5IO0A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f9
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 45
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io0A00
1WPIA 2LTKA 3SBCA 4GSSA 1K0AA 1VRSD 3TJBA 3L4NA 1ZL9A 4V1Ap 4MH2A 1EZKA 8GSSA 1XIYA 4GQFA 1EV9A 4QL9A 2FHEA 3H4KA 1OYJA 2GZZA 3KTLA 4I6XA 2J9HA 3C1RA 2VL2C 4PX1A 3GMFA 3CTGA 3Q18A 3GKNA 4ZIJA 1XCCA 4OD7A 2D2ZA 3ZIVA 4DSSB 1XOAA 2CVKA 4RI6A 1BAYA 3RHBA 2WULA 2FNOA 1AAZA 4JR6A 2FGXA 3E9JB 2EIOA 1M2AA 3WYWA 2OBIA 1XBSA 2VCZA 4HS1A 5F05A 1F3BA 3TOTA 4NV2A 1QUWA 2VO4A 2DJJA 2H01A 1PGTA 1V40A 1WOUA 4J2FA 5EY6A 2LEGA 2OE1A 4AJ6A 4K7IA 3EYTA 3TRXA 1V58A 4GLTA 4KAEA 5JCUA 3MWHA 5HR0A 2B7JA 1G7OA 4TR1A 2GSSA 1V98A 3I9V2 2VCQA 2XPEA 4HEA2 2OADA 4MPFA 3IR4A 2C3NA 5B6NA 1SL0B 2PU9C 1U6TA 5JCWA 2MYGA 1AQWA 3IK7A 1Z5YE 1M9BA 4EVMA 3ME8A 2FWFA 1GSUA 2DJ0A 2LJAA 3GTUB 1J9BA 2QSIA 3GRXA 1K0DA 1HNBA 4YQVA 4NHZA 5DALB 2F3MA 3IRAA 2VUPA 1VF2A 2YCDA 3F8UA 3GX0A 2I9HA 1N8JA 1BQ7A 5IMCA 4DSQA 3VWXA 2GSRA 1EV4A 5J9CA 2MBSA 1OC9B 2C0EA 5D93A 2AV4A 4GRFA 2WCIA 5ECRB 2C4JA 2JSZA 2N5BA 3I69A 3W8JA 5ID2B 1Z7PA 2IL3A 2PGTA 3KH9A 1NW2A 2FA8A 2YNXA 2R6KA 1YEPA 3FZAA 4AF2A 1J0FA 17GSA 5ABRA 1KBNA 2GVPA 3D5JA 3HZ8A 4MZBA 4XS4A 4DVCA 3TRQA 3GIXA 2H66A 1GSEA 1BX9A 3EU4A 3GUSA 3DMLA 2HT9A 2M72A 2GTUA 2ZUPA 2B6MA 3EVIA 1ZYEA 4MF6A 1QFNA 5ECLB 3J7Yk 4IELA 4F2IA 2V32A 19GSA 4EF0A 1MTCA 3LJRA 1EEJA 2I3YA 1YEXA 22GSA 3UOMA 5L71A 2P5RA 4K0GA 2IMFA 4MZCA 5HFGA 2K8SA 3M9KA 3BOAA 4KA0A 5FWGA 2H1BA 5DJMA 3RHCA 1U3IA 1A8LA 3A2XA 3H1NA 1SK0A 2IMIA 3W6GA 2ON5A 4WKWA 1XWKA 3WT2A 2L6CA 1BYEA 1ZOFA 4RUVA 2DBCA 1BG5A 5IIZA 2OKAA 1M99A 2EIQA 1SD8A 3GSSA 4HDEA 3V1WA 1K0BA 2C3TA 3ZIJA 3GHAA 4V2LA 2V6KA 5B8AA 1HD2A 4XTSA 2O87A 1XOBA 4BVYA 2B5EA 1WMJA 1KNGA 1A0RP 2R3XA 4N11A 2WS2A 4LLRA 2LV3A 4L5LA 1OAZA 4NWYA 5LCZA 4G2EA 1PQNA 3HHVA 3TKSA 3SWLA 2PMTA 3RDWA 1SK2A 2H72A 3TJGA 3WGDA 2IFQB 1JZRA 6GSUA 4IS0A 