4XS6 | Genus

Total Genus 50

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	50
sequence length	163
structure length	163
Chain Sequence	SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAFHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title	Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant rcsb
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	50
structure length	163
sequence length	163
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2015-01-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4xs6A00

3BJ5A 3KMOA 2DSAA 2LRTA 2EIRA 4ZL7A 3VFIA 2IL3A 3KJYA 2I9HA 2GS3A 4J2FA 2R5GA 3RHCA 4X43A 3I9V2 2YWNA 5IIZA 3VPQA 3GMFA 2F3MA 4EC0A 5ECLB 3FY7A 4AJ8A 3PINA 5G2ZA 2I1UA 2L57A 4HQSA 1EGRA 1THXA 4PUAA 4AJ7A 1QQ2A 3R2QA 5D8IA 2MYGA 1AXDA 4Z7XA 3KZQA 4HDEA 4MK3A 4RI6A 4N10A 3TJJA 1XOBA 2PUKC 1K0AA 4N0ZA 1KBNA 1XBSA 2O85A 1XW9A 4NPBA 5C04A 2F8AA 4RQXA 1EEMA 2WDUA 2XC2A 3F3QA 1XWCA 1W89A 5IMFA 3VURA 3HCZA 3RHBA 2VL9A 2OACA 5KN0A 4J56E 2HRFA 2VLVA 3UVHA 1XIYA 4TR1B 1I5GA 2H75A 1KTEA 4CDOA 2B1LA 2C0EA 1SD8A 4GLTA 3P8WA 4I2UA 4NMUA 1TU7A 2IFQB 2B5XA 3UIWA 2XPEA 3TOTA 2CA8A 2ON7A 3N9JA 5DBQA 3LORA 1V2AA 1B9YC 1Y25A 2DLXA 2XBIA 1NM3A 2F51A 3D4MA 2REMA 3HVXA 4HI7A 2H01A 3IE3A 3KXOA 3MWHA 1T3BA 1J0FA 2YWMA 4E8HA 1A2JA 3GV1A 1YY7A 3CSIA 1ILOA 1ZMAA 4N30A 3IAM2 2H71A 1MDIA 2DC5A 3MAKA 3HHVA 4ZB9A 3LGCA 4GRFA 1Z5YE 2LRCA 2HZEA 4G10A 2RIIA 1SU9A 4GSTA 4RUVA 1BAYA 5HQPA 1THOA 4IQ1A 3APOA 3KH7A 1EV4A 1OE8A 3KTBA 4WF4A 1R4WA 4JE1A 4JR6A 5EVOA 4KUNA 4K0GA 3LQ7A 3L78A 1EP8A 3A2XA 2IJYA 1FAAA 4WXTA 3ERFA 3A2WA 2WZ9A 4POKA 1WP0A 1G6YA 2IMDA 2TIRA 3HVVA 3IR4A 1PX6A 4ACSA 1BQ7A 1T1VA 4IP1A 2IMIA 3H1NA 5B8BA 2FA4A 2PGTA 4BWSA 4EO3A 1M9BA 2YOIA 4GCIA 1ZOFA 2I81A 1TU8A 3QFBC 3O76A 5H5SA 1X9WB 4PNFA 2YNXA 1RK4A 3DMLA 3CRUA 2VD1A 4J57E 1E2YA 5ECSA 4KDXA 2RLIA 1R26A 4F9ZA 4MZBA 2GGTA 1XWGA 2FUG2 1ON4A 5F05A 1M0UA 4BA7A 2NBSA 9GSSA 5J9BA 3O6TA 4YQVA 1IYIA 1F3BA 2EIOA 4HZ2A 3LXTA 4WKWA 4IJIA 