5C04A

Crystal structure of the f37h mutant ahpe from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
SMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFHPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative peroxiredoxin MT2298
publication title The active site architecture in peroxiredoxins: a case study on Mycobacterium tuberculosis AhpE.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 54
structure length 153
sequence length 153
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5c04A00
4EC0A 3QAVA 3ZFLA 1K0OA 2DSAA 2PUKC 5ELAA 4V2LA 3I43A 2F8AA 4WETA 3CSIA 4QL9A 4CW9A 1N2AA 3BCKA 1S3AA 3GKMA 6GSXA 3NZNA 2C8UA 1SL0B 2BTOT 1FVKA 2LRNA 4YQVA 2YWOA 4FH8A 1RW1A 1NM3A 4I5QA 2B1LA 3FRCA 5CRWA 3C7MA 2JZRA 4TR0A 2YCDA 1MD3A 2JACA 3CSJA 1XVQA 2KP1A 6GSTA 5INYA 1SD8A 2LJRA 3CYNA 3FW2A 3L78A 1W89A 2DJ0A 5JCGA 1YZXA 2YOIA 3IRAA 2MMNA 4Z7XA 1TTZA 3VWUA 5GZZB 3VWWA 2RLIA 4KDXA 3HD5A 3MNGA 5DAKB 5ECSA 4MZWA 2YJHA 3BBYA 4O92A 5DVBA 1ZMAA 4BVYA 3IE3A 1E6BA 3HYPA 4ECIA 4ECBA 2VL2C 2ES7A 5F8BA 2AJQB 2M80A 5B6MA 4MZCA 3ZFBA 4XS4A 3VLNA 4FYCA 2TRCP 4HJMA 2YZUA 5LNKe 1HQOA 5AIXA 4YQUA 2FA4A 3UBKA 4ML1A 5B8BA 5F07A 4V2MA 5CREA 1JZOA 2MMZA 2AV4A 1X9SB 2B1KA 2FHEA 4JRRA 1M2AA 3MAKA 2IFQA 3ZZXA 3W6GA 2I9HA 3UOMA 5CRHA 4TN8A 2VM2A 2VAFA 3MSZA 2GDRA 2FWHA 2F51A 2D2ZA 3BD2A 1ERWA 3F9UA 4PUAA 2RUEA 1A2JA 1GSQA 3VPTA 4N10A 3CMIA 3RBTA 4F03A 2WZ9A 1MDKA 2R37A 2FWEA 2R2JA 1QXHA 2H75A 3S9FA 3IK9A 1G7EA 2XHFA 4PQIA 3LG6A 4JZQA 2EIQA 2KOKA 5IPHA 2PPTA 3FZ4A 1Q98A 4L8EA 1A24A 2C3TA 4G2EA 4TXOB 4OCFA 2ZUPA 2VD1A 5E59A 1YQ1A 1QUWA 2OE0A 1TKDB 2FWFA 3A2WA 4IGJA 2GZZA 3ZVJA 2WRTA 3CTGA 2DJ3A 4GSTA 5FHIA 2L5LA 4D73A 3KCMA 3LSZA 3IAS2 2WJUA 5G5FA 3UBLA 1V2AA 3EC3A 2AUVA 2PU9C 3CRTA 1JZWA 3L9UA 2YANA 1PX7A 4NMUA 4HZ2A 2LEGA 1NHYA 2LKUA 3QAWA 5IMFA 5HR3A 9GSSA 2R3XA 3G7JA 1M2BA 3M8NA 2LV3A 3TKSA 2PGTA 2AYTA 4AJ7A 3I69A 2OA7A 5JWQB 2WGRA 1TW9A 1TP9A 1B4PA 1TK5B 1CQGA 4HU9A 4MJCA 5ECOB 4J2FA 3E0UA 