4XS4A

Salmonella typhimurium ahpc c165s mutant
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVSPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs4A00
4HI7A 2GQKA 6GSXA 1G6WA 4HJMA 2KHPA 2X8HA 1K0DA 4YAVA 1ON4A 1F6MC 4MZCA 3QOUA 6GSWA 4OFNA 4OCEA 1EV9A 4ECBA 2GZZA 1ZCPA 4ZBDA 2K6VA 5EL8A 5J9BA 3UEMA 2VLUA 2VO4A 2GSTA 5COHA 1XZOA 4WBRD 1O85A 4POBA 4NXIA 4MABA 1X5EA 4I97A 4FIWA 3KP8A 2HSHA 2IJYA 3H4KA 3MAKA 1ZL9A 4BA7A 1PKZA 1TKDB 2AB6A 3VFIA 4JR6A 3ME8A 4ILFA 2WS2A 3ZYWA 2R4VA 3GH6A 4HU7A 1F3AA 3L4NA 1QK8A 3FY7A 2CZ2A 4K6XA 1PL1A 3J7Yk 4DSQA 3KJYA 4IJIA 4PQ1A 6GSYA 4RI7A 5DVBA 2B5EA 4LLRA 3LYKA 1Q98A 1GSSA 2B1LA 2ON7A 2IMEA 2AAWA 4WEYA 1FW1A 4N11A 4OFTA 2E2GA 1JZDA 5DQYA 5HFIA 4EVMA 5F06A 2MMAA 4D73A 2IWTA 1N8JA 4NV5A 4K7NA 1GTUA 4V2MA 1SKSB 2IFQA 3LWAA 3GH9A 4WETA 4HUAA 5IO2A 3GTUB 4E8HA 3DVXA 5IMCA 4KSMA 5ECQB 1ACVA 6GSUA 3EU3A 5CYYA 2B5XA 2JZTA 3A2VA 1PN9A 5DAKB 1Q4JA 4IP6A 4YH2A 2H6YA 4IHUA 2G0FA 2YZHA 3V1WA 1VGLA 4K0NA 5H5RA 2MMZA 3GIXA 3FW2A 4LL1B 5IMDA 3FYGA 2B7JA 5HR0A 1DSBA 5AGYA 2QSIA 2CAIA 3VPQA 1EP8A 4MF6A 1M9BA 5DCGA 2V32A 1MTCA 5D9WA 1S3DA 3C71A 4PX1A 1OYJA 2YN1A 3F9UA 4MCUA 1XW6A 1WJKA 2GQMA 3LYPA 3QD9A 1A0RP 1V58A 3ERWA 2PUKC 1AIUA 3TDGA 4DSSA 3IR4A 1WMJA 2YP6A 4IJ3A 4K7IA 4F2IA 4IBPA 4ZBBA 3IE3A 1KBNA 4GWRA 4BVYA 4OWYA 4OFMA 2XBIA 4K1FA 3GMFA 2VIMA 3KTBA 2C80A 3N9JA 1B9XC 3PH9A 3BD2A 1SD8A 2DSAA 1XWCA 1XW9A 3F6FA 2HZEA 2KP2A 4HZ4A 1A23A 1K0OA 1FB0A 2CAQA 1BYEA 3DRNA 2DJ3A 2JSZA 3D0ZA 1BJXA 1OVNA 1Z7RA 5CRDA 1PMTA 5J9CA 2DMMA 1EGOA 2IMIA 2B7KA 2LJRA 1RW1A 5DJMA 2GVPA 1TK5B 3KH9A 2DMLA 2DIYA 3PINA 4ZL8A 2C0FA 2K8VA 1HNBA 1AW9A 1THOA 4GSNA 2JZSA 4BVXA 3HDCA 4RI6A 2O89A 1EOGA 2H1DA 3WYWA 2H71A 1TRUA 3APQA 5J5NA 2MMNA 5B6MA 3TJKA 2FNOA 4KUNA 1GSDA 2YWIA 5J41A 2GLRA 5KN0A 2FY6A 2MMOA 2Z9SA 1MDKA 4TXOB 3IRAA 1EV4A 1T4ZA 1V57A 3LQ7A 4NAXA 1GUMA 1BX9A 4J57E 4RUVA 1V98A 3DYRA 3US3A 4TR4A 19GSA 1TDIA 