3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
1E1NA 1BF3A 1DOEA 1GERA 3PVCA 4H2QA 1EBDA 4AOXA 3RP7A 1EL8A 2BK5A 2R9ZA 2TPRA 4IA6A 1GEUA 3UKAA 3GYJA 5KOWA 3Q9TA 2YM2A 1F8SA 3M0OA 5JCIA 2WOWA 1H81A 5JCNA 2C72A 4J31A 5M0ZA 3R9UA 4Z43A 5DBJA 5J60A 4EIPA 1PHHA 3UP5A 3ALJA 2V3BA 4EQWA 3AE4A 2GAGB 1DJNA 4FK1C 3ADAB 2GVCA 2A87A 2FJAA 2R46A 4BJZA 3EF6A 1VG0A 4J57A 1NENA 3OC4A 4H7UA 3P4RA 1PBFA 3GYIA 1CHUA 1BGNA 3IC9A 3DMEA 4TLZA 4AOSA 3KKJA 1DOBA 1FEAA 1VDCA 3L1RA 3LZWA 1PJ6A 3AYJA 1NHRA 3LOVA 1EL9A 1IUTA 1RSGA 3AE8A 2Y6QA 1OJAA 3NYCA 4O5UA 1E1LA 1GRAA 2X8GA 1GRTA 4ICYA 4B66A 4HB9A 5IPYA 1L0VA 5HY5A 1B8SA 4IV9A 1PXCA 4WCTA 3KPFA 1F6MA 3UTEA 4FX9A 3AE1A 1CJ2A 4N9XA 2ZBWA 4C77A 1YKJA 2BS2A 2WP6A 3SFDA 1BGJA 5FS9A 1VQWA 3VQRA 1CJCA 2XYOA 2OAMA 3PO7A 1ZDLA 4Z24A 3I3LA 1V59A 2WESA 1EL5A 3UKLA 4U8OA 4C3YA 3AE6A 3ITJA 4OPTA 1PBCA 4U8PA 2VQBA 3AB1A 1X31B 4H4PA 2BS3A 3H8LA 3CGBA 3P4PA 4B68A 3EANA 3UP4A 4C3XA 1GRHA 3CPJG 1DJQA 4A65A 2VVLA 1MO9A 2GH5A 3FMWA 3II4A 2Q0LA 1FOHA 3RP8A 4H2PA 1PN0A 1P2EA 2ACZA 3GRSA 1KNPA 1N1PA 5KVHA 2FBWA 2JB2A 4Y4NA 3UTFA 4GF7A 3CPHG 3CNPA 2B76A 3P4QA 3VR8A 4X9NA 3AD9B 4J33A 4K5SA 1EL7A 1CJ3A 2XVEA 4X4JA 1QJDA 4U8MA 4K2XA 1GXFA 2YLXA 3CGEA 1TYTA 3RP6A 2B9WA 2WHDA 3LXDA 1KFYA 2TMDA 2Q0KA 2AR8A 4IVOB 1JRYA 2OALA 1D5TA 3SGLA 3QFBA 4CY8A 1XPQA 4D04A 2WDRA 1NHQA 3EPTA 2JK6A 2WU5A 2C76A 4B67A 1KF6A 2C67A 3COXA 2YM1A 3G5QA 2VVMA 1N4UA 1LPFA 1GNDA 2R4JA 3ALLA 4FK1A 1D7LA 2GB0A 2IVDA 4YSZA 2C3CA 4Z2RA 4JDRA 3SFEA 3QSEA 1GT8A 4CBQA 2CVJA 4IVMB 1PJ5A 4NZHA 2BCGG 1TDKA 1XDIA 2BCPA 1XANA 4NEVA 4AT2A 5GRTA 2RGJA 4OPCA 4U8LA 3IWAA 2YG6A 3K7MX 2RABA 2QA1A 1D4CA 3C96A 2YVFA 4B65A 2O9ZA 5BUKA 3AECA 4CNKA 3G5SA 4D03A 4APNA 2R4EA 2XFQA 4J34A 3GMBA 2IVEA 2R0PA 4OPGA 2GEWA 2E1MA 2VOUA 2XFOA 4JQ9A 1VRQB 5IQ4A 3AEGA 1KNRA 3GSIA 1PS9A 2E4GA 2B9YA 2OLOA 