5JWOB

Crystal structure of foldswitch-stabilized kaib in complex with the n-terminal ci domain of kaic from thermosynechococcus elongatus
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
TAVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLIALRLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Circadian clock protein kinase KaiC
publication title Structural basis of the day-night transition in a bacterial circadian clock.
pubmed doi rcsb
source organism Thermosynechococcus elongatus
total genus 28
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jwoB00
2VAFA 2FWHA 4QL9A 3CMIA 4MZBA 3GKMA 2VCVA 2YZHA 4YAVA 3PGTA 1PL1A 5AIXA 4MA9A 1HYUA 3MWHA 1JZOA 4L0UA 1A24A 5IQYA 2REMA 2YN1A 3G7JA 5GAPD 1EGOA 1YKAA 1R7HA 4V2NA 3LYKA 2BJXA 2L4QA 4ISDA 5IMFA 4K0NA 3C1SA 2YJHA 4G2EA 5J41A 2FGXA 5ECHB 4IKHA 4IN0A 1IYHA 3MDKA 5DBQA 3IBHA 3F9UA 2H1GA 1W4VA 5A4WA 2LQOA 1GTAA 4TXOB 2H71A 3LEFA 4DSRA 6GSSA 2R6KA 2JZTA 3KIJA 2H70A 2JU5A 2H75A 3N9JA 1O8WA 1ZGNA 2XPDA 2ZUPA 5GZZB 2GVPA 1WP0A 3DYRA 1JZWA 3F0IA 5IMVA 1B9XC 3APSA 4Z7XA 3VK9A 4KE3A 2JSYA 4WETA 4ZBDA 1EV9A 1AQVA 4OMVA 1GSEA 1AQXA 4MF7A 1Z3EA 5DDLA 2GZZA 3TJFA 3TJJA 1K0AA 5F07A 2QKEA 4POKA 1V58A 1T7PB 3ZFLA 1X5DA 2LJRA 4PNGA 2C3NA 2GDRA 2WFCA 4EUYA 1M99A 2K9FA 2F9SA 1UC7A 2NTOA 1X9MB 4POMA 4POBA 4HZ2A 1GTIA 2B6MA 1OC3A 1HNCA 2H19A 2PVQA 3TKPA 2OBKA 2PERA 2WJUA 2MBSA 1PN9A 3VURA 1SL0B 3TKRA 1T8EB 2LJKA 4AJ8A 5IIZA 4MF5A 2CAQA 2F8FA 1EEMA 4ZIJA 4GRFA 4MF6A 1A0FA 3QAWA 4IW9A 5C04A 2C0DA 2PMTA 1FW1A 3TJGA 3M3MA 2FLSA 5IM9A 4KB3A 5CRDA 17GSA 4I8BA 5CRHA 4GQCA 4JRRA 3D21A 2GSRA 3IAM2 1EOHA 1OAZA 2GGTA 5DQSA 4MABA 2CA8A 4LL4B 1USBA 4MK3A 3P8WA 4HUAA 1NM3A 4HZ4A 2RM5A 1XBSA 2DJ0A 1FG4A 2XC2A 3GX0A 2FCHA 1J0FA 1A23A 5H5RA 2DBCA 2E2MA 4K9ZA 4OD7A 3ZYWA 4JR6A 4MPGA 3LFLA 2OADA 3CSIA 4HS1A 1TP9A 3EMXA 2LKUA 2E7PA 2KHPA 3APQA 4OO5A 4BVXA 5ENUA 2FA4A 4PQ1A 3VLNA 5CYYA 13GSA 1Q98A 3IXRA 2FHEA 3QFBC 5HR1A 3MNGA 1YF0A 1ERUA 1BYEA 3VPQA 3EMPA 4KDYA 3L9VA 4BPYA 