5IPHA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c84s mutant
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFSAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iphA00
2V32A 2RM6A 4NXIA 5IOXA 3IE3A 2QC7A 2YZHA 4ZL8A 1XFLA 1G6WA 3ZIJA 2B5YA 1PSQA 2K6VA 4LA1A 2E2GA 5INYA 1FW1A 2HSYA 3G7JA 2PMTA 4MDCA 4TVEA 4XIHA 1XW6A 1X9WB 3A2WA 1SJIA 5GSTA 1ML6A 1EOGA 16GSA 2PBJA 5CO3A 3ZFLA 2DJ2A 2V1MA 4WKWA 3C7MA 3EMPA 1Z9HA 3I43A 1BAYA 2PUKC 2YOIA 1TU8A 1EP8A 3TJBA 4L0UA 3GH9A 4I6XA 5D96A 5CRWA 3EURA 4WEYA 2NVLA 1DSBA 4DSQA 4YQUA 3H1NA 3TOTA 3FYGA 1A23A 2LRNA 2CA8A 2FWHA 2VLUA 3DXBA 5DAKA 2LQQA 5KN2A 1ZL9A 4V2MA 5D73A 5G31A 3VLNA 1B9YC 1S3CA 4ECJA 1AQXA 3IOSA 4K7OA 4G2EA 3NOFA 2LJRA 3MDKA 1T1VA 2HZEA 1GUKA 1T4YA 1FOVA 3ZMKA 3ZMLA 4IVFA 3MSZA 4TN8A 1M2DA 3VWVA 2L5LA 1ERUA 1JFUA 1SYXA 3KP9A 2VO4A 4WETA 4IJIA 2C3NA 1RK4A 4NV2A 2DJKA 4BA7A 3M3MA 3DIEA 4GTUA 2O87A 4IP6A 1PGTA 4HS1A 2GDRA 1H4OA 3TUEA 3A2XA 2FGXA 4GRFA 4ECIA 4JEDA 1C72A 2O7KA 1QUWA 2IWTA 3PH9A 3UARA 2H6YA 5IMFA 4BPYA 2R5GA 4XRDA 1EEJA 4ZBAA 2LRCA 3ME7A 4YQVA 1ST9A 3J7Yk 1XOAA 1HNAA 4EE0A 1YKAA 1ZYQB 3TRXA 2DC5A 1SL2B 2JZTA 1TW9A 1OE8A 1FO5A 4F0BA 4TXOA 1UN2A 1OC9A 2YJ7A 5ID2A 2ON7A 4POLA 5DDLA 3L0HA 1BG5A 1XWAA 1XOBA 2D2ZA 1IYHA 4OFTA 3FZ9A 4N10A 3KTBA 4MJCA 2J23A 3F6DA 4OO5A 4TR1A 1PQNA 4NWYA 3Q74A 1V9WA 4JZQA 3F63A 3KH7A 4AGSA 1PRXA 4WF4A 5D9XA 3Q6OA 5FT3A 4WBJA 4HI7A 4ZB6A 1K0MA 2H6XA 3ME8A 1TXXA 2GT6A 4RQRA 3HY2A 1X5CA 1Z7PA 5KN1A 3QCPA 2AB6A 3GRXA 4L5OA 4MLYA 3H79A 4GLTA 1TTZA 4ZB8A 1XWGA 3I9V2 2E0QA 1X5DA 1XWBA 1O73A 1PKZA 2TRXA 3F6FA 4ID0A 1VGLA 2B6MA 2TRCP 3GL3A 4XRAA 4HEA2 1O8WA 1GTAA 5IOWA 4MZBA 1AQVA 2BJXA 3UBLA 2RM5A 2RLIA 3TJKA 1EEMA 4I2TA 3CTGA 20GSA 3GL5A 4HZ2A 5JCWA 5A4WA 3WT1A 4MH2A 3ED3A 1Y25A 4K2DA 3HHVA 1BX9A 2OE3A 3EMXA 2DJ1A 3MWHA 3CSJA 4GQCA 1GLQA 2VM1A 3RPPA 2L4QA 5DCHA 3C71A 1SKRB 1TK8B 1I9DA 5KN0A 2CQ9A 4L8EA 2G0FA 1ZYEA 2J9HA 