5B6MA

Crystal structure of human peroxiredoxin 6 in reduced state
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
221
structure length
221
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-6
publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 221
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6mA01
5IMAA 1THOA 2XPDA 3Q6OA 4TR1B 1T8EB 1WWJA 1XCCA 2YV7A 5CO3A 4MF5A 1XXUA 1XWBA 2OE1A 4K7NA 5G5FA 3LSZA 4V2NA 6GSTA 2CX3A 1QGVA 4KSOA 2JZTA 5GZZB 3ZTLA 5F8BA 4L8EA 4L5OA 3VWXA 5DAKB 3E3EA 3FR3A 1V98A 2RUFA 1YKCA 2K8SA 4JEDA 6GSYA 3VLNA 6GSVA 1AUCA 4PUFC 5DBQA 2LJRA 5G2ZA 2DJ2A 1A0RP 3F4RA 4F03A 3VWVA 4J2FA 4OO4A 1EGRA 4KSMA 3TKSE 1OC9A 3IHQA 4N11A 1S3AA 5ELAA 4JRRA 4QQ7A 1EZKA 4YQUA 3GX0A 5HR2A 2AHEA 3E0UA 2ALBA 2FNOA 5CYYA 2MBSA 2F9SA 2O85A 4TRXA 2RIIA 2AJQB 4XS6A 4OFNA 3PH9A 4XS4A 4XIHA 2F8AA 2O87A 1LJRA 5HFKA 3TJKA 1ZMAA 4IKHA 3KP8A 2GQMA 2C0DA 4GSTA 2VM2A 2F8FA 2KLXA 4O7HA 1MD3A 4KCEA 22GSA 1M2AA 3CTGA 3KGKA 4HI7A 2JU5A 4MABA 2YANA 4GXZA 4F0CA 4AGSA 2HLSA 1OE8A 1PKZA 4POMA 5GAPD 3QMXA 5ABRA 1M0UA 2DJ3A 4ULXA 3LXTA 1K0DA 4TXOB 3F8UA 2L6DA 3FEUA 2DSAA 5HFGA 4MZWA 2B5EA 1TDIA 4LL1B 3BOAA 1R4WA 2GT6A 2H0HA 1XOAA 3BD2A 4FO5A 1E2YA 3IK9A 5FT3A 3GMFA 5ECMB 1TW9A 1ERWA 2TRCP 3L9VA 1YEXA 2HZEA 12GSA 1XW9A 4J57E 4EL1A 5JWQB 4KAEA 2OE0A 1SKSB 1TRWA 4DEJA 4HS1A 4MA9A 1QXHA 1YY7A 3HDCA 1C72A 4GF0A 4GSSA 2LEGA 3ERWA 4O32A 5ELGA 4K6XA 2O89A 3KIJA 2P5RA 4ZB8A 5JWOB 3LGCA 4CHSA 2G2QA 4DSSA 1ZYEA 2YJHA 2R4VA 1OAZA 4POKA 4YQVA 1WRYA 3BCKA 3GTUB 5LD0A 1GSDA 5G1KA 2D2ZA 3ZVJA 3RPPA 2G0FA 4EF0A 4IN0A 4WBRD 5CRDA 2KOKA 2LSTA 3D4MA 5KN0A 5AGYA 3HD5A 5ECQB 1MDJA 2GQLA 2IMDA 3KTLA 4IHUA 3DVWA 4Q5RA 3LEFA 2EIQA 2NTOA 3DMLA 2MZCA 2C80A 4O5RA 2E2MA 1XBSA 2VOCA 4IBPA 1BX9A 4BPYA 4RUVA 5J9CA 4BA7A 1TRUA 2WJUA 1PRXA 4XRDA 3GYKA 3FRCA 4CDOA 4BVYA 2FA8A 2E0QA 4NAXA 2LRCA 3DRNA 5A4VA 1HNAA 4NV2A 1F37A 4WBJA 1PKWA 3QPMA 4WKWA 3A5WA 1Z6MA 4KH7A 3APQA 5IM9A 2NBSA 