5INYA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f8
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 48
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5inyA00
1T3BA 5DQSA 2XBQA 4G19A 1SYXA 1BAYA 2NTOA 3RHBA 1WOUA 1U3IA 2IL3A 4I97A 5ECNB 1AQWA 1EEMA 2LJKA 2GVPA 1K0MA 4TN8A 3KIJA 3HD5A 4CHSA 1O73A 2AB6A 1HQOA 2KLXA 4HQZA 2LRNA 2MZCA 2GGTA 1UVZA 4EO3A 2GQLA 1XWAA 3RPNA 2XC2A 4OMVA 2LJRA 1GH2A 4PXOA 5CAXA 4PQHA 2L4CA 2DMLA 2E7PA 3FZ4A 2HNLA 3MDKA 4LMVA 5KN3A 2DSAA 3KCMA 3GIXA 2HSHA 2VCQA 1V98A 4IS0A 3VFIA 1U87A 4PNGA 2R3XA 3QFAC 4ZXGA 1O7UA 4GF0A 1PX7A 4HJ2A 2YJ7A 4MF7A 2H6ZA 2LSTA 1GTIA 5J41A 4TR1B 4KDYA 2JSYA 4KCEA 3M3MA 1ZYEA 2KOKA 3GRXA 1UA5A 3K8NA 2B1KA 4RQRA 2DJ3A 1XCCA 2CVDA 3GKXA 1EV4A 4GSSA 1OC8A 5EL8A 1YF1A 1KNGA 4G9HA 2DJ1A 3TRPA 1A0RP 3IXRA 1JZOA 2WULA 2X99A 3ZIVA 1FG4A 2VOCA 5CP1A 3CRUA 1A23A 6GSUA 3Q6OA 4PNFA 3UJ1A 1VF3A 1ZL9A 3KP9A 3NOFA 1GP1A 4KW6A 2P5QA 3I9V2 4MK3A 4L0WA 3GL5A 1THOA 4OO4A 2V32A 4KUNA 1Z3EA 1T4ZA 2C0GA 3IA1A 5DJLA 2C3TA 2FWEA 3E3EA 1J9BA 6GSTA 4KCAA 1Q4JA 4HZ4A 2I81A 3TDGA 2TRCP 5ECHB 1GSFA 2L5OA 2YWOA 1K3OA 5ENUA 3EU4A 3L9SA 4KDXA 3HA9A 1XIYA 2JL4A 2BJXA 1TP9A 5KEJA 2P31A 1R5PA 3VLNA 3HKRA 2VL3A 3HXSA 1DSBA 3DD3A 1I5GA 3VPTA 4KNDA 3FY7A 2OBIA 3KZQA 1SD8A 1SKRB 3UEMA 1FAAA 4WBJA 5JWQB 2ZCTA 3LYKA 4GTUA 4ZB9A 3DIEA 3DXBA 5FWGA 4ZBAA 2B5YA 4I2UA 3IC4A 4G10A 1B4QA 2VL2A 5H5SA 3HYPA 3QFBC 5INYA 1PMTA 1XW5A 1N2AA 1S3AA 1BJXA 3L9UA 5JCUA 2CVBA 3LSZA 2WFCA 6GSVA 2H01A 2IPAA 3J7Yk 5IMVA 4GLTA 3AY8A 3KJYA 5C00A 4ECBA 2H74A 3HVSA 4ZL7A 4POKA 4LL1B 1X9SB 1B8XA 4N11A 4DVCA 4L5OA 4DSSA 2VLVA 4LLRA 1B9YC 2WCIA 1ILOA 1MTCA 12GSA 5LCZA 3IRAA 3LJRA 14GSA 1EEJA 4TRXA 3OR5A 1XOAA 3LWAA 3RDWA 3NIVA 1YQ1A 3ZIJA 4EDZA 2LKUA 2OE0A 3C8EA 5IMAA 1ABAA 4IQ1A 2VUPA 2HT9A 5DAKB 2FD3A 2L6DA 1TI3A 4NMUA 3ERWA 1THXA 3TKSA 1YY7A 3DGQA 4TW5A 1EGOA 2C4JA 2TIRA 4EL1A 3BJ5A 4EDYA 3LXZA 3US3A 2BTOT 