5KN2A

Native bovine skeletal calsequestrin, high-ca2+ form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
352
structure length
352
Chain Sequence
LDFPEYDGVDRVVNVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMDELILELAAQVLEDKGVGFGMVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSVYVFKGDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDDNKLIGYFKNKDSEHYKAYEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVSFVEAHKRSTLRKLKPESMYETWEDDLDGIHIVAFAEETDPDGYEFLETLKAVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFNIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Calsequestrin
publication title Characterization of Post-Translational Modifications to Calsequestrins of Cardiac and Skeletal Muscle.
pubmed doi rcsb
total genus 105
structure length 352
sequence length 352
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn2A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn2A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn2A02
3Q18A 1Z5YE 2L6DA 4G9HA 4GTUA 2B7JA 2H0HA 3FEUA 2LKUA 2KP1A 4WETA 3APQA 2VL2C 3DEXA 5CNWA 5C00A 4PX1A 1EOHA 5FHIA 1RK4A 1TI1A 5AIVA 1O8WA 5J9CA 3KH7A 1UVZA 2CX3A 2EIRA 3WT2A 1WP0A 2L4CA 3L0HA 2KOKA 3FW2A 1K0MA 3FY7A 4KUNA 4IGJA 5CRGA 4OFNA 3QAVA 2O85A 3WGDA 2VCZA 3IHQA 2FHEA 4EC0A 1V9WA 2DBCA 3VPQA 2GGTA 4N0ZA 3BCKA 4V2NA 5AN1A 4ZL9A 4MF5A 2ON7A 1JZWA 1RQMA 3I9V2 2HI7A 2MMOA 3EMPA 3KMOA 4K0GA 4BPYA 1ST9A 3Q19A 3KIJA 2MZCA 5ECMB 3US3A 4G10A 5D93A 1WMJA 1K0OA 1Z7RA 3KZQA 1AW9A 5HFGA 5ECQB 2GSRA 5DJLA 2GSQA 3VK9A 3DKSA 1TK0B 5G30A 5IO2A 2LJAA 2IFQB 6GSYA 4YAPA 2JSZA 2HZFA 3QR6A 3LGCA 4MMMA 4Q5RA 4TR4A 5ECNB 1T00A 4QQ7A 2GQKA 1VGLA 2A2RA 2FD3A 3QAWA 4RUVA 5B8AA 1QXHA 5DDLA 3PR8A 1EZKA 2HSYA 5EPFA 5F07A 5JWQB 4MF7A 3GKXA 4IVFA 2V6KA 3GTUB 1ML6A 6GSUA 4YQVA 3DIEA 5DBQA 2LUSA 4POMA 1GRXA 2R4VA 2FLSA 3LXTA 2FWGA 3OR5A 1BYEA 1SL1B 5FT3A 1M2AA 4TR1A 2H74A 3GL5A 3HY2A 1TW9A 2I4AA 2JZRA 2PGTA 3ME8A 1OC8A 1U3AA 4KDYA 4ECBA 1SYXA 3TJJA 3WGEA 4J57E 4TKYA 1YY7A 3GFKA 4F82A 5IOWA 1MD3A 3HDCA 1GSSA 3HJPA 3ERFA 4DEJA 1R26A 3PGTA 2FGXA 