5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
2MBTA 3H8QA 3TKSE 4JR4A 2XBQA 3RPPA 18GSA 4K7NA 4IN0A 5IIZA 1Z6MA 2B7KA 1EGRA 4JZQA 2NBSA 2K18A 1MDJA 4HJ2A 3GNJA 1ILOA 4XS4B 1GRXA 1GUKA 3EU3A 3UOMA 3GKNA 3TRQA 3H1NA 1URMA 4YAVA 4F9ZA 3MDKA 2CVKA 3H79A 1ZGNA 4GWRA 4FH8A 4AJ7A 1K3OA 5HR2A 3DVWA 1Z6NA 5ECQB 3PGTA 1JZOA 3E9JB 5A4VA 4IP1A 4JU5A 2HFDA 3GX0A 5LD0A 2H6XA 4POLA 1QUWA 4N10A 3BCIA 4KW6A 4D73A 4HQSA 2IWTA 1OC3A 5F05A 3BBYA 1KBNA 1PN9A 3J7Yk 4FO5A 4PNFA 2OJLA 1ML6A 1B4QA 4BPYA 3EMXA 2DJKA 1GLPA 3DRNA 2VL3A 3H93A 2ES7A 1OKTA 3TUEA 2NTOA 4QQ7A 2VLVA 4KCAA 1GULA 5KN0A 1JLWA 2HZFA 3APOA 1AQVA 1H4OA 1K0NA 5CRWA 1T8EB 1GL8A 1WOUA 2L6CA 5A5KA 1F37A 5CNWA 4DSSA 1YZXA 2HE3A 2WFCA 2F9SA 2KP2A 2H8LA 2AV4A 4ZB9A 4ZL7A 2DIZA 2MZCA 5IMDA 1XXUA 2J9HA 3P8WA 1E2YA 4YH2A 1YDKA 1SJIA 2R37A 2DJ0A 3D4TA 4ZBBA 5ECPB 4X1UA 2WRTA 4MZCA 4POMA 3CMIA 3HD5A 3US3A 3D22A 4ACSA 3W8JA 4MJEA 2KUCA 1OYJA 8GSSA 2M80A 1SD9A 2R5GA 4J57E 4YQVA 2QSIA 3MSZA 1SK0A 5G2ZA 3HZ8A 4WR4A 1WWJA 4PXOA 2LQQA 3L9VA 3I6AA 2H01A 1X9SB 1M9BA 1SU9A 2FGXA 3M9JA 2PERA 3HYPA 2IMKA 3VI5A 4MF7A 5DAKB 4MCUA 1F6MC 2L5OA 3IK7A 3FY7A 2GSTA 5G5EA 3LYPA 4JEDA 5B6NA 1U6TA 1FB6A 5ECIB 2YN1A 3A2XA 3CSIA 2YNXA 2ON7A 3TRPA 2VD0A 4NMUA 3G7JA 1O7UA 1WPIA 1HQOA 2GQLA 2DJ2A 3VFIA 3TKPA 1Z5YE 2J23A 4JR6A 3TKRA 3MNGA 2VM2A 9GSSA 2CT6A 4PQ1A 5GSSA 2XPEA 1B9YC 1J9BA 4GRFA 3HJMA 4E8EA 3DXBA 2HSHA 2VO4A 3I9V2 1TRUA 5ID2B 2VM1A 10GSA 5IMCA 5AIXA 4MABA 4IHUA 3NZNA 3FZ9A 4KH7A 2AUVA 3IAM2 1Q98A 1A8LA 3FYGA 5HFIA 22GSA 5CREA 3GX8A 4BL7A 2C1YA 4HEA2 3TRXA 2C0DA 2AAWA 1UVZA 2L59A 4PQIA 3RHBA 1FG4A 4HUAA 2FA4A 4LA1A 2AYTA 2DJ1A 2H75A 7GSSA 2X99A 3QAVA 1ST9A 2X8GA 4EF0A 1MDIA 3GV1A 2I4AA 1K0DA 1PL2A 4HI7A 4WXTA 1BQ7A 2P31A 1PL1A 4OFMA 1EWXA 4V1Ap 4OFTA 3C71A 4DEJA 3KZQA 1EGOA 2PVOC 4PNGA 2O87A 2G0FA 3VWVA 3TKSC 2GZPA 3PINA 2PPTA 3EMPA 2CZ3A 3ZFBA 5JCGA 4F82A 1Z9HA 3KMNA 