3O6TA 6GSWA 3EMPA 4GTUA 4J57E 3GX8A 2B1LA 5IMVA 3HJMA 2VLUA 1RK4A 2H71A 1H4OA 4HQSA 1TP9A 1GH2A 3LXZA 1JLVA 1OC9A 2CX4A 1FVKA 2GS3A 3LORA 4ML1A 2VL2A 3QR6A 3DKSA 2FY6A 1PX7A 2N5AA 4EUYA 1TU8A 2H6YA 3FR3A 1FB0A 4Q5NA 1K0CA 4HOJA 3UJ1A 3QMXA 3UL3A 1SU9A 1PA3A 3ERGA 3WGEA 5HR3A 5F0GA 3D0ZA 4L8EA 3HZ4A 4HI7A 3GKKA 4YAPA 2DJ3A 2VM1A 1FVJA 1ACVA 3IE3A 3OR5A 2WJUA 10GSA 4TVEA 1PN9A 5H5QA 2HFDA 1G6WA 1A2MA 1E2YA 4HUAA 3GL3A 1PD21 4K7OA 5EVOA 3TKSE 1DE1A 5D96A 1OKTA 2PBJA 3M3MA 5AISA 2LNTA 4FIWA 3HCZA 4WR4A 3MSZA 3GH9A 2VLVA 1ZCPA 1Z6NA 4TXOB 7GSSA 2BMXA 3GFKA 4OFTA 3HJPA 5CP1A 1O6JA 3HA9A 3TOUA 3ZZXA 2H70A 3QDNA 5DAKB 3LWAA 3RPPA 5IOWA 2L5LA 2YANA 3BJ5A 2DIZA 5HR2A 2JL4A 3KCMA 1WE0A 4KCAA 1K0NA 1HQOA 1PX6A 2CQ9A 1V2AA 4ZB8A 3UMAA 4GXZA 4JE1A 4CDOA 1VF1A 2FD3A 1EEMA 1YKCA 2LNSA 2L6DA 2CAIA 3UVTA 4KDUA 4EO3A 2YJ7A 2LJRA 2KUCA 2NDOA 3ZITA 5IMDA 1ZZYA 1V57A 2I4AA 4IVFA 4TKYA 3PR8A 4ZBBA 1O8XA 1Q4JA 3KTBA 1YY7A 5E59A 1YKAA 1W4VA 2R5GA 3ZVJD 4AJ8A 3GH6A 3MDKA 2DC5A 18GSA 5IPGA 2GDRA 3KEBA 1AXDA 3M9JA 1LU4A 2CT6A 2KP1A 4WF4A 1Z3EA 3ZREA 1NHOA 2C0FA 5CO3A 2PUKC 2GZPA 1SYRA 1SJIA 1Z9HA 4ZB9A 1TK0B 4PNFA 1TI3A 2PVQA 2IPAA 2LSTA 4V2NA 5ECNB 2MBTA 2NBSA 1UA5A 3KGKA 4IW9A 2CZ2A 2H19A 5J4UA 5ECIB 2JZTA 3WD6A 3UEMA 2YV7A 1F6MC 5CRGA 5ECSA 4ECBA 2XHFA 1BJXA 4E8EA 1ZGNA 1O8WA 1CQHA 2HRNA 1K0OA 5DCGA 1ML6A 2TRCP 3FW2A 5G31A 2FWHA 6GSSA 3F4SA 3Q6OA 3BCIA 4ISDA 2WRTA 3TKQA 2HZEA 3DEXA 4WR5A 3TCOA 2PVOC 1XWBA 3ME7A 2AAWA 3QCPA 3H8QA 1I9DA 1TRSA 2GT6A 1WP0A 1GRXA 1RQMA 5EL8A 4MABA 3LQ7A 3EINA 3DIEA 2JZSA 3E3EA 3FK8A 3ZRDA 1ST9A 4NHWA 4XIHA 1FB6A 4PQIA 2FA4A 3FYGA 1GTAA 4ZB6A 2GSTA 4HJ2A 4HZ4A 1JHBA 4OCFA 3PINA 3KP8A 6GSVA 1R4WA 1ZYQB 1T00A 3D21A 1GP1A 5ECOB 2GT5A 2HLSA 4GWRA 5D9XA 1GLQA 2FWGA 4JBBA 5IMAA 4HZ2A 2C1YA 3VPQA 3EWLA 3FHKA 4PUFC 4ECIA 4KNDA 2OE3A 1UN2A 1FW1A 2MZCA 1GNEA 1TOFA 4HU7A 4XHMA 1AW9A 1GUHA 3H93A 4L5OA 2VOCA 4XCSA 1F37A 4ULXA 