1A2LA 8GSSA 2LTKA 2A2RA 4NWYA 2V6OA 5KN2A 2DJ1A 4PNGA 2LJRA 5DVBA 2PU9C 2AYTA 5G5EA 1TTZA 3FKFA 5IQYA 3J7Yb 3DEXA 2GVPA 1SL1B 1T7PB 3H4KA 3NZNA 3ZRDA 5AIXA 2O87A 4PX1A 2OBKA 5E4WA 1T4ZA 1GSUA 4KSOA 2M72A 1NHOA 2OKAA 1FB0A 4JU5A 4O5RA 4V2NA 2DJKA 1R5AA 1VF2A 3NOFA 2KLXA 3L4NA 3ZMKA 1ZZYA 4K8MA 1PGTA 2PBJA 3QFAC 2C3TA 2ZCTA 2DMLA 4KX4A 4WBRD 3GNJA 3FK8A 1XW6A 1T4YA 2YJHA 2OE0A 4CW9A 2F8FA 5DALB 3GKXA 4GF0A 1TRVA 3DXBA 5ECNB 2FGXA 4IHUA 3IDVA 3MDKA 3PGTA 14GSA 3EURA 3LG6A 1B48A 4TR4A 17GSA 2FY6A 3QMXA 1E6BA 3VPTA 1GTBA 5L71A 3GL3A 4OFMA 3QAWA 1VGLA 1HNBA 5JWOB 2YWOA 12GSA 3F0IA 3HVSA 2FA8A 3DVWA 3LJRA 5G5FA 3HJPA 4AF2A 2YJ7A 1GSFA 1UVZA 3GIXA 3TJBA 2LUSA 1ACVA 1U87A 2L5LA 1KEBA 5GSTA 4KDUA 3KD0A 3A5WA 5J9CA 3MSZA 4YAVA 20GSA 3TGZA 2HI7A 2PWJA 3I69A 5DCHA 3D0ZA 3UMAA 1BJXA 2CVDA 2YP6A 1TI1A 1RW1A 2RM5A 2A2SA 3D21A 4JR4A 5DDLA 2YV7A 4D73A 1WMJA 1O8WA 3HXSA 1NHYA 2H8LA 4IQAA 2GTUA 3VWWA 2G2QA 3ZREA 4Q5FA 2PPTA 4F0CA 3CMIA 5IMAA 2LSTA 1F37A 4BL7A 4MPFA 3IOSA 2HSYA 2ALBA 2NVLA 3PH9A 4WETA 2FNOA 3G7YA 1QFNA 5IMCA 4IP6A 5G1LA 1PX7A 1EGOA 1FVJA 4ECJA 4MCUA 6GSUA 1GUMA 4EL1A 1A2MA 1SD9A 2B1KA 4KE3A 2N5AA 1JFUA 1NW2A 2V1MA 5D9WA 5LNKe 3QDNA 2DMMA 1YEXA 2HLSA 4KNDA 2RUFA 3S9FA 3F3RA 4POMA 1DBYA 3VWVA 2CT6A 2H6YA 4ZXGA 3L9SA 2MMOA 4ISDA 4IELA 2P5QA 1K3YA 1X9SB 2FWGA 4CHSA 2P0GA 3GX0A 1TP9A 2EC4A 4DSSA 2NPBA 4I2TA 3FHKA 3ERWA 3KIJA 3U5RE 1VF1A 4N11A 4XRDA 2DIZA 2H73A 1RQMA 1W4VA 4ZILA 5HFKA 5AGYA 4EUYA 1K0MA 1Z6MA 2VCZA 1GTIA 4EVMA 1B4QA 4JRRA 1GL8A 1PN9A 4IBPA 5CRHA 2XHFA 1OVNA 5IOXA 4LL4B 3FYGA 19GSA 1GP1A 4K2DA 4OO4A 2E2MA 2H70A 5FWGA 2R37A 3BCKA 4TW5A 2L5OA 7GSSA 3H8QA 5A5KA 1U3AA 3BBYA 2FWEA 5JCUA 4ZL9A 1F9MA 4MABA 1B8XA 1BEDA 3FZ9A 4IGJA 1DUGA 5CP1A 1F3AA 2OADA 4MF6A 1TRWA 5ECRB 3WGDA 4MMMA 1JZWA 2AV4A 3M1GA 3I6AA 2C0DA 3ERGA 4I8BA 1YKCA 4KH7A 4NHWA 3QOUA 1CQHA 5ELAA 4HJ2A 2CZ3A 2PMTA 2C1YA 1SK2A 3WD6A 2QC7A 1GWCA 4O92A 4DEJA 2LQOA 3EMXA 5ABRA 2C3QA 4JZQA 4X1UA 2CZ2A 3ZVJA 4EF0A 3P90A 2HYXA 1PL2A 1X9MB 3EU4A 2VIMA 3ZMLA 4Q5QA 3EWLA 1ABAA 1GH2A 2HE3A 5C00A 5GZZB 3LFLA 4MZWA 4IW9A 4IVFA 2AAWA 5IMZA 3M0FA 1O8XA 3EYTA 5IO0A 5G31A 2H30A 4X0XA 1WIKA 4NXIA 2QKEA 1OYJA 2VL2A 3EE2A 3G7JA 3IK7A 1A0FA 3UAPA 4I97A 2LEGA 1QUWA 1WOUA 1BYEA 4MJEA 4HOJA 3SWLA 2CX3A 3WGXA 3VWUA 2PN8A 2HZFA 5D9TA 2MBTA 2H74A 1YJ6A 4KGIA 2CQ9A 4ECBA 3LYKA 3TRPA 3FRCA 4DVCA 3ZFLA 1I9DA 5D96A 1OC3A 1HNCA 4IS0A 2C3NA 4HS1A 1C72A 1Y6EA 3Q74A 1OE7A 4OWYA 1EOHA 2GQLA 4PGTA 4GXZA 2H6XA 1OKTA 2H72A 1TJDA 1OC8A 2ES7A 3UVTA 3J7Yk 2OBIA 1X5CA 3H93A 2HNLA 2H1AA 1FVKA 1XCCA 2YN1A 2HT9A 3U6VA 1HYUA 1M2DA 2OA7A 2FHEA 2MMZA 3TJGA 5EL8A 4XS4A 1YF0A 6GSYA 1YF1A 2H76A 2VM1A 3E0UA 5G1KA 2YZUA 5B8AA 5DJMA 1PQNA 3L9UA 1V58A 1WE0A 3F4SA 4I6XA 5ID2A 6GSTA 1K0NA 1OC9A 4L0WA 1MDJA 2V32A 2J23A 1GTUA 4EE0A 1BX9A 1J9BA 3ME7A 1WRYA 2TRXA 5HFIA 3TKPA 5IO2A 1TK8B 1AC1A 2GQMA 1A24A 2VCQA 2MMNA 3APQA 3FZAA 4ZBAA 4TXOA 3IV4A 3V1WA 1GSSA 2GSSA 3Q19A 1F6MC 1GNWA 2C0FA 3AY8A 1TDIA 4PURA 3RBTA 1TK0B 3HA9A 1Z7RA 2H0GA 2JL4A 4PXOA 5ECQB 2M46A 5KN3A 1XVQA 2I3YA 3M9KA 3FR6A 16GSA 5KEJA 5ECOB 2JSZA 3MNGA 2D2ZA 3HDCA 2DJJA 1ZGNA 3C1SA 1ERTA 4L5LA 3EU3A 3W8JA 2JZRA 1GSDA 4KCEA 1ERWA 3IXRA 1ERUA 5J4UA 3FR3A 4QQ7A 3HYPA 5D73A 3LYPA 2H1BA 3GTUA 4ZBDA 1SJIA 3A2VA 4TR3A 5GSSA 2X8GA 2CV4A 5HR1A 2LRNA 4MLYA 5J5NA 4O32A 4K6XA 2KP1A 1TKDB 2K18A 4LLRA 2YZHA 1Q98A 1WWJA 3RAZA 2O8VB 5LD0A 2WCIA 3RPNA 3NIVA 5E59A 2V6KA 2DJ3A 5IM9A 3GH9A 1XWKA 4MPGA 1GNEA 1GULA 4LMWA 2HSHA 1QGVA 5DAKA 3OR5A 10GSA 1EEJA 2VL2C 3FZ5A 1K0DA 3TJFA 4FIWA 3UEMA 4KSMA 2LNTA 3ZL5A 1PSQA 4NHZA 4GTUA 6GSXA 4GQCA 2RM6A 5IPHA 4MF7A 5H5QA 2IN3A 1JZRA 1TRUA 1YDKA 3A3TA 4YH2A 3KCMA 4LMVA 2B5YA 1U88A 3LXZA 2E0QA 4F82A 1XXUA 3QAVA 1FHEA 1JZDA 3BCIA 4ZB6A 3TOUA 3HJOA 1K0BA 3C7MA 4PUFC 4ULXA 1H4OA 1GLPA 3F4TA 3F6FA 4BWQA 1QMVA 1PMTA 4YQMA 4EKZA 2Z9SA 2HZEB 2R4VA 5D93A 5AIVA 1S3DA 4L0UA 3TKQA 3UBLA 2OE3A 1T8EB 5D9XA 3C1RA 1R7HA 3ZFBA 2PVOC 3TDGA 4TOPA 1OAZA 4XS4B 2KOKA 5GAND 1U6TA 4LA1A 5CRWA 3ZIJA 4ZL8A 1S3AA 5J41A 3UBKA 