1BX9A 1X9SB 1EWXA 2AUVA 2GSSA 4WBJA 4JU5A 4POLA 1TDIA 3ZZXA 5A4UA 2GT6A 4KUNA 3BOAA 3TRXA 3FR9A 3HA9A 4TVEA 1V98A 2VLUA 4EE0A 3EYTA 3CTFA 4I6XA 3IDVA 5J3RA 1YKCA 4EVMA 1GH2A 2JZRA 1K0CA 4Q5RA 1K0OA 2H0GA 4TR0A 5F06A 2YNXA 4GCIA 4BWSA 3P2AA 3F8UA 2BTOT 1SKWB 1PL2A 2FUG2 3KGKA 1UVZA 3ZMLA 2VL2A 2JZSA 1FVKA 2CV4A 1RW1A 1ERWA 5JWOB 4K6XA 4MH2A 1O7UA 1X9WB 1AIUA 1F9MA 2AV4A 2NPBA 1TKDB 5E59A 4FH8A 2VIMA 1YEXA 1MD4A 2L5LA 1JLVA 3BD2A 1PA3A 1BJXA 2ZNMA 1BQ7A 3D6IA 1Z5YE 4NV2A 3GKKA 1EGRA 3GN3A 4L5OA 1NHYA 5LCZA 2YJ7A 2RM6A 2HRNA 3TKSA 3LXZA 1QMVA 1QFNA 4X0XA 1M2DA 1FB0A 1OKTA 2OE0A 1Z9HA 2YWOA 3LG6A 3LQ7A 1B8XA 2LUSA 2HI7A 4MP4A 1V40A 1VGLA 4O5RA 4V2MA 4WR5A 4TN8A 4ZXGA 2LQQA 3IE3A 2CAIA 4ILFA 3KH7A 1HNBA 5ECOB 3RAZA 4XCSA 5DJMA 2AJQB 2IFQB 2V32A 4BA7A 1N8JA 1TRSA 3DWVA 4P3YB 3VI5A 2K8VA 5FHIA 3R2QA 1XOBA 4KW6A 1M2AA 1OC9B 1TU7A 3AY8A 2R3XA 1MDJA 4IHUA 4EXJA 3O6TA 2HSYA 4IBPA 4NHWA 2YV7A 1ZZYA 4FYUA 2O7KA 5ECSA 5D93A 3Q6OA 1X0RA 5ECRB 1SENA 4YH2A 1KNGA 2FWGA 5D9TA 2TIRA 3UEMA 1B9YC 1OVNA 3EU3A 4CDOA 2I3YA 3PH9A 3FR6A 3UBKA 4YAPA 3TJKA 1YF1A 2L6CA 5AISA 1F3AA 4J2FA 3J7Yb 1M0UA 3GL3A 1OE8A 1WIKA 3H8QA 5ECKB 3ZIVA 2V6KA 3ZRDA 2CX4A 4I5QA 2YWNA 3NIVA 1OE7A 4ML6A 4EDZA 2I9HA 4BWQA 1I5GA 3D4MA 1V2AA 4GSSA 2H74A 5D96A 1WMJA 1F6MC 3UAPA 2GLRA 1WPIA 3Q18A 2VCWA 1S3DA 2C8UA 2DJKA 3F4RA 1GSFA 3L4NA 1O85A 5ABRA 3F3QA 4NWYA 4DSSA 3ZLPA 3LJRA 1G6WA 2GS3A 5ID2B 3F4TA 5EY6A 4F0BA 4KH7A 4HQZA 3DMLA 2LEGA 1R5PA 4QQ7A 1PD21 2R4VA 2PGTA 2CQ9A 1T3BA 4O7HA 2MMOA 2VO4A 1SK0A 3ERFA 2RIIA 2XHFA 5HQPA 4PXOA 1SL2B 3GH6A 2YWIA 5KN1A 3ED3A 4MCUA 5JCWA 2V41A 4KSMA 3CXGA 2TRXA 1K0DA 3ERWA 3KP9A 3LGCA 2DLXA 2A2SA 3ME7A 1X5EA 2IJYA 1SK1A 2ON7A 1OC8A 4DVCA 3GL5A 3H79A 3HZ8A 2KLXA 2DSAA 2R5GA 2GQLA 4IQAA 2LTKA 1DE1A 5EVOA 2H01A 2OKAA 2VLVA 2PVOC 2P5RA 3DVXA 1SL1B 2IIYA 1DE2A 1FVJA 1TI1A 2LRNA 1X5CA 1GRXA 1G7EA 3FZ5A 1HD2A 3VWXA 2WB9A 2CZ3A 4K2DA 1A2JA 4K7IA 2GT5A 5HFIA 1EOGA 5ECMB 1PX6A 2VM1A 4FYCA 5E4WA 1SJZA 4EDYA 3CYNA 3GYKA 5DCGA 3UVHA 