2QAEA 3NYFA 1Y0PA 1GALA 4YTNA 4EM3A 1H82A 3REDA 3UTGA 1ZKQA 4AP1A 1KSSA 2XLTA 4LIIA 3UTHA 2BYBA 5IQ1A 2BACA 3SQPA 4OPUA 4GRTA 3M13A 1ELIA 2BABA 2YLZA 2WOVA 4TM0A 2ZZ0A 1LQUA 1PDHA 1NDAA 1ZMDA 4H2NA 1IUUA 4ZN0A 2GRTA 3AE5A 4GDPA 4TLXA 5J7XA 1LVLA 3QVPA 2XLUA 4Z2TA 2XLPA 1H83A 4HA6A 1S2YA 4KPRA 2I0ZA 2W0HA 3K7TA 2VVLG 1E1MA 2ZZCA 1IJHA 1S3BA 1Y56A 1CC2A 4LA1A 2BK4A 4A6NA 4CY6A 1S2QA 4YKGA 3NLCA 4EM4A 2B7RA 4DNAA 4GUVA 3V3NA 2DKIA 2FJEA 2NPXA 5KOXA 1DODA 4K5RA 1CC6A 1B4VA 3CN8A 1L9DA 3S61A 4C74A 5KRQA 3AXBA 3HZLA 2EQ9A 4M52A 4Z25A 4NTEA 1GTHA 4JN9A 1H84A 2V6OA 4CCQA 4U2SA 2WETA 2WPFA 5BVAA 1CJ4A 1N4WA 2ZZBA 1OJCA 4YWOA 5KVIA 2WP5A 3CNSA 3DJEA 3VRDB 4ADWA 2GAHB 2YG4A 4UDQA 3WE0A 5C3JA 2YLRA 1COYA 2WPEA 3VRAA 3AWIA 2YWLA 4BK3A 2EQ7A 2A89A 3FPZA 3T37A 3FG2P 3AE9A 3AEAA 2GR2A 2OLNA 3FIMB 3DK9A 4JNQA 3UKHA 2VRLA 3URHA 4B63A 2E5VA 2XFPA 1B5QA 3AEDA 3F8PA 2BC1A 4YXDA 4K7ZA 3RNMA 1GV4A 1M6IA 4DSHA 4NTDA 3AD8B 4U2LA 1GRBA 4XWRA 4EMIA 2YR6A 1FECA 3AEBA 3LZXA 1D7YA 4EQXA 4U8IA 4B64A 1PBEA 2QCUA 1W4XA 3GDPA 2V61A 1Y56B 4A6NB 1E39A 1NPXA 1KSUA 4U2TA 1LJ1A 2JB1A 2XVIA 1N4VA 1GTEA 1ZOVA 4A7AA 1PJ7A 2R0CA 2X50A 2VQ7A 3NH3X 2X8HA 3C4NA 2C7GA 1ZX9A 3VRBA 3ATRA 5GSNA 1H7WA 3V3OA 1L9CA 1OJDA 1PXAA 2C66A 4U8NA 2WDVA 4REKA 3IHGA 3DJGX 4DGKA 3QSSA 1K4QA 1CBOA 5JCMA 3KLJA 3NT6A 4JNAA 4J56A 2BXSA 5KWFA 2GV8A 3F8DA 2V60A 3QSMA 1TRBA 4CCRA 3KVEA 2CDUA 4ZCCA 4I59A 2YG3A 1TDEA 1QLBA 5FS6A 2C75A 3BNUA 3AE7A 3M12A 4NEWA 2YAUA 5EB5A 3DJDA 2RGHA 4PABA 4DSGA 3LB8A 2XLSA 3CNJA 1O94A 1MXTA 3UOXA 3LJPA 1IUXA 2JAEA 1M64A 3PS9A 2C64A 1K0JA 3ABVA 1ZP0A 2F5ZA 1OJ9A 5HXIA 1F8WA 1JNZA 2XCGA 2YG7A 1TYPA 2Z5XA 3NGCX 1DXLA 2FJDA 3QVRA 3F8RA 5CQFA 2VRMA 4OCGA 1Z6LA 3AE3A 1O95A 4TM3A 5EOWA 1B37A 4EIQA 2XLRA 4RG4A 2GQFA 3UKFA 3NN6X 3ALMA 5FMHA 2X99A 1K0IA 1MOKA 3DJJA 1GREA 4U8JA 3VR9A 3GDNA 3P9UA 3RHAA 