NXIA 2KP1A 3FK8A 5ECMB 3GH9A 4CW9A 3NIVA 2EC4A 3FKFA 1SK2A 2C3NA 3Q18A 1G6YA 2CAIA 3CSJA 2H72A 3I69A 4LA1A 1R7HA 3IK9A 2IMDA 1ERUA 3F3QA 1BQ7A 4TW5A 1T00A 4RI7A 1A2MA 4N11A 4XRAA 1ZYEA 3RHCA 1ILOA 3CTFA 3VK9A 3TJGA 5IMCA 3VFIA 2B7JA 1K0OA 2BJXA 3ZMKA 4TXOA 4TKYA 2B5EA 1XOAA 6GSTA 3HVXA 5ELAA 1GNWA 2J23A 2LKUA 3M8NA 2CZ3A 4YH2A 1FO5A 4Q5FA 1THOA 1DSBA 3GSTA 19GSA 5J5NA 3W8SA 5AISA 3CMIA 5DBQA 3LYKA 1DE1A 3D22A 5KN1A 1OC9A 1M2DA 2VO4A 1VGLA 2DLXA 2IFQB 5CNWA 2P31A 1O8WA 2G2QA 2BMXA 2H70A 2RLIA 3QD9A 4KNDA 3MSZA 3L4NA 3TKQA 4PQIA 5GZZB 1X9WB 3VURA 3LGCA 3KM6A 4ZL8A 3EC3A 5E59A 4MA9A 2X8HA 1JZOA 1JZDA 4ZL9A 4IP1A 1AIUA 1EV4A 4G19A 1K3YA 2X8CA 2YJ7A 2ZUPA 4PGTA 3R2QA 5ECIB 5L71A 2MBTA 2OA7A 4L0WA 1X5CA 1FG4A 1NM3A 1B48A 1XWGA 5AIXA 4I2UA 2C0DA 3APQA 2HZEB 3IPZA 2VUPA 2HRFA 4HS1A 3LQ7A 3GRXA 3F6DA 5ECSA 3KMOA 2GVPA 5ELGA 2LQQA 1THXA 2A4VA 4NAXA 3DIEA 2YWNA 2HSYA 3P8WA 5JWQB 2DJ0A 1M2AA 2VLUA 4HJ2A 3UMAA 1LJRA 1MD4A 3FEUA 2I3YA 3CRTA 2JSYA 1V40A 2H1GA 2GS3A 2LJAA 3F0IA 3TJBA 5D9WA 2MMOA 2WRTA 4FO5A 4KW6A 4MMMA 1PKZA 2X64A 3UARA 1M7TA 2VLVA 1QFNA 2H6XA 2IMIA 1TRUA 1KTEA 9GSSA 4BVXA 1GSFA 2NVLA 3M9KA 1K0MA 5ECNB 4X43A 5ECKB 1GTUA 5G30A 4CDOA 2CX3A 2E7PA 3ZFLA 2YZHA 1GSQA 2VIMA 1A2JA 4OCEA 1WMJA 2DMMA 4IGJA 1OYJA 2H76A 2VL2C 2E0QA 2JZSA 1XOBA 4V2MA 2YN1A 2LNSA 1MEKA 4WF4A 5D9XA 5IMAA 4LMVA 3KTBA 4MJEA 3UBKA 3DGQA 3HJOA 4F2IA 1HNAA 2GQKA 4KDYA 4MLYA 4DSRA 4LL4B 4TR0A 3SWLA 4MJCA 2RUFA 3CXGA 1T8EB 3IE3A 1F2EA 4I8BA 1C72A 1KNGA 2VL9A 4XRDA 1BG5A 1MDKA 1K0BA 2ON5A 2R37A 5DJMA 4NV2A 5AGYA 4JR4A 5EY6A 4BWQA 4N0VA 2WFCA 3F4SA 3QCPA 3H93A 4MH2A 3VLNA 4OCFA 1I9DA 2LTKA 4WETA 2I9HA 1TI1A 4EDYA 2K9FA 2L5OA 1PL2A 4PUAA 5KN2A 4NHZA 2XPEA 2IMEA 5ECPB 3VPTA 5CRHA 1GLPA 5DDLA 4ACSA 2H0HA 2YWOA 2K18A 1J9BA 2ALBA 1GLQA 5KEJA 1RK4A 2L57A 3TKSE 1G7OA 2NBSA 5DVBA 2HLSA 3ZREA 3IAS2 2O7KA 1S3DA 2PMTA 5B7CA 3TOUA 4NWYA 5G1LA 1G6WA 3ZIJA 2R2JA 2Z9SA 3EMXA 1VF1A 2C8UA 3ZVJD 4KA0A 3ZZXA 4EUYA 3C7MA 4K7NA 4K0GA 1GUKA 2WULA 5GAND 2ON7A 5D9VA 3A3TA 2M46A 2FHEA 2DSAA 2YWMA 3CRUA 1ZGNA 3F4RA 3LEFA 3UL3A 5CYYA 2FWEA 3QAVA 4JBBA 3I9V2 4IJIA 1WPIA 1XWKA 2E2MA 2CVDA 4D73B 3QAGA 6GSVA 4KX4A 2XBIA 3WGXA 2CA8A 2DJKA 3HDCA 1DUGA 1HNBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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