5JCGA

Structure of human peroxiredoxin 3 as three stacked rings
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
TAPAVTQHAPYFKGTAVVNGEFKDLSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGSGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIKPSPAASKEYFQKVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
publication title Structures of Human Peroxiredoxin 3 Suggest Self-Chaperoning Assembly that Maintains Catalytic State.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 59
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jcgA00
1X0RA 5ID2A 2LRTA 3CSIA 2H0HA 3KP8A 2GSSA 3WD6A 3W8JA 5EY6A 2VIMA 1OKTA 2C0EA 2E0QA 3M0FA 4G2EA 4LA1A 2AHEA 4XTSA 2FA4A 2O87A 1MDJA 5AIVA 1M0UA 5D96A 3QD9A 4KB3A 1TW9A 5DCGA 4K7IA 1U87A 1TRVA 2WZ9A 2A4VA 1GWCA 1J9BA 2YCDA 1QFNA 4KCEA 3CXGA 4V1Ag 4YQVA 1FW1A 2L5LA 1BX9A 1O7UA 1PX7A 2BTOT 5CYYA 3IAS2 2VL2C 4V2LA 2VLVA 2L4CA 1MD3A 2B1KA 4EVMA 5HR3A 5AN1A 5G1LA 1O81A 5H5QA 2OBIA 4MZBA 3ZMKA 2F8FA 1PGTA 4MJAA 2FLSA 4JU5A 2WDUA 2GZYA 1YEPA 1WWJA 1A2MA 4N0VA 1FB6A 1OE7A 1OVNA 2GSQA 1I9DA 2PU9C 3HY2A 1F37A 1THXA 3APOA 3LGCA 1Z3EA 2GSTA 3WYWA 3LORA 2I3YA 1PA3A 2HSYA 1NSWA 4I2TA 2X99A 2B5XA 2VUPA 2VL2A 4POLA 2PBJA 2TRCP 5D9XA 3UIWA 4LL1B 2JZTA 3H1NA 4EE0A 2M72A 1VF1A 3D5JA 4DSSA 3I9V2 1SJZA 2HFDA 4O92A 2YPMA 5IO0A 3UBKA 1K0DA 3HJOA 1K0OA 1SK1A 4LL4B 5IMDA 3O76A 5ECMB 2FGXA 2EIRA 3IDVA 1GSUA 3FW2A 3PGTA 4L0WA 4GRFA 4O7HA 5F8BA 3ED3A 5IOWA 2JACA 2IFQA 3VI7A 1A0RP 4OFNA 4GF0A 5C04A 2H73A 1Z5YE 1HNBA 1O85A 4V2MA 4PNFA 1RK4A 4ZBAA 1Z7PA 5DAKB 4HOJA 2VL3A 2FWFA 3PH9A 4ISDA 2IMEA 1KEBA 1W4VA 4GQCA 1FVJA 1ZL9A 3GL3A 3FRCA 2R5GA 1K0NA 2CAQA 4O5RA 2C3TA 1Y6EA 3TJFA 1FG4A 1E6BA 1TTZA 4TR4A 3EMXA 1YKAA 2GSRA 3C1RA 3F6FA 3EURA 3R2QA 4F0BA 3MNGA 3A2WA 2H19A 2BJXA 4IVFA 2IMDA 3QAVA 5CRGA 3RHCA 2LSTA 4J2FA 2XHFA 2P5QA 1B4QA 2V2GA 1K0BA 1GH2A 3GMFA 3M9KA 3MWHA 3UJ1A 3UMAA 4WBRD 5J9CA 5CRHA 4QL9A 3KM6A 2O89A 4K1FA 1O8XA 3EYTA 2I9HA 3OR5A 3BCIA 1SL1B 4ECIA 2FD3A 4WEYA 14GSA 