2WJUA 1GNEA 3LORA 4P3YB 4V1Ag 2TRXA 2FUG2 3M0FA 2VUPA 1EEJA 1BG5A 5ECIB 4GSTA 3ZMKA 2B6MA 5IOWA 1ERUA 3UAPA 1OE7A 1BEDA 1XOBA 3FK8A 1U3AA 3M3MA 4J56E 20GSA 2L5OA 3IOSA 4PXOA 4JE1A 3TB2A 2VD0A 1O6JA 3RBTA 4O92A 3FKFA 4ULXA 3RDWA 2LQOA 4JR4A 5IPGA 3HJMA 4OCFA 2WRTA 1YKAA 4KNDA 3D21A 2QC7A 3BCKA 3P2AA 2QKEA 1EEMA 2WZ9A 4ZL7A 2P5QA 1XCCA 4TRXA 4F82A 3EC3A 1Z9HA 3HXSA 1ZZYA 2M46A 2J23A 1OAZA 3UARA 1G7OA 3G7YA 4NHWA 3ERFA 1GWCA 2ALBA 3M9JA 4L0UA 3P8WA 3VK9A 1SJZA 1GULA 4ZIJA 1H4OA 4TW5A 2H1BA 1YEPA 2ZNMA 4IW9A 2HI7A 4PURA 1Z6NA 3GKNA 5IOXA 2AYTA 2VAFA 2WGRA 1R4WA 2IMDA 1K3OA 5G1LA 2PPTA 4EO3A 2H73A 2YJHA 4EDYA 1NHOA 1ML6A 5DALB 2LNTA 1EOHA 2X8GA 4AGSA 2C8UA 3FEUA 3H8QA 3DGQA 4XRDA 4WF4A 1QUWA 4I5QA 2H70A 4TXVA 4ECJA 4TOPA 1K3LA 1EP7A 2LRNA 3QDNA 5F8BA 1B8XA 2I4AA 2BJXA 18GSA 5ECNB 2C4JA 2H0GA 4YQUA 4XHMA 2N5AA 3QAGA 3GFKA 3EMPA 3UVHA 3VURA 4MP4A 1FG4A 1TRWA 5INYA 5LNKe 4KDYA 1M2AA 2R5GA 4Q5RA 1UN2A 3ZREA 2DBCA 1DUGA 1OC9B 3EWLA 2LSTA 1KTEA 5B6NA 2C0GA 3HKRA 3DXBA 1XOAA 3CSHA 10GSA 4TVEA 4KCEA 5B8BA 1XPVA 2MBTA 2L4QA 3GN3A 2CX4A 1GRXA 1EGRA 3ISOA 1KNGA 4V2LA 1QMVA 4ZB9A 4XRAA 2CX3A 3GTUA 1SL2B 1X5DA 4Z7XA 2RUFA 1T4YA 2E7PA 3BJ5A 2YWMA 3UBLA 2VM1A 2FWGA 5DAKA 3UJ1A 4F9ZA 1JZWA 2F8AA 1GLQA 1A2MA 3PR8A 2JU5A 1E6BA 1JFUA 4QQ7A 2VM2A 1K0AA 1T00A 4ZXGA 3CMIA 2V6KA 3TKRA 2X8CA 5D9XA 5CAXA 3GKXA 3TKPA 4POMA 1FVKA 3EYTA 3APOA 3CSIA 4KB3A 3QCPA 3IBHA 2LRTA 3O6TA 1GTAA 5GAND 4MPGA 4GXZA 4I2TA 3TJBA 3C73A 5DQSA 4MF5A 3GNJA 1JLWA 5F05A 4L0WA 3CBUA 2HRFA 2VCVA 3RPNA 1TXXA 3L0HA 2P5RA 1GP1A 2LTKA 2GT6A 4JU5A 4MJAA 1TU8A 2ZUPA 4LA1A 1PD21 4OO4A 1WRYA 3ZIJA 3A3TA 2BTOT 3QFAC 4BPYA 5G31A 5JCGA 3AY8A 4PUFC 2H30A 3I43A 5AISA 1JZRA 4Q5QA 1T1VA 3D4MA 4ZILA 3LG6A 2VCXA 2DJKA 4G2EA 1OC8A 2H8LA 3DVWA 3E9JB 3S9FA 5HR1A 2REMA 3GUSA 5EY6A 1VF4A 3F8UA 1SYRA 5IMZA 4I6XA 4PGTA 1XFLA 3GRXA 1SJIA 5GSTA 4L5OA 4RQRA 1UA5A 1X9WB 2EIRA 3KZQA 3RAZA 3KIJA 