5KN1A 3TB2A 1TRVA 2C3QA 4IJ3A 1PKWA 2BTOT 1XWAA 3ZYWA 1T8EB 2VL9A 1GTBA 2CVDA 3KMOA 4FO5A 4WETA 4E8HA 3UARA 2OE0A 4RQRA 2RUFA 3A2WA 4MP4A 3A5WA 2VCTA 3D4MA 3LGCA 4WBRD 5G1KA 2ZNMA 2F8AA 1MD4A 3CSJA 2DJ1A 3EE2A 4YQUA 2H1AA 1TDIA 1S3AA 4POLA 5GSTA 3CTFA 1CQGA 2YZHA 3GURA 2J23A 2WB9A 2R4VA 4ZXGA 2P31A 5JCGA 1A2JA 3P8WA 4IP6A 4ECCA 5IQYA 2LQQA 2G0FA 3NOFA 5FHIA 3VLNA 4KB3A 4XRAA 4HJMA 3ZMKA 5CYYA 6GSTA 3D22A 4BA7A 1M7TA 2PPTA 5A5KA 1FAAA 3C1SA 3C7MA 5ELGA 5LNKe 4JRRA 4O5RA 2R37A 2IWTA 5A4UA 3IOSA 4TR3A 4TOPA 5D9WA 2HNLA 2H6ZA 4K0NA 2K6VA 3N5OA 3F6DA 1JFUA 3ED3A 20GSA 3TKPA 2O8VB 4GQCA 2IJYA 1AUCA 1TXXA 1O7UA 4DSSA 5IO2A 3CSIA 3CMIA 3TJKA 2YPMA 1NHYA 3F3QA 11GSA 1R5PA 4FYCA 5GSSA 3UBLA 4NV5A 4KUNA 3TJJA 1XW6A 3APSA 3UBKA 4Z7XA 3IAS2 3DRNA 1VGLA 2HXKA 4X43A 3TRPA 1DE2A 4J56E 4F03A 2DLXA 5JWRB 3I6AA 4LL1B 1MEKA 2P5QA 3IV4A 4WF5A 4KX4A 1SJZA 1GULA 4D73B 1SKWB 1QQ2A 5D73A 3ZFBA 5LD0A 3FR9A 1TI1A 4EDZA 1GSDA 5ENUA 4NMUA 3KP9A 1A24A 1M0UA 4POMA 1HNAA 1A2LA 5B6MA 1K3YA 2WZ9A 2R2JA 3DXBA 4K2DA 4MF7A 3FY7A 2G2QA 1V9WA 3GTUA 2TRXA 1AQVA 1M2BA 4QL7A 5ECQB 3F0IA 5DALA 1YF1A 1F9MA 3F3RA 2HYXA 5A4VA 1USBA 1YJ6A 2OJLA 2H76A 2H8LA 5DQSA 3ERFA 5G2ZA 3VWWA 1R5AA 4G9HA 4MJCA 5B7CA 2AB6A 1B8XA 1DUGA 1GTUA 2GQLA 2RUEA 1YDKA 5B8BA 2MMZA 4GF0A 1XWGA 3F63A 5DCHA 3TUEA 5H5RA 2X8HA 4YH2A 5ID2A 2DJKA 1SL2B 4BWQA 4MMMA 2LRCA 2AYTA 5ECHB 4PXOA 5KEJA 4ZL9A 4K7NA 1NSWA 1XXUA 4TR4A 1K3LA 2RM5A 4MDCA 5C00A 1TTZA 4IJIA 1HNCA 4NPBA 1DBYA 2DMMA 2LS5A 2O89A 2VD1A 3U5RE 1GWCA 2MMOA 3M1GA 5IM9A 2M80A 2YOIA 3F4TA 5CRHA 4PQHA 4Q5RA 3UAPA 1B48A 2JZRA 4Q5FA 4G10A 4EKZA 4FYBA 1X0RA 1GNWA 3RBTA 1MDKA 4KW6A 2WFCA 4O92A 1T4ZA 2KOKA 2XC2A 2JACA 1T4YA 2JU5A 3NIVA 4MK3A 2WDUA 1S3CA 1VF3A 2REMA 3IC4A 5F07A 1A23A 1IYIA 1OC8A 4QQ7A 14GSA 2C0DA 5H5SA 3IXRA 4ZBDA 3KZQA 3CXGA 2LUSA 2YJHA 2NPBA 2ES7A 1YF0A 3GNJA 2K18A 5IPHA 4K9ZA 3G9BA 1Y25A 3IHQA 1OE8A 4CHSA 3HVVA 2DMLA 4LMVA 