1Q1RA 1TDFA 3GD4A 1LV0A 2B9XA 3UOVA 4JY3A 1UKVG 3L8KA 3K30A 4H4ZA 1IUWA 3NRNA 4USQA 5FS7A 2DKHA 3LADA 1JRZA 2PHHA 4GCMA 2Y6RA 2NVKX 2WEUA 4Z44A 2CULA 1P2HA 1YQ3A 4YSHA 5CKUA 4K8DA 1JOAA 4YTMA 3H4KA 1REOA 3CGCA 3DGHA 3V76A 1PXBA 4H4YA 3UCLA 2R45A 2Z5YA 4E0VA 5BULA 4YSYA 3O0HA 1Q1WA 5HYMA 1DOCA 1LTXR 3OZ2A 3NG7X 5HHFA 2WOIA 5JCLA 2XVFA 5U63A 4BJYA 3GMCA 4KX6A 2X3NA 2UZZA 1FL2A 2XDOA 4BURA 4GR1A 4TM4A 2CFYA 3G5RA 1CL0A 1GETA 3BI2A 5U1OA 5FS8A 4FDCB 5EB4A 4H2RA 3BHFA 3NK2X 4LU6A 1OJTA 3IHMA 4YTPA 4H4VA 2V5ZA 1LQTA 4H50A 3GD3A 1FCDA 1IUVA 3AE2A 3GWDA 4H4QA 2H89A 3AYLA 4XXGA 2BA9A 2XVJA 1GESA 1BWCA 3AEEA 2Q6UA 1JU2A 4OPIA 3JSKA 3P4SA 4I58A 3CPIG 3CTYA 1H6VA 3UKPA 3NN0X 3NK0X 3UOZA 3QFAA 2EQ6A 3BI5A 4H4RA 3D1CA 4USRA 4BK2A 2IIDA 3H8IA 4O5QA 1E7PA 2WPCA 2YLWA 1D4EA 1GPEA 3KA7A 1GSNA 1NAAA 4PAAA 1AOGA 2GMJA 1O5WA 3P1WA 2A8XA 2ARDA 4H4XA 4RSLA 4XWZA 3AYIA 4WX1A 2V3AA 3B6DA 4AT0A 3UOYA 3Q6JA 4OPDA 2AQJA 2WS3A 1FEBA 2H88A 3NTDA 5BRTA 5TR3A 4NTCA 2WQYA 4X9MA 4Z26A 2WU2A 2R0GA 1JRXA 2GMHA 1K0LA 1E1KA 2GR3A 1S3EA 2GF3A 1NHSA 2BC0A 2QA2A 2YR5A 4EMJA 1BKWA 5JCKA 2AAQA 4Y4LA 2YVJA 3ATQA 2YLSA 2YG5A 4Z2UA 2X8CA 4U8KA 3CIRA 3DGZA 2GQWA 3NHOX 3I6DA 5U25A 1YY5A 4YKFA 2VZ2A 1F3PA 1NHPA 3GWFA 3QJ4A 4Y4MA 1HYUA 2J3NA 2YLTA 1XHCA 4H4SA 1SEZA 4J36A 3KD9A 3NKSA 2YQUA 3DK8A 1TDOA 2C73A 4ECHA 2B7SA 3GRTA 1F8RA 3NYEA 1PBBA 4RG3A 1DNCA 1E6EA 4H4UA 1ONFA 3E1TA 2XFUA 1JEHA 2JB3A 3BI4A 4P9SA 5C2TA 1ZMCA 2WP9A 4A99A 1ZK7A 3ZDNA 4EQRA 3NTAA 1H86A 4OPLA 4EMWA 1KDGA 4UDRA 3AD7B 4TM1A 2EQ8A 2WDQA 3NK1X 3S5WA 5EBKA 2YVGA 1ZY8A 4B69A 1CC4A 2GR0A 3DA1A 2C65A 3BHKA 3CNDA 4UDPA 1GRGA 2XVHA 3C4AA 3UKQA 4H4WA 3NIXA 1RYIA 3ZYXA 4A9WA 3SM8A 4MJWA 1NEKA 1RP0A 5LV9A 5KXJA 4EQSA 1D4DA 1L9EA 3ICSA 1YQZA 1YQ4A 3NNEA 3UKKA 4UP3A 1NG3A 3DK4A 1TDNA 3ICRA 2FJBA 3EAOA 1QO8A 1PBDA 4YSXA 4CNJA 4A79A 3IF9A 