3RDWA 1VF3A 2CZ2A 2QSIA 2X64A 5D93A 1TP9A 3H79A 4EO3A 3CRTA 2YCDA 3ZVJD 4GRFA 2H66A 3Q74A 1GWCA 5D96A 1THXA 1GLPA 4EVMA 3QFAC 1V40A 2PBJA 4QL9A 4FH8A 4EE0A 4RI6A 3GHAA 1Z6NA 3NIVA 4GQFA 3DKSA 4LMVA 2GGTA 4ZILA 3UBLA 3A2XA 2DJ1A 3L78A 3G7YA 4Q5NA 4KW6A 5HR0A 3EMXA 3EINA 5F0GA 1Z3EA 1G7OA 3M1GA 1O7UA 4K0NA 3KMNA 2AAWA 4K7OA 1I9DA 4YQMA 1XVQA 1PD21 4YH2A 2YWOA 3LYPA 5ECSA 2JSYA 4IW9A 2R3XA 2F3MA 1K3YA 1BQ7A 3EE2A 4HUAA 1H75A 1U88A 1E6BA 3M9JA 1GNEA 3QFBC 1XWGA 2WCIA 4ISDA 2V2GA 2DMMA 4KDXA 4KGIA 1GSYA 1QFNA 2B5YA 4H86A 3C71A 2IFQB 1F3BA 2I9HA 4JE1A 4JR6A 1TRSA 2P31A 2VL2C 2EC4A 4RQXA 3VFIA 2DLXA 6GSWA 3NZNA 2CT6A 2MYGA 5CAXA 3OR5A 3D0ZA 1MEKA 4IGJA 2C0FA 4I2TA 4YAVA 3HKRA 4FYBA 1ACVA 4I6XA 2GLRA 4MJEA 5A4WA 2KHPA 3UOMA 5C00A 3C7MA 2GSTA 4OCEA 4GWRA 3P7XA 3ZMLA 3GH6A 2KP1A 4NWYA 1G0TA 2V6OA 2WFCA 2GDRA 4JZQA 3J7Yk 5IMDA 4RQRA 5IOXA 5AIXA 1JFUA 2X8GA 1PN9A 2V1MA 5CREA 3WT2A 1SENA 3LWAA 4DSRA 2C0EA 3TUEA 1HQOA 4X0XA 1Z5YE 4G2EA 1A23A 5JWRB 1WJKA 2HE3A 2YZHA 2QGVA 3WYWA 1G6WA 3MAKA 3CSHA 3FR6A 5D73A 2V32A 1PL2A 3F4TA 2FA4A 2R37A 1M7TA 2VCZA 3HCZA 1GUKA 3H1NA 4PNFA 3ERGA 3UMAA 2X8HA 4V2MA 4TR0A 1MD4A 3N9JA 1V9WA 2CX4A 4Q5QA 1TI3A 4K8MA 2XBQA 3W6GA 1A8LA 5G31A 5GAND 1B4QA 2VLTA 2H0IA 5GSSA 4ZB6A 3I6AA 3EURA 1QUWA 3MNGA 2H74A 1Z7PA 1EOGA 2NVLA 2XHFA 3D4TA 3M3MA 4OWYA 4ZL7A 2FWEA 4HJMA 3TOUA 5IMVA 3QAGA 1SU9A 3ERFA 4OCFA 1AQXA 1XIYA 4IVFA 4NPBA 1ST9A 2IL3A 1BEDA 2VCVA 1PX7A 2CAQA 5DQYA 4IELA 3GN3A 4ECJA 3U6VA 4F9ZA 2HSYA 2AV4A 2YJ7A 5EL8A 1KNGA 1YF0A 3L0HA 2PU9C 4NHWA 5DAKA 1O8XA 2FWGA 4K7IA 2ON7A 2P0GA 2M80A 1XPVA 3TOTA 2MMZA 1FVKA 1TRVA 3DGQA 1WP0A 1NW2A 4MJAA 2H30A 2EIRA 3QDNA 4HZ4A 3IV4A 2K8VA 2C3NA 3TJGA 3IAS2 3FZ9A 4IQAA 2IMFA 4MH3A 1AQVA 2LRTA 3KXOA 1V2AA 1FAAA 2HYXA 4OO5A 1OKDA 2FWFA 2L57A 3TCOA 4OFTA 3U5RE 4I2UA 2H0GA 4L0UA 1GLQA 2L5OA 2OE3A 3RPNA 3I9V2 2VUPA 5G5EA 8GSSA 3QOUA 1V57A 4AF2A 3HA9A 2H8LA 1K3LA 1XWKA 3FR9A 4MZBA 4JR4A 5INYA 4TKYA 5B6MA 