4KCAA

Crystal structure of endo-1,5-alpha-l-arabinanase from a bovine ruminal metagenomic library
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
635
structure length
635
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGPSTYELKRVSVHDPSIVWDPSSKTYYIFGSHRAAAKTTDLMSWTAFTAPWKTATSNNAANNVAFETPAVKKVKKGGVDVDFPAFSATKWSAKGGSGYSVDGNMWAPDVIYNKVLKKWCMYLSINGNAWYSSIILLTADNIEGPYLYQGPVVIGGFKNGTEYKETDFELVLGPQSSLPERYATGGKWGDRYPNNIDPCVFYDEEGKLWMTYGSWSGGIWMIELDENTGLRDYDVTYELTGSGNGITVDPYFGKKIAGGYYVSGEASYIEYIGGYYFLFVTYGGLAAGGVASDYNNGGYQMRVFRSEKPDGPYLDARGTDAVFASYKLDFGPDANDNRGVNIFGAYGDWGNQTKGKNSERSQGHNSIIAAEDGRTYLVYHTRFQNRGEEHEVRVHQVFQNEDGWLVAAPFEYTGETVKSADIATSQQVPTNKIAGSYKLLTHPFKLDHRVKELAKPVDIELNADGTITGSTTGTWSVKEGTSYITINLDKEYKGVIVEQTLEPTSDKAFVFTALNRNGVTIWGYKPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endo-1,5-alpha-L-arabinanase
publication title Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 181
structure length 635
sequence length 635
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.99: Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase.
pdb deposition date 2013-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.128.10 Mainly Beta Beta Barrel Lipocalin Lipocalin 4kcaA03
2.115.10.20 Mainly Beta 5 Propeller Tachylectin-2; Chain A Glycosyl hydrolase domain; family 43 4kcaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kcaA01
4GF0A 4NXIA 4MPGA 3D5JA 3U14A 3GV1A 1K0CA 1A0FA 1XXUA 4GXZA 1AXDA 1O7UA 1UC7A 3GKXA 4DSSA 4ECIA 3LSZA 3D22A 3EU3A 5G2ZA 4MLYA 2BTOT 2X8HA 3K1UA 2QQUA 1XIYA 3D61A 3LYKA 4LL4B 1X9WB 1FO5A 4JZQA 2X8TA 3IHQA 3WMZA 2H1BA 3Q19A 2XQRA 4K9ZA 2G0FA 3I9V2 1GTUA 2I1UA 3F4RA 1JZDA 2GT6A 3LXZA 1Z6NA 4O8PA 3F8UA 1ZYEA 5ELAA 2A2RA 4XS4B 3AKIA 1AQVA 4L0UA 1A0RP 3NIVA 3C7EA 4POMA 3ZIVA 4YQUA 3RWKX 5F07A 3FKFA 4EXJA 3BJ5A 3ZFLA 1JFUA 1VKDA 1PL2A 3L4NA 3HVVA 2QC7A 2VL2C 4EL1A 3WPUA 1IYIA 4LMWA 4BPYA 2L4CA 4MH2A 4KGIA 5G31A 5DAKB 2KP2A 1A23A 5L71A 1RK4A 4HS1A 1K0DA 4UDIA 3EYTA 4AK6A 2WRTA 4PVAA 2PMTA 1RQMA 3EURA 3ZRDA 1AQWA 3HDCA 3J7Yk 2HRFA 3TB2A 3TJKA 4G19A 2WGRA 5HR3A 3G7IA 4I97A 5ECIB 4MA9A 2K9FA 1OC8A 3D60A 4IP1A 1K0BA 1TI3A 2R4VA 3KMNA 1OAZA 5JWRB 