1X5CA 1M9AA 3APSA 1DBYA 4F03A 1M2AA 2VL2C 4EKZA 3GL5A 5B8BA 1XPVA 2DLXA 4KSOA 3R2QA 1EV4A 2Z9SA 1TDIA 1AAZA 4EDZA 2K8SA 2VIMA 3DVXA 4JE1A 5D8IA 3IDVA 2EC4A 2VLUA 2GZYA 4RI7A 4X43A 4NPBA 5CRHA 1Z3EA 4MZWA 5JCUA 5D9WA 2B5XA 1FB0A 4MPGA 5EY6A 3WGEA 1ERVA 1WMJA 5HFKA 2BMXA 1AW9A 5JWRB 4PX1A 3F6DA 3CTGA 2WB9A 4RQRA 4KSMA 2PN8A 2HZEB 4YQUA 1BYEA 3O6TA 3QMXA 4HOJA 2C3QA 2IMFA 3HA9A 1F3AA 1A0FA 4GXZA 2LRNA 4J56E 1XVWA 1PGTA 2RUEA 3RPNA 5DBQA 2FWEA 2H6YA 1TTZA 3A5WA 3RAZA 2DSAA 1QQ2A 3VPTA 2DIYA 2JSZA 4PUFC 3A2VA 1GTBA 1EEMA 3EE2A 3KP8A 4V2MA 1A8YA 1XIYA 5GSTA 2X8CA 1NM3A 4TXOA 3TB2A 1BG5A 3J7Yb 2KLXA 2L6DA 5H5QA 4PGTA 3F4RA 1X5EA 4TR1A 1AIUA 2HT9A 1K0BA 5INYA 2H73A 3LGCA 2IMDA 3QCPA 2FD3A 1K3YA 1QK8A 5IMAA 5CAXA 1QFNA 2YJHA 2EIOA 1PA3A 2WULA 5EPFA 2KP1A 1YKCA 5CRDA 3VURA 3GA4A 3P90A 4MDCA 2R3XA 3UVHA 4HDEA 1GH2A 4TXVA 3KCMA 4ISDA 4TN8A 4Z7XA 2PUKC 2CX4A 1JLVA 1YKAA 2L4CA 3IR4A 1TU8A 3TJBA 4IW9A 5F07A 4I2TA 4HQZA 3GUSA 4OCEA 4TVEA 5DALB 2H19A 1MDKA 3WYWA 3V1WA 4ML1A 3C73A 1SJ6A 4XS4A 1TRVA 1BAYA 3M1GA 4MMMA 3KIJA 5F0GA 3RHCA 4F2IA 2GVPA 4MLYA 3H4KA 4ZB8A 2WDUA 2K6VA 1F9MA 3GTUA 5EVOA 1GTUA 3S9FA 5B7CA 2YWIA 1T4YA 2PBJA 2GLRA 1PX6A 1PKWA 1AQWA 1GTAA 1EP7A 4KNDA 4IJ3A 2BTOT 3LJRA 1YF0A 4CHSA 4MJBA 2LQOA 3F9UA 3WGDA 4JRRA 2AB6A 1HYUA 1ERUA 3GSSA 2N5AA 4ZBAA 3KP9A 1R4WA 4MH3A 1Z7RA 3AY8A 4O7HA 2HI7A 2BJXA 1J08A 2LJAA 1E6BA 2JU5A 2YPMA 2B7JA 3ERFA 2EIRA 4L0UA 1NHOA 4I6XA 1ABAA 1OC9A 1G7EA 1TRWA 1SK2A 4BWSA 1B48A 1ZYEA 1GP1A 2ZNMA 1HNAA 1DE1A 2LKUA 1V58A 1AUCA 2TRCP 5ECMB 1NHYA 4ZB6A 2IPAA 1QXHA 1G6WA 4NWYA 2R4VA 16GSA 1OAZA 4KE3A 3KM6A 2N5FA 2CAIA 6GSWA 3RBTA 4XRAA 1YEPA 3HCZA 3OR5A 3ERGA 4V2LA 2JSYA 2LJKA 6GSYA 2XPDA 3ZVJD 1GSSA 1SJZA 2HNLA 4GLTA 1FW1A 3GH6A 5GZZB 1SKRB 3G7IA 3A3TA 2TIRA 3GL3A 3QOUA 5LCZA 1TW9A 2KHPA 1TU7A 3QAGA 5J3RA 5HFGA 2DBCA 4EDYA 1GSQA 5DQYA 3KJYA 1NSWA 2VCTA 5IOWA 1JHBA 2WS2A 4EXJA 