5J3RA

Crystal structure of yeast monothiol glutaredoxin grx6 in complex with a glutathione-coordinated [2fe-2s] cluster
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
AFNVQKEYSLILDLSPIIIFSKSTCSYSKGMKELLENEYQFIPNYYIIELDKHGHGEELQEYIKLVTGRGTVPNLLVNGVSRGGNEEIKKLHTQGKLLESLQVWSDGKFSVEQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Monothiol glutaredoxin-6
publication title Crystal structure of yeast monothiol glutaredoxin Grx6 in complex with a glutathione-coordinated [2Fe-2S] cluster
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae s288c
total genus 39
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j3rA00
2MMAA 2MZCA 3D0ZA 3S9FA 1PSQA 5KEJA 5JWRB 4E8EA 5ECMB 1G6WA 3CRTA 2QGVA 3ISOA 1ZZYA 2DSAA 4LL1B 2DJKA 4BPYA 4EUYA 2LJAA 5JCUA 4IBPA 2CZ3A 2YWOA 5GSTA 3LJRA 1Z9HA 4QQ7A 5A4UA 4D73A 1NM3A 4FYUA 3TKPA 4K0NA 1G6YA 3WGEA 1A23A 5DVBA 4WR4A 2JL4A 3UARA 1FW1A 3E9JB 2PWJA 1TI1A 3DD3A 2R6KA 4GQCA 1OKTA 4KDUA 4K7NA 3KH7A 1PX7A 2GSSA 4TR1A 4JRRA 3A5WA 3KEBA 3HVSA 5G5FA 1GUHA 2YANA 3HDCA 3LYKA 1TOFA 1WMJA 2H1BA 3UIWA 3TJGA 5B8BA 3GX0A 3QAWA 3ZL5A 5J9CA 3VWVA 1X5DA 1E2YA 3IR4A 3EURA 3LWAA 3TKQA 1TK8B 4RUVA 3IHQA 3RBTA 2JADA 4IJ3A 5CRDA 1YF0A 4YQUA 4G9HA 1GRXA 1I9DA 2VM2A 3APOA 1FG4A 4YAPA 4PX1A 1F37A 5DAKA 5KN2A 2CX3A 5D9TA 1OAZA 1XOBA 3IDVA 3VURA 1GSYA 4XIHA 2KUCA 3ZZXA 2FD3A 2VM1A 3UEMA 1J9BA 5GAND 3EE2A 2IPAA 2G0FA 3J7Yk 4IGJA 2N5BA 1TI3A 2OKAA 1QGVA 2MMOA 2GT5A 4J56E 3DRNA 1X5EA 4RI6A 1SK1A 5CRWA 1BQ7A 4J2FA 2ON5A 1JZOA 3LFLA 3DXBA 3HJMA 2FWEA 2YCDA 4TW5A 4N10A 4IP1A 2FA8A 4XRAA 3APSA 3GNJA 4I97A 1EOGA 4ML1A 5E59A 5DQYA 2CT6A 2OBIA 13GSA 1C72A 4EDZA 5CAXA 2H6XA 2LJKA 4TR1B 5DJLA 4TRXA 3H8QA 4HJ2A 3WGXA 3ME8A 2CZ2A 1FO5A 2GTUA 3GTUA 5HR0A 5E4WA 1B9YC 4L0UA 1OVNA 2LRTA 4TR3A 2DJJA 4J57E 3BBYA 2V2GA 3CXGA 2J9HA 3GL3A 2X8GA 3DGQA 5COHA 1T4YA 3J7Yb 1SD9A 1ZYEA 5D9XA 4DVCA 2YZUA 1GUMA 2NBSA 3CSJA 4FYCA 3LGCA 1TP9A 1S3AA 3H1NA 5DAKB 5G5EA 1Q4JA 4ID0A 5A4VA 4PQHA 2VL2C 1Z7RA 4V2LA 3BOAA 3QAGA 3VPTA 2JZTA 