5LNKe

Entire ovine respiratory complex i
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
LGLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQEKNVSLNNFSADQVTRALENVLSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Mitochondrial complex I, 51 kDa subunit
publication title Atomic structure of the entire mammalian mitochondrial complex I.
pubmed doi rcsb
total genus 19
structure length 84
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
e PF05047 L51_S25_CI-B8 Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5lnke00
3ZZXA 1V2AA 3BBYA 5FHIA 2JL4A 3K8NA 3APQA 4KDUA 3US3A 1PRXA 3IK7A 4PGTA 2H70A 1M2DA 1HNAA 4IN0A 2OE0A 3O6TA 4MK3A 3TJBA 5DAKA 4V2NA 2B6MA 2VO4A 1FHEA 1EP7A 1BEDA 1ILOA 4OFNA 4OFMA 4BL7A 1AUCA 2V2GA 2GGTA 5DDLA 4Q5QA 5CYYA 2IWTA 2I1UA 3ZRDA 3IE3A 5IMFA 5KN0A 2ZNMA 1EGRA 1NHYA 2V6KA 4N10A 2KLXA 4WBRD 2J9HA 3A2XA 4ZILA 1GSSA 2AV4A 3A5WA 6GSWA 3Q74A 1R4WA 1VGLA 1OYJA 2K6VA 3ZVJA 1OC8A 2DMLA 1G6YA 4P3YB 3IAS2 4JRRA 4IQAA 2DJ3A 3HZ4A 4OO4A 2GSQA 1TRSA 2MBTA 3IK9A 1SKWB 4FYBA 1EOGA 3EINA 4NXIA 1B4QA 2O7KA 1U3IA 4HJMA 3L9VA 2K8VA 4JEDA 2K18A 5CP1A 1A8LA 1GSYA 1M0UA 5D96A 1EOHA 1XBSA 4MZWA 1HNBA 1SJ6A 5IMAA 4KH7A 2LRTA 5HR0A 3RAZA 2F8FA 3L9SA 4IP6A 3GMFA 3TRXA 3F4RA 1PA3A 4ECJA 3QAGA 2EIRA 2L4QA 2HSHA 3RDWA 1BG5A 3R2QA 2WJUA 5J5NA 4XS1A 3KM6A 2TIRA 5C04A 3DIEA 1OC3A 4YQVA 1LU4A 5JWOB 1T4ZA 3ME7A 5L71A 3MNGA 2GQLA 5ECQB 4L8EA 3ZREA 2X8CA 3KP8A 3VWWA 2RUFA 1K0OA 3EE2A 1FW1A 3NOFA 4ZL8A 1F2EA 2JSYA 4KDXA 3RBTA 2CQ9A 1T7PB 4AF2A 1BYEA 1X0RA 5IOWA 3APOA 4ZXGA 2O85A 3HA9A 4L5OA 3GTUB 3HKRA 1Z7RA 2X8HA 3UL3A 2ZCTA 2TRXA 3E3EA 4QL7A 4KA0A 1UA5A 2GTUA 1F6MC 5ID2B 5F07A 1XOAA 1X5CA 1GTUA 3M8NA 1O7UA 4F0CA 1AIUA 1XWBA 2H1BA 4MJAA 2PGTA 2M46A 3DMLA 5A5KA 1MTCA 1BX9A 4TW5A 2XC2A 18GSA 3HVSA 5GAND 1GUKA 1Z3EA 1WRYA 1Z6NA 5HR3A 1VF2A 2P5RA 2TRCP 1URMA 12GSA 2LRNA 3UBKA 2FWGA 3EU3A 4YQUA 2FWEA 4IS0A 10GSA 3IBHA 2ON7A 4GF0A 2WB9A 4XS6A 4OD7A 3KMOA 4CDOA 3GN3A 1TI3A 1NM3A 3O3TA 2VM1A 