5HQPA

Crystal structure of the erp44-peroxiredoxin 4 complex
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVSPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFEHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/chaperone
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of the ERp44-Peroxiredoxin 4 Complex Reveals the Molecular Mechanisms of Thiol-Mediated Protein Retention.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 181
sequence length 181
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hqpA00
1G7EA 5JCUA 3UIWA 2VCQA 4PUAA 2HYXA 3FW2A 4KSOA 1B4PA 2X8CA 3C73A 2VLTA 2JZRA 4PURA 22GSA 2CVBA 2JSZA 2GQLA 3GH6A 1GH2A 2R3XA 2DMMA 1ZYQB 4X43A 1T4ZA 1OKDA 3ZMLA 2MMAA 5DJLA 1J08A 4V2MA 5GSTA 2WULA 1A2LA 3TKRA 2YPMA 1O8XA 4L8EA 1HNAA 1A24A 1PL2A 4O5RA 4IN0A 2DJ1A 2E2GA 4BWSA 1OKTA 3NIVA 5DBQA 1SU9A 4TR3A 3F4SA 2M80A 3GKXA 3BCKA 3QFBC 1ILOA 3DD3A 5LD0A 1N8JA 1WMJA 3EURA 4POMA 1YZXA 1AQVA 1H4OA 4MJAA 2EC4A 4KB3A 1SJZA 3M1GA 4WXTA 3KM6A 1XW5A 2YN1A 4NXIA 2H6XA 3ED3A 4TR0A 5CO3A 4NHWA 3G7IA 2FD3A 4PNFA 3ZTLA 2DIZA 1K0MA 1QQ2A 2MMOA 3FY7A 1M2AA 3J7Yb 2L59A 5IM9A 3RHBA 3HYPA 3RPNA 1NHYA 2TRCP 3CSIA 1FB0A 2WCIA 3KTLA 4IBPA 3EU3A 4V1Ag 2FLSA 3KMNA 1EEJA 1U3AA 5C04A 2G2QA 2PPTA 3CMIA 5F06A 2GZPA 3TRXA 2VCZA 5LNKe 4JE1A 3D4MA 5GAPD 1W4VA 3GMFA 5F0GA 5ELGA 1A8YA 1T8EB 1PQNA 5HR0A 4CDOA 1SK0A 4N30A 4HDEA 1SJIA 2FWGA 5KN3A 1SKRB 1ZL9A 3HJOA 3BOAA 1XWBA 3M9KA 1VGLA 4GRFA 3TOUA 1VF3A 4HQSA 1XOAA 1ZOFA 2CZ2A 2VCVA 3U6VA 2F8FA 2PN8A 5ECIB 3GTUB 2CAQA 1Z7RA 3ZIJA 2H70A 3DIEA 2J9HA 4ZXGA 3EE2A 1YF0A 4XS4B 4ML1A 4OCFA 2CVKA 1GSEA 5B8BA 1F2EA 4AF2A 1K0CA 1M9AA 4OO5A 1SL1B 2WJUA 5AGYA 3VI5A 4KUNA 3LFLA 2FGXA 2DJKA 1T7PB 3L9VA 1ERVA 3QAVA 2LJRA 5J41A 5GZZB 1SJ6A 3F3QA 2YWIA 5ECMB 3CTGA 1R5AA 2HZEA 3DWVA 1JLWA 2B5YA 2OE3A 4RQXA 3LXZA 4POKA 4MABA 2GZZA 2N5BA 2M72A 1Y25A 4TXOB 1FVKA 2CX3A 5DQYA 4J2FA 3H8QA 3PR8A 1MDIA 1ZZYA 1TP9A 3A2WA 3IAM2 2JZSA 4POBA 4KW6A 5D9WA 2CVDA 5INYA 2GQMA 2B3SA 