3FW2A 5LCZA 5DJLA 1X5EA 2VL2A 1VRSD 4WXTA 1PQNA 4JU5A 1MDKA 4XRAA 2GT5A 2YPMA 1OC9B 3F0IA 1JZDA 2WZ9A 1TK8B 4HQZA 4TR4A 3UJ1A 2N5FA 5D9VA 4AJ6A 2JSZA 1ABAA 1K0NA 3TRPA 4ZBDA 1GSUA 2CQ9A 5IO2A 2AB6A 5B6NA 4TVEA 2VD1A 2VD0A 2LTKA 4LMWA 1F6MC 3APSA 5GSTA 4GTUA 2WGRA 4E8EA 4I5QA 1YQ1A 5HFIA 1KEBA 5A5KA 1TKDB 16GSA 3GX8A 3FZ5A 5JCGA 1JLWA 4DSQA 5IPGA 2GZYA 2IMKA 4HJ2A 3LXZA 3PINA 1B9YC 4N0ZA 3LORA 1F9MA 4HZ2A 3ZMKA 2YWMA 1ML6A 3S9FA 2J23A 5ID2B 1B8XA 3VURA 3ZREA 5A4UA 4IJIA 1FB0A 5EVOA 2FY6A 4WEYA 2WDUA 2XC2A 3GSSA 5D9TA 3GSTA 5C04A 5KEJA 3US3A 2TRXA 1J9BA 5CP1A 3VI7A 3GH9A 3HJOA 4V1Ap 3GTUA 1O73A 1SYXA 1AIUA 1OC3A 3I69A 2R2JA 1A2JA 1M9BA 2HZEB 1SD9A 3EU4A 3L9UA 4ILFA 5IQYA 2P5QA 5G30A 4I97A 4PUAA 1X9MB 1GRXA 1AAZA 3IPZA 2RLIA 4KCAA 1T3BA 2IMEA 4KE3A 2H70A 2GSQA 2ZCTA 2L4CA 1OVNA 3HHVA 3IRAA 1TJDA 3G7IA 1R26A 13GSA 4D73B 4EUYA 3GKMA 2LV3A 3GRXA 1TK0B 2DIZA 1ZL9A 2PN8A 3F4SA 1GTIA 1UN2A 4IJ3A 3D5JA 1JHBA 4EXJA 2B5XA 3F6FA 3ZIVA 3LFLA 1XW6A 1CQGA 3TJBA 4NMUA 1Q4JA 3ZL5A 2ON5A 3Q19A 4WF5A 2X8CA 2KUCA 1N8JA 3CBUA 3MWHA 6GSSA 2N5BA 1M9AA 3NOFA 4DVCA 3HVVA 4V1Ag 1PSQA 4POLA 2CV4A 3TRXA 3WT1A 4HOJA 4AJ7A 3EC3A 1GSSA 5CNWA 5J5NA 1O8WA 5E59A 1K0CA 2ZUPA 1F2EA 1M2DA 1GULA 2LRNA 4KA0A 2V6KA 2IJYA 4PQIA 2H1GA 2IPAA 4MCUA 3CSJA 1A24A 2X99A 3GURA 1AW9A 3F63A 3TRQA 2O8VB 3A3TA 3TKPA 1QMVA 1UVZA 4N10A 1KBNA 5ECPB 5D9XA 2DC5A 2OBIA 5F06A 4WR4A 4IS0A 3TB2A 4TN8A 4FYCA 1X9SB 3IE3A 3HJPA 5IO0A 2LKUA 3O3TA 3F6DA 3DWVA 2H1AA 2J9HA 1O6JA 3IC4A 4TOPA 3M0FA 1X9WB 2HI7A 2DJKA 2H19A 1GSEA 2YN1A 3FY7A 1H4OA 1S3DA 1VF1A 3ME7A 1U3AA 3AY8A 2R5GA 3UBKA 3DEXA 3MSZA 3O6TA 2DBCA 2LQOA 1IYIA 2VCWA 2RUEA 3I43A 1PL1A 4ZIJA 4EC0A 3HVXA 2FCHA 2IFQA 1G7EA 4N0VA 3UIWA 3H4KA 1MDIA 2MMNA 1TOFA 2HFDA 1YF1A 3TJFA 5ECRB 1K3OA 5J4UA 5H5QA 3M9KA 2H72A 2A4VA 1DBYA 3RHBA 4Z7XA 2PMTA 5F05A 3LQ7A 1Q98A 2H1BA 3HZ4A 5IPHA 4TXVA 5ECLB 1GL8A 4ZB9A 3APOA 1N2AA 2B7JA 1A8YA 1R5PA 4ZXGA 4GSNA 2FGXA 4MPFA 3EMPA 