5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
1TU8A 2C3TA 2C0GA 4N11A 3TKRA 2H72A 3KD0A 1I5GA 5ELAA 4ECJA 5DQYA 3IOSA 3A2WA 5J9CA 4TXVA 3WT2A 2ZCTA 4HDEA 3EVIA 1JZOA 2H76A 2CVDA 4WXTA 1K0MA 2EIQA 1V40A 3HJMA 5DALB 2DJ2A 4TR1B 3GKMA 2LRCA 1K0CA 2FLSA 4MK3A 2NTOA 4V1Ag 1BX9A 2WRTA 3G7IA 3DIEA 3PGTA 1LJRA 1QQ2A 3RPPA 1THXA 1PX6A 3GRXA 3EYTA 2GLRA 3GL3A 3ZMKA 4FO5A 2H6XA 4POKA 1F9MA 3MAKA 3WT1A 2L4CA 3FY7A 5ECOB 5F06A 3QCPA 18GSA 2NPBA 4I97A 2B5XA 1USBA 3EURA 2WZ9A 2MMOA 3GURA 4TR4A 2RIIA 4FIWA 4JU5A 2GGTA 4KH7A 4IVFA 4MH3A 1SL1B 3ZIVA 3APSA 1DBYA 3QOUA 3GX0A 5AIVA 2F51A 2VO4A 1WWJA 4KE3A 1EP7A 4JRRA 3BCKA 3Q18A 4EC0A 2CQ9A 3G7YA 2L59A 1OE7A 1XCCA 2NVLA 3MDKA 4MJEA 4E8HA 1GWCA 3GH6A 4IJIA 13GSA 3LG6A 4D73B 2PPTA 2VCQA 1AW9A 2FNOA 1J0FA 4MF5A 4Q5QA 4IBPA 3O3TA 1O85A 3KZQA 3HYPA 3QD9A 5B6MA 3LEFA 2VOCA 4F0CA 5ECNB 2PVOC 2I4AA 4GXZA 5J5NA 3F6FA 1TRWA 2K6VA 3HVVA 4MZBA 3ZZXA 4X43A 1FAAA 2PGTA 1SKRB 2H0IA 3D5JA 2VIMA 5IMCA 4BA7A 10GSA 6GSYA 1GP1A 1JZWA 2OACA 3CSHA 2RLIA 5ABRA 5HR1A 1OC3A 5CNWA 4FYBA 3GKXA 2M80A 12GSA 2QC7A 3L0HA 2HRFA 4IW9A 4XCSA 2WJUA 2O85A 2DMLA 2A2RA 4GF0A 4XRAA 1YJ6A 3RAZA 3TJBA 3PINA 2P0GA 2H75A 1V98A 5HR2A 4IKHA 1B48A 3LGCA 5C00A 4MJCA 2GVPA 5IQYA 4K8MA 1GSFA 3IR4A 1XWCA 3KH7A 2FGXA 2LJKA 4ILFA 1K0NA 1YF0A 4HUAA 2H30A 3VK9A 1TJDA 4GLTA 3C1RA 2X8CA 2VCWA 2GTUA 4MF7A 4BWQA 1XBSA 5IPGA 3G7JA 2DJ3A 3A3TA 3J7Yk 3Q6OA 3LQ7A 1GNEA 2EIRA 2FCHA 2GSRA 2RM5A 4JE1A 1S3CA 3GKKA 3UBKA 4QL7A 2YNXA 1RW1A 3W8SA 1EOGA 5DAKB 3HJPA 4ISDA 3TUEA 1K0AA 1R5AA 3IAS2 1ERUA 3GIXA 2D2ZA 2FY6A 2H19A 1XWGA 1KTEA 2DJ0A 1SK0A 3QFBC 4J57E 2VL2C 1F37A 2AUVA 2LRTA 1K0BA 1VGLA 1GULA 1Q4JA 4IN0A 3ZL5A 5ECRB 4TW5A 6GSWA 4HZ4A 4I5QA 2YWOA 1DSBA 1K0OA 2XPEA 3GV1A 1SKSB 4PQHA 1TRSA 3TJJA 3LXTA 4H86A 1ABAA 3BBYA 4OO5A 3IBHA 2LUSA 1GSSA 1OC8A 2FWGA 5KN2A 3JCML 3TKPA 1GH2A 3HVXA 2MBSA 3FK8A 1ACVA 4RUVA 4HJ2A 2HXKA 4OO4A 1M9BA 2H73A 3M1GA 5CREA 1NHOA 3F4SA 3J7Yb 2JSYA 1SD9A 5ELGA 2YJHA 4ML6A 5IM9A 1EWXA 2OA7A 2B5YA 1OE8A 3VWWA 3CXGA 1T8EB 3O6TA 4RQXA 2MMZA 2YWMA 3M8NA 5HFGA 3TB2A 3QFAC 2N5AA 4RQRA 2H1GA 1IYHA 2K18A 3GN3A 4KB3A 1TK0B 1SYXA 1X9WB 2KLXA 3UARA 1WP0A 1TI1A 1QGVA 1PKZA 3DXBA 1O8XA 3FHKA 4PXOA 4WR5A 2PUKC 2J9HA 2VL2A 3EE2A 1PA3A 4TR3A 1R5PA 1QMVA 4WEYA 4KDYA 4K7OA 3GKNA 4LMWA 2BJXA 1TW9A 5HFKA 2LNTA 5JWRB 5GSSA 3D0ZA 3UEMA 4TKYA 5ECIB 3UOMA 4DSQA 1Q98A 3BCIA 3F9UA 4EO3A 1J9BA 3BD2A 2HT9A 3WD6A 1VRSD 4GSTA 1SJZA 4CW9A 1X0RA 4NWYA 5IMAA 2XBQA 1FG4A 1W89A 2OBIA 1X5DA 2X8GA 2LJAA 3IXRA 5EVOA 3KCMA 2PWJA 1FVJA 3IHQA 4PGTA 2H8LA 1WRYA 2NDOA 3TRXA 5A5KA 1KNGA 5DQSA 2IL3A 1YEXA 4WKWA 2GSSA 3ZLPA 2IWTA 4PUAA 3P7XA 4K1FA 3DGQA 5A4VA 1Z9HA 1MTCA 4KGIA 4ZILA 1MD4A 3FR9A 2WULA 4YH2A 2B6MA 2IPAA 2OJLA 4K0GA 4BVXA 2L6CA 4IP6A 2V41A 2WGRA 1FOVA 7GSSA 16GSA 5ECHB 1T7PB 2KOKA 1E6BA 4J56E 2VAFA 4XS1A 2VD1A 1Z7RA 2P31A 3QAWA 4HS1A 1PRXA 4KDUA 3KMNA 2H6ZA 2RUEA 1HNBA 1ZZYA 5CRGA 3A5WA 3FZAA 3CTGA 3QDNA 4LLRA 3TJGA 1EEMA 2ZNMA 1NSWA 2R37A 4GCIA 3HVSA 2L5OA 1Y25A 1ZCPA 2C0DA 3DEXA 3IV4A 2GZZA 2JACA 2YZHA 2ON5A 1ZL9A 3CSIA 4IP1A 4J2FA 4ZL7A 5H5QA 2C1YA 3C73A 4KW6A 2OE3A 1YQ1A 1BYEA 3ZRDA 3VI5A 5FT3A 3F6DA 1THOA 2PVQA 3CSJA 1O73A 1U87A 3GFKA 4EKZA 2GQLA 3DYRA 3VURA 3N9JA 4ZL8A 4TXOA 6GSSA 3DRNA 17GSA 4WBRD 5D96A 4EUYA 1XZOA 4JEDA 4NMUA 2VCXA 5GAND 11GSA 1Z5YE 2PN8A 4ID0A 1U3AA 2H74A 1GSDA 2E7PA 4K2DA 3FYGA 3F4RA 1ERWA 1OYJA 2M72A 4ZB8A 3ZFBA 3IK9A 1SK1A 2V32A 3M9KA 3KJYA 1SJ6A 1DUGA 3HA9A 5GSTA 2OADA 3GSSA 5A4UA 2VCTA 2AAWA 1J08A 4CHSA 1M9AA 3CYNA 1VF2A 2FD3A 3V1WA 5LCZA 1ZYQB 1JFUA 2HRNA 4G19A 5G30A 3DVWA 2IN3A 5C04A 6GSUA 1FB0A 4HQZA 2H1AA 5KN0A 1GRXA 1OC9A 4I6XA 3VWVA 1M0UA 1Z3EA 3D6IA 5E4WA 2IMFA 4ULXA 2O89A 2DIYA 3A2VA 1AQXA 3GTUA 5CP1A 1SKWB 1TI3A 4GQCA 2HLSA 5INYA 1B4PA 3ZITA 2GSTA 4Q5RA 3F8UA 3I6AA 2AJQB 1M2DA 3TGZA 2YN1A 1F2EA 1PGTA 6GSXA 3W6GA 1O6JA 3EU4A 5CRDA 2XPDA 4MP4A 3ZMLA 2LQOA 2GZPA 2H6YA 1PSQA 4CDOA 4MA9A 3ZIJA 1XVWA 3C1SA 3R2QA 5EY6A 2BMXA 5COHA 3L9UA 5CAXA 3ERWA 3UJ1A 3HD5A 4JBBA 4LL4B 4HOJA 1XOAA 5ECPB 3CRTA 1AAZA 3VI7A 1ZMAA 1O7UA 5IMFA 4QL9A 3RDWA 2R2JA 2CX3A 1X5EA 3KMOA 1B8XA 1NHYA 4EDZA 19GSA 1K3YA 3I43A 4KA0A 1LBKA 1PX7A 4L0WA 3H4KA 4F82A 4DSSB 2CX4A 2VL9A 2HE3A 3M0FA 2GS3A 3HZ8A 1EZKA 4Q5FA 4KSOA 4Q5NA 4O5RA 3WGDA 5EPFA 2KP2A 5D93A 1TU7A 2ALBA 3P2AA 2MBTA 3IC4A 3HKRA 1IYIA 2GZYA 3WYWA 1QK8A 1TRUA 1XVQA 2I81A 1W4VA 3TRPA 1TRVA 3SBCA 3TKQA 1XIYA 2VCZA 4XHMA 1K3OA 3DMLA 4K6XA 5ID2A 1M2BA 3UVTA 2JADA 4YQUA 2YWIA 3C71A 3KTBA 4NHWA 4MZWA 4MCUA 5DVBA 3ED3A 1WJKA 3TOTA 1GNWA 1F3BA 1X9SB 6GSVA 3UVHA 2PBJA 4E8EA 3I9V2 2LTKA 4IS0A 1Y6EA 2PERA 3FRCA 2LRNA 1XOBA 2B1KA 4MLYA 4MABA 2QKEA 5H5SA 4BL7A 2JZRA 3HZ4A 1V58A 2C80A 1TTZA 1AUCA 4HI7A 5LD0A 1BEDA 1JZDA 1A24A 4MJAA 4EF0A 4BWSA 2AHEA 2QSIA 4F0BA 2LS5A 4HEA2 3LWAA 1DE2A 2C8UA 2TIRA 4OFNA 2C3NA 4XS4B 3M3MA 4LMVA 1SL2B 2MZCA 2HFDA 5D9VA 5B6NA 1WMJA 3D22A 2FUG2 1KBNA 2GDRA 2G0FA 5L71A 1H75A 2TRCP 5D9XA 2E2GA 1K0DA 2HI7A 5DALA 4TR1A 4X1UA 5GAPD 2OE0A 2VCVA 1S3DA 1PMTA 3UL3A 3TRQA 1AXDA 1OVNA 1YZXA 3H8QA 3M9JA 1GUHA 3EMPA 1A2LA 2V1MA 4KSMA 3VWXA 4KX4A 1NW2A 2H66A 2PMTA 2XHFA 5EL8A 1H4OA 3ZVJA 3MSZA 1AQWA 3D21A 4PQIA 1EGOA 1R4WA 2VD0A 3NZNA 4NXIA 2IMKA 3FZ4A 2YV9A 3RHBA 3UBLA 4FYCA 3FEUA 3KGKA 1PL2A 2O7KA 5KEJA 4POLA 4F03A 2I9HA 1TK5B 2DJKA 1SENA 2HNLA 5DJMA 5D9WA 4IGJA 1SK2A 1GLPA 1Z6MA 4F2IA 4YAPA 4L0UA 1UVZA 3TKSE 2ZUPA 4POMA 5DBQA 3KXOA 5HR3A 4D73A 3L4NA 1YF1A 2F8FA 5J4UA 4ZB6A 4I8BA 1RQMA 5ECMB 1X9MB 3K8NA 1N8JA 5A4WA 3LYKA 3TKSC 3CMIA 4OFMA 3APQA 3F3RA 4L5OA 4RI7A 3ME8A 5B7CA 3H1NA 3VPTA 5ECSA 1TKDB 2FHEA 4GQFA 5CRHA 2VM1A 3A2XA 3W8JA 2B1LA 2M46A 2PU9C 1SU9A 1SD8A 5D8IA 1U3IA 2GQMA 5HFIA 1T1VA 5IPHA 3ERFA 1JHBA 3ZTLA 4OMVA 4OCEA 4O7HA 5DCHA 2CZ2A 3C7MA 2CVKA 3HCZA 4MPGA 4LL1B 5IO2A 5D73A 3EWLA 1KEBA 2GQKA 4WBJA 1GSQA 1GL8A 5G5EA 4PQ1A 2VLVA 1MEKA 2DBCA 5IOXA 3RPNA 5ENUA 3OR5A 4DEJA 1ERTA 4NAXA 3H79A 1XW6A 1UA5A 2IFQB 4PX1A 5HQPA 1GLQA 4N10A 1F3AA 3SWLA 2C0EA 3LXZA 1O81A 5D9TA 3BJ5A 5J9BA 1FW1A 3GHAA 4V2LA 2DLXA 3Q19A 3F4TA 2X8HA 4V2NA 3ZVJD 2X64A 3GSTA 1B9YC 4FYUA 2H0HA 1EV4A 1F6MC 1I9DA 1M2AA 2DJ1A 2MYGA 2L5LA 4ECCA 1TK8B 4TN8A 3IPZA 3H93A 1ZOFA 1T4ZA 4ZIJA 3TKSA 2A2SA 2EIOA 8GSSA 5IMZA 4ZBAA 3E0UA 2KUCA 3US3A 1B4QA 4GRFA 1MDKA 2RM6A 3BOAA 2HZFA 2MMAA 3EU3A 2B3SA 5DAKA 3S9FA 5KN3A 3HXSA 4K7IA 2YOIA 2LSTA 2RUFA 2N5BA 4XS4A 1G6YA 4PNFA 4FH8A 3DVXA 5ECQB 9GSSA 4NV5A 2BTOT 4MZCA 3IDVA 2DIZA 2FA4A 4JR4A 3E3EA 4DSRA 4KUNA 1M7TA 3DWVA 4KCAA 2L57A 4DVCA 3F3QA 2N5FA 3GX8A 1CQHA 1MD3A 2F8AA 1PL1A 4BPYA 4WETA 2IMDA 2JL4A 5ECKB 5ECLB 1SL0B 3QPMA 5G1LA 2R5GA 2IMIA 5CYYA 2VLUA 3LYPA 1WIKA 3ZYWA 4EE0A 3UMAA 4HQSA 2YJ7A 3EC3A 4QQ7A 2V2GA 2REMA 1MDJA 1BAYA 4TOPA 5DJLA 2E2MA 2H70A 5KN1A 4YQMA 1YDKA 1HNCA 1JZRA 5JWOB 1XXUA 3GNJA 2FWEA 2H01A 1Z6NA 4MH2A 2K9FA 1VF1A 5AIXA 1URMA 4N0VA 1OKTA 1OKDA 4OFTA 3NIVA 4MF6A 2IMEA 1PQNA 4HJMA 3L9VA 1AIUA 1XWKA 2IIYA 2CAIA 2KHPA 1HD2A 2R6KA 1XFLA 4POBA 14GSA 3N5OA 4IJ3A 4N0ZA 1GUKA 1YEPA 4IQAA 5IMVA 1G7EA 1TP9A 1GTIA 5J41A 4G10A 4MDCA 1A8LA 4NPBA 2P5RA 3U6VA 2WCIA 2HZEB 1R26A 4HU7A 1XPVA 4TVEA 4Z7XA 5H5RA 2JZTA 4GWRA 1PD21 3GA4A 4AJ8A 4F9ZA 2FWHA 1JLVA 2GT6A 3VLNA 2OE1A 1FHEA 1RK4A 4AJ6A 2OKAA 1A23A 1ON4A 5F07A 1UN2A 1YKCA 2IFQA 3TOUA 4MMMA 3IE3A 4MJBA 3VWUA 2KP1A 4RI6A 3IAM2 2XBIA 2MMNA 2YP6A 4TR0A 3GYKA 3L78A 1AC1A 2O8VB 3MWHA 5DCGA 5G5FA 1G6WA 1JLWA 3LFLA 2LQQA 1XW9A 4I2UA 2VUPA 2FWFA 5F0GA 2YWNA 1QXHA 3FZ5A 4ACSA 2CVBA 4K7NA 1V9WA 1GSYA 1BG5A 3L9SA 2WB9A 3RHCA 5J3RA 4PNGA 1TXXA 3ISOA 1XWBA 4KDXA 2YPMA 4YQVA 2LV3A 6GSTA 3NOFA 3CBUA 5IO0A 1TOFA 3ZFLA 5B8AA 1BJXA 2H1DA 1T3BA 1BQ7A 3LSZA 2I3YA 4IQ1A 2LJRA 1WPIA 