16GSA 2KHPA 1A8YA 2DJ2A 2V1MA 2LRNA 1T7PB 4IQ1A 4ECJA 4K8MA 1MD3A 1A0FA 1KEBA 3ZTLA 4KGIA 2K8VA 3C71A 1GUKA 3C8EA 4EC0A 1THOA 2ON7A 2IN3A 2JSYA 3FZ5A 2E2MA 1EP7A 4OCEA 3VK9A 1OC3A 4JR4A 3KD0A 3HD5A 2LQOA 2I81A 4I8BA 1LJRA 3KM6A 3LXTA 3IBHA 2L5OA 5HR1A 2YWOA 3ZLPA 1X5DA 1FO5A 3HXSA 1Z6MA 1B4QA 1U87A 2VLTA 1JZDA 3DVWA 3WGXA 2IFQA 3L9VA 1TW9A 4P3YB 2XBQA 4K1FA 2BJXA 4LMWA 3TDGA 3GV1A 4F0BA 3Q74A 1XWCA 3IAM2 2F9SA 3QOUA 5HFIA 5G30A 5JWOB 4TR1B 1RW1A 3FEUA 2L57A 1AC1A 1MDIA 1Y6EA 1I5GA 2DSAA 1ZMAA 1H75A 4FYUA 1F2EA 1NM3A 1OVNA 1G7EA 3RAZA 2OBKA 4JU5A 4POBA 2PERA 1QMVA 4KDXA 1PSQA 3LEFA 3QD9A 5E4WA 2ZCTA 2OA7A 2V41A 1DSBA 3CRUA 2E7PA 5DQYA 2A2RA 3US3A 1FOVA 1TU7A 4EL1A 4V2MA 5CAXA 2H1DA 1FG4A 4N10A 1C72A 3E0UA 3L9UA 4OO5A 4HU9A 2VL3A 3GA4A 3EC3A 1SJ6A 1G0TA 1X5CA 3ZFLA 1O85A 2VCXA 5ECPB 1WJKA 5D9VA 3IPZA 3VI5A 3KIJA 4BVXA 2X99A 2CAQA 5JWQB 5CREA 1EOHA 4TRXA 5CNWA 1T3BA 2GGTA 2VCVA 3HY2A 5IMZA 3CBUA 3TGZA 2AJQB 3UIWA 2EIRA 3G7JA 4O7HA 4TXOA 1U88A 2HI7A 2H30A 2VCWA 4MPGA 1SKRB 3BCKA 5F06A 1GSYA 1TK8B 5DAKA 4XS1A 2B5XA 1M2DA 4XS4B 2YWIA 1X5EA 1KTEA 1WIKA 4AJ7A 4OMVA 4I2UA 1SD9A 13GSA 1SKSB 2VIMA 3IA1A 1AQXA 3QAWA 2GSQA 1TJDA 1ERUA 1E6BA 1S3DA 4IKHA 1B9YC 4MJBA 3M8NA 2A4VA 4MF5A 4MZWA 3ZVJA 2H73A 3JCML 1FHEA 3O76A 5AIXA 1XVQA 3DGQA 4XS6A 4PQ1A 5GZZB 4MCUA 2HZFA 5ECKB 4EXJA 2IMDA 3F9UA 1ON4A 3G7YA 3D6IA 1TRUA 3KXOA 4I2TA 5D8IA 2KLXA 1WRYA 3G7IA 1SL1B 3RPNA 3QFBC 5A4WA 2H1GA 2H0HA 1U3AA 4TXVA 5EPFA 1K3OA 3DD3A 2A2SA 2EC4A 1N2AA 2YN1A 4OFMA 1YZXA 4GCIA 2F51A 4Q5QA 1OKDA 1PRXA 3NZNA 4ZL7A 4TW5A 1PL1A 4WXTA 4KE3A 3QPMA 4KDYA 1F3AA 2NVLA 3N9JA 3R2QA 1XVWA 3PH9A 3J7Yb 4OO4A 2YWMA 3APOA 3HJOA 5KN2A 1XZOA 5CRWA 3TJFA 4KCEA 2GQMA 4N30A 5AIVA 1QK8A 1GTIA 2CVBA 5AGYA 2HSHA 3FKFA 1G6YA 1GUMA 3CSHA 4HQZA 2FLSA 5GAPD 2GZYA 1XFLA 2HE3A 3PGTA 4OWYA 3BD2A 5AN1A 4L0UA 1TKDB 5D9TA 2LKUA 4FH8A 3LYPA 2H0IA 4PUAA 5DJLA 2OACA 2XPDA 3MNGA 2B5YA 4AGSA 