4H4TA 2YR4A 3D8XA 2JBVA 2OA1A 2BS4A 2C3DA 5ER0A 3CNTA 4AP3A 1JNRA 2GR1A 2BK3A 4C5OA 4OVIA 1Q9IA 3KU9A 5L46A 2WBAA 3DH9A 4GDEA 1IUSA 4J2WA 1ZOYA 3K7QX 4JY2A 2BXRA 4YT0A 4BK1A 5M10A 3ICTA 2Q7VA 3BNMA 1BZLA 3FBSA 3ISHA 1GOSA 1GRFA 1NG4A 2XFNA 3B3RA 1H7XA 4IA5A 1VG9A 2JKCA 4BV6A 3AEFA 2HQMA 4A5LA 4ZCDA 4K22A 2RGOA 2PYXA 2C70A 3CGDA 4CRTA 4B1BA 1CF3A 2APGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BF3A 5HR1A 1GERA 4D73B 4O5RA 1OC8A 4Q5FA 1EEMA 4MJBA 1LJRA 3C73A 2AV4A 4F0BA 3Q9TA 1NSWA 2GSTA 1H81A 1A8YA 3BJ5A 5M0ZA 2I9HA 5HFGA 3ALJA 2JSZA 3GH9A 2PVQA 2GAGB 4FK1C 1B9YC 3U5RE 3NZNA 4KX4A 4ZB8A 2A87A 3RHCA 1U6TA 4J57A 3I9V2 4NWYA 3DMEA 3G7YA 20GSA 4IQAA 3LZWA 1NHYA 3AYJA 1IUTA 1E1LA 2MMZA 3ZYWA 1X5DA 5IPYA 3LGCA 4G9KA 4IV9A 4WCTA 1F6MA 3UTEA 4FX9A 3LYKA 4N9XA 2ZBWA 4C77A 2BS2A 3EMXA 1BGJA 5FS9A 4KDUA 3E9JB 2OAMA 3PO7A 1ZDLA 4MJCA 5B7CA 3I3LA 4YJHB 2C0GA 1X31B 3SBCA 1FHEA 1M9BA 2CVKA 3PPUA 4B68A 3UP4A 4I6XA 2DJ1A 2CZ2A 4I8BA 2OACA 3FMWA 3QD9A 1OKDA 2VOCA 1V2AA 1JFUA 2WS2A 1P2EA 4II3A 1N1PA 2M46A 4G10A 2FBWA 3ZIJA 3UTFA 4GF7A 2VLVA 4JR6A 2XVEA 4U8MA 2X4AA 3CRUA 1GXFA 2YLXA 3CGEA 2D2ZA 3D4MA 4F2IA 2AR8A 1FVJA 1JRYA 2H66A 3PH9A 3QFBA 2O7KA 1NHQA 3EPTA 4JZQA 4KCAA 3EU3A 1GWCA 2YM1A 2PGTA 4PQIA 4KCEA 1W89A 4WETA 5IPHA 1D7LA 2GB0A 1TDIA 2IVDA 4YQUA 2LUSA 3SFEA 1AQVA 1YDKA 3ZNPA 1A23A 2A2PA 2MMAA 1A2LA 2GQMA 2BCPA 2YN1A 2VCVA 2E0QA 3KM6A 4GSNA 5EL8A 4EL1A 2RGJA 5GRTA 4U8LA 4EO3A 3UJ1A 2OJLA 4WR5A 2BMXA 2QA1A 3CSHA 3C96A 3FYGA 4Z7XA 3KPKA 2FLSA 3FKFA 4APNA 2GDRA 2H74A 4LMWA 3W8JA 1TI3A 3GMBA 4YJDA 2F9SA 1TOFA 1HNBA 4N11A 3IAS2 1KEBA 2OLOA 3FR6A 3LEFA 4HJ2A 5F07A 2H6YA 5DALA 3UTGA 2XLTA 1HNCA 5D8IA 4CW9A 2WULA 2E4AA 2ZZ0A 2LKUA 1LQUA 1ZMDA 1IUUA 3AE5A 2IFQB 4ZBAA 3GKKA 1E2YA 1ZCPA 4G74A 2XLUA 4Z2TA 1H83A 4YJFA 4Q5QA 3HVNA 1EOGA 1S2YA 2V41A 2I0ZA 2W0HA 3K7TA 