1K3YA 2JSZA 2C80A 1PKWA 4TXOB 2X8HA 1GRXA 1C72A 2HNLA 3ZITA 1VF4A 1T1VA 3L9VA 4N0ZA 5CRDA 1T7PB 2AAWA 2YWNA 4FYUA 4PQHA 4XS6A 4HQZA 4ML6A 3LYPA 4OO4A 3VURA 3RDWA 1TK8B 4XRAA 5B8BA 2EIOA 3ERFA 2C0FA 3N5OA 3BJ5A 1DUGA 6GSXA 4HI7A 4J56E 3TUEA 1FO5A 4NWYA 1UN2A 1GNWA 2V1MA 2CZ2A 2C8UA 1MEKA 1TRWA 5ECPB 1LU4A 4KGIA 3H93A 1PKZA 1B9XC 2VM1A 4AGSA 5KN3A 4TR3A 1FB0A 1JZWA 22GSA 2DMMA 5JCWA 4JE1A 2CVBA 3ME8A 4WETA 1M99A 2CX3A 5HFGA 1R7HA 2DJ0A 1HQOA 1U3IA 1ST9A 3DVXA 4EDYA 4BA7A 4AJ8A 5ECQB 3HYPA 1AC1A 1I5GA 2I4AA 1XVWA 5DAKA 5E4WA 3KD0A 3P7XA 3US3A 1DSBA 4AJ7A 5D93A 3C73A 1MD4A 4K8MA 1TI1A 5EVOA 1SD9A 4RI6A 3P2AA 4HZ2A 3LWAA 3HVSA 4TW5A 3CRUA 4TR1B 5HR1A 18GSA 1V9WA 1VF3A 5JCGA 3RPPA 3IE3A 3GSTA 5HR2A 5DALB 3F3RA 4Q5RA 3FZ9A 2CT6A 2DJKA 1QUWA 2OKAA 3HKRA 4MP4A 1AQVA 3EVIA 2OJLA 4L8EA 4NPBA 2RLIA 3O6TA 1JHBA 2REMA 3D0ZA 2LJKA 19GSA 1NW2A 5DBQA 2OBKA 3IPZA 1PN9A 5HFKA 2WCIA 2C3QA 3F6DA 3ZFBA 4KDYA 1PQNA 5GSSA 2YZUA 2PVQA 4K0GA 4MF5A 4K2DA 4ILFA 3D22A 4LMVA 3KCMA 3QAWA 3DKSA 2M80A 1Z7RA 4TKYA 2WRTA 1XCCA 3F0IA 10GSA 1QGVA 1TK0B 3UEMA 4TXOA 2LRCA 3TJGA 2LEGA 1EV9A 1XW9A 5EPFA 2IMIA 1SL2B 3KZQA 1M7TA 2ON7A 2O8VB 2H1DA 2DJ2A 2H0IA 1GSEA 2F8AA 1SENA 4PURA 3GN3A 1M2DA 4ECJA 3F3QA 4WR5A 2DLXA 3KTLA 4JEDA 4E8EA 3F4RA 3C8EA 1QQ2A 1Z6MA 4KA0A 3D4TA 2WJUA 1SK0A 5FWGA 5G5EA 3F4SA 2VLUA 2GS3A 3GKKA 3W6GA 2GQMA 1T00A 3HA9A 3HVXA 4NXIA 3LQ7A 3QCPA 1TOFA 4ZB6A 4IJIA 3E3EA 5GSTA 2P5RA 1S3CA 3QAGA 1F6MC 1F2EA 3EINA 4IBPA 2KLXA 2V6KA 1Q98A 2HLSA 4HU9A 4QL7A 1GULA 4DSSB 2VLTA 3VWVA 3VWUA 1A24A 1H75A 2LJRA 2VD0A 2L57A 3HCZA 5CP1A 1TKDB 4K9ZA 2OE0A 3V1WA 1X9MB 5DDLA 1PD21 9GSSA 4G9HA 1A0FA 3GX0A 2IFQB 4YQUA 4CW9A 5ECNB 5KEJA 2YV7A 2KUCA 1PX6A 3IR4A 4TR1A 4E8HA 4DVCA 5ENUA 5J5NA 7GSSA 5DALA 3E9JB 5AISA 1YEXA 3BD2A 5E59A 3IC4A 2YV9A 1CQHA 2RUEA 2OE3A 3FZAA 2PVOC 4TRXA 3LG6A 4ZIJA 1GSQA 5D9VA 4MF6A 1FVKA 3LSZA 4ECBA 4Q5FA 5A5KA 5GAPD 3KJYA 2PN8A 5AGYA 5IMVA 1LBKA 1GUMA 4MDCA 4F03A 4MJCA 1X5CA 2ZUPA 4IN0A 3FHKA 1XW6A 1NHYA 4ZB9A 