4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

1GREA 3COXA 2WPCA 3T37A 3ALJA 2YG3A 4H4RA 4K5SA 4XXGA 4RG3A 4Z2RA 2WPFA 1MO9A 1PJ5A 1CC6A 2BACA 2WHDA 3L8KA 1H84A 3OZ2A 3S5WA 5L46A 3EF6A 1F8WA 2WPEA 2OLNA 1KF6A 3P4QA 4BV6A 1IUSA 1D5TA 4X4JA 2V61A 1ZK7A 2GH5A 1BGJA 2YAUA 1TDFA 1E6EA 3NYFA 1EBDA 3SFDA 5CQFA 2Z5YA 4B69A 1Q9IA 1PBFA 3NTAA 4OPCA 3GDPA 3ICTA 4CY6A 1JRYA 1LQTA 2XVIA 1EL8A 2XLRA 3AEFA 3QSSA 4EMWA 3KVEA 2VOUA 2YG5A 2C3CA 1CL0A 4OPIA 3VRAA 3WE0A 2W0HA 4U2TA 1QJDA 4K8DA 4C3YA 4DNAA 4Z24A 5JCNA 3NHOX 2GMJA 2QAEA 2Y6QA 2QCUA 3AEGA 2DKHA 4A7AA 2BCPA 3UOVA 3CN8A 4O5QA 4H4UA 2WOIA 3UOYA 1OJTA 2GMHA 3AWIA 1UKVG 2V3BA 3ALMA 3UKLA 2NPXA 3UOXA 1GETA 1Y0PA 4Z2UA 1H6VA 1LQUA 2GF3A 2OALA 3GMCA 5GRTA 4B65A 4YSXA 3UCLA 1PBCA 4FK1C 4IVMB 4J57A 4TM1A 4U2SA 2YR4A 5CKUA 3LZXA 3PO7A 3UKQA 3AYJA 1XDIA 2XVHA 5EB4A 3ICRA 3GD4A 3SQPA 2C72A 5BULA 2GR0A 3P1WA 2WDRA 4YT0A 1OJAA 2EQ7A 3AD8B 2YG4A 2WU5A 2BS3A 4B66A 2AAQA 4H4TA 1TYPA 1NPXA 1OJCA 1CJ4A 1SEZA 2YM2A 5C3JA 5KOXA 3H8LA 1D4DA 3P9UA 3GYIA 2R46A 2X50A 3RP6A 2V6OA 1PDHA 4CRTA 2WDVA 3VQRA 4EMJA 1CJ3A 1BZLA 5KXJA 3D1CA 3DMEA 2R0CA 1NENA 4C5OA 1L9DA 2WP6A 2XFNA 3C96A 3UKFA 4OPTA 2WP9A 3H8IA 4AP1A 1M64A 1VDCA 5FS6A 1N1PA 5U1OA 4D04A 4PABA 1L9CA 1NHPA 3ATQA 5C2TA 4Z2TA 2C73A 2RGOA 3FPZA 3IC9A 4H2QA 4EIPA 1GALA 3DJJA 5KRQA 3AE7A 3P4RA 2UZZA 1XPQA 5FMHA 1DNCA 1GTHA 1PXAA 3SGLA 2B9WA 3UP4A 3AE4A 2WS3A 1JNZA 4U8LA 1PXCA 4KX6A 1GTEA 3DGZA 3NH3X 2YM1A 4A9WA 3VR9A 4BK2A 4C77A 4OCGA 4LU6A 2B76A 2FJBA 4IA5A 4U8KA 2C76A 3GMBA 4XWRA 1IJHA 4LA1A 3UTFA 3NT6A 3ZYXA 4B67A 2ZZBA 5DBJA 1GNDA 4U8IA 4TM3A 3D8XA 4A6NA 4BK3A 1GSNA 1GPEA 2EQ8A 4GCMA 2J3NA 3BI5A 4H7UA 5EB5A 2BK4A 1NHRA 2IVEA 1COYA 3DJGX 4EIQA 3GYJA 3KKJA 4BK1A 3FIMB 4ZN0A 5IPYA 1PJ7A 1KFYA 1ZDLA 2EQ9A 4A99A 1E1LA 3S61A 1E7PA 1CF3A 4H2PA 3QFAA 2JB2A 5J60A 1BKWA 2RGHA 1H82A 3EANA 3URHA 4AOXA 4DSHA 5HYMA 4J2WA 1F8RA 3KA7A 1MOKA 3M12A 1H81A 1DJNA 1F8SA 3BNMA 1DOCA 2GQFA 1VG0A 4XWZA 2R0PA 1N4WA 5KVHA 1YQ4A 3K7TA 2VVLA 3NKSA 4EM4A 4CNKA 1NAAA 1TYTA 2A8XA 4TM4A 