2C0DA 1TK5B 5ECQB 3ERFA 3GSSA 2RM5A 4K6XA 3QFBC 3JCML 3M8NA 2V6OA 3QOUA 5B6NA 5AIXA 3IOSA 3HZ8A 4TXVA 1K0MA 4WF4A 4N0VA 1GUKA 4IQ1A 4Q5RA 1QUWA 1WP0A 4OFTA 2DLXA 2XBIA 2PBJA 5IIZA 4I8BA 4HS1A 2GQLA 1YKCA 3SWLA 5IMAA 5C04A 3KP8A 4MLYA 4F0CA 5EL8A 3U5RE 2H70A 1GSFA 4JBBA 4ZIJA 2LKUA 3KMOA 4KSOA 3FR6A 1VF1A 3GTUB 1TRUA 4ULXA 4V1Ag 12GSA 2YZHA 4PXOA 1YDKA 4PNGA 1ZYQB 4IS0A 3GKNA 1HD2A 1EP8A 1TRWA 2V32A 4GSTA 4JE1A 2L6CA 3C71A 1RK4A 2PU9C 4POMA 2LTKA 3TB2A 1XWBA 2NDOA 2YWIA 5L71A 4ECJA 3FZ4A 4IQAA 1U3AA 1XFLA 5HQPA 2KHPA 1XW5A 4XS6A 2OE3A 2XHFA 1WWJA 2HXKA 3FZAA 1A0FA 5A5KA 1F3BA 1GLPA 1TRSA 2A4VA 1NHYA 1GTAA 2L5LA 1J0FA 16GSA 2FWHA 3GA4A 1PMTA 2V6KA 3GURA 3IXRA 5JCGA 2PMTA 3P7XA 2DJ2A 2O89A 20GSA 4MPFA 3GYKA 3UL3A 2H1AA 1SYXA 4BL7A 1Y25A 1K0DA 3BCIA 2C3NA 2VO4A 4ZBDA 4FIWA 4MZWA 3VWXA 1A2LA 2B5XA 3W8SA 2WRTA 2I1UA 2X64A 4CDOA 2VOCA 3ZMLA 1PL2A 2QKEA 2H74A 5DBQA 3DVWA 1UN2A 3CTGA 5J5NA 4MDCA 1FHEA 2ALBA 4OFMA 3RDWA 4K2DA 2IN3A 4NAXA 2JACA 4AJ7A 5JWQB 4IN0A 1H75A 4I2UA 5H5RA 5FHIA 1CQHA 2WCIA 3QFAC 4H86A 4F03A 3ZREA 5F06A 2CAIA 2LEGA 1SJZA 1T00A 3FHKA 1OKDA 2AAWA 2OBKA 1T4ZA 4BVXA 4KE3A 3RHBA 2CQ9A 4E8HA 4MCUA 3APQA 5ELAA 3TUEA 5EPFA 2E7PA 2LQOA 4CW9A 4GWRA 4ISDA 5EY6A 2VL3A 10GSA 4IHUA 1GTUA 5D9WA 4EKZA 4OMVA 1QK8A 4JEDA 2FHEA 3TJKA 1T3BA 1AUCA 1SD8A 4DSSA 1T1VA 1GSQA 8GSSA 5AN1A 3O76A 3IE3A 5D73A 4ZILA 2J23A 1XW6A 2C3TA 3RHCA 3GH6A 1AAZA 2VCTA 1KEBA 3UJ1A 1FVJA 2FLSA 3VI7A 1NW2A 4GRFA 5KN3A 4GQFA 3IAS2 3P2AA 3TJBA 4ZXGA 2MMZA 2XC2A 2HZEA 3ZMKA 2H75A 2O8VB 3GIXA 3LQ7A 1PKZA 4LMWA 4KW6A 3IK9A 1U3IA 2CVBA 4Q5FA 4POLA 3TKRA 2G2QA 2ON7A 4OO4A 4GSSA 4K7OA 2H0IA 1XXUA 2CV4A 3DIEA 5AISA 3ZITA 1WIKA 5GSSA 1O85A 4NV5A 1AQWA 5ECKB 3D5JA 4K9ZA 2OE1A 1VF4A 1XBSA 6GSUA 4XS4A 5D9VA 4XHMA 2BJXA 1MD4A 4MH2A 1MDJA 3M3MA 2V1MA 2EIQA 3HD5A 4HDEA 3HJPA 3KIJA 5IOWA 1F9MA 2C4JA 2GZYA 1PD21 3DWVA 4WF5A 1EV9A 4QL7A 1U6TA 2L4CA 4ZBBA 1GSEA 4JZQA 3KM6A 4PUFC 3TRXA 2C8UA 5G1KA 4DSSB 3GH9A 1X5CA 3L9SA 2LNSA 5ID2A 1QFNA 4KX4A 2FWGA 4HUAA 