3IK7A 3EE2A 3GV1A 1GSSA 4IP6A 5J9BA 3ZREA 5CRWA 4ML1A 5CREA 1T3BA 5ECHB 2IJYA 3TKPA 1GLPA 4IKHA 3ZVJD 2DJJA 2XPEA 1TU7A 3QFAC 1BYEA 3UARA 1K0MA 1KTEA 4BWQA 2F3MA 4K6XA 5B8AA 2C4JA 4RQXA 5G5FA 2JADA 3Q19A 4HJ2A 2YJ7A 4CDOA 4MJBA 3VPQA 3H8QA 5F07A 5F0GA 2EIQA 1QXHA 1ERTA 1O6JA 2FCHA 4LMWA 3IRAA 3LFLA 4I2UA 2H6YA 3H4KA 3GX8A 1OAZA 1N8JA 3SWLA 2IPAA 4D73A 3EC3A 2V6OA 3TKRA 3KTBA 1QMVA 1WMJA 3Q74A 2CVDA 2CX4A 3HVVA 3GA4A 1AQWA 1DE1A 3ZLPA 5ECOB 1EGRA 2B7KA 2K6VA 3A3TA 3QMXA 3E0UA 3IA1A 1PMTA 1YKCA 3NOFA 2YWOA 4GXZA 4FIWA 4KH7A 3UVHA 3SBCA 3GL5A 4NV5A 2AJQB 3ERWA 3VWXA 3GTUB 3TJBA 3J7Yb 3IXRA 4TOPA 3ZRDA 1GSDA 3ZL5A 1H4OA 3GKNA 3UL3A 5IMCA 3P90A 5INYA 2AV4A 1EOHA 1O8WA 4IQAA 2VCVA 4I8BA 4DSQA 4GSTA 1XWBA 4G10A 4ZILA 2GQKA 2H71A 1U3AA 3CTGA 4X1UA 3MDKA 2GT6A 5ELAA 2LQOA 1V2AA 1RW1A 2J23A 3CTFA 5JWQB 2ALBA 5G30A 4K0NA 4PNGA 4KCAA 2B3SA 1BEDA 2MZCA 1SYRA 1V58A 16GSA 1JZRA 2DIYA 2B7JA 2H6XA 1JZOA 4OMVA 3DXBA 6GSVA 1G7OA 1S3DA 5DCHA 1SJ6A 2WB9A 2VO4A 4F9ZA 1IYHA 3GH9A 1A8YA 20GSA 2AB6A 4TN8A 6GSUA 1UC7A 4KE3A 2HSHA 1FAAA 2FY6A 4GSNA 4MPFA 2KHPA 2EC4A 2I1UA 4BVYA 2YP6A 4FO5A 3L0HA 5GAND 4QQ7A 2CAIA 2XC2A 4PUFC 3GSSA 2AUVA 1ZGNA 3APSA 4XCSA 2F51A 4HQSA 5B7CA 1GNEA 2CV4A 2VL9A 2I81A 1OC9B 2VCWA 1PL1A 1EOGA 1K0CA 3I69A 1ILOA 1TP9A 3M3MA 1XWGA 5IQYA 3HZ4A 5H5RA 1B48A 2IMFA 1YDKA 2R37A 5B6NA 3GIXA 2NBSA 2XPDA 3KH9A 3KGKA 3TJJA 4JZQA 5JCUA 3HXSA 2L4QA 2LRNA 2JU5A 1G6WA 1URMA 4KDXA 1HD2A 4Q5QA 3F8UA 2VCXA 4NAXA 2LNTA 1X5EA 1ZYQB 3GTUA 1ON4A 1Q4JA 3GNJA 2KP2A 5B6MA 1ZOFA 3HJPA 2H74A 1DBYA 2GTUA 3VI5A 3G7IA 2HI7A 3FZ5A 3WGDA 2OACA 3HDCA 1ERVA 2ES7A 2K8VA 3C7MA 4ZBDA 1KNGA 3M1GA 2P31A 1GUHA 3D21A 4I97A 1M2AA 4I5QA 5EL8A 1VGLA 1R26A 1K3LA 1LJRA 4MJEA 5IMAA 1EEJA 3RAZA 4V2NA 3FKFA 1ZCPA 3HD5A 3TJKA 1JLWA 5KN0A 3G7JA 1ERUA 1GL8A 2HZEB 4ZL8A 4WXTA 4FH8A 5IMZA 2RUFA 1GSFA 6GSSA 3EU3A 2YWMA 2B1LA 1SYXA 2J9HA 3TKSC 5JWRB 2R4VA 4IJ3A 4ZBBA 4HDEA 3WGXA 4XS4B 2H8LA 2GLRA 3BBYA 3EMPA 1X9WB 4FYCA 4ZXGA 4HEA2 5C00A 2C0GA 1HNCA 