5IMVA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f6
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imvA00
5J9BA 2VCXA 3N5OA 4MABA 2LV3A 5IMDA 1RQMA 2H19A 1YDKA 4K1FA 1ZCPA 2GDRA 2ZNMA 2R5GA 2WRTA 4PNFA 5HQPA 1WIKA 4XS4A 4WR5A 2B5XA 3F63A 2LJKA 3FRCA 1T4ZA 4H86A 5G2ZA 2B5YA 4F0CA 3TRPA 3CBUA 4TW5A 2WB9A 5E59A 2JZTA 4N30A 2KHPA 2C0GA 4OCFA 4WF4A 5JCGA 1TK0B 1OKDA 4WEYA 2PBJA 1O85A 3VPTA 3E9JB 1XWCA 1E6BA 4DSSA 1M2DA 3F3QA 2GT5A 2L57A 3WGXA 3GFKA 4MF7A 3A2VA 1Q4JA 1YKAA 3ED3A 1YKCA 1B9YC 1X5DA 3GKXA 3LEFA 1J08A 4TXOA 3A5WA 1A8LA 4YAPA 1R4WA 5DALB 5D8IA 2CA8A 5FT3A 2O8VB 2H6ZA 3H8QA 5AIXA 1TRSA 1WRYA 2LEGA 2WS2A 4GRFA 5DDLA 1TJDA 3AY8A 2P5RA 4IN0A 2WDUA 3RBTA 3CRTA 2VD0A 3HA9A 4ML1A 4PXOA 1XPVA 1PN9A 2XC2A 4HI7A 4PUAA 4TKYA 2DMMA 3FK8A 1V2AA 2VUPA 3UAPA 3FR9A 3RPNA 1EZKA 1GTUA 3VWVA 1BG5A 1K0MA 1FG4A 2H0GA 4KE3A 4N0VA 3QFBC 1AAZA 4G10A 1FB0A 1Z5YE 2R2JA 2H0HA 3TRQA 1F3BA 5H5QA 1MEKA 2WZ9A 4E8HA 3KXOA 22GSA 2P5QA 2DIZA 2H74A 2HSYA 1FOVA 4EDYA 2IJYA 3LGCA 2JZRA 3NIVA 3QFAC 1A2LA 8GSSA 4O92A 3H93A 3G9BA 2L5OA 1SJIA 1QQ2A 2ALBA 2HZFA 2LRCA 3HJPA 3ZYWA 1USBA 2RIIA 3R2QA 1BJXA 4RQXA 3QAVA 4KCAA 4OFMA 1QK8A 3EYTA 4BWQA 2LQQA 2DJ1A 2VIMA 3ME8A 5AIVA 2OADA 1FW1A 1X5CA 4KH7A 1ACVA 1HQOA 1ZYEA 2H76A 1QUWA 2I81A 4V1Ag 2AB6A 4F2IA 1T00A 1ABAA 1OE8A 3KD0A 1R5AA 4ISDA 3RAZA 3KMOA 2JSZA 2YCDA 3ZLPA 2G0FA 2LSTA 1Z9HA 3D21A 2VD1A 4Q5FA 3GX8A 2DIYA 1W4VA 1YQ1A 3EU3A 1M99A 1GUKA 4I5QA 3UVTA 4NAXA 4YQMA 4WBJA 4K7OA 4I6XA 3A3TA 3QDNA 1WJKA 2A2SA 1O73A 3F8UA 2MBSA 5DAKB 5AGYA 3Q74A 2MMAA 2PMTA 5D9WA 2AJQB 3LJRA 3IAS2 1H75A 2X8HA 3KH7A 4LMWA 3GKMA 4HJ2A 4WKWA 3FZAA 3HJOA 1BYEA 4I2TA 2R3XA 1WMJA 3UL3A 1PL2A 2JZSA 3TRXA 4V1Ap 2Z9SA 2YWOA 3DVXA 1OC8A 2VCZA 3WT1A 5CRWA 2VLVA 2I9HA 3IRAA 3V1WA 1TTZA 1TK8B 2WCIA 5GAPD 3ERWA 5HR2A 1B8XA 5A5KA 2DJ0A 1R26A 2VLTA 1A8YA 1GH2A 3VWUA 2B7KA 1A23A 1O8WA 3QOUA 5DQSA 2YP6A 4RQRA 4KCEA 