2I1UA 1PRXA 1XWGA 4RQXA 3PR8A 2OADA 3IHQA 4QL7A 2JL4A 1DUGA 2B5EA 5DQSA 4DSRA 4NV5A 5H5SA 3D6IA 5IO2A 3ZLPA 2A2SA 13GSA 3QDNA 3F6FA 1U3AA 3ZYWA 3CXGA 4WF4A 1R26A 4DVCA 2VCVA 2LJRA 2QGVA 5IO0A 1T4ZA 3EWLA 4NHWA 4BWQA 3EVIA 3CRTA 3L78A 3GKMA 3D4MA 4GSTA 2LUSA 3D0ZA 3DWVA 3E3EA 2NPBA 4GF0A 4FYUA 5HR3A 5ECKB 14GSA 2G2QA 4D73B 2GS3A 1UC7A 3IBHA 4NHZA 5G1LA 2B1KA 3M8NA 3KMOA 1HD2A 4WKWA 2H76A 1S3DA 2X64A 3IK9A 6GSXA 2LNSA 2JZRA 2DJJA 3ZMKA 4WBJA 3CRUA 4N11A 2F51A 5IMVA 5JWOB 3GH9A 1V40A 1XWKA 4KGIA 5B6MA 3HJOA 4MP4A 5HR0A 1OE7A 20GSA 3ZIVA 1RK4A 5H5RA 2H74A 4BVXA 1S3AA 3LXZA 4ZL9A 4YQMA 1NW2A 1VF2A 1XBSA 1TK5B 3F4TA 3D21A 1C72A 2LEGA 2C8UA 5DJLA 4E8HA 4I5QA 2HSYA 2XC2A 5DDLA 5G31A 4OO5A 4ZILA 4TR0A 1GUMA 2OACA 4RUVA 1GTIA 3GURA 4ID0A 3ZREA 1K0OA 1AXDA 3TCOA 2OBKA 1MTCA 3EU4A 5LNKe 2PGTA 3QAWA 2XHFA 1VF4A 2WCIA 4HU9A 2I81A 3HXSA 5J9BA 3I69A 3KH9A 2H0GA 4MF5A 4JBBA 2CQ9A 1AC1A 1FOVA 3Q6OA 5DJMA 3ZMLA 4OWYA 1OKDA 2C0GA 4HZ4A 2M46A 2NVLA 4TRXA 2VD1A 4FIWA 3FZ4A 3UJ1A 1XFLA 5IOXA 2V2GA 3CYNA 4WEYA 1YY7A 4OMVA 2CA8A 5KN3A 2LV3A 4ZXGA 2H6ZA 3LXTA 3ZITA 1XW6A 2FNOA 2IN3A 3ERWA 3FR9A 3MWHA 5D9VA 4KX4A 4K7IA 1TRSA 5HQPA 3UBKA 3APQA 4POKA 3C1SA 1EP8A 4F0CA 4IJIA 3DYRA 4MJAA 3FZ5A 1YF1A 4OD7A 2B5YA 5E59A 2LRTA 6GSUA 2HZEA 4O92A 4WBRD 3SBCA 2B1LA 5KEJA 4MPFA 3ZVJA 1ZCPA 1ERTA 1AQXA 2L4QA 3F63A 5KN1A 2E2MA 6GSVA 5FHIA 3IE3A 5ECLB 3DGQA 3FR6A 3F8UA 2O89A 3C1RA 3F0IA 1JZWA 1GSYA 1K0MA 2IL3A 2NDOA 3VWXA 2RM5A 1KTEA 3LQ7A 3QFBC 2GQKA 1USBA 1UN2A 3HVVA 4GSNA 3UAPA 2P0GA 2F8AA 2VOCA 4GCIA 3QPMA 3W6GA 4I8BA 2FA8A 1PD21 2H66A 2FHEA 1V2AA 3GHAA 4EL1A 1ZL9A 1JZRA 4BA7A 1FVKA 2K9FA 1A24A 3ISOA 3UIWA 4V1Ag 3N9JA 5GAPD 3KGKA 2HLSA 2REMA 3LWAA 5IPHA 5J41A 1TKDB 2IJYA 3ZTLA 3VWUA 4TR3A 1V98A 2GGTA 1THOA 19GSA 4TR4A 3KTLA 3L0HA 1V57A 3LG6A 4IBPA 4KDUA 5C04A 5IM9A 4V2NA 3QD9A 4Q5RA 4ZL8A 1ZYQB 3KD0A 1XW5A 2ZCTA 4GQFA 5DALA 1WRYA 