2PERA 3S9FA 5IO2A 2H01A 3KXOA 1T4ZA 1YJ6A 4MLYA 5GZZB 2K9FA 1TK5B 4EL1A 5ABRA 2VOCA 3FR3A 4IHUA 2N5FA 1AQXA 3DD3A 1K3OA 1G0TA 3APQA 5D9WA 3GH6A 3BOAA 2VM2A 5IIZA 3TKSA 3H79A 2B5YA 1A2JA 2LNSA 1OC9A 2MMZA 3UBLA 2BMXA 1AIUA 4WKWA 1USBA 3M9JA 1GTAA 1R4WA 2DSAA 1A8LA 4FYBA 3RBTA 2RIIA 1T8EB 3ZIVA 5CO3A 4EO3A 3KH7A 2YNXA 3UOMA 2N5AA 3HZ8A 4GWRA 1V98A 1V40A 2YANA 1ABAA 3VFIA 1GLQA 2AYTA 4L0UA 2OADA 5D73A 4D73B 2C0DA 2PPTA 1M2BA 2GZPA 5ECKB 1EP8A 5CAXA 2FWEA 1YY7A 3JCML 1MTCA 1AXDA 3HJMA 4PUAA 2YN1A 4IW9A 2C1YA 2H1BA 2IMKA 4XRDA 3CSJA 5L71A 4MPGA 2G2QA 3DWVA 3I43A 5F06A 3IK9A 2K8SA 1AW9A 3DVWA 2YWIA 1XZOA 2H0GA 1TDIA 2DJ1A 2DMLA 1BG5A 2G0FA 2FA8A 3TOUA 3QR6A 1TRUA 1ERWA 2GQLA 4I6XA 3KEBA 2F9SA 2KOKA 1SKWB 4NHWA 1GTIA 3FK8A 1XBSA 2H76A 1SJIA 3WT2A 4EC0A 3TCOA 3TKSE 1QK8A 2HZEA 4HZ4A 3CRTA 4L5LA 4DSRA 2DIZA 4G19A 5CNWA 3NIVA 1WIKA 2CA8A 2H1GA 2L59A 3GKXA 4TVEA 3I6AA 1BQ7A 4MABA 2WGRA 1S3AA 2E2MA 4WF4A 3LYKA 3QFBC 2WFCA 4XS4A 4WBJA 2RM6A 2K18A 4YAPA 4BPYA 3A2VA 4BWSA 1TI3A 2IWTA 2MBSA 4XHMA 5D9TA 2FWGA 1AAZA 3K8NA 1SD8A 3HHVA 1AUCA 1VRSD 2Z9SA 5ECIB 1G6YA 1BJXA 2OE1A 2HE3A 4BVXA 1X5DA 1F3AA 2NDOA 4YQMA 1YZXA 1XIYA 3FR6A 3LXTA 4MZWA 5ELGA 5FHIA 1N2AA 1SKRB 1G7EA 2QGVA 4EDZA 3PINA 2YJHA 3L78A 3FZ4A 4HUAA 1WE0A 3LXZA 4MCUA 3RHBA 1OC8A 1GUKA 1HNAA 2JZSA 4WR4A 4KSMA 4F0CA 3TRXA 3F4TA 3L9UA 1FOVA 2IN3A 4OO5A 1FHEA 1NHOA 4JRRA 1B4PA 2NPBA 1M9BA 1CQGA 1OKDA 3L9SA 1SU9A 4PX1A 1ML6A 1TU8A 2DBCA 3CSHA 4WF5A 1F9MA 4ULXA 2O85A 1XVQA 3M8NA 4PQ1A 2MBTA 2RM5A 4HJMA 5HQPA 5G31A 5LD0A 4ECCA 2LQQA 3C1SA 8GSSA 3WT1A 4ZL7A 2TIRA 4MF7A 1JFUA 4POKA 5ECSA 5G1KA 1W89A 4EUYA 1TXXA 3TOTA 3N9JA 3DGQA 3GUSA 4KW6A 5LNKe 4IGJA 4EF0A 1WP0A 1RQMA 2H75A 3G7YA 5HFIA 1NM3A 2CZ3A 3Q6OA 5FT3A 3QPMA 1R5AA 5DJLA 3GURA 4K7NA 3AY8A 1XWKA 2B5EA 4Z7XA 5A4WA 2IIYA 2N5BA 1R5PA 2NTOA 4TXVA 4HS1A 5G2ZA 2ZCTA 5HR0A 2CVKA 1M9AA 1EP7A 1A2LA 4KX4A 3KMOA 3F9UA 3KIJA 2YZHA 2GT5A 4XIHA 1XPVA 5AIXA 4JBBA 4H86A 1SL0B 2GVPA 3IHQA 3KP9A 1ACVA 3ZIJA 4KSOA 