4RUVA 2E7PA 1KEBA 5DJLA 4POLA 1V9WA 4ECJA 3GL5A 2IN3A 1B4QA 4YAVA 5A4WA 4IJ3A 5J9CA 5IQYA 2K8SA 2YPMA 1AQWA 5IMVA 3GTUB 3NOFA 4Q5RA 2IWTA 3EU4A 2GLRA 2YJ7A 1SL2B 3QR6A 2H6XA 4MPGA 5C04A 3TKSC 2PWJA 1CQHA 1ZOFA 3HVVA 3UEMA 1TK5B 2CAIA 3DXBA 1TI1A 4MJEA 3VLNA 5B7CA 1XW9A 4EUYA 4F03A 1PSQA 1ILOA 4MZWA 1ERWA 2FWGA 2H1BA 1SENA 3I6AA 2A2RA 1VF2A 2VCWA 2RM5A 2WJUA 2PVQA 1J0FA 1GTAA 1SYRA 1K0CA 2ES7A 4DVCA 2PU9C 2GZPA 5CREA 2RM6A 4AF2A 1O81A 4KX4A 1SD8A 2A4VA 1EGRA 14GSA 1U3IA 4O32A 4MZCA 5GAND 4G9HA 1Y6EA 1SYXA 4HQZA 3HHVA 2PGTA 3ZMKA 2L6DA 3C1SA 4IQAA 4ULXA 1EWXA 2I3YA 5J5NA 1PMTA 4WR4A 1K0AA 1GWCA 4QL9A 3GSTA 5JWOB 3O3TA 1A24A 2BMXA 3UBKA 4L0WA 3UIWA 2XHFA 2XPEA 6GSSA 3UBLA 5KN3A 2VO4A 2DBCA 4GQCA 3ME7A 1VF1A 12GSA 20GSA 1O6JA 3EC3A 3IR4A 3ZITA 4POBA 1F9MA 1X9WB 3IPZA 1I5GA 1EEJA 1N8JA 4NWYA 1OYJA 1R7HA 1OVNA 1XFLA 2JSYA 2FY6A 1GSDA 2F3MA 2J9HA 2KP1A 5ECRB 5CNWA 3DWVA 1EV4A 2X8GA 3M0FA 4YQVA 4AJ8A 4NMUA 5CO3A 4ACSA 5DCGA 2L5LA 3J7Yk 4K9ZA 1AW9A 1NHYA 6GSWA 2YANA 2CVBA 2VL2A 2V32A 2F8FA 4Q5NA 3G7JA 2HYXA 5ECNB 2GSSA 1NM3A 3UMAA 4PQ1A 4KSOA 2LRNA 3IHQA 4QQ7A 1J9BA 1SK0A 3G7IA 1TU7A 2GS3A 4IGJA 2IMFA 2VAFA 4Z7XA 1UA5A 3GUSA 1Z7PA 5IOXA 5COHA 2E2MA 3IAM2 1OAZA 2LRTA 2K6VA 1U6TA 4KDYA 1XVQA 5ENUA 1PKWA 5KN1A 5IIZA 6GSUA 4N11A 1JHBA 3VK9A 3F3RA 6GSVA 4GQFA 2QKEA 1THXA 1LU4A 1HNCA 11GSA 5D9XA 3LXZA 2IPAA 2GVPA 4X1UA 1OC9B 4I2UA 1N2AA 3D4MA 1T7PB 3DGQA 4ZBAA 2H01A 3FKFA 3MWHA 5AISA 4IP6A 5CRGA 2JU5A 4FH8A 3UOMA 1Q98A 3GKKA 5JCWA 3ZIJA 4ZXGA 1XVWA 2YWIA 2N5AA 4XCSA 1XCCA 4AJ6A 3GH6A 2HSHA 1OE7A 2B3SA 3FYGA 6GSYA 1AIUA 4LL1B 1UN2A 2C0EA 2R4VA 4JU5A 1PRXA 1UC7A 4QL7A 2GGTA 4POKA 1DE2A 2CT6A 4MF6A 3C73A 4HZ4A 1T1VA 5D93A 4IW9A 4Q5QA 4XHMA 2IFQB 4DEJA 1A0RP 1K3YA 4F0BA 1A0FA 2CAQA 3HVXA 4GXZA 2EIRA 1ZL9A 4DSRA 2VM2A 1EOHA 1WE0A 4ZILA 5L71A 1GTIA 1DUGA 1V98A 4GF0A 5F0GA 1SD9A 3RHCA 3LFLA 5HR0A 1DE1A 4NXIA 2AUVA 1MDIA 3W8SA 