5IPHA 2AB6A 3K8NA 3TCOA 4MH3A 2H72A 2NPBA 4YH2A 4TR4A 2L5OA 2GGTA 7GSSA 5DALA 1V58A 2GS3A 1PX6A 1OE7A 4L0WA 1O81A 3OR5A 2HFDA 2HZEB 1O8WA 2NVLA 1SL0B 2DJ0A 2HT9A 5CYYA 3HXSA 2VCZA 1K3LA 2IIYA 2H01A 1TKDB 4TR0A 3FEUA 3L9VA 3EMXA 2GLRA 1F2EA 4IKHA 2X99A 2IWTA 2LNTA 1MEKA 1KTEA 17GSA 3KJYA 4JR4A 2IFQB 4MF7A 4CHSA 3O6TA 1T7PB 1M2AA 3P8WA 1HYUA 2TRCP 2AYTA 4XS4B 5JCWA 3I43A 1VF3A 1EGOA 1EOHA 2GQKA 1JLWA 1AIUA 4IVFA 3VWWA 2LRNA 3FW2A 4MJEA 4KGIA 3TKSC 3ZYWA 4F2IA 2HI7A 3UBKA 4WR5A 2I81A 3CTFA 3E0UA 3DVXA 4ML6A 2VD0A 2CA8A 2R37A 3DEXA 2QC7A 2PVQA 4TKYA 1WE0A 2LS5A 3C1RA 4ZL8A 4KCEA 4X43A 1KBNA 2PUKC 1HQOA 2WZ9A 1AQVA 4WBJA 5ID2B 4OO5A 4RQRA 5IO0A 2F51A 1S3DA 3GMFA 3HVVA 3US3A 1K0AA 4YQMA 3NOFA 2P0GA 1O73A 2JZRA 1M2DA 3HKRA 5DALB 1VGLA 4IP6A 3TOUA 2YV9A 2IMDA 2F3MA 5IMZA 2KLXA 1QQ2A 4BA7A 1SL1B 1GTIA 18GSA 1TU8A 1R5AA 3EU3A 1B4QA 5ECOB 2OA7A 2ZNMA 2VCXA 2TRXA 1G7EA 1K3YA 1GNWA 4WXTA 3VI5A 3FY7A 4DEJA 4MZBA 3F3QA 4Q5QA 5ENUA 4LA1A 3ZIVA 2V41A 4XS1A 2L6DA 5D8IA 5IMCA 2H6ZA 4I5QA 2FA4A 1N8JA 2KP1A 5LNKe 3KH9A 1A8YA 2RUEA 4ILFA 2DMLA 1V57A 1X0RA 4GSNA 1GL8A 1YY7A 5HR1A 4KSMA 3MNGA 3H79A 1FVKA 2OJLA 5J9BA 2VIMA 3ZLPA 1K0BA 1SJ6A 1A24A 2PPTA 1M99A 2IMEA 3LORA 1TDIA 4P3YB 1FB0A 2YJ7A 1EGRA 1Z5YE 3TRPA 2VL2A 3E3EA 5CRHA 2B7KA 3GKMA 2R4VA 2XPEA 1SU9A 1YEXA 3D22A 2DIZA 1EWXA 1OC8A 2HYXA 2I3YA 2TIRA 3KP9A 4RQXA 3CMIA 1ZCPA 3FK8A 5LD0A 1X9MB 3F9UA 1O8XA 3H93A 3NIVA 2L59A 1XW9A 4TN8A 4AGSA 4DSRA 1E6BA 4OD7A 1JFUA 4IW9A 1PRXA 4X0XA 1ERVA 3QCPA 5ECSA 3CSIA 1JLVA 5DCHA 5G30A 2JU5A 5ECLB 4MK3A 5ABRA 2AUVA 5J3RA 1PKWA 1RW1A 3F4TA 2GSQA 3BJ5A 2GSTA 1Z6NA 3LXTA 1THOA 1PA3A 2B1LA 4KAEA 1ERUA 4JU5A 3FZ5A 2H76A 1TK0B 4AJ6A 4HQZA 2HSYA 4EXJA 2DJ3A 1SENA 1G7OA 2C80A 2FGXA 4N0ZA 9GSSA 2CAQA 3VLNA 19GSA 2PGTA 3BCKA 2GQMA 1MD3A 2P31A 1ZOFA 4N11A 2F9SA 5ECRB 1TTZA 2JSZA 2EIOA 11GSA 4K1FA 4F9ZA 4X1UA 5D96A 2H0HA 5DQSA 3FRCA 2D2ZA 2GVPA 1SK0A 3FKFA 2IL3A 1ACVA 2LQQA 5DJMA 3D4TA 1G0TA 2RIIA 4TXOB 4TVEA 4ZB8A 3A2VA 2YV7A 1PN9A 2E2GA 4KCAA 5LCZA 2HE3A 