4IJ3A 3PR8A 4PQIA 5CO3A 1LJRA 2LS5A 5FT3A 2TRCP 1EV9A 1SJ6A 5AN1A 2ON5A 1ZYEA 2CX4A 1ZL9A 1LU4A 3Q18A 5DQYA 4OD7A 4MDCA 2H1DA 4TXOB 3F8UA 5ECPB 4OFTA 2LJKA 2K8SA 3W6GA 3GFKA 1Z7PA 3GUSA 4ILFA 4K0NA 2JSYA 1SK0A 2JACA 4QL7A 3ZVJD 3L9VA 2V2GA 11GSA 4MF5A 5EPFA 1PKZA 1UC7A 1M2AA 1HD2A 2JADA 2YPMA 5G30A 5B6NA 3KGKA 5CYYA 1SKWB 1A8YA 2AJQB 2MMAA 1FG4A 2IFQA 4BPYA 2XPDA 1SL2B 2GQKA 3TKRA 1JLVA 4WR4A 2NTOA 2XBQA 1DE2A 4NV2A 2GDRA 3TKSA 5HFGA 3G9BA 4XIHA 1NSWA 4MJCA 4ZIJA 1TW9A 2H66A 1J08A 1R5PA 3C73A 3VWXA 3TKSE 1X5EA 1YQ1A 2GZYA 3LWAA 4E8EA 1JZOA 1PKWA 2DJ0A 2L6CA 2MBSA 3VLNA 2L6DA 2WS2A 3GKMA 5JCWA 4P3YB 2C80A 3RPPA 1IYHA 1MTCA 3IC4A 2B6MA 2R2JA 2GZPA 3H79A 3ISOA 2BTOT 2CVKA 4F0BA 3DWVA 1GUKA 1KNGA 3F63A 5GAPD 1SYXA 3D4TA 4OO5A 1LBKA 4ML1A 4POBA 4OCFA 2JZTA 18GSA 3GL5A 2WGRA 3QD9A 2GSTA 3M8NA 4GSSA 3LEFA 2GT5A 2LKUA 3DRNA 3GA4A 2X8CA 1AQVA 2K6VA 4WEYA 3VI7A 5JWQB 1XFLA 4KDYA 4KAEA 2E2GA 3WYWA 1AIUA 4Q5NA 4QL9A 4HEA2 2B7KA 3TCOA 4XS1A 2YCDA 2BJXA 3F4RA 1AQXA 1ZCPA 3TRXA 1EZKA 3QCPA 3E3EA 4V2MA 1BG5A 3CXGA 1X0RA 2P5RA 2QGVA 3IAS2 4ECIA 3CBUA 2MZCA 4DSRA 4F2IA 2C8UA 4HZ4A 1ST9A 3QR6A 3P7XA 13GSA 4K7IA 1UA5A 3O3TA 5ECMB 4PQHA 2R3XA 5F07A 1VRSD 2C0GA 3HZ8A 5FHIA 4D73B 3EVIA 2HRNA 4IKHA 1N8JA 2YANA 3M9JA 3C71A 4RI7A 2H19A 4MZCA 1XWAA 4HU7A 2BMXA 3VK9A 4KB3A 4GSNA 5CRDA 3CTGA 1MD3A 5DQSA 1S3CA 4GQFA 2VCVA 3ZTLA 3D6IA 3ZZXA 2VCXA 4MJAA 2L59A 1EWXA 1G6WA 4XHMA 3APSA 1K0CA 5LCZA 1G7EA 3DGQA 3C8EA 2H1GA 1SJZA 4ML6A 2KHPA 3GKNA 4HU9A 3WT1A 4FYBA 1AAZA 1HQOA 1V57A 3KH9A 2LV3A 5DALA 3Q6OA 1PRXA 4L8EA 3HKRA 1V9WA 4MJBA 4MH3A 2JZSA 6GSVA 2IIYA 1AUCA 4G9HA 1JLWA 4FH8A 4TVEA 2R6KA 1X5DA 2FWHA 2LJAA 2WRTA 5JWRB 4DSSB 2L4CA 1A23A 1Q4JA 2H0HA 3TKSC 2VM2A 4JBBA 3E9JB 4OMVA 4G19A 2GT6A 4XTSA 2VLTA 2X64A 5CREA 3LSZA 2CAIA 5IMDA 1XOAA 2VLUA 4K1FA 1GSEA 2B5EA 1ML6A 1QXHA 3ED3A 1DSBA 4H86A 1SKRB 4MP4A 2IWTA 4NV5A 3IBHA 1G7OA 3GURA 4KCAA 4AGSA 5ENUA 2OE1A 1ZYQB 2H0IA 4HJMA 2YV9A 1A8LA 3US3A 1TRSA 1SKSB 4EDYA 2FCHA 2WB9A 2IMEA 