5C00A 1IYIA 2FNOA 3KP9A 1EOGA 2B5EA 2HZEA 4MLYA 2H66A 2MMOA 1JZOA 4PURA 4PUFC 5GSTA 1K3LA 4P3YB 2NTOA 3W6GA 1AQVA 4RI7A 1FAAA 4HUAA 4MJAA 2GSQA 2V2GA 5EL8A 5IMCA 4HJMA 3LG6A 2OE3A 4EC0A 2CVKA 3H79A 3LYPA 3WD6A 5F8BA 2PUKC 3CTFA 5D96A 4IVFA 2P31A 1EGOA 4FO5A 1GP1A 3IXRA 3KEBA 2BTOT 4FYBA 1G6YA 3F9UA 2H1GA 4OMVA 4MA9A 1HD2A 1PKZA 1KTEA 4ECCA 4JEDA 3KMNA 3EURA 5J41A 3I43A 4MK3A 1MD4A 3IOSA 4GSNA 3HCZA 3TOTA 1GNEA 3BCKA 3KTBA 4K6XA 1BX9A 5D9VA 3KJYA 2EC4A 3F0IA 3FY7A 3WT2A 1BQ7A 4FYCA 2DJKA 1SK2A 5DBQA 1G6WA 2OE0A 2GT6A 2YV9A 1U88A 1GSQA 5CAXA 1JLVA 1YY7A 3VI7A 2DJJA 4L5OA 3EWLA 3HD5A 3Q19A 2OE1A 1E2YA 3ZRDA 1TU8A 2H71A 4LMVA 3IA1A 5FWGA 1NHOA 2HI7A 4LA1A 4OFNA 5ECKB 1GLQA 4ID0A 4BA7A 3IBHA 3KCMA 4HU7A 1AXDA 3L9SA 3GKNA 5IMFA 4JE1A 2M46A 3KZQA 3US3A 4PNGA 3IE3A 3RDWA 2NVLA 1GL8A 1SJZA 3F4RA 16GSA 1XWKA 10GSA 2E2GA 2L6CA 3CXGA 4JZQA 1WOUA 1AC1A 4ZIJA 3A2XA 3APOA 2OA7A 3DIEA 2GSRA 2L4QA 2LUSA 2V6OA 3ISOA 1W89A 3VPQA 2HT9A 3RHBA 4TR0A 1T3BA 4D73B 4DSSB 2O87A 2XBQA 1S3CA 1NSWA 2I4AA 1HNAA 2NDOA 2VCVA 4TXOB 1PX7A 1H4OA 1LBKA 2X64A 1EV9A 4GSSA 4TR4A 5G1KA 2O85A 3SBCA 3HXSA 4V2LA 2MMZA 3I9V2 2H73A 2LQOA 5F07A 1M0UA 4BWSA 4MH2A 3L9VA 19GSA 2N5BA 2IIYA 5G5FA 2HRNA 2LJAA 3K8NA 3HVSA 1OC9A 3A2WA 2K8VA 3GA4A 1MD3A 5LCZA 3KIJA 4IJIA 1ERVA 2FA8A 4YH2A 3M3MA 4PQIA 4N0ZA 4JR4A 2H0IA 1SKSB 5ECMB 4BPYA 4K0GA 1F3AA 1TI3A 2C0FA 3KGKA 2NPBA 2C4JA 5J3RA 1SKRB 4XRDA 3HZ8A 3TCOA 2VCTA 4O5RA 4KDUA 2CX3A 2VCQA 4BVXA 4ZL9A 5HFIA 1M7TA 4EXJA 2JL4A 3TB2A 1TP9A 1K3OA 2DMLA 1ERUA 1M2AA 4WBRD 2EIQA 2VL3A 2LKUA 4X43A 1QFNA 1WP0A 2EIOA 1MTCA 3GSSA 1XOBA 4PX1A 4KW6A 2O7KA 4V2MA 3TKSE 4K7NA 3ZIVA 3KH9A 5CRHA 3EMPA 5FHIA 1RW1A 5IPGA 4ZBDA 1XWBA 4K0NA 5DALA 3JCML 4MF5A 2YN1A 3ZL5A 1M9BA 2H1DA 3GNJA 5DJMA 2IFQA 3WGEA 2R6KA 1EEMA 2GSTA 3PGTA 5ECSA 4EVMA 4CW9A 5ECOB 5HR1A 2PPTA 1GULA 3TKPA 2HNLA 1G7EA 3C8EA 2GQLA 4GTUA 2FWFA 3MNGA 3VWWA 2C3TA 5ECIB 2ZCTA 