3EWLA 4O92A 3RPPA 2YWMA 3KTLA 2L57A 3LEFA 1YQ1A 2O7KA 1M9BA 3Q19A 4IJIA 4MJCA 3ED3A 3F8UA 3HHVA 4ZL9A 4MP4A 3EMPA 3TGZA 3F4RA 4KB3A 1ERTA 2DMMA 3KMNA 3UBLA 2N5FA 2YN1A 1BAYA 2C3QA 3TJJA 2O87A 1BEDA 4KH7A 3QPMA 4EDYA 4ACSA 4V2MA 1Z3EA 5IOXA 2WJUA 3IC4A 3M1GA 5B7CA 2VUPA 3PGTA 5DDLA 1Q98A 3G9BA 4Q5NA 5B6MA 2PERA 5HFIA 3KZQA 4XCSA 2IJYA 3FZ9A 3I6AA 4O32A 1XZOA 1TU7A 3Q6OA 2BMXA 4HZ4A 3L4NA 1AXDA 6GSTA 1OC9B 2YWNA 2VLTA 1Z6MA 3GHAA 2HNLA 3KCMA 4BWSA 3WYWA 2H1GA 4EF0A 4EC0A 3IK7A 4I6XA 1HNCA 2DJ1A 3RAZA 5GZZB 2LSTA 1THXA 4I2TA 2QSIA 3F0IA 1YJ6A 2VL9A 1U87A 5ECHB 3EC3A 3M9KA 4HI7A 2DIYA 4RI7A 3UOMA 4EO3A 4KUNA 2R3XA 6GSWA 3Q18A 3PH9A 2X8HA 1O6JA 3F3RA 1YF1A 3QMXA 1ON4A 4HU9A 2IFQA 3VK9A 3MDKA 1GSSA 1BX9A 2AJQB 2GZZA 1EV4A 4V1Ap 2C0FA 5F05A 5C00A 2H6YA 1A2MA 4BVYA 1CQGA 1ML6A 3L9UA 1ERWA 5HFKA 5KN0A 2Z9SA 2B5YA 4MABA 2ZCTA 3M0FA 3MAKA 1XIYA 1DBYA 2WDUA 1M9AA 1R5PA 5AGYA 1X9WB 1LU4A 3UAPA 2RUFA 1DUGA 1EEJA 2AV4A 2YOIA 1UC7A 2WULA 1PL1A 5CNWA 4WBRD 4K7IA 4POKA 5HR3A 4L5LA 1USBA 4JR6A 4QL9A 1YEPA 4NMUA 3TJFA 3HVXA 2H1DA 2F8AA 3GRXA 1AQXA 3VFIA 1R4WA 1XWAA 1A8LA 1DE2A 2HLSA 1XWKA 1PQNA 1QMVA 5J41A 2MYGA 3ZVJA 3AY8A 1GTBA 4HU7A 2PVOC 4GTUA 4ZB6A 2H71A 3GL5A 1N2AA 1PGTA 2WGRA 3QDNA 2XBQA 3GKXA 2YNXA 4EVMA 1XOAA 5IMDA 3L0HA 1XCCA 4OCEA 4LMVA 1JZRA 4MZCA 5CO3A 3W8JA 2K8SA 1FB6A 4NXIA 3FYGA 3KGKA 1TJDA 1MDKA 5F0GA 2KOKA 2B6MA 4MF5A 3ZIJA 3CYNA 3D4MA 1GULA 1YKAA 1B9XC 1GSUA 3L78A 3PINA 2H73A 3MSZA 5EVOA 3HA9A 3WD6A 4ECBA 4MMMA 3KTBA 1ABAA 3VWUA 3DMLA 2P5RA 3TKSE 2H8LA 1M2BA 2HZFA 4DSQA 2O85A 4NV2A 2CVKA 2GDRA 5IQYA 3BD2A 4MJAA 3IAM2 3F63A 1S3CA 2LV3A 4NHZA 3C1SA 6GSXA 2GZPA 5IMVA 3I9V2 1XVWA 1TW9A 4G10A 5FWGA 2YP6A 2K8VA 2K9FA 2I4AA 3A2WA 4D73B 2FNOA 5J4UA 5B8AA 2VAFA 5INYA 2B3SA 1NHOA 4O5RA 3LSZA 2WB9A 1BYEA 2RLIA 1ILOA 1U88A 1UVZA 4HEA2 1YZXA 1ST9A 1Y6EA 2R5GA 2DC5A 1T8EB 3ME7A 3D6IA 2OADA 5D93A 1SKSB 3I69A 3TKSA 1I5GA 3PR8A 2WS2A 3CRUA 1F6MC 4GCIA 1JHBA 1AC1A 5ECPB 2LRCA 4KNDA 4F0BA 1ZL9A 4ECIA 5IPGA 2H66A 5G2ZA 1HNAA 