3UOMA 1TRVA 1ML6A 4IELA 3L9SA 2B5XA 3F6FA 2V1MA 1TI3A 1THOA 1G6YA 1AUCA 5ECQB 1MTCA 5DAKA 5G2ZA 5IMDA 3C7MA 4N0ZA 3TDGA 4X43A 1SK2A 6GSYA 2H0HA 1S3AA 2O87A 4AJ6A 4MH3A 2FWEA 1AXDA 1HNAA 1Q4JA 4EO3A 3RBTA 4HJ2A 1VF1A 2LSTA 1QXHA 3HHVA 2OE3A 2HZEA 5B7CA 1JZDA 4XIHA 2JL4A 2MMAA 4E8HA 5KN3A 1GLQA 1YEPA 3G9BA 2YP6A 2G2QA 2E2GA 1QUWA 4RUVA 3WYWA 2LV3A 4LLRA 2VD0A 3GKNA 4IP6A 3FHKA 2YZUA 2JADA 4L5LA 3VI7A 4LMVA 4ULXA 3CSJA 1M2BA 4PURA 2B3SA 3BCKA 9GSSA 3C1RA 1G7OA 1V57A 2FY6A 5CP1A 2H76A 1SYXA 2WGRA 3CSHA 1DUGA 1PMTA 1S3CA 4HDEA 2JSZA 1THXA 5F8BA 2YCDA 3JCML 3GSSA 3GNJA 4RI7A 1SD8A 3CBUA 7GSSA 1O81A 1JLWA 2WCIA 4WBRD 1GSQA 4KA0A 1VF4A 2JACA 3OR5A 4WF4A 4N11A 2A4VA 5CAXA 1XW6A 14GSA 2IMDA 1H4OA 3E3EA 1T00A 3GV1A 3PINA 3LXTA 2B5YA 3F3RA 5ECNB 2H73A 1GSSA 3GUSA 4GWRA 1K3LA 4G19A 4MDCA 1TXXA 2AHEA 1QK8A 4F82A 3KTBA 4GF0A 3UVTA 3M8NA 4IP1A 5AN1A 4N10A 1WWJA 4RI6A 1SU9A 3TOTA 2DMMA 1XW9A 3GFKA 3D5JA 1ZL9A 4IQ1A 3KEBA 2WZ9A 1O73A 2PUKC 5AIVA 4LA1A 3LORA 3RPNA 1ST9A 5D8IA 1U6TA 1B4PA 3I6AA 1NSWA 2DJ3A 1XCCA 4XS6A 2LNTA 4TRXA 4PUFC 2ZCTA 1YY7A 6GSXA 2L57A 3LYPA 4JE1A 5IO2A 5DQYA 2C4JA 5INYA 5G1KA 4D73A 4ECBA 3A2XA 4NV5A 1TTZA 4Q5QA 1XXUA 2DJ2A 1BG5A 4KGIA 1SD9A 1O8XA 4CW9A 1PKZA 1RK4A 4I2UA 4JR4A 5FT3A 8GSSA 4AGSA 3VPTA 1A8LA 3ZREA 1GUHA 2HLSA 5ELAA 3QAVA 3DRNA 3I69A 4MJAA 2AAWA 2F8AA 3KP8A 2C0EA 3DD3A 4GXZA 3EINA 2KP1A 2J9HA 1A2LA 2LRCA 1FAAA 5HR0A 3IV4A 3H4KA 3GTUB 2QSIA 4MJBA 2V6OA 1ERVA 1Z7RA 1SJIA 2XPEA 2KOKA 3C71A 1QGVA 3EWLA 2FA8A 1H75A 1K0MA 2X8HA 4GLTA 2CZ2A 3NOFA 4E8EA 4QL7A 1TRWA 1QQ2A 3HVVA 1B4QA 3TKQA 1OKDA 5CREA 3KH9A 4EF0A 2O8VB 5EL8A 1XWAA 2HYXA 3ZMKA 3IAS2 1FHEA 3FZAA 5ECLB 4XRAA 1AW9A 4HI7A 3ISOA 1K3OA 2NDOA 4FO5A 4XS4A 4NMUA 4OCEA 3CTGA 1GTBA 5H5SA 3C8EA 3WGXA 2AYTA 2C1YA 4YQVA 4WF5A 5EPFA 4NXIA 2C0GA 3HY2A 1GSDA 1B48A 2NVLA 2B7JA 5C00A 2D2ZA 4GSNA 5AGYA 1KBNA 3DGQA 3FYGA 5IMZA 1EZKA 3J7Yk 3RHBA 1EP8A 1AAZA 2IN3A 5KN2A 3W6GA 2FD3A 2K18A 3GMFA 5ELGA 4OCFA 1MDKA 4AF2A 3FEUA 2X8CA 2HZEB 3ZVJD 