4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
4PAAA 4NEVA 4LU6A 3AYJA 4AP1A 4A65A 2QA1A 4O5QA 2R0CA 4OCGA 2WOVA 3K7QX 4Z43A 1PXAA 3P4RA 2XLRA 2XLSA 3NG7X 4ICYA 3GD4A 1IUXA 2YWLA 3ICTA 3UKPA 2X50A 3G5QA 2JB2A 3OZ2A 4JY3A 5KOWA 4FX9A 4JQ9A 1CC6A 4EQSA 2YLWA 4IA5A 4GDPA 1LTXR 1H81A 1E1LA 2VOUA 5KWFA 1IUSA 3GDPA 2YM2A 4BK2A 4K5RA 1H6VA 4TM1A 2EQ8A 1CC4A 2GB0A 2WDVA 3DGHA 2EQ6A 3BI5A 1E39A 1S2YA 3BNUA 3F8RA 2OAMA 4YSHA 2A8XA 3DGZA 4C3YA 3S61A 3I3LA 1P2EA 5FS9A 2O9ZA 5IQ4A 4KPRA 1PXBA 1JEHA 4PABA 3AEGA 2NVKX 3SQPA 1DODA 2UZZA 3BI4A 3LZWA 3M13A 4H4SA 2GQWA 4B63A 1NAAA 2XYOA 3KVEA 1E6EA 3ALJA 3SM8A 5JCIA 1NEKA 4Y4NA 3ITJA 1YY5A 3F8PA 1GOSA 3GSIA 2WP9A 4EIQA 2JBVA 4APNA 1DOBA 2YG7A 4EMJA 2B7RA 3GRSA 3NK1X 1F3PA 3ISHA 2E1MA 3GRTA 1JOAA 3H8LA 2BK5A 2V61A 2GMJA 4J57A 1Y56B 4GCMA 1E1KA 3ZYXA 2Q0KA 2XVFA 3JSKA 1JNRA 4ADWA 2CVJA 2WPCA 1OJAA 2YQUA 1PDHA 2YG6A 1GRTA 3Q6JA 4Z24A 4GRTA 1K0JA 3VR9A 4H2RA 2BS2A 3QSMA 1HYUA 3QJ4A 2Y6QA 4YT0A 4OPUA 2AAQA 4RG4A 2YVJA 3UKAA 4DGKA 2AQJA 3K7TA 1H84A 2WU5A 4U8NA 2E4GA 2YVGA 3UOXA 4BK1A 4Z2UA 2C73A 1GERA 5BRTA 4X4JA 1K0IA 2WETA 3AD8B 2XDOA 3NLCA 3PVCA 5JCMA 3FBSA 3DJDA 1H83A 1EL9A 4KX6A 4OPIA 2C76A 2GR3A 2X8HA 3RP6A 1EL8A 4EQXA 4OPTA 1NPXA 3KPFA 2FJAA 1GSNA 3L1RA 4TLXA 5KVIA 2WPEA 4NEWA 4A7AA 4U8OA 1GTEA 2Z5XA 4B65A 1ZMCA 3GYIA 2C64A 3ICRA 3ATQA 1FCDA 2WS3A 2XFNA 2QCUA 2YLSA 3VRDB 1BF3A 2X99A 3VRAA 3DK9A 2R0PA 1CBOA 2CFYA 1PJ6A 2JK6A 3QVRA 3CTYA 1OJDA 4GUVA 3NT6A 5BUKA 4JY2A 1S3BA 1EBDA 1YQZA 4B67A 4REKA 3QVPA 1JRYA 3V3NA 2FBWA 1S2QA 2B76A 3RHAA 3NN0X 5HY5A 2YR4A 1IUWA 3AE2A 2XVHA 5KOXA 5GRTA 3K30A 1S3EA 4LIIA 4DNAA 1PJ7A 3ALLA 4J2WA 1RSGA 3P4PA 1NHPA 1RYIA 3GD3A 1SEZA 1PS9A 2FJDA 4OPDA 4U2TA 1GT8A 3PO7A 2YVFA 2YLZA 4CNKA 1N4UA 2XVEA 4C5OA 4N9XA 1GRFA 