3UOMA 3IHQA 3EMPA 2PVQA 2FD3A 4HQZA 3WGEA 2VD0A 3GKKA 3JCML 3TRQA 3CYNA 2X99A 1B4PA 2IMFA 1TI3A 3GRXA 2IMKA 3IPZA 1T00A 1H75A 3GH6A 3EC3A 1O73A 1FB6A 2VO4A 2GZZA 4BVYA 2DIYA 5F8BA 4IN0A 5F06A 1M2BA 3P2AA 3SBCA 5B7CA 4OCEA 2E7PA 3N5OA 1FOVA 1FO5A 1O81A 3ZIVA 1SL0B 2K8VA 1VF4A 1EOGA 1UN2A 4XS6A 3VI5A 5F0GA 3GN3A 2M80A 5D9VA 1EP7A 1TOFA 4V1Ag 1O6JA 2FWFA 5KN1A 1GSYA 5J3RA 1DE1A 2QSIA 1YZXA 3G7IA 5IPGA 1GTAA 4LL1B 3L0HA 1B9XC 5B6MA 3W8SA 4YAPA 1SYRA 4POLA 1O7UA 2YWIA 2GSQA 3TJKA 2VCTA 4EDZA 3BOAA 1VF3A 4MA9A 3EINA 4WBJA 4V2LA 1XWBA 2GLRA 3D22A 4ZB8A 3M3MA 2AHEA 2A4VA 3GHAA 4XRAA 3FEUA 1K0OA 3DIEA 2X8HA 1GLQA 5HR2A 4TXVA 3KTLA 3K8NA 3UARA 2CAQA 4TN8A 3IA1A 3FW2A 3UJ1A 2K9FA 1URMA 3HJMA 1M7TA 1M9AA 4Q5RA 4TRXA 3RDWA 3GX8A 5HR0A 1V98A 3GSSA 3DKSA 1O85A 2KUCA 3F6DA 5JCGA 2G0FA 3TB2A 1MDKA 2O89A 5A4UA 3BD2A 3DYRA 2OJLA 2VL3A 4FYUA 5DJLA 5ECIB 3UL3A 3DVXA 2GSRA 2EIQA 3KP9A 2VUPA 3CTFA 4XCSA 3IK9A 3HD5A 2L4QA 1AQWA 1XVWA 5COHA 4V1Ap 5AISA 1JHBA 2JU5A 4FYCA 5ID2B 1OC9B 2PERA 2N5FA 2ZUPA 3QPMA 1SENA 2DBCA 2F9SA 2ZNMA 3GYKA 4WF5A 1FW1A 4KA0A 4TR0A 3HZ4A 1G0TA 4ID0A 2KP2A 4L5OA 2FLSA 5IOWA 1A0RP 3CRTA 3ZLPA 1USBA 4RQRA 1QK8A 5HR3A 3KMNA 3F9UA 1GSQA 2C4JA 2WJUA 4JEDA 1Z3EA 2AB6A 4TR1A 4F03A 3ME8A 1PA3A 5ELGA 3KP8A 2O7KA 2NDOA 1GUHA 1YKAA 1XZOA 2HXKA 3WT2A 1TXXA 1HNAA 22GSA 1Z9HA 4MH2A 1OKDA 1XW5A 4HUAA 5CNWA 5IMVA 2V41A 2I4AA 3IRAA 5ECKB 1GRXA 1K3OA 2LQQA 3D5JA 4WR5A 3ZYWA 2IPAA 2VCWA 3QAGA 4AJ6A 2N5BA 3GTUB 3KEBA 5A4VA 1M99A 6GSSA 1MD4A 5ECHB 5CAXA 2VOCA 5H5RA 4K7NA 5DCGA 2B7JA 2H6ZA 4I5QA 2LNSA 3I43A 2B3SA 1F2EA 4O7HA 5INYA 1AW9A 4ECCA 1Z6NA 4NAXA 1SK1A 4G2EA 1WPIA 2VAFA 4EXJA 5A4WA 6GSWA 3HY2A 5EY6A 5CRGA 1PL1A 4FO5A 1K3LA 1ERVA 4K7OA 3TUEA 1XPVA 3CSHA 3CSJA 5DAKB 1PD21 2WULA 1MEKA 4GWRA 3FR9A 3ZITA 2RUEA 2CVBA 3FZ4A 1WJKA 2DJ2A 4DSQA 4K9ZA 2HFDA 2J9HA 3GSTA 2AUVA 4OFNA 4YQUA 1CQGA 1U3IA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4XS6A

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations