5B6NA

Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in sulfinic acid state
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
221
structure length
220
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-6
publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 220
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6nA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6nA01
2GSSA 4BVYA 3TKRA 2ALBA 3E0UA 5ABRA 1B9YC 2CX4A 1OE7A 1YKAA 2V6KA 1K0MA 1Y25A 4IBPA 3QDNA 1SL1B 1B4PA 4ECCA 2NBSA 3EU4A 5IM9A 4K7IA 3NOFA 2C3QA 2GLRA 4XCSA 1VRSD 1K0AA 1EZKA 5IMDA 1W89A 3HKRA 4CDOA 2H6YA 2CVKA 3IV4A 3TKSA 1ZYEA 4ML6A 2XBIA 5IOXA 3VLNA 3WGEA 1M9BA 1GLQA 2JL4A 1F6MC 5F07A 4BWSA 1O6JA 3DEXA 4FYCA 1K3OA 4BPYA 1X9SB 1SD9A 2C80A 5J41A 2ZUPA 2VD0A 1IYHA 2VIMA 4TOPA 2H01A 14GSA 1VF1A 3TKQA 2YNXA 1TK8B 3C7MA 1T4YA 4ULXA 5C00A 2X8GA 2PN8A 5J9BA 5B6NA 1V98A 3HDCA 3RDWA 4OCEA 3BCKA 2FCHA 2I3YA 1PRXA 4KW6A 1YKCA 6GSVA 3TRPA 5H5QA 2TRCP 2YANA 3FR3A 2YZUA 1EEMA 5AISA 4GRFA 4RUVA 13GSA 1KBNA 1OC9A 3CSJA 1B8XA 2V1MA 5DALB 4MF7A 3H8QA 2WB9A 3GKMA 1F37A 3E3EA 3FK8A 1QQ2A 2R4VA 3BD2A 3UBKA 4XS1A 2LNTA 4O5RA 2OKAA 3NIVA 4JZQA 4BWQA 4L5OA 4MLYA 4L8EA 3KZQA 4RQRA 4WBJA 6GSTA 5HR0A 3UBLA 2BTOT 1BG5A 1HNBA 2OBIA 4JRRA 2GSQA 4YQVA 1WMJA 3DRNA 5EPFA 3TOUA 2JU5A 2QGVA 2MMOA 5G1LA 2CAQA 1A23A 2IMDA 2YV7A 2QKEA 2WDUA 5D9VA 3KMOA 1TK0B 1PD21 4QQ7A 5H5SA 5GSSA 1U3AA 1X9WB 2QSIA 2YJ7A 2XC2A 5DAKB 3ZFLA 3GKKA 2K9FA 1NW2A 2B3SA 4POMA 1UVZA 2RLIA 3ZMKA 1PA3A 4EUYA 4KA0A 2AUVA 1J08A 3RHCA 4KB3A 4TR1A 4EL1A 3P8WA 1SJZA 2VD1A 5F05A 3GRXA 3WT1A 4IELA 1TRUA 2VL2C 1PQNA 1KEBA 5E59A 2KP1A 3HXSA 1TXXA 1FVKA 5ECOB 3M0FA 2H1BA 3F6DA 5ECQB 1ABAA 1G7OA 4FO5A 2F51A 1AAZA 4MF6A 2E2GA 3US3A 5KN1A 4IQ1A 3ERFA 4I97A 4X43A 5DBQA 1DE2A 1ACVA 17GSA 1YEXA 1PSQA 4MP4A 3F6FA 4OCFA 5GZZB 3KEBA 3FEUA 4P3YB 2B1LA 3P7XA 5G31A 1AUCA 2GQKA 1E2YA 3D0ZA 3TGZA 3UL3A 1YY7A 1VF2A 4XRAA 5ECHB 4RQXA 1XWGA 4V2LA 1ERUA 5D9WA 1XWBA 