5ID2A

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
154
structure length
153
Chain Sequence
VMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
total genus 49
structure length 153
sequence length 154
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2A00
3UIWA 2FGXA 5DJLA 3GL3A 3OR5A 1EP8A 1ERVA 3M1GA 5A5KA 2LJAA 2H72A 3CSJA 4LL1B 4LMWA 2PGTA 3LYKA 3Q6OA 3U5RE 5ECPB 3GNJA 3UOMA 4KB3A 5GZZB 4BPYA 4LMVA 3A2VA 4OWYA 4ECJA 5AN1A 4L0WA 5H5QA 2IN3A 1XWKA 2GSSA 5D9VA 2FWFA 3ERWA 2IWTA 2F8AA 2H0IA 3IK9A 3VI7A 3L9SA 4EUYA 2L5LA 2YN1A 5DVBA 3VK9A 2GGTA 4V2MA 2DBCA 3Q18A 4IVFA 5F07A 5F05A 1K0DA 2DC5A 2B5EA 4PUAA 2I9HA 5IMAA 2FUG2 2N5FA 2FCHA 4GLTA 1ZL9A 2A4VA 3TKSC 5IIZA 5IQYA 1SKSB 4BL7A 5JWRB 2GQKA 2OE3A 2VCVA 2CAIA 2V6OA 1GNEA 3CSIA 2LNTA 11GSA 2NVLA 4YQMA 1GSFA 3F3QA 2VIMA 4BWQA 2PU9C 2VCXA 2IJYA 4HU9A 1VF1A 3CTGA 2J23A 1G7EA 7GSSA 3APSA 3US3A 3IHQA 2TRCP 3QMXA 2VAFA 6GSWA 2FA8A 1X9SB 4QL7A 3S9FA 1TW9A 2YCDA 2WDUA 4BA7A 2X64A 4KAEA 3W8SA 3J7Yb 4WR4A 2L6DA 1AC1A 3P8WA 2GQLA 3GA4A 4ZB6A 1SL1B 2WCIA 3LXZA 1FHEA 1S3AA 5ECHB 3BBYA 4OFNA 2PPTA 3HVSA 5ECQB 4GTUA 3RDWA 2LKUA 1E2YA 1FB0A 2H6YA 2GZPA 3QAWA 1TRSA 3UBLA 2QKEA 3UJ1A 5HFKA 3GRXA 2IMKA 1OYJA 3KMNA 1B4QA 2OADA 1A0FA 3E0UA 1K0OA 4K8MA 3TGZA 2LNSA 4POBA 4WXTA 4MPGA 1QXHA 3F4SA 18GSA 1U3IA 2NBSA 4AJ7A 3UVHA 4EDZA 4RUVA 5G30A 2DSAA 3IR4A 1Z7PA 4ZB9A 5ECIB 3MAKA 1HNBA 2O87A 1SD9A 2YV7A 4OCFA 2QC7A 1O6JA 1WJKA 5CRWA 4IELA 1GLPA 1OKTA 1TI1A 4OCEA 2MYGA 2IIYA 1RK4A 2TRXA 1B4PA 4EO3A 2PMTA 4PQ1A 4HOJA 5HFIA 1M0UA 3FKFA 3TJFA 1PQNA 1ZCPA 5CNWA 5FT3A 4WR5A 1PGTA 2CZ3A 3IAS2 1SENA 1T8EB 3GH9A 2HSHA 3GIXA 1H4OA 2FWHA 3M8NA 4PQHA 1TU7A 5DCHA 2AB6A 2X8GA 1GUKA 2ZNMA 3E3EA 2X8HA 3WGEA 4TKYA 5CRDA 3QDNA 1EZKA 4JBBA 4HU7A 1EV9A 6GSYA 3G7YA 1X9MB 4EL1A 1GSSA 2RM5A 2GDRA 3D21A 2NPBA 2HSYA 2XHFA 3LYPA 1A24A 4DEJA 2H1AA 4WF5A 2P5QA 1HD2A 4JU5A 3TKSA 2WULA 3PH9A 3FZ9A 1GTBA 1ZYQB 1V57A 3I9V2 4ECBA 