4OWYA 2VVLG 2B5XA 3PINA 1IJHA 1S3BA 3K8NA 4CY6A 4DNAA 3VPQA 4RI6A 6GSXA 1DODA 13GSA 1OKTA 2FGXA 2VAFA 2VL2C 4MZCA 4PTSA 2NPXA 4OCEA 1EGRA 2VCXA 3AXBA 1YF0A 3HZLA 1XPVA 4Z25A 5G2ZA 4NTEA 3TB2A 4ULXA 5BVAA 1CJ4A 1AW9A 1N4WA 1OJCA 4V2MA 5KVIA 2WP5A 5A5KA 1F9MA 1MD4A 3KMNA 2YLRA 1Y25A 3GTUA 1T00A 2YWLA 3H93A 2C4JA 2A89A 2IMEA 5D9TA 3GYXA 3FIMB 1YEXA 4PQ1A 4B63A 5C00A 3AEDA 4G2EA 4NTDA 5ECLB 3WT2A 3LZXA 1AUCA 4U8IA 1ERVA 6GSTA 2V61A 2FWFA 1NPXA 5CRWA 4U2TA 3A2WA 2JB1A 2ON7A 1N4VA 2XVIA 2FUG2 5G1LA 2X50A 5ECHB 3ME7A 3GX8A 2VCQA 1XVQA 5GSNA 3HVVA 1BAYA 1H7WA 3FZ9A 1OJDA 1PXAA 1AQWA 3IHGA 2MYGA 3C71A 1GSQA 5J3RA 2AJQB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BF3 A;  5HR1 A;  1GER A;  4D73 B;  4O5R A;  1OC8 A;  4Q5F A;  1EEM A;  4MJB A;  1LJR A;  3C73 A;  2AV4 A;  4F0B A;  3Q9T A;  1NSW A;  2GST A;  1H81 A;  1A8Y A;  3BJ5 A;  5M0Z A;  2I9H A;  5HFG A;  3ALJ A;  2JSZ A;  3GH9 A;  2PVQ A;  2GAG B;  4FK1 C;  1B9Y C;  3U5R E;  3NZN A;  4KX4 A;  4ZB8 A;  2A87 A;  3RHC A;  1U6T A;  4J57 A;  3I9V 2;  4NWY A;  3DME A;  3G7Y A;  20GS A;  4IQA A;  3LZW A;  1NHY A;  3AYJ A;  1IUT A;  1E1L A;  2MMZ A;  3ZYW A;  1X5D A;  5IPY A;  3LGC A;  4G9K A;  4IV9 A;  4WCT A;  1F6M A;  3UTE A;  4FX9 A;  3LYK A;  4N9X A;  2ZBW A;  4C77 A;  2BS2 A;  3EMX A;  1BGJ A;  5FS9 A;  4KDU A;  3E9J B;  2OAM A;  3PO7 A;  1ZDL A;  4MJC A;  5B7C A;  3I3L A;  4YJH B;  2C0G A;  1X31 B;  3SBC A;  1FHE A;  1M9B A;  2CVK A;  3PPU A;  4B68 A;  3UP4 A;  4I6X A;  2DJ1 A;  2CZ2 A;  4I8B A;  2OAC A;  3FMW A;  3QD9 A;  1OKD A;  2VOC A;  1V2A A;  1JFU A;  2WS2 A;  1P2E A;  4II3 A;  1N1P A;  2M46 A;  4G10 A;  2FBW A;  3ZIJ A;  3UTF A;  4GF7 A;  2VLV A;  4JR6 A;  2XVE A;  4U8M A;  2X4A A;  3CRU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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