1GUMA 4BVYA 4YQVA 1BG5A 1QFNA 1X9MB 4POMA 2YP6A 3G9BA 3L9VA 4OWYA 3GFKA 3ISOA 3C1SA 2FY6A 3HDCA 4K7NA 3C1RA 5EY6A 2V2GA 4XIHA 1Q98A 3LQ7A 3SWLA 1WWJA 2PUKC 2O89A 2GQMA 4KX4A 1GRXA 3F0IA 2CT6A 2LRTA 5CO3A 1EV9A 4RUVA 4JR4A 1OC3A 5IPHA 3HJPA 2FHEA 3A2VA 1GUHA 3ED3A 3DWVA 3KGKA 3TUEA 1K0AA 3WGXA 4K2DA 3TKSC 2DLXA 3TJKA 2LQQA 4P3YB 3UAPA 2R5GA 5FHIA 4IN0A 3TCOA 5G5EA 3F8UA 2AHEA 1PGTA 1K0DA 3IDVA 4XS4B 3TGZA 2WRTA 2OKAA 4OO5A 4KB3A 2GT6A 2ON5A 1X5CA 1PQNA 1TOFA 1ON4A 2B5XA 4K7IA 2N5BA 4NHZA 2KHPA 5D93A 3APSA 1MDJA 3KH9A 4K7OA 4X1UA 2VCVA 2QC7A 4EE0A 3KD0A 5KN1A 1GWCA 3MAKA 1ERUA 1W4VA 2FWGA 4IHUA 5DALB 1ERWA 1SD9A 1GNWA 2EIOA 20GSA 2FWFA 1PSQA 1ZCPA 5ECMB 4AJ6A 5JCGA 4PX1A 3IAM2 2PMTA 1JFUA 2ALBA 2B3SA 4GQCA 1QQ2A 3ZZXA 2REMA 5JCWA 1O6JA 4ZB8A 1QGVA 2PVOC 4MP4A 3A2WA 2DJ0A 4RI6A 3ZVJD 3IAS2 3QAVA 1A8LA 5J5NA 2JZRA 1IYHA 3UOMA 5B8BA 4NHWA 3ZFBA 2A2SA 3UBKA 2N5AA 2H75A 1JZRA 4MPGA 4J57E 1FVKA 3TRXA 1FB6A 2VM1A 1B9XC 3D5JA 5GAND 3HVXA 2J9HA 2VCWA 4BL7A 5GSTA 1J08A 3Q18A 2YANA 5D96A 4AGSA 2YNXA 2AAWA 2RUEA 1MDIA 3H93A 3P90A 4N0VA 5D9VA 1O81A 4HU9A 3FRCA 2X8CA 3KMNA 3QR6A 5IOXA 5CRGA 2H72A 4H86A 5G5FA 4EF0A 3ZRDA 2PBJA 1K3LA 2PERA 1HD2A 4NV5A 5IMCA 4IJIA 2JZTA 2C8UA 2OE1A 1OKTA 2E2MA 2L4QA 2JSZA 5ECLB 2VLUA 1PN9A 1XWBA 2L6CA 19GSA 1GTUA 4ECCA 4E8EA 1XPVA 1F37A 3HJOA 3MSZA 1OVNA 3DYRA 4IJ3A 1HNAA 1MDKA 3I69A 4EVMA 1O8XA 3V1WA 2IFQB 5G1KA 2XBIA 3G7YA 2H30A 1J0FA 3GKNA 4PQIA 1OC9B 1TK8B 3TJJA 4HDEA 3F6DA 5IMZA 4POLA 1K0NA 4L8EA 5EVOA 5FT3A 1NW2A 3M9JA 5ECIB 2HZEB 2F8AA 1QMVA 2MBSA 3ZTLA 3FHKA 5CREA 4I8BA 4XTSA 1H75A 2EIRA 5JWRB 2LEGA 1M9AA 4WF5A 1DBYA 2NDOA 1TXXA 4Q5RA 4KDUA 2R6KA 3Q19A 2F8FA 3KM6A 1QK8A 2A2RA 1A24A 2AUVA 1RK4A 4JRRA 3MNGA 1Y25A 3G7JA 1OKDA 4HU7A 1ZGNA 3UVHA 4ZBBA 5ID2A 1SKSB 4HI7A 1NM3A 2ZNMA 2C3NA 4JBBA 5ECPB 3DVXA 2RIIA 2H1DA 2HFDA 3QMXA 4DEJA 3GTUA 2KP1A 1N8JA 3J7Yb 1T8EB 4MJEA 5IO0A 1G6WA 1FW1A 