2K8VA 2VM2A 1HYUA 4OD7A 4IELA 1M99A 3QR6A 4PUFC 3CTFA 3ME7A 4EXJA 3GMFA 4ZL9A 2FA8A 3UAPA 2IJYA 2LKUA 1N2AA 2V6KA 4OCFA 3HJOA 4GSNA 2HSYA 5E59A 4X0XA 1ZYEA 2WFCA 4ECBA 4O32A 4WR4A 3FR3A 4HU9A 3KTLA 4IHUA 2L6DA 1VF3A 1TDIA 2V6OA 3FR6A 2C3QA 1FB6A 3E9JB 3FZ9A 5F8BA 1YY7A 3KP9A 2AB6A 3KH9A 5DDLA 1WE0A 1T4YA 3D4MA 4WF4A 5AN1A 5IOWA 2X99A 1GTAA 2K8SA 5AGYA 2CV4A 5CRWA 3G9BA 1X5CA 3FW2A 1PN9A 3IA1A 4K0NA 3KEBA 3P90A 2LEGA 1LU4A 2F9SA 3TJKA 1WOUA 2I1UA 1U6TA 2XC2A 2JZSA 2GSQA 1GTUA 2DMMA 2DJJA 1EV9A 5IIZA 4EL1A 2A4VA 4TXOB 3UIWA 3F63A 5HR0A 2G2QA 1OAZA 1SYRA 5F05A 4JR6A 5LNKe 1YKAA 2CZ3A 3TDGA 1EOHA 4KNDA 4KCEA 1C72A 1QFNA 4EVMA 5IMDA 20GSA 2C0FA 1FO5A 3F0IA 4WF5A 22GSA 2AV4A 2QGVA 3QAVA 4P3YB 4ECIA 3TJFA 2HZEA 3WGXA 2WDUA 1ML6A 1T00A 1NM3A 2B7KA 2WS2A 4NHZA 1SJIA 2P5QA 1GTBA 1O8WA 4KAEA 2VLTA 5FWGA 4L5LA 1A2MA 4G9HA 3DD3A 4GSSA 3CRUA 3D4TA 3I69A 1MDIA 1GSUA 2CT6A 4G2EA 1S3AA 2VL3A 2H0GA 2GT5A 4XS6A 2E0QA 3HY2A 3LJRA 4MPFA 3QMXA 1ILOA 2EC4A 3GL5A 1OC9B 3LORA 3C8EA 3APOA 3GTUB 3ERGA 5G1KA 2YANA 1UC7A 1ERVA 2TRXA 4DSSA 1A8YA 4LA1A 4O92A 4XRDA 2O87A 3GH9A 2B7JA 3ZREA 4GTUA 3VPQA 3EMXA 1EGRA 1EEJA 4NV2A 1CQGA 3KIJA 4AGSA 2C4JA 1G7OA 2YV7A 3Q74A 1PKWA 4EDYA 5FHIA 2YCDA 2R3XA 3KM6A 1V57A 5JWQB 1ST9A 2HYXA 1V2AA 1A2JA 4ZXGA 5CO3A 4AF2A 5G31A 2Z9SA 1ZGNA 3IK7A 2DC5A 2L4QA 3GUSA 2HSHA 4V1Ap 3MNGA 2J23A 1FVKA 3QAGA 1XWAA 4ML1A 4V2MA 4YAVA 2LNSA 3U5RE 4N30A 3HDCA 3IRAA 4AJ7A 3RBTA 4OWYA 2NBSA 5JCUA 1QUWA 2H71A 2YZUA 1GSEA 3P8WA 4PURA 3DKSA 2ON7A 1B9XC 4XIHA 1XW5A 2OBKA 1R7HA 2F3MA 2CAQA 4TRXA 1AQVA 1GUMA 1A0RP 2H1BA 2R4VA 2AYTA 3KP8A 5JCGA 3AY8A 2B5EA 2CA8A 1G0TA 2JU5A 5B8BA 5JCWA 5AISA 1U88A 4BVYA 5ID2B 4ZBDA 4HZ2A 1A0FA 2JSZA 4XTSA 1K3LA 3PH9A 3O76A 1EP8A 4L8EA 1VF4A 3HHVA 4JZQA 3FKFA 1E2YA 1HQOA 5G2ZA 2DSAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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