2JZSA 3IXRA 4O32A 4FYBA 3HHVA 3LFLA 4L5OA 4ZIJA 3G7YA 2FLSA 3KXOA 5G1KA 1YEXA 4TOPA 3UMAA 3EC3A 2DMLA 4EUYA 1G7OA 3TJGA 4O5RA 2PVQA 1THXA 1ZOFA 3UARA 2V1MA 3L9SA 1DSBA 3C7MA 4MK3A 2L57A 1XOBA 3M0FA 5DVBA 3U5RE 1FO5A 1KNGA 5F8BA 1PQNA 2VCXA 2QC7A 3LORA 1GSUA 4F0BA 2H1GA 5A4UA 3TOUA 2P5RA 1M7TA 2ALBA 1PSQA 4RI6A 2F3MA 1O6JA 1Q4JA 3O76A 4AJ6A 4ECCA 4FYCA 5IPGA 2YANA 3TJFA 4QL9A 2H70A 1KEBA 3WT1A 3TKSA 1XZOA 3DMLA 5COHA 3CBUA 2HXKA 2M72A 2CX3A 1M99A 2CVBA 1TOFA 3QFAC 5L71A 1HNBA 3EINA 1I9DA 4TXOB 17GSA 2HRNA 1TP9A 4YAPA 3MAKA 2VL2A 4ILFA 4WR5A 1S3CA 2R6KA 4EE0A 1PMTA 2IFQB 1LU4A 4Q5QA 3GRXA 1MD3A 3NOFA 3HZ4A 3O3TA 1X0RA 5AIVA 1M2BA 3RDWA 2C0FA 3FR3A 4K6XA 5IQYA 3G9BA 4N0ZA 3VI7A 2OA7A 1SKSB 1QGVA 4ECBA 2YJ7A 5B8AA 1IYIA 2H71A 4LL4B 2CV4A 3GYKA 2FWGA 2WZ9A 3Q19A 4NV2A 4LMVA 5D9XA 1ZMAA 1T7PB 4K0NA 4N0VA 3F4SA 1GSEA 4GTUA 1QMVA 5ECOB 4WF5A 3GTUB 11GSA 4L0WA 3P7XA 4KDYA 3LSZA 1EOGA 1WJKA 4AGSA 4ML6A 3TJKA 1IYHA 4PUAA 12GSA 3EURA 1JZDA 2DC5A 2VL9A 2VLTA 1XWAA 4XCSA 2DMMA 2GT6A 2N5BA 4Q5NA 5C00A 3ZIJA 2H72A 2MYGA 3M9KA 1SL0B 3TJJA 2O8VB 1N2AA 2CZ2A 1BX9A 3Q18A 4EVMA 4WETA 5ELAA 3W8SA 3CTFA 5AN1A 4OO4A 3WD6A 2GSQA 2YP6A 4HZ2A 3IA1A 2LNTA 1ERWA 1TI3A 1EEJA 2PWJA 3FHKA 4IQAA 1OC9B 3FKFA 3VK9A 4ULXA 4KAEA 3GKXA 3TOTA 2MMOA 3QR6A 1YQ1A 5DAKA 2GZZA 1LJRA 5ABRA 1LBKA 3F3QA 3ME8A 3UEMA 2WGRA 2RLIA 3VPQA 4Q5FA 3VLNA 3FK8A 2GDRA 1ON4A 2LTKA 3L4NA 4GQCA 4H86A 3GKKA 4TKYA 2VCWA 4I2UA 3GFKA 2VAFA 5DCHA 3HJPA 2LSTA 2OBIA 5J4UA 2FUG2 5EL8A 1GNWA 1GNEA 2YWNA 1R5PA 4KUNA 2OE0A 1SL1B 2C3NA 3IOSA 2AHEA 3I43A 3HVSA 3DIEA 2GSSA 2GSRA 3DEXA 1Z7PA 2I3YA 2H30A 5ID2A 2FY6A 3GN3A 2OE3A 1WIKA 2JZTA 1F2EA 4MF6A 2WJUA 3SWLA 1O8WA 1SD8A 1Y25A 6GSSA 4ECIA 5DCGA 1B9XC 2YCDA 4DSSB 2CAQA 5AISA 4X0XA 4MZBA 1K3LA 3KTBA 3E0UA 4OFNA 1A2JA 3FRCA 2ZUPA 1FAAA 5F06A 2PMTA 4KA0A 5CYYA 1GWCA 2LRCA 1EOHA 2TRXA 2EIQA 3IV4A 2C80A 3HY2A 4XS1A 1W4VA 