5J9BA 3KMOA 4WXTA 4GQFA 2B1LA 3GNJA 4N30A 2EC4A 4MLYA 5H5QA 7GSSA 1AQVA 3HZ8A 4GRFA 17GSA 3ZREA 1A2MA 2NVLA 4F82A 3FR9A 1TK5B 1OE7A 4ML6A 1XW9A 3DMLA 1PD21 4GCIA 3GN3A 4TKYA 4Q5QA 2L59A 4HJMA 3I43A 1Y6EA 2R2JA 3QCPA 4CDOA 1H4OA 4DSRA 1FOVA 4O5RA 1U6TA 1KEBA 3A2XA 1TDIA 3QOUA 5DJMA 3U6VA 1M99A 3IOSA 4TOPA 2FNOA 1K0BA 2V6KA 3P7XA 1XBSA 1IYIA 3HJMA 3GX0A 4XRDA 5AIVA 5E59A 2GSQA 4WBRD 2A4VA 4ZBDA 1EOGA 2WZ9A 3H79A 3GURA 4V2LA 11GSA 1JLVA 4F0BA 2D2ZA 2O87A 1Z7RA 2DJJA 5HR0A 1SJZA 2LTKA 2IJYA 1XXUA 5GSSA 4IQAA 2H8LA 2OJLA 4WKWA 1M0UA 1NSWA 1YJ6A 4FIWA 5F07A 2RUFA 1A8YA 4EC0A 4PUAA 2C80A 2HE3A 2JADA 4POBA 2H66A 3F4TA 1XZOA 1KBNA 2YN1A 4MA9A 2C0DA 3EMXA 4I6XA 5ELAA 2B5EA 5ABRA 2P0GA 4MDCA 1G6YA 2CAIA 2LRCA 1PKWA 5ECOB 2DBCA 4V1Ag 4X0XA 3IK9A 4ZILA 3FK8A 1A2JA 1XVWA 1A0FA 3LEFA 5CNWA 5DDLA 4TR3A 1WJKA 5LNKe 2O85A 3UL3A 4MJAA 2K9FA 4MZBA 2GDRA 2AJQB 1YZXA 3PGTA 2VO4A 2IMIA 4LL4B 4NAXA 2CVKA 2C1YA 3GH6A 4FYBA 4OFMA 1DE2A 4FYUA 3JCML 4K0GA 2OE3A 4TR0A 3SBCA 3HCZA 2M80A 1ZZYA 5G1LA 4JU5A 2LJAA 3GKKA 1G7EA 5J4UA 1GSYA 4GSNA 3KH7A 2MYGA 1E6BA 3GKMA 2PU9C 1U88A 4MF5A 4V2NA 3EURA 1FO5A 3TJFA 2M46A 2H6XA 2H71A 2MMAA 3GX8A 8GSSA 2LV3A 2LNSA 5B6MA 4BVXA 2WDUA 2F9SA 4NPBA 4L5LA 5B8AA 5F0GA 4L0UA 1FB0A 2GZPA 22GSA 5IQYA 2FA4A 2JACA 1SL0B 1V58A 2X8GA 4D73A 3CTFA 2YCDA 2HRNA 1TTZA 4DSQA 2IN3A 4PURA 3TKPA 4ULXA 1O8WA 2XPDA 2KUCA 1MD3A 2CX3A 1XOBA 1R7HA 5J3RA 2Z9SA 5AN1A 3F63A 3WYWA 1F3AA 3TKQA 2P5RA 3EYTA 2VCTA 3KP8A 5KN2A 1YKAA 1EOHA 1JZDA 4RI7A 3GH9A 4IVFA 1RW1A 2QKEA 1MEKA 2CZ2A 3TJGA 3H8QA 3RPPA 3UMAA 4K0NA 1SENA 3W8JA 1HNBA 3EINA 5CYYA 1C72A 2NPBA 4EUYA 1HNCA 3O3TA 4KE3A 4AF2A 3QAWA 3F4RA 3GHAA 2IIYA 1NHOA 4RQXA 2LUSA 4MJBA 5HFGA 1F3BA 4K1FA 1F6MC 1B4PA 2K8VA 4Q5FA 2F3MA 3GSSA 1PL1A 4BWSA 1V40A 4TXOA 4Q5NA 2RLIA 1BEDA 5EPFA 3D6IA 3M8NA 3ZITA 1URMA 1LJRA 2RM6A 3GMFA 3BBYA 2LNTA 3Q74A 1GTAA 2CA8A 1VRSD 2LQOA 2OA7A 1AAZA 3LFLA 4TR4A 