2DJKA 1TXXA 2A2RA 1ZOFA 1AQWA 1TRVA 1GNWA 4IBPA 4LMWA 1OAZA 2C0DA 5JCWA 4MJBA 5G31A 2PMTA 3BCKA 4IKHA 4KE3A 2LKUA 4F82A 1O8WA 1AQVA 2XBIA 3QOUA 1T1VA 4PUFC 4YAVA 2PERA 1OC9B 6GSTA 1TJDA 3KEBA 3KZQA 2IMDA 2LJRA 3F4TA 5H5SA 3DVXA 1WWJA 3EMXA 1W4VA 1E2YA 7GSSA 2OACA 3GKKA 3ZIJA 4MDCA 1XW5A 3KCMA 4DSRA 4YH2A 3ED3A 3ZLPA 5LD0A 5HFGA 3CTFA 1J08A 5CO3A 1SD9A 1XW6A 1LBKA 3TRPA 3ZYWA 2YWOA 5CRWA 3LXTA 4ULXA 2HI7A 4AGSA 4TVEA 5ECPB 4EDZA 4LL4B 1ML6A 2K8SA 1NSWA 2L5OA 3D21A 4GSNA 3LFLA 4POMA 3F0IA 4GCIA 2LRCA 22GSA 1MDKA 4NPBA 2DJ1A 1M9AA 2CVDA 2CAIA 3G9BA 2X8GA 3QPMA 4TR0A 2KP1A 5IPGA 4WKWA 4GRFA 4WR4A 1U87A 2HZEA 4NHZA 4K8MA 4KUNA 5KEJA 1V58A 4L5LA 4K7OA 3BCIA 1AW9A 2FGXA 4MABA 2CZ3A 5HR2A 3LYKA 3WT2A 4ZL9A 1TOFA 4Q5NA 5D9XA 1ERUA 1Y25A 1XOBA 2FWHA 4X0XA 4KCAA 5IMDA 1S3DA 4I8BA 3D0ZA 3TJJA 1OE8A 4WXTA 2GDRA 3FW2A 5J4UA 3EVIA 5B8AA 1IYIA 1X5EA 1PX6A 2HZEB 3P7XA 4TR1A 4EDYA 1B8XA 1O8XA 5D8IA 3UOMA 4KX4A 3F6DA 1K0BA 2GQMA 2Z9SA 2F3MA 1WMJA 4HQZA 2JACA 3DRNA 1T4YA 1XXUA 5F05A 4EUYA 5A4WA 3GNJA 3QCPA 4TR1B 1WE0A 3NZNA 2C3QA 3KH9A 3W8SA 1PQNA 3FZ9A 4PURA 1SKSB 2H71A 3C73A 4PX1A 2JZRA 4Q5FA 4LLRA 3IDVA 4NV5A 2WULA 1ERWA 1CQGA 1HNCA 4HU7A 3TRQA 4E8HA 3DEXA 1K0MA 5FT3A 4EXJA 2FA4A 2ES7A 4IGJA 2N5AA 1M7TA 1Z7PA 5CRHA 2H72A 3CRUA 2DJ0A 4KNDA 1X9WB 3L4NA 2B5XA 1NHOA 1F9MA 1M9BA 4X1UA 3TOTA 2C0GA 3FR6A 4MPFA 1OKDA 1QFNA 1OVNA 3KTBA 5DJLA 1QK8A 6GSSA 1RK4A 4BPYA 2RM6A 2P31A 1S3CA 1XIYA 1ZZYA 3IAM2 5DALA 4TXOA 1ZYQB 4TR4A 4K6XA 3UAPA 4HDEA 4ML6A 2MMAA 3HVVA 2H74A 2AHEA 1FO5A 2IN3A 2WDUA 4BA7A 3PGTA 4JE1A 4EE0A 2AJQB 2MMZA 4N30A 4ZB9A 3VPQA 2C8UA 1TW9A 3LJRA 4JBBA 5ENUA 1WPIA 1GLPA 2XPDA 1QMVA 3VK9A 1U6TA 2G2QA 3I69A 2GLRA 1SYXA 4FYCA 3GKNA 3IRAA 4MZBA 3H8QA 2LTKA 1R5AA 1V98A 2KUCA 1FG4A 4O5RA 5HFKA 3FY7A 4V2MA 3FZAA 3GUSA 4DVCA 3EMPA 3LORA 1MD4A 4DEJA 4JZQA 2MBSA 3E9JB 2YV9A 1FOVA 2KP2A 5DQSA 3IPZA 5IMCA 3ZVJD 2BMXA 3CSJA 3EWLA 3L78A 3QFBC 4HJ2A 4BVYA 4CW9A 4D73A 1FVKA 2OADA 2H30A 5ECNB 2CX4A 3LYPA 4QL9A 4AJ6A 