1THOA 2VUPA 2H8LA 3UVHA 2HZEA 4WXTA 2FD3A 5FKCA 4TR0A 2GLRA 2E7PA 4HQZA 4N4BA 1GYEB 3Q6OA 5ECPB 1M9AA 5HFGA 5CRHA 3CSJA 1FAAA 5GSTA 4OFMA 1GSQA 2NTOA 4L0WA 1M0UA 4HI7A 2V41A 1XW9A 4ML6A 7GSSA 4F0BA 5D93A 2PGTA 5ECNB 1Y9MA 2HXKA 3E0UA 1FVJA 3HD5A 3SWLA 5J9CA 3O76A 4K0NA 5ECLB 3GHAA 4K8MA 1OKTA 3TKSE 2VD1A 2DJ0A 3HJMA 3M0FA 4GSSA 4ZXGA 3VWVA 2YFRA 2C8UA 3AKFA 6GSYA 5AGYA 19GSA 2K8SA 3D5ZA 3KD0A 2VL2A 3QPMA 1FW1A 3GIXA 3DMLA 2IFQA 1Z9HA 2H30A 5JWOB 4J2FA 2DJKA 4FFFA 2LKUA 5B8BA 5HR2A 1EV9A 1K3LA 2JSYA 4TKYA 1X9SB 4HU7A 4X43A 3P90A 2VCXA 5J3RA 2CX3A 4ULXA 1PKZA 2GDRA 1V2AA 1K0MA 3KJYA 3APQA 2DJ1A 2VAFA 2AAWA 2L57A 3F6DA 2B6MA 1V98A 5CRWA 3MSZA 2MYGA 4N10A 2LNTA 1OKDA 1YJ6A 5J41A 3ED3A 2OADA 4KDUA 1TU7A 2WCIA 1QMVA 3HHVA 2X64A 3FZ5A 5CAXA 1QFNA 1VF4A 4ZB8A 4Q5FA 2IMDA 3GURA 4G10A 3HA9A 1SMPI 1T00A 1A2LA 1SJZA 1Z5YE 3PR8A 1B4QA 3H93A 2ZUPA 2OA7A 4O8OA 3IV4A 1IYHA 4EDYA 3V1WA 2HFDA 4I6XA 3DVXA 1J08A 3QD9A 1SKSB 3TKSC 2TIRA 2EIQA 2M72A 3KP9A 2ADEA 2R37A 2EIOA 1H4OA 1AQXA 2X8FA 5FLWA 2QKEA 3FK8A 1JZWA 2PWJA 3M1GA 4G9HA 17GSA 2PPTA 1YIFA 4CDOA 3APOA 1O85A 1V57A 2B5XA 5B6SA 2GZZA 5ECHB 3TJGA 1MDKA 1ZOFA 2B1KA 3ZMLA 3L9VA 1GSYA 5CNWA 1ACVA 3P8WA 3F0IA 2OJLA 4MZCA 3QAWA 2H1DA 3IXRA 3GRXA 3HCZA 1NW2A 3CSIA 5CRDA 3TGZA 3RHBA 5HFKA 2AEZA 1T4YA 3EMPA 3LEMA 3TCOA 3HY2A 1F9MA 4IHUA 3TKQA 2MMOA 2GS3A 3WN0A 1GLPA 1HYUA 3BYJA 1PGTA 3LFLA 3ZVJA 4E8HA 2PU9C 2HT9A 3UIWA 4KC8A 2YZUA 3Q18A 2E2MA 4TW5A 4L5LA 2DMMA 1HNAA 4UDGA 1M2AA 3WAUA 2WB9A 3LWAA 1Y4WA 2YFSA 5LD0A 1T4ZA 4IP6A 4N30A 2FWFA 2GSTA 3U6VA 1B4PA 2YPMA 3VWWA 3VWUA 1YZXA 3GL3A 3WGDA 4OO5A 3UJ1A 4YQVA 4KSMA 4DSQA 4U6DA 2GSQA 2CAQA 4TXOB 3M3MA 1PD21 3LQ7A 3C2UA 3VURA 2H74A 2J9HA 1I9DA 1SL0B 3SC7X 1C72A 3WATA 4K1FA 3D21A 14GSA 1TRWA 1PSQA 2VCTA 3TKSA 5F8BA 4KCBA 4JR4A 2WJUA 18GSA 3IAS2 2B3SA 4LMVA 2AUVA 5HR0A 2IN3A 2C3QA 1X0RA 4QQ7A 1SYXA 1DE1A 5A4WA 1ILOA 3GTUB 1NHOA 1V40A 2OBIA 4NPBA 3UGGA 1ST9A 2XC2A 3IDVA 4WETA 4HJMA 4Q5QA 4ZB9A 3W8SA 3IAM2 1Y7BA 1YF0A 1SENA 3NOFA 1ST8A 3KH9A 3UGFA 4OFTA 2K8VA 3PH9A 1TK8B 4YQMA 3OM5A 3DVWA 4V2LA 2AHEA 3BYKA 2I81A 3D4MA 3ERWA 9GSSA 2H75A 1HQOA 3W6GA 1R26A 2H01A 2N5FA 2WS2A 5EL8A 5FIXA 5A5KA 2F9SA 3H79A 5ID2A 