5ID2B 4EL1A 1SK1A 5EY6A 4IELA 5IM9A 4IKHA 4NV5A 2C3QA 4IHUA 3TKSA 3BCIA 2FA4A 1FVJA 1MDKA 2H8LA 2KP2A 3IK9A 1PQNA 5ECQB 4I97A 4OO5A 2OBKA 2V1MA 1Z3EA 3PR8A 4NHWA 4XS1A 2RUEA 3FZ4A 1EP7A 1TDIA 3ZMLA 3TJBA 2H72A 3M8NA 4HOJA 3P90A 5AN1A 3I69A 6GSXA 4KB3A 2I1UA 1DBYA 1GRXA 4ZBBA 3ZVJA 3E3EA 2C80A 2GZZA 4G19A 5ECLB 3IC4A 4ZL7A 4XIHA 4POMA 3EVIA 3LWAA 4K2DA 4GWRA 5KEJA 5G30A 1VGLA 2O89A 3D22A 4MZBA 5KN0A 2M72A 3TUEA 1SL1B 2PERA 1PGTA 2LJRA 3D0ZA 4DSQA 3O76A 4HZ2A 5IPHA 1FO5A 2B6MA 2LS5A 3QMXA 3BJ5A 1Z6NA 3LXTA 3EINA 3QAWA 1O7UA 3LORA 3LYKA 3QAGA 2V41A 2RLIA 3GYKA 2B1KA 4KNDA 5DAKA 3VFIA 4OCEA 4ECIA 2TIRA 2KUCA 2P0GA 1MDJA 1C72A 3M9JA 3TKQA 3ZFBA 3GL3A 5B6MA 5JCUA 3ZZXA 1GSFA 2X99A 4EO3A 5A4UA 4KUNA 1ZYQB 1DSBA 3TJKA 3BOAA 1XIYA 1U3AA 2DJ2A 5GSSA 2VL9A 5IO0A 4MP4A 2DSAA 2JACA 4D73A 2AV4A 1VRSD 4J2FA 2D2ZA 1AUCA 3F4SA 4OO4A 4TR1B 3UVHA 1SKWB 4J57E 4I8BA 2FHEA 3D5JA 2H1AA 3MDKA 1XZOA 4K8MA 1TXXA 1K0OA 4OFTA 2ON5A 1XXUA 9GSSA 2HFDA 3TDGA 3CTGA 3FZ5A 3UJ1A 1F6MC 3DRNA 1WPIA 5IOWA 5CYYA 5EPFA 18GSA 1TW9A 3GTUA 1TRVA 4ZB8A 1YF1A 2CQ9A 3PH9A 1ZGNA 1OC3A 4F82A 1KBNA 1YF0A 2QGVA 2CV4A 1VF4A 3QCPA 4WETA 1GSYA 3CMIA 2FWHA 4N10A 3BD2A 1S3DA 1S3AA 2MBTA 3MSZA 2HLSA 2RUFA 2OBIA 1YZXA 3DEXA 1TKDB 1I9DA 4JBBA 3P8WA 3L9UA 1GLPA 4BL7A 4MJCA 1JLWA 4IQ1A 5HFKA 2L59A 3E0UA 2IMKA 3G7YA 2OJLA 2REMA 5HR3A 3GMFA 4KGIA 4V2NA 3C71A 4J56E 4EF0A 4G2EA 4TR3A 5KN2A 4TOPA 4HQSA 3GIXA 1NW2A 1PX6A 3D6IA 3KTLA 2IMIA 2XBIA 3CSJA 3APQA 3D4TA 3IV4A 1XW5A 3TKRA 1QGVA 4FIWA 3DMLA 2C8UA 2AYTA 1XWGA 5DQYA 1T8EB 3O6TA 3ZTLA 1ERTA 1F2EA 1OKTA 4PQHA 3GRXA 3ERFA 5F06A 2B1LA 3MAKA 2WFCA 3U5RE 5B8BA 3KM6A 2JADA 2FWEA 4HU9A 1YEXA 3GV1A 4KSMA 1GNWA 6GSTA 2F8AA 2H30A 5ID2A 2CZ2A 3RPPA 3S9FA 4YQUA 3L4NA 1XOAA 3N9JA 3QD9A 3QPMA 2K18A 1IYHA 2B7JA 2ZUPA 5H5RA 2PN8A 2GQMA 2GZYA 1V40A 3ERGA 3OR5A 2IMEA 3VURA 4O7HA 1X9SB 5B8AA 1ZMAA 5ECPB 5ELGA 5G31A 1V57A 4WF5A 1M2BA 