2GGTA 5ECSA 3ZFBA 4OO5A 4Q5NA 2VCTA 3E0UA 3LXTA 4IKHA 5G1KA 3F3RA 4NWYA 5AIXA 2H6XA 1A0FA 4MPFA 3IC4A 1BQ7A 2EIOA 3LFLA 3TUEA 3KH7A 1K0CA 5HQPA 3F4SA 1WWJA 2OADA 2LJKA 3HA9A 5D9VA 3TKQA 4FO5A 5IMFA 2CZ3A 3H93A 2C3TA 1GSUA 2LS5A 1PX6A 4O32A 1ERTA 1OKDA 3FZ4A 3GKKA 1J9BA 4GCIA 1V40A 4FYCA 3KCMA 4KA0A 5G5FA 1I9DA 1QFNA 2F3MA 4MF7A 2KP1A 2A2SA 2H0IA 12GSA 3BBYA 2EIQA 2O87A 3LJRA 1M99A 1PSQA 1SK0A 1S3AA 2GZYA 1GSYA 2YCDA 4F0BA 5ELAA 2M72A 4HJ2A 2IL3A 4K7OA 1VF2A 3CTGA 4K8MA 2RUEA 3TKSC 3EMXA 2L57A 1B9YC 3EU4A 3I6AA 4HDEA 1G7EA 4HZ2A 4FH8A 3O76A 4EDZA 1XWAA 2HNLA 1G0TA 4ZB6A 3KXOA 4ML6A 1V9WA 3U6VA 2X99A 3EE2A 2VLVA 1Z3EA 5IO0A 1YZXA 5HR2A 1U6TA 2PWJA 1MDJA 1BAYA 5D96A 4D73B 2GQLA 4GF0A 3SWLA 5GSSA 1EZKA 5A4UA 1SKWB 3ZVJA 5H5QA 1SL0B 2LNSA 3L9VA 2VL2C 3F4RA 5LD0A 5JCWA 1F9MA 4MK3A 2E2MA 4ISDA 3TJFA 5GZZB 2KLXA 3VLNA 4X1UA 3TRQA 3GA4A 1A8YA 1PRXA 3UMAA 4GRFA 5G5EA 1M2DA 2WB9A 13GSA 4BWQA 2CT6A 3ZRDA 3DD3A 1OKTA 3L9SA 4NHZA 2OKAA 4KGIA 2GSRA 3W8JA 4GQFA 4MZBA 2YV9A 3ZL5A 3KTLA 2PU9C 1XVWA 1W4VA 1QQ2A 4TR1B 2OBIA 1AAZA 5ECHB 5D8IA 3WGEA 5C00A 1UVZA 3DEXA 1M9AA 5A4VA 4MLYA 2DJJA 2QGVA 2WULA 3FZAA 2J9HA 5DALA 4L8EA 2OACA 1GSEA 3UL3A 1AQWA 3HVXA 1O7UA 2D2ZA 1H75A 6GSSA 1AQXA 14GSA 2AV4A 4WF5A 4IP1A 4MH3A 2V41A 1GH2A 4AF2A 1LU4A 3QAVA 1THXA 5DBQA 3KD0A 5DDLA 4XS4B 4FYBA 4IN0A 4KSOA 3IHQA 2VCQA 1T8EB 3F63A 4N0VA 3CTFA 1WIKA 5IIZA 3EVIA 2V6OA 1ABAA 4NV2A 1XWBA 1NM3A 3U5RE 3ERGA 1OC9A 4EUYA 5CNWA 1B4QA 2RM5A 2A2RA 2L6DA 4ID0A 1FO5A 5CP1A 2VCWA 2KUCA 3ED3A 1ZMAA 2WCIA 1JHBA 1R26A 1A2JA 2I1UA 4ECCA 3A5WA 1QXHA 3GSTA 1TK8B 3D6IA 1FB6A 6GSVA 1TP9A 2H6ZA 1U3IA 5IMVA 2DJ2A 4KE3A 4LMVA 2PN8A 2X64A 1XWGA 5GAPD 4QL9A 5ENUA 3W8SA 2YZUA 4O7HA 3WGDA 2ON5A 2OE1A 3WD6A 3QAWA 1GUHA 4ZBAA 1O8WA 3G7IA 3F6DA 2H1GA 5JWQB 4DEJA 3GSSA 2C3QA 3ZIVA 2H72A 4IELA 4POKA 1HNCA 3GV1A 1AQVA 3ME7A 3GYKA 4XTSA 3ZFLA 3KMNA 4BL7A 2AJQB 4HOJA 5G30A 2B3SA 2CVDA 4LMWA 