5A4UA 3KIJA 3EYTA 1SKRB 2J9HA 4AF2A 3ME7A 2HLSA 3LJRA 2OACA 3TKRA 2P5QA 2L4QA 3UVTA 1XFLA 1Y6EA 5AISA 3KMNA 1B8XA 2K18A 2LTKA 3DYRA 4I8BA 1QGVA 1RK4A 3RAZA 2LSTA 5G1KA 3ZIVA 1YF1A 3ME8A 3P7XA 1EV4A 3TDGA 3W8SA 1GWCA 1Z6NA 3EURA 2VLUA 5ENUA 1MDJA 1LBKA 2H8LA 2MBTA 3K8NA 3D0ZA 1B9YC 2IMEA 4EUYA 5CRGA 2QKEA 3IA1A 2LQQA 3FR9A 4J57E 5HQPA 1YY7A 1OC9B 4PNGA 3F3RA 3I6AA 1J08A 2IN3A 2GZPA 2OBKA 4O5RA 3SWLA 2IMIA 4POLA 4X0XA 1SK1A 3GYKA 1QK8A 3DRNA 2RM6A 5A4VA 2JU5A 3TKSC 2H19A 1Z9HA 5DALA 1ZYEA 4LA1A 2I3YA 1T4ZA 4KSMA 1SL2B 1XWGA 3BOAA 3ZRDA 5LCZA 5E4WA 1TXXA 5B8AA 4ZBBA 1SD9A 4XCSA 2HSHA 2VCTA 3BJ5A 4HUAA 4OFNA 3EVIA 4GF0A 1GSEA 4MJAA 4LL1B 2ON7A 3CXGA 5DJLA 2LS5A 3QDNA 5J9CA 1W4VA 2MBSA 4KNDA 4NWYA 3V1WA 4JBBA 3GH9A 5KEJA 3P2AA 4JE1A 2BMXA 4HJ2A 4K9ZA 1MEKA 5KN0A 2H1AA 3UMAA 1OVNA 3U6VA 3GUSA 3NIVA 1K0MA 2HE3A 5ECIB 5IOWA 2BJXA 1JLVA 3EINA 1O85A 2R5GA 5B6NA 5DCHA 1XCCA 4XS4B 4GWRA 3O3TA 4N11A 3ZREA 3QCPA 3VI5A 1DE2A 5ECLB 1FW1A 3KXOA 4X43A 4AJ6A 3KMOA 1OE7A 1OYJA 3GSSA 3UEMA 4MZBA 4N0VA 5LD0A 2ZNMA 2VCXA 4KDUA 2JZSA 2F8FA 1PX6A 2VL3A 3KH9A 3PH9A 1AQVA 1H4OA 3IHQA 3L9VA 2IFQB 3ZTLA 4K7IA 1LJRA 2C0FA 2H76A 1AXDA 3UARA 4IQAA 2K9FA 4MF7A 3ZMKA 4LMWA 3UL3A 13GSA 1GTBA 1PKWA 1AIUA 4POKA 1M2DA 2GTUA 3HDCA 4GSNA 3HJMA 1OKTA 1A23A 3DKSA 3LQ7A 4POMA 2VO4A 2HYXA 2O85A 2PBJA 4XHMA 4LL4B 4F0CA 1FVJA 3M0FA 3JCML 1Z5YE 1BG5A 4EXJA 1JHBA 4BPYA 1GTUA 3H8QA 1J0FA 1G6WA 3ERGA 4EKZA 3GV1A 3GMFA 4IP1A 3QR6A 2EIRA 5D9WA 6GSUA 1GL8A 4D73B 4J56E 3F6DA 1WOUA 1ILOA 4HDEA 4DSRA 5F05A 1GULA 4EDZA 3FR3A 2GVPA 2H70A 2XC2A 1EP7A 4BWSA 1VGLA 4RQRA 2KP2A 2I81A 3A2VA 1ZYQB 2LNSA 6GSWA 5CP1A 2PVOC 6GSYA 3GURA 3FKFA 3FZ5A 1GSUA 3GKXA 5EPFA 1YEXA 2B5XA 2GQMA 3ZLPA 1FB0A 4O32A 2YV7A 3D5JA 2CX4A 4X1UA 4BWQA 3PGTA 3VK9A 3R2QA 4MPFA 5D73A 5F06A 2FUG2 4GRFA 1X5EA 3TB2A 4NHWA 3C71A 3Q6OA 1K0BA 5IIZA 3GA4A 5HR1A 3LYKA 2B5EA 4PQ1A 3HKRA 8GSSA 1A8YA 3HA9A 4FO5A 1M99A 2YV9A 3RDWA 1FB6A 5ID2A 4K1FA 4WR4A 4NAXA 1TI3A 1S3DA 