3F8DA 2WQYA 4A6NA 3NIXA 3NYCA 1B37A 1ELIA 2XCGA 1VG0A 1ZMDA 3DA1A 4FDCB 2X3NA 4I58A 4U2LA 1CC2A 5KVHA 1GRBA 3AE8A 4BK3A 2A87A 2A89A 1KDGA 4ECHA 3AYIA 4Z44A 3UTEA 4B69A 1XDIA 5L46A 3DH9A 4XWZA 1NHQA 1F8WA 5FS8A 3UOVA 1B5QA 3AE3A 5ER0A 4M52A 3K7MX 2XFOA 2XVJA 3L8KA 3KKJA 3II4A 3KLJA 3AXBA 3UKQA 2GVCA 3T37A 3CGBA 3ICSA 4J34A 2R46A 3BI2A 1LQUA 5CKUA 3NYFA 1YQ4A 3CIRA 4H4RA 4A5LA 2C72A 2YR6A 3LZXA 2ACZA 4P9SA 1DXLA 4EMWA 2WU2A 3NK0X 4EM4A 2Q0LA 2TPRA 5FS6A 2R0GA 1QLBA 4BV6A 1DOCA 3LXDA 3RP8A 2RGHA 2BA9A 1Q1WA 4Y4LA 2HQMA 2OLNA 2V5ZA 1M64A 1NHSA 3BHKA 4D03A 4GDEA 4BJZA 3QFAA 1TDKA 5JCKA 3RP7A 5KRQA 4EMIA 1BWCA 4MJWA 1D4EA 1GREA 3UTHA 3C4AA 3QSSA 4CCQA 4H4TA 4YTPA 1F6MA 1X31B 3FPZA 4TLZA 4WX1A 5FMHA 5M10A 2WPFA 1JNZA 4USRA 1NDAA 2AR8A 2I0ZA 1VQWA 3CNTA 1L9CA 3FMWA 1GALA 2APGA 4H4PA 1TRBA 2YG3A 1CJ4A 1B8SA 3CPIG 3PS9A 1D7LA 2VQBA 2RGOA 1TDFA 5KXJA 1D4DA 1PJ5A 2XFQA 3ALMA 4YTMA 5EBKA 3V3OA 3V76A 1M6IA 2ZZCA 2YLRA 4IV9A 1O94A 3RNMA 2BXRA 2C66A 2Z5YA 3HZLA 4YTNA 1VRQB 2JB1A 1PXCA 4JN9A 1W4XA 1IUTA 2YM1A 1N4VA 1DJQA 3G5SA 4C77A 1D5TA 1RP0A 2C7GA 3AD9B 1L9EA 1Y56A 5EB4A 3CNPA 1ONFA 2C67A 2WP5A 1GESA 2C3CA 4B68A 4H4XA 4C3XA 1PBFA 4USQA 4Z26A 3CNDA 1D7YA 3AEBA 3S5WA 4NZHA 1JRZA 1NG4A 3AEDA 1OJTA 3LOVA 4AOXA 4DSHA 4K7ZA 1ZDLA 4K5SA 4H2NA 4TM4A 1JU2A 3NTAA 2JAEA 3G5RA 4H4UA 4CNJA 1KFYA 4YKFA 3BNMA 3B6DA 1XHCA 2E5VA 2C75A 2V60A 1GRGA 1FL2A 4IVMB 3UKHA 3IF9A 2V3AA 3O0HA 3LADA 4AT0A 3DK4A 2VRMA 2Q6UA 4IA6A 1NG3A 3NKSA 1XANA 1N1PA 3P4QA 5CQFA 2WDRA 3EANA 4XWRA 3UP4A 3CGEA 1KF6A 1LJ1A 2V3BA 1ZOYA 2YG4A 4H2PA 1UKVG 1DJNA 4Y4MA 5EB5A 1L9DA 3ADAB 4H4YA 2BK3A 4Z2RA 2EQ9A 1FOHA 5JCNA 1VG9A 2X8CA 3C4NA 4B66A 3AE1A 4AT2A 3AYLA 3H8IA 2YLTA 3FG2P 4K2XA 3BHFA 4J33A 4O5UA 3GWFA 4BJYA 4UDQA 2ZZ0A 4YSYA 2DKHA 5C2TA 