4LL1B 3CYNA 4EL1A 1SL0B 5IPHA 1TXXA 3KTBA 3WD6A 1ABAA 2DJ1A 2CQ9A 1R4WA 2YWOA 2H1DA 3BCIA 17GSA 5DCGA 4NPBA 1O6JA 1NHOA 3KJYA 2WULA 3GNJA 3HCZA 1XVQA 3DYRA 2OE1A 1BG5A 4RI7A 3ZMLA 4KGIA 2H66A 1VF4A 3L9UA 3KGKA 2Z9SA 2C3TA 2LRNA 5G5FA 4IJIA 1EEMA 3TB2A 1V40A 3AY8A 4ECCA 1VF3A 3LEFA 5GAND 5CRDA 5DCHA 1XW9A 1GSEA 4D73A 3M9JA 4MZWA 3O6TA 2M46A 3TKSC 1AC1A 4AF2A 1AXDA 2JU5A 5CREA 1DBYA 3L9VA 5CRHA 1SU9A 2P5RA 2B5XA 2BMXA 1S3AA 1TI3A 1XWCA 4GRFA 4EVMA 3IA1A 5HFKA 4GSTA 3TRQA 1OAZA 1B9YC 2GT6A 2YNXA 2G0FA 3IXRA 3TCOA 2HLSA 5ECSA 4JBBA 4MP4A 3VI7A 1T3BA 1HNBA 5D9WA 3D6IA 4PNGA 22GSA 1Q98A 2HNLA 3RDWA 1S3DA 3K8NA 3FYGA 3HYPA 5ID2A 4EO3A 1QMVA 1EEJA 2MMNA 1K3LA 3E0UA 1I9DA 1XW5A 5ENUA 3F8UA 3HA9A 4K1FA 4HEA2 3GH6A 3P7XA 1ZL9A 2K6VA 2FA8A 1ZCPA 2CX4A 4O5RA 6GSWA 4EXJA 2H75A 3VWUA 3CMIA 5IIZA 3Q6OA 5D9TA 4ZB8A 1SKSB 4I2UA 3GSTA 3SBCA 1K0CA 2DIYA 2C3QA 3LWAA 4KA0A 1JLWA 3GL3A 1GLQA 4MJEA 1W4VA 3GRXA 4HZ4A 4MJAA 4EDYA 4GSSA 5IMFA 3GKNA 2A2SA 1FG4A 1M0UA 1K0AA 2V32A 3C1SA 1OE8A 1PGTA 3MWHA 2LEGA 3GSSA 5ECOB 2QKEA 2VLVA 2GQMA 3QFBC 3ZFBA 2R6KA 4DSQA 5JWOB 1BEDA 1SENA 2YN1A 1GNWA 3KP9A 1ZYEA 2DSAA 2TRCP 4ID0A 4NV5A 1GL8A 2VAFA 4TXOA 3DXBA 5F0GA 4JEDA 2DC5A 4P3YB 2YWNA 2P31A 4DSSA 1HNAA 3KEBA 3TDGA 1N2AA 2DIZA 1O7UA 3UVTA 2JSYA 2LNSA 4H86A 6GSTA 3G7JA 1MDJA 4ZBBA 1Z6NA 4FO5A 3ZTLA 2A4VA 3MNGA 2CT6A 4PXOA 5LNKe 2C4JA 1U6TA 2DMMA 2GZZA 3F4TA 5GSSA 4MLYA 2DJ3A 2H6YA 3EMXA 2LV3A 4FYCA 1BQ7A 3ZFLA 2NTOA 1YF0A 2M72A 5F06A 4WR4A 2H72A 3A3TA 5KN0A 3IPZA 3TRXA 4EF0A 2K18A 1ERWA 1M99A 3DD3A 3N5OA 4TOPA 3SWLA 4IQAA 4WF4A 1XZOA 2YANA 3F4SA 4XS4A 1U88A 3QFAC 3EWLA 2R3XA 4AGSA 1PL2A 2IN3A 2B5YA 3TOUA 1A24A 1O85A 4KCEA 3O76A 5J41A 3HKRA 3GX0A 1YEPA 3H8QA 3UAPA 1O81A 9GSSA 4MH2A 1B48A 1JZDA 1LBKA 3RHBA 1ILOA 1XCCA 2FUG2 1J9BA 1EOGA 2GLRA 2FNOA 2VM2A 3TJGA 1EGRA 1YEXA 2H6ZA 4HQSA 4IHUA 4IS0A 1EGOA 1X9MB 2QGVA 2C3NA 4EUYA 1YDKA 3R2QA 1PQNA 4CHSA 3CXGA 3C71A 1ZZYA 3W8JA 1NHYA 2CZ2A 3IR4A 3U5RE 3KH9A 5G1KA 5CYYA 5A4VA 5JCWA 1X9SB 3GN3A 4IW9A 2MBSA 3HVSA 2VL9A 3LJRA 1A8LA 2RM5A 2FA4A 2NBSA 2IFQA 1VF2A 4BVXA 3CRUA 