2LNSA 2HFDA 3N5OA 4K1FA 3GA4A 1SKRB 2CVBA 5JWRB 1WRYA 4IVFA 2A2RA 4YQMA 1PGTA 4EKZA 2B5EA 2CT6A 2YV9A 1F2EA 2PU9C 1XWBA 5GAND 3CRTA 4L8EA 2VL3A 3UL3A 12GSA 5COHA 4GSTA 3P90A 3HKRA 2L5OA 3ERGA 4KX4A 3ZITA 3NZNA 2M80A 1XWKA 3D4TA 5D73A 4ZBAA 3RHCA 1GUKA 4MZWA 2DIYA 2ALBA 3E9JB 4KCAA 3IK7A 1NW2A 2HZFA 4XHMA 3MAKA 1N2AA 5F05A 3Q74A 2VCTA 3EC3A 5CRWA 3VWWA 3ZVJA 4L0WA 2QGVA 3O3TA 5GSTA 5J9CA 4KCEA 3HJMA 3IHQA 2YPMA 3TRQA 5G31A 4KAEA 1A8YA 5CO3A 1PSQA 5B8BA 4MPFA 5IOXA 1JFUA 2PN8A 3KD0A 4XTSA 1GULA 4ZB6A 1Z7PA 1MEKA 3FK8A 1XVWA 4ECCA 1M9AA 3HJOA 3GX8A 2VCXA 1HQOA 10GSA 1DSBA 1K3YA 11GSA 4OFNA 4HU9A 1CQHA 4TOPA 1WJKA 3SWLA 4ZL9A 1R5AA 1KEBA 4JBBA 3FY7A 1VF2A 2VUPA 3ZTLA 2VCZA 2OA7A 2J23A 3I43A 1G0TA 2P5QA 3EURA 3WT2A 1UN2A 4TR1A 1FO5A 4TXVA 3H93A 3DKSA 2XBIA 4Q5NA 4IGJA 3TB2A 4PQHA 3DXBA 4IJIA 5IPHA 3QPMA 3TUEA 2GQKA 5D9VA 1GLPA 1T4YA 4AJ7A 3U5RE 4ZB8A 2VD1A 2HXKA 2KP2A 4NHZA 3A5WA 2MZCA 2C80A 1BEDA 2P0GA 2IMKA 1ZMAA 3H1NA 2RUEA 1GNWA 1I9DA 2OE1A 3GSTA 1YZXA 1ON4A 1AQWA 3UMAA 5L71A 3APOA 4F0CA 1U3AA 4J57E 5G5FA 3HDCA 3ZIJA 5CNWA 3KM6A 1Y6EA 2IMFA 1TW9A 5DVBA 4WEYA 5G1LA 4OFMA 1IYIA 2H1DA 1PKWA 5IO0A 3L9UA 4MJCA 4PQIA 1XW5A 2IPAA 3TOUA 1J9BA 1UA5A 3G7IA 3IRAA 4LL1B 3D22A 3A2VA 3A3TA 2RLIA 4V2LA 4YQUA 1LJRA 4IJ3A 5DALA 4ECJA 2B1KA 1JHBA 4GTUA 3FZ9A 1VF3A 3EU4A 3QOUA 4XS4B 4TR4A 2IFQA 3ZFBA 3GRXA 1K0BA 4ACSA 4HEA2 3HVXA 2EC4A 4TR3A 1YDKA 3QD9A 3K8NA 1OC9A 1XWCA 3QAGA 2VL9A 2H0IA 5ECIB 2EIOA 1FB6A 22GSA 4LMWA 3EVIA 4EC0A 3L78A 1AC1A 3WT1A 3HD5A 1LBKA 1XPVA 2LS5A 2CVDA 1U88A 2YWMA 3F4SA 1SKSB 4ZL7A 1TK0B 4N0VA 4KNDA 4PX1A 2IWTA 5F0GA 3VWVA 4K7NA 1O6JA 5GSSA 2C3QA 4ML1A 1XFLA 3UBLA 5DJLA 3GIXA 3IK9A 4HOJA 3FZ4A 5LD0A 4KDXA 1TRUA 3SBCA 1ABAA 3KMNA 1T4ZA 1GTUA 1E2YA 3M0FA 2DC5A 3FW2A 2G0FA 4F2IA 2GZPA 2OACA 3HYPA 4NPBA 2X99A 2MMZA 6GSTA 3TKSE 3WD6A 4KSOA 18GSA 5ID2A 2L59A 4GQFA 2F3MA 3M9JA 5B6NA 5G5EA 4OWYA 1ZOFA 3TJBA 5IOWA 4ZB9A 3EE2A 1TOFA 4RQXA 4ZILA 2X8GA 2YANA 2O89A 3BCIA 4MMMA 3RPPA 3KZQA 2DMLA 1A2MA 19GSA 