5IIZA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f0
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. raphani 756c
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iizA00
1SJZA 4F0BA 4POMA 2GZYA 4FYUA 4HQZA 2H66A 2R37A 3LYPA 1M2BA 5A4VA 2PGTA 2V1MA 4BVXA 1TJDA 1A8LA 1SL2B 1SD9A 4BL7A 2PMTA 3LQ7A 4WR5A 1X9MB 1A0FA 1BJXA 1A8YA 3UOMA 1SKSB 5GSTA 4JBBA 4YQUA 3LJRA 3IC4A 4N0VA 4MJEA 1YQ1A 1V57A 1XBSA 3TGZA 3DRNA 3ERFA 1PKWA 4MDCA 3MAKA 5JWQB 5J9CA 3P2AA 3QAWA 1DUGA 2NVLA 1SKRB 1Y25A 1F9MA 3A2VA 3BOAA 5EPFA 1ON4A 4E8EA 4I6XA 2B5EA 5H5RA 4ZL9A 3PGTA 1BX9A 1RK4A 2P5QA 4ISDA 4ECJA 1B48A 1SL0B 1KNGA 4KDYA 4PX1A 4MJBA 4MH2A 1ST9A 4JRRA 4O7HA 1EOGA 5IIZA 2ON7A 4GTUA 1TI3A 2WB9A 2BTOT 5IPHA 2GTUA 3F4SA 1ZMAA 2MZCA 2NPBA 5AISA 3ZRDA 1YKCA 2CVBA 2CT6A 1A23A 3QFBC 5E4WA 3GKKA 4LL1B 2LJKA 2YWNA 3QD9A 5F8BA 3ZL5A 2M46A 2FNOA 3W8SA 2YWIA 3V1WA 2R5GA 2VLVA 4TR1A 2YP6A 1F3AA 3HA9A 1GUHA 1HQOA 1A24A 3Q6OA 5G1KA 4AF2A 1YY7A 2PWJA 4HDEA 1TRSA 4KCEA 2E2MA 2B1LA 2JACA 2B7KA 1VF4A 1QGVA 2P31A 5B6NA 1XWAA 4XS1A 4Q5FA 2X8GA 5DBQA 2E0QA 3TKQA 2V6OA 5D9XA 5KN0A 3DXBA 4PQ1A 1O81A 1JZOA 1PX7A 2XPDA 4NHWA 5HR1A 1TRWA 3F63A 1SK2A 4GQFA 2IFQA 3CSHA 3F3QA 3G7IA 2IMFA 2DJ1A 1OC9A 3HJMA 1K3LA 4G9HA 5D8IA 2G0FA 4HU7A 3GRXA 5IMFA 3GKXA 3HKRA 6GSWA 1GSFA 1T3BA 2JL4A 4XTSA 1SK0A 1X9SB 5D9VA 3ZLPA 2B1KA 4Q5QA 1IYIA 1EZKA 3N9JA 1R5PA 4MPGA 3TKSA 1ZOFA 3APOA 2DIZA 4EUYA 5IMAA 1XPVA 2DC5A 4J57E 4TW5A 2H0HA 2V32A 2YN1A 5IQYA 5LD0A 1B4PA 5CRWA 5ECOB 3FR3A 4GWRA 1XIYA 4MP4A 4O5RA 2H73A 4TR0A 1HD2A 2H0IA 2H70A 1AIUA 3L78A 3PINA 5A4UA 2LS5A 2LKUA 4IP1A 3KD0A 5B6MA 1GULA 3RAZA 4L5OA 1F3BA 3DIEA 5D9TA 3VWXA 3TUEA 1JZWA 4X1UA 2IL3A 1OE8A 1SU9A 3GMFA 3M0FA 5ELGA 2B3SA 3EMXA 4KSOA 3KP9A 3GKMA 4RUVA 1SK1A 3TKPA 1G6WA 3HZ4A 2FCHA 3GH6A 4CDOA 2H6XA 2HSYA 1GTAA 5DAKA 1TXXA 4V2NA 1Y6EA 5DDLA 1SD8A 4GCIA 2K9FA 3UIWA 2C1YA 4K0NA 3O3TA 3H93A 2HT9A 5J41A 2DBCA 5LNKe 