2V32A 4MCUA 3EVIA 3LV4A 3WPVA 2MMAA 5GLKA 2G2QA 4EQVA 1YEXA 2B5YA 2OXBA 1R7HA 2E2GA 2P0GA 3TRXA 1EP8A 4YAPA 2CV4A 1XVQA 4GSTA 1G7EA 1LBKA 1XOAA 5ENUA 4Z7XA 3CRUA 3M8NA 1GUMA 2DIYA 3I43A 1Z7PA 4EF0A 3S9FA 4N0VA 3VPTA 1WE0A 2C0EA 4JR6A 2WFCA 2REMA 5DALA 5J9BA 3IRAA 4ZL7A 3EU4A 2ALBA 5ECKB 3KEBA 1ERTA 4KA0A 5DCGA 4ACSA 5IOWA 4IS0A 5DQSA 3IPZA 4EO3A 4HU9A 4J56E 4TR1B 2V6OA 1M7TA 3C1SA 2Z9SA 3BD2A 2OKAA 1ERUA 1JIWI 5ANNA 2E0QA 1TP9A 1DUGA 5ECRB 4PGTA 11GSA 4F0CA 4IVFA 1VF1A 4MMMA 2FY6A 2N5AA 2KHPA 2YCDA 4OMVA 4MJEA 2WDUA 4IN0A 2ADDA 3G7JA 3QFAC 1TRVA 2V2GA 3ZMKA 5IPHA 1UYPA 1GSFA 3CU9A 2C4JA 1UN2A 1TRSA 1KTEA 2YN1A 1K0AA 2CA8A 3TJBA 5KN1A 5AY9A 4HDEA 3CMIA 4FYBA 4D47A 4D73A 1YQ1A 2XHFA 4MJAA 4IJ3A 4F2IA 4LL1B 3WASA 1YRZA 4L8EA 1JLVA 2B7JA 3NQHA 1TXXA 3A2VA 1V9WA 1WIKA 2YJ7A 2ON7A 3F9UA 3KXOA 2JZSA 5HQPA 2YOIA 2EXJA 3HXSA 4PVIA 1E6BA 4KSOA 2MBTA 2C80A 3H4KA 3WGEA 4PUFC 3E9JB 2H76A 2PVOC 4JEDA 1HNBA 1TRUA 1FG4A 3CTGA 4AJ8A 3LIHA 3ZVJD 3LJRA 3OM2A 3P2AA 3US3A 5H5QA 5IIZA 5AYEA 4O7HA 4MJCA 1TK0B 3QDNA 4NHWA 1WPIA 4HQSA 1UA5A 2MBSA 3VI7A 4FFIA 3IBHA 1M99A 3WT1A 2H0IA 3DIEA 4IBPA 1ZCPA 4BA7A 4OD7A 2PBJA 5A4UA 3R67A 1WOUA 5DDLA 4ZBAA 2IMIA 4MPFA 4V2MA 1WL7A 4OO4A 5AISA 1VF3A 3RHCA 1BX9A 4NOVA 2O85A 1QK8A 3LDRA 1B9XC 3RAZA 3KM6A 3TKRA 1X9MB 5GLQA 1OYJA 3WD6A 2P5RA 1KEBA 3APSA 5HR1A 4I5QA 1GUHA 3RPNA 4HUAA 4X1UA 5F06A 1F3BA 4KW6A 3MDKA 2HLSA 1VRSD 1DBYA 1WP0A 2QQVA 3UEMA 1KNGA 4ID0A 1ERVA 4WBJA 5CREA 3M9JA 4ZB6A 3OM4A 5AYDA 5IO2A 3D5YA 3VPQA 4WF4A 1A8YA 1N8JA 4DSRA 2DIZA 4N11A 2H0GA 2I3YA 1W2TA 4PNFA 5JOWA 1PQNA 2PN8A 4HOJA 3FEUA 3QAGA 3EC3A 4CHSA 3C71A 1F6MC 2GSSA 5JCWA 1U87A 5IMFA 2L6CA 1YY7A 3QEFA 2LQOA 1EGOA 2KOKA 4J57E 5H5SA 1GL8A 2FCHA 2GVPA 3ZTLA 3DRNA 3A3TA 2MMZA 1TTZA 1XOBA 3TOUA 2JSZA 1GYHA 2RLIA 2VM2A 4HEA2 3HJPA 4KCAA 2TRXA 4WBRD 3D6IA 1GSUA 3ZFBA 2I4AA 1SD8A 4TXVA 3GL5A 1FB0A 2L4QA 1OVNA 2GGTA 3FW2A 1EOHA 3GSTA 1HD2A 3IC4A 1YKCA 4ILFA 4I8BA 3GA4A 4XS4A 1ZMAA 3C7MA 3J7Yb 2FWEA 4KC7A 3ZIJA 1YEPA 4RUVA 3TJFA 4FH8A 3VI5A 2VLVA 2ZNMA 4XRDA 2AC1A 1R5AA 4HJ2A 5LNKe 4IW9A 3A2WA 3GX8A 1S3DA 1BAYA 3BCIA 2LRCA 2OE3A 3O3TA 5ECQB 3NZNA 4MF6A 3K8NA 3C7FA 5DAKA 2D2ZA 5IQYA 5J4UA 2FWHA 3ZXKA 