3GNJA 1GNEA 4F2IA 2ZCTA 2HFDA 1ABAA 5GAPD 1PSQA 1EOGA 4XTSA 2H0HA 4IQ1A 5ECMB 3LXZA 1WJKA 4L0WA 2MYGA 1YF0A 1OE8A 3LGCA 3UJ1A 1DUGA 4XIHA 5HFKA 1X9MB 1S3CA 1PL2A 2B7JA 2C3NA 2V6OA 4KSOA 2CQ9A 2M72A 4YH2A 1GTAA 1A0FA 2LRCA 2MMOA 1SYXA 4V2NA 3MWHA 4MF5A 2JSZA 2PWJA 3QMXA 4JEDA 4OWYA 4PNFA 5DALB 1XWCA 4KH7A 4WF5A 2GLRA 2VUPA 2GQLA 4I2UA 2GSRA 3GSTA 2FGXA 2H0IA 4OFMA 11GSA 5GSTA 1UC7A 1M0UA 5HFIA 4EDYA 5J4UA 4EF0A 20GSA 5IMZA 2LQOA 1FOVA 1M9AA 4ML6A 3WGEA 3WT1A 2HXKA 1MDIA 5DQSA 2LRTA 4OMVA 1LU4A 1BEDA 17GSA 2IPAA 2X8CA 5AN1A 1ON4A 1XW5A 4KB3A 4XS6A 5H5QA 3GX0A 1A8LA 2B5YA 4HI7A 4Q5NA 1XOAA 1WWJA 4G10A 3UVHA 1K0AA 2VLVA 2XBIA 2P31A 2DLXA 1NSWA 1SKSB 1UVZA 3VWXA 5KN1A 3OR5A 4EVMA 4DSSB 1CQHA 1HD2A 3RPPA 1SJIA 4PURA 2C0EA 4MABA 4YQMA 3TKPA 4O7HA 2B7KA 2R6KA 1V9WA 3F0IA 3HHVA 1F3AA 2M46A 5D9TA 12GSA 3ZL5A 1ERVA 3IBHA 2EIOA 2DBCA 4Q5QA 5IOXA 4KA0A 4WF4A 2H1BA 3FHKA 3Q19A 4RUVA 5IMDA 3TGZA 3FZAA 3E9JB 3APOA 1U3IA 1XXUA 5ECKB 4XRDA 4EO3A 5ECHB 2HZFA 3ED3A 1FAAA 5EVOA 4G19A 1A2LA 2E0QA 4JR6A 4IVFA 2KLXA 2J23A 3FYGA 3IXRA 2CT6A 3C1SA 5ECPB 4XRAA 1GUMA 5J41A 1ZGNA 3EU4A 1F9MA 3QAGA 3KEBA 1K3YA 1MTCA 3U5RE 3QOUA 1EWXA 2CV4A 3EMXA 1EP8A 1TI1A 4N30A 4MLYA 4MH3A 3WD6A 3IK7A 1KTEA 2A2SA 4RQXA 4ZB9A 4Q5FA 4TR4A 2O89A 4GQCA 3KZQA 1B4QA 2TIRA 4ZB8A 1U87A 4ILFA 5GAND 3KGKA 2TRXA 1X5CA 2CA8A 5J5NA 2EC4A 1AC1A 2RIIA 1JZDA 4HU7A 1BYEA 2C0GA 2LJKA 1Z7RA 4FYBA 2YNXA 1WRYA 2DJ2A 4HEA2 4TOPA 1T3BA 4TR3A 3KJYA 3E3EA 1E2YA 3TUEA 2HRFA 5IQYA 1R4WA 1GP1A 2DJJA 1H75A 3D6IA 1B9XC 2FNOA 5IO0A 2QSIA 4K7OA 3KP8A 1YKAA 6GSVA 1N8JA 1K0NA 3DMLA 2C3QA 3GH6A 2AHEA 2L59A 3SBCA 2JSYA 2LJAA 4IJ3A 1O81A 3HJPA 4V1Ap 2IL3A 4E8HA 19GSA 1HNBA 1NW2A 1EGRA 2VOCA 1GH2A 2L5OA 4DVCA 2FWGA 3G7YA 2DJKA 2KUCA 3KD0A 2V41A 2YWIA 1SJ6A 1ACVA 5CO3A 2X8GA 1XWBA 3A5WA 3DXBA 3DEXA 3IPZA 2FLSA 1X0RA 5IMAA 1MD4A 1OKDA 2P5RA 3N9JA 1C72A 2HI7A 1J9BA 1WIKA 1G0TA 4ZL8A 4OCEA 3LFLA 5IMVA 1SK2A 5ID2B 4K2DA 4TR1A 4IELA 1YJ6A 4TVEA 3APQA 3DVWA 2VL9A 1ZCPA 2GZYA 4MK3A 3QPMA 4KW6A 1PA3A 5IMCA 3FEUA 1JZRA 3VWVA 4GLTA 4GQFA 2WB9A 1TDIA 4WXTA 1T00A 5KN3A 3J7Yk 4CDOA 2HZEA 3H79A 3ZITA 3ISOA 3LYPA 2V32A 1GSDA 22GSA 3TKQA 1XW9A 2OADA 5HR2A 3P8WA 4P3YB 5ECQB 5JCWA 2X99A 4KCAA 3QFBC 5IPGA 2L6DA 4DSSA 2YN1A 2F9SA 2HRNA 2FCHA 4QQ7A 3VI7A 4OD7A 5FT3A 1DSBA 3GL3A 2CVDA 1K3OA 1HNCA 2C1YA 3WYWA 1AUCA 2VIMA 1XWKA 4KDYA 5G2ZA 2NBSA 1O8WA 2H72A 4F82A 1PD21 3ERFA 3DD3A 2CZ3A 2VD0A 1KEBA 3QD9A 1SYRA 2N5FA 2DC5A 3TKSE 3RHBA 1Z6MA 2YWMA 2CZ2A 1T8EB 2E2MA 3EE2A 3IR4A 4BA7A 5CRDA 4K8MA 2ON5A 1PQNA 4FIWA 2IMKA 5H5RA 1ML6A 1BAYA 3TRQA 2DMLA 4ZIJA 3LORA 1RQMA 2IWTA 4HQZA 4ZBDA 3HJOA 3F63A 1USBA 4HOJA 3L9SA 4L0UA 4WBJA 2CVKA 2FY6A 2QC7A 1K0DA 1OC3A 2R4VA 1O6JA 1GTIA 1QQ2A 2V1MA 2JZTA 2X8HA 2C4JA 3P90A 2JADA 3WGDA 1WE0A 3D21A 4CHSA 1Z7PA 4F9ZA 5EL8A 3GX8A 1F37A 2A2RA 5CYYA 2WFCA 10GSA 2K8VA 2AAWA 3ZMLA 2LNTA 2WS2A 4RI6A 3HVVA 4ZL9A 4RI7A 5B7CA 1X5DA 4GTUA 2FA8A 3HY2A 4WKWA 5D96A 1EZKA 5G1LA 1PMTA 3G9BA 4AGSA 3GHAA 5JCUA 1Z3EA 1TU8A 2PERA 2C80A 1SK0A 1T1VA 2NPBA 1EEJA 1TOFA 3C73A 1KNGA 2A4VA 3G7IA 1TU7A 4IP6A 3ERWA 3GRXA 4EE0A 4LLRA 3CSHA 5C04A 5HFGA 2VCVA 2NVLA 3KM6A 2H1DA 2H30A 2VLTA 1EGOA 3TCOA 4ZILA 1T7PB 4F0BA 2GS3A 1B48A 3H4KA 1YKCA 3D22A 2GT6A 4LMVA 4N0ZA 1R26A 2OE1A 1TRSA 4PUFC 1GUKA 2DIZA 4MA9A 4NXIA 2H1GA 3IC4A 1R7HA 4K6XA 3HXSA 1GSYA 4OO4A 1F3BA 2KHPA 4ECJA 5DBQA 2PMTA 1SKWB 1O73A 4JU5A 2FD3A 2DIYA 4DEJA 2X64A 6GSSA 4ZL7A 4KUNA 3QFAC 1QMVA 2O87A 1GNWA 2CX3A 2E2GA 2O8VB 2XBQA 3O76A 1HYUA 3ZIJA 4WR5A 2OBIA 5DJMA 4MDCA 3UAPA 2YJ7A 1AQWA 2OE3A 1U88A 2Z9SA 2WCIA 2DMMA 2WDUA 3ZYWA 1VF1A 3KH7A 1ZL9A 4MP4A 4TXVA 4IHUA 2I4AA 4TR1B 3M9KA 5ECRB 3Q18A 2YZHA 4MCUA 3GKKA 3GTUA 1THOA 3HZ8A 1XWAA 4IN0A 1O7UA 2YP6A 4NPBA 2HZEB 3C1RA 5DQYA 5D93A 3FZ9A 4I2TA 3KTLA 4IW9A 1Q4JA 5JWRB 1SENA 2OJLA 1TK0B 3C8EA 2L4CA 3I9V2 1FG4A 4PGTA 2DJ1A 1A0RP 3GFKA 2H0GA 2I1UA 3AY8A 2QGVA 2H01A 3FY7A 4K0GA 3HVXA 3DWVA 4PX1A 1XW6A 3VURA 3NOFA 3PR8A 4TRXA 3FR6A 3WGXA 1YEPA 2OKAA 