4Q5NA 4BPYA 1UN2A 4EVMA 3GNJA 1GNEA 3RPPA 4ECIA 5A5KA 1V9WA 1TJDA 1M99A 2DJ3A 3ZYWA 3L9SA 1OVNA 1F9MA 2MYGA 1GSQA 4V2NA 1JZOA 1TRUA 4YH2A 1EV9A 2FA4A 4K7IA 2H01A 3LXTA 5DALA 2GT5A 4HJMA 1F3BA 2LNTA 3TUEA 2K6VA 3HJMA 1EGOA 4H86A 3VPQA 1SL0B 3S9FA 2F9SA 4EDYA 4FYBA 3TCOA 3IPZA 5IO0A 3KP9A 1VF1A 3LGCA 4LMVA 5EL8A 4K2DA 1QK8A 2R37A 4IVFA 4OMVA 2B5EA 1A2JA 1R7HA 4I8BA 2DIYA 1PA3A 8GSSA 4N0ZA 4YAVA 1BQ7A 2QSIA 1SKWB 2HZFA 2GGTA 3GSTA 4PUFC 3L0HA 5CP1A 2VCTA 4MJEA 7GSSA 2ES7A 2AJQB 1WWJA 4OFMA 3UVTA 2J23A 3KTBA 2IMFA 2C0FA 3EWLA 5HQPA 1LBKA 4MH2A 2C3TA 4KE3A 3D6IA 2N5AA 1WOUA 1FB6A 2JU5A 3US3A 1OYJA 2DJ2A 2NVLA 2QC7A 2PWJA 4GXZA 1FW1A 1PX7A 4GWRA 2RUFA 2X8GA 4IQ1A 1G6YA 1UVZA 1WE0A 5FT3A 1B9XC 1GLPA 5LCZA 1XFLA 2V6OA 5HR3A 1R5PA 5H5RA 2PVQA 3IC4A 3Q6OA 13GSA 2H71A 5DCGA 3KEBA 4WBJA 2LNSA 3KMOA 1OC3A 5DAKB 4EE0A 4I2TA 2WDUA 4K1FA 1A8LA 4IELA 1K0DA 3APSA 4MF7A 2H66A 3LJRA 3E9JB 3CBUA 4EC0A 2K18A 3DXBA 3GKNA 3JCML 4X1UA 3HA9A 4ML6A 2A4VA 1GRXA 4Q5FA 2GQKA 5DJMA 3UJ1A 3RDWA 3GV1A 2H19A 2L57A 1NW2A 4WKWA 4O7HA 1UA5A 1Q98A 2C3QA 4IP1A 1YDKA 2GSTA 3CTFA 1Z3EA 3CRTA 2HFDA 3QAWA 1EOHA 3IR4A 1MEKA 1VF4A 2TIRA 4GSTA 3SWLA 3IDVA 3FRCA 1NM3A 2LSTA 4AJ7A 4DSSA 3HY2A 5ENUA 4KGIA 1T00A 4I5QA 5CAXA 1SD9A 4HU9A 5H5QA 3I9V2 1DE2A 4K0NA 3FR9A 3F0IA 4FO5A 3G9BA 4XTSA 4CW9A 4LA1A 4XS1A 3BD2A 5JWQB 1V98A 1R26A 4XS4A 1GSUA 4GQCA 2FWHA 2EIRA 2H0GA 3U5RE 2HSHA 5CRHA 4G9HA 2K8VA 3P2AA 1UC7A 3LYPA 3IAS2 2H73A 4HEA2 5DQSA 2QKEA 2L5OA 5DALB 3Q18A 1O73A 1MTCA 5G1LA 4K8MA 1K0AA 3H1NA 5CYYA 3L78A 5IQYA 3TKSC 2E0QA 1B8XA 3ERFA 2VLUA 2R4VA 4F0BA 1B4QA 2P0GA 2O85A 1XWGA 4EF0A 3M8NA 5JWRB 6GSVA 1DUGA 2XPEA 20GSA 2FY6A 4GF0A 3W8JA 4HUAA 2ZNMA 3WYWA 4ECJA 5D9VA 4TOPA 1M9BA 2OKAA 4ULXA 2L4CA 4Q5RA 3IXRA 4MDCA 3HVSA 3GN3A 4POLA 1K0OA 5J3RA 1DBYA 4L5OA 3GKKA 2PMTA 1U88A 1EOGA 1VF2A 1GUHA 2AUVA 1GULA 4HQZA 1J9BA 1Z7PA 1QFNA 2DMLA 3CRUA 3QAGA 1TI3A 2F8AA 4BVYA 2YZHA 4O92A 5D96A 1QUWA 4CHSA 3D0ZA 9GSSA 4Z7XA 3M9JA 3WGXA 1HNCA 5ECKB 1LJRA 