1SK0A 1EWXA 2IIYA 2H19A 4AJ7A 2REMA 5DAKB 5IPHA 1GSEA 5ECKB 1SKRB 1PX7A 2V32A 1T3BA 3UVHA 2O87A 5D9WA 3SWLA 2A4VA 2VLUA 4ECIA 3GL5A 2A2SA 3I9V2 5IMZA 2H1DA 4FH8A 1G7EA 1EGOA 1MD3A 2YWIA 3M3MA 1AC1A 3BD2A 3HVXA 1C72A 2DSAA 2IPAA 3VI7A 1HQOA 3D22A 3IOSA 1JZOA 3D4MA 3ERGA 3ZFBA 1XW9A 1Y6EA 5J3RA 4TN8A 5F8BA 1VF4A 1SL2B 4XRDA 4ZBBA 1TU8A 5DJMA 4YAPA 4EO3A 4F2IA 3DD3A 1YZXA 3CSIA 4PXOA 4V1Ap 2FWFA 5D9TA 3M0FA 2YWMA 3IV4A 2C0EA 5ELAA 2IFQA 1JLVA 2YOIA 2LQOA 4ECBA 2VLTA 2P5QA 5IM9A 1TDIA 2AAWA 2CT6A 2ZUPA 3GFKA 3VPTA 4JU5A 5B6NA 1K0DA 4HUAA 4HOJA 2GT5A 2FD3A 3TGZA 2VD0A 3TKQA 1YJ6A 2H66A 3IXRA 3QD9A 4V1Ag 2YPMA 1A0RP 3HJPA 4RQXA 2DBCA 2QC7A 3EYTA 8GSSA 1VRSD 1K3OA 4EVMA 2PVOC 1AXDA 2H75A 2N5BA 1XWCA 1Z9HA 5ECLB 1G6WA 4AJ8A 5ECHB 1XVQA 2DMMA 2O8VB 2E2GA 1JZDA 5EVOA 5A4VA 3H79A 2G0FA 2OBKA 3FR9A 3GL3A 1UC7A 5F06A 1DBYA 1Q98A 1A2LA 2H73A 2HFDA 5CNWA 4MPGA 5ECOB 1JLWA 5A4UA 3RPPA 4JR6A 1H4OA 2NPBA 4FIWA 4KDYA 5ELGA 2MMOA 5J9CA 1PMTA 1SJZA 3GSTA 3FR3A 1K3YA 2NBSA 4MH2A 3HHVA 2FCHA 4TRXA 1F37A 2B1KA 1J0FA 2WZ9A 4Q5RA 2DJ2A 5IOXA 1OKTA 2BTOT 2LV3A 1ST9A 3ME8A 1O85A 2FLSA 1AQXA 4GQCA 4MLYA 1B48A 1GRXA 4TOPA 1Q4JA 1KEBA 3RHBA 2VCXA 2BJXA 5LCZA 3L9UA 3UBLA 1Z5YE 3GIXA 5CRGA 2EIOA 1QGVA 1O81A 3F4SA 4PUAA 3UIWA 1YKAA 1YDKA 3JCML 1NW2A 5ECIB 1TKDB 1ZYEA 1TU7A 5F0GA 2WS2A 2F8AA 4BVXA 3A2WA 3ERWA 3ZMKA 4F9ZA 2VCTA 5AIVA 4K7IA 2PVQA 3LG6A 1GSFA 1M2BA 2HRNA 2B1LA 2PBJA 1U88A 2PWJA 4F0BA 4I2UA 5AIXA 4BWQA 3VFIA 3MAKA 5D73A 4EC0A 2I81A 2RUEA 4PNGA 5JCGA 3SBCA 3TKRA 4LMVA 1PSQA 1M99A 3L0HA 3IC4A 3TCOA 1EV9A 1DE1A 2N5FA 3V1WA 4WEYA 2GS3A 1O6JA 2FA8A 4O7HA 1PL2A 5IIZA 3BOAA 1XWGA 3ZITA 4IQ1A 1XWAA 4POBA 1F3AA 3I43A 2QKEA 3GX8A 5G5EA 2VD1A 4FYUA 3C1RA 1ABAA 3CMIA 2JZSA 2HZFA 3C7MA 4QQ7A 3P90A 3QFAC 4ZB8A 2WFCA 1DUGA 1SENA 4H86A 4EF0A 2GT6A 5G1KA 4MF6A 2JZTA 1RQMA 14GSA 1TTZA 3D6IA 5JWRB 4RI6A 3HCZA 2OE1A 3DVWA 4KB3A 3MSZA 1MDJA 4HI7A 2CVKA 4ECCA 3H93A 1TI1A 1K0CA 2VCQA 1TP9A 2OKAA 1OE7A 2YWNA 4GLTA 2FUG2 1PL1A 1SD8A 5G5FA 