3CMIA 2JZRA 3VFIA 4ACSA 2FD3A 5G31A 1ZGNA 2V2GA 2WDUA 2TRXA 3H79A 4JR6A 3F9UA 1A2JA 5H5QA 4KAEA 2HZFA 5HFIA 4AJ7A 4ZXGA 3GX0A 2VLTA 1YF1A 4HEA2 4KNDA 3OR5A 3F6FA 1O8XA 3L9SA 1S3CA 4MABA 1G7OA 2FA8A 2H1DA 1MDKA 1XXUA 4G10A 5IM9A 1ILOA 2VCXA 2VCTA 2LNSA 1USBA 2DIYA 4L8EA 4WXTA 1SJ6A 1B4QA 3VWWA 19GSA 4ZBAA 1T1VA 1AXDA 2VCVA 4EC0A 2GZPA 5C04A 1F6MC 2EC4A 1FW1A 2REMA 4XS4B 3KTLA 3VWVA 2X8HA 3CSJA 2OADA 2L59A 4K2DA 2HSHA 3CYNA 4K7IA 1EP7A 4OO5A 5DJLA 4D73B 3LGCA 1IYHA 1TRVA 4J2FA 1PMTA 2H74A 1PL1A 5CYYA 1U87A 4POLA 1FVJA 5AGYA 1XWGA 3UEMA 3WYWA 2H8LA 1E2YA 2LJAA 1MDIA 2TRCP 4IVFA 5EVOA 4AGSA 2LJRA 3GKNA 2KUCA 2PERA 1YEPA 5IO0A 3A2WA 4ECBA 3MWHA 4WBRD 10GSA 4ZBBA 2C4JA 2H1AA 2IMDA 1XWCA 2IPAA 1WP0A 1K3YA 1EV4A 1HYUA 3TDGA 2R2JA 2QC7A 2DSAA 2GSSA 1WE0A 1WPIA 1K0NA 2MMZA 1V98A 3TJJA 4IHUA 1XCCA 5DVBA 4IELA 4FYCA 3QR6A 3HHVA 2FUG2 1W4VA 2ALBA 3WT2A 2FLSA 1K0OA 3M3MA 3HD5A 1GLPA 1TI1A 3M9JA 2HRNA 2IMEA 4KDXA 3FHKA 3HCZA 5D73A 1FHEA 2OE1A 3NZNA 3D4MA 1R7HA 2PBJA 4L5LA 4PNGA 3FZ9A 1Q98A 3R2QA 1GUMA 1LU4A 4FYBA 4YAPA 4N30A 3ZMLA 4MPFA 1TOFA 2H6ZA 2NBSA 1G7EA 5AN1A 20GSA 3TCOA 4OFMA 1TK0B 6GSTA 2GZZA 5CRDA 1M2DA 3F8UA 1TTZA 2FA4A 1OC8A 1YJ6A 1Z9HA 4POBA 3BJ5A 2RLIA 3HZ8A 3KXOA 1A2LA 1TK8B 3O76A 4ZB6A 3QAGA 4TR3A 2K8SA 4GQCA 1XW6A 4MZBA 4Q5RA 4HS1A 4ZB9A 4KW6A 3A3TA 3GX8A 4RI7A 3PH9A 4NWYA 4BWQA 2N5BA 3KEBA 3EYTA 3LXTA 4F0CA 2KP2A 4BA7A 2GLRA 2JADA 1B9XC 4HJMA 4FIWA 5IMZA 4CW9A 2VM2A 3EMPA 1ML6A 3HVSA 1PL2A 3D22A 2CQ9A 2LRCA 3IOSA 3FR6A 4E8HA 3ZYWA 3BCKA 3L9UA 4DVCA 3D21A 3Q74A 3D4TA 2PPTA 4PGTA 16GSA 3ZFBA 4K7NA 3GNJA 1OC3A 5B7CA 4OWYA 2F8AA 3ZVJA 1GTBA 3IXRA 3LEFA 5B8BA 5F0GA 3P7XA 1ABAA 1W89A 3UAPA 3ZREA 3Q18A 3S9FA 2H1GA 5CRHA 2ES7A 3L4NA 2PU9C 5D96A 2MBSA 2Z9SA 3GH9A 3M9KA 5G5EA 2CAQA 5DCGA 1V58A 3RHCA 5DQSA 3KH7A 3BD2A 4MF6A 1X5EA 4IP6A 1GUKA 3KH9A 3TJKA 3TJFA 4EO3A 2AAWA 1F2EA 1YEXA 5CRGA 1JZRA 2R4VA 3GA4A 3KMNA 5ECMB 3IAS2 5B8AA 2MMNA 2XBQA 2IWTA 3FY7A 2IJYA 4NPBA 1ACVA 4OCFA 5KN3A 2JU5A 3DYRA 2J23A 4TOPA 2ZNMA 3F4TA 9GSSA 2V41A 3C1SA 1URMA 5INYA 2C3QA 2DLXA 3GN3A 2DJJA 2JZTA 3HYPA 2HYXA 1OYJA 1AC1A 2LTKA 4G19A 1OKDA 2CVDA 4HZ4A 3LXZA 3G7JA 2NTOA 3FKFA 1X5CA 4ULXA 1BEDA 2R3XA 2CZ3A 5IOXA 1LBKA 6GSUA 5HFGA 3FZ4A 4XRAA 1WMJA 3Q19A 4IS0A 2FWHA 1C72A 2H0GA 5GSSA 4WF5A 4KH7A 3E0UA 1XW9A 4MCUA 2MYGA 4GSSA 4GXZA 1DE1A 4OFTA 5ECLB 1AQWA 2IN3A 3WGEA 4ZL7A 2LQOA 4HUAA 3CSIA 1ZZYA 8GSSA 2RUFA 2N5AA 2VL2A 4OMVA 4IKHA 4NV5A 3PR8A 2PN8A 3K8NA 2HI7A 3L9VA 1THXA 2GSRA 5CO3A 13GSA 2CV4A 1VF3A 4ECCA 4KX4A 1EP8A 4DSSA 4IQAA 4LMVA 4L0UA 4N11A 2XHFA 5ID2B 3ZIVA 6GSYA 1NSWA 4BPYA 4KDUA 3CTGA 3MDKA 4PQIA 3VI7A 3QCPA 2X99A 3EINA 3VI5A 2ON5A 4JR4A 2B7JA 2C0FA 3ME8A 2DJ2A 4AJ8A 4XS4A 2JSYA 4V1Ag 2KOKA 1ERUA 11GSA 1GL8A 2VM1A 2QGVA 1TK5B 3TOUA 5DCHA 4L0WA 4BWSA 1SYXA 4TXOB 4D73A 3U6VA 2LUSA 1AAZA 3QFAC 1GTIA 1EEJA 1NHYA 2HE3A 3APQA 2QKEA 1U3AA 1PKZA 2A2SA 4LLRA 4JE1A 3DKSA 2X8CA 1FB6A 3HXSA 1S3DA 2FGXA 4N0ZA 2YJ7A 3KM6A 3E9JB 4FH8A 1R4WA 5DQYA 3F3RA 2EIRA 3KGKA 2LRNA 5LCZA 3DVXA 4FO5A 3E3EA 2HRFA 3TKSE 3FR9A 3P90A 2OE0A 3DD3A 3UBKA 5ENUA 1XOBA 1Z3EA 4DSSB 5CNWA 4MJCA 4KE3A 3QPMA 2GQMA 4K6XA 5ECPB 5CP1A 3ZZXA 4EVMA 3TRPA 4BVYA 1OAZA 1N8JA 1OVNA 3IV4A 1EWXA 4Q5NA 2GT5A 3HVVA 2A4VA 5FT3A 3QMXA 5ECNB 3I69A 4MJAA 1BAYA 3APSA 4X43A 3UARA 2F51A 3C73A 4OO4A 4EF0A 1NW2A 2H75A 2C0DA 1J08A 1Z7RA 3ZVJD 4NMUA 3JCML 2WJUA 3GTUA 1TP9A 2C80A 3IPZA 2IIYA 1QUWA 4PURA 4EE0A 4RQRA 2AJQB 4LL4B 1OKTA 1VGLA 4N10A 4K1FA 4TKYA 1M99A 2GQLA 3IR4A 4K8MA 3MSZA 1XVQA 1YDKA 1SJIA 2RM6A 5G2ZA 5DALB 5JCGA 2OJLA 1TW9A 3RHBA 1O85A 2OBIA 2F3MA 1YKAA 2ZUPA 1O73A 3GIXA 5AIXA 2VL3A 4OD7A 2G2QA 3M1GA 4YAVA 1HNCA 1ZYQB 3P8WA 1PN9A 2PVOC 1XVWA 4IBPA 4XHMA 1MD4A 3IK9A 2O87A 3UMAA 3WGXA 4ZB8A 4ML1A 4ZBDA 4IJIA 5GAPD 2VAFA 2K6VA 1U6TA 2L5OA 2VUPA 2XC2A 5L71A 1EV9A 5ELAA 2YWMA 3IA1A 2ZCTA 3IAM2 4F9ZA 4G2EA 3VPTA 3LG6A 4GF0A 5F07A 4JZQA 2GSQA 4WR4A 3EU4A 1FG4A 4MK3A 2HNLA 1GRXA 1YF0A 2DJ3A 1F37A 3J7Yk 3QDNA 3WT1A 5DJMA 3UL3A 1PX6A 1K0AA 1PRXA 1TRUA 3H4KA 3ZIJA 3HVXA 4GLTA 4HOJA 2CA8A 4GSNA 2FY6A 1MD3A 1AW9A 1PD21 4O92A 2XPEA 4WKWA 2VD0A 2YANA 3FW2A 3KP8A 3GTUB 3IDVA 2B5XA 3CRTA 2M72A 2GS3A 2I4AA 5KN1A 4I2TA 3KTBA 5J4UA 1WJKA 3HY2A 1SYRA 4MZCA 5KN2A 1ERTA 3NIVA 5J5NA 1K0DA 1Q4JA 2C8UA 5A4WA 2JSZA 2FWGA 5G1LA 3D0ZA 1FB0A 3M8NA 2L6DA 3RDWA 1UC7A 4F03A 2H01A 5CREA 1O8WA 1TDIA 2GVPA 1GLQA 4TVEA 2GQKA 4J56E 1E6BA 1V40A 1WOUA 2DMLA 5D9WA 1A2MA 4XRDA 4K0GA 3TJGA 2L6CA 1T7PB 1X0RA 3BCIA 4EL1A 1GP1A 2H72A 3QOUA 1M0UA 4PXOA 3IHQA 4TRXA 4OCEA 1K0CA 1T00A 5G5FA 5ECKB 5EY6A 1ERVA 3VK9A 2DJ0A 2YPMA 1UN2A 4LA1A 3FYGA 1XW5A 2CVKA 4KSMA 2H19A 2N5FA 4HU9A 4IQ1A 1JZDA 1T4YA 4TN8A 4RI6A 2YOIA 3H8QA 2WZ9A 5HR0A 2MBTA 1FOVA 4MF7A 1U3IA 5ECHB 4MLYA 3NOFA 1J9BA 1QK8A 3GUSA 3LFLA 1DE2A 1DSBA 22GSA 1GSDA 4RQXA 7GSSA 1NM3A 2YZHA 2I9HA 2LNTA 3A5WA 1GWCA 3J7Yb 1GNEA 2OA7A 2H30A 2HZEB 3L0HA 4HJ2A 5JWOB 3ERWA 4ZILA 3KCMA 3ERGA 2IMKA 3G7YA 2I81A 4H86A 4XIHA 4ECIA 5HFKA 2X64A 5AIVA 1FAAA 1H75A 3LORA 2LV3A 4EDZA 2F9SA 1LJRA 1K0BA 1V2AA 1I5GA 2AHEA 3GFKA 2C0GA 3GV1A 2NDOA 3W6GA 2GGTA 5ID2A 4EDYA 3DGQA 2LEGA 5JWRB 2I3YA 1M2AA 1QXHA 3FEUA 2J9HA 5COHA 2F8FA 4IW9A 3RPNA 1GSSA 1JLWA 1SL1B 1TKDB 2L5LA 1VRSD 4QQ7A 2KLXA 2R6KA 4NV2A 3UBLA 1AUCA 1XFLA 3D5JA 2AV4A 1V9WA 3EU3A 4IGJA 2O8VB 5HQPA 3CXGA 2VCQA 3RPPA 1EGRA 4NHZA 3N5OA 2E2GA 4PNFA 3ZFLA 2VD1A 1GSEA 4XCSA 1X9WB 2EIOA 2P5RA 4TXOA 1FVKA 2E7PA 1NHOA 2WRTA 4JEDA 5ABRA 5J3RA 3CBUA 1XZOA 3UVHA 3ZITA 3VPQA 3TOTA 2D2ZA 4YH2A 1ZYEA 2GSTA 1G0TA 2P0GA 5A5KA 2WS2A 3C7MA 3GL5A 2QSIA 1Z6MA 4NXIA 1M7TA 5CAXA 3GSTA 3DWVA 2MMAA 1S3AA 5JCUA 1GH2A 1DBYA 3HDCA 2YCDA 4WBJA 4MMMA 4EXJA 1J0FA 3KMOA 3CRUA 3IBHA 5F06A 4PQHA 3GL3A 1ZCPA 4XS6A 1YZXA 3FZAA 3ZMKA 1PGTA 4O32A 4DEJA 1GSQA 3QAVA 2B5YA 2RUEA 1VF1A 1ZL9A 1EOHA 2HFDA 2PUKC 1I9DA 4ZIJA 