1K0MA 1AXDA 4WF4A 3FKFA 4JBBA 1B9XC 2YNXA 2VL3A 3TKQA 3H93A 3LJRA 2YWNA 2HNLA 2LUSA 3GUSA 6GSUA 5IMFA 2I3YA 5KN2A 1YKAA 1W89A 3VPQA 3IR4A 3DYRA 2LS5A 1HNCA 2CAIA 5JCWA 4BWSA 5B7CA 1RK4A 2I1UA 4I8BA 2VO4A 2L4QA 4KUNA 4X1UA 2GZZA 2GSRA 2HT9A 5IIZA 2K9FA 4GCIA 2B1KA 4NXIA 5DALB 1SYRA 2FHEA 4ECCA 19GSA 1S3CA 2WS2A 4ZBAA 1V58A 4PQHA 1OKTA 14GSA 3KM6A 2BJXA 5DJMA 4G19A 4MPGA 2VM1A 2H1DA 3ED3A 3KCMA 4N30A 2DMLA 4ECIA 4WR5A 2VIMA 4NHZA 1GTUA 3WD6A 2A2SA 1YEPA 1T00A 1EP7A 4K9ZA 1X5DA 1VF2A 2HRFA 17GSA 3UVTA 1NHOA 4ECBA 5D9WA 4MZCA 1GTAA 5FWGA 3UAPA 3ISOA 3UVHA 4TR1A 5AISA 3P8WA 2AUVA 5ECHB 2XPEA 3LG6A 4F82A 2BMXA 1JZOA 1VGLA 3ZYWA 1XOBA 1ZYQB 3IDVA 1J0FA 1RQMA 2GQKA 3D22A 2L59A 2VL9A 1URMA 3EVIA 2HZFA 1USBA 3GIXA 2GVPA 3KTBA 5B8BA 1WPIA 1EEMA 2KP2A 1B48A 2WULA 1FVJA 5J41A 1QK8A 3P2AA 2C3QA 1EEJA 2OA7A 2PERA 3QD9A 2CVBA 1K0AA 2JL4A 3UEMA 5HQPA 1OE7A 3CRUA 3ZFLA 1HYUA 1OC8A 2PUKC 4IP6A 1K0BA 2CVKA 2YOIA 1T4YA 3ZLPA 2K18A 3GFKA 1AC1A 2E7PA 1B4PA 3C1SA 3K8NA 5B8AA 4HU7A 3FYGA 5H5SA 3UL3A 2DIYA 5JCUA 4CW9A 3FK8A 9GSSA 1TTZA 3ZITA 3R2QA 3W8JA 1XW5A 1JZRA 2L5LA 3GV1A 1DE2A 1ERVA 1BAYA 4MDCA 1K0OA 4ID0A 1T4ZA 4FIWA 5L71A 4GLTA 4QL7A 2WRTA 3F9UA 5AIVA 4MK3A 1KTEA 1FOVA 4EDYA 3QR6A 4J56E 5KN3A 3D6IA 3ZRDA 2DJJA 2R6KA 1XWAA 1XFLA 4TXOA 5DDLA 5DVBA 4XS4B 5ECIB 1SKWB 3KJYA 4XHMA 4K0GA 2Z9SA 5EY6A 3VWUA 4IP1A 1TI1A 1SK2A 2EIOA 1SJZA 2H01A 4OMVA 1JLVA 4V2LA 4PXOA 4BWQA 2VAFA 2B6MA 5ID2A 2MBTA 2I4AA 2HXKA 3JCML 1Y25A 3IBHA 6GSXA 5ENUA 3F3RA 2VLUA 3DIEA 4G10A 3ZFBA 3TKSC 2B3SA 3V1WA 1EGOA 3GKKA 1SK0A 3BBYA 3SBCA 1M99A 2MMAA 4YAPA 3F3QA 5D8IA 3H8QA 2B1LA 2LNSA 3D21A 1GTBA 10GSA 3BJ5A 2WB9A 2ES7A 3GL5A 3RAZA 5HR1A 2TIRA 3ZZXA 3C73A 2B7KA 3A2WA 3M8NA 4L0WA 2YWIA 4TR3A 3IK7A 4HDEA 2PPTA 3GKXA 2K6VA 1G6YA 5KN1A 1WIKA 5ECNB 1NM3A 1SKRB 2OADA 4KX4A 3SWLA 4D73A 3VI5A 5EPFA 2NDOA 2RM5A 1VF4A 2XBIA 3EU3A 3HZ8A 2VCXA 4PURA 2IN3A 1ILOA 4DSSB 1A2MA 3W8SA 2LJAA 5FHIA 3GA4A 1BYEA 3IAM2 3P90A 3QAWA 3DVXA 3HXSA 1MTCA 4PNGA 2JZSA 4K2DA 2OBKA 3L9SA 1XZOA 1T1VA 3HYPA 4ACSA 2L6CA 4GQCA 11GSA 3O76A 1FG4A 4KNDA 2H6ZA 1LU4A 3CYNA 4MF6A 4FYUA 2VCQA 1XWCA 2C8UA 4ML6A 5J9BA 2FD3A 1HNBA 2HRNA 3CMIA 5CRGA 5DCGA 1NHYA 4K1FA 3EYTA 2ZNMA 1SL1B 1AQWA 1UA5A 4F0BA 2OACA 4O92A 1T7PB 4ZL9A 2RM6A 1A0FA 2H76A 2YV9A 1Z7RA 2VLVA 4MP4A 1GSQA 4PX1A 1ERUA 4KB3A 2PWJA 5AN1A 1ON4A 2IWTA 2O7KA 1U6TA 2VCTA 1FW1A 1TU7A 1HD2A 2CVDA 3RHCA 2IMIA 3GNJA 1GUMA 4LA1A 4XTSA 3C1RA 3KMOA 3VWWA 1WE0A 1WOUA 2H6YA 3ZIJA 3J7Yb 3A2VA 2PVOC 3DD3A 2H6XA 1TXXA 4WETA 2OKAA 2YP6A 1SJIA 1SL0B 3EWLA 3VK9A 4X43A 5HR3A 5LNKe 2BTOT 3MDKA 1BG5A 2GSSA 1LBKA 4BVXA 1F3AA 2C3TA 5DQSA 4IQ1A 3BCIA 4HEA2 1DSBA 2LJKA 5COHA 3CXGA 3PR8A 4MF7A 3RBTA 4OD7A 1DE1A 1SL2B 3FZ4A 1X5CA 4AJ8A 3TJJA 5IMCA 1UC7A 1FHEA 2V41A 1SD8A 2FUG2 1OYJA 3IXRA 3WGEA 3WGDA 2PVQA 3KEBA 3UARA 1O81A 5DCHA 2QKEA 1QQ2A 2I81A 1O85A 2H75A 3PGTA 2F51A 4ZL8A 2MMOA 3WGXA 2H73A 1EV9A 4ZBBA 4HU9A 3TKSA 1X0RA 2JZRA 3KZQA 4PQ1A 2LNTA 4ML1A 1ZZYA 1YDKA 1PA3A 2N5AA 3KP9A 1J08A 4TW5A 1A2LA 2CA8A 7GSSA 4MH2A 2AYTA 1GNWA 4F2IA 3KH9A 1PGTA 5IMZA 2C0GA 5G1LA 4MLYA 2A2RA 2GS3A 4G9HA 4NV5A 4Q5FA 20GSA 2E2GA 1EWXA 3IOSA 4EDZA 1TU8A 5H5RA 2GZPA 3ME8A 1R7HA 2FWHA 2REMA 18GSA 3CSIA 3L4NA 5CRHA 3IA1A 3TDGA 4MMMA 3DXBA 1GH2A 4E8HA 5IOWA 5F07A 3CTFA 5DALA 3G9BA 2C4JA 2GTUA 2M72A 3QCPA 4EKZA 1EOHA 5E4WA 1XVWA 1U87A 1WMJA 3Q18A 1EV4A 4P3YB 1PMTA 3VPTA 4MJCA 5CRWA 1ERTA 1YZXA 3HY2A 2H71A 1FB6A 4XS1A 4LL4B 1I5GA 2NPBA 4LLRA 1CQHA 4HQSA 3TKRA 1M2BA 2DJ0A 3FZAA 4MJBA 3GKNA 1EP8A 1TK5B 1GSFA 1PX6A 1DUGA 2PGTA 4POBA 4KDYA 5ECKB 2HSHA 3GL3A 1GUHA 1ZOFA 4KDUA 1SK1A 2JADA 1SJ6A 3FHKA 3KH7A 1RW1A 4RI7A 1ZGNA 4PGTA 5J3RA 4L5LA 3HJMA 3HVSA 1JZWA 4BL7A 2IIYA 2LQQA 1BJXA 1W4VA 2YZUA 1Y6EA 3G7JA 2CZ3A 2FLSA 1Z9HA 1IYHA 1YJ6A 4XCSA 1U3IA 3KD0A 1R5AA 2M46A 1GP1A 2QC7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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