4X43A 2PMTA 2M80A 4JU5A 5B6MA 2LJRA 1MEKA 4I97A 1XW6A 2F51A 1OYJA 4ISDA 2JL4A 4XIHA 4KB3A 4XCSA 3GTUA 4IQ1A 1PD21 3HXSA 1THXA 1BAYA 4I2TA 1OC9A 1N8JA 2C0DA 4JR6A 1MTCA 4XS1A 4X1UA 3PH9A 5IM9A 4OFMA 1YQ1A 3TUEA 1B8XA 3NIVA 2XC2A 4JE1A 2LQQA 2B7KA 1GSUA 3GIXA 4XRDA 1F3BA 1PX7A 2X8GA 2IPAA 3W6GA 4XRAA 5LCZA 4LMVA 2VUPA 1E6BA 2XBQA 2WCIA 1FB0A 4I8BA 5IO0A 2H1AA 1A8YA 2PBJA 2YJ7A 5CAXA 1YKAA 3GMFA 4GCIA 1HQOA 3WGXA 1B4QA 3P8WA 2GZYA 1DUGA 2KLXA 4G2EA 4GXZA 3HJOA 1MD4A 3D4TA 1TJDA 4PQIA 1JZRA 2B1LA 2OE0A 4KE3A 1TK5B 1ERUA 5INYA 2PU9C 5GAPD 3ZYWA 1AIUA 1GH2A 1SKRB 4CDOA 4TRXA 3A2WA 2H76A 1X5EA 4I6XA 4HJ2A 1SK1A 1PRXA 4NWYA 3UJ1A 2VCTA 1WJKA 2P5QA 4PUFC 1RW1A 3FK8A 1HNCA 2FWFA 1XVWA 3LSZA 2MBTA 4POBA 3H79A 3VLNA 2IMIA 3VURA 2C1YA 1IYIA 2DJJA 2OA7A 1QFNA 1WOUA 4AJ6A 1U3IA 2I1UA 1KTEA 4ILFA 1F37A 1GUHA 5KN1A 2PWJA 1FOVA 1PKWA 20GSA 4FYBA 1UC7A 2RIIA 3WYWA 2X8HA 2OE3A 2GQLA 2GS3A 1YF1A 3KTLA 1V2AA 1GSQA 3RAZA 1C72A 2GDRA 13GSA 3APSA 4J2FA 1XOBA 3TOTA 4V2MA 3F3QA 1ZOFA 1URMA 3C7MA 3ZIVA 2C8UA 1GTIA 4ZB6A 2I9HA 5G1LA 1F6MC 4YQMA 19GSA 4AJ8A 2F3MA 1G6WA 3BBYA 4NV2A 2H1GA 1BJXA 1A2MA 3G7YA 12GSA 2FWHA 4KAEA 3M8NA 2PVOC 2MYGA 1M9BA 4ZBAA 2HE3A 1ERVA 1K0DA 2VD0A 5DJMA 2XHFA 3LYKA 3EVIA 3D5JA 2CAQA 3D4MA 3L78A 6GSSA 2QSIA 4Z7XA 2IMKA 1ZGNA 14GSA 4KW6A 2K8SA 2H73A 4K7NA 2VOCA 4WKWA 3QD9A 4NHWA 4TR1B 3D22A 3N9JA 2L57A 1LJRA 5G31A 3M0FA 4FIWA 2EIOA 4JRRA 2YZHA 3CRTA 2YZUA 3IC4A 3HVVA 4O7HA 5ECLB 2AJQB 4PURA 3GYKA 2C0FA 4MF6A 5G5EA 2HZEB 2XPEA 2AB6A 2NDOA 2L4QA 3KD0A 3FR3A 2FY6A 3IRAA 2OKAA 1OKDA 3FZAA 2WDUA 3G9BA 4BVYA 5EVOA 1TDIA 2B3SA 1ACVA 2C80A 1VRSD 2JACA 3QMXA 3S9FA 1TRVA 3A2VA 2I3YA 5DALB 5IMAA 3M1GA 1OE7A 5ECIB 2L5LA 3ZMKA 2IWTA 1TRSA 4PUAA 2HFDA 4LLRA 2F8FA 2J9HA 1FAAA 3CTGA 2IIYA 4KH7A 5IMVA 1K0NA 2XPDA 8GSSA 4YQUA 1QQ2A 5B7CA 2AYTA 1SD8A 2PERA 2E2GA 4PQHA 2WFCA 4MZBA 2CA8A 1A0FA 3APOA 2JZTA 1CQGA 1OC3A 1ON4A 3VPTA 4D73B 3C8EA 2H8LA 1TRUA 2ES7A 4BWSA 2L59A 3Q74A 4KNDA 2XBIA 2IJYA 5AIXA 3KCMA 3EC3A 1YZXA 3A2XA 3RBTA 1B9XC 1GULA 2FCHA 4HOJA 1Z3EA 2OACA 1KNGA 3TKSE 5DVBA 1FHEA 2B5EA 2ZUPA 