5H5QA 1E6BA 1F3BA 1PX7A 3US3A 3U6VA 2K6VA 2ON5A 3D0ZA 4FIWA 4EL1A 4KDUA 4K7OA 2IMEA 1ACVA 2AB6A 4ECIA 5J9BA 1TJDA 4DSSB 3L0HA 6GSVA 1WE0A 5G30A 3LWAA 2P31A 2NBSA 4ZL8A 1U3IA 2M46A 1TK8B 4O32A 4PUAA 2VM2A 3O76A 1Z6MA 5ECPB 1CQGA 4O92A 5DCHA 3E0UA 4G9HA 2WDUA 3QDNA 2WULA 3UJ1A 5LNKe 1GWCA 1TU8A 3Q19A 4HQSA 3KJYA 3TGZA 2B7KA 1Y25A 2X64A 4Q5FA 1JZRA 3GURA 4TR1B 3ZL5A 4WKWA 2CVKA 1LU4A 1XVQA 5KN0A 4JEDA 2EIRA 5CRGA 3GKXA 1KTEA 4JZQA 4V1Ap 4BVYA 3BBYA 2XBQA 2H30A 4V1Ag 3I9V2 1EEJA 1URMA 5J4UA 2M72A 1BAYA 1MD3A 4RQRA 3FRCA 1RQMA 4DEJA 3F63A 3HXSA 3WGDA 2MBTA 3RDWA 2HT9A 5JCUA 5D9WA 2FNOA 1DBYA 5B6MA 4G10A 2H6YA 2DJ1A 3HVSA 2GTUA 3FR3A 2WRTA 1PRXA 1U87A 4TXOA 2L4CA 2H1AA 4HJMA 4MJEA 1GSYA 1ILOA 3LSZA 3TCOA 3M9KA 2VOCA 4I2TA 4MZCA 1ZYQB 20GSA 1XZOA 4OFTA 2DJJA 5DAKB 1YQ1A 3PR8A 5HR3A 3IPZA 1W89A 2LJAA 2VCQA 1K0NA 4N30A 1WOUA 4MLYA 1VRSD 2PBJA 2YOIA 5KEJA 1R4WA 1GP1A 3QMXA 3HZ4A 1GNEA 4IS0A 5JWQB 2B1LA 2H72A 1M7TA 5DALB 3W8SA 3KTLA 2I1UA 3HCZA 2R2JA 3M1GA 2GSQA 3GH9A 2VL2C 5HFKA 1F37A 4K0GA 2H1BA 2C0FA 5IMAA 2GQMA 2RUFA 4XRDA 5B8AA 3UARA 2V2GA 1C72A 5A5KA 2C3TA 2QC7A 6GSUA 2HRFA 2FWFA 2Z9SA 3G7YA 3GHAA 1ZCPA 5IMCA 3KMOA 1ZYEA 3CRUA 3IC4A 2MYGA 4WXTA 16GSA 3KXOA 3S9FA 5HR2A 2N5FA 1XOAA 1GUMA 4BL7A 2GZYA 2HNLA 4CHSA 3DEXA 3TKSC 1XWGA 2MMNA 4F9ZA 3DVWA 2IMIA 5FWGA 2H66A 2OBIA 2PWJA 4ID0A 2KUCA 3HJPA 1OYJA 2H6ZA 1TK5B 1A0RP 1V9WA 2L6DA 3VFIA 2O85A 1NHOA 2HE3A 2OJLA 3P7XA 2H6XA 2EIQA 1R26A 2N5AA 3IA1A 2VLTA 4PGTA 1Z6NA 2R37A 5IPGA 5D9XA 4TW5A 2H8LA 3QR6A 5J5NA 2K8SA 4F03A 2BMXA 1PQNA 4WR4A 2N5BA 3UIWA 1MDIA 2TRCP 5HFGA 5A4VA 4I97A 4XS1A 3A2WA 4X1UA 3IOSA 4K8MA 3DIEA 2F51A 4J56E 3F6DA 3WGEA 3QCPA 4PNFA 4TKYA 5JCGA 3MSZA 4FYBA 1FOVA 3TRPA 4OO4A 2PPTA 3C73A 2I4AA 3W8JA 1EV4A 3IR4A 4DSQA 3V1WA 4H86A 3BJ5A 1M9BA 3GTUA 1XIYA 4HU7A 3ME8A 2IL3A 2LRTA 1SJ6A 2ES7A 2HSHA 4ZBBA 4D73B 2GSTA 3KCMA 1GL8A 1EP7A 2I81A 1ERTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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