4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

3ISHA 1ZX9A 1QO8A 1IJHA 4ADWA 1GNDA 4BJZA 3NK2X 4LA1A 1CHUA 4A99A 4NEVA 1FEAA 4YSHA 1PJ5A 4TM3A 4Z2UA 4NEWA 2YLRA 1PXAA 1V59A 3AE6A 3AEFA 4JQ9A 4H2NA 4H4WA 4TM0A 1D4EA 3P4SA 3LZWA 4H4VA 3ALLA 4Z2RA 5ER0A 2WETA 1F3PA 1JEHA 1GETA 4NZHA 3NNEA 4U2SA 2BABA 2Q0LA 2XFUA 3IC9A 1PJ7A 2BC1A 3KPFA 1PN0A 3AEAA 4B68A 2ZZ0A 2XFQA 3GYIA 4YTPA 5EOWA 2TMDA 1S3BA 2E1MA 4H2RA 2GR1A 2WU5A 4ZCDA 4BK2A 4K8DA 1GTEA 2XDOA 1TDFA 4UDRA 4OPLA 1CL0A 3C4NA 1MXTA 3HZLA 3K7TA 2CFYA 2EQ9A 1N4UA 2XVHA 1L9EA 4C77A 4B69A 1RSGA 2J3NA 2FJAA 2BK4A 2NVKX 3ABVA 3FG2P 1NDAA 3K7MX 2R46A 1DNCA 4WCTA 3H8IA 2V3AA 4GDEA 1M6IA 4YXDA 1L0VA 5BRTA 1OJAA 1D7LA 4GDPA 5BULA 1GRFA 1N4VA 5TR3A 2R9ZA 4XWZA 1KF6A 3SQPA 1ZP0A 2VVLG 2CDUA 2X8GA 3P9UA 3UOVA 2YAUA 2YLZA 2VQBA 2WP9A 3F8PA 2IIDA 3UP4A 2YVGA 3LZXA 1QJDA 2XLRA 3GMCA 4YKFA 1KFYA 4H4PA 4I59A 5FS9A 1YQ3A 5J60A 3DMEA 1Z6LA 3NH3X 3EF6A 1H7XA 4JY3A 2GB0A 2C64A 5BVAA 4IA6A 1TDNA 3NK0X 3P4PA 2AR8A 1NHPA 1O94A 2YQUA 4U8NA 4U8PA 4AT0A 2HQMA 1COYA 2DKIA 1IUWA 3KD9A 2H89A 2UZZA 4EQWA 1PBBA 3QFAA 5CKUA 2JKCA 1REOA 5M10A 4Y4NA 4J2WA 3NTAA 4B66A 2C65A 3QSEA 1PBDA 3ICRA 1IUUA 1BGNA 3AD9B 2GH5A 4YKGA 3NG7X 2EQ7A 4FK1A 2WS3A 4N9XA 2W0HA 5KRQA 1F6MA 4TLZA 3D8XA 1L9CA 2JB2A 5U63A 2OA1A 1ZOVA 4REKA 5EBKA 4NTDA 2GR3A 2WPEA 4JNAA 4RSLA 3AEBA 2E5VA 4B65A 2WP6A 5LV9A 4CCQA 3ITJA 3PVCA 3QVPA 1YY5A 5C2TA 4DGKA 4JN9A 2YG3A 1CC2A 3NYCA 4GR1A 2XYOA 3AE3A 1CJ4A 1K0JA 3D1CA 2RGHA 1W4XA 2VRMA 5DBJA 3DJEA 3EPTA 2YR4A 3FIMB 1F8WA 4HA6A 4PAAA 1PHHA 1VRQB 4A65A 3BNUA 4RG3A 3UCLA 3IHMA 1VG0A 4J56A 4C3YA 4AOXA 4LU6A 4EM3A 1LQUA 4NTCA 4Z26A 1FL2A 4EQSA 2WESA 1HYUA 1BWCA 3NKSA 4FX9A 3UKKA 2V3BA 1H84A 2YG7A 3ZDNA 1K0LA 3SM8A 1N4WA 2XVIA 2O9ZA 4YSXA 4Z25A 3OC4A 3GD3A 2XVFA 1ZMCA 4J33A 3QSMA 2ZZCA 4B67A 1PDHA 4H4RA 2XVEA 2WHDA 5HHFA 4USQA 4BURA 1KNRA 2BC0A 3OZ2A 2WOWA 4D04A 2B7SA 3M12A 2WP5A 4H4SA 3AE4A 3ALJA 3GWDA 4U8KA 4U8JA 1KSUA 1GRBA 1S2QA 2X8HA 2XVJA 2BA9A 3ATRA 3ZYXA 4AP3A 4BK1A 4EMWA 4EQXA 1K4QA 2WQYA 2BK3A 4K7ZA 1D4DA 2QAEA 3O0HA 1O5WA 3M0OA 4FDCB 2IVDA 3REDA 5JCIA 3CGBA 2FJEA 1EL7A 2Q7VA 4DSGA 1JRZA 4GF7A 3UKPA 4B64A 1FEBA 4TM1A 4K5SA 2B76A 3UOXA 1H83A 4P9SA 3VR9A 5IQ1A 2BS2A 5C3JA 2V60A 2GEWA 3UKFA 3VQRA 5BUKA 3DK4A 4U8OA 1CBOA 1H6VA 1H7WA 3P1WA 4H4ZA 4OPTA 4BJYA 2GAHB 2Y6RA 5JCMA 4H50A 2E4GA 3ATQA 3KVEA 2WOVA 2VRLA 2YLTA 3Q9TA 2C66A 1CJ2A 4B1BA 1JNRA 2X8CA 3L8KA 2JB3A 1XANA 2QA2A 3COXA 1S2YA 4B63A 2I0ZA 1K0IA 4X9MA 1NG4A 3UOZA 1NENA 5FS6A 2APGA 1KDGA 2H88A 3AYIA 1E1LA 4H4UA 1VG9A 4UP3A 3UKAA 2GF3A 2B7RA 4ICYA 4CNKA 2GR2A 4ZN0A 4EIQA 2VVLA 2XLPA 3IWAA 2GAGB 3LXDA 4FK1C 1UKVG 5HYMA 3AE1A 5KWFA 2R4EA 1CC6A 3CPJG 3H8LA 3AE9A 2ZZBA 1EL5A 3L1RA 4YT0A 1AOGA 1F8RA 2WEUA 1TYPA 2ACZA 1B8SA 3LOVA 4JDRA 1SEZA 2FJBA 3AE8A 4OVIA 5HXIA 3RNMA 3DK9A 5JCKA 3AWIA 1GREA 3UOYA 1PXBA 2RGJA 1E1NA 2EQ8A 2GVCA 2YLXA 3GSIA 5L46A 2R0CA 3RP7A 1GV4A 3CNTA 4YSYA 1BGJA 2A8XA 1Y0PA 1DJQA 4K22A 1XPQA 3F8DA 3QFBA 4C3XA 3IHGA 2YR5A 4XWRA 2C3CA 3NIXA 2EQ6A 2YR6A 3NT6A 4XXGA 3UTHA 3BI5A 4NTEA 1DOCA 3DGZA 5EB4A 3NTDA 2RGOA 2XLTA 1PBCA 3B3RA 5FS7A 3DH9A 4WX1A 4ZCCA 4A6NB 1GT8A 1OJDA 2QA1A 2VZ2A 4H4XA 3AYLA 1PBFA 3AE5A 4I58A 3NRNA 4H2PA 4O5QA 1NPXA 3S61A 4CRTA 4CBQA 3KLJA 3NGCX 2VOUA 1FOHA 3S5WA 4U2LA 4A7AA 2OLOA 1E6EA 1TDOA 3G5RA 2AQJA 2FJDA 2Y6QA 3H4KA 1E1MA 4U8MA 3P4QA 1CJCA 1S3EA 2YVFA 1GSNA 1PS9A 1E39A 1IUVA 2WOIA 1GESA 3C96A 4UDPA 5KVIA 2C7GA 1IUSA 2B9XA 3ICTA 4TM4A 1DOEA 1F8SA 1GRTA 1GRGA 2C67A 3LJPA 3RP6A 2X50A 5FMHA 3GRSA 2V6OA 1E1KA 4J57A 3UKHA 4J31A 2BXRA 3UTGA 1IUXA 1LTXR 4OPCA 2PHHA 1ONFA 3EANA 3DK8A 2F5ZA 1ZKQA 4OCGA 2GV8A 4C5OA 1BF3A 3NLCA 1GXFA 3SFEA 4LIIA 3FMWA 3UKLA 1Y56A 1DOBA 3CGEA 2GQFA 3UKQA 4JY2A 2WBAA 2CVJA 2C3DA 5GSNA 3V76A 3VRDB 2PYXA 3RHAA 3URHA 3UTEA 3CNSA 5HY5A 3DGHA 3K7QX 2YVJA 3T37A 1LVLA 4BK3A 2A89A 1RYIA 3LB8A 2CULA 2OAMA 3ALMA 2V5ZA 2WPCA 4GRTA 4YTMA 1E7PA 1VQWA 4A9WA 2JB1A 3G5QA 3CN8A 2R0GA 3VRAA 4IA5A 3SGLA 1NHQA 4ECHA 3GRTA 3ICSA 2A87A 3IF9A 3V3NA 3F8RA 1CC4A 5U1OA 4J36A 1ZY8A 1YQ4A 4Z44A 1KSSA 2YM2A 3BNMA 3CPHG 3Q6JA 1LJ1A 