1PD21 3Q6OA 3DGQA 4G10A 2YN1A 4KAEA 2CV4A 3EC3A 2IJYA 3LEFA 2H6YA 4GWRA 2C80A 4ZIJA 1SK2A 5IO2A 2H01A 4NHWA 1R26A 3IA1A 1A2JA 3TJFA 4HZ2A 3F3RA 4LL1B 3KXOA 2H1GA 3H4KA 1E6BA 4IELA 3FKFA 16GSA 2IMEA 3HJMA 5G2ZA 3GRXA 4GTUA 2IL3A 2PN8A 4MJEA 2I4AA 3QMXA 4IW9A 4O32A 3TDGA 1VF3A 3MWHA 3WGXA 3IHQA 3QAWA 1MDIA 2GZPA 5J41A 2EIQA 5COHA 5ABRA 4MA9A 3J7Yb 2J23A 2YZUA 4HQSA 2HE3A 1S3AA 1QXHA 4XS4A 4MF7A 5JCUA 2L4CA 1YF0A 3D5JA 3VWUA 3TKSE 2VUPA 2PUKC 4OMVA 3TOUA 4IJ3A 4L0UA 3KMNA 4GSTA 3TUEA 4KSOA 2LSTA 1JFUA 4G19A 3GYKA 1RW1A 2YP6A 2HXKA 2YCDA 1GH2A 2CVBA 6GSYA 5HR1A 1THXA 2I9HA 5J9BA 2B7JA 4ID0A 2H6ZA 2VL9A 2AB6A 5GSTA 4K1FA 4MP4A 2WRTA 5H5QA 3HXSA 1ON4A 3ZL5A 3G7JA 2V1MA 2KOKA 2M80A 3CXGA 4N11A 2GSRA 3HD5A 3APSA 4GQFA 2L59A 1GP1A 4X43A 4J2FA 2EC4A 4TXVA 2PPTA 3N9JA 1A24A 4NAXA 4ZL7A 5DALB 4TXOB 4IP1A 4RUVA 2M72A 3LGCA 4XHMA 3KIJA 2R2JA 3F3QA 4WF4A 4FO5A 2F51A 3S9FA 1A8YA 2VL2A 3GX0A 1K0AA 1W89A 2H0IA 4KW6A 3GV1A 1F3BA 5EY6A 1R7HA 3WGEA 2C0FA 3LWAA 2YJ7A 1G7OA 3UEMA 1YF1A 2AYTA 4N0ZA 2OJLA 3P8WA 2B3SA 5GAPD 5IO0A 3GA4A 1GSUA 3FK8A 2VCWA 4MJCA 1PN9A 6GSUA 2FHEA 3FZ4A 3C1SA 2CX3A 2HYXA 3AY8A 5FWGA 1YEXA 1B9XC 3GSSA 2VIMA 2LNSA 3H1NA 4IHUA 1GUHA 3F63A 1GNEA 3DXBA 3EU4A 3GH6A 4E8EA 4D73B 1LJRA 4LA1A 2D2ZA 1SU9A 5B8BA 1T00A 2YZHA 1K0NA 4OWYA 2LJKA 2RIIA 2C3NA 1KNGA 3VLNA 3C71A 5D9VA 4NMUA 1TRWA 2B5YA 3U5RE 3G7YA 2HRFA 4NV2A 4EKZA 1BJXA 3N5OA 19GSA 3E0UA 3KD0A 1GUMA 1SJIA 4IJIA 2R37A 3GURA 2YV7A 4ISDA 5DCHA 5HQPA 3LXZA 5JWQB 2GSTA 1V9WA 1ZMAA 2C1YA 3LSZA 2QSIA 5CRDA 1GTIA 4IVFA 4HZ4A 2VCVA 4EL1A 3HZ8A 5CREA 5EL8A 4CHSA 3WD6A 2H0HA 2P0GA 5KN1A 1ERTA 4WBJA 4WR5A 5B7CA 2OE3A 5DBQA 1X5DA 2GVPA 1TK5B 4OO5A 1FVJA 3GTUA 1XWKA 4KSMA 3I6AA 1XVWA 1X9MB 2IFQB 1G0TA 5ECMB 3FHKA 3ERFA 3KTLA 5ID2A 4TKYA 3FEUA 2AUVA 4J57E 3CBUA 2HNLA 3TB2A 3IR4A 3FYGA 1GLQA 5IQYA 2MZCA 6GSVA 3F8UA 1YEPA 1Z6MA 2DLXA 3QAVA 5G1LA 3BJ5A 1JHBA 1H75A 2IMKA 1QQ2A 4I5QA 1ERVA 2KHPA 3CYNA 2CA8A 5IMVA 1EEMA 2X99A 2H1AA 2CZ2A 2H76A 1ZGNA 3UVTA 