2HXKA 1YQ1A 4MJCA 5J9BA 2KOKA 3BD2A 4HDEA 1U3AA 1EGOA 1XXUA 2L4CA 2C0EA 14GSA 1FVJA 2VCZA 3IDVA 2WGRA 3A3TA 2H66A 4ULXA 4XIHA 4J2FA 2MZCA 2MMZA 4NHZA 1FG4A 1XWCA 4K1FA 5IOWA 2WS2A 4PQIA 3RPNA 1JLWA 2B1KA 4IP6A 3IAM2 4QQ7A 4TR4A 3W6GA 2KP1A 3R2QA 5D9TA 1NSWA 2JZTA 1GH2A 2OA7A 1TK0B 2LRNA 4KX4A 2GT5A 2K18A 5DQYA 3TCOA 5J9CA 2AAWA 2X99A 3HVVA 4PUFC 5D8IA 2JACA 1EOGA 1T4ZA 1AXDA 1ON4A 5B6MA 2LJRA 20GSA 2DIZA 2C80A 16GSA 1M99A 3H4KA 3QD9A 1SKWB 1HYUA 3QFAC 2CVKA 2H70A 2VO4A 5B8AA 3I43A 1J9BA 2HZEB 1KTEA 5IPHA 2AHEA 1X5DA 2V2GA 5IMZA 1GWCA 3WGXA 1YY7A 4L8EA 4I2UA 3F3RA 4G9HA 1A23A 3L0HA 2VLTA 1A2MA 2FNOA 4X43A 5EPFA 2H74A 1A2JA 5IO2A 4HEA2 2O8VB 2GTUA 4TW5A 2H75A 2AYTA 2P31A 1YZXA 3F63A 4XS1A 5E4WA 4D73B 2BJXA 4WF4A 2FWEA 5GSTA 5CO3A 3H8QA 1GSYA 1TJDA 2E0QA 1R26A 1TI3A 4L5OA 3G7IA 3VFIA 1M9AA 2L59A 4POKA 3TJKA 1PKWA 2K8SA 4KW6A 2ALBA 4RI7A 3FW2A 4BVYA 3GV1A 2GVPA 1Q4JA 2B5XA 3L9VA 4FYCA 4NHWA 4FIWA 4G10A 4OFTA 3HCZA 2XBQA 13GSA 3DMLA 3BCKA 5DAKB 4IKHA 2LS5A 3I69A 4EDYA 3MWHA 1FOVA 2CT6A 2CVBA 3ZRDA 3QOUA 1YKAA 2H1GA 2PVQA 4N10A 2KUCA 1U87A 1T3BA 5ABRA 4ZL7A 2C0DA 3DXBA 4MMMA 1BQ7A 1PMTA 5COHA 1SKRB 1BG5A 1XZOA 2DJJA 1JZWA 2C8UA 1QMVA 2QSIA 4FYBA 3F6DA 4ZL9A 1GSEA 1SYXA 4I5QA 3G9BA 4EF0A 2R3XA 4I8BA 3P7XA 3GKXA 3MSZA 4KCEA 4FYUA 2H1BA 2LEGA 4MH2A 4PX1A 2MMNA 3EYTA 4GCIA 5KN0A 3D4MA 5G5EA 3RBTA 5DALB 3WYWA 4OO4A 1SU9A 4FH8A 1B9YC 1TXXA 4F2IA 2CVDA 2RUFA 1X0RA 4JR6A 3IBHA 1CQGA 4MJBA 2YWOA 3C1RA 1CQHA 3O3TA 4TRXA 1AW9A 4DSQA 1OC9B 3GN3A 3KP8A 1RQMA 1MDJA 4PNGA 4HJMA 2C1YA 5IPGA 4PXOA 4EVMA 2CQ9A 4I97A 2F9SA 1MD4A 3EMPA 5L71A 1VRSD 1WMJA 3M9JA 1XWBA 1UA5A 5G1LA 3H1NA 4YH2A 3TRXA 4ZBDA 1FB6A 1ZZYA 2QGVA 1AIUA 1AQWA 1E6BA 4OD7A 5KN2A 1ML6A 1EOHA 4E8HA 4H86A 1TU8A 1XOBA 2OE0A 2YPMA 2M72A 3ZIJA 3LQ7A 1NM3A 1X5EA 4QL9A 2LTKA 3IOSA 5J41A 3QFBC 2PWJA 2JL4A 4NPBA 4KDXA 2L5OA 1GSUA 4GQFA 1SL0B 2KLXA 4WBJA 3IXRA 3VWXA 3A5WA 1RW1A 5A4WA 3I6AA 1TKDB 1QQ2A 4MF6A 2B7KA 2H01A 1TDIA 1ABAA 5HR2A 2GSRA 3HVXA 4NXIA 4XHMA 2P0GA 2H30A 4K0NA 4ID0A 1Z7RA 1HNCA 5A4VA 5DDLA 2VM1A 2HZEA 1LU4A 3ZLPA 2PBJA 4DSRA 4KE3A 4O32A 4MH3A 4EXJA 1A0RP 1B9XC 1G7OA 3GFKA 3FK8A 2V41A 4O5RA 2VCTA 3RHCA 2AJQB 3EU4A 2C3NA 1OVNA 1LBKA 3M9KA 3ME8A 5EL8A 5JCGA 2H0HA 2CX3A 4YQUA 3VWWA 1IYIA 2DJ1A 1F37A 3H79A 3N9JA 5AISA 3F9UA 1YJ6A 1W4VA 4MA9A 1K3LA 3NOFA 4WBRD 3Q74A 2R37A 2HE3A 4D73A 3GUSA 4MDCA 5H5SA 3RAZA 3TRQA 2YWMA 3EU3A 1UVZA 2HZFA 3FR3A 3SBCA 2L4QA 4EKZA 3ZFLA 3ZTLA 1O8XA 2ES7A 3TJBA 4MP4A 2PUKC 4XRDA 4IJIA 2OE1A 4MJEA 4DVCA 2VCWA 1XPVA 4GSSA 4TXVA 5DAKA 4ZL8A 4KA0A 1V2AA 2YOIA 4ML1A 2C3TA 4HQSA 4Q5QA 3QPMA 1O8WA 4HI7A 4ISDA 2HFDA 1Y6EA 2JZRA 1WPIA 1ZMAA 4E8EA 1JZOA 2CA8A 4KDUA 5JCWA 2YJ7A 4IQ1A 5ECKB 2RLIA 1USBA 6GSUA 5ENUA 9GSSA 3DIEA 3TB2A 2GSQA 3BJ5A 2VM2A 2I3YA 2YWIA 2E2GA 2IFQB 1URMA 1BX9A 5HFGA 5IMFA 2ZCTA 4MABA 3EURA 1SK0A 3BCIA 1VGLA 5DBQA 5AIXA 3KMOA 1THOA 2JZSA 2HI7A 4LLRA 1XBSA 4X0XA 1F9MA 1S3CA 1QFNA 4ZB8A 5DALA 4N11A 4LL4B 22GSA 2YZHA 3FEUA 4F9ZA 5ELAA 2LRTA 4IJ3A 2DMMA 1JZRA 3VLNA 3P90A 1GTUA 4MZCA 5CAXA 1FAAA 2FHEA 4HUAA 5HQPA 2VLUA 1R4WA 2F8FA 3KH7A 3KP9A 1OC9A 1S3DA 2GLRA 3TOTA 3D6IA 3VPQA 1YF0A 1JHBA 5F0GA 2X8CA 2DJ0A 5G1KA 1K3YA 3HA9A 2HLSA 4POMA 3LG6A 6GSVA 2YJHA 1YDKA 1F6MC 4IW9A 1DSBA 5DJMA 1J0FA 2KP2A 2VL3A 3DVWA 3L4NA 4V2NA 3VURA 3WGDA 1KNGA 1G6WA 4TR1B 1MTCA 1TTZA 1XWGA 4K0GA 4JE1A 3KTBA 4G2EA 1QGVA 3E9JB 3P2AA 1A8YA 3KH9A 4PNFA 4O92A 5G31A 5FWGA 1AAZA 2H8LA 1K0NA 3FR9A 1JZDA 6GSSA 5CRGA 3KXOA 1EWXA 4HZ4A 4ML6A 4ECCA 5KEJA 2CAQA 1PN9A 3C8EA 2DJ3A 3DWVA 3LEFA 5D96A 1GTAA 3HD5A 4KH7A 2LQOA 2EIQA 2REMA 3D5JA 3HZ8A 5DCGA 3G7JA 4GXZA 1SK1A 1EP7A 5EVOA 3LGCA 1B8XA 3HXSA 5HR3A 5H5RA 3KZQA 1OE8A 2GZYA 1Z6NA 1YEPA 5GSSA 1KBNA 1GTIA 2N5BA 3DVXA 3TJJA 3F6FA 1Q98A 3TKRA 3LWAA 2HRNA 5ECMB 1YF1A 1O85A 3KTLA 3HZ4A 3ED3A 4NAXA 2LUSA 1PL2A 1NHYA 2HYXA 2JSYA 1WIKA 1GP1A 3D4TA 3O76A 4K6XA 3V1WA 5G5FA 3GSTA 5AIVA 