3FPZA 3GYJA 4UDQA 3BI4A 5IPYA 1ZMDA 3C4AA 2R0PA 4RG4A 1Q1WA 3AE7A 3R9UA 3ADAB 2Z5YA 3RP8A 2C76A 1O95A 4K5RA 3DA1A 4CNJA 1PJ6A 3GDPA 3K30A 3DJDA 1KNPA 2C70A 3CGDA 1DODA 2B9WA 3NHOX 3VRBA 2YG4A 3I3LA 1VDCA 4TLXA 2ARDA 4H4TA 3NN0X 2YG6A 4YSZA 1P2HA 4PABA 1Q1RA 3NK1X 3QJ4A 1GTHA 3AYJA 1D5TA 3PO7A 3KKJA 4OPIA 4OPUA 4APNA 5KXJA 5J7XA 1MOKA 2XFOA 4CCRA 2OALA 2XCGA 1H81A 3BI2A 2AAQA 2VVMA 2X99A 4HB9A 4D03A 2QCUA 3FBSA 1ZOYA 2YG5A 1GPEA 1FECA 3SFDA 3V3OA 2WPFA 2WU2A 2XFPA 1JU2A 3BHFA 2X3NA 4GCMA 4YWOA 3PS9A 2NPXA 4Z43A 3GWFA 4BV6A 1EBDA 3CPIG 1GOSA 4Z2TA 3I6DA 3CNPA 1NG3A 3UTFA 5JCLA 2JBVA 4A5LA 2BS3A 1LPFA 2WDRA 1LQTA 3NYFA 1ELIA 2WDQA 3DJJA 3UP5A 1H86A 1DXLA 3AB1A 3AECA 2V61A 1EL9A 2BXSA 1BZLA 3GMBA 1MO9A 1Q9IA 2FBWA 4IVMB 1QLBA 4KX6A 4MJWA 1CJ3A 2BCGG 1B5QA 3LADA 3QVRA 2YWLA 4U8LA 1JRYA 1OJ9A 3M13A 2C72A 3P4RA 4X9NA 2GMJA 4GUVA 4Z24A 1GALA 4U8IA 1CF3A 3CTYA 3CGCA 3EAOA 4A6NA 4EQRA 1JNZA 4DNAA 4K2XA 4EIPA 1TDKA 2BYBA 1GEUA 2B9YA 2JAEA 4Y4MA 1NHRA 1JOAA 3WE0A 4H7UA 4Y4LA 4IVOB 4AT2A 3E1TA 3VR8A 3KA7A 4H4YA 2GRTA 4A79A 4JNQA 2YLWA 2BCPA 2GQWA 1XHCA 4U2TA 1GRHA 1OJCA 3G5SA 5KOXA 5KVHA 4C74A 4CY8A 2RABA 1TYTA 4H2QA 2GMHA 2Q6UA 2OLNA 3AD8B 1TRBA 2YLSA 5EB5A 1B4VA 1NEKA 2TPRA 3BHKA 3AEDA 1IUTA 1N1PA 1OJTA 1PBEA 1P2EA 2VQ7A 1D4CA 4CY6A 5GRTA 1B37A 2BACA 2Z5XA 1GERA 2BS4A 3CNJA 2IVEA 2XLSA 4USRA 4J34A 3AD7B 5U25A 2WDVA 4E0VA 1X31B 3QSSA 5KOWA 2DKHA 2ZBWA 3II4A 1BKWA 3B6DA 4KPRA 2GR0A 2JK6A 1JRXA 5IQ4A 5M0ZA 4OPDA 3AEGA 1PXCA 3AXBA 1ZDLA 3GDNA 1H82A 1L9DA 3KU9A 3NYEA 4EM4A 4EMIA 3NN6X 3CNDA 1DJNA 3GD4A 2R45A 3CIRA 1GRAA 3AE2A 4DSHA 1FCDA 1EL8A 4EMJA 1YQZA 1ZK7A 4OPGA 4O5UA 4AOSA 2R4JA 1NAAA 1YKJA 4IV9A 4YTNA 3JSKA 5JCNA 2XFNA 2XLUA 1M64A 5FS8A 1NHSA 1XDIA 1LV0A 3AEEA 4AP1A 3DJGX 4M52A 2C73A 1Y56B 5CQFA 2Q0KA 2YM1A 1RP0A 4X4JA 1TDEA 2BK5A 4H4QA 1D7YA 2C75A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2C0GA 4WR5A 4DSSA 4EE0A 4BJZA 1M99A 4LA1A 3DYRA 1CHUA 5CNWA 4Z2UA 3RHCA 2E7PA 4ZBDA 3AE6A 1SL2B 4BL7B 3LJRA 3ALLA 1F3PA 1GETA 3ZIJA 2BABA 1K0NA 3N9JA 5H5RA 1QGVA 2PBJA 2C4JA 4YTPA 5JCUA 1S3BA 4BK2A 4ZCDA 4K8DA 3F4RA 1UVZA 3HZLA 3RDWA 1EP8A 1K0DA 6GSUA 2EQ9A 3O76A 2XVHA 1L9EA 3PR8A 2VOCA 2KLXA 1PX6A 2J3NA 4GCIA 3FG2P 1G6YA 2R46A 4WCTA 1V2AA 1Z6NA 4XRDA 3SY4A 4L0UA 4HQZA 4YXDA 5ECOB 4EL1A 5BULA 2PPTA 1GRFA 2VVLG 4KDUA 2YAUA 2GZPA 3TJFA 4F0CA 2WP9A 3UP4A 2YVGA 3F4TA 5DALB 5FS9A 5IOWA 2I9HA 4USSA 2BRAA 3NH3X 1R4WA 3EF6A 1H7XA 4JY3A 2VCVA 4PTSA 2GB0A 1OKTA 3CMIA 4WF5A 1SJIA 2VIMA 2HQMA 4HU7A 1XW6A 2H89A 4EQWA 1PBBA 4HU9A 2CQ9A 3QFAA 2QGVA 2YV7A 1GUKA 1REOA 5M10A 2IMDA 2OKAA 3JCML 2FA8A 3AD9B 3NG7X 3HVVA 3QAWA 1F6MA 4JR6A 2OA1A 2EIQA 3KCMA 4EC0A 4JNAA 2V32A 5IO0A 5CRGA 5G1LA 2WP6A 2OE3A 1DSBA 4JN9A 3QAGA 19GSA 3NYCA 3UVTA 2MBTA 4IJIA 4KA0A 5CRHA 5A4UA 2GS3A 3L9SA 4X0XA 1X5EA 2RGHA 4OWYA 4HJMA 1ZGNA 3EPTA 2YOIA 4PAAA 4J56A 4NTCA 1FL2A 2O7KA 1HYUA 1TP9A 2FWEA 1F9MA 3E3EA 4K9ZA 4NAXA 4FX9A 4ZILA 1K0LA 2PU9C 2XVIA 5HFGA 3OC4A 1M9BA 3GD3A 1ZYNA 3QSMA 5HHFA 3HYXA 3IK7A 2BC0A 3OZ2A 4BL7A 4D04A 2B7SA 1VF4A 1FAAA 4IP1A 1EZKA 1PN9A 1T00A 2X8HA 1GRBA 2XVJA 3ATRA 4AP3A 3VURA 2OE0A 2EC4A 3EWLA 2WQYA 1D4DA 2G2QA 1K0BA 1TOFA 4FDCB 3REDA 3CGBA 4FYCA 1JRZA 3KPKA 5KNLA 4GF7A 3UOXA 2CVKA 1PA3A 4KCAA 4EKZA 1Z7PA 2YANA 2MMNA 3KH9A 1UN2A 3UKFA 2GEWA 3V1WA 4U8OA 4DVCA 1ZCPA 5EPFA 1H6VA 4H4ZA 1A8YA 2GAHB 1FVKA 3M1GA 2GTUA 3Q9TA 2DSAA 2LJAA 2VL2A 1XANA 5IM9A 1S2YA 4FO5A 2I0ZA 4X9MA 3UOZA 1NENA 2H1DA 4CW9A 3AYIA 1E1LA 4MPFA 2C0EA 1Y25A 2ON5A 5ECLB 4FK1C 1UKVG 1U6TA 5KWFA 2YCDA 4ZL8A 2B7KA 1EL5A 1AOGA 4N11A 1TYPA 3ZFBA 4V1Ap 5D9WA 1QUWA 2C0FA 3RNMA 3UOYA 1PXBA 2H76A 1TTZA 2EQ8A 2HLSA 7GSSA 1GV4A 4YSYA 4HZ4A 2FUG2 2JL4A 1AXDA 1JZRA 2YP6A 4K22A 4BPYA 2R4VA 5AISA 3ZNOA 5CO3A 2AYTA 1DOCA 4QQ7A 2EIOA 3CSJA 3TUEA 1SKWB 4HJ2A 3DH9A 4WX1A 2AHEA 1GT8A 1OJDA 2QA1A 4PX1A 3EC3A 5HR0A 3AE5A 3F8UA 5FHIA 3LFLA 3KLJA 1FOHA 2ES7A 4I97A 4A7AA 2PVOC 3IRAA 3G5RA 5IMVA 1E1MA 4ZBAA 1GESA 2M80A 3ED3A 1FB6A 3KMOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4EIQA

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