3CRTA 2QGVA 4N0VA 11GSA 4O92A 2NDOA 1WP0A 3PINA 1UVZA 2WCIA 2C3TA 2V41A 5GSSA 3D4TA 4RQRA 1TK0B 1A2MA 3F9UA 2IMFA 4KGIA 3TKSA 1HYUA 4XIHA 1EEJA 3WT1A 1T8EB 4MH3A 2O89A 3W8JA 3RPNA 4GSSA 1K3LA 3UMAA 3ZFLA 1WOUA 1U3AA 1I9DA 2OBIA 1N8JA 2NVLA 3VURA 4I2TA 1EP8A 4YQMA 1A23A 5ECRB 4K7NA 1DE2A 1HD2A 3GKMA 2C4JA 2DC5A 1YKCA 4XTSA 1IYHA 5GZZB 3FRCA 1XZOA 3WGDA 2GZYA 2X64A 3M9KA 3VI5A 3Q18A 20GSA 1EZKA 2H8LA 4KCEA 2H6XA 2NTOA 2L6DA 1GULA 1OC9A 2E0QA 1TRUA 1WIKA 3P2AA 2DJJA 1N2AA 1FAAA 4PQIA 3NIVA 4OCEA 2LS5A 4ML1A 3ZMLA 2HT9A 1BAYA 2RM5A 2CAQA 4OCFA 2XPEA 3PR8A 4ACSA 2ALBA 1A0FA 2VL2C 1SL0B 4HU9A 2GQKA 1GTAA 2E2MA 3GH9A 4ILFA 1JZWA 4ZBAA 3OR5A 2HSYA 2R4VA 5DCGA 4K0GA 2YNXA 3DKSA 4BWSA 5KN2A 2LNTA 1FB6A 1J9BA 4POLA 5C00A 2L6CA 2VM2A 4XCSA 1I5GA 1AAZA 1KTEA 1FB0A 5H5RA 1VF1A 4POKA 2DIYA 2FY6A 4NWYA 17GSA 4WF5A 2L57A 2OA7A 5CAXA 5DQYA 4GXZA 4OFTA 4XRAA 3VWXA 5E59A 1O73A 1YQ1A 1GL8A 5AISA 2B5EA 4PNFA 5AN1A 5LNKe 4MCUA 1MEKA 2MMNA 1ZCPA 3KJYA 2V6OA 1GSQA 4K0NA 4ZB6A 1SL1B 5G30A 2VAFA 2LJAA 2VCZA 2LQQA 4F03A 3W6GA 5E4WA 1THOA 3PH9A 2DIZA 2VL3A 1B9YC 4MMMA 5INYA 4TR3A 1R5PA 4HS1A 5D93A 2RLIA 2GSSA 4V2LA 4WETA 3M9JA 13GSA 4ZBDA 2F9SA 3M1GA 2L5LA 1WJKA 1PKZA 1KBNA 3A3TA 1JZRA 1TK8B 5DVBA 4G9HA 2VLVA 4I97A 5HFIA 3KP9A 2MYGA 2R6KA 2IMIA 3G7IA 3HDCA 1DSBA 5EPFA 3GKXA 3J7Yk 2PU9C 2R5GA 5ECSA 3ISOA 1M2AA 4G2EA 2GZZA 1GWCA 2HLSA 2ON5A 3UARA 1XCCA 1SK1A 3DWVA 3QDNA 3MDKA 4K2DA 3ZTLA 1SYRA 1PGTA 2FNOA 1B4PA 2K9FA 1BQ7A 3KGKA 2LUSA 6GSXA 3HJOA 1UN2A 2XBQA 3UJ1A 3CSHA 4MZCA 1QUWA 5KN3A 4RI7A 3WYWA 4JR4A 1XPVA 4PQHA 3CTGA 1EV4A 3TJGA 2JSZA 3VWVA 3TKSC 1YY7A 3F6FA 3GHAA 3LQ7A 2JU5A 4K9ZA 2I3YA 4DSQA 3HY2A 3KH7A 3FZ5A 1V57A 4PQ1A 4XS4B 4DSSA 3EURA 2YJHA 2B7KA 1PKWA 1ZL9A 3TKPA 4MF5A 3TJKA 1USBA 4J56E 5AGYA 4I6XA 2YANA 2E7PA 3U6VA 3A2VA 1GTBA 5B6MA 2LEGA 2XHFA 2H0GA 1CQHA 2JADA 3HYPA 4L0WA 4HEA2 2WGRA 3ZIVA 3DYRA 3C8EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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