4WETA 2XPDA 3C73A 3ERGA 4GRFA 3M0FA 1GUMA 2F51A 4JR4A 2H76A 1T1VA 1IYHA 1V9WA 5IOXA 3EC3A 1X5CA 2XC2A 1XFLA 2EIRA 2Z9SA 3M3MA 3PINA 2K6VA 3EE2A 2O85A 3DEXA 1GLQA 2DMLA 2L6CA 2DLXA 3UAPA 3FZAA 3HHVA 1N2AA 1PKZA 1XW9A 2GS3A 4N30A 3Q19A 2KHPA 3JCML 2MBTA 1SL2B 3VWUA 5D9XA 5D73A 2AUVA 4JRRA 1ST9A 3HYPA 2LRCA 2PVOC 1PX7A 4GWRA 19GSA 1XIYA 1QK8A 2I4AA 5ECRB 2N5AA 3EMXA 4IGJA 2PN8A 4HJ2A 4N0ZA 2IMEA 3MDKA 1GSDA 5C00A 3ZFBA 1Z3EA 2YANA 2OACA 1KEBA 4OMVA 3TKQA 3DRNA 2WRTA 5ID2B 5J3RA 4V1Ag 4I6XA 2V6KA 3PR8A 1EV4A 5AGYA 1A8LA 1YKCA 4YAPA 1J08A 3QR6A 4MJAA 4DSSB 5G2ZA 4IN0A 2F3MA 3WD6A 1OE7A 2OBKA 2O89A 1TK8B 3CYNA 2H19A 2B3SA 2GSTA 3UEMA 4CDOA 5LNKe 2IFQA 2WZ9A 5J5NA 3UL3A 2R4VA 4AJ6A 3IE3A 5IMDA 4N0VA 2YZUA 3GSSA 1XOAA 5B7CA 2VL2C 2DJKA 3FYGA 1TRVA 1TK5B 3N5OA 3GTUB 2C0GA 2MMOA 4MZBA 2DJ2A 4HZ2A 1AUCA 4K7OA 1V40A 1K3OA 3HJPA 1V98A 5JWOB 1A2LA 2BTOT 4KNDA 1XCCA 1WRYA 4Q5RA 4XCSA 5FHIA 4X1UA 1I9DA 1GULA 4V2LA 2G2QA 5CREA 1TP9A 5KN1A 5IMVA 2FLSA 3LSZA 1PL1A 4HQZA 1HQOA 4IQAA 2J9HA 1R5AA 3HJOA 2LSTA 2FY6A 1U6TA 3GX0A 2VLVA 2K8VA 4MCUA 1ERTA 4TXOB 5CP1A 3A2XA 3KJYA 2H6ZA 4XRAA 4Q5FA 2IMDA 3APQA 4K2DA 5EY6A 2NDOA 2RUEA 4TR1A 1V58A 4POLA 4L0UA 4CW9A 4JZQA 4KGIA 1T4YA 3W8JA 4TOPA 2C3QA 4F0BA 4NV5A 3ZYWA 1ZOFA 1UC7A 5IO0A 3RHBA 3RPPA 2WFCA 3CRUA 2GQMA 1O81A 2M80A 3CXGA 2G0FA 3A2WA 5ELGA 3FRCA 6GSXA 4MF7A 3EVIA 3ZL5A 1ERWA 1ILOA 2VCQA 3TUEA 2FWGA 4TN8A 1SJIA 2LQQA 1N8JA 2VL9A 2HNLA 1G6YA 3ZIVA 3HY2A 1JFUA 4OFMA 1G0TA 1GRXA 8GSSA 2PERA 3GH6A 5HR1A 4AF2A 3IV4A 3C7MA 1HNAA 1DBYA 2FD3A 1MD3A 5D9WA 4Q5NA 3IA1A 1VF3A 4F82A 3ZITA 1XW5A 2RM6A 4XS4B 3DYRA 4ECIA 5B8BA 3F4RA 5A4UA 3KIJA 4NWYA 2EIOA 3DGQA 4ACSA 3ZVJA 1EEMA 3DD3A 5JCUA 4ZBAA 5GAPD 2WJUA 3FY7A 1ZYEA 1K0AA 1SJ6A 1GL8A 3KEBA 4KUNA 3K8NA 2I81A 1F2EA 3SWLA 1M9BA 2EC4A 1TRUA 4JEDA 1PD21 2VL2A 3IPZA 1AQVA 1BYEA 1SYRA 2H6XA 3TKPA 1XVQA 4J57E 3IC4A 4CHSA 3ZMKA 5KN3A 2VD1A 3LFLA 5LD0A 1C72A 1DUGA 2BMXA 5J4UA 