5HFGA 1K3OA 4HOJA 1JZWA 4N30A 2IMIA 3HZ4A 3QAVA 3N5OA 1XWCA 1A0RP 3DKSA 2MBTA 3GX8A 6GSSA 2P5QA 3KXOA 4Z7XA 2PN8A 4PQ1A 2M80A 1GP1A 3H4KA 3LG6A 4HJMA 2HRFA 1K0OA 1IYHA 2JSYA 3ZRDA 1V98A 4XRDA 3W6GA 3G7IA 2OACA 2MBSA 1QXHA 2H19A 3G7YA 1K0NA 3DYRA 14GSA 2M46A 3NZNA 1OC3A 5AIVA 4TOPA 3FR9A 4MA9A 2R2JA 3HY2A 3A2XA 2VCVA 3F6FA 2EC4A 1UA5A 1VF2A 1MTCA 1SK2A 1RQMA 1WJKA 3HCZA 2A2RA 3QR6A 5F8BA 4OCFA 2NTOA 2XPDA 1B48A 1M0UA 5CREA 4TXOA 3N9JA 3GUSA 1EEMA 4PNFA 2OE0A 3V1WA 1WRYA 2WFCA 2MMNA 3ERGA 4MF6A 4KDYA 3ZVJD 2REMA 4L8EA 1J08A 3ERWA 1X9SB 3UMAA 2YPMA 1JZDA 2RM6A 1XVQA 3WGDA 1W89A 1ZGNA 2GSRA 1W4VA 4ECCA 1M7TA 1OE8A 5F07A 4EE0A 1R7HA 2IMFA 4V2NA 4GLTA 4NHWA 5KN1A 4GXZA 1SJIA 3GN3A 2C1YA 2EIRA 3SBCA 4K0GA 2YJHA 5H5QA 2CX4A 2VCQA 1MDIA 4KDXA 1URMA 5FT3A 5CRGA 3WT2A 2LJRA 4LLRA 4O7HA 5A4WA 1O7UA 3F6DA 2I9HA 4AF2A 3U6VA 2K6VA 3O3TA 2BTOT 3IBHA 4PGTA 4WKWA 1Z7PA 4POBA 1KNGA 1SL2B 5IM9A 1LBKA 4FYBA 2HSHA 2B7JA 2AHEA 4FO5A 3CSHA 1WOUA 1AW9A 3WT1A 2ES7A 1V9WA 2FWFA 1FOVA 1OC9A 3EYTA 3CBUA 3IV4A 1TXXA 2K18A 1DSBA 4YAVA 3GFKA 2VLVA 3ZFLA 3VPQA 5G31A 1EZKA 5ECNB 4PUAA 2JZSA 4WEYA 2B5EA 1SYRA 4ZBAA 4MPGA 4ZL7A 2HRNA 1OYJA 4NWYA 2H30A 1IYIA 1B4PA 3A3TA 3D21A 6GSYA 1EP7A 2IMKA 3C8EA 1A2JA 2E2MA 3EU4A 1XWGA 2C0EA 2N5AA 1R26A 3LXZA 3KD0A 4KA0A 4OWYA 1BJXA 2M72A 3GSTA 4F82A 3HYPA 1V40A 3MWHA 3TRQA 1GH2A 3HJOA 1FAAA 4OFNA 3GV1A 4HZ2A 1SKWB 1GNEA 4ZB9A 5ELGA 2C0GA 1DE1A 3GKKA 1BG5A 4IELA 3QD9A 2DBCA 3IRAA 1TRVA 3G7JA 5GAPD 1VRSD 22GSA 4MJBA 1HNBA 2LUSA 2VLUA 4L5OA 4LL4B 1XPVA 2KP2A 1WPIA 4YQVA 2VD1A 4PQIA 4G2EA 5JWOB 4FH8A 4HQSA 4AJ8A 2GT6A 3IPZA 6GSVA 3C7MA 4NPBA 3LYPA 1LJRA 1H4OA 3RPNA 1GSDA 1GWCA 2CVDA 4K8MA 5DCGA 1K0CA 5H5SA 3F4SA 2X8CA 2A2SA 5CP1A 3ZTLA 5IMFA 1B8XA 2FCHA 1NSWA 3EINA 2FUG2 5ECIB 3EVIA 1GLQA 5IO2A 2E0QA 2VCWA 3ZFBA 3C73A 1F3AA 2L4QA 1ZMAA 1V2AA 4EL1A 3M9JA 3UVHA 3FR3A 4G19A 2ZUPA 2B1KA 3TDGA 2F8FA 3R2QA 4PURA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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