1WP0A 3DRNA 1TW9A 3UARA 4QL9A 2WJUA 5GZZB 3M0FA 2YJHA 1ST9A 1XWCA 3IHQA 4Z7XA 5A4VA 5CRWA 2VM2A 2GSRA 2E0QA 1AW9A 3GA4A 4DSSB 3CSHA 2LS5A 2PWJA 1PKZA 3FYGA 1VF2A 1AIUA 1ZMAA 5AISA 2WGRA 2H0IA 2DJ2A 4HZ2A 4MABA 3D4TA 5IIZA 1GUKA 2H1BA 2GSTA 1V57A 5IMFA 3BCKA 3D4MA 4TR1A 4WF4A 3FKFA 2B7KA 4KAEA 3ZVJA 4E8HA 1S3DA 1Z6MA 1EP8A 3TJBA 4N10A 3NZNA 1GSDA 1BX9A 2G0FA 2FWHA 3LGCA 4FH8A 5A4WA 4MZWA 4OD7A 2IMEA 4PQ1A 5GAPD 4X43A 3H4KA 2PPTA 3CBUA 16GSA 3UBLA 4HUAA 5HR1A 3EU3A 1G0TA 1K3YA 1R5AA 4JZQA 4ILFA 1X5EA 3F4SA 4MPFA 3L0HA 1TI1A 2KP2A 6GSSA 3FEUA 1R4WA 4WEYA 2YZUA 2CV4A 2NBSA 5AIXA 5A5KA 2CX4A 2YWIA 4PGTA 2XHFA 1T7PB 2N5FA 1UC7A 2L5LA 2YOIA 3S9FA 1SU9A 1PL2A 5HR2A 3VWWA 2C0EA 3CXGA 4ECJA 3HHVA 3FR6A 2JZSA 3ME8A 1GULA 5CRDA 4BWQA 3WD6A 3VWUA 1GSSA 2HRFA 1X9WB 3D0ZA 2FUG2 1BQ7A 1OAZA 1ERTA 1XWKA 2H1GA 4KH7A 4CW9A 1JZWA 4KGIA 4F9ZA 4V1Ap 5G2ZA 1Z6NA 3ZYWA 5G31A 3E0UA 3KTBA 3N5OA 1GL8A 4JEDA 4JR6A 3VI5A 3VWXA 2O8VB 2IMFA 2K18A 1BYEA 1EGRA 3PR8A 1GSUA 2DMMA 2R4VA 2QGVA 1VF4A 1XWGA 3D22A 4ACSA 2PN8A 5ELGA 4BPYA 5D9XA 3QDNA 1DUGA 3F3QA 5ECKB 5E4WA 2GSSA 1WMJA 2H0HA 3A3TA 5LD0A 1OE8A 4OFTA 5DQYA 2R37A 5C04A 18GSA 3TOUA 1SL2B 2G2QA 3KTLA 5ECQB 2HLSA 1SJ6A 4K8MA 1Z7PA 2WS2A 3H1NA 4HS1A 3C73A 5IO2A 2DIZA 13GSA 2IMKA 4KA0A 5H5RA 1OYJA 2GZYA 4FYCA 1M7TA 3FZAA 4YQUA 2C3QA 4XCSA 3IPZA 1AUCA 1SJIA 3CYNA 6GSYA 2I4AA 4WR4A 4IELA 1QUWA 1UN2A 4ZL8A 5G30A 4I5QA 5DAKA 1F9MA 2VAFA 3A5WA 3IV4A 3DEXA 1F2EA 3GL3A 3P8WA 4ZL9A 1GSEA 2E2GA 3LXTA 1TKDB 2AV4A 2V6OA 5DVBA 1S3CA 2CZ3A 5DCHA 4XRAA 2V41A 3CMIA 2HI7A 3KEBA 2EIQA 3BOAA 2MBTA 4GXZA 4XS6A 3ZMKA 3P2AA 3HY2A 2GLRA 1LBKA 4NV2A 3FZ5A 5F8BA 3L4NA 5A4UA 4OCEA 1TJDA 5D9TA 1WE0A 3EVIA 3GYKA 4XS1A 5B7CA 2BMXA 1HYUA 2ES7A 3N9JA 3TKRA 5D9WA 2MMNA 2B6MA 1KTEA 2GQKA 2VD0A 2YPMA 4HEA2 3EMPA 4OCFA 3C7MA 3O76A 4IGJA 4ZIJA 1V2AA 1VF1A 1PA3A 1VGLA 2X8HA 1YDKA 4IW9A 2H19A 4XS4A 3TB2A 5KN0A 1M2AA 1EWXA 