5CO3A 4HUAA 2KUCA 3SWLA 3GYKA 4KX4A 2DJ0A 1QFNA 1ZYQB 4Q5QA 1WRYA 3F0IA 1NHYA 3HCZA 3WGXA 4POKA 4PNFA 5B7CA 2WULA 1WOUA 5F8BA 3E9JB 4KH7A 3ZRDA 2KOKA 2I1UA 4OWYA 2EIOA 1GTIA 3C1SA 1SKRB 3CTFA 3QR6A 4IJ3A 1O81A 1ZZYA 3D22A 5GSTA 1AIUA 4HU9A 3LG6A 2WJUA 3RBTA 1Z9HA 3GV1A 3CRUA 4DSSA 4IN0A 1BEDA 1MDJA 1IYIA 2O85A 2IFQB 3SBCA 1FOVA 5DQYA 2X64A 4PXOA 3JCML 3GUSA 1A2JA 2DIZA 2H8LA 10GSA 2HYXA 3UEMA 2RM6A 2AB6A 3ZLPA 2PERA 4PNGA 2OJLA 2HXKA 4IVFA 3C1RA 1AXDA 1X5CA 3ZL5A 5CNWA 2FHEA 4DEJA 5A5KA 2HSHA 4XRDA 2VAFA 3GH6A 1R5PA 2XPDA 2ES7A 2VO4A 5HR1A 4KCEA 1PX6A 3FYGA 5DCGA 3LJRA 1SYRA 1XVQA 1U87A 4GXZA 3A3TA 2J9HA 3LEFA 2FWFA 1GP1A 1FB0A 5B6MA 1XXUA 2GSTA 3BJ5A 2L5OA 4CHSA 1A8LA 2CX3A 4PGTA 4EE0A 1CQGA 5A4WA 1YF1A 4FIWA 5HFIA 3PH9A 4WF5A 2MMZA 4ZL7A 2LRTA 3L9UA 2H6XA 6GSUA 7GSSA 3DKSA 2R6KA 1EGRA 2KLXA 4J2FA 3LYKA 5FWGA 3C71A 4RI7A 1LJRA 2FY6A 4NAXA 4N0ZA 2P31A 1GWCA 3WYWA 3TKSC 3Q6OA 2BJXA 1XOAA 1PGTA 2HLSA 5JWRB 4OFTA 4RI6A 2O8VB 3WT2A 1VGLA 3LQ7A 4H86A 3QCPA 2EIRA 3APOA 4LMWA 2VCQA 5CAXA 1JZWA 4KUNA 2C3TA 3A5WA 4F0CA 1TTZA 4WKWA 2LRNA 3HVXA 4BA7A 4HJ2A 2RIIA 3IDVA 1I9DA 2I4AA 4ZBAA 2XPEA 2H66A 4TXOA 4ECIA 2B6MA 1TOFA 2VL3A 3IAM2 2WZ9A 2IJYA 2PWJA 4JBBA 3TOTA 1ZCPA 1Z6MA 3VPQA 2H30A 3HJPA 1ST9A 1OKTA 2X99A 5ECMB 1JHBA 1TRVA 1EV9A 1AC1A 3QMXA 1NSWA 1UC7A 1OKDA 1O85A 4EKZA 1G7EA 1GLPA 4TRXA 4DSQA 3EC3A 1O8XA 1YQ1A 4F82A 2IMIA 2DJ1A 1BQ7A 3GNJA 3HJMA 1H4OA 5D73A 3IR4A 1GL8A 2WGRA 4MPFA 2HNLA 3DD3A 2I81A 4EF0A 3KD0A 3TJGA 4CW9A 3G7YA 1T1VA 4POLA 1QUWA 3GFKA 3MSZA 2EIQA 3GURA 1G0TA 2OE0A 2H76A 5AIVA 2P5RA 2R2JA 3Q19A 2F9SA 4MJAA 2DJ2A 1A8YA 3GMFA 1SK0A 2GZZA 1K3YA 1ON4A 3ZIJA 2HE3A 1TDIA 3IE3A 20GSA 2PUKC 4IQAA 3H93A 5IO2A 1AQXA 1B9XC 3UAPA 2MMAA 2PBJA 2VLTA 4K7NA 4XTSA 4ZBBA 5LD0A 1M99A 4OFMA 2FNOA 3H79A 2JADA 4MCUA 4TW5A 4KCAA 4KAEA 3IHQA 2NPBA 4PUFC 1AQWA 5A4VA 3H4KA 1A0FA 2YCDA 4XS4A 2YWIA 1URMA 1SKSB 3FZ4A 2LTKA 4YQUA 3FRCA 1FW1A 2FGXA 3F4TA 5FHIA 1GUKA 4E8HA 1HNCA 