4POLA 3CSJA 2VCZA 3LGCA 3RHCA 1IYIA 3LXZA 4MJBA 3DWVA 4PQIA 2FD3A 1VF3A 3M8NA 2I81A 3GHAA 2LV3A 4IQ1A 3CXGA 2H66A 2JACA 2FGXA 4XCSA 1Z5YE 3HJPA 1FHEA 3O3TA 1YF1A 2GZPA 1GL8A 4RQXA 3VPTA 2LRCA 4IVFA 4KW6A 4BWSA 1SENA 1XVQA 3ZMLA 3KM6A 4Q5FA 2L5LA 3IK9A 3TCOA 1GNWA 3ZVJD 4OD7A 5DJLA 2DC5A 1PL2A 2FCHA 2DIZA 3MDKA 1C72A 4EL1A 5KN3A 1XXUA 1URMA 1SK1A 3IK7A 1NW2A 1T7PB 2VD1A 1FAAA 3D5JA 2P31A 2WFCA 7GSSA 3QFBC 1SD9A 3I9V2 5G2ZA 2ZCTA 4FYUA 1MEKA 4ML1A 5D73A 2PVOC 1M7TA 1U87A 3DMLA 1YQ1A 2VL3A 4G9HA 3GX0A 2PMTA 3KEBA 2HYXA 5F07A 5DCHA 1YKCA 3A2WA 1ZYQB 1O73A 3F4TA 4KAEA 2XPEA 2RLIA 4PQHA 1B48A 4WR4A 3QR6A 2YPMA 2HRNA 4F0CA 1WE0A 5E59A 3NIVA 2DJ0A 1MD3A 3LSZA 3TJJA 1J0FA 2FWFA 1YDKA 4PUAA 1A8LA 3GURA 4ZB8A 2HE3A 1AC1A 1O8XA 1F2EA 1V2AA 3KMOA 2XPDA 2CVKA 1ILOA 4WBJA 5B8AA 1F3BA 4AJ6A 1OE8A 1PA3A 2CQ9A 2XBQA 2BMXA 3F3QA 2HZFA 3PGTA 2VLTA 2IIYA 1ERVA 2H76A 3UIWA 3Q19A 2N5FA 3JCML 4IQAA 3VI5A 5CREA 3TKSE 1RQMA 3HY2A 5J3RA 2P0GA 3TRXA 2GTUA 2B5YA 3GX8A 2OBKA 3FR3A 3UVTA 1GUKA 1GSFA 3KGKA 2IMKA 4DSRA 5ID2B 5IMAA 1Z6MA 4HS1A 5ECKB 2V1MA 3FZ5A 1TRVA 3GL5A 1XWKA 5J4UA 1TK0B 3W6GA 2OJLA 2PVQA 1GLPA 11GSA 1R5AA 3Q74A 3ZLPA 4TN8A 1SYXA 2IN3A 4YQMA 4AJ8A 4LL4B 2N5BA 3TRPA 4JBBA 3MNGA 4TKYA 4KDXA 1PKWA 2H0HA 1TW9A 4N10A 3VWWA 1VF1A 3M1GA 4JEDA 4CHSA 1Y25A 3R2QA 1DBYA 1CQHA 1AXDA 2LEGA 1XBSA 4JRRA 1OC3A 2NTOA 2DJ1A 2C1YA 1EWXA 3ZITA 4HQSA 3HHVA 3QPMA 3NOFA 4MMMA 3M9KA 2LQQA 4TXOA 1SL1B 5FT3A 4HU9A 2LJAA 1GTIA 4TR3A 4HQZA 4K0GA 3IAS2 3L9UA 2IPAA 4TR1A 1UC7A 4KX4A 3HVSA 1Y6EA 3VWVA 1DE1A 5ABRA 3FZ9A 4F03A 1WP0A 1YF0A 2M80A 2K8SA 2IMFA 2GSSA 1ST9A 2EC4A 4K2DA 2XHFA 3FR6A 4K9ZA 2L6CA 2K9FA 3APSA 5F0GA 4TR0A 1B4PA 3F0IA 1VRSD 4EC0A 2GS3A 3VI7A 1HNAA 2OE0A 4NPBA 5IPHA 4DVCA 2YOIA 4XS1A 1WOUA 1I5GA 5KN1A 3SBCA 4XS4A 3C1SA 2PERA 1YEXA 3C7MA 4HEA2 2O7KA 5A5KA 4H86A 4XS6A 1HQOA 3Q18A 4MH2A 5FHIA 2R3XA 3UOMA 1TU7A 2YNXA 3BOAA 3P90A 3K8NA 1G6YA 3H79A 