4MK3A 4OFNA 4D73B 3IK9A 4CDOA 5F06A 5B8BA 5H5SA 4EDYA 2FWGA 4NMUA 1TRUA 3EC3A 3QFBC 1S3DA 3N5OA 1T3BA 2OADA 4TR3A 1Q4JA 3LJRA 1A24A 4HU7A 3IAS2 4ZBDA 3ZREA 3LFLA 4NHZA 2MBTA 3TGZA 1ERVA 2JADA 1OC3A 1WPIA 4AJ7A 3TKPA 4ILFA 1HNBA 3GX0A 1U88A 3FY7A 1E2YA 2DIYA 1GUMA 4PNFA 3KMNA 1JLWA 1QGVA 2VCXA 4TOPA 3L9SA 2H71A 2C0GA 1PL2A 5ECOB 4ECBA 1SD8A 2X8CA 2IL3A 1GSQA 1WIKA 2WRTA 1QFNA 2CAQA 4I5QA 1K0BA 4F0CA 4MF5A 2GLRA 1R7HA 5G5FA 2MMNA 4NHWA 4TRXA 2I1UA 2OE0A 5DQYA 2DJ0A 2IPAA 1M9AA 3NIVA 4OO4A 5DAKB 5A4VA 3BOAA 5AN1A 2O85A 1SKSB 3UL3A 3IAM2 3GUSA 3FR3A 3GIXA 3HD5A 1THOA 1HQOA 2VL2A 2VD0A 2C0DA 3IRAA 3DWVA 2HZEB 3VI5A 4K0NA 4TR0A 6GSUA 1T4ZA 2O89A 4PUFC 2LS5A 3TJFA 2DLXA 1SD9A 3TJJA 4YAVA 1M2BA 2LNSA 5LNKe 1NHOA 1JZDA 2NDOA 3J7Yb 3HVSA 4V1Ag 1WMJA 2H8LA 1VRSD 4E8HA 4MZWA 2CZ3A 1GUHA 1KNGA 1B8XA 2HNLA 2V6KA 2WDUA 2GS3A 4ML1A 4DSSA 3O6TA 4GWRA 1FB6A 1ERWA 5B6MA 3E0UA 2JSYA 3W6GA 1V40A 1DUGA 1ON4A 5AGYA 4AJ6A 1O7UA 1F37A 3D21A 2YP6A 2XPEA 1U6TA 3FZ4A 5ABRA 2C8UA 4FYCA 4QL7A 1LJRA 3P7XA 4EUYA 2AYTA 3TB2A 2P31A 2OA7A 1A2JA 2CX4A 4V1Ap 4PUAA 1I5GA 2FHEA 5DALB 5G30A 4TXOB 12GSA 3VK9A 4OWYA 1OC9B 2FY6A 5ID2B 5B6NA 2CZ2A 3TOUA 1XW9A 3WGDA 1U3AA 1LU4A 2VL3A 2NBSA 3CRTA 3GSTA 1Q98A 1TJDA 1XIYA 1LBKA 4HZ4A 4PQIA 1R26A 2YWOA 1B9XC 4TR1B 4TW5A 5HR2A 5IMAA 4PQ1A 2DIZA 5CREA 5D8IA 2FA8A 4MCUA 3I6AA 5ECHB 1Z6NA 1WRYA 18GSA 3QMXA 2DSAA 3TRPA 4ZL9A 3PGTA 1PN9A 3KTLA 1K3YA 4X43A 3IK7A 5DJMA 3FZ5A 3WYWA 3GV1A 3KM6A 1M99A 5ECRB 2GTUA 4V2NA 2GZZA 4WBRD 2N5AA 4BVYA 2B7JA 5J5NA 3V1WA 2OBKA 1O85A 3OR5A 4KSMA 1XW5A 3ISOA 4HU9A 4ACSA 1SYRA 2K9FA 4H86A 1GSFA 2X64A 4EL1A 3RAZA 2K8SA 1O6JA 3Q18A 1F3AA 6GSYA 2LQOA 2PERA 4HJ2A 5AISA 3QR6A 3VURA 4POBA 2DMMA 1VF1A 2IFQA 5F05A 2VIMA 4N30A 4XTSA 2FLSA 1PX6A 5F07A 4K8MA 2GGTA 2YNXA 4OFMA 2R6KA 1X0RA 3QAGA 3BCIA 5H5QA 3N9JA 2H1BA 3F4TA 1GTBA 1AW9A 1TU7A 5ECSA 5ECMB 1A2MA 5HR1A 1V57A 5J41A 5LD0A 1U87A 1J9BA 5ECQB 4WF5A 