2DC5A 2IWTA 1RQMA 1NHYA 3BCIA 3EWLA 2L57A 2VCXA 4O32A 4J2FA 5IM9A 4AJ8A 4MZCA 3RHCA 1V9WA 1GLQA 2H73A 2OBKA 2I9HA 2VD1A 5IPGA 1YEPA 1WIKA 2VIMA 4EXJA 4GSTA 2VLTA 3LG6A 5ID2B 5B6NA 1SYRA 2WB9A 3HVVA 2H70A 3GTUB 5DALA 1I9DA 3TKSE 1JHBA 2X64A 4WETA 2DIYA 4GWRA 2YV7A 3EC3A 4YH2A 5ECRB 1YF0A 2CAQA 2K6VA 4KSMA 5COHA 3ZFLA 5HFIA 5HFKA 3KXOA 4LA1A 2V1MA 2O7KA 3QD9A 3PINA 3IE3A 1SK1A 2B7JA 3UVTA 1FHEA 3F3RA 3FZ9A 1DE1A 3MWHA 1R26A 1PX6A 5L71A 4HQSA 2GZZA 1Z9HA 2YV9A 1ACVA 4F2IA 1SK0A 2OACA 1K0OA 2VL2C 5IOWA 2H6YA 1B48A 3GSTA 3O6TA 3W6GA 3ZLPA 1A2LA 3U5RE 1YKCA 3ERGA 3TOTA 3VI7A 3ZL5A 1WRYA 3C71A 1USBA 3DVWA 1G7OA 1ML6A 3APOA 2ON7A 4K6XA 2GS3A 1WPIA 1TRWA 3IK7A 4MMMA 5D8IA 4NXIA 2YZHA 2VCZA 3ERFA 4EKZA 6GSXA 4YQMA 2FGXA 3IR4A 1W89A 2K8SA 2XPEA 2FA8A 4MH2A 2OADA 4K9ZA 3L78A 2F51A 1ERVA 4PUFC 1E2YA 1EZKA 4LMWA 2M72A 4F03A 3BD2A 3W8SA 4N0ZA 3R2QA 5F05A 4QQ7A 4YAVA 3M1GA 3E9JB 3UIWA 2I1UA 1GTBA 9GSSA 2PVQA 3IBHA 4JE1A 1SK2A 5D73A 1XVQA 3FW2A 2PGTA 3F9UA 3EE2A 5CRHA 2IFQA 1AXDA 3WGEA 4IP6A 4V2MA 4MJCA 1M2BA 1OC9A 1M9BA 3APQA 3ME7A 1U3AA 2HZEA 1K0CA 3WGDA 1EP7A 4ID0A 3VK9A 2YWNA 1XFLA 3RAZA 3CSIA 2H0GA 1LU4A 1TU7A 3DKSA 2YWMA 3WT2A 1MD4A 1ZYQB 2FLSA 3GUSA 3HZ4A 2VL9A 3QAGA 2AYTA 3VPQA 1QXHA 1CQHA 4O92A 1T00A 3PH9A 5JWOB 3M9KA 4F0CA 1TU8A 3VURA 1SL1B 2MMZA 5HR3A 4ISDA 1XW6A 4NWYA 2HXKA 3CSJA 3GV1A 5ECSA 1TRVA 5DCGA 5HQPA 1AQXA 1T1VA 2C0FA 4O7HA 1GLPA 1AC1A 4ZB6A 3D21A 3I6AA 1T4YA 4XHMA 4FO5A 1O85A 4IBPA 2ZUPA 1M2DA 2HZFA 2QSIA 2HSYA 4MH3A 4BA7A 4D73B 1GSQA 1PRXA 4TXVA 1Z5YE 4QL7A 1TK0B 2RM5A 1YEXA 2GT5A 3CRTA 5DBQA 1X0RA 2MMOA 5J9CA 2HYXA 1TRSA 2FCHA 3VWVA 2JU5A 3LYPA 1SKWB 3G7IA 1CQGA 5AGYA 3QPMA 2TRXA 3F6FA 2IMDA 1ZOFA 4HOJA 4G2EA 4IKHA 4WR5A 2H76A 2J23A 1FVJA 4AJ7A 1X5DA 3WT1A 3LORA 4YAPA 1GNEA 6GSWA 4MCUA 2GTUA 4ML1A 1JLWA 2DJKA 5F06A 3RBTA 4TVEA 3FR3A 3TRQA 4KSOA 5IMDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite