5IPGA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure fft-butyl (hyperoxodized by t-butyl hydroperoxide)
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
156
structure length
154
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 43
structure length 154
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5ipgA00
1U6TA 3IE3A 4QL9A 2M80A 4XHMA 1ABAA 2GSQA 2HZEB 3TKSC 2PVQA 5ECNB 3APSA 4OFNA 1U88A 1EZKA 1UC7A 1ST9A 1NM3A 4BA7A 3E9JB 1GULA 5KN1A 1O81A 1U87A 3TOUA 5ECSA 3TJGA 5IPGA 5ABRA 1QQ2A 1EEJA 1MEKA 1I9DA 2ALBA 3KIJA 1B48A 2B6MA 4WBJA 1GL8A 2YJ7A 3FRCA 4HJMA 1OKDA 4OWYA 2XBIA 5G5FA 1XW5A 4BWQA 3FW2A 1S3CA 1A0FA 1SD8A 3MDKA 3M0FA 2IN3A 4J57E 2FLSA 2FD3A 1MTCA 4PQHA 2FY6A 4Q5FA 2DJ1A 4RI7A 1NHOA 3F0IA 11GSA 3ZL5A 5DAKA 5B8AA 3GN3A 1SL0B 1TK0B 3F4SA 1ZGNA 2VOCA 4D73A 4GQCA 1WMJA 4XS1A 1TDIA 3IXRA 4FIWA 4G9HA 4RUVA 2OADA 14GSA 2OE3A 2JZTA 2LUSA 3A3TA 2OACA 3VK9A 3QAVA 1T1VA 4NWYA 3VURA 4K6XA 4WEYA 1KTEA 4KAEA 5ECRB 1XWBA 3DRNA 2IMKA 4GQFA 3L9VA 4ZL7A 1WJKA 1ZCPA 5D9TA 3GX0A 2F3MA 1THOA 1T00A 3GSSA 2P5QA 1M2BA 4L5LA 3IPZA 3AY8A 1A8YA 3HD5A 2CVDA 3F4TA 2QGVA 1SKSB 1N2AA 4TOPA 3QMXA 1SYXA 3KH7A 3UJ1A 1J9BA 1GSEA 2R3XA 1Q4JA 2ES7A 4MPFA 5JWQB 2C4JA 4BVXA 2HNLA 2YCDA 2FWHA 1EV9A 2RIIA 3DEXA 2GQKA 3H93A 2H0HA 1GUKA 1K3YA 5G1KA 4LMVA 5ENUA 1H75A 4IBPA 3LEFA 4GSSA 4ILFA 3L9UA 3SWLA 5A5KA 4O92A 5ECMB 1BYEA 3HYPA 1TKDB 4NHWA 4YH2A 1AUCA 2PUKC 1AIUA 1A2MA 1PD21 2HYXA 1GSYA 3KTLA 2CVKA 2J9HA 1JLWA 2KP1A 3ZMKA 5IMFA 2H74A 1PN9A 4V2MA 5IMAA 2H71A 5AN1A 2L6CA 2GSSA 3RBTA 4HJ2A 4QQ7A 1NSWA 3QDNA 3EINA 4F82A 2LQOA 5ECHB 2YWIA 1EGRA 5LD0A 1PX6A 2AUVA 5D9WA 3LYKA 3G7YA 4IHUA 3O3TA 3FK8A 1ERVA 3HVVA 1BAYA 4ISDA 13GSA 4GTUA 2VD1A 3TKPA 1AQVA 20GSA 3ZFLA 2C0GA 3ISOA 1HQOA 5ECKB 3HKRA 5C04A 1WE0A 1M99A 2VD0A 1Z7PA 2CVBA 4JE1A 3UBKA 2BJXA 2RM5A 4EE0A 4MH2A 4MZCA 3M1GA 5COHA 2WB9A 3GIXA 4MF5A 4EVMA 4F03A 1K0CA 3C1RA 3EMPA 3OR5A 4I97A 1GUHA 4TXVA 5A4UA 3UMAA 4AF2A 3FEUA 3KGKA 1FAAA 4YQVA 4WXTA 4ECJA 5KN3A 2LV3A 3ME7A 3UARA 4N0VA 2H73A 2VL2A 5B7CA 1SK2A 4MPGA 2B7JA 4JEDA 1F2EA 1S3DA 1G0TA 1LBKA 3LSZA 1U3IA 3F6DA 5D9XA 2PBJA 2IFQA 1CQHA 3DYRA 4LA1A 4RI6A 1OC3A 3ME8A 5DALB 1YJ6A 3GV1A 1HNBA 2E7PA 2IMDA 1Z5YE 3ZITA 4ULXA 1ERWA 1YKCA 2VM1A 4KDXA 4AGSA 2OE1A 3PGTA 4L0UA 5HFGA 3QCPA 4K9ZA 4L8EA 2R5GA 3ZREA 3GYKA 2H6ZA 1BX9A 3FR6A 22GSA 2YWMA 3L4NA 2B3SA 2MMZA 3H4KA 2DC5A 1USBA 4NPBA 2EIOA 2LJRA 3DD3A 2PWJA 2NPBA 3IHQA 2OBKA 1SL2B 4HQZA 1BQ7A 3ZVJD 5KN2A 1K0DA 2DJ3A 4ML6A 4K2DA 2WZ9A 3GKNA 2VO4A 2A2SA 1HNAA 2PVOC 2O8VB 2JSZA 3RDWA 1O8XA 3UOMA 2DMLA 3N9JA 2R37A 1YY7A 4OO4A 3A5WA 3TRQA 5DJMA 4PGTA 1RW1A 1G6WA 2GDRA 5IPHA 1YEXA 4KUNA 3J7Yk 3IA1A 4AJ6A 3KP8A 1NW2A 3LGCA 1TXXA 2GT6A 4MABA 1YF0A 4HS1A 3WYWA 3VPQA 1GNWA 4IELA 2X8GA 2VAFA 2VUPA 4I2TA 1QXHA 1K0MA 3F6FA 4KGIA 4PQ1A 4TXOB 1FHEA 4ACSA 3W6GA 5EPFA 3NIVA 2MMAA 2IL3A 1GSQA 1XFLA 2O85A 4MJCA 1ZYQB 3KTBA 1Q98A 3WT2A 3RPNA 3BJ5A 3FHKA 3C7MA 4JR6A 4X0XA 1WRYA 2X64A 1JZWA 3IV4A 3EWLA 1V58A 2DBCA 3PR8A 4PQIA 1UN2A 4XS6A 4PNGA 2KLXA 5HR2A 1SD9A 1GUMA 9GSSA 4K7IA 1PSQA 4HU9A 2TRCP 1DUGA 2CX3A 3HJMA 5F0GA 2HE3A 1M2DA 4XIHA 5DCHA 1DE2A 5F06A 1EV4A 2C3QA 1VGLA 4XRAA 5B6NA 4JU5A 3ZMLA 1ML6A 4EKZA 4KNDA 3FR9A 5CO3A 2RLIA 5CRDA 3L0HA 3NOFA 1OC9B 3TRPA 3I69A 5DDLA 3GFKA 1VRSD 3GRXA 1URMA 1YF1A 1XZOA 6GSWA 2A4VA 3GURA 5ID2A 4JBBA 3ZRDA 1ZZYA 4MDCA 2I4AA 1IYIA 2IMFA 4NXIA 3L9SA 2REMA 3VPTA 3EC3A 3APOA 2H1AA 1Y25A 2WDUA 5AIVA 1JZOA 1HNCA 1GTBA 2EC4A 2KOKA 4ECBA 3LXZA 4MA9A 5A4WA 2K8SA 4IP1A 4MZBA 2R4VA 3NZNA 3F3RA 1K0AA 4POBA 1X0RA 4I6XA 5D73A 1K3OA 1V9WA 4IVFA 5CAXA 2R2JA 3LJRA 2IWTA 3ZFBA 3P90A 2GTUA 2EIRA 5D93A 3P2AA 2VCQA 4MJAA 2YANA 4E8HA 4EF0A 1F3BA 3H8QA 4KCAA 4OCFA 3FZ5A 4KSOA 1T4ZA 1EEMA 1OE7A 4FYUA 4HZ4A 4FO5A 3IC4A 1TRUA 2C8UA 1FVKA 3ZIVA 2GQMA 3DKSA 2MBSA 2E0QA 3D4MA 4HQSA 5GSSA 5IIZA 4PXOA 2HZFA 1GTAA 4HZ2A 3HHVA 3FY7A 1UA5A 2ZNMA 2CQ9A 2H0GA 2XPDA 1JZDA 3LYPA 4ZBBA 2VCXA 4ZB6A 1V2AA 3M9KA 4HU7A 3A2WA 4IQAA 4GWRA 3CYNA 6GSYA 3KMOA 1X5CA 4ZBAA 1GTIA 1ERTA 3A2VA 4N10A 3HXSA 2IIYA 4J56E 3TGZA 2CAIA 3UVTA 4WF4A 2FHEA 5GAPD 5FT3A 4O7HA 4GCIA 4MLYA 1UVZA 2YN1A 1B4QA 3WD6A 12GSA 2JZSA 1X5EA 1ZMAA 3KP9A 4FH8A 1ON4A 4LLRA 4DSRA 4V1Ag 5CRWA 1PMTA 3WGXA 4TR4A 2HXKA 4G19A 4PUAA 5DAKB 1SJZA 1SJIA 4K0NA 2H0IA 7GSSA 1YQ1A 2HSYA 3GKKA 2H6XA 4D73B 2V1MA 4HDEA 1AQXA 4Z7XA 2K6VA 8GSSA 3MNGA 3VWVA 2IMEA 1GP1A 1O8WA 4I5QA 2OE0A 4ZBDA 1OE8A 3W8JA 1K0OA 5CYYA 3JCML 1K3LA 1WWJA 1XWCA 2QSIA 6GSVA 2LS5A 1MDIA 3KCMA 3VI5A 4F0BA 2LRTA 2ZUPA 2B5YA 1PL1A 3D22A 1YKAA 4TN8A 1EP8A 5DQSA 2PERA 1G7EA 2OJLA 1OVNA 4KX4A 2L5OA 3CRTA 2DLXA 4N11A 1W89A 3U6VA 3TKSE 3TOTA 2VIMA 4RQRA 4IJIA 1OKTA 4O32A 3E3EA 4XTSA 1R26A 2G0FA 1PA3A 2L4CA 2HLSA 2AYTA 3Q18A 3IAS2 2AV4A 2WS2A 3D5JA 2CZ3A 2J23A 2V6KA 5A4VA 4BL7A 5FWGA 1EP7A 1XOAA 5CRGA 2MYGA 4ML1A 2E2MA 1MD4A 1ZOFA 2YNXA 4DSQA 4EDZA 1J0FA 1F3AA 3GUSA 2F8FA 3F4RA 1YDKA 2CX4A 3MWHA 1GTUA 4EXJA 5IM9A 4FYCA 3GHAA 3D6IA 4L0WA 5KEJA 1YEPA 4G10A 4POMA 5HR3A 5INYA 1GSDA 4HOJA 3KH9A 1FB6A 2TRXA 1KNGA 3LXTA 3TKRA 3O76A 2AJQB 4WETA 1JZRA 4ECCA 1AW9A 5CREA 3HVSA 6GSUA 2CV4A 3HCZA 3EU4A 2L5LA 2FGXA 1R5AA 2GQLA 2GZYA 4L5OA 2DJJA 1AQWA 2N5FA 4MP4A 4IKHA 1VF4A 3G9BA 3ERFA 2B5EA 4GSNA 1IYHA 2JACA 3M9JA 1BG5A 1R7HA 2NBSA 3BCIA 5LNKe 3C1SA 2K9FA 1F37A 5F05A 5IMCA 3E0UA 3QFAC 4NV5A 3G7IA 2MMNA 3UIWA 3TDGA 1SK1A 5H5QA 2LJKA 1A0RP 4GXZA 2OA7A 5J3RA 5EL8A 3GTUA 1XOBA 4BVYA 2GSRA 1BJXA 3KEBA 5LCZA 5IMVA 3TJKA 3C8EA 4AJ8A 1JLVA 1TU8A 1CQGA 3FKFA 4XS4A 2RM6A 2FUG2 17GSA 4GRFA 3F8UA 4RQXA 1PRXA 1O7UA 2I1UA 3CTFA 2RUFA 5G30A 4MMMA 3LG6A 1QUWA 3ERWA 3EVIA 3QR6A 2JZRA 3TJJA 2IFQB 5GZZB 4HEA2 2V2GA 1GH2A 4EUYA 3TJBA 4WF5A 2L6DA 1XCCA 3EURA 1T8EB 2XHFA 2WCIA 5DJLA 4N0ZA 2N5AA 3WGEA 5CNWA 4J2FA 2CT6A 5ELAA 5IO0A 2H72A 5EY6A 3TJFA 1WOUA 1F6MC 1Z6NA 2YOIA 1AXDA 4N30A 2C0EA 4HI7A 2BMXA 1QK8A 2FCHA 4PX1A 5ECOB 2LQQA 4BPYA 4MF7A 1T3BA 1PL2A 