4EDZA 1PN9A 2GTUA 4O32A 5GLPA 2LRTA 3IR4A 1Z3EA 2C0DA 5FKBA 4NAXA 5D8IA 1GTBA 3KH7A 1YKAA 1B8XA 1YDKA 4ZILA 2YWOA 3WN2A 3TKPA 1VF2A 1JLWA 2F8FA 1TKDB 2B4WA 4NHZA 3C7OA 3HKRA 3A5WA 3GFKA 3QC2A 3P7XA 4O92A 6GSVA 1U88A 4MF5A 3C73A 4PQ1A 2B5EA 5B8AA 5IOXA 2WULA 5GLNA 3TRQA 5CRGA 4F03A 1TW9A 3UGHA 3KZQA 3A2XA 4H86A 3OM7A 3GMFA 3H1NA 1K0OA 3GH6A 3GSSA 1BQ7A 1XCCA 2JU5A 4KCEA 4IGJA 2YWIA 3QMXA 5IO0A 1O6JA 1JZOA 5C0PA 5FHIA 1MDIA 5JCUA 1USBA 2EC4A 4KDYA 4IQAA 4XS1A 2HSHA 3N5OA 2M46A 3WMYA 4BVYA 3C8EA 5EVOA 3LGCA 1TU8A 3BYLA 4AF2A 4FYCA 4K2DA 4EKZA 5JWQB 3VT1A 1ABAA 2DMLA 4NV5A 3F4SA 3VSSA 5AN1A 5J5NA 4EE0A 5A8DA 1MDJA 5G1LA 2OE1A 3UBKA 3M9KA 1FVKA 1Q98A 1R5PA 4PUAA 2RM5A 2YV9A 3FR6A 5JOZA 1OE7A 2FLSA 2VLTA 1M9BA 3LG6A 2VL3A 1TOFA 5IMDA 2IMKA 4COTA 4NV2A 1X5DA 3JCML 2DBCA 2LTKA 3C1RA 2AB6A 3VSZA 1PMTA 3FY7A 10GSA 5JOXA 4PXOA 1O8WA 4CW9A 3LIGA 2C0GA 1R4WA 4FYUA 1OE8A 2CVKA 2CVDA 2LRNA 1NM3A 1EWXA 4IKHA 4LLRA 3WGXA 3I6AA 3ZXJA 1EZKA 1ZYQB 4MZWA 5A7VB 4X0XA 3WPYA 1RW1A 4K7NA 4MK3A 4XRAA 1T1VA 4FFGA 2L5OA 3UVTA 4GCIA 1Y6EA 5H5RA 5CO3A 5AIVA 1A8LA 2C3TA 3DD3A 2OBKA 4PX1A 5LCZA 1JHBA 4QL7A 5ABRA 3VK9A 2YWNA 3GN3A 4AJ6A 3QEDA 1GSSA 3GKMA 2C0FA 4TOPA 2LUSA 4N1IA 5HFIA 5D9TA 2QSIA 1DE2A 3QZ4A 4HZ4A 5GAND 4DSSB 2YWMA 2AJQB 3ZYWA 4K7OA 4G2EA 2VCWA 4GWRA 1B9YC 2I9HA 4WR5A 1SKRB 1SJ6A 3VSFA 1A2JA 16GSA 6GSXA 2A4VA 1GWCA 5G1KA 4Q5RA 2IWTA 2EXHA 4BL7A 3QEEA 3QFBC 2LSTA 1JZRA 2A2SA 2RUFA 3LYPA 4YH2A 5DVBA 1W18A 1DSBA 2X8SA 4E8EA 2H70A 4POBA 2ON5A 1QXHA 1CQGA 3E3EA 1A2MA 1M2DA 2VCVA 2O7KA 3ZXLA 3TJJA 2YP6A 5JOYA 4HZ2A 13GSA 4MJBA 2YNXA 2NDOA 3ERFA 1PX7A 3HVXA 1QGVA 2VDTA 4ECCA 2CT6A 4RI7A 1TK5B 5AYCA 2F8AA 1J9BA 5FMCA 4POLA 2LEGA 3PIGA 3GNJA 3UOMA 5EY6A 4TXOA 4XCSA 2GZYA 4V2NA 4IJIA 1U3AA 5DCHA 2M80A 22GSA 4V1Ap 1EOGA 1T3BA 2GQKA 1ZGNA 2K18A 2R5GA 1WWJA 3ZL5A 2X99A 2H1AA 4RI6A 3ZREA 2DSAA 4XTSA 3DKSA 3KTBA 1TI1A 5D96A 3QOUA 3KF3A 2XPDA 2JL4A 3GTUA 3ZLPA 3ZZXA 3EINA 1V58A 2H72A 1SL2B 5IPGA 3RPPA 5FK8A 2J23A 3FZ9A 1KBNA 2HZEB 2R6KA 4OFNA 4KE3A 1XW6A 1J0FA 4OWYA 2F3MA 3VT2A 3LEFA 1ERWA 2NVLA 8GSSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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