4IP1A 1GSYA 1JHBA 2VCXA 1DE2A 4OO4A 3UBKA 2H19A 5D73A 5A4UA 3A5WA 2ALBA 1H4OA 2YPMA 3L9SA 3GKMA 3BJ5A 2LQOA 3E3EA 1O8XA 1TK8B 2RLIA 4MA9A 4L8EA 3DRNA 5ID2B 3I6AA 4FH8A 4IN0A 5DAKB 4TR0A 3DWVA 5CP1A 11GSA 4K7IA 4F03A 4GLTA 2I81A 2B1KA 1GSFA 2VCWA 2YWIA 1GNEA 4POKA 4N0VA 4ECIA 2WB9A 1O73A 4Q5NA 3BD2A 1EP7A 3CBUA 2R5GA 2AV4A 1G7OA 1GTUA 3P2AA 3C73A 4HU7A 1WRYA 2O8VB 2P0GA 2X64A 4K8MA 3KMNA 4Q5QA 4IELA 2IMEA 4OD7A 1CQHA 1PKZA 2VLTA 4NAXA 2BJXA 3F6FA 1PN9A 4EKZA 4MZCA 1M9AA 3FRCA 1GUKA 2GTUA 1JZOA 1ERTA 1OKTA 2CVDA 4EE0A 2JADA 1SJ6A 3UOMA 1M2BA 2GSTA 1T7PB 3F9UA 3ZL5A 3EYTA 1A2LA 4PGTA 1R5AA 1PSQA 3ZZXA 3QAGA 3ME7A 2E0QA 1W89A 2HT9A 2YV9A 3IDVA 2VD1A 2CZ3A 2LRTA 4TW5A 1SK0A 2G2QA 2VLUA 4HDEA 4RI6A 4DSSB 1FW1A 3E9JB 3FZ5A 1V58A 3ZVJD 3C1RA 4L0UA 2K9FA 2X8CA 4CW9A 3KXOA 5ECKB 3UEMA 4GF0A 4L0WA 3ZREA 5FWGA 3DVWA 3TJKA 2WJUA 5HR0A 1SJZA 1G7EA 1VF1A 3W8SA 2VM1A 3L4NA 1X5DA 2DMLA 1AQXA 6GSVA 2PVQA 2X99A 3DVXA 1DE1A 3KP8A 3HVXA 2PPTA 4ULXA 5L71A 3GHAA 1XFLA 3UIWA 3RPPA 5H5SA 2H30A 3GA4A 4PQ1A 2H0GA 2H71A 2ZCTA 4XS4B 3ZITA 1B4PA 2CAIA 4ACSA 1T1VA 3IE3A 2DJ2A 1AQWA 3H1NA 3ERGA 2RUFA 3IBHA 3TKQA 1T4YA 3GURA 4N11A 3QPMA 4RQRA 3F6DA 3HD5A 4ZB9A 2LSTA 5JCUA 4X0XA 10GSA 2H01A 4O32A 2VCQA 2H70A 2L5OA 4JZQA 2E7PA 2ON5A 4OFTA 1Q4JA 1GUMA 1IYHA 1NM3A 1PA3A 1R5PA 3MSZA 5F05A 2HYXA 2DLXA 1E2YA 3MAKA 4HS1A 3VI5A 1Y25A 1XPVA 4F9ZA 3F4RA 2YJHA 4ML6A 2N5AA 4BWQA 3GX8A 1GWCA 4OCEA 2O89A 3I69A 1USBA 2J23A 2HSHA 2YOIA 3ZIJA 2TIRA 1A23A 4ML1A 2EIQA 1OVNA 1TOFA 1TTZA 4XS6A 1F9MA 5HQPA 2WS2A 4KX4A 3KM6A 5J9BA 5DQSA 2LJKA 3TKPA 3TKRA 2IMFA 18GSA 2LRCA 1JLVA 1XWBA 2DJKA 3M9KA 1R7HA 5G2ZA 4MABA 4GQCA 4XHMA 5A4WA 4GSNA 3J7Yb 1Z6MA 3GUSA 4BA7A 3H4KA 5JWRB 3GH9A 1PX6A 5D9XA 3GKKA 1X5CA 2B6MA 2VO4A 5IOXA 1OC9B 1AUCA 1WIKA 5EY6A 3NOFA 2H0IA 3F0IA 3F3RA 2NVLA 1SK2A 4KSOA 1HYUA 5IMCA 1PL1A 1V98A 4MCUA 1ZMAA 4V2LA 1J0FA 1SD9A 2LTKA 4G19A 2GSSA 4I5QA 2MMAA 4N10A 3LORA 1I5GA 2JZSA 2LS5A 4XTSA 3VWXA 5HFIA 2V41A 4GWRA 4WF5A 5ECRB 3UBLA 3VFIA 2GVPA 2PUKC 4V1Ap 4YAVA 5D8IA 2FWEA 5C04A 5HR2A 2HZEA 4EDZA 4ZXGA 5DQYA 4LMWA 3UVHA 