3QAGA 1VF2A 4OMVA 3GL3A 2C1YA 4DSSA 1S3AA 5HQPA 2E2GA 4KDUA 4F0CA 1QFNA 5ECPB 3KD0A 1HYUA 2XPEA 1XW6A 3QD9A 2HT9A 4OO5A 3F3QA 5JWRB 3HY2A 2A2RA 3GSTA 3UAPA 4F9ZA 4X43A 3PINA 2PU9C 3CMIA 2WULA 1DSBA 2C3NA 4BWSA 5GAND 4EO3A 1ZYEA 2PGTA 2VCWA 2IJYA 2O89A 4MF6A 4ZB9A 3V1WA 2NTOA 6GSSA 3EYTA 2BTOT 1TRVA 1FW1A 3I43A 3PH9A 4PURA 1TU7A 4ZILA 1U3AA 3M8NA 1O85A 2IPAA 1V57A 1A23A 1T7PB 2LJAA 3KXOA 4PNFA 3C73A 4OCEA 4X1UA 3ED3A 5HR1A 2TIRA 4GLTA 2K8VA 3A2XA 3Q19A 2FNOA 4TR1A 4POKA 2HFDA 1PGTA 2QKEA 1QMVA 4Q5NA 3O6TA 3DXBA 5AGYA 3IK7A 2H8LA 3EE2A 1O6JA 3BOAA 2VL9A 2HZEA 2PPTA 4Q5QA 4KA0A 3ZZXA 4KE3A 2GVPA 3F9UA 18GSA 4CDOA 1GRXA 4JZQA 1B4PA 2X8CA 3DVWA 2OKAA 2QC7A 2FWEA 4MZWA 1FO5A 1SL1B 2C80A 3HZ4A 2VLTA 1A2JA 3QFBC 4POLA 4CW9A 2ZCTA 2M46A 3GH9A 1VF1A 4YAPA 5HFIA 2VM2A 4Q5RA 2VCTA 3L78A 3WT1A 2K18A 1X9WB 1QGVA 3CSJA 1GSSA 5DVBA 3MAKA 2YZUA 4V2NA 5HFKA 3WGDA 5ID2B 2WRTA 5B6MA 1ILOA 1TOFA 2FWGA 2H76A 2NDOA 1X9MB 3VLNA 3FZ4A 5JWOB 2LSTA 3P7XA 2VCZA 2I9HA 3IK9A 2LNSA 3KM6A 4EL1A 4E8EA 4ZL8A 2G2QA 2LRCA 1XWAA 5G2ZA 1Z7RA 4YQMA 4IJ3A 3IDVA 2B7KA 2MMOA 1E6BA 2ON7A 1EOHA 4TW5A 1J08A 1F9MA 1XPVA 2L4QA 1LU4A 1PX7A 1XBSA 2MBTA 2R6KA 1N8JA 3GKMA 3TKQA 3QAWA 4HUAA 3I9V2 3FYGA 3LFLA 5KN0A 1SU9A 4JR4A 1ACVA 2GZPA 4LL1B 3TKSA 2LKUA 4XCSA 2CA8A 2H1DA 2L59A 2DJKA 2P0GA 5CP1A 4GSTA 3GH6A 5GSTA 1SENA 2AB6A 2KUCA 5J9CA 3TB2A 1VF3A 2H1GA 6GSXA 2C0DA 2V6OA 1XVQA 3CSIA 1XXUA 5H5RA 1MD3A 1WPIA 2DIYA 1B9YC 3BD2A 3UBLA 3Q6OA 3ERGA 1XWKA 3F63A 4F2IA 3VFIA 2O87A 5IQYA 5IO2A 3APQA 3GA4A 4XRDA 2AAWA 3IR4A 4P3YB 1TI3A 2D2ZA 4GF0A 4IQ1A 2HRNA 19GSA 3ZLPA 3RHBA 2H1BA 1EWXA 1WIKA 2M72A 1OYJA 3UVHA 1XWGA 4ZXGA 5H5SA 3DMLA 1Z3EA 3GMFA 3BCKA 4DVCA 1X5DA 2GGTA 1KEBA 1ERUA 2HRFA 3KJYA 5E59A 4KB3A 1A8LA 4KSMA 5E4WA 5IOXA 3DVXA 3ZVJA 3VWUA 1G6YA 2MZCA 2B1LA 6GSTA 2IMIA 1PQNA 1HD2A 2H6YA 2H30A 3BBYA 3CBUA 1JFUA 3ZYWA 1GLQA 2DJ0A 2PMTA 3ZIJA 2I81A 4K0GA 1TRWA 1TP9A 3QOUA 4TRXA 2B1KA 1X9SB 2VL2C 1SKWB 