3UEMA 2K8VA 1X9SB 1A8LA 4PXOA 2H30A 3H8QA 2MMZA 2B5XA 4GF0A 5C00A 3L9VA 3GKXA 3F3QA 4IW9A 1OVNA 3KCMA 5D9WA 2G2QA 2JACA 10GSA 1PKWA 5FHIA 3WGEA 1GNEA 4GSNA 1SJZA 5ECNB 2BTOT 4HQSA 4BL7A 3C8EA 2NPBA 1QXHA 4KW6A 4MH3A 2GT5A 2GVPA 2HT9A 11GSA 3F9UA 1PX7A 2C80A 2V2GA 13GSA 2YZUA 4LMVA 1CQHA 4ZBBA 4GSSA 1OYJA 3IV4A 3WD6A 3D22A 1PD21 4XS1A 4EF0A 4MZCA 1B4PA 3SBCA 4IBPA 4LL1B 3FR6A 4POMA 4QL9A 1YEXA 4IJ3A 4GXZA 4Q5NA 1JZOA 1XVWA 2JZRA 1GULA 1IYIA 2CVKA 3PINA 4KAEA 2PVOC 1GWCA 2R4VA 2H01A 4PX1A 2JU5A 1PL1A 2FCHA 4RUVA 1EZKA 3WGXA 2C0EA 4K9ZA 5DALA 2F9SA 1F3BA 2VOCA 3UOMA 3HJPA 1X9MB 2MZCA 1GNWA 3KEBA 1S3AA 4IN0A 1XZOA 4ML6A 1W89A 2O8VB 4O92A 1GSYA 1SKWB 5C04A 4BVXA 2FNOA 3ZFBA 5E59A 3M9JA 2L6DA 1ABAA 1K3OA 6GSSA 2FA4A 2Z9SA 4L5LA 3QAWA 2QGVA 4I2UA 1WWJA 4YH2A 3M0FA 1Y6EA 2HLSA 4ULXA 3GH6A 2GSRA 2C4JA 2LEGA 4DSSB 2OBIA 4JRRA 3HA9A 2OE1A 2H1AA 1FAAA 5F0GA 2KOKA 2ALBA 2EC4A 5HFGA 4TR4A 2GSQA 2LNTA 5ECLB 4XS4A 3R2QA 2GZYA 3HKRA 1EGRA 5KEJA 4G9HA 2QKEA 1YEPA 2HI7A 2XC2A 3QDNA 5EY6A 1N2AA 2K18A 3DVXA 3QD9A 1ZOFA 1WP0A 2IMKA 2B1LA 4L0WA 2KP1A 1DBYA 3C73A 1GSUA 3TKSE 5EL8A 2IN3A 4HOJA 1TP9A 1O81A 2IMIA 2M46A 1EP7A 4MMMA 1OC8A 4NPBA 1JLVA 1A2LA 2WZ9A 2QSIA 2WFCA 3O3TA 1QK8A 2H73A 2PN8A 3M8NA 3EYTA 1GTIA 2A4VA 2KUCA 4RQXA 4DEJA 2LRTA 1URMA 1B4QA 2X8HA 5ECPB 3VWWA 4DVCA 1TOFA 1OKDA 2JL4A 3ERGA 2ZCTA 1G7OA 3GURA 4O5RA 3HCZA 5IMVA 4MJAA 4KDYA 3HVXA 2HSHA 2LTKA 2C0FA 2FUG2 1FB0A 2CVDA 2VCZA 4IP1A 14GSA 2NTOA 3DKSA 5IIZA 1V98A 4KDUA 3LYPA 1WOUA 2IJYA 1HYUA 2IFQB 3K8NA 3MNGA 3FW2A 2R2JA 4HUAA 4OCEA 3ERWA 2IIYA 4IELA 2VD1A 2ZUPA 4GQFA 3ZL5A 1HNCA 1M0UA 4MJBA 3FZAA 1AUCA 5GAPD 5IQYA 4KH7A 4DSRA 3L4NA 2AUVA 2PGTA 1H75A 4GCIA 3CMIA 2KHPA 2P5RA 3JCML 2GSTA 1BYEA 3VFIA 2EIQA 4K7IA 4TXVA 3GMFA 4F9ZA 4J2FA 1TI1A 1XVQA 5D9VA 1VF2A 2X99A 2A2SA 3KD0A 4Q5RA 1ZCPA 2PPTA 3VPQA 3SWLA 5J3RA 2GQMA 3VI7A 2RUFA 1SENA 3GHAA 3HZ8A 1YF1A 3TKQA 4KDXA 2H0IA 3D5JA 