5IQYA 3H93A 2C0GA 2O87A 2HRFA 2D2ZA 1FB6A 4NMUA 1EV4A 1XXUA 3ISOA 3ERWA 3FHKA 4JR4A 3IK7A 1J08A 5COHA 1H75A 4ZBDA 5KN3A 1XWAA 5IMDA 4MJCA 3FZ4A 7GSSA 1NSWA 5LD0A 2MMZA 3NZNA 3UL3A 5DALA 4F0BA 1QUWA 3P90A 1MDIA 3IK9A 4LL4B 1V57A 2GT5A 3BOAA 2EC4A 3TRPA 4WBRD 3LXZA 4WXTA 5IMZA 1WWJA 1FVJA 4KCAA 2L6CA 5GZZB 2IL3A 5HR1A 3EE2A 4HZ2A 5HR3A 2V6OA 6GSXA 3PINA 4HQZA 3IOSA 1BX9A 1GLPA 3UARA 2IMDA 4IJ3A 2R2JA 1G6YA 5D96A 1U87A 3FR9A 2K8VA 2N5FA 2YV7A 3DGQA 4FYUA 2VCVA 1F3AA 4WEYA 2VL2A 2H6XA 3HZ4A 5AGYA 3VWWA 3IV4A 5KEJA 5J5NA 3LFLA 1F2EA 2CVKA 2QC7A 4K0NA 3WT1A 2CVBA 3MDKA 3ED3A 4MDCA 1QK8A 4K6XA 2F9SA 1UN2A 4RQXA 3RPNA 3G7IA 2WZ9A 5JCGA 3IAS2 4V1Ag 5AISA 1Z7PA 4F2IA 2E2MA 3HZ8A 4POLA 3LG6A 4K2DA 4MPGA 3FR6A 2WRTA 1QGVA 4DVCA 4ZL7A 1KBNA 2CV4A 2ZNMA 5A5KA 5DAKA 4TR3A 2OADA 2V2GA 1AAZA 1KEBA 5CO3A 2KHPA 4O92A 2RUEA 1EP8A 3CSIA 3CSHA 3IAM2 3HJMA 2YWMA 5E4WA 3ZLPA 2RM6A 1SYRA 5B8BA 4GQFA 1JFUA 1MDKA 5B6NA 2F8AA 1TU7A 1SL2B 2BTOT 2O7KA 4OMVA 5J3RA 1YKCA 3TGZA 3O3TA 3F63A 1DSBA 2YCDA 1SKWB 1FO5A 2KUCA 5D9VA 1GSDA 4NXIA 1XWKA 1Z9HA 3EURA 4KDUA 1TU8A 1K0BA 5E59A 3D21A 1WE0A 5ECHB 5GSTA 2NPBA 4ZL8A 4N30A 2YP6A 4E8HA 1M7TA 4DSRA 1T8EB 4MK3A 5H5QA 4IBPA 2V1MA 4TVEA 3TJBA 2PN8A 16GSA 3FKFA 1T4ZA 4WR5A 2KP2A 2DJ0A 1WPIA 5IPGA 3CSJA 3ZVJA 2R37A 2OJLA 1TRWA 1FVKA 1TKDB 1YJ6A 1GTAA 1XOAA 3QCPA 4KSMA 4L5OA 4HU9A 3EU3A 5ELGA 1PMTA 1EV9A 4IKHA 4QL9A 2VL3A 3ZRDA 4PNFA 3D0ZA 1G0TA 2AUVA 4Q5FA 5ECPB 3CTFA 4KDXA 1X0RA 2GZPA 5J4UA 3DMLA 2LNTA 2TRXA 3J7Yk 4NHZA 1XWGA 2HXKA 1SJIA 4OWYA 4HJMA 3JCML 4OCFA 5ELAA 3EINA 4OO5A 4HUAA 2REMA 5CRWA 4K7OA 4TN8A 3UMAA 4L5LA 4ZILA 1NW2A 3RHCA 4K9ZA 3HHVA 3TJFA 4YH2A 1XBSA 1S3CA 3U6VA 1A0RP 4ZIJA 5EL8A 4WBJA 1LU4A 1UA5A 3GV1A 5F8BA 4E8EA 4TXVA 3LQ7A 4AJ7A 5KN2A 3EU4A 2AAWA 5ABRA 1M2DA 2WGRA 1X9WB 3QOUA 3TKSA 4QL7A 4LA1A 1HD2A 3LYPA 3QDNA 3FZ9A 1GP1A 2N5BA 4TXOB 2C0EA 1EWXA 1AQVA 3I43A 1K3YA 2VIMA 4J56E 4F0CA 4MH3A 1A2JA 3VWVA 2H1BA 1THOA 1K3OA 1GTBA 2OBKA 4MPFA 4MJBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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