1I5GA 4OCFA 3LYKA 1OVNA 3ZZXA 5ECNB 2X8HA 3L9UA 2R2JA 3GMFA 1RW1A 5D73A 5A4WA 1XVQA 1G0TA 1TK8B 1X9MB 4NAXA 1B4PA 5G30A 3ZL5A 1A23A 2AJQB 2GQMA 2HRFA 2C3TA 4TW5A 4PURA 5ECRB 4IELA 2OE1A 2HYXA 4LLRA 2YV9A 1WE0A 2XBIA 1PX7A 1XCCA 1XOAA 4I97A 4BVYA 1BEDA 2CVDA 3WT2A 2YWMA 4IP6A 1WP0A 1M2DA 1A2LA 4LMWA 2A2RA 3BJ5A 2YZUA 4GSSA 3HKRA 1TJDA 2B6MA 2JADA 3A2WA 1MD4A 2MMNA 2C4JA 1UA5A 2QKEA 1J0FA 5E4WA 4G2EA 2IIYA 2FCHA 4K1FA 5FWGA 1G6YA 3P2AA 4IVFA 1VF3A 4L8EA 5J9CA 2RIIA 1XWCA 2O85A 2E7PA 2I9HA 3TKQA 2A4VA 5FT3A 1O81A 1SL2B 1K0CA 3N5OA 1V9WA 1T1VA 2H0IA 2MMAA 3KEBA 1R5AA 4AJ8A 4LL1B 1MEKA 5ECSA 3C8EA 2FWHA 4G9HA 2FWFA 3CSHA 4XRDA 1JFUA 4EC0A 3IRAA 2V41A 3BCKA 1BJXA 2H0HA 2DJ3A 2ON5A 4DSQA 2IMEA 3WGXA 1XWBA 3HDCA 5D96A 5IMFA 1RQMA 2P5QA 3D5JA 3IPZA 1U88A 3NIVA 3JCML 1OC8A 3VWWA 1OE8A 3ZRDA 2YV7A 4MH2A 5AGYA 1VF1A 1TI1A 4L5LA 1R7HA 2MBSA 4AF2A 4POBA 3K8NA 5KN2A 3IC4A 1ZZYA 2OKAA 4XIHA 1CQHA 4IKHA 1SYRA 2B3SA 3TGZA 3UBLA 2VCZA 5ENUA 1O85A 5JCWA 2LS5A 2E0QA 4XTSA 3F3RA 2F8FA 3U6VA 4XHMA 4KCEA 2L5LA 4G19A 4J2FA 1SENA 2JACA 1U87A 5ECHB 3BOAA 3Q74A 3FW2A 1M0UA 2IMIA 4HJMA 1O8XA 5IMZA 2MMZA 1W89A 4K7OA 4K0GA 1GUHA 3UL3A 2VUPA 1U3IA 1H75A 1K0AA 5J5NA 3GIXA 1TK0B 2GTUA 3BD2A 3FEUA 1X5DA 1HNCA 4EO3A 4KB3A 4P3YB 4NXIA 1DE2A 1O73A 2H1AA 5CP1A 3ZFLA 4IQ1A 3CSJA 3FZAA 1B8XA 3M3MA 2O7KA 4XS6A 5G5FA 2E2GA 1CQGA 3LEFA 5ELGA 2RUFA 4MA9A 2C0EA 3ED3A 3DKSA 1SK1A 2IFQA 5CO3A 3DD3A 1A0RP 3EYTA 3PH9A 1N8JA 4IS0A 1ACVA 5D9TA 1YJ6A 1FVJA 6GSTA 1XW9A 1TXXA 4G10A 1PKZA 2GT5A 4K9ZA 2KOKA 4KDXA 1T00A 1VRSD 4N30A 4CDOA 4HS1A 1EZKA 2PU9C 1T3BA 5GAND 5CRGA 2V32A 2RM6A 4ZBDA 5HR1A 2D2ZA 1EV9A 1VGLA 3GSTA 4MJCA 4ECJA 3ME7A 2YOIA 4TR1B 1GSDA 4PQHA 4HU7A 3IAS2 1FHEA 1SYXA 1SKWB 4K2DA 2YZHA 1F3BA 3UVTA 2V6KA 4IGJA 1X9WB 1GSFA 2K8VA 2YWOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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