4KCEA 4V2LA 2DJ3A 1TK5B 2H70A 3GKKA 3LXZA 3LEFA 2AHEA 1V2AA 2CAIA 1NHYA 4PNGA 4KX4A 3G7IA 4KSOA 5CYYA 1SK0A 1GSEA 1TRWA 4ZIJA 1JHBA 9GSSA 3KIJA 5JWOB 1TRVA 3IDVA 4NAXA 4AF2A 3CSIA 2RUEA 3HZ4A 1KTEA 5IMZA 1Z3EA 4X1UA 2I3YA 2LKUA 1RQMA 1WE0A 5ECIB 3GTUA 1YY7A 3D4MA 2PVQA 3KP8A 1E6BA 5IPGA 2VLVA 3QPMA 3LQ7A 3WT2A 3BCKA 2GQLA 2OACA 2GZPA 3GA4A 4NV5A 1M7TA 3BBYA 3DMLA 1NW2A 4IKHA 1XXUA 5JWQB 3TJGA 4ISDA 2FWFA 2YV7A 3F3RA 5D93A 2VCTA 5CNWA 1SL0B 3CSHA 3QAVA 4MF7A 3IBHA 5DQSA 2X8GA 3G7YA 4I97A 5J9BA 3AY8A 4MABA 1KBNA 3TKSC 6GSTA 4MP4A 1OKTA 4ZXGA 1K0AA 5G5EA 1VF3A 2AV4A 2PU9C 4XS4B 2L59A 2WB9A 4F2IA 3UVHA 1K0DA 5EVOA 4ZB9A 3M9KA 3A2VA 5L71A 4IS0A 1G6YA 3FEUA 2B3SA 4WR4A 5JCGA 2H66A 2LUSA 3HXSA 4ZL7A 2XBIA 1J08A 5HR3A 2B5EA 3KZQA 3ZLPA 3Q19A 1EGOA 2YV9A 3MAKA 3ZITA 1A0FA 3LORA 1CQGA 1K0CA 3H4KA 2E2MA 4JBBA 5ENUA 2HRFA 4MPFA 3FR9A 1GLPA 2DBCA 1TRSA 1DE2A 2H1GA 3DGQA 5DJLA 2H1DA 4K1FA 4EVMA 1FVKA 3DYRA 4N0ZA 4K0GA 4LMWA 1GL8A 4XS6A 3EU4A 3QOUA 4RI6A 5DVBA 3L9UA 4PQHA 3ZVJA 1GRXA 3EE2A 2VAFA 3US3A 2XPDA 3E9JB 5HFIA 3GSSA 4F03A 4YAPA 5GSSA 3F4RA 3HVVA 2BMXA 3P90A 4IQ1A 1F2EA 2H6ZA 2YWNA 5CAXA 4GSTA 2XHFA 5G1LA 5CRDA 2YN1A 1OAZA 3U6VA 4WR5A 2PWJA 1K0OA 3CRUA 3EINA 5B7CA 3UJ1A 4BWSA 3PR8A 4EO3A 2VCQA 1SK2A 3H93A 1BQ7A 3QFAC 1YQ1A 1R4WA 4Q5QA 3TKRA 3C1RA 4CHSA 3CBUA 3F4SA 3P8WA 1AIUA 4X0XA 2CVBA 4JR6A 4EC0A 3TCOA 1SJ6A 2RIIA 3CTFA 2IMDA 3EU3A 3HDCA 3LWAA 6GSVA 3E3EA 5A4UA 1MDKA 3D0ZA 3DD3A 2MMOA 2EIOA 5IO0A 4KGIA 2LJKA 5J9CA 3LGCA 2AJQB 2H72A 2L57A 1R5AA 6GSWA 1YDKA 3LYKA 3TDGA 4OCFA 4JE1A 1MDIA 2C3QA 4WXTA 3KJYA 1WJKA 1T7PB 2KP2A 3UAPA 5J4UA 5GAND 4I8BA 5KN3A 1FHEA 3UBKA 3KXOA 2F8FA 4KUNA 1DE1A 1AC1A 1MD3A 1JZRA 2H0HA 3ZRDA 3HJMA 2FD3A 2LJAA 22GSA 4POKA 5A5KA 2EIRA 1XCCA 1T00A 3ZYWA 2TIRA 1GSSA 1ZZYA 3D4TA 2P5QA 1SL1B 1GTUA 1BEDA 4IQAA 4Q5FA 3VPTA 1B48A 2ES7A 4PGTA 3A3TA 1GH2A 3G9BA 3A5WA 1UC7A 1PA3A 2HZFA 3EWLA 5H5RA 3RDWA 1SU9A 2H19A 