1OC8A 3GKXA 1EOGA 2YWNA 5B8BA 4OD7A 3RPPA 3D21A 2JU5A 4MK3A 3LORA 3HJOA 4KCEA 1FOVA 1TK5B 4MCUA 3CXGA 1K0BA 2GSTA 5D8IA 1KBNA 1TRSA 2B5XA 2X8HA 3P8WA 1E2YA 2PN8A 2X99A 1M0UA 4QL7A 2I3YA 2WFCA 3N5OA 1XVWA 1XW9A 3DGQA 2VLVA 1R4WA 1G7OA 2JSYA 1H4OA 1BEDA 1Z6MA 5D9VA 3VI7A 2GZZA 3FR3A 3LWAA 1GSUA 3CTGA 5J9BA 3KMNA 2XBQA 1A2LA 4G2EA 2F51A 2FWFA 4K8MA 3IAM2 2DJ2A 1RK4A 2JL4A 1AC1A 2V41A 5DBQA 5DALA 5IOWA 3HA9A 4EDYA 3H1NA 3D0ZA 4IW9A 2YJHA 3GX8A 4ZL9A 4MJEA 1Z9HA 1FVJA 4ZB8A 3GL5A 1M7TA 2YV9A 3HVXA 2F8AA 4WBRD 5HR0A 1Y6EA 1A24A 2ON5A 4TVEA 4K7NA 3IRAA 4FYBA 3MSZA 1AAZA 4ECIA 2GS3A 2H19A 1JHBA 2P5RA 5CRHA 2LTKA 4PUFC 1M9BA 2XC2A 5FHIA 4YAVA 1SKRB 4LL4B 2RUEA 4NV2A 1M9AA 1PKWA 2LRNA 2GT5A 3RAZA 3H79A 5J41A 2OBIA 4JRRA 1TI1A 2WJUA 1TJDA 5EVOA 1W4VA 4V2LA 5D96A 4YQUA 1TK8B 2Z9SA 2KP2A 2YPMA 1EGOA 3GTUB 4TR3A 2C0FA 2JADA 4CHSA 5F07A 5AISA 1LJRA 4IS0A 3C71A 1V98A 2AHEA 2V32A 5L71A 1WP0A 3TUEA 3HJPA 5IMDA 3UEMA 3D4TA 3UL3A 1O73A 4XS4B 2CAQA 4K7OA 5ECQB 4LMWA 5ECLB 4OFTA 1B8XA 3I6AA 1ZL9A 2L57A 2WGRA 5JCGA 2NVLA 3IBHA 1MDKA 1YZXA 4K1FA 5ELGA 2H01A 1RQMA 5F8BA 3EMXA 3TRXA 1GSFA 5DCGA 3HDCA 1V40A 4KW6A 4TXOA 3DIEA 4H86A 4AJ7A 3IOSA 4NHZA 3J7Yb 4NMUA 4TR0A 4EC0A 1C72A 2N5BA 3SBCA 3KZQA 1TW9A 1GNEA 4TKYA 3RHCA 2H66A 1THXA 4KDYA 1DBYA 3K8NA 1R5PA 3U5RE 1SYRA 5AIXA 1T4YA 5G1LA 3HZ8A 2VCVA 4OFMA 2DMMA 4IN0A 5DQYA 3Q74A 1FB0A 2LNTA 3DWVA 1OAZA 3M3MA 5G31A 4NAXA 3QPMA 3EU3A 3LQ7A 4DSSB 1XIYA 3G7JA 2LEGA 4DEJA 2EIQA 1FG4A 3VWWA 4V1Ap 16GSA 1TTZA 1GWCA 5JCWA 2YV7A 1GLPA 3TCOA 3CRUA 5J4UA 5IMZA 2VLUA 4ID0A 2YZHA 1K0NA 4ZIJA 2YP6A 4I8BA 4IGJA 3GNJA 1OC9A 2KHPA 3FZ9A 4MH3A 5C00A 1M2AA 2VL3A 3R2QA 3US3A 3S9FA 5G5EA 4I2UA 2DSAA 2GLRA 5JCUA 1SJ6A 3VWXA 2FA8A 3ZTLA 1DE1A 1PKZA 2O7KA 4MJBA 4WR4A 2H70A 2FA4A 2HI7A 2HSHA 2DIZA 3CSHA 2F9SA 1MDJA 5J5NA 1I5GA 4WR5A 2YWOA 10GSA 2H75A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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