2C0FA 5INYA 4KCAA 1EEJA 1M2BA 5ID2A 1ACVA 3FZ4A 2B5YA 1WP0A 3FR6A 4K7IA 3HKRA 4KSOA 3ME7A 3IK7A 2ON5A 2L57A 4DSSA 1SD8A 3MNGA 1FO5A 1X9WB 3GKKA 4FO5A 1OC8A 4ILFA 2O7KA 2HT9A 4WKWA 10GSA 3CBUA 3O6TA 4G19A 6GSTA 3F0IA 2LJKA 1O73A 2OJLA 2R5GA 4XTSA 3TDGA 2LV3A 4RQRA 3L9UA 1WOUA 3GURA 3TJGA 4MF5A 4O7HA 5ECNB 3LORA 3GTUA 5C04A 2V1MA 1M2DA 4PGTA 2C4JA 3HJMA 3KGKA 3CMIA 4TR3A 1Z5YE 3GX8A 12GSA 3FHKA 3APOA 3UBKA 3WT1A 5LCZA 2NTOA 2IPAA 3BOAA 1I5GA 1FW1A 4RQXA 2OBIA 1DE2A 1K0CA 4NMUA 1UN2A 3D22A 1K0MA 4MLYA 5IM9A 4ZIJA 2YV9A 3CSHA 3UVTA 1GSQA 4F0CA 4TXOA 4J56E 2P5RA 5ECLB 1QUWA 5CYYA 4ZXGA 4MZWA 3KCMA 4Z7XA 3GKMA 5DQSA 3KM6A 5HR0A 2CV4A 3ISOA 2RIIA 4KSMA 3VWVA 1XWAA 1Z9HA 3EWLA 2WB9A 2JADA 2I1UA 4TVEA 2IMIA 3D0ZA 1F3AA 5CRHA 3VI5A 1PSQA 1EGRA 2FA4A 4IBPA 1PX6A 4BVXA 1U88A 1WWJA 3F8UA 1GNWA 2DIYA 1BEDA 1FVKA 4F03A 5D93A 2B1LA 2CZ2A 2H73A 1XVWA 1ZGNA 5ECOB 4IHUA 3C1SA 4HS1A 1THXA 3TKSE 1T7PB 4IP1A 1R7HA 3ZREA 3J7Yk 2HRFA 3GL5A 3UARA 4AGSA 3LXTA 1K0BA 4TR0A 3C71A 1SK2A 2D2ZA 4PURA 2GZZA 4L5LA 1TOFA 17GSA 2H1DA 4MK3A 2ON7A 5F8BA 2ZUPA 2MMAA 4IS0A 2IL3A 3FZ5A 3GYKA 3NZNA 2E2MA 1H75A 3TRPA 3PGTA 4BWSA 3WT2A 4XS4A 1OAZA 3GHAA 3ZMLA 3U6VA 5E59A 2R6KA 3QAVA 2V32A 4K7NA 1NHOA 1VF2A 3CRTA 4AJ8A 3ZZXA 4KDYA 2AV4A 2TIRA 2XBIA 1LJRA 1OC3A 2JSZA 1Z6MA 3QCPA 2H71A 2YP6A 2E7PA 2M46A 2JU5A 3IRAA 5GAND 1BJXA 4RI6A 1M7TA 3GKNA 5F06A 2VUPA 4WEYA 1OKDA 3HDCA 2XPEA 3VPTA 4MPFA 1XW6A 2GT6A 4P3YB 1W89A 4EE0A 2K9FA 2B6MA 2H0GA 3L78A 1WE0A 2A2SA 1O7UA 1SJZA 1F3BA 2OKAA 1MEKA 1TRWA 4GQCA 1VF4A 4GSTA 4ZILA 4GF0A 2A2RA 1DE1A 4K9ZA 3KD0A 3NIVA 4I2TA 3H93A 3ERFA 1YEXA 5B6NA 1B48A 3LJRA 4NV2A 2R2JA 1Y25A 2MBSA 3AY8A 1MDKA 4LA1A 4YQVA 1PRXA 4GSNA 5IMCA 1M2AA 3F4TA 5JWQB 1MDIA 4EC0A 5ECSA 3CTFA 2YNXA 3QAGA 3UMAA 1JLVA 2CX4A 2IMFA 1AQXA 4OO5A 2VOCA 1PA3A 1GUHA 3TOUA 4V1Ap 1ERUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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