3A2XA 2E7PA 2FNOA 2V41A 3KMNA 2R6KA 2HT9A 4IQ1A 1ZMAA 2A2SA 4N10A 3ERGA 4MA9A 1F3BA 4P3YB 4O32A 3DIEA 1U88A 2L6DA 2MYGA 3QOUA 1MDKA 2E2GA 3P8WA 3ZZXA 2O7KA 2QSIA 4GQFA 2H6ZA 1E2YA 2H70A 3ME7A 1PRXA 1GP1A 4KUNA 2HXKA 2H30A 2GZZA 4OD7A 2P0GA 2WS2A 2R3XA 6GSWA 1DE2A 4GCIA 3RPNA 3ZTLA 4IP1A 4ACSA 5KN2A 3GRXA 1K0AA 1B8XA 3TRQA 1O73A 4NV2A 4YAVA 3J7Yk 4XS1A 4ZL9A 5J41A 3O3TA 1X9SB 1XW5A 1THOA 2KP1A 5F05A 3LEFA 3DEXA 2PMTA 2DJ3A 3U6VA 1PL2A 4PGTA 4PQIA 2GDRA 2PUKC 5D8IA 3ZMLA 4JR4A 3W8SA 1ZYEA 3TB2A 4J57E 13GSA 4MH2A 4F2IA 1HYUA 1OC3A 2QC7A 1Y25A 3EU4A 3FEUA 2ZNMA 2PGTA 1YF0A 1XOBA 3TKQA 3U5RE 5IPHA 3WGEA 2ON5A 11GSA 2X64A 4X43A 2HYXA 2HZFA 4AJ6A 2XBIA 4EKZA 1XWAA 2X8GA 4POMA 4PXOA 1WJKA 1SK2A 1SKSB 5DQSA 1EGOA 1JLVA 3CMIA 5ECRB 4IS0A 2PWJA 4KNDA 1J08A 1UA5A 3TGZA 4KAEA 1XXUA 1A23A 1IYIA 2GGTA 4ID0A 2X8CA 5IMFA 1B9YC 2HRFA 3ZFLA 2FWHA 2A2RA 5A4UA 3NZNA 1GTUA 2FHEA 3ZVJA 3ISOA 2FUG2 5COHA 2MMNA 3VWWA 2B6MA 1EV4A 1GTBA 2LS5A 4MH3A 4CHSA 2QKEA 1GSYA 3GKMA 2D2ZA 1TJDA 5KN1A 2MMOA 3C71A 3IBHA 2JL4A 4MMMA 2C3NA 1VF2A 4ZB8A 17GSA 4POBA 1EEMA 2H66A 4BL7A 3LJRA 4OCFA 2VCTA 5DJMA 3CYNA 5ID2B 1EZKA 1JZDA 3ZYWA 4RQRA 4F82A 2LV3A 2M46A 3A5WA 5DQYA 5J4UA 3UVTA 1UVZA 2VD1A 2TRXA 2HRNA 1YQ1A 1PSQA 5IM9A 5DVBA 3F63A 3L4NA 3UAPA 1V57A 4OFMA 2H72A 1U6TA 3DMLA 4JR6A 1OE8A 1J0FA 3QDNA 4N30A 4NMUA 5IOXA 2LTKA 3FY7A 4MK3A 3IAM2 2IL3A 4EXJA 4NHZA 2H1AA 3DRNA 4L5OA 1MDIA 5H5SA 1OYJA 4RI7A 5IPGA 4GLTA 2NVLA 5LCZA 3Q18A 4KDUA 5JWOB 3VK9A 1Z6NA 1TRSA 1KBNA 2DC5A 1XFLA 2JZRA 4GSSA 3FR9A 3GYKA 3EWLA 1XOAA 2L5OA 1T4YA 12GSA 3IOSA 6GSYA 4TR0A 5J3RA 2LUSA 4GTUA 2VCZA 4V1Ap 4K7OA 5ECLB 4N11A 2LKUA 4LLRA 4MZCA 3FYGA 3MSZA 2VCQA 4YH2A 4DEJA 2CQ9A 4HU7A 4AF2A 2OA7A 4OWYA 2R2JA 3D4MA 3TDGA 3D6IA 1WRYA 3IV4A 2WULA 1Z9HA 3G9BA 4RUVA 1XWCA 3VLNA 1EWXA 3TRPA 3BCKA 4OCEA 2L6CA 3MAKA 3DYRA 3GHAA 2MMAA 3VPTA 3GFKA 4Q5NA 2LJAA 2V32A 4OFTA 3PR8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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