3KMNA 1GSFA 1R7HA 5IOXA 1PL2A 2QC7A 2LRTA 1EGOA 3CYNA 2CV4A 5CRDA 2KP2A 4IQAA 4PURA 2I1UA 4ZILA 2IMKA 3EU3A 4DEJA 2MMNA 5ECMB 1O73A 2V2GA 3ERWA 2B1KA 1UC7A 3KJYA 1LBKA 4WEYA 1YQ1A 4OFNA 5HFKA 3A2VA 2X8GA 3QAVA 5C04A 4O32A 1TRWA 3VURA 1ILOA 4GSNA 2MMAA 4N0ZA 2L4QA 4PGTA 4G19A 1AIUA 1URMA 2PWJA 2VD0A 5G5EA 4F82A 3I43A 1XW5A 1HYUA 3WT1A 2QGVA 2X8CA 3FR6A 2RM6A 3F4RA 5J5NA 1GSSA 4IP1A 4CW9A 4EDYA 3K8NA 1ABAA 3HVXA 5J9BA 2L4CA 1XW9A 1QGVA 2H6XA 3FRCA 2O7KA 2VAFA 1XPVA 9GSSA 1PMTA 4IHUA 2H0GA 3C73A 3P90A 1EOGA 4YAVA 3GYKA 2GQKA 3A3TA 4RI7A 6GSXA 1Z7RA 4ML6A 3CRTA 4JEDA 1THXA 1X9SB 3APQA 2DIYA 4ACSA 3VI7A 3AY8A 1VF4A 3VPTA 5J41A 3VWVA 3F6FA 3LYKA 2E2GA 2QKEA 4L0WA 3O3TA 1ERWA 3LG6A 4LL4B 1GL8A 2CZ3A 4GSTA 1JLWA 5G1LA 1X9WB 3QAGA 1O81A 3MAKA 2B7KA 4F0CA 4NAXA 4IN0A 4WBJA 5KN3A 4RQXA 2WGRA 4V1Ag 3LSZA 5F8BA 2HRFA 2XBIA 2B3SA 2YZUA 1W89A 3HDCA 3HVSA 2FUG2 5DDLA 3H79A 2VM2A 6GSYA 2HSYA 3L78A 4XRDA 4ID0A 1ERTA 3TKRA 4X1UA 2YWNA 1M9AA 4ILFA 1J08A 3DYRA 1OE7A 5G5FA 2X64A 2L59A 4MLYA 4IBPA 2FCHA 4F9ZA 1EP8A 2C8UA 5IMFA 2N5FA 5HQPA 2FWEA 3LFLA 5DBQA 1TK5B 4ZL8A 3DVXA 3GN3A 5COHA 4I97A 3VFIA 3U6VA 12GSA 2RLIA 4X0XA 1B4PA 2RIIA 2HZEB 4D73A 4K6XA 4YQMA 4PNGA 3GL5A 3Q19A 4H86A 4TN8A 3S9FA 3KH7A 3D4TA 5FT3A 4TR0A 1Q98A 1WWJA 1R26A 2F8FA 4MA9A 2K9FA 1SYXA 4EE0A 3ZMLA 4MH3A 2CA8A 3HYPA 1PKZA 3UVHA 3DWVA 3FZ9A 3L9SA 4JZQA 4POKA 2H74A 5IO0A 2AUVA 5DVBA 2YV9A 1IYHA 4BPYA 1JZOA 3GKMA 3IDVA 2YP6A 1T1VA 2V6OA 4KSOA 1GSQA 1X9MB 2IIYA 4BL7A 4NXIA 3W8SA 3VWUA 5J3RA 1UVZA 4IGJA 1K0MA 5INYA 3IK9A 3BBYA 2Z9SA 2NTOA 1BEDA 4BWSA 1SK1A 4KSMA 2C0GA 1B9XC 3M0FA 2JADA 5ELAA 1QXHA 2H75A 1EWXA 2C80A 3GSTA 4MJAA 4ZBAA 2ALBA 3EURA 5GAND 4MJEA 4N0VA 2CX3A 3P7XA 1GLPA 3P2AA 1MDJA 2TIRA 2LJKA 2P0GA 3GKXA 4I5QA 3EMXA 1EGRA 3FZ4A 4LA1A 2E0QA 5KN0A 2PN8A 3HKRA 1SENA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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