1JFUA 2E7PA 3L0HA 3APSA 1V40A 3TJKA 4KCEA 5G31A 1K0CA 3F6FA 3GKNA 2IIYA 3D4TA 5CNWA 3O6TA 5A5KA 1YDKA 1FHEA 3M1GA 4MMMA 1U3AA 4YAPA 1OAZA 3TJJA 4G9HA 3F8UA 5J3RA 2VCZA 3GN3A 4TKYA 5D8IA 1AQXA 1XOBA 4IS0A 5D9VA 1F6MC 1BJXA 2V6KA 2GT5A 1HNAA 4ZB6A 2G2QA 4HQSA 1UA5A 1BQ7A 4IBPA 2V2GA 3F4TA 3A2XA 3CRUA 3A3TA 4AJ8A 3H1NA 2GSQA 2VCWA 1ZZYA 5JWOB 1I5GA 2GSTA 2XPDA 4XS1A 1VF2A 5G30A 2H6YA 4NV2A 4BVXA 4OO5A 5KN2A 1M7TA 1BX9A 1XPVA 3Q74A 1UN2A 3TOTA 1XZOA 3DVXA 2B3SA 5C00A 1V98A 5G5EA 1SU9A 1AAZA 1PKZA 1THXA 2LUSA 3PINA 3US3A 5COHA 2YPMA 3FK8A 3LEFA 4TW5A 2VM1A 3LWAA 5EY6A 5DDLA 5DAKA 5AIVA 2H71A 4K0NA 4DSQA 1TJDA 5J9BA 2VCQA 3ZVJD 2CVBA 1G6YA 5HR0A 4KE3A 5H5SA 1VF4A 4K7NA 3J7Yb 4KGIA 1FO5A 3RHCA 1R5PA 2F3MA 4GXZA 3TRXA 3EWLA 2K8SA 4WEYA 1KBNA 2H73A 2RM5A 3L4NA 7GSSA 1ERUA 2G0FA 1XVWA 4GCIA 3VFIA 3MDKA 3HZ4A 4PQHA 3RPNA 3IOSA 4GSSA 4QL7A 1O8XA 3VPQA 4KX4A 3GL5A 4WBRD 1V58A 2HSYA 1GSSA 3TJGA 3BCIA 1IYIA 2H6ZA 2YWNA 2O7KA 4NHZA 4BL7A 3D4MA 14GSA 3CTFA 2MZCA 2REMA 1ERTA 1NHOA 4NV5A 5ABRA 4OFTA 1IYHA 1T4YA 2K6VA 2L57A 4V1Ag 4HZ4A 1QFNA 3CBUA 4IKHA 5AGYA 3WT2A 16GSA 2RUFA 1DBYA 1TRWA 4MPGA 4ZBAA 5A4WA 3EU3A 2L6CA 4I97A 3M9JA 1AW9A 1SL1B 1TRUA 4MF6A 5CAXA 4YAVA 3HVSA 2IMFA 2PN8A 1I9DA 3F4RA 1URMA 4TXOA 1EV9A 4FYUA 1GLQA 2P0GA 1ST9A 4ID0A 1WMJA 3IAM2 4JR4A 3H93A 5IM9A 4ISDA 3IV4A 1R5AA 5ECNB 1K3LA 1EEMA 1F2EA 1EOHA 1WPIA 2NTOA 3GTUB 3TJBA 2N5BA 4ECCA 4L5OA 1GSFA 2GSSA 2B6MA 3KTBA 2MMAA 2H66A 2N5AA 1OC8A 4H86A 5IO2A 1XIYA 1TRVA 4ZXGA 2H6XA 2IJYA 4EL1A 3GIXA 5FWGA 1U6TA 2JL4A 3HCZA 3EMPA 1X9WB 1GUHA 4ULXA 4Q5RA 5F0GA 1SJZA 2CAIA 2AB6A 2ALBA 18GSA 1A2MA 5DCGA 1TK8B 1ZOFA 1GLPA 1G7OA 4E8EA 1Y25A 1XBSA 2PVQA 3N5OA 2GQKA 5ELGA 1WP0A 1JLWA 3UIWA 2NDOA 4MJEA 1DE1A 1PN9A 2IMDA 2C0DA 3F4SA 4POBA 1PRXA 3DIEA 4MJBA 3KP9A 1VF3A 5D9XA 1VRSD 4ACSA 4I6XA 3TRPA 2H74A 4MH2A 3DGQA 3W8JA 3M3MA 1PL1A 2HNLA 3IDVA 2CAQA 4KAEA 4PXOA 2VL2A 3LXTA 4IJIA 5GSSA 2WULA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite