3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
3UKAA 3D8XA 1S2QA 2E1MA 2V60A 3F8DA 2R46A 3BI4A 1FECA 4H50A 4N9XA 2Q7VA 3Q6JA 3ICSA 1RYIA 3NHOX 4J34A 4H4TA 5FS6A 2A8XA 4J57A 1REOA 1MXTA 2NVKX 2GMJA 4UDPA 4BK3A 2JB1A 2XLUA 2YG4A 5FS9A 2WPFA 2VQ7A 3ALJA 1GSNA 4UDQA 2DKHA 2V5ZA 3UP4A 5M10A 1GALA 3EF6A 2APGA 3ABVA 5JCLA 2XDOA 2GR0A 2BK5A 1VDCA 4XWRA 1DOEA 1CC6A 3NKSA 2XYOA 4P9SA 4GDEA 3CTYA 2X3NA 2AQJA 3UP5A 2JAEA 3DJDA 2B9YA 2CDUA 2GB0A 2EQ8A 4YXDA 4FK1C 3OC4A 4OPLA 2WESA 3UKLA 1MOKA 4EM4A 1DOCA 2XFQA 2C7GA 1HYUA 1GV4A 5HYMA 1H6VA 2VRMA 2WQYA 2BXSA 4C5OA 3I3LA 3FMWA 2IVEA 3AXBA 3UCLA 3K7MX 4IA5A 4GF7A 3P4QA 4J36A 4NTCA 4EIQA 4Z2UA 1V59A 5KWFA 3NYFA 1IUWA 1W4XA 2VVMA 1PHHA 3IHGA 1H7WA 1TDKA 3AE6A 3KKJA 1L9CA 3UTEA 2GH5A 3DJJA 4A6NA 2ZZCA 3G5QA 2YLZA 2XFPA 3UTGA 4YTMA 2X8GA 1NHQA 1GOSA 3NN0X 3CPIG 4UDRA 2WDVA 4B67A 4EIPA 2A89A 3ICTA 4J31A 2GF3A 1B4VA 3CNJA 4K2XA 4Y4MA 4A7AA 1CJ4A 3ATRA 4GDPA 3AD8B 3QFAA 4GCMA 4H4WA 1YY5A 2WETA 3VRAA 2R4EA 4TLZA 1CF3A 3K7TA 4Y4NA 1ZP0A 4WX1A 3B3RA 1O94A 4D03A 1B5QA 2BA9A 1PJ7A 2AAQA 1EL7A 1K4QA 2OLOA 3ISHA 2GQFA 5EB4A 5FS8A 4C77A 2ZZ0A 3SFEA 4AP1A 1OJCA 2YR4A 1ZOYA 2EQ7A 3KVEA 4CY8A 2BYBA 3GDPA 3P1WA 4EMWA 4NZHA 3P4PA 4JY3A 1GRFA 4USQA 4LIIA 3ZDNA 3KU9A 1NG4A 1JU2A 2WPEA 3FIMB 1COYA 1N1PA 3CIRA 3NK2X 3T37A 1NHPA 5HXIA 2B7SA 1PS9A 3AEGA 3IC9A 4UP3A 4JN9A 3GYIA 4H4QA 2BK4A 4JNQA 3M13A 2B7RA 4CY6A 4HB9A 4APNA 5FMHA 3I6DA 1CJ3A 1E1MA 4H4YA 3UTFA 1GTEA 5IQ4A 4H4VA 1ONFA 3UKKA 1S3BA 5KXJA 4K22A 2GAHB 2YM1A 3AE7A 1CC2A 2WP6A 1K0JA 3COXA 3NG7X 1JRZA 1PXCA 2BS2A 4YKFA 1TYPA 2C65A 4B1BA 4CBQA 2CFYA 3KLJA 3PO7A 1E1KA 2WOIA 2WU5A 2Z5XA 2XVFA 1FEAA 3GWDA 4DSGA 3E1TA 3KD9A 4GRTA 1GRGA 4OCGA 1PBFA 3ALMA 1N4WA 2PHHA 1YQ3A 3VRDB 3G5SA 4U8OA 4YSYA 4RSLA 2BXRA 1NENA 3CN8A 4FX9A 4O5QA 2AR8A 3NK1X 4OVIA 4DGKA 2GAGB 3LZXA 1H86A 1NPXA 4FDCB 3R9UA 3VR8A 2XVJA 1LPFA 1IUUA 2Z5YA 5EOWA 3O0HA 1O95A 3REDA 1P2HA 3CGDA 3UKPA 4H4PA 4ADWA 4BK2A 2C76A 4YKGA 1D7LA 1MO9A 4X4JA 1GESA 3ITJA 4NEVA 2BC0A 4D04A 2ARDA 1JNRA 3DJEA 2GR1A 3AE2A 5C3JA 5CKUA 4JQ9A 2XVHA 1XPQA 1LV0A 3ALLA 3QVRA 4A99A 2BCPA 5U63A 1KSSA 2DKIA 4EQWA 2E4GA 4EQSA 1GRAA 2GEWA 1ZY8A 2EQ9A 1NEKA 2OA1A 1PXBA 3DH9A 1KSUA 1H83A 5EBKA 1OJTA 3Q9TA 5TR3A 3UKFA 4Z26A 4HA6A 1PBEA 2XVEA 2RABA 1PJ5A 3AD9B 1LTXR 2B9WA 3C96A 1NHRA 3S5WA 2RGHA 4B69A 3DA1A 3DK8A 1KDGA 4TM3A 3AD7B 1TYTA 3B6DA 3QJ4A 2BABA 3AEBA 3VR9A 3CPHG 5JCNA 3AEFA 2O9ZA 5KOWA 2E5VA 1TRBA 4K7ZA 2XLPA 2YQUA 3NGCX 3RP8A 2YR6A 4XXGA 1GEUA 3K7QX 1IJHA 1CJCA 3ATQA 4U2TA 4YT0A 3NRNA 3OZ2A 1ZKQA 1DJQA 2YG5A 1LQTA 1LJ1A 2R4JA 2GV8A 4TM4A 5U1OA 3IWAA 3AEEA 1L9EA 2R9ZA 5KVIA 2YLWA 1JNZA 3BI2A 4ZCCA 2FJDA 1O5WA 1F6MA 1EL5A 1BF3A 1PN0A 1TDEA 4OPDA 1N4VA 4E0VA 3GD3A 2C73A 1GXFA 3ICRA 4LU6A 3CNPA 2A87A 2VVLA 3NN6X 3H8LA 5U25A 2C72A 5JCMA 2B9XA 1GREA 2GMHA 4BV6A 2FJAA 2I0ZA 4U8LA 4X9MA 4ZCDA 2BS3A 3BNMA 1VRQB 3NT6A 4Z24A 4BJYA 4BURA 3P9UA 3LADA 4BK1A 2ZZBA 1XHCA 4TM1A 2OALA 5HHFA 2YLRA 3AECA 4TM0A 3EAOA 4U8IA 2HQMA 2V3AA 3BHKA 4U8MA 2JB3A 1GT8A 2XFUA 2W0HA 1D4DA 4U8NA 4YSZA 3AYJA 3UOZA 1S2YA 1EL8A 2XLRA 4JY2A 1YQZA 4CNKA 1SEZA 2PYXA 1ZX9A 2JKCA 3M0OA 3DGHA 4I58A 4OPCA 3CGCA 4A79A 4EMIA 3VRBA 2Q0KA 2VRLA 1UKVG 4YSHA 1B8SA 4YTPA 3L1RA 1TDFA 1EBDA 2F5ZA 3NIXA 4U8PA 4EQXA 1IUVA 3NYEA 4KPRA 3H8IA 3AE5A 1F3PA 2R0GA 4X9NA 1GERA 2VZ2A 1KFYA 1ZDLA 3AWIA 1B37A 5BVAA 2H88A 4YWOA 3KA7A 2C66A 3UOYA 1CBOA 2WOWA 2X50A 5IPYA 1M64A 1GRBA 1F8RA 2X99A 3PS9A 1Q9IA 4H4RA 4IVMB 3GRSA 4BJZA 3D1CA 3GWFA 4A6NB 1GPEA 5J60A 1KNRA 2V6OA 4RG3A 2BC1A 3BNUA 1Y56B 2BS4A 2YLTA 2X8CA 4Z44A 3F8PA 1E7PA 3NNEA 2CULA 5KOXA 1VG9A 2J3NA 4H4UA 5EB5A 3SFDA 1H7XA 2Y6RA 1GTHA 1P2EA 3AEDA 5M0ZA 2WPCA 2XLTA 3IHMA 4OPTA 4K5SA 2QCUA 2JBVA 3DJGX 4AOSA 3LJPA 3LZWA 3CNTA 4Z2RA 3LB8A 3RP7A 1YKJA 4U8KA 4NTDA 1OJAA 1F8SA 4H7UA 1Q1WA 1NHSA 1F8WA 3AB1A 1GRTA 3G5RA 2BCGG 3QFBA 1TDNA 2JB2A 4NEWA 4REKA 2EQ6A 3CNSA 3S61A 4C74A 4H2RA 2ACZA 4Z25A 1DXLA 2FBWA 1QJDA 2V61A 4H2NA 2GR2A 4B68A 2WEUA 2TMDA 4M52A 4AT0A 4USRA 4B63A 2ZBWA 1OJ9A 2X8HA 2YLSA 4K5RA 1H82A 4CNJA 2JK6A 4J2WA 5C2TA 3HZLA 1JRYA 2YG7A 2XCGA 2H89A 3QVPA 4B64A 2IVDA 1DNCA 1DOBA 3DK9A 1GRHA 1KF6A 2RGOA 3QSSA 3RHAA 1XANA 2WOVA 3AE3A 1H81A 4J56A 3AE4A 3NH3X 4A65A 2WBAA 4Y4LA 4EMJA 4ZN0A 5L46A 5GSNA 3RNMA 3H4KA 2WP9A 2WU2A 3CGEA 4AP3A 2R0PA 2V3BA 1JEHA 4A9WA 1BWCA 1D5TA 1E1LA 2BACA 1OJDA 3GRTA 1ZK7A 4H4ZA 2B76A 2RGJA 4JDRA 2GR3A 3SM8A 3UTHA 4EM3A 4WCTA 2YG3A 1PBBA 2GVCA 2C3DA 5HY5A 4IV9A 1H84A 2C70A 1ELIA 3V3OA 5GRTA 4B65A 1E1NA 5IQ1A 5J7XA 3FBSA 2Q0LA 2XLSA 3ZYXA 4OPGA 1PBCA 1XDIA 1S3EA 3GDNA 1X31B 3GD4A 4CCRA 1L9DA 2YVGA 4EQRA 4CCQA 3NTDA 4IVOB 2WDRA 3CGBA 4ICYA 5DBJA 3EANA 1CJ2A 4GUVA 2GQWA 5CQFA 3SQPA 3SGLA 1AOGA 2WS3A 4GR1A 1GNDA 2IIDA 4MJWA 4O5UA 4H2PA 1PDHA 3P4SA 3GMCA 1BGNA 1QO8A 4A5LA 2QAEA 3DK4A 4I59A 4DNAA 4YSXA 1Q1RA 4Z2TA 1QLBA 4H2QA 2TPRA 2C67A 3CPJG 1IUXA 2YR5A 2Q6UA 1BKWA 2FJBA 4U8JA 2VQBA 3F8RA 4PAAA 1FL2A 2WDQA 1LQUA 3AYLA 3DGZA 4LA1A 1E6EA 3GYJA 1PBDA 3NLCA 1D4EA 3UKQA 2OAMA 1JRXA 1M6IA 3UOXA 1BGJA 1Y56A 1YQ4A 3LOVA 3NK0X 4H4XA 1VG0A 3QSEA 4FK1A 1NG3A 3K30A 4B66A 2YVJA 1D7YA 5BRTA 2UZZA 3L8KA 1ZOVA 3DMEA 4TLXA 4U2SA 2YM2A 3GSIA 3QSMA 2FJEA 3P4RA 2NPXA 4KX6A 4C3XA 3V76A 2YG6A 1D4CA 2VVLG 1NAAA 4C3YA 4YTNA 1CC4A 1IUSA 3IF9A 1LVLA 3AE1A 3BI5A 1ZMCA 3FPZA 2QA1A 2C75A 3NYCA 1RP0A 3UKHA 1FEBA 1PXAA 1ZMDA 4IA6A 3VQRA 2R0CA 