2RGJA 4A79A 1PBEA 3B3RA 4JNQA 1L0VA 4DSGA 1GPEA 2GRTA 3NYEA 4H4QA 1F8RA 3P9UA 5U1OA 4YSZA 3UCLA 2PYXA 4B64A 1E1MA 4JNAA 1O5WA 1D4CA 4Z2TA 1OJ9A 2H89A 2BC0A 4LA1A 3IHGA 4EIPA 1V59A 2XLTA 1GXFA 2OLOA 2WEUA 1TYTA 3DJEA 4U8JA 2BXSA 3UTFA 1MOKA 2VZ2A 5U25A 2V6OA 1H86A 1VDCA 4X9NA 2IVEA 4YWOA 3P4SA 3IHMA 2R45A 2R9ZA 4OVIA 3SGLA 3UP5A 3AE9A 3EF6A 3CNSA 4OPGA 2BK4A 1AOGA 3C96A 1KNPA 4H2QA 1Z6LA 1KNRA 3I6DA 2VVMA 4TM0A 2B9XA 2FJEA 2VVLG 4J31A 3AE6A 1QJDA 2GEWA 4ZN0A 4NTDA 4J56A 1CJ2A 4OPCA 1KSUA 1TDEA 1YQ3A 3UKLA 4A9WA 2TMDA 5BULA 3COXA 4U8IA 1PBDA 1TDOA 3VR8A 4YSXA 3NRNA 1BGNA 3H4KA 3GMCA 1CHUA 1ZX9A 3LB8A 1IJHA 3NGCX 4U2SA 3DK8A 3LJPA 1EL5A 3AE4A 1COYA 2YLXA 1E7PA 4Z25A 3REDA 2FJBA 2JB3A 1CJ3A 1E1NA 3DJGX 3E1TA 4HA6A 4EM3A 2ZBWA 3NHOX 3NN6X 3D1CA 5U63A 2BS3A 3ATRA 1H82A 3DJJA 5HHFA 4IVOB 2BS4A 3GYJA 3CN8A 3ZDNA 5IPYA 1GEUA 4JDRA 5IQ1A 1Q1RA 2EQ7A 2QAEA 3UOYA 2H88A 1NENA 2ARDA 2BABA 5LV9A 4UDRA 1PBCA 2NPXA 2GF3A 1EL7A 3R9UA 2BCGG 2VVLA 2WHDA 4X9MA 2JKCA 3M0OA 5DBJA 5J60A 2OALA 3KU9A 3QFBA 3QSEA 4NTCA 2B9WA 2Y6RA 3WE0A 2C65A 1DOEA 2XVIA 4HB9A 3CPJG 4AP3A 5BVAA 1LQTA 4UP3A 1TDNA 1GETA 3VQRA 1XPQA 1LPFA 2F5ZA 1P2HA 2IIDA 1LV0A 2VQ7A 4J36A 1PN0A 1ZOVA 1B4VA 4NTEA 1REOA 4YXDA 2WOWA 2WOIA 3P1WA 2BC1A 2B7SA 4RG3A 4AOSA 2X8GA 2R4JA 2YAUA 3DMEA 4I59A 2GR1A 2WBAA 2BACA 1YKJA 3AB1A 5FS7A 3UOZA 1H7WA 1KSSA 4TM3A 1JRXA 2XLUA 3UTGA 2GH5A 1DNCA 3SFEA 3CNJA 3UKFA 1CF3A 4FK1A 4C74A 4E0VA 3GMBA 1GRHA 1TYPA 3D8XA 3IWAA 4BURA 3GWDA 3NK2X 3EPTA 4XXGA 5EOWA 1ZY8A 4H4VA 2OA1A 1GV4A 4H4WA 3AE5A 1N4WA 1BKWA 2VRLA 1BGJA 1FEBA 2GAGB 2WESA 3AEAA 4GF7A 4H50A 5GSNA 2DKIA 4GR1A 2Q7VA 4D04A 3KA7A 5JCLA 3AWIA 3EAOA 5M0ZA 2IVDA 1CJCA 4U8KA 1GTHA 2WDQA 5C3JA 1GNDA 3VRBA 3OC4A 3NH3X 2J3NA 1PHHA 4RSLA 4ZCDA 2PHHA 3IC9A 4EQWA 