5AN1A 3WT1A 1SU9A 1GTBA 3IDVA 2HT9A 2IFQB 2FWHA 2FA4A 5JWOB 1A24A 1QGVA 2JADA 4CDOA 8GSSA 5L71A 2AHEA 6GSTA 2H19A 4ACSA 4ZL9A 3HVVA 5E4WA 1JLVA 1W89A 5ECOB 3OR5A 1ERWA 5FWGA 2I9HA 2H75A 1TI1A 4MDCA 5HFKA 2G2QA 1K3YA 1XIYA 4WKWA 2FHEA 3D4TA 2PBJA 2KOKA 4EF0A 3HZ4A 4MA9A 2GDRA 3TOTA 4JZQA 1K0NA 9GSSA 5EVOA 4E8EA 3H1NA 1E2YA 3C1RA 3HYPA 2TIRA 3NZNA 3WGXA 1FVJA 5EPFA 1USBA 3E3EA 1M0UA 3GL3A 3A2XA 2YJ7A 1YY7A 5CRHA 3VWXA 3FHKA 5KEJA 3IXRA 5KN2A 2FWEA 4DSSB 1X9MB 3MWHA 5JCUA 4V1Ap 2C3NA 4AJ7A 1DE2A 3D22A 4WR5A 3FR9A 2MBSA 3ZTLA 4YAPA 3EURA 5CO3A 1TTZA 2JZRA 4KDUA 1SK2A 1NHYA 5CRGA 1O81A 4YQVA 3DIEA 3HD5A 2L4CA 5HFGA 4EE0A 3TGZA 4I2UA 3RPPA 5HR3A 3HJOA 2R37A 4EKZA 2HZEB 3CYNA 1ZYEA 3EINA 2NBSA 1YJ6A 1K0BA 3IV4A 3KP9A 3TKSA 1SKRB 5CRWA 3DKSA 1MDIA 4KH7A 1KEBA 4GQCA 2ES7A 2F9SA 1IYHA 5ECRB 3FRCA 4I8BA 4X43A 3G7JA 1NSWA 1M2BA 2HLSA 2O8VB 4WXTA 4O5RA 3VWUA 1X0RA 2HSYA 5B7CA 3UBKA 2RIIA 2XC2A 2JL4A 1FOVA 5LCZA 1AUCA 2E0QA 5ECMB 1ZOFA 2C0EA 2CVBA 1XW5A 4J2FA 1T3BA 3TJGA 1ZGNA 2HFDA 3CRUA 4ECIA 2CV4A 2CA8A 4GSSA 2JSYA 2GSQA 4L5LA 3ZZXA 2PGTA 1U88A 4MJCA 2VL2A 1MD4A 3MSZA 2C0DA 4EXJA 3N5OA 4N30A 2R6KA 1TJDA 1F37A 3J7Yb 1JZOA 4CW9A 4GLTA 3IA1A 4KCAA 1Z7PA 2H01A 3HCZA 4G10A 3HZ8A 2DLXA 1J08A 3WT2A 3C8EA 2R2JA 5IM9A 4N0ZA 2YWNA 5IQYA 3P7XA 2VOCA 1WPIA 2MZCA 4OMVA 4PNGA 2K18A 3IAM2 2OA7A 1PGTA 2I3YA 2WDUA 3RHBA 3Q6OA 2V2GA 4V2NA 3TOUA 1LJRA 1RK4A 1A2LA 1LBKA 2NDOA 1N2AA 3QMXA 4QL7A 2FA8A 2VL9A 3LEFA 4MZWA 2HXKA 5ID2A 3G9BA 4IGJA 1TRSA 5C04A 3CRTA 2OE3A 1SJ6A 3BCIA 4G19A 5ECLB 5JWRB 1TOFA 2NVLA 1S3CA 2H74A 1K0MA 1HD2A 2O85A 1R5PA 2F8FA 4PNFA 5D9TA 4XIHA 5ELGA 4MJEA 2TRCP 2YV7A 2FLSA 1TI3A 1X5CA 5D93A 2AUVA 2H1AA 1PQNA 2MYGA 4GTUA 2GT5A 3IPZA 4X0XA 2RM6A 1X9SB 2YWOA 5H5SA 4IS0A 1GSQA 2NPBA 2L59A 1HYUA 2A4VA 2F51A 5ECPB 1R7HA 2LKUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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