8GSSA 1N8JA 6GSXA 5LCZA 1THXA 2F8AA 17GSA 1K0NA 4G19A 1YJ6A 1EV4A 1YZXA 2OJLA 1RW1A 3FHKA 4HJMA 3LSZA 5CRHA 2F3MA 1GSDA 3GTUB 3TRQA 4LL4B 2H75A 3ZZXA 3L78A 2V6OA 4KB3A 3RBTA 2YJHA 1MEKA 1J0FA 3F0IA 3KGKA 3GKMA 3ZIVA 2YCDA 5EPFA 2OKAA 2JSZA 1F6MC 2MMAA 2MBSA 1ERTA 2H74A 3GX8A 4XHMA 4OD7A 3RHCA 2M72A 2ON5A 3O76A 2E7PA 3BJ5A 3FRCA 4MJEA 2GSSA 1USBA 1MTCA 3FKFA 5G1KA 1A0RP 2C3TA 2CV4A 4O7HA 1AQWA 1KEBA 1EV9A 2WJUA 3ZTLA 3DRNA 2WULA 2I4AA 3LXTA 2I9HA 5HQPA 2HRNA 1G0TA 4F82A 1PMTA 2XBQA 3VWXA 2DJJA 4EXJA 3BD2A 4EDZA 4KCAA 5DCGA 4BWQA 2N5FA 2VL9A 2ZNMA 2L5OA 3APOA 2IMFA 2GQKA 3IR4A 1JZWA 1K3LA 1XWCA 1QMVA 2A2RA 2FWEA 1ZMAA 1YF0A 2B7KA 2VM2A 3U5RE 4FYUA 5GZZB 4MPGA 3I69A 4MA9A 1MDJA 1F9MA 1MD4A 2IMEA 2WGRA 2F51A 2H76A 1Z5YE 5D9TA 5F8BA 3TKSA 2LSTA 5E4WA 2C1YA 3IC4A 5G2ZA 3M1GA 5HR0A 3W8SA 2R3XA 3IPZA 2YWMA 1HD2A 1ILOA 2N5BA 1X5EA 4N0VA 1TK0B 1G7EA 3KH9A 1VF4A 3W8JA 1QQ2A 3S9FA 1O8XA 4KNDA 5JCUA 4HQZA 4EKZA 4TKYA 3GYKA 2HXKA 5IMDA 3IA1A 2HYXA 2M80A 3VWUA 5ELAA 2HE3A 4HDEA 2B1KA 5IPHA 1OE7A 2WCIA 3KMOA 4LLRA 2CX3A 2LV3A 4K7NA 2VCVA 1AXDA 4E8EA 1UA5A 3DEXA 1BJXA 4FIWA 19GSA 1ACVA 3D6IA 4FO5A 2REMA 2VCWA 1T8EB 1UVZA 5JWRB 2H0GA 2VLTA 1Z7RA 2JZSA 3P2AA 3DVWA 5CP1A 3ZVJD 3APQA 5AIXA 2YPMA 5DBQA 4KE3A 4ECCA 2L4CA 4QQ7A 4IHUA 1SK1A 1AAZA 1NM3A 2V41A 5IMCA 1U3IA 5HFKA 2L6CA 4J56E 1GP1A 3GFKA 2DMLA 3FK8A 1M9BA 1M2AA 1XWKA 4FYBA 3F8UA 5FWGA 5ELGA 4O32A 4N11A 1ZGNA 1NSWA 1TDIA 4OMVA 4KA0A 1Z6MA 1XPVA 4PURA 1W4VA 3ERFA 3CXGA 1A8YA 4J57E 5IM9A 5IO2A 1TI3A 3CYNA 3RHBA 4YQMA 1V58A 3GNJA 3UIWA 4JU5A 4XCSA 2KLXA 2I81A 4MF6A 2R37A 5AIVA 3LG6A 2HFDA 2CT6A 3GKNA 2YWIA 1EOHA 3APSA 1FVJA 5B8AA 1TKDB 1XBSA 3EVIA 3UVTA 2P0GA 4K6XA 5CRGA 1R5PA 3UMAA 3C1SA 4Z7XA 3GN3A 3HYPA 4D73A 4P3YB 4IGJA 1FG4A 3IXRA 3RPNA 2WS2A 3HJOA 4ZILA 5COHA 4JR4A 2AAWA 2YANA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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