4CY8A 4H4ZA 4U8PA 2ZZBA 3CGDA 4CRTA 5HXIA 1NHRA 3AEFA 2QA2A 1QO8A 5HYMA 1LVLA 4A99A 1IUUA 3M12A 4ZCCA 1GRAA 1O95A 1IUVA 2XFUA 3CGCA 3KD9A 1F8SA 3AD7B 1FEAA 2BCPA 4A6NB 1ZP0A 2W0HA 3URHA 3AE7A 3NTDA 1PBBA 2GV8A 4FK1C 2BYBA 2B9YA 2YR5A 3CPHG 2CULA 2R4EA 4B1BA 4OPLA 4WCTA 4U8MA 3UKKA 3Q9TA 2XLPA 4CY6A 3GDNA 2GAHB 1FECA 2GQFA 1MO9A 4CCRA 4U8LA 2C70A 1CL0A 3ABVA 5TR3A 1K4QA 1ZK7A 4CBQA 2GMHA 2XFPA 5J7XA 4YKGA 2RABA 4K22A 3NNEA 3SFDA 1H7XA 1MXTA 2GR2A 4UDPA 1ZKQA 1OJCA 2YG5A 1K0LA 2WP6A 3AEEA 4EQRA 2C3DA 3FIMB 1Q9IA 1BZLA 2CDUA 4H7UA 1Y0PA 3AECA 2GR0A 4K8DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BJXA 2AUVA 4EE0A 4A65A 4OCGA 2R0CA 1Z9HA 2L59A 2QC7A 3SZWA 5IMDA 4XS6A 1PXAA 4J2FA 4KSOA 2XLRA 4MH2A 3WYWA 2VL3A 3GD4A 3L9VA 2X50A 3OZ2A 4EQSA 3M3MA 4GQCA 1OYJA 1WMJA 2RUEA 2YLWA 2LS5A 4GDPA 1QQ2A 1LTXR 1H81A 4IA5A 5IO2A 1YJ6A 5KWFA 13GSA 4BA7A 4K5RA 2YJ7A 2EQ8A 1CC4A 2WDVA 3VI5A 2YN1A 4OO5A 1GTIA 4X43A 2LRNA 4JEDA 4KH7A 17GSA 5B8AA 1PXBA 3LQ7A 3M13A 4AJ6A 4B63A 4L8EA 1YKCA 3LSZA 5JCIA 3SYIA 2HRKA 1YY5A 1JHBA 3BD2A 4X1UA 3J7Yb 5HR1A 4JRRA 1WWJA 5C00A 2B7RA 2H8LA 4OWYA 1GTUA 1E1KA 5D9WA 1SK0A 2Q0KA 2IFQA 1JNRA 5CRGA 4GXZA 4V2LA 4GRTA 4H2RA 1HQOA 2H1BA 3QJ4A 2Y6QA 1GSEA 4RG4A 2EIQA 1X9SB 3HYWA 2LKUA 4BK1A 1BQ7A 1K0IA 3SZ0A 2XDOA 5JCMA 2I1UA 1ML6A 3LFLA 5DVBA 1YY7A 3QFAC 1QMVA 3KPFA 3L1RA 1DUGA 4TLXA 5KVIA 4NEWA 1K3LA 1ON4A 4BVYA 1GTEA 4B65A 2PN8A 2PWJA 4ZL9A 2V1MA 3ZVJA 3NIVA 1H75A 2X99A 3GFKA 3G7IA 3DK9A 5KN3A 2R0PA 2UZ8A 2CFYA 2JK6A 2K6VA 5BUKA 1GLQA 1S3BA 4REKA 5DDLA 2PGTA 2B76A 2ZCTA 2DJ2A 1KBNA 1FO5A 3NN0X 3T2KA 1WE0A 5KOXA 5ABRA 4TR4A 4G0LA 1RSGA 1SEZA 1PS9A 2XPDA 4U2TA 1Y6EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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