4IQAA 2X64A 2YANA 5ECOB 2XHFA 1OC8A 4ZL7A 1X9MB 5HFKA 3GSSA 2H1DA 2IPAA 2C1YA 4K9ZA 2I3YA 2IMDA 4ZIJA 2DJ0A 4F0CA 1ON4A 3GURA 5L71A 1SD8A 2FWEA 1Q4JA 4XHMA 3EMPA 1YKCA 5KEJA 2RIIA 2ON7A 3MSZA 19GSA 1U3IA 3C71A 1FVJA 1G0TA 4OO4A 3UBKA 3MDKA 5HR1A 2XC2A 5JCWA 3N9JA 2YOIA 1GSFA 5DCHA 2VUPA 1X9WB 4MCUA 1FAAA 2GSSA 4MA9A 5ELAA 2NDOA 1S3DA 5CRWA 2YCDA 2GZYA 1HQOA 1O7UA 4NMUA 4K0GA 5IPGA 3DGQA 4BWQA 1T4YA 2FA8A 2C4JA 1GLQA 2DJJA 2YP6A 3RHCA 1JFUA 5JCGA 6GSUA 5F05A 4BL7A 2L6CA 3K8NA 1YQ1A 1WIKA 4IHUA 1XPVA 1JZDA 2VD0A 4TR1B 1AUCA 2XBIA 3TKSA 1YJ6A 4HJ2A 3TRPA 5G31A 3VFIA 4PGTA 1SYXA 3MNGA 4WBRD 4DSSB 3TOTA 4IKHA 2O87A 3F9UA 4KA0A 4JEDA 4K7NA 1PD21 5IOWA 2PU9C 3O6TA 2MZCA 2V32A 5G5FA 5DAKA 2NTOA 4WF5A 3PGTA 1WRYA 2O89A 1X0RA 2C8UA 2A2SA 2YZUA 3TJGA 3TRQA 10GSA 2AV4A 11GSA 2PBJA 6GSYA 3FZ5A 3UMAA 4JR4A 2YJHA 1MD4A 1ZMAA 2M46A 4MMMA 5ECQB 2LTKA 3ZLPA 3IV4A 1SENA 3QOUA 2B1KA 1FOVA 3KCMA 4N0VA 1FO5A 2CAIA 2C0GA 4X0XA 2FHEA 2AB6A 3QR6A 3ZIVA 1PSQA 4ZBBA 2H0HA 2MMZA 3A2VA 4NHZA 5HFIA 4KH7A 3TB2A 3LQ7A 5A4UA 2OACA 2B6MA 2CA8A 3DYRA 3VURA 3TGZA 4KCAA 4MJCA 2ZUPA 2OE0A 2IFQB 3C1SA 1XZOA 2IMIA 4ACSA 4ILFA 3H79A 2VM1A 3HZ8A 6GSXA 3BCIA 3UARA 2VL2C 4J56E 3KH7A 1B9YC 1ABAA 3CSJA 4V1Ap 2C0EA 3DVWA 1N2AA 5F8BA 3KJYA 1G7OA 2VOCA 4MZCA 2KLXA 4QL7A 5A4VA 2VIMA 4WF4A 5E59A 1DSBA 1ERWA 1GNWA 2HSYA 1Z9HA 4JU5A 6GSTA 4PQIA 2H74A 5KN0A 2VL9A 1GL8A 3QPMA 2V6KA 3D5JA 1TRVA 3FYGA 3ME7A 4OCEA 2H1GA 1XCCA 4PQHA 3F8UA 2IMEA 2LQOA 3IE3A 5G2ZA 1TDIA 2R5GA 3TKSE 2B7KA 3F6FA 4E8EA 1K3LA 1S3AA 1W89A 2DC5A 1ZCPA 3AY8A 4NV2A 1TU8A 2KOKA 4K6XA 2BTOT 1V58A 17GSA 1KTEA 2RM5A 1OE8A 3QMXA 2LRTA 12GSA 1BG5A 1TRWA 3GX8A 2DLXA 1HD2A 2LRNA 1FHEA 1SYRA 4HZ2A 2V1MA 5B8AA 2E2MA 3TJBA 4AJ8A 4NAXA 5ABRA 4ZL8A 3UBLA 2LQQA 3HHVA 3I69A 2ALBA 1PN9A 3VK9A 5B7CA 1GTIA 3N5OA 1V57A 1GTUA 1X5EA 4XRAA 1CQHA 1EP7A 4KDXA 1O8WA 1YEXA 2CQ9A 2H0IA 3F4RA 2WRTA 1F37A 5IMDA 2JZTA 2H30A 1ST9A 2OBKA 1G6WA 3CXGA 3ZITA 2HE3A 4MLYA 5G30A 5ID2A 4IJ3A 1XVQA 3MWHA 1T3BA 