5JCKA 5KRQA 1JOAA 2YLXA 1E39A 3RP6A 1VQWA 3AE8A 2XFNA 3BHFA 3WE0A 1Z6LA 3II4A 1K0LA 3AYIA 3NTAA 3URHA 1BZLA 4AOXA 1K0IA 1N4UA 1PJ6A 3EPTA 5ER0A 5FS7A 1L0VA 2C64A 3UOVA 4PABA 2CVJA 3M12A 2YVFA 3CNDA 5JCIA 1DJNA 2BK3A 3V3NA 5BUKA 4NTEA 1DODA 1IUTA 2YWLA 4J33A 4Z43A 3JSKA 1RSGA 1Y0PA 5BULA 3GMBA 2XFOA 1GETA 4DSHA 2WP5A 2YAUA 2VOUA 3C4AA 2R45A 3KPFA 3LXDA 4OPIA 1CL0A 4AT2A 1FOHA 2WHDA 1EL9A 1FCDA 3AEAA 1NDAA 1CHUA 3PVCA 4H4SA 4JNAA 2OLNA 2QA2A 4ECHA 3ADAB 4RG4A 3C4NA 4U2LA 4CRTA 4K8DA 4OPUA 2GRTA 5KVHA 3AE9A 1TDOA 2C3CA 3FG2P 4XWZA 5LV9A 1KNPA 2XVIA 2Y6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OFMA 4QFDA 2V60A 3BI4A 1YY7A 2LEGA 3VURA 4H50A 1O81A 3Q6JA 1RYIA 4J34A 4H4TA 4WF4A 3MYDA 2JB1A 4BIKA 5FS9A 2CQ9A 3G9BA 3HVXA 2PBJA 1GSNA 3DVXA 4UDQA 3UP4A 2OA7A 3C1RA 4IS0A 3EYTA 3SZCA 2GSQA 3G7JA 3EF6A 3LQ7A 3ABVA 5JCLA 2XDOA 4XWRA 2LJRA 4K2DA 4KDXA 3L0HA 4AJ8A 3VWXA 2X3NA 2PERA 3DJDA 5KMSA 2CDUA 2GB0A 4YXDA 2EQ8A 3P8WA 4G19A 1YJ6A 5J41A 4J2FA 2EIRA 5GAPD 1MOKA 4EM4A 4TXVA 4V2NA 1GUKA 4KSOA 1BQ7A 4Q5QA 3TJFA 4ZL8A 4Q5NA 4G6GA 4ULXA 3I69A 3AXBA 3M1GA 5ECOB 1IYHA 1V59A 3AE6A 2PUKC 3W8JA 4KF9A 3DJJA 4MDCA 1JZOA 3ZREA 3EC3A 4YTMA 3KJYA 3KZQA 1ILOA 4TR3A 4B67A 2A89A 2MMOA 3CNJA 2AAWA 1CJ4A 3W8SA 2YWMA 3N5OA 4MMMA 2DJ2A 4WX1A 3B3RA 4D03A 6GSXA 1PJ7A 1AQWA 1EL7A 1K4QA 2AAQA 3C73A 2FLSA 1OJCA 2YR4A 4ECJA 3T2YA 3GYKA 4YJHA 5KMPA 22GSA 3F63A 1T7PB 4TOPA 4RI7A 2N5FA 2I4AA 2PPTA 2YZUA 4ZB9A 4USQA 3ZDNA 3KU9A 2E48A 1HNCA 1NG4A 1JU2A 3LXTA 2D2ZA 4HQSA 1A23A 3TCOA 3CIRA 5CRGA 2B7SA 1F37A 4JN9A 1K0OA 3GHAA 3ZNOA 3US3A 1FO5A 4YAPA 4APNA 1RW1A 3UTFA 20GSA 5IQ4A 4I6XA 1KIFA 2CVDA 4QL7A 2K9FA 3ZIJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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