4L5LA 2C1YA 1PD21 1GUHA 4XRAA 3FR3A 1K0BA 1TOFA 2FGXA 4EKZA 1CQGA 5EVOA 1YJ6A 1ON4A 1TRWA 3CYNA 1GUMA 4XS4B 2YV7A 1AQXA 1HYUA 3Q18A 4X0XA 1V58A 4PGTA 1JZRA 4LL4B 1B4PA 5CRDA 3F6FA 3ZVJD 5INYA 2QC7A 3CRUA 4NV2A 1Z7RA 1HNBA 17GSA 4JR6A 5ECHB 3BBYA 4CDOA 1JZWA 3HYPA 4AGSA 2VLUA 1JZDA 3C7MA 4MH3A 3TJJA 1K0DA 1RK4A 5ELAA 2TRXA 1GSEA 5B6NA 4WXTA 1QXHA 4ZB9A 2N5FA 4L0UA 2F51A 2YJHA 2YWMA 2HXKA 3FR6A 1GSSA 2HRFA 1F37A 2YZHA 1PL1A 3J7Yb 4XTSA 1TRUA 2C0DA 1JFUA 4NHZA 3P7XA 3U6VA 4KDXA 5H5SA 4EE0A 3TJFA 2H75A 1WWJA 4NPBA 2R37A 2IL3A 1K0NA 1FHEA 4KAEA 2YNXA 2NBSA 5F05A 1XWAA 3F4TA 2C3NA 4XS6A 5CP1A 2CX4A 4IS0A 4ZB6A 2LNSA 4ILFA 2LNTA 5D73A 2FD3A 4KA0A 1U87A 2FLSA 2GQKA 3FEUA 1UVZA 1KNGA 3P2AA 3SWLA 3GH9A 4K7IA 4IP1A 2XPDA 4AJ7A 5D9TA 4MCUA 3FHKA 4ML6A 4GSTA 3EMXA 3VI5A 2GTUA 5A4VA 4TN8A 2HZEB 1B48A 2K9FA 3W8JA 2HE3A 2H6YA 1URMA 2WGRA 3CSHA 4OD7A 4GLTA 1EP8A 4MMMA 4ZL8A 2MMNA 3IK7A 2YWNA 3HJMA 3LSZA 1X0RA 2F9SA 1FB6A 3EE2A 5J4UA 1SL0B 4MDCA 2M80A 2OACA 4IBPA 2CZ3A 4ECBA 3ZFLA 2VOCA 3DVWA 3LQ7A 4GCIA 4TR1A 2KLXA 4TVEA 5G1LA 1A2JA 4BVYA 4RI6A 3GX0A 2VL2C 2YZUA 3L78A 3C1RA 2J23A 3KP8A 2X8CA 2OKAA 2L4CA 4LLRA 1THOA 2FCHA 3APSA 4JRRA 3ZREA 2H70A 1GTBA 1G0TA 2FUG2 1A2MA 4F9ZA 3DKSA 1O8XA 1SJ6A 3GURA 2TRCP 2MYGA 2V6KA 1XBSA 4TXVA 4EDZA 1QMVA 2PVOC 3DYRA 5LNKe 5IMZA 3PINA 5HFGA 1SU9A 1VF3A 2AAWA 2KOKA 1YEPA 3TGZA 2QSIA 1X5EA 1T4YA 4HDEA 2YOIA 3H1NA 3HDCA 5GZZB 2DLXA 4TRXA 4HS1A 3H4KA 13GSA 5JWQB 2CVDA 2ON7A 2E0QA 1X9MB 3UARA 3TJGA 1LJRA 3F6DA 1ZZYA 5JWRB 2BJXA 3Q6OA 5IO2A 3CSIA 1ST9A 3HY2A 1Z6MA 3FZ9A 2LTKA 5IMAA 7GSSA 3HKRA 4FYUA 2VM1A 3FW2A 4MJBA 5DCHA 5E4WA 3VWXA 3TOUA 1GSUA 1G7OA 2AHEA 3GHAA 3HZ4A 2WULA 5DVBA 4L8EA 1B9XC 5G5EA 1R5PA 4HEA2 3GN3A 3M1GA 3M9KA 2DC5A 1FVKA 4E8EA 3DD3A 3NZNA 2MZCA 1M9AA 3WYWA 3IDVA 1ML6A 4OWYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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