3KH9A 4BVXA 2K9FA 2IN3A 2WZ9A 5D9TA 5IMAA 4MH3A 3GHAA 4L0UA 1BEDA 1Z5YE 4I2UA 1M0UA 5KN1A 1K0NA 2CV4A 2IIYA 3F6DA 4TR1A 4YQMA 4GQFA 1KEBA 5EVOA 4K7OA 3ZFLA 4FYUA 3EVIA 4QL9A 2WB9A 14GSA 4GLTA 1XWCA 1MD3A 3BBYA 4ZB6A 4WEYA 4TN8A 2R2JA 4MPFA 4YQUA 5ECPB 4DEJA 3DRNA 2F3MA 3HVVA 3UVHA 3ISOA 4ECCA 5AISA 1GSSA 2LJAA 4QQ7A 3VWUA 3UEMA 1YEPA 4FH8A 1X5DA 2WGRA 4V2LA 1XBSA 3GRXA 4JRRA 3P8WA 4WETA 4DSRA 4EXJA 4HU7A 3P90A 1X5CA 3LSZA 1TTZA 1HNBA 1ML6A 1BAYA 2PVOC 2IL3A 4MF6A 2VO4A 3CSHA 4IW9A 2X8HA 2O7KA 5H5SA 3A3TA 4YQVA 3UOMA 4JBBA 4GTUA 2QGVA 3HD5A 1TKDB 1A0RP 4MK3A 3KZQA 4RI7A 1XOBA 2YJ7A 1AIUA 1OAZA 4BA7A 1AXDA 2D2ZA 1X9SB 4ZL9A 3VWXA 5IMZA 2H76A 3PINA 1PX6A 2JL4A 3M0FA 3LORA 1AQWA 2G0FA 2WS2A 3HVXA 1QXHA 1MDKA 2NBSA 4MP4A 5EPFA 3KGKA 2LRCA 3ZMKA 3VWWA 1GTBA 1O85A 5DDLA 3J7Yk 2VAFA 2VM2A 2IFQA 4TW5A 1M7TA 1BJXA 1GUMA 4KNDA 3FKFA 3QD9A 3NOFA 5IMFA 1PRXA 3QFAC 4LL4B 1RK4A 2H6YA 2OBIA 1GP1A 4DSQA 1AC1A 3H93A 3GIXA 1K0BA 2Z9SA 1URMA 1EP8A 1SK2A 2B7JA 2OE1A 3IRAA 3RBTA 4NWYA 2YWNA 2CZ3A 3FR6A 3ERWA 4E8HA 1H75A 2GVPA 1XXUA 2AAWA 2HT9A 3IA1A 5ECRB 3DEXA 1GSDA 3ZL5A 3OR5A 2KP1A 1GSYA 4KDUA 3IBHA 1LU4A 3VWVA 1JZWA 5G1KA 3R2QA 2DBCA 1AQXA 4F9ZA 1M2DA 2PERA 2GTUA 2H72A 5CREA 5D73A 1JHBA 2AHEA 4F2IA 1TXXA 2H1AA 3ZFBA 3HCZA 1EZKA 6GSSA 2HRNA 3GYKA 1ZGNA 4IS0A 1WP0A 1O6JA 3WGEA 3FEUA 5IIZA 4G10A 1A0FA 3FZ9A 3HXSA 2MBTA 3C7MA 4XIHA 1S3CA 3RAZA 1ERTA 2IJYA 5ID2B 3FHKA 1SK1A 4LL1B 2HXKA 2YWOA 3G7YA 1T1VA 3D21A 1KBNA 1OC9A 4DVCA 2LS5A 3KD0A 1IYHA 1XVWA 3H4KA 3IHQA 5FWGA 2JACA 1V2AA 5IMCA 2TRXA 1VRSD 5COHA 4ECBA 2X99A 2GSQA 4RI6A 2HI7A 2N5FA 2H8LA 5ECLB 1I9DA 1RQMA 2GLRA 1CQGA 5J4UA 1ERUA 1BYEA 3WT1A 1ACVA 2WFCA 3UL3A 3FK8A 4WR5A 2H1BA 3D22A 2P31A 4KSMA 1XWKA 3NZNA 4RQRA 1USBA 4GSSA 2BJXA 4GCIA 4KAEA 2RLIA 5CRGA 3VI7A 2RM6A 3KXOA 3C8EA 2YWMA 1Y6EA 1JZRA 2FCHA 3LG6A 16GSA 4LMWA 3ZVJA 2E7PA 2V2GA 3HDCA 2JSYA 4TVEA 3ZRDA 5CRDA 5C00A 3C1RA 1E6BA 2RUEA 4D73B 3TJKA 2H6ZA 3HJPA 4EO3A 2P5QA 1E2YA 5FHIA 1TK8B 1XW6A 4ZILA 1K3YA 4AJ6A 2L6DA 1GTAA 4TRXA 2VL3A 1PGTA 3EMXA 5IMVA 2VLVA 4EL1A 5B6NA 3D4TA 4TXVA 18GSA 2P5RA 4IP6A 4N10A 4TKYA 1BX9A 5D8IA 4EKZA 2NPBA 3DVXA 4I97A 6GSWA 2ON5A 2HLSA 3CYNA 4ZB9A 2BMXA 3V1WA 5IPHA 2C0DA 5DVBA 2YV9A 2I4AA 4OFNA 1SL2B 1XIYA 5A4WA 1TOFA 1GWCA 2HNLA 2LKUA 2R6KA 3WGDA 1FG4A 4HOJA 3GL3A 1KNGA 5AIVA 2OJLA 1Z6MA 5HR2A 2K8SA 3WT2A 4PX1A 2FWFA 2MBSA 4L5LA 3FZ4A 3Q74A 1THOA 4J57E 4MZWA 3I6AA 1TU7A 1K3OA 3W6GA 5IO2A 2I81A 1PMTA 1R4WA 3KP8A 4G19A 4RUVA 2I1UA 2LUSA 2GDRA 3GUSA 2C3NA 4LLRA 3TJJA 1J0FA 2F51A 1GUKA 4ZB8A 1YY7A 2PGTA 5G5EA 1PKZA 2CX4A 3KIJA 3QCPA 4N11A 3VPTA 1WJKA 1EGRA 1NHOA 3APOA 1XWAA 1U87A 4OWYA 4MZBA 3GKMA 4O32A 3BJ5A 3QDNA 4IGJA 3PH9A 2VCWA 3FR3A 3A5WA 3W8SA 5F07A 3DMLA 3GX0A 1IYIA 2XBQA 3E0UA 2ZCTA 4OD7A 1RW1A 1F6MC 5KN2A 1DE1A 2IWTA 1C72A 3A2XA 2FNOA 4YAPA 3E3EA 2H75A 4ZBDA 2FUG2 4PQ1A 4KDYA 4G2EA 1AW9A 1OC9B 3ERGA 3APQA 3Q19A 3TJFA 4P3YB 4WR4A 3LWAA 1XW9A 3ME8A 1V40A 3TKQA 1NSWA 2AYTA 1EV4A 4OFTA 2GT6A 2A2RA 3VLNA 1F3AA 5J9BA 5CNWA 3O3TA 1ZYEA 3ZREA 2CT6A 5B6MA 5ECNB 4F82A 2LV3A 3WD6A 2OA7A 2OADA 5E4WA 3F4TA 4FIWA 2VCXA 4NPBA 3EINA 4AGSA 1QGVA 1HYUA 1QMVA 2KHPA 4NV5A 2DSAA 1JLVA 3GH9A 5AIXA 4GSNA 1A2MA 4HZ4A 1PKWA 5EY6A 5IOXA 1AAZA 2EIQA 3IOSA 1MDJA 1YF1A 3UAPA 5GAND 2XPDA 5D9XA 3F3RA 3EU4A 5J5NA 3O76A 4HI7A 3FZAA 4MF5A 3I43A 2GS3A 1B48A 3TDGA 2YNXA 3LEFA 2KP2A 2MMNA 4XRDA 1TK0B 2VL2A 4IJIA 1TI1A 5AN1A 5D93A 2V41A 1SKSB 3IK7A 2GSRA 4Q5QA 2EIOA 1Z6NA 4I6XA 4KX4A 4F03A 5ECSA 2HRFA 2HZEB 2PUKC 3GA4A 2B5XA 1OE7A 4PXOA 1TK5B 4PNGA 1O81A 4L0WA 4KCEA 4XCSA 5HFGA 3ZZXA 3G7JA 2B1LA 4EUYA 1EWXA 2I9HA 1A23A 1WPIA 3GTUA 2C80A 4ID0A 3GL5A 3HKRA 4XS6A 3M3MA 2YV7A 1YKAA 3SBCA 4MPGA 2KUCA 2REMA 2VD1A 3GFKA 4ISDA 4JR6A 1EEMA 3MAKA 3ZVJD 2O8VB 2JADA 5J9CA 5JWOB 1TRSA 1TW9A 5GSSA 3P7XA 4ZBAA 4MJBA 2L4QA 4D73A 4EDZA 1U6TA 3HZ4A 4HS1A 1PL1A 1I5GA 3IK9A 3DKSA 2LJKA 3EYTA 1THXA 2L5LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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