1K0OA 1GUMA 3BOAA 3FY7A 5IMAA 3H1NA 2FWHA 3VWVA 1SKWB 5ECNB 4GQFA 4TR3A 2E7PA 1A2MA 1KNGA 2L6DA 5ECRB 2C0GA 2CZ2A 1MD4A 4MZWA 5DCHA 3G7JA 1PL2A 2VUPA 4O32A 1VF3A 3GL5A 1U6TA 2CV4A 1R5AA 2VM1A 4WETA 5ECLB 2H6ZA 4K8MA 1S3CA 4BL7A 3VWUA 1KTEA 3PGTA 3ZZXA 3D4MA 5D96A 1TP9A 4LL1B 2C0EA 4YAPA 3DWVA 3S9FA 3FR9A 2H1AA 4NXIA 5JWOB 4WF4A 3G9BA 1TI1A 3HVVA 4KDXA 1JZOA 2GGTA 5D9TA 3M8NA 4IJIA 2H1DA 1QXHA 4ECJA 1PKWA 3VURA 1SU9A 1ZL9A 5AIXA 2D2ZA 5ECKB 3EYTA 1OYJA 3V1WA 3W6GA 5DJLA 2M80A 2VCVA 4L5LA 4QL7A 1XW6A 3ZFBA 2H72A 4MJCA 4DSSB 6GSWA 1SYXA 3FR6A 3UOMA 4GTUA 1EEJA 4IKHA 5EL8A 4ACSA 5ID2B 1M2DA 2LJAA 1XZOA 2H70A 3NZNA 2AAWA 1H75A 4LA1A 4IS0A 4EXJA 4HDEA 4NHZA 1TK5B 3IOSA 4K7OA 3F3QA 1YDKA 4IGJA 4JR6A 4F2IA 4NV2A 1TU8A 2HSYA 1WIKA 2AYTA 1JZDA 1OAZA 4GSTA 4WXTA 1THXA 4HEA2 4I2TA 2IN3A 4NHWA 3HVSA 1MTCA 5E4WA 5ECPB 4I5QA 1ML6A 2FD3A 3EWLA 5IMVA 3ERWA 4I2UA 1ERWA 4IHUA 3TKPA 3EE2A 3P2AA 3WD6A 3CTGA 4FH8A 2L57A 3M9JA 1U88A 2B7KA 3KIJA 3D4TA 4ECBA 4AGSA 1V9WA 2VCZA 2YWNA 1W4VA 2CA8A 11GSA 4TXVA 3VWWA 16GSA 4PQIA 2B5EA 3FZ9A 1HNAA 1M7TA 1M9AA 3FZAA 1F3AA 2GS3A 4HZ4A 1LU4A 3GL3A 1WPIA 3TKSE 1FG4A 2ZNMA 1JLVA 5DALA 2OA7A 3L9SA 2VM2A 1ILOA 2FA8A 2RUEA 4N11A 4GSSA 3GTUB 1F3BA 5IOWA 2GZYA 5COHA 3A2XA 2A2SA 3VFIA 2CAIA 4Q5RA 4NMUA 1WWJA 5CRWA 3GIXA 4J56E 3D5JA 2AHEA 1T00A 3PR8A 1ZGNA 3F4SA 5INYA 1X9MB 1HD2A 1USBA 3GSSA 4MK3A 2TRXA 22GSA 3DVXA 4ZB6A 1RQMA 4D73B 3D6IA 2VCTA 2H0GA 2PVQA 1FHEA 2LSTA 3ISOA 2H0IA 1MD3A 12GSA 3KH7A 2I9HA 4Z7XA 2K18A 3ZREA 2H74A 2R3XA 3HD5A 4N10A 2YN1A 1QGVA 5G1KA 18GSA 1YZXA 4ZIJA 2F8FA 1WE0A 3QOUA 4HQZA 2XHFA 4YAVA 2VL9A 1K0BA 2FA4A 1TRSA 2GT6A 4KNDA 4EDZA 5KEJA 4XIHA 5DAKA 3KTLA 1A2LA 5EVOA 4HI7A 4HOJA 2A4VA 3ZVJA 1V57A 1NM3A 1XFLA 2LUSA 2PMTA 4ZXGA 5B8AA 4HS1A 4ZL8A 4L0WA 3F63A 5GAND 4HZ2A 1PN9A 1JFUA 4KDYA 4ZB8A 3RHBA 5LNKe 2OBKA 4F03A 4KDUA 5AGYA 3EMPA 4GCIA 4WBRD 4HU7A 2KP2A 2LRCA 3TCOA 2V41A 1MEKA 3QAVA 4EO3A 3KJYA 3TJKA 3CMIA 1FB6A 1YJ6A 5GAPD 4IW9A 2NTOA 2C8UA 3EVIA 5ECSA 4EVMA 4K1FA 2EC4A 3KMNA 2IIYA 3VPTA 3CSHA 1T4ZA 3ZVJD 3IK9A 5HR2A 1E6BA 1XPVA 4PQHA 2IWTA 2LKUA 2B1KA 5KN2A 5IQYA 4Q5NA 3KP8A 1Z7PA 2GVPA 3HZ4A 1XW5A 3LWAA 2JZRA 1O73A 5CYYA 2G0FA 3IBHA 3QPMA 5IMFA 3TRXA 5IPHA 2CQ9A 4GLTA 1OVNA 1OE8A 2YZHA 3C73A 3RPPA 3TJBA 5HFGA 2IPAA 3HYPA 3CRTA 3KP9A 5JWQB 4WR4A 3TJFA 2B7JA 4MPGA 1O7UA 2C3NA 2HFDA 3Q74A 4ZL9A 3TDGA 1M0UA 3IXRA 3L9VA 2N5BA 4ISDA 3ED3A 1GULA 3KH9A 1JZRA 3CBUA 1SD8A 3TJJA 2L59A 1XWKA 2H75A 2IFQA 3CXGA 4MJEA 5J9CA 1GNEA 3VI7A 3LSZA 3F4RA 2V2GA 3QAWA 1OC9B 4G9HA 3F8UA 3UVTA 4JU5A 4NV5A 2DBCA 2E0QA 3W8JA 4ML1A 2GQMA 4EC0A 1HQOA 5J3RA 3DVWA 6GSSA 5HR3A 2DJJA 3CSIA 5DQSA 1GUHA 3EMXA 3MDKA 2LV3A 2PVOC 4ILFA 3VI5A 3L0HA 1XIYA 2DIYA 4KSOA 1DUGA 2WFCA 2WRTA 1I5GA 3C8EA 2HRNA 5F0GA 2O7KA 1M2BA 2H0HA 2LQQA 2ON5A 4K9ZA 4MF5A 4DSRA 5L71A 3HHVA 5AN1A 2H73A 4V2MA 3GSTA 5JCUA 4Q5FA 3KTBA 1B4QA 1DBYA 2J23A 1GRXA 5IO0A 1XVWA 4WEYA 1UN2A 4IP1A 3M9KA 4AF2A 2GQLA 2A2RA 2OADA 4MJBA 2Z9SA 3FHKA 2RM5A 2ON7A 4TR1B 1EOGA 2HZEA 1SJ6A 3QD9A 1S3DA 1R4WA 3J7Yb 5DDLA 2VCXA 2RUFA 5G30A 2REMA 1GSFA 2LEGA 4JEDA 3KCMA 2GTUA 4IP6A 1TJDA 2FUG2 5F06A 3U6VA 5KN0A 3HJOA 2LS5A 4TN8A 5DVBA 2LJKA 5CP1A 4ZBDA 4JE1A 3OR5A 1V40A 1K0NA 4OMVA 3DGQA 2CT6A 4GWRA 4OO4A 2MMNA 2P5QA 2VCWA 2F8AA 4MH2A 1N2AA 3ZITA 4KGIA 1DE1A 1B48A 1X5DA 3F9UA 3LORA 2H1GA 3LGCA 3N5OA 4OD7A 3I43A 4FYUA 3I69A 2V6OA 1K0CA 2AV4A 1T7PB 1ERVA 4AJ6A 2MBSA 3GX8A 1QK8A 5DJMA 2DLXA 3W8SA 3GKNA 3L4NA 5KN3A 2GZPA 4J57E 5IMCA 4MA9A 1U3IA 1G6WA 1ZOFA 3KM6A 3VWXA 3N9JA 3O6TA 1TU7A 1GH2A 4AJ8A 1GSQA 2O87A 2PGTA 1S3AA 3LXZA 4G10A 4TR4A 2L5LA 1A24A 5D93A 3M1GA 2VLVA 1WJKA 3GKXA 2V32A 4G2EA 3ERGA 5A4UA 8GSSA 5IIZA 3TUEA 4O7HA 5B8BA 2C1YA 3HY2A 2C4JA 4V2NA 4K6XA 2M72A 2QC7A 4MABA 2N5AA 1GSYA 5ELGA 5D8IA 2WS2A 2JACA 4E8EA 4V1Ag 5G5EA 1Q4JA 1Z5YE 3FKFA 4YQMA 4MMMA 1TKDB 1SK2A 3ZIVA 4OO5A 1BAYA 1RW1A 2C0DA 3GH9A 1UA5A 2R5GA 4LMVA 4ZILA 3RAZA 1BJXA 2HI7A 4I6XA 1J0FA 4ID0A 1OC3A 1SK1A 4K2DA 4N30A 2P0GA 1SL2B 1TRWA 1MDIA 2DJ3A 2IMEA 3IPZA 3UIWA 1YF0A 3GHAA 4KE3A 4TKYA 1GSSA 4HJMA 2K6VA 3QFAC 1XBSA 3LXTA 3MNGA 4HQSA 1BYEA 3M3MA 2DMLA 3DMLA 1EOHA 3AY8A 4G19A 3P90A 1JLWA 4NWYA 1BX9A 3Q18A 1X5EA 3DIEA 2PU9C 5C04A 5CRGA 2G2QA 3BCIA 2OE3A 3R2QA 3EU3A 1EGOA 2ZCTA 1MDKA 1V58A 1HYUA 1TW9A 1J9BA 2L6CA 3IC4A 3KGKA 9GSSA 2HRFA 5J4UA 4DVCA 2GDRA 2DJKA 3GN3A 4K0GA 2YJHA 3QFBC 2B5XA 4I8BA 2R37A 4O92A 5G2ZA 2O89A 2AJQB 5JCGA 1R26A 4V1Ap 2LQOA 1EP7A 6GSXA 1GNWA 3PINA 3D21A 1Z6NA 4GSNA 2E2MA 2BMXA 1C72A 1F2EA 3EINA 1GSEA 5G5FA 4PURA 1OC8A 5HFKA 4MZCA 3IAS2 3G7IA 4F9ZA 3KXOA 2YV9A 4TXOB 1T8EB 3APQA 1V2AA 1R7HA 3A2WA 1ZMAA 1O8WA 2CVDA 2VLUA 4EDYA 2XBQA 1GTAA 2L4QA 4PX1A 4JR4A 5ID2A 2X8CA 3APSA 2LNSA 4YH2A 1VF4A 2IMKA 4PQ1A 2IL3A 3ME8A 4LL4B 3UJ1A 3UARA 3FW2A 4MH3A 1AQVA 5ECIB 3ZYWA 3EURA 4X1UA 1SENA 1SJIA 1X0RA 3K8NA 2VL2A 4ZB9A 2JZSA 4PUAA 3BBYA 2VOCA 1XWCA 2MZCA 2TIRA 4XS6A 2FWEA 2NDOA 1Q98A 1N8JA 1XCCA 2PPTA 4NPBA 1TI3A 1M2AA 1THOA 1PL1A 3IK7A 2WCIA 4K0NA 1K0DA 2NVLA 3IA1A 1FAAA 1Z7RA 2DSAA 3A2VA 4TVEA 2FLSA 5FT3A 4X0XA 2YOIA 2OE1A 3FZ5A 3TRQA 1GTUA 2GSRA 4WR5A 1T3BA 2L4CA 2MBTA 2FWGA 2M46A 1EWXA 1WP0A 1XOBA 2LJRA 1AW9A 3TB2A 1EV4A 3ZMLA 3O76A 5EY6A 4L0UA 3VK9A 1ERTA 1RK4A 2N5FA 1A0RP 1FO5A 4FYBA 3CYNA 5HQPA 4XHMA 2DC5A 2HZFA 1NHOA 2HZEB 5CREA 3DYRA 2X8HA 5D9XA 1PKZA 3GTUA 3I9V2 4XS4B 2YWMA 1GSUA 2KHPA 4OFNA 3HZ8A 3LFLA 1FVJA 2K8SA 4LLRA 4MDCA 1PMTA 5ENUA 3DXBA 2OACA 3MWHA 2DMMA 2H71A 5CRHA 5CRDA 1GTBA 2CZ3A 4F0BA 2JSYA 3ME7A 1XWAA 5LCZA 4QL9A 1Z3EA 3I6AA 4N0VA 5ELAA 4BVXA 2JZTA 3MAKA 1QMVA 2YWOA 3U5RE 1DSBA 2F3MA 4D73A 2K8VA 2GT5A 2MYGA 1F9MA 3ZTLA 5IPGA 3QAGA 2C0FA 3UVHA 3F3RA 4GQCA 3L78A 2HT9A 3WGDA 1CQHA 3RPNA 1XW9A 1EP8A 2B5YA 4POBA 1K3LA 5J5NA 2IMFA 6GSYA 3O3TA 3UMAA 5H5RA 2CVBA 3J7Yk 5IMZA 5JCWA 19GSA 4KSMA 4GF0A 1LBKA 1G6YA 2YP6A 3LYPA 4MZBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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