4MZWA 1U88A 3I43A 1PQNA 3IE3A 1MEKA 3ISOA 1MTCA 5ECSA 2YV9A 2LQQA 4KUNA 5IPGA 4TR1B 6GSVA 3D6IA 3EWLA 4WEYA 3O6TA 5IMCA 12GSA 3RBTA 2DJKA 1AQVA 5HR2A 1GSUA 4X0XA 5IOWA 1GNWA 2FWFA 2K18A 5H5SA 4MH3A 2YNXA 3F0IA 1T4ZA 4WF4A 2H6YA 1KBNA 3I9V2 3F4RA 4PUAA 3LWAA 2I1UA 2KHPA 2C3TA 3UJ1A 4MF5A 1K0MA 2H71A 3IK7A 1PA3A 1SENA 2FHEA 4HQSA 5DALA 3WGDA 3F6DA 2IFQB 5HR3A 2RM5A 2L4QA 1BG5A 3EC3A 1WIKA 4WETA 3VLNA 1THOA 3GSSA 2GT6A 3A2XA 2C3NA 5GZZB 1OC9B 1UA5A 2V6KA 5JCWA 3UVTA 2CAIA 4K9ZA 1Z6NA 3US3A 5E59A 4P3YB 5IO2A 2O85A 4PUFC 1H4OA 1CQGA 2A2RA 1GTUA 1O6JA 2MMOA 2LSTA 1QFNA 4CHSA 5IMVA 2TIRA 3I6AA 1WRYA 4POKA 1KEBA 3TRXA 3WD6A 1Z7PA 5GAND 2VO4A 4JU5A 2JZSA 4NAXA 3U5RE 1EGOA 3LYKA 1BQ7A 1CQHA 2VOCA 1A0RP 1TU7A 3TJBA 1ERWA 1Z5YE 3G9BA 4IN0A 3SBCA 2LRTA 2VCWA 3DMLA 4I97A 4OFNA 1R5AA 4I2UA 6GSSA 2IMIA 1MDJA 4TR4A 1SKWB 1VF2A 3KZQA 1K3OA 1UVZA 3DVWA 3FZ5A 5KEJA 4GRFA 1FO5A 5ECQB 2CX4A 3C1RA 3TRQA 3VWUA 4ILFA 5J9BA 3KIJA 3KJYA 2YJHA 17GSA 4LMWA 4IJ3A 2YV7A 3EURA 1RW1A 2OACA 2O7KA 1X5DA 5DAKB 3ME7A 2HLSA 1B9YC 4ML6A 4V2LA 1TU8A 5ECIB 1B8XA 4V1Ap 2AYTA 4KGIA 2WCIA 3FK8A 4HZ2A 5F05A 18GSA 1JLVA 2M80A 1KTEA 3IRAA 1T8EB 3TB2A 1OE7A 5G30A 2O89A 4KB3A 1XOAA 4YQVA 4HI7A 2XBIA 2CX3A 2OE3A 1QMVA 2CZ2A 2FWEA 3BBYA 1HNAA 4ID0A 2VCZA 3DEXA 2L57A 2VL2C 2B6MA 3LSZA 5C00A 3EE2A 1JFUA 1JHBA 3TKSC 3MNGA 4V2MA 2PVQA 4ZL8A 2GDRA 2WFCA 3W8JA 1PSQA 2WULA 2VL9A 1G6YA 3GURA 4K7OA 1O7UA 3SWLA 1M9BA 3GYKA 1M9AA 1N2AA 2OBKA 5IMDA 6GSXA 3EVIA 4KCAA 4YQMA 2WGRA 4EKZA 5FHIA 3AY8A 4DSQA 2BMXA 4I8BA 4I5QA 4DSRA 2BJXA 3TKRA 4F2IA 2VLUA 3ED3A 4F82A 2H76A 1XWKA 2AB6A 4GSTA 2H1BA 1GSYA 3H1NA 5FWGA 2L4CA 4QL9A 2RIIA 2HZEA 3C8EA 4Z7XA 1XWBA 4TXVA 1R26A 2C0EA 3GHAA 4QL7A 3HJOA 2HXKA 2YZUA 4MA9A 2KP1A 5EL8A 4AJ6A 14GSA 2EIQA 3FRCA 2AUVA 3VURA 2K8VA 3HJPA 3ZTLA 5D93A 1BYEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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