1CJCA 2GB0A 1IUWA 3E1TA 1KSSA 2X99A 4JNAA 4EQWA 3UKKA 2VQBA 1CHUA 1W4XA 4YSYA 1GXFA 1P2HA 2RABA 2YLWA 2XLPA 2ZBWA 2WESA 4N9XA 3AE8A 2CVJA 3ITJA 2E5VA 2TMDA 1ONFA 1N4UA 1ZY8A 1GRHA 3V76A 5TR3A 2Q6UA 4U8NA 2NVKX 4Z44A 3UTHA 3ATRA 1CJ2A 2V5ZA 4EQRA 1P2EA 3AEBA 3AE2A 3VRBA 1KNRA 2IVDA 1TDNA 1GRFA 2I0ZA 4YKGA 4IV9A 1LTXR 2PYXA 2X8GA 4C3XA 3H4KA 2YLTA 3IWAA 2B9XA 2WOWA 1H86A 1DXLA 3BI4A 3M0OA 1GRGA 3DJDA 2YVGA 3AECA 4NTDA 3SFEA 2JB3A 1FEBA 4JQ9A 4CBQA 3GRSA 3Q9TA 2TPRA 1BGNA 2C7GA 4H2NA 3FG2P 1QLBA 1F3PA 3II4A 4JY3A 3P4SA 4YTPA 3M13A 3ABVA 4AT2A 4AOSA 4YSZA 4C74A 2BS4A 1RYIA 3LOVA 2BC0A 1B5QA 3ALLA 1Q1RA 2JAEA 3F8RA 4H4YA 5HHFA 2OA1A 3SM8A 1JEHA 4Z43A 1DJQA 3C4AA 4A65A 3GDNA 3L1RA 1JRZA 3QVRA 4OPLA 2CULA 1K0LA 1DOBA 1LV0A 4OVIA 2C67A 1N4VA 1PXBA 1Q1WA 2BCGG 3AE9A 4H4PA 4UDRA 1GESA 5FS9A 3I6DA 4HB9A 4ICYA 3KD9A 1KSUA 4IA6A 1E1KA 5GSNA 2FJDA 1PS9A 4K2XA 1GERA 5KWFA 2ACZA 3NIXA 2GVCA 4NZHA 4EM3A 3ZDNA 3KLJA 2DKIA 2ZZ0A 2GAHB 3AB1A 3NN0X 4OPGA 2QA2A 3AEEA 3GWFA 3JSKA 3NRNA 4Z25A 4U8MA 5EBKA 2YLZA 2R4JA 1IUVA 1O94A 3BHFA 1X31B 3AEAA 3QVPA 3IHGA 1XHCA 2VQ7A 4UDPA 3AE6A 4A79A 3VR8A 2QA1A 1NEKA 1NHQA 2XCGA 2BK5A 4P9SA 2WEUA 4TLZA 2YLRA 3G5QA 3LADA 1B8SA 1LJ1A 1PBBA 3BI2A 2GEWA 1H7XA 4CCRA 5BVAA 2GQWA 4H50A 1FEAA 4AP3A 2YR5A 2IIDA 3HZLA 4USQA 2F5ZA 1YKJA 3ICSA 1DOEA 1L9EA 1VRQB 4U2LA 4BJZA 1CC2A 2XLSA 1MXTA 3ISHA 1O95A 2XFOA 1ZX9A 1S2QA 3AD7B 1KNPA 1DODA 2XVJA 2GR2A 2X8HA 2XVFA 3CNPA 4OPDA 3NK1X 1LPFA 1ZKQA 4GF7A 4J36A 2AR8A 3LZWA 2RGJA 3GD3A 3G5SA 1TDOA 1JRXA 3KU9A 1D4EA 1FOHA 2VRLA 2XFUA 3F8DA 4JDRA 3I3LA 3PS9A 1GOSA 1V59A 1EL9A 4GDEA 3CGEA 2Q0KA 2R4EA 1YQZA 1QO8A 1K4QA 4ECHA 2A87A 5LV9A 3IHMA 3NK0X 1L0VA 3GRTA 2CDUA 3DK4A 3QJ4A 4JNQA 5KVIA 3UTGA 3QSMA 1KDGA 2BS2A 3UKHA 1BF3A 3K30A 1IUXA 2YVFA 2ARDA 3C4NA 3PVCA 2CFYA 3QFBA 4YWOA 4WCTA 4CNJA 2VZ2A 3IF9A 2Y6RA 1ELIA 3CNDA 3NG7X 1H7WA 4YKFA 1GT8A 5IQ1A 1GRTA 1OJ9A 4H4WA 4GRTA 3AXBA 3NN6X 4YXDA 4GDPA 3V3OA 1IUUA 1Y56B 2B7RA 1YQ3A 4J31A 4MJWA 4LIIA 4NTEA 2OLOA 4PAAA 4YSHA 1JU2A 2E4GA 2AQJA 3DK9A 3AE5A 4EQXA 4Z26A 5HY5A 2WU2A 3B6DA 2BYBA 2R0GA 2Q7VA 2WETA 2WQYA 1LVLA 1NDAA 3CGCA 2GAGB 3CGDA 1Y56A 4ADWA 5FS8A 2X8CA 2R9ZA 4USRA 1ZP0A 1ZOYA 2PHHA 5BRTA 1YY5A 3CTYA 3NK2X 4FK1A 4DGKA 3RNMA 3BHKA 2BXRA 3CIRA 1VG9A 2C70A 3EAOA 4X9MA 2O9ZA 2OAMA 1RP0A 5JCKA 2JBVA 4H4QA 4J33A 4DSGA 3REDA 2FBWA 2YG7A 4YTMA 3NLCA 3LB8A 3O0HA 2R45A 1F6MA 1S3EA 1E1MA 1K0IA 1XANA 1CC4A 4Y4MA 3CPJG 3UTEA 2YLSA 4GUVA 1ZMDA 4B1BA 2HQMA 2XDOA 1B37A 4H2RA 4U8JA 3AD9B 3BNUA 1EL7A 4H4SA 1OJDA 3UKAA 1PHHA 2BC1A 3NYCA 3AEDA 2X3NA 2XVEA 2YG6A 1HYUA 1K0JA 2FJAA 4HA6A 4RSLA 2EQ6A 3DH9A 2GR3A 4FDCB 1FECA 1GRAA 3F8PA 3GSIA 4H4VA 1E1NA 3P4PA 1NG4A 2B9YA 2XLTA 2C64A 3AE1A 4E0VA 4H4ZA 4K5RA 4WX1A 2YQUA 4J34A 1RSGA 5BUKA 1PJ6A 5FS7A 4EQSA 1NHSA 4B64A 2JKCA 1IUTA 2WOVA 5M0ZA 4J56A 2B7SA 2APGA 2XFPA 4JN9A 2GRTA 4Y4LA 4A5LA 1FL2A 1S3BA 3AE3A 3NYEA 4NEWA 3CNJA 1ZMCA 4RG4A 1CBOA 1ZOVA 2Q0LA 2A89A 2V60A 2YLXA 3RP8A 4ZCCA 2XFQA 4B63A 3ADAB 1D7LA 2YWLA 2XYOA 4H4XA 4YTNA 2C66A 5U25A 1AOGA 3R9UA 2WP5A 2BA9A 2JK6A 4M52A 1GRBA 1M6IA 5KOWA 1VQWA 2BXSA 2Z5XA 1NG3A 3CGBA 3NGCX 4I59A 4BURA 5IQ4A 1JNRA 3CPIG 1D7YA 3K7MX 4I58A 4U8PA 5U63A 1GEUA 4IVOB 4OPUA 5M10A 3LJPA 2V3AA 3UOZA 4D03A 4UDQA 4BJYA 2ZZCA 1TRBA 3V3NA 2VVMA 1H83A 4B68A 1TDEA 3G5RA 3LXDA 4O5UA 2XLUA 1PBEA 3RHAA 1B4VA 3QSEA 3DJEA 2YR6A 3UKPA 1O5WA 3UP5A 4X9NA 4KPRA 2VVLG 1PN0A 3NTDA 1S2YA 1E39A 1TDKA 1PBDA 3KPFA 5JCMA 5JCIA 2BK3A 2VRMA 5JCLA 4A6NB 2GV8A 2BABA 1REOA 4EMIA 3FMWA 3B3RA 3DK8A 4APNA 4JY2A 2C75A 1GV4A 2WBAA 5EOWA 3EPTA 4Y4NA 3K7QX 1FCDA 4REKA 1Z6LA 2JB1A 4K22A 4CCQA 5J7XA 3GWDA 3OC4A 2E1MA 4CY8A 3DA1A 5ER0A 4TM0A 2YVJA 3CNTA 2H89A 3DGHA 3Q6JA 4AT0A 5HXIA 2GR1A 4ZCDA 3RP7A 1D4CA 2FJEA 2C3DA 4NTCA 2WDQA 4NEVA 3AYLA 3CPHG 4TLXA 3VRDB 1BWCA 2C65A 2H88A 1EL5A 4K7ZA 4FX9A 3AYIA 4UP3A 3CNSA 1JOAA 3FBSA 4U8OA 4GR1A 3NNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4V2NA 5DBQA 1EP7A 3ZITA 3ALJA 3T37A 1OE8A 4XXGA 3CBUA 1MO9A 4V1Ap 4IW9A 3DWVA 4J56E 1GRXA 3OZ2A 1XOAA 1F8WA 3IK9A 2WPEA 3IRAA 1PD21 3MAKA 4GTUA 2MBTA 4G74A 2YAUA 4K1FA 4PNGA 4YAPA 20GSA 5CAXA 1E6EA 1EBDA 4PQIA 3HYXA 3NYFA 1Q9IA 3NTAA 2AB6A 3WD6A 2AHEA 3GDPA 1HNCA 4CY6A 4D73B 2VCXA 3QSSA 2XLRA 2YG5A 2FWGA 3L4NA 4OPIA 1SD9A 2V6KA 3HZ4A 1M3IA 5DAKB 3WE0A 3P2AA 3NIVA 3TKRA 1ERTA 3T14A 1K3YA 1JZOA 2GMJA 2Y6QA 4F2IA 11GSA 2DKHA 4POMA 2NPBA 4MF7A 2BCPA 3SZ0A 4O5QA 3UOVA 3GV1A 1OJTA 4HDEA 4F9ZA 3M0FA 3TKPA 1GLPA 4Z2UA 2GF3A 5GRTA 2TRXA 2IFQB 1YF0A 4IN0A 4U2SA 3ZYWA 3PO7A 3A2VA 3AYJA 1XDIA 2XVHA 2X4AA 5EB4A 4V2MA 3ICRA 5BULA 4FIWA 2RUEA 3A5WA 2EQ7A 4KCEA 2WU5A 2OJLA 2H1GA 4B66A 4AJ7A 4NV5A 2BRYA 1S3CA 6GSUA 3NZNA 2YM2A 5C3JA 4G2EA 3H8LA 2R46A 2V6OA 5DQYA 3TRPA 1QUWA 4EMJA 3DYRA 4O92A 4HUAA 1NENA 2WP6A 3C96A 2GSTA 2LQOA 3LORA 2XHFA 4AP1A 5FS6A 1OKDA 1L9CA 2LSTA 4AJ8A 4Z2TA 1FG4A 3SWLA 3IC9A 3RPPA 4O5RA 2UZZA 2PUKC 4ZB8A 2B9WA 1K0NA 1JNZA 1WIKA 3HA9A 1PXCA 4KX6A 4HJ2A 3HVVA 1W89A 4OWYA 2B76A 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2R4JA 1IUVA 4PNFA 3BHFA 3AEAA 3FR9A 5LCZA 2H6YA 4Q5FA 4DVCA 2VQ7A 4UDPA 3AE6A 1SJZA 2XCGA 5JWOB 2LRTA 4TLZA 4A5PA 4HJMA 4BVXA 2AV4A 1MDIA 3G5QA 5BVAA 3ZLPA 2GEWA 4FYUA 4H50A 1FEAA 2HZEA 2YR5A 1VF3A 1YKJA 1GP1A 1DOEA 1Y6EA 3IPZA 5G5FA 2DJ2A 1S2QA 3AD7B 4LL1B 3D5JA 1DODA 4GRFA 2MYGA 3FY7A 1LPFA 2H1BA 1PL2A 1WRYA 3LZWA 3FZ4A 4KDUA 1TDOA 3G5SA 2LRNA 1FOHA 2VRLA 4NAXA 3I3LA 3VWXA 2H74A 1YQZA 5LV9A 3TJJA 1THOA 3NK0X 1SYRA 3QSMA 1KDGA 2YVFA 4G9KA 3PVCA 1XZOA 2CFYA 3QFBA 2CZ2A 5LNKe 2WZ9A 2FY6A 1ELIA 4G73A 2NDOA 1GT8A 4MZCA 1OYJA 1OJ9A 5J3RA 3AXBA 4YXDA 3IBHA 8GSSA 4G6GA 1Y56B 1Z9HA 1YQ3A 4USSA 5D9VA 4EL1A 2OLOA 1K0BA 4G19A 3JCML 1FOVA 2C3QA 2AQJA 4ML1A 3AE5A 4OO4A 2WU2A 2GS3A 3B6DA 3LG6A 2WQYA 3CGDA 2VL3A 2B3SA 2OA7A 2G2QA 2X8CA 1J9BA 2YZUA 3QFAC 4V2LA 1ZOYA 2HI7A 4DGKA 1YY5A 4ILFA 4EDZA 3MWHA 3CMIA 2BXRA 4JR4A 4X9MA 2O9ZA 1GLQA 2XPDA 4DSQA 5JCKA 2H72A 1R5PA 2GDRA 3LB8A 2V32A 1CC4A 1O7UA 2O89A 14GSA 5G31A 3KP8A